Liza e qelizave BL21 me ultratinguj
Qelizat BL21 janë një shtam i E. coli që përdoret gjerësisht në laboratorët kërkimorë, bioteknologji dhe prodhimin industrial për shkak të aftësisë së tyre për të shprehur proteina me efikasitet shumë të lartë. Shkatërrimi i qelizave, liza dhe ekstraktimi i proteinave me ultratinguj përbëjnë metodën e zakonshme për të izoluar dhe mbledhur proteinat e synuara nga brendësia e qelizave BL21. Trajtimi me ultratinguj e shkatërron plotësisht qelizën dhe çliron të gjitha proteinat e bllokuara brenda saj, duke e bërë të disponueshme 100% të proteinës.
Qelizat BL21 për shprehjen e proteinave
BL21 është një shtam bakterial i E. coli, kimikisht kompetent, i përshtatshëm për transformim dhe shprehje të proteinave në nivel të lartë duke përdorur një sistem induksioni me ARN-polimerazën T7 dhe IPTG. Qelizat BL21 mundësojnë shprehjen me efikasitet të lartë të proteinave nga çdo gjen që është nën kontrollin e një promotori T7. Shtami BL21(DE3) i E. coli është një shtam për prodhimin e proteinave i bazuar në ARN-polimerazën T7, i kombinuar me vektorë shprehjeje të bazuar në promotorin T7, dhe përdoret gjerësisht në laboratorë dhe industri për të prodhuar proteina rekombinante. Në BL21(DE3), shprehja e gjenit që kodon proteinën rekombinante transkriptohet nga ARN-polimeraza T7 (T7 RNAP) e koduar në kromozom, e cila transkripton tetë herë më shpejt se RNAP-ja konvencionale e E. coli. Kjo e bën shtamin BL21(DE3) shumë efikas dhe e shndërron atë në një nga sistemet qelizore më të parapëlqyera për shprehjen e proteinave.
Protokolli për lizën dhe ekstraktimin e proteinave nga qelizat BL21 me ultratinguj
Liza e qelizave BL21 kryhet kryesisht duke përdorur trajtimin me ultratinguj në kombinim me lauroil sarkozinatin e natriumit (i njohur edhe si sarkosyl) si tretësirë tampon për lizën. Përparësitë e shkatërrimit të qelizave dhe ekstraktimit të proteinave me ultratinguj qëndrojnë te besueshmëria, riprodhueshmëria e rezultateve, si dhe te përdorimi i thjeshtë, i sigurt dhe i shpejtë i sonikatorëve. Protokolli më poshtë jep udhëzime hap pas hapi për lizën e qelizave BL21 me ultratinguj:
- Për të larguar proteinat shaperone, sedimentet bakteriale BL21 u risuspenduan në 50 ml tretësirë tampon natrium Tris-EDTA (STE) të ftohtë si akulli (e përbërë nga 10 mM Tris-HCL, pH 8,0, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, me shtesë prej 100 mM PMSF).
- Më pas, shtohen 500 ul lizozimë (10 mg/ ml) dhe qelizat inkubohen mbi akull për 15 min.
- Më pas, shtohen 500 ul DTT dhe 7 ml sarkosyl (10% (w/v), i përgatitur në tretësirën tampon STE).
- Është thelbësore që të gjitha tretësirat tampon për pastrim të mbahen të ftohta si akulli dhe mostrat të mbahen mbi akull gjatë gjithë kohës. Të gjithë hapat e pastrimit duhet të kryhen në dhomën e ftohtë, nëse është e mundur.
- Për lizën dhe ekstraktimin e proteinave me ultratinguj, mostrat trajtohen me ultratinguj në VialTweeter MultiSample Ultrasonicator për 4 x 30 sec me amplitudë 100%, me një interval prej 2 min ndërmjet çdo trajtimi me ultratinguj. Si alternativë, një homogjenizues me ultratinguj i tipit me sondë, me majë mikro, p.sh., UP200Ht me S26d2 (3 x 30 sec, pushim prej 2 min. ndërmjet cikleve të ultratingujve, amplitudë 80%) mund të përdoret.
- Për hapat e mëtejshëm të pastrimit, mostrat duhet të mbahen mbi akull ose, si alternativë, të ruhen në -80°C deri në përpunimin e mëtejshëm.
Shkatërruesi i qelizave me ultratinguj UP200St me majë mikro S26d2 për lizën dhe ekstraktimin e proteinave
Liza me ultratinguj me kontroll të saktë të temperaturës
Kontrolli i saktë dhe i besueshëm i temperaturës është thelbësor gjatë punës me mostra biologjike. Temperaturat e larta nisin degradimin e proteinave të shkaktuar nga nxehtësia në mostra.
Ashtu si të gjitha teknikat mekanike të përgatitjes së mostrave, trajtimi me ultratinguj krijon nxehtësi. Megjithatë, temperatura e mostrave mund të kontrollohet mirë kur përdoret VialTweeter. Ju paraqesim mundësi të ndryshme për të monitoruar dhe kontrolluar temperaturën e mostrave tuaja gjatë përgatitjes së tyre me VialTweeter dhe VialPress për analizë.
- Monitorimi i temperaturës së mostrës: Procesori ultrasonik UP200St, i cili vë në punë VialTweeter, është i pajisur me një softuer inteligjent dhe një sensor temperature që lidhet me prizë. Lidheni sensorin e temperaturës me UP200St dhe futeni majën e sensorit të temperaturës në një nga epruvetat e mostrave. Nëpërmjet ekranit dixhital me ngjyra dhe me prekje, mund të caktoni në menynë e UP200St një interval specifik temperature për sonikimin e mostrës suaj. Ultrasonikatori do të ndalet automatikisht kur të arrihet temperatura maksimale dhe do të qëndrojë në pauzë derisa temperatura e mostrës të bjerë në vlerën e poshtme të intervalit të caktuar të temperaturës ∆. Pastaj sonikimi fillon sërish automatikisht. Ky funksion inteligjent parandalon degradimin e shkaktuar nga nxehtësia.
- Blloku i VialTweeter mund të ftohet paraprakisht. Vendoseni bllokun e VialTweeter (vetëm sonotrodën pa transduktor!) në frigorifer ose në ngrirës për ta ftohur paraprakisht bllokun e titanit, gjë që ndihmon në vonimin e rritjes së temperaturës në mostër. Nëse është e mundur, edhe vetë mostra mund të ftohet paraprakisht.
- Përdorni akull të thatë për ftohje gjatë sonikimit. Përdorni një tabaka të cekët të mbushur me akull të thatë dhe vendoseni VialTweeter mbi akull në mënyrë që nxehtësia të mund të shpërndahet shpejt.
Klientë në mbarë botën përdorin VialTweeter dhe VialPress për punën e tyre të përditshme të përgatitjes së mostrave në laboratorë biologjikë, biokimikë, mjekësorë dhe klinikë. Me softuerin inteligjent dhe kontrollin e temperaturës së procesorit UP200St, temperatura kontrollohet në mënyrë të besueshme dhe shmanget degradimi i mostrave i shkaktuar nga nxehtësia. Përgatitja ultrasonike e mostrave me VialTweeter dhe VialPress jep rezultate shumë të besueshme dhe të riprodhueshme!
Gjeni pajisjen optimale ultrasonike për shpërbërjen e qelizave për aplikimin tuaj të lizës
Hielscher Ultrasonics është një prodhues me përvojë shumëvjeçare i pajisjeve ultrasonike me performancë të lartë për shpërbërjen e qelizave dhe i homogjenizuesve për laboratorë, sisteme tavoline dhe sisteme në shkallë industriale. Madhësia e kulturës suaj të qelizave bakteriale, objektivi juaj kërkimor ose i prodhimit dhe vëllimi i qelizave që do të përpunohen në orë ose në ditë janë faktorë thelbësorë për të gjetur pajisjen e duhur ultrasonike për shpërbërjen e qelizave për aplikimin tuaj.
Hielscher Ultrasonics ofron zgjidhje të ndryshme për sonikimin e njëkohshëm të shumë mostrave (deri në 10 flakonë me VialTweeter) dhe të mostrave në masë (d.m.th., pllaka mikrotitrimi / pllaka ELISA me UIP400MTP), si dhe ultrasonikatorin klasik laboratorik të tipit sondë me nivele të ndryshme fuqie nga 50 deri në 400 vat, deri te procesorët ultrasonikë plotësisht industrialë me deri në 16 000 vat për njësi për shpërbërjen komerciale të qelizave dhe ekstraktimin e proteinave në prodhim në shkallë të gjerë. Të gjithë ultrasonikatorët Hielscher janë ndërtuar për funksionim 24/7/365 nën ngarkesë të plotë. Qëndrueshmëria dhe besueshmëria janë veçori thelbësore të pajisjeve tona ultrasonike.
Të gjithë homogjenizuesit ultrasonikë dixhitalë janë të pajisur me softuer inteligjent, ekran me ngjyra dhe me prekje dhe regjistrim automatik të të dhënave, të cilat e bëjnë pajisjen ultrasonike një mjet pune praktik në laborator dhe në mjediset e prodhimit.
Na tregoni çfarë lloji qelizash, çfarë vëllimi, sa shpesh dhe me çfarë objektivi duhet t’i përpunoni mostrat tuaja biologjike. Ne do t’ju rekomandojmë pajisjen ultrasonike më të përshtatshme për shpërbërjen e qelizave sipas kërkesave të procesit tuaj.
Tabela më poshtë ju jep një ide për kapacitetin e përafërt të përpunimit të sistemeve tona ultrasonike, nga homogjenizuesit kompaktë që mbahen në dorë dhe ultrasonikatorët MultiSample deri te procesorët ultrasonikë industrialë për aplikime komerciale:
| Vëllimi i serisë | Debiti | Pajisjet e rekomanduara |
|---|---|---|
| Pllaka me 96 puse / pllaka mikrotitrimi | n.a. | UIP400MTP |
| 10 flakonë me nga 0,5 deri në 1,5mL | n.a. | VialTweeter me UP200St |
| 0,01 deri në 250mL | 5 deri në 100mL/min | UP50H |
| 0,01 deri në 500mL | 10 deri në 200mL/min | UP100H |
| 10 deri në 2000mL | 20 deri në 400mL/min | UP200Ht, UP400St |
| 0,1 deri në 20L | 0,2 deri në 4L/min | UIP2000hdT |
| 10 deri në 100L | 2 deri në 10L/min | UIP4000hdT |
| n.a. | 10 deri në 100L/min | UIP16000 |
| n.a. | më i lartë | grup pajisjesh UIP16000 |
Na kontaktoni! / Na pyesni!
Sonikator pllakash UIP400MTP për shpërbërjen e qelizave me kapacitet të lartë përpunimi në pllaka me 96 puse
Ultrasonikatori UP200Ht me mikromajë S26d2 prej 2mm për sonikimin e mostrave të vogla
Lexoni më shumë se si mund ta përdorni homogjenizuesin tuaj ultrasonik të indeve për përgatitjen efikase dhe të besueshme të tretësirave tampon!
Fakte që ia vlen të dini
Bakteret Escherichia coli
Escherichia coli është një lloj bakteri që nuk formon spore, është Gram-negativ dhe karakterizohet nga forma e një shkopthi të drejtë. Bakteret E.coli gjenden në mjedis, ushqime dhe zorrët e njerëzve dhe kafshëve. E. coli zakonisht është i lëvizshëm falë flagjelave peritrike, por ka edhe lloje të palëvizshme. E.coli janë organizma të ashtuquajtur kemoorganotrofë anaerobë fakultativë, që do të thotë se janë të aftë si për metabolizëm respirator, ashtu edhe për metabolizëm fermentues. Shumica e llojeve të E.coli janë të padëmshme dhe kryejnë funksione të dobishme në organizëm, p.sh. pengojnë rritjen e specieve të dëmshme bakteriale, sintetizojnë vitamina etj.
Qelizat bakteriale të Escherichia coli të të ashtuquajturit tip B janë një kategori e veçantë e shtameve të E.coli, të cilat përdoren gjerësisht në kërkime për të studiuar mekanizma si ndjeshmëria ndaj bakteriofagëve ose sistemet e restriksionit dhe modifikimit. Për më tepër, bakteret E.coli vlerësohen si një mjet pune i besueshëm për shprehjen e proteinave në laboratorët e bioteknologjisë dhe të shkencave të jetës. Për shembull, E.coli përdoren për të sintetizuar përbërje si proteinat dhe oligosakaridet në shkallë industriale. Për shkak të veçorive specifike si mungesa e proteazave, prodhimi i ulët i acetatit në nivele të larta të glukozës dhe përshkueshmëria e shtuar, qelizat E. coli B janë qelizat pritëse që përdoren më shpesh për prodhimin e proteinave të krijuara me inxhinieri gjenetike.
Proteina rekombinante
Proteinat rekombinante (rProt) po marrin rëndësi të konsiderueshme në shumë degë, përfshirë prodhimin kimik, industrinë farmaceutike, kozmetike, mjekësinë njerëzore dhe veterinare, bujqësinë, industrinë ushqimore dhe atë të trajtimit të mbetjeve.
Prodhimi i proteinave rekombinante kërkon përdorimin e një sistemi të shprehjes. Si sisteme qelizore të shprehjes për prodhimin e ADN-së rekombinante mund të përdoren si qelizat prokariote, ashtu edhe ato eukariote. Ndërsa qelizat bakteriale përdoren më gjerësisht për shprehjen e proteinave për shkak të faktorëve si kostoja e ulët, mundësia e lehtë e rritjes së shkallës së prodhimit dhe kushtet e thjeshta të mjediseve të kultivimit, sistemet me qeliza gjitarësh, majash, algash, insektesh dhe sistemet pa qeliza janë alternativa të konsoliduara. Lloji i proteinës, aktiviteti funksional dhe rendimenti i kërkuar i proteinës së shprehur ndikojnë në përzgjedhjen e sistemit qelizor që përdoret për shprehjen e proteinave.
Për të shprehur një proteinë rekombinante, një qelizë e caktuar duhet të transfektohet me një vektor ADN-je që përmban kallëpin e ADN-së rekombinante. Qelizat e transfektuara me kallëpin më pas kultivohen. Si pasojë e mekanizmit qelizor, qelizat transkriptojnë dhe translatojnë proteinën me interes, duke prodhuar kështu proteinën e synuar.
Meqë proteinat e shprehura mbeten të bllokuara në matricën qelizore, qeliza duhet t’i nënshtrohet lizës (të shpërbëhet dhe të çahet) për të çliruar proteinat. Në një hap pasues të pastrimit, proteina ndahet dhe pastrohet.
Proteina e parë rekombinante e përdorur në trajtim ishte insulina njerëzore rekombinante në vitin 1982. Sot, në mbarë botën prodhohen më shumë se 170 lloje proteinash rekombinante për trajtime mjekësore. Proteinat rekombinante që përdoren zakonisht në mjekësi janë, për shembull, hormonet rekombinante, interferonet, interleukinat, faktorët e rritjes, faktorët e nekrozës tumorale, faktorët e koagulimit të gjakut, barnat trombolitike dhe enzimat për trajtimin e sëmundjeve të rënda si diabeti, nanizmi, infarkti i miokardit, insuficienca kardiake kongjestive, apopleksia cerebrale, skleroza multiple, neutropenia, trombocitopenia, anemia, hepatiti, artriti reumatoid, astma, sëmundja e Crohn-it, si dhe për terapitë kundër kancerit. (shih Phuc V. Pham, në Omics Technologies and Bio-Engineering, 2018)
Literatura / Referencat
- Cheraghi S.; Akbarzade A.; Farhangi A.; Chiani M.; Saffari Z.; Ghassemi S.; Rastegari H.; Mehrabi M.R. (2010): Improved Production of L-lysine by Over-expression of Meso-diaminopimelate Decarboxylase Enzyme of Corynebacterium glutamicum in Escherichia coli. Pak J Biol Sci. 2010 May 15; 13(10), 2010. 504-508.
- LeThanh, H.; Neubauer, P.; Hoffmann, F. (2005): The small heat-shock proteins IbpA and IbpB reduce the stress load of recombinant Escherichia coli and delay degradation of inclusion bodies. Microb Cell Fact 4, 6; 2005.
- Martínez-Gómez A.I.; Martínez-Rodríguez S.; Clemente-Jiménez J.M.; Pozo-Dengra J.; Rodríguez-Vico F.; Las Heras-Vázquez F.J. (2007): Recombinant polycistronic structure of hydantoinase process genes in Escherichia coli for the production of optically pure D-amino acids. Appl Environ Microbiol. 73(5); 2007. 1525-1531.
- Kotowska M.; Pawlik K.; Smulczyk-Krawczyszyn A.; Bartosz-Bechowski H.; Kuczek K. (2009): Type II Thioesterase ScoT, Associated with Streptomyces coelicolor A3(2) Modular Polyketide Synthase Cpk, Hydrolyzes Acyl Residues and Has a Preference for Propionate. Appl Environ Microbiol. 75(4); 2009. 887-896.
Sonikatori VialTweeter për sonikimin e njëkohshëm të 10 mostrave, p.sh. për të shpërbërë qelizat BL21
