ცილოვანი გრანულების ულტრაბგერითი ხსნადობა
პროტეომიკაში ნიმუშის მომზადება არასდროს არის უმნიშვნელო დეტალი. ეს არის საფუძველი, რომელზეც აგებულია იდენტიფიკაციის სიზუსტე, რაოდენობრივი განსაზღვრის სანდოობა და რეპროდუცირება. ცილის ნიმუშის მომზადების ერთ-ერთი ყველაზე მუდმივი გამოწვევაა ცილის გრანულების ეფექტური ხელახალი გახსნა დალექვის ან კონცენტრაციის ეტაპების შემდეგ. სწორედ აქ ხდება ცილის გრანულების ულტრაბგერითი გახსნა სულ უფრო მნიშვნელოვანი. კონტროლირებადი ულტრაბგერითი მეთოდის გამოყენებით, ლაბორატორიებს შეუძლიათ გააუმჯობესონ ცილის აღდგენა, დააჩქარონ გრანულების გახსნა და უფრო ეფექტურად მოამზადონ ნიმუშები მას-სპექტრომეტრიისა და ბიოქიმიური ანალიზისთვის.
ცილის ხსნადობა: რატომ არის სონიკაცია მნიშვნელოვანი თანამედროვე პროტეომიკაში
ცილის გრანულები ხშირად წარმოიქმნება აცეტონის, ეთანოლის, მეთანოლ-ქლოროფორმის, ამონიუმის სულფატის ან TCA-ს დალექვის დროს. ეს სამუშაო პროცესები ფართოდ გამოიყენება დამაბინძურებლების მოსაშორებლად, ცილების კონცენტრირებისა და ექსტრაქტების გასაწმენდად ანალიზამდე. თუმცა, დალექვის დასრულების შემდეგ, შედეგად მიღებული გრანულის ხელახლა გახსნა შეიძლება რთული იყოს. მკვრივი აგრეგატები, ჰიდროფობიური დომენები, მემბრანასთან ასოცირებული ცილები და ძლიერად ურთიერთქმედი ცილოვანი კომპლექსები ხშირად ეწინააღმდეგებიან ჩვეულებრივ შერევას ან მორევას. არასრული გახსნა შეიძლება გამოიწვიოს ნიმუშის დაკარგვა, ცილების მიკერძოებული წარმოდგენა და ცუდი რეპროდუცირება ექსპერიმენტებს შორის.
სონიკაცია სწორედ ამ შემაფერხებელ პრობლემას აგვარებს. თხევად გარემოში მექანიკური ენერგიის გენერირების გზით, სონიკაცია არღვევს კომპაქტურ გრანულების სტრუქტურებს, ხელს უწყობს ბუფერის შეღწევას და აგრეგირებული მასალის ხსნარში გაფანტვას. შედეგად, ცილების უფრო სწრაფი და ხშირად უფრო სრული აღდგენა ხდება, რაც განსაკუთრებით ღირებულია შეზღუდული რაოდენობის ნიმუშებთან, რთულ ლიზატებთან ან პროტეომიკურ სამიზნეებთან მუშაობისას.
მიკროფირფიტის სონიკატორი UIP400MTP ცილის ექსტრაქციისა და გრანულების ხსნარისთვის
რატომ არის ცილის გრანულების ხსნადობა რთული
ცილის დალექვა ეფექტურია, რადგან ის ცილებს ხსნარიდან გამოჰყავს. თუმცა, იგივე პროცესი, რაც დალექვას სასარგებლოს ხდის, ასევე ქმნის გრანულების აღდგენის პრობლემას. გრანულების დალექვის შემდეგ, ცილები შეიძლება მჭიდროდ შეიკვროს და ნაწილობრივ დენატურირებული გახდეს. ჰიდროფობიური ურთიერთქმედებები შეიძლება გაძლიერდეს, მოლეკულათშორისი შეკავშირება გაიზარდოს და ზოგიერთმა ცილამ შეიძლება შეინარჩუნოს მარილები, ლიპიდები, ნუკლეინის მჟავები ან მატრიქსის სხვა კომპონენტები. ძლიერი ხსნადობის ბუფერის გამოყენების შემთხვევაშიც კი, პასიური რესუსპენზია ხშირად ნელი და არასრულია.
პროტეომიკაში ეს მნიშვნელოვანია, რადგან გრანულების არასრული გახსნა არა მხოლოდ ამცირებს საერთო მოსავლიანობას. მას შეუძლია შერჩევითად გამორიცხოს ცილების გარკვეული კლასები, განსაკუთრებით მემბრანული ცილები, სტრუქტურული ცილები ან აგრეგაციისკენ მიდრეკილი სახეობები. ეს ნიშნავს, რომ საბოლოო ანალიტიკური შედეგი შეიძლება აღარ ასახავდეს ორიგინალური ნიმუშის ნამდვილ შემადგენლობას. მაღალი გარჩევადობის პროტეომიკაში, სადაც სიმრავლის ან ტრანსლაციური მოდიფიკაციის დახვეწილი განსხვავებები შეიძლება ბიოლოგიურად გადამწყვეტი იყოს, მომზადების ასეთი მიკერძოება სერიოზულ შეზღუდვას წარმოადგენს.
როგორ აუმჯობესებს სონიკაცია ცილის გრანულების ხსნადობას
ულტრაბგერითი დამუშავება აუმჯობესებს ხსნადობას ნიმუშში მაღალი სიხშირის მექანიკური ენერგიის შეყვანით. ეს ენერგია ხელს უწყობს კომპაქტური გრანულის მასალის დაშლას და ზრდის კონტაქტს ხსნადობის ბუფერსა და ჩაშენებულ ცილებს შორის. მხოლოდ დიფუზიასა და ხელით შერევაზე დაყრდნობის ნაცვლად, პროცესი აქტიურად ფანტავს გრანულას უფრო მცირე ფრაქციებად, რომლებიც უფრო ადვილად იხსნება.
პრაქტიკული ეფექტი მნიშვნელოვანია. ულტრაბგერით სონიკაციას შეუძლია:
- დააჩქაროს მკვრივი ან ჯიუტი ცილოვანი გრანულების დაშლა
- ცუდად ხსნადი და აგრეგირებული ცილების აღდგენის გაუმჯობესება
- პროტეომიკის სამუშაო პროცესებში მომზადების დროის შემცირება
- მონელებისა და ანალიზისთვის უფრო ერთგვაროვანი ნიმუშების მხარდაჭერა
ეს გაძლიერებული დისპერსია განსაკუთრებით სასარგებლოა, როდესაც გრანულები ხელახლა სუსპენზირდება შარდოვანას, თიოშარდოვანას, სარეცხი საშუალებების, ქაოტროპების ან პროტეომიკაში ხშირად გამოყენებული სხვა რეაგენტების შემცველ ბუფერებში. ულტრაბგერითი გამოსხივება ეხმარება ამ კომპონენტებს უფრო ეფექტურად მიაღწიონ და გაიხსნან გრანულა, რაც იწვევს უფრო ერთგვაროვანი ნიმუშის ხსნარის წარმოქმნას.
ულტრაბგერითი ხსნადობის უპირატესობები პროტეომიკაში
ულტრაბგერითი ხსნარის მთავარი უპირატესობა ის არის, რომ ის ხშირად არასაკმარისად შეფასებულ მომზადების ეტაპს კონტროლირებად და ეფექტურ პროცესად აქცევს. პროტეომიკაში ამას პირდაპირი ანალიტიკური შედეგები აქვს.
- პირველ რიგში, გაუმჯობესებული ხსნადობა ზრდის იმის ალბათობას, რომ ფერმენტულ დაშლაში შესული ნიმუში წარმოადგენდეს ცილის სრულ პოპულაციას. მაგალითად, ტრიფსინის დაშლა დამოკიდებულია იმაზე, თუ რამდენად ადეკვატურად არის გაშლილი და ხელმისაწვდომი ხსნარში. თუ ნალექის ნაწილები გაუხსნელი რჩება, ეს ცილები ეფექტურად გამოირიცხება პეპტიდების გენერირებისა და შესაბამისად, აღმოჩენისგან.
- მეორეც, ულტრაბგერითი დამუშავება აუმჯობესებს რეპროდუცირებადობას. გრანულების ხელით რესუსპენზია თავისთავად ცვალებადია, განსაკუთრებით მაშინ, როდესაც საქმე სხვადასხვა ოპერატორს, გრანულების ზომას ან ნიმუშის მატრიცებს ეხება. კონტროლირებადი ულტრაბგერითი დამუშავება სტანდარტიზაციას უკეთებს ნიმუშზე მიწოდებულ ფიზიკურ ენერგიას, რამაც შეიძლება შეამციროს ცვალებადობა პრეპარატებს შორის და გააუმჯობესოს თანმიმდევრულობა LC-MS ან გელზე დაფუძნებული სამუშაო პროცესების შემდგომ ეტაპზე.
- მესამე, ულტრაბგერითი გამოკვლევა ძალიან ღირებულია დაბალი შეყვანის და ძვირფასი ნიმუშებისთვის. კლინიკური პროტეომიკა, ბიომარკერების აღმოჩენა, უჯრედული კულტურის ექსპერიმენტები და ქსოვილების კვლევები ხშირად შეზღუდული მასალის გამოყენებას ეყრდნობა. ხსნადობის დროს ცილის ნებისმიერი დანაკარგი ამცირებს ნიმუშის ინფორმაციულ ღირებულებას. ეფექტური ულტრაბგერითი ხელახალი გახსნა ხელს უწყობს ანალიტის რაც შეიძლება მეტი რაოდენობის შენარჩუნებას.
- და ბოლოს, ულტრაბგერითი მეთოდი ხელს უწყობს სამუშაო პროცესის სისწრაფეს. პროტეომიკის ლაბორატორიებში, რომლებიც ამუშავებენ მრავალ ნიმუშს, საჭიროა მომზადების საიმედო, დროის ეფექტური მეთოდები. სწრაფად და სრულად ხსნადი გრანულა არა მხოლოდ მოსახერხებელია; ის ამცირებს შეფერხებებს, ამცირებს შეცდომების დამუშავების რისკს და აუმჯობესებს გამტარუნარიანობას.
სონიკაცია ჩვეულებრივი რესუსპენზიის მეთოდების წინააღმდეგ
ტრადიციული გრანულების რესუსპენზიის მეთოდები, როგორც წესი, მოიცავს პიპეტირებას, მორევას, მორევას, ხანგრძლივ ინკუბაციას ან განმეორებით გათბობის ეტაპებს. მიუხედავად იმისა, რომ ეს ტექნიკა შეიძლება ეფექტური იყოს ფხვიერად შეფუთული გრანულებისთვის, ისინი ხშირად უჭირთ მაღალკომპაქტურ ან ჰიდროფობულ ცილოვან მასალასთან მუშაობას. მხოლოდ მექანიკური შერევით შესაძლოა ვერ მოხერხდეს გრანულის სტრუქტურის სრულად დაშლა, რის შედეგადაც რჩება ხილული ნაწილაკები ან უხილავი უხსნადი ფრაქციები.
სონიკაცია უფრო აქტიურ და მიზანმიმართულ მიდგომას უზრუნველყოფს. ნელ ბუფერულ დიფუზიაზე დაყრდნობის ნაცვლად, ის ფიზიკურად არღვევს ნალექს და ხელს უწყობს სწრაფ ჰომოგენიზაციას. ეს არ გამორიცხავს შესაბამისი რესუსპენზიის ბუფერის საჭიროებას, მაგრამ მნიშვნელოვნად აუმჯობესებს ამ ბუფერის მუშაობას.
წმინდა მანუალურ მეთოდებთან შედარებით, ულტრაბგერითი ხსნარით მკურნალობა ხშირად გვთავაზობს უკეთეს პროცესის კონტროლს, უფრო მეტ ეფექტურობას და გაუმჯობესებულ შესაბამისობას პროტეომიკის მომთხოვნი აპლიკაციებისთვის. ლაბორატორიებისთვის, რომლებიც ეძებენ როგორც ანალიტიკურ ხარისხს, ასევე ოპერაციულ სანდოობას, ეს ულტრაბგერით მკურნალობას მიმზიდველ არჩევნად აქცევს.
ულტრაბგერითი ცილის გრანულების ხსნადობის საუკეთესო გამოყენების შემთხვევები
ულტრაბგერითი ხსნარი განსაკუთრებით სასარგებლოა სამუშაო პროცესებში, რომლებიც მოიცავს:
- ცილის ნალექი მას-სპექტრომეტრიამდე,
- უჯრედული ლიზატებიდან ან ქსოვილის ექსტრაქტებიდან გრანულების აღდგენა,
- მემბრანული მდიდარი ან აგრეგაციისკენ მიდრეკილი ცილების აღდგენა,
- და ნიმუშის მომზადება რაოდენობრივი პროტეომიკისთვის, სადაც რეპროდუცირება აუცილებელია.
ეს ასევე ძალიან აქტუალურია, როდესაც გრანულები შენახულია, ძალიან ძლიერად გამომშრალია ან დამზადებულია რთული ბიოლოგიური მატრიცებისგან. ასეთ შემთხვევებში, პასიური რესუსპენზია შეიძლება განსაკუთრებით არაეფექტური გახდეს, მაშინ როდესაც ულტრაბგერითი თერაპია ხელს უწყობს ნიმუშის გამოყენებადობის აღდგენას ნაკლები ხელით ჩარევით.
VialTweeter sonicator 10 ნიმუშის ერთდროული სონიკაციისთვის, მაგ. ცილის ექსტრაქციისა და ხსნადობისთვის
იპოვეთ საუკეთესო სონიკატორი თქვენი ცილის ხსნარის სამუშაო პროცესისთვის!
ძვირფასი ნიმუშებით, დაბალი შეყვანის მასალით ან მაღალი გამტარუნარიანობის პროტეომიკით მომუშავე ლაბორატორიებისთვის, Hielscher-ის პორტფოლიო გთავაზობთ რამდენიმე სონიკაციის ფორმატს, რომელთა ზუსტად შესაბამისობაში მოყვანა შესაძლებელია სამუშაო პროცესთან.
აირჩევთ თუ არა Hielscher-ის ზონდის ტიპის სონიკატორს, VialTweeter-ის მრავალმილისებრ სონიკატორს თუ UIP400MTP მიკროპლატე სონიკატორს? – თითოეული ულტრაბგერითი მოდელი მიმართავს სხვადასხვა ნიმუშის მომზადების სცენარს, ხოლო იგივე ძირითადი უპირატესობის გაზიარებით: რეპროდუცირებადი ულტრაბგერითი ენერგია ეფექტური და კონტროლირებადი ნიმუშის დამუშავებისთვის.
ზონდის ტიპის Sonicators
ულტრაბგერითი ზონდები, როგორიცაა UP200Ht, განსაკუთრებით კარგად შეეფერება ინდივიდუალური ნიმუშების პირდაპირი ულტრაბგერითი დამუშავებისთვის. პროტეომიკის ლაბორატორიებისთვის, UP200Ht არის ძლიერი არჩევანი, როდესაც ცილის გრანულებს სჭირდებათ ინტენსიური რესუსპენზია მცირე და საშუალო მოცულობებში, განსაკუთრებით იქ, სადაც მეთოდის კონტროლი და განმეორებადობა მნიშვნელოვანია. პირდაპირი ზონდის ულტრაბგერითი დამუშავება შეიძლება სწრაფად დაარღვიოს კომპაქტური გრანულის მასალა და დაეხმაროს ხსნადობის ბუფერებს წვდომაში ცილებზე, რომლებიც სხვა შემთხვევაში ნაწილობრივ გაუხსნელი დარჩებოდა.
ყველა ზონდის ტიპის სონიკატორის მიმოხილვა!
VialTweeter Multi-Tube Sonicator
იმ შემთხვევაში, თუ რამდენიმე დახურული ფლაკონის დამუშავება იდენტურ პირობებშია საჭირო, მრავალმილის სონიკატორი VialTweeter-ს აშკარა უპირატესობა აქვს. VialTweeter საშუალებას იძლევა მცირე მოცულობის ინტენსიური სონიკაციის, სტერილურ პირობებში რამდენიმე დახურული ფლაკონის სონიკაციის გზით. ნიმუშის ერთდროული მომზადება მრავალ საცდელ მილში ერთსა და იმავე პირობებში, ასევე ჯვარედინი დაბინძურების, ნიმუშის დაკარგვის და აეროზოლის წარმოქმნის შემცირებული რისკი დახურული ფლაკონის დამუშავების დროს VialTweeter-ს ნიმუშის მომზადების საიმედო ინსტრუმენტად აქცევს. პროტეომიკისთვის ეს ძალიან მნიშვნელოვანია მრავალი რეპლიკიდან ან კლინიკური ნიმუშებიდან ძვირფასი გრანულების დამუშავებისას, სადაც მილებს შორის თანმიმდევრულობა კრიტიკულად მნიშვნელოვანია.
შეიტყვეთ მეტი VialTweeter-ის შესახებ!
მიკროფირფიტის სონიკატორი UIP400MTP
მაღალი გამტარუნარიანობის ლაბორატორიებისთვის, UIP400MTP მიკროპლატეების სონიკატორი აფართოებს სონიკაციის სარგებელს ფირფიტებზე დაფუძნებულ სამუშაო პროცესებში. UIP400MTP, როგორც მიკროპლატეების და მრავალჭაბურღილიანი ფირფიტების სონიკატორი, სტანდარტულ ფირფიტებზე ერთგვაროვანი ულტრაბგერითი დამუშავებისთვის, მათ შორის 96-ჭაბურღილის ფორმატებში, ხაზს უსვამს მის ვარგისიანობას ავტომატური ნიმუშების მომზადებისთვის ისეთ სფეროებში, როგორიცაა პროტეომიკა, დიაგნოსტიკა და წამლის აღმოჩენა. პლატფორმა შექმნილია მრავალი ნიმუშის ერთდროული დამუშავებისთვის, ისეთი უპირატესობებით, როგორიცაა ჯვარედინი დაბინძურების რისკის შემცირება, შრომის დაბალი ინტენსივობა, ნიმუშის აღდგენის გაუმჯობესება და ავტომატიზირებულ სამუშაო პროცესებში ინტეგრაცია.
პრაქტიკულ პროტეომიკაში ეს ნიშნავს, რომ გრანულების ხსნარის, უჯრედის ლიზისის, ექსტრაქციის და მასთან დაკავშირებული მომზადების ეტაპების მასშტაბირება გაცილებით ეფექტურად შეიძლება. ნიმუშების ერთმანეთის მიყოლებით დამუშავების ნაცვლად, ლაბორატორიებს შეუძლიათ მთელი ფირფიტების ულტრაბგერითი დამუშავება თანმიმდევრული ენერგიის შეყვანით. ეს ფასეულია მაშინ, როდესაც სამუშაო პროცესებს სჭირდება გამტარუნარიანობისა და ანალიტიკური სიზუსტის შერწყმა, მაგალითად, სკრინინგის კვლევებში, რაოდენობრივ პროტეომიკაში ან სტანდარტიზებული ნიმუშების მომზადების მილსადენებში. ამიტომ, UIP400MTP არ არის მხოლოდ მოსახერხებელი ინსტრუმენტი; ეს არის პლატფორმა, რომელიც მხარს უჭერს ავტომატიზაციის, რეპროდუცირებადობისა და მაღალი გამტარუნარიანობის პროტეომიკის უფრო ფართო ტენდენციას.
შეიტყვეთ მეტი UIP400MTP მიკროპლატე სონიკატორის შესახებ!
VialTweeter სამაცივრო პალატაში – კონტროლირებადი პროცესის პარამეტრები sonication-ის დროს.
მაღალი გამტარუნარიანობის ცილის ექსტრაქცია და ხსნადობა მიკროპლატე სონიკატორით UIP400MTP
დიზაინი, წარმოება და კონსულტაცია – ხარისხი დამზადებულია გერმანიაში
Hielscher ულტრაბგერითები ცნობილია მათი უმაღლესი ხარისხისა და დიზაინის სტანდარტებით. გამძლეობა და მარტივი მუშაობა საშუალებას იძლევა ჩვენი ულტრაბგერითი აპარატების გლუვი ინტეგრაცია სამრეწველო ობიექტებში. უხეში პირობები და მომთხოვნი გარემო ადვილად უმკლავდება Hielscher ულტრაბგერითებს.
Hielscher Ultrasonics არის ISO სერთიფიცირებული კომპანია და განსაკუთრებული აქცენტი კეთდება მაღალი ხარისხის ულტრაბგერაზე, რომელიც აღჭურვილია უახლესი ტექნოლოგიით და მომხმარებლის კეთილგანწყობით. რა თქმა უნდა, Hielscher ულტრაბგერითები შეესაბამება CE და აკმაყოფილებს UL, CSA და RoHs მოთხოვნებს.
ლიტერატურა / ლიტერატურა
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet VialTweeter – Sonicator for Simultaneous Sample Preparation
- Susana Jorge, Kevin Pereira, Hugo López-Fernández, William LaFramboise, Rajiv Dhir, Javier Fernández-Lodeiro, Carlos Lodeiro, Hugo M. Santos, Jose L. Capelo-Martínez (2020): Ultrasonic-assisted extraction and digestion of proteins from solid biopsies followed by peptide sequential extraction hyphenated to MALDI-based profiling holds the promise of distinguishing renal oncocytoma from chromophobe renal cell carcinoma. Talanta, Volume 206, 2020.
- Lindemann C, Lupilova N, Müller A, Warscheid B, Meyer HE, Kuhlmann K, Eisenacher M, Leichert LI. (2013): Redox proteomics uncovers peroxynitrite-sensitive proteins that help Escherichia coli to overcome nitrosative stress. Journal of Biological Chemistry 288(27); 2013. 19698-714.
- Gonçalo Martins, Javier Fernández-Lodeiro, Jamila Djafari, Carlos Lodeiro, J.L. Capelo, Hugo M. Santos (2019): Label-free protein quantification after ultrafast digestion of complex proteomes using ultrasonic energy and immobilized-trypsin magnetic nanoparticles. Talanta, Volume 196, 2019. 262-270.
ხშირად დასმული შეკითხვები
რატომ არ არის ულტრაბგერითი აბაზანები შესაფერისი ცილის ხსნადობისთვის?
ულტრაბგერით აბაზანებში, კავიტაცია, ულტრაბგერითი აბაზანების მუშაობის პრინციპი, ძალიან არათანაბრად ხდება, რაც იწვევს ნიმუშების განლაგებას სხვადასხვა ულტრაბგერითი დამუშავების ქვეშ. ულტრაბგერით აბაზანაში ნიმუშის მილების პოზიციიდან გამომდინარე, თითოეულ ნიმუშზე გავლენას ახდენს სხვადასხვა ინტენსივობა. პროტეომიკა დამოკიდებულია შედარებადობაზე. თუ ერთი გრანულა არასრულად არის გახსნილი, ხოლო მეორე სრულად არის რესუსპენდირებული, მიღებული მონაცემები შეიძლება ასახავდეს მომზადების მიკერძოებას და არა ნამდვილ ბიოლოგიას. ულტრაბგერითი აბაზანებისგან განსხვავებით, უკონტაქტო სონიკატორები, როგორიცაა VialTweeter ან Microplate Sonicator UIP400MTP, მხარს უჭერენ უფრო სტანდარტიზებულ დამუშავებას, რაც საშუალებას იძლევა რამდენიმე ნიმუში პარალელურად დამუშავდეს შესაბამის ულტრაბგერით პირობებში, რაც ხელს შეუწყობს რეპროდუცირებადობის გაუმჯობესებას ექსპერიმენტებს შორის. ეს განსაკუთრებით სასარგებლოა ბიომარკერების კვლევებში, შედარებით პროტეომიკაში და სამუშაო პროცესებში მრავალი ბიოლოგიური ან ტექნიკური რეპლიკაციით.
რა არის პროტეომიკაში ყველაზე გავრცელებული ანალიზები?
პროტეომიკაში ყველაზე გავრცელებული ანალიზებია ცილის რაოდენობრივი განსაზღვრის ანალიზები და ცილის დახასიათების მეთოდები, რომლებიც გამოიყენება ნიმუშის მომზადებისა და ანალიზის დროს. ხშირად გამოყენებული ანალიზებია ბრედფორდის ანალიზი, BCA ანალიზი, ლოურის ანალიზი და ულტრაიისფერი შთანთქმის მეთოდი 280 ნმ-ზე ცილის კონცენტრაციის გასაზომად. პროტეომიკის უფრო ფართო სამუშაო პროცესებში, SDS-PAGE, Western blotting, ELISA, გელშიდა დაშლის მეთოდი და მას-სპექტრომეტრიაზე დაფუძნებული ანალიზები ასევე ფართოდ გამოიყენება ცილის სიმრავლის, სიწმინდის, მოლეკულური წონისა და იდენტურობის შესაფასებლად.
რა არის Coomassie Brilliant Blue?
Coomassie Brilliant Blue არის ტრიფენილმეთანის საღებავი, რომელიც ფართოდ გამოიყენება ცილის მეცნიერებაში გელებში ცილების შესაღებად და ცილების კოლორიმეტრიული რაოდენობრივი განსაზღვრისთვის. ის ძირითადად უკავშირდება ფუძე და არომატულ ამინომჟავურ ნარჩენებს, განსაკუთრებით არგინინს, და ცილებთან შეკავშირებისას განიცდის სპექტრულ ცვლას. ეს თვისება მას სასარგებლოს ხდის როგორც ელექტროფორეზის შემდეგ ცილების ვიზუალიზაციისთვის, ასევე ბრედფორდის ცილის ანალიზისთვის.
როგორ მუშაობს ბრედფორდის ანალიზი?
ბრედფორდის ანალიზი მუშაობს ცილის ნიმუშის Coomassie Brilliant Blue საღებავთან შერევით მჟავე პირობებში. როდესაც საღებავი უკავშირდება ცილებს, მისი შთანთქმის მაქსიმუმი იცვლება დაახლოებით 465 ნმ-დან 595 ნმ-მდე, რაც იწვევს ფერის გაზომვად ცვლილებას მოწითალო-ყავისფერიდან ლურჯამდე. შთანთქმის ზრდა 595 ნმ-ზე პროპორციულია ცილის კონცენტრაციისა განსაზღვრულ დიაპაზონში, რაც საშუალებას იძლევა რაოდენობრივი განსაზღვრის სტანდარტულ მრუდთან შედარებით, რომელიც ჩვეულებრივ მზადდება მსხვილფეხა რქოსანი პირუტყვის შრატის ალბუმინით.
ნიმუშების ფოკუსირებული სონიკაცია მრავალჭაბურღიან ფირფიტებში
Hielscher Ultrasonics აწარმოებს მაღალი ხარისხის ულტრაბგერითი ჰომოგენიზატორებისგან ლაბორატორია რომ სამრეწველო ზომა.