Si mund ta fuqizojë sonikimi lizozimën për lizën e qelizave bakteriale
, Kathrin Hielscher, publikuar në Lajmet e Hielscher
Çarja e qelizave bakteriale është një hap kritik në bioteknologji, kërkimin farmaceutik dhe prodhimin e proteinave. Një nga mjetet më të zakonshme për këtë punë është lizozima, një enzimë që dobëson muret qelizore bakteriale. Por, megjithëse lizozima është efektive, ajo shpesh nuk është mjaftueshëm e shpejtë ose e fuqishme kur përdoret e vetme – veçanërisht kur punohet me kultura të dendura ose me baktere të modifikuara për të mbishprehur proteina.
Këtu hyn në lojë sonikimi. Studiuesit mbështeten gjithnjë e më shumë në përpunimin me ultratinguj për të përmirësuar ndjeshëm lizën qelizore të bazuar në lizozimë. Kur përdoren së bashku, lizozima dhe sonikimi formojnë një sistem plotësues shumë efikas që jep rezultate më të shpejta, më të plota dhe më të riprodhueshme.
Pse lizozima e vetme shpesh nuk mjafton
Lizozima vepron duke zbërthyer peptidoglikanin, një përbërës strukturor kyç të mureve qelizore bakteriale. Kjo qasje enzimatike është e butë dhe përdoret gjerësisht, veçanërisht për E. coli. Megjithatë, në kushtet reale laboratorike, trajtimi vetëm me lizozimë mund të ketë kufizime.
Sfidat e zakonshme përfshijnë:
- Shkatërrim jo të plotë të qelizave në kultura me dendësi të lartë ose në kultura të agreguara
- Kohë të gjata inkubimi
- Efektivitet të reduktuar te bakteret që mbishprehin proteina ose që janë përshtatur ndaj stresit
- Ndryshueshmëri nga një seri në tjetrën
Këto kufizime mund të ndikojnë negativisht në proceset pasuese, si ekstraktimi, kthjellimi dhe pastrimi i proteinave – duke ulur përfundimisht rendimentin dhe qëndrueshmërinë e rezultateve.
Shkenca pas sinergjisë midis lizozimës dhe sonikimit
Sonikimi fut valë ultrasonike me intensitet të lartë në një mostër të lëngshme. Këto valë krijojnë flluska mikroskopike që kolapsojnë me shpejtësi në një proces të njohur si kavitacion. Forcat prerëse, ndryshimet e presionit dhe mikrorrymat që rezultojnë shkatërrojnë fizikisht strukturat qelizore.
Kur sonikimi zbatohet pas trajtimit me lizozimë – ose njëkohësisht me të – të dyja metodat përforcojnë njëra-tjetrën në disa mënyra të rëndësishme:
- Qasje më e lehtë te muri qelizor
Lizozima dobëson murin qelizor bakterial, duke e bërë atë shumë më të cenueshëm ndaj forcave mekanike të krijuara nga ultratingujt. - Lizë qelizore më e shpejtë
Energjia ultrasonike shkurton ndjeshëm kohën e nevojshme për të arritur shkatërrimin e plotë të qelizave, krahasuar me trajtimin vetëm enzimatik. - Përpunim më i njëtrajtshëm
Sonikimi përmirëson përzierjen, duke siguruar që të gjitha qelizat të ekspozohen në mënyrë të njëtrajtshme si ndaj lizozimës, ashtu edhe ndaj stresit mekanik. - Rendimente më të larta të proteinave
Liza më e plotë nënkupton çlirim më të madh të proteinave, enzimave dhe metabolitëve brendaqelizorë – duke përmirësuar rikuperimin e përgjithshëm.
Një rrjedhë tipike pune për sonikimin e asistuar nga lizozima
Në laboratorët që punojnë me shtame bakteriale që mbishprehin proteina, një rrjedhë pune e konsoliduar ndërthur lizën enzimatike me atë ultrasonike:
- Risuspendimi i qelizave
Sedimentet bakteriale të mbledhura risuspendohen në një tretësirë tampon të përshtatshme për lizë që përmban lizozimë, zakonisht në përqendrime prej 0,1–1 mg/mL. Sonikimi i butë nxit risuspendimin e shpejtë dhe të njëtrajtshëm të qelizave. - Paratrajtimi enzimatik
Suspensioni inkubohet për 10–30 minuta në temperatura të kontrolluara (zakonisht midis 4 °C dhe 25 °C), duke i mundësuar lizozimës të dobësojë murin qelizor. - Shkatërrimi me ultratinguj
Suspensioni i paratrajtuar sonikohet duke përdorur një procesor ultrasonik Hielscher, me amplitudë, regjim pulsimi dhe ftohje të optimizuar. - Kthjellimi
Mbetjet qelizore largohen me centrifugim ose filtrim, duke lënë një lizat të kthjelluar të pasur me proteinat e synuara.
Pse studiuesit zgjedhin sonikatorët Hielscher
Sonikatorët Hielscher janë veçanërisht të përshtatshëm për lizën qelizore të asistuar nga lizozima, falë saktësisë dhe fleksibilitetit të tyre. Përparësitë kryesore përfshijnë:
- Amplitudë dhe energji hyrëse të rregullueshme për përpunim të riprodhueshëm
- Funksionim në regjim pulsimi për të reduktuar grumbullimin e nxehtësisë
- Kavitacion efikas në një gamë të gjerë vëllimesh dhe viskozitetesh
- Kalimin e lehtë nga mostrat laboratorike me vëllim në mikrolitra te prodhimi industrial
Ky kombinim i bën sistemet Hielscher mjete të vlefshme si në laboratorët kërkimorë, ashtu edhe në mjediset e prodhimit në shkallë të gjerë.
Sonikatori UIP400MTP për pllaka me shumë puse për përgatitjen e mostrave me kapacitet të lartë përpunimi
Faktorët kyç për optimizimin e rezultateve
Për të përfituar sa më shumë nga sonikimi i asistuar nga lizozima, studiuesit rregullojnë me kujdes disa parametra:
- Përqendrimi i lizozimës: Përdorni dozën më të ulët efektive për të kontrolluar kostot dhe për të minimizuar ndërhyrjet në proceset pasuese.
- Energjia ultrasonike: Zbatoni fuqi të mjaftueshme për të siguruar lizë të plotë pa dëmtuar proteinat e ndjeshme.
- Menaxhimi i temperaturës: Sistemet e ftohjes ose banjat me akull ndihmojnë në mbrojtjen e përbërësve të synuar që janë të ndjeshëm ndaj nxehtësisë.
- Cilësimet e pulsimit: Sonikimi me ndërprerje përmirëson efikasitetin e kavitacionit dhe qëndrueshmërinë e mostrës.
Fuqizoni lizozimat me sonikim!
Kombinimi i lizozimës me shkatërrimin me ultratinguj ofron një zgjidhje të besueshme dhe me performancë të lartë për lizën e qelizave bakteriale. Sonikimi rrit efektivitetin e trajtimit enzimatik, duke mundësuar përpunim më të shpejtë, shkatërrim më të plotë dhe rendimente më të larta të produkteve brendaqelizore.
Me sisteme ultrasonike që mund të kontrollohen me saktësi dhe të përshtaten për shkallë të ndryshme, si ato të Hielscher, studiuesit mund të rregullojnë imtësisht rrjedhat e tyre të punës për të përmbushur kërkesat e bioteknologjisë moderne – qoftë në një laborator të vogël apo në një linjë prodhimi industrial.
Lizë bakteriale me kapacitet të lartë përpunimi me sonikatorin UIP400MTP për mikropllaka
Literaturë / Referenca
- Ghosh, A., Bhar, K. & Siddhanta, A. (2019): Oxygen sequestration by Leghemoglobin is positively regulated via its interaction with another late nodulin, Nlj16 of Lotus japonicus. Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology 28, 2019. 414–423.
- Hannah K. Lembke; Adeline Espinasse; Mckenna G. Hanson; Christian J. Grimme;Zhe Tan; Theresa M. Reineke; Erin E. Carlson (2023): Cationic Polymers Enable Internalization of Negatively Charged Chemical Probes into Bacteria. ACS Chem Biol . 2023 September 15; 18(9): 2063–2072.
- Müller MRA, Ehrmann MA, Vogel RF (2000): Multiplex PCR for the Detection ofLactobacillus pontis and Two Related Species in a Sourdough Fermentation. Applied Environmental Microbiology 66, 2000.
- Di Giosia, Matteo; Bomans, Paul; Bottoni, Andrea; Cantelli, Andrea; Falini, Giuseppe; Franchi, Paola; Guarracino, Giuseppe; Friedrich, Heiner; Lucarini, Marco; Paolucci, Francesco; Rapino, Stefania; Sommerdijk, Nico; Soldà, Alice; valle, Francesco ; Zerbetto, Francesco; Calvaresi, Matteo (2018): Proteins as Supramolecular Hosts for C60: A True Solution of C60 in Water. Nanoscale 10(21); 2018.
Pyetje të shpeshta
Çfarë janë lizozimat?
Lizozimat janë enzima antimikrobike që katalizojnë hidrolizën e lidhjeve glikozidike β(1→4) në peptidoglikan, një përbërës strukturor kyç i mureve qelizore bakteriale, duke çuar në dobësimin e murit qelizor dhe në lizë, veçanërisht te bakteret Gram-pozitive dhe qelizat Gram-negative të bëra të përshkueshme.
Cilat janë përparësitë dhe kufizimet e lizës qelizore duke përdorur lizozome?
Liza qelizore duke përdorur lizozima ofron përparësi si kushte të buta reaksioni, ruajtje të funksionalitetit të proteinave dhe stres të ulët mekanik, por kufizohet nga kinetika e ngadaltë, liza jo e plotë në kultura bakteriale të dendura ose rezistente, efektiviteti i reduktuar ndaj membranave të jashtme të paprekura të baktereve Gram-negative dhe ndryshueshmëria në varësi të fiziologjisë qelizore dhe kushteve të rritjes.
Si e rrit sonikimi aktivitetin e lizozimave?
Sonikimi rrit aktivitetin e lizozimës duke shkatërruar mekanikisht muret qelizore bakteriale dhe duke i bërë ato të përshkueshme përmes forcave prerëse të shkaktuara nga kavitacioni, gjë që rrit qasjen e enzimës te peptidoglikani, përshpejton kinetikën e lizës dhe sjell shkatërrim më të plotë dhe më homogjen të qelizave.

