Metabolomika e Lehtësuar nga Sonication me Përpunim të Lartë
Metabolomika është fusha e kërkimit që përdor teknika të performancës së lartë për të karakterizuar dhe për të përcaktuar sasinë e molekulave të vogla në biofluide të ndryshme, si urina, serumi, plazma, feces dhe pështyma, duke zbuluar nënshkrime unike metabolike. Sonicatori me fuqi të lartë UIP400MTP, i projektuar për pllaka me shumë pus, është një mjet i fuqishëm për lizimin e qelizave në këto mostra, duke lehtësuar lirimin e metabolitëve për analiza në rrjedhën e poshtme. Kjo qasje e saktë dhe e besueshme është thelbësore për metabolomikën, ku dizajni i saktë i studimit, përgatitja e përpiktë e mostrës, konfigurimi i optimizuar i platformës, analiza gjithëpërfshirëse e të dhënave dhe interpretimi kuptimplotë biologjik janë parësorë. Metabolomika përdor të dy qasjet e synuara, të cilat fokusohen në klasa specifike të molekulave si karbohidratet, lipidet dhe aminoacidet, dhe teknikat jo të synuara, të cilat ofrojnë një pasqyrë të gjerë të profileve metabolike brenda një kampioni, duke zbuluar kompleksitetin e ndërlikuar të sinjalizimit metabolik.
UIP400MTP është një sonikator pa kontakt, me fuqi të lartë për lizën e qelizave dhe nxjerrjen e metabolitëve në pllaka me shumë pusi
Përgatitja e mostrës me performancë të lartë me Sonicatorin 96-puse UIP400MTP
Përdorimi i sonikatorit pa kontakt UIP400MTP në kombinim me pllaka 96 pusesh është një metodë efikase për homogjenizimin me fuqi të lartë dhe nxjerrjen e metabolitëve. Ky konfigurim shmang kontaktin e drejtpërdrejtë me kampionin, duke reduktuar rrezikun e ndotjes së kryqëzuar gjatë përpunimit të disa mostrave në të njëjtën kohë.
Protokolli hap pas hapi për homogjenizim me 96-pus Sonicator UIP400MTP
- Përgatitja e mostrave metabolike
Vendosja e mostrës: Shpërndani çdo mostër (p.sh., feçet, indet e zorrëve ose përmbajtjet luminale) në puse individuale të një pllake ose mikropllake 96 pusesh.
Tretës: Tretësit organikë, si metanoli, etanoli, acetonitrili, kloroformi dhe përzierjet e tyre (ujore), janë thelbësore për nxjerrjen e metabolitëve, duke ndihmuar në çlirimin e metabolitëve ndërqelizor nga matrica qelizore. Përdorni 100–300 µL tretës për pus, duke siguruar vëllim të mjaftueshëm për të zhytur plotësisht kampionin.
Standardet e brendshme: Opsionale, shtoni standardet e brendshme në çdo pus për normalizim gjatë analizës metabolike në rrjedhën e poshtme. - Konfigurimi mesatar i bashkimit
Niveli i ujit: Vendoseni pllakën 96 pusesh në platformën e sonikimit të mbushur me ujë (mjedisi bashkues) siç përshkruhet në manual. - Konfigurimi i parametrit UIP400MTP
Cilësimet e energjisë: Rregulloni amplituda tejzanor në 50-80% të fuqisë maksimale për homogjenizim efikas.
Modaliteti i pulsit: Vendosni ciklin e tingullit në pulse alternative (p.sh., 30 sekonda AKTIV, 30 sekonda FIKUR) për të lejuar ftohjen dhe për të parandaluar mbinxehjen e mostrës.
Koha totale: 4–10 minuta, në varësi të kompleksitetit dhe rezistencës së mostrës.
Kontrolli i temperaturës: Përdorni një ftohës laboratori për të mbajtur ujin në 4–8°C gjatë sonikimit për të mbrojtur metabolitët e ndjeshëm ndaj nxehtësisë. - procesi i sonikimit
Nisni UIP400MTP për ciklet e zërit.
Monitoroni procesin përmes ndërfaqes UIP400MTP.
Efekti i kavitacionit do të homogjenizojë mostrat dhe do të lizojë qelizat brenda puseve, duke lëshuar metabolitët ndërqelizor në tretës. - PostSonication
Centrifugimi: Pas sonikimit, transferoni përmbajtjen e pllakës në tubat e grumbullimit nëse është e nevojshme. Centrifugoni në 4,000–6,000 × g për 10 minuta për të grumbulluar mbetjet e patretshme dhe materialin qelizor.
Koleksioni i Supernatantit: Transferoni me kujdes supernatantin nga çdo pus në tuba ose pllaka të reja për analizë.
Tharje opsionale: Thani supernatantët duke përdorur një koncentrues vakum (p.sh. SpeedVac) nëse kërkohet përqendrim, atëherë rikonstituoni në një vëllim të vogël të tretësit të duhur.
Përfitoni nga kapaciteti i përpunimit me performancë të lartë të sonikatorit të pllakave me shumë pllakë UIP400MTP dhe lehtësoni kërkimin dhe analizën tuaj metabolike!
UIP400MTP sonikator me performancë të lartë për kërkime metabolike në pjata me shumë pusi, pjata 96 pusesh, tuba dhe enët Petri.
UIP400MTP Sonicator i pllakave Multiwell për përgatitjen e mostrës me performancë të lartë në kërkimet metabolike.
Parimi i tingullit pa kontakt me UIP400MTP
UIP400MTP aplikon valë tejzanor në puset e një pllake 96 pusesh në mënyrë indirekte nëpërmjet një mediumi bashkues (p.sh. uji). Këto valë krijojnë kavitacion, i cili prish qelizat dhe çliron metabolitët pa kontakt fizik midis sondës së sonikatorit dhe kampionit.
“Po ju shkruaj për t'ju falënderuar për përvojën tonë fantastike duke përdorur sonikatorin tuaj UIP400MTP për lizën uniforme dhe të qëndrueshme bakteriale të mostrave të mikrobiomës fekale. Ne po e shtyjmë zarfin për teknologjinë e lizës me kapacitet të lartë dhe instrumenti juaj është i përshtatshëm për këtë detyrë. Disa nga pikat kryesore janë:
- Lehtësia e funksionimit – instrumenti është i lehtë për t'u përdorur dhe personalizimi është i thjeshtë duke përdorur zgjedhjet e menysë
- xhiros e lartë – i shkëlqyer për trajtimin e pllakave, me 96 mostra në të njëjtën kohë
- Edhe sonikimi i të gjitha enëve – pajisja ishte në gjendje të jepte të njëjtën sasi sonikimi në të gjitha puset, gjë që ishte thelbësore për aplikimin tonë
- Mbështetje nga ekipi Hielscher – mbështetja ishte e shkëlqyer, ju keni qenë gjithmonë pranë nesh në trajnime, për t'iu përgjigjur pyetjeve tona dhe për të adresuar problemet, me sugjerime që na ndihmuan të arrijmë në qëllimin tonë.
Faleminderit përsëri për ndihmën dhe ndihmën tuaj ndërsa punuam për të optimizuar protokollet tona.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Kryeshefi Shkencor – Intus Biosciences
Sonicatori me pllaka me shumë pllakë UIP400MTP lehtëson përgatitjen e mostrës me performancë të lartë, p.sh. në kërkimin dhe analizën e metabolitëve.
Sonicator me pllaka 96 pusesh UIP400MTP: Lëngu transmetues i ultrazërit rrethon të gjitha puset dhe siguron sonikacion uniform të çdo kampioni
Karakteristikat kryesore të Sonicatorit me pllaka me shumë puse UIP400MTP
| sonikacion me fuqi të lartë | I përshtatshëm në mënyrë perfekte për pllaka 96 pusesh dhe pllaka të tjera me shumë pus, UIP400MTP lejon sonifikimin e njëkohshëm, identik të mostrave të shumta, duke shkurtuar ndjeshëm kohëzgjatjen e përgatitjes së kampionit dhe duke rritur xhiron e testimit të numrit të lartë të mostrës. |
| Përdorni Pllakën Multiwell sipas zgjedhjes suaj | UIP400MTP është projektuar për të sonikuar çdo pllakë standarde me shumë pus, pllakë PCR ose pllakë mikrotitërore. Ju zgjidhni pjatën më të përshtatshme për eksperimentet tuaja. Meqenëse UIP400MTP nuk kërkon materiale konsumuese të pronarit, kjo ju kursen shumë para! |
| Ultratinguj pa kontakt | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP aplikon ultratinguj intensivë pa futur asgjë në mostër. Mund t'i sonikoni pllakat e ealuara me shumë pusi, enët e mbyllura dhe shishkat. Hielscher ju furnizon mbajtës të mostrave të personalizuara për çdo shishe ose enë jo standarde. |
| Preciziteti dhe Kontrolli | Kontrolli i saktë dhe softueri inteligjent ju lejon të vendosni parametrat tejzanor për t'iu përshtatur në mënyrë optimale nevojave tuaja specifike të përpunimit. Ju merrni efikasitetin dhe efektivitetin maksimal të sonikimit për çdo eksperiment. |
| kontrollin e temperaturës | Vendosni një temperaturë specifike për sonikimin tuaj. Sonicatori i pllakave UIP400MTP mund të monitorojë temperaturën e mostrës dhe të rregullojë tingullin në përputhje me rrethanat. Një lëng ftohës riqarkullues ftoh çdo pus në pjatë për kontroll të saktë të temperaturës. |
| Protokolim dhe telekomandë | Çdo ekzekutim i sonication mund të kontrollohet nga një kompjuter. Nuk nevojitet instalim i softuerit. Ju mund të përdorni shfletuesin tuaj standard (p.sh. Chrome, Firefox, Edge ose Safari) në çdo sistem operativ (p.sh. MacOS, Windows, Android, iOS ose Linux) për të kontrolluar dhe monitoruar UIP400MTP nga distanca. Çdo ekzekutim i sonication prodhon një protokoll të detajuar sonication për vlerësim dhe dokumentacion. Skedari i protokollit është në një format CSV jo të pronarit, të cilin mund ta hapni me programin tuaj të preferuar, p.sh. Microsoft Excel, Apple Numbers ose OpenOffice Calc. |
| E fortë dhe e besueshme | I projektuar dhe ndërtuar në Gjermani sipas standardeve më të larta të cilësisë, UIP400MTP nuk është vetëm i fuqishëm, por edhe jashtëzakonisht i qëndrueshëm. Dizajni i tij përmbush standardet industriale dhe përballon lehtësisht ashpërsinë e përdorimit të përditshëm në një mjedis laboratorik kërkues. Ju mund ta përdorni UIP400MTP vazhdimisht 24 orë, 7 ditë në javë në operacione me shpejtësi të lartë. |
- efikasitet të lartë
- teknologjinë më të fundit
- besueshmëria & qëndrueshmëri
- kontroll i rregullueshëm, i saktë i procesit
- softuer inteligjent
- veçoritë inteligjente (p.sh., të programueshme, protokollimi i të dhënave, telekomanda)
- e lehtë dhe e sigurt për t'u përdorur
- mirëmbajtje e ulët
- CIP (i pastër në vend)
Dizajn, Prodhim dhe Konsulencë – Cilësi e prodhuar në Gjermani
Ultrasonikët Hielscher janë të njohur për cilësinë e tyre më të lartë dhe standardet e dizajnit. Qëndrueshmëria dhe funksionimi i lehtë lejojnë integrimin e qetë të ultrasonikëve tanë në objektet industriale. Kushtet e vështira dhe mjediset kërkuese trajtohen lehtësisht nga ultrasonikët Hielscher.
Hielscher Ultrasonics është një kompani e certifikuar ISO dhe i kushton theks të veçantë ultratingujve me performancë të lartë që paraqesin teknologjinë më të fundit dhe lehtësinë ndaj përdorimit. Sigurisht, ultrasonikët Hielscher janë në përputhje me CE dhe plotësojnë kërkesat e UL, CSA dhe RoHs.
Sonicator pa kontakt UIP400MTP për përgatitjen e mostrës metabolike në mikropllaka.
Literatura / Referencat
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Pyetjet e bëra më shpesh në lidhje me kërkimin metabolik
Çfarë është mikrobioma?
Mikrobioma i referohet komunitetit kolektiv të mikroorganizmave, duke përfshirë bakteret, viruset, kërpudhat dhe arkeat, si dhe materialin e tyre gjenetik, që banojnë në një mjedis të caktuar, siç është trupi i njeriut. Ai luan role kritike në shëndetin e bujtësit duke ndikuar në metabolizmin, funksionin imunitar dhe mbrojtjen kundër patogjenëve, ndërkohë që formohet nga faktorë të tillë si dieta, mënyra e jetesës dhe mjedisi.
Çfarë është Metabolomika?
Metabolomika është studimi gjithëpërfshirës i metabolitëve, të cilët janë molekula të vogla të prodhuara gjatë proceseve metabolike brenda një sistemi biologjik. Ai përfshin identifikimin, kuantifikimin dhe analizën e këtyre molekulave për të kuptuar funksionet qelizore, rrugët metabolike dhe mënyrën se si ato reagojnë ndaj ndryshimeve gjenetike, mjedisore ose patologjike.
Çfarë është Metabolome?
Metaboloma është grupi i plotë i molekulave të vogla ose metabolitëve, të pranishëm brenda një sistemi biologjik, si një qelizë, ind ose organizëm, në një kohë të caktuar. Ai pasqyron aktivitetin biokimik dhe gjendjen fiziologjike të sistemit, duke ofruar njohuri për metabolizmin dhe ndërveprimet e tij me mjedisin.
Hielscher Ultrasonics prodhon homogjenizues tejzanor me performancë të lartë nga laboratori te madhësia industriale.