Metabolomika e lehtësuar nga sonikimi me kapacitet të lartë
Metabolomika është fusha e kërkimit që përdor teknika me kapacitet të lartë për të karakterizuar dhe kuantifikuar molekulat e vogla në lëngje të ndryshme biologjike, si urina, serum, plazma, feçet dhe pështyma, duke zbuluar shenja metabolike unike. Sonikatori me kapacitet të lartë UIP400MTP, i projektuar për pllaka me shumë vrima, është një mjet i fuqishëm për shpërbërjen e qelizave në këto mostra, duke lehtësuar lirimin e metaboliteve për analizën pasuese. Ky qasje e saktë dhe e besueshme është thelbësore për metabolomikën, ku dizajni i saktë i studimit, përgatitja e kujdesshme e mostrave, konfigurimi i optimizuar i platformës, analiza e plotë e të dhënave dhe interpretimi biologjik i kuptueshëm janë parësore. Metabolomika përdor si qasjet e orientuara, të cilat fokusohen në klasa specifike të molekulave si karbohidratet, lipidet dhe aminoacidet, ashtu edhe teknikat jo të orientuara, të cilat ofrojnë një pasqyrë të gjerë të profileve metabolike brenda një mostre, duke zbuluar kompleksitetin e ndërlikuar të sinjalizimit metabolik.
UIP400MTP është një sonikator pa kontakt, me kapacitet të lartë për shpërbërjen e qelizave dhe ekstraktimin e metaboliteve në pllaka me shumë vrima
Përgatitja e mostrave me kapacitet të lartë me sonikatorin e pllakës me 96 vrima UIP400MTP
Përdorimi i sonikatorit pa kontakt UIP400MTP në kombinim me pllakat me 96 vrima është një metodë efikase për homogjenizimin me kapacitet të lartë dhe ekstraktimin e metaboliteve. Ky konfigurim shmang kontaktin e drejtpërdrejtë me mostrën, duke reduktuar rrezikun e kontaminimit të kryqëzuar gjatë procesimit të mostrave të shumta njëkohësisht.
Protokol hap pas hapi për homogjenizimin me sonikatorin e pllakës me 96 vrima UIP400MTP
- Përgatitja e mostrave metabolomike
Vendosja e mostrës: Shpërndani secilën mostër (p.sh., feçet, indet e zorrëve ose përmbajtjen luminal) në vrima individuale të një pllake me 96 vrima ose mikroplake.
Tretësi: Tretësit organikë, si metanoli, etanoli, acetonitrili, kloroformi dhe përzierjet e tyre (ujore), janë thelbësorë për ekstraktimin e metaboliteve, duke ndihmuar në lirimin e metaboliteve intracelulare nga matrica qelizore. Përdorni 100–300 µL tretës për vrimë, duke siguruar volum të mjaftueshëm për të zhytur plotësisht mostrën.
Standartet e brendshme: Opsionale, shtoni standarde të brendshme në çdo vrimë për normalizim gjatë analizës metabolomike pasuese. - Konfigurimi i mediumit lidhës
Niveli i ujit: Vendosni pllakën me 96 vrima në platformën e sonikimit të mbushur me ujë (mediumi lidhës) siç përshkruhet në manual. - Konfigurimi i parametrave të UIP400MTP
Cilësimet e fuqisë: Rregulloni amplitudën ultrasonike në 50–80% të fuqisë maksimale për homogjenizim efikas.
Modaliteti i pulsit: Caktoni ciklin e sonikimit në pulse alternative (p.sh., 30 sekonda ON, 30 sekonda OFF) për të lejuar ftohjen dhe për të parandaluar mbipërmesimin e mostrës.
Koha totale: 4–10 minuta, në varësi të kompleksitetit dhe fortësisë së mostrës.
Kontrolli i temperaturës: Përdorni një ftohës laboratori për të mbajtur ujin në 4–8°C gjatë sonikimit për të mbrojtur metabolitet e ndjeshëm ndaj nxehtësisë. - Procesi i sonikimit
Nisni UIP400MTP për ciklet e sonikimit.
Monitoroni procesin përmes ndërfaqes së UIP400MTP.
Efekti i kavitacionit do të homogjenizojë mostrat dhe do të shpërbëjë qelizat brenda vrimave, duke liruar metabolitet intracelulare në tretës. - Pas sonikimit
Centrifugimi: Pas sonikimit, transferoni përmbajtjen e pllakës në tuba mbledhjeje nëse është e nevojshme. Centrifugoni në 4 000–6 000 × g për 10 minuta për të sedimentuar rrënojat e patretshme dhe materialin qelizor.
Mbledhja e supernatantit: Transferoni me kujdes supernatantin nga çdo vrimë në tuba ose pllaka të reja për analizë.
Tharja opsionale: Thani supernatantet duke përdorur një përqendrues vakum (p.sh., SpeedVac) nëse kërkohet përqendrim, më pas rikrijuani në një volum të vogël të tretësit të përshtatshëm.
Përfitoni nga kapaciteti i procesimit me kapacitet të lartë të sonikatorit të pllakës me shumë vrima UIP400MTP dhe lehtësoni kërkimin dhe analizën tuaj metabolomike!
Sonikator me kapacitet të lartë UIP400MTP për kërkim metabolomik në pllaka me shumë vrima, pllaka me 96 vrima, tuba dhe pjata Petri.
Sonikator i pllakës me shumë vrima UIP400MTP për përgatitjen e mostrave me kapacitet të lartë në kërkimin metabolomik.
Parimi i sonikimit pa kontakt me UIP400MTP
UIP400MTP aplikon valë ultrasonike në pushtat e një pjate me 96 pushta në mënyrë indirekte përmes një mediumi lidhës (p.sh., ujë). Këto valë krijojnë kavitacion, i cili shkatërron qelizat dhe liron metabolitët pa kontakt fizik midis sondës së sonikatorit dhe mostrës.
“Shkruaj për t’ju falënderuar për përvojën tonë fantastike duke përdorur sonikatorin tuaj UIP400MTP për lizën bakteriale uniforme dhe konsistente të mostrave të mikrobiomës fecale. Ne po shtyjmë kufijtë e teknologjisë së lizës me kapacitet të lartë, dhe instrumenti juaj është i përshtatshëm për këtë detyrë. Disa nga pikat kryesore janë:
- Lehtësia e operimit – instrumenti është i lehtë për t’u përdorur, dhe personalizimi është i thjeshtë duke përdorur zgjedhjet e menysë
- Kapacitet i lartë – i shkëlqyer për menaxhimin e pjatave, me 96 mostra në një herë
- Sonikim i njëtrajtshëm i të gjitha enëve – pajisja ishte në gjendje të jepte të njëjtën sasi sonikimi për të gjitha pushtat, gjë që ishte thelbësore për aplikacionin tonë
- Mbështetja nga ekipi Hielscher – mbështetja ishte e shkëlqyer, ju ishit gjithmonë aty për ne në trajnim, për të përgjigjur pyetjet tona dhe për të adresuar problemet, me sugjerime që na ndihmuan të arrijmë qëllimin tonë.
Faleminderit sërish për ndihmën dhe asistencën tuaj ndërsa punonim për të optimizuar protokollet tona.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Drejtor Shkencëror Kryesor – Intus Biosciences
Sonikator i pjatave me shumë pushta UIP400MTP lejon përgatitjen e mostrave me kapacitet të lartë, p.sh. në kërkimin dhe analizën e metaboliteve.
Sonikator i pjatave me 96 pushta UIP400MTP: Lëngu që transmeton ultratingujt rrethon të gjitha pushtat dhe ofron sonikim uniform të secilës mostër
Karakteristikat Kryesore të Sonikatorit të Pjatave me Shumë Pushta UIP400MTP
| Sonikim me Kapacitet të Lartë | I përshtatshëm në mënyrë të përkryer për pjatat me 96 pushta dhe pjata të tjera me shumë pushta, UIP400MTP lejon sonikim të njëkohshëm dhe identik të mostrave të shumta, duke shkurtuar ndjeshëm kohëzgjatjen e përgatitjes së mostrave dhe duke rritur kapacitetin e testimit të numrave të lartë të mostrave. |
| Përdorni Pjatën me Shumë Pushta që Dëshironi | UIP400MTP është projektuar për të sonikuar çdo pjatë standarde me shumë pushta, pjata PCR, ose pjata mikro-titer. Ju zgjidhni pjatën më të përshtatshme për eksperimentet tuaja. Meqenëse UIP400MTP nuk kërkon materiale konsumi proprietare, kjo ju kursen shumë para! |
| Ultrasonikim Pa Kontakt | Sonikator i Pjatave me Shumë Pushta UIP400MTP aplikon ultratinguj të intensitetit të lartë pa futur asgjë në mostër. Ju mund të sonikoni pjata me shumë pushta të mbyllura, enë dhe shishe të mbyllura. Hielscher ju ofron mbajtëse mostra të personalizuara për çdo shishe ose enë jo-standard. |
| Precizion dhe Kontroll | Kontrolli i precizionit dhe softueri inteligjent ju lejojnë të vendosni parametrat ultrasonikë për t’iu përshtatur në mënyrë optimale nevojave specifike të procesimit tuaj. Ju merrni efikasitet dhe efektivitet maksimal sonikimi për çdo eksperiment. |
| Kontrolli i Temperaturës | Vendosni një temperaturë specifike për sonikimin tuaj. Sonikator i pjatave UIP400MTP mund të monitorojë temperaturën e mostrës dhe të rregullojë sonikimin përkatësisht. Një lëng ftohës recirkulues ftoh çdo pusht në pjatë për kontroll të preciz të temperaturës. |
| Protokollim dhe Kontroll i Largët | Çdo cikël sonikimi mund të kontrollohet nga një kompjuter. Nuk nevojitet instalim softueri. Ju mund të përdorni browserin tuaj standard (p.sh. Chrome, Firefox, Edge ose Safari) në çdo sistem operativ (p.sh. MacOS, Windows, Android, iOS ose Linux) për të kontrolluar dhe monitoruar UIP400MTP në mënyrë të largët. Çdo cikël sonikimi prodhon një protokol të detajuar sonikimi për vlerësim dhe dokumentim. Skedari i protokolit është në format CSV jo-proprietar, që mund ta hapni me programin tuaj të preferuar, p.sh. Microsoft Excel, Apple Numbers, ose OpenOffice Calc. |
| I Fortë dhe i Besueshëm | I projektuar dhe i ndërtuar në Gjermani sipas standardeve më të larta të cilësisë, UIP400MTP nuk është vetëm i fuqishëm, por gjithashtu jashtëzakonisht i qëndrueshëm. Projektimi i tij plotëson standardet industriale dhe i reziston lehtësisht rigorozeve të përdorimit të përditshëm në një mjedis laboratorik kërkesues. Ju mund të përdorni UIP400MTP vazhdimisht 24 orë, 7 ditë në javë në operacione me kapacitet të lartë. |
- efikasitet i lartë
- teknologji e avancuar
- besueshmëri & qëndrueshmëri
- kontroll i procesit i rregullueshëm, i preciz
- softuer inteligjent
- karakteristika të zgjuara (p.sh., programim, protokolim të dhënash, kontroll në distancë)
- e lehtë dhe e sigurt për t’u përdorur
- mirëmbajtje e ulët
- CIP (pastrim në vend)
Dizajn, Prodhim dhe Konsulencë – Cilësi e Bërë në Gjermani
Ultrasonikatorët Hielscher janë të njohur për standardet e tyre më të larta të cilësisë dhe dizajnit. Qëndrueshmëria dhe operimi i lehtë lejojnë integrimin e qetë të ultrasonikatorëve tanë në impiantet industriale. Kushtet e vështira dhe ambientet kërkesëse përballen lehtësisht nga ultrasonikatorët Hielscher.
Hielscher Ultrasonics është një kompani e certifikuar ISO dhe i jep rëndësi të veçantë ultrasonikatorëve me performancë të lartë që karakterizohen nga teknologji moderne dhe lehtësi përdorimi. Natyrisht, ultrasonikatorët Hielscher janë në përputhje me CE dhe plotësojnë kërkesat e UL, CSA dhe RoHs.
Sonikator pa kontakt UIP400MTP për përgatitjen e mostrave metabolomike në mikroplate.
Literatura / Referencat
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Pyetje të Shpeshta rreth Kërkimit Metabolomik
Çfarë është Mikrobioma?
Mikrobioma i referohet komunitetit kolektiv të mikroorganizmave, duke përfshirë bakteret, viruset, kërpudhat dhe arkeat, si dhe materialin e tyre gjenetik, që banojnë në një mjedis të caktuar, siç është trupi i njeriut. Ajo luan role kritike në shëndetin e hostit duke ndikur në metabolizëm, funksionin imunitar dhe mbrojtjen kundër patogjenëve, ndërsa formohet nga faktorë si dieta, stili i jetesës dhe mjedisi.
Çfarë është Metabolomika?
Metabolomika është studimi i plotë i metaboliteve, të cilat janë molekula të vogla të prodhuara gjatë proceseve metabolike brenda një sistemi biologjik. Ajo përfshin identifikimin, sasiun dhe analizën e këtyre molekulave për të kuptuar funksionet qelizore, rrugët metabolike dhe mënyrën se si ato përgjigjen ndaj ndryshimeve gjenetike, mjedisore ose patologjike.
Çfarë është Metaboloma?
Metaboloma është grupi i plotë i molekulave të vogla, ose metaboliteve, të pranishme brenda një sistemi biologjik, siç është një qelizë, ind ose organizëm, në një kohë të caktuar. Ajo pasqyron aktivitetin biokimik dhe gjendjen fiziologjike të sistemit, duke ofruar njohuri mbi metabolizmin dhe ndërveprimet e tij me mjedisin.
Hielscher Ultrasonics prodhon homogenizues ultrasonik me performancë të lartë nga laboratori në madhësi industriale.