მიკრობიომის კვლევა და კლინიკური ანალიზი გამარტივებულია Sonication-ით
Sonication არის ძლიერი ტექნიკა, რომელიც ფართოდ გამოიყენება მიკრობიომის კვლევასა და კლინიკურ ანალიზში, რაც ხელს უწყობს მაღალი გამტარუნარიანობის ნიმუშის მომზადებას. ულტრაბგერითი მეთოდი განსაკუთრებით ეფექტურია რთული ბიოლოგიური ნიმუშების დასამუშავებლად, როგორიცაა მიკროორგანიზმების შემცველი. სონიკაციის გამოყენება აადვილებს უჯრედების ლიზას, ნუკლეინის მჟავების, ცილების და მეტაბოლიტების ექსტრაქციას და ანალიზს, რაც საშუალებას იძლევა უფრო ღრმად გავიგოთ მიკრობული თემები და მათი როლი ჯანმრთელობასა და დაავადებაში. Hielscher-ის მაღალი გამტარუნარიანობის სონიკატორები ცნობილია მათი სიზუსტით, ეფექტურობითა და რეპროდუცირებადი შედეგებით, რაც მათ შესანიშნავ არჩევანს აქცევს მიკრობიომის კვლევებისთვის.
ისარგებლეთ მაღალი გამტარიანობის გაჟონვით მიკრობიომის კვლევაში
96 ჭაბურღილის თეფშიანი სონიკატორი UIP400MTP აუმჯობესებს მიკრობიომის კვლევას მაღალი წარმადობის ნიმუშის მომზადებით
მაღალი გამტარუნარიანობის ნიმუშის მომზადება 96 ჭაბურღილის ფირფიტის Sonicator UIP400MTP-ით
Sonication-ის გამოყენება მიკრობიომის კვლევაში
ეფექტური უჯრედის ლიზისი
Sonication ძალზე ეფექტურია მიკრობული უჯრედების ლიზირებისთვის, მათ შორის ხისტი უჯრედის კედლებით, როგორიცაა გრამდადებითი ბაქტერიები და სოკოები. ულტრაბგერითი ტალღები ქმნიან კავიტაციის ბუშტებს ნიმუშში, რომლებიც იშლება და ქმნის დარტყმის ტალღებს, რომლებიც არღვევს ღია უჯრედის კედლებს და გარსებს. ეს პროცესი უზრუნველყოფს უჯრედების ყოვლისმომცველ დარღვევას და უჯრედშიდა შიგთავსის ეფექტურ განთავისუფლებას, როგორიცაა დნმ, რნმ და ცილები.
კონტროლირებადი დნმ ფრაგმენტაცია
ისეთი აპლიკაციებისთვის, როგორიცაა შემდეგი თაობის თანმიმდევრობა, ხშირად საჭიროა დნმ-ის დაჭრა პატარა, ერთგვაროვან ფრაგმენტებად. Sonication უზრუნველყოფს ზუსტ კონტროლს ფრაგმენტაციის პროცესზე, რაც მკვლევარებს საშუალებას აძლევს მიიღონ სასურველი ზომის დნმ-ის ფრაგმენტები. ეს კონტროლი მნიშვნელოვანია თანმიმდევრობის ბიბლიოთეკების მოსამზადებლად და მაღალი ხარისხის თანმიმდევრობის მონაცემების უზრუნველსაყოფად.
ნიმუშების გაძლიერებული ჰომოგენიზაცია
მიკრობიომის კვლევისას, ნიმუშები ხშირად შეიცავს მიკროორგანიზმების მრავალფეროვან ნაზავს. Sonication ეხმარება მიაღწიოს ამ მიკროორგანიზმების ერთგვაროვან განაწილებას ნიმუშში, რაც უზრუნველყოფს თანმიმდევრულ და განმეორებად შედეგებს. ეს ჰომოგენიზაცია გადამწყვეტია ზუსტი რაოდენობრივი ანალიზისთვის, როგორიცაა მიკრობული სიმრავლის განსაზღვრა ან სპეციფიკური მეტაბოლური აქტივობების გაზომვა.
საიმედო მეტაბოლიტის ექსტრაქცია
სანდო მეტაბოლიტის მოპოვება გაჟღერებით არის ფართოდ გამოყენებული ტექნიკა მეტაბოლომიკაში ბიოლოგიური ნიმუშებიდან მცირე მოლეკულების იზოლირებისთვის. Sonication იყენებს მექანიკურ ვიბრაციას, რომელიც არღვევს უჯრედის მემბრანებს, რაც ხელს უწყობს უჯრედშიდა მეტაბოლიტების გამოყოფას გამხსნელში. ეს მეთოდი ეფექტური, რეპროდუცირებადია და თავსებადია სხვადასხვა ტიპის ნიმუშებთან, რაც მას ღირებულ ინსტრუმენტად აქცევს მაღალი გამტარუნარიანობის და მიზანმიმართული მეტაბოლური კვლევებისთვის. წაიკითხეთ მეტი ულტრაბგერითი მეტაბოლიტის ექსტრაქციის შესახებ!
“მე ვწერ, რომ მადლობა გადაგიხადოთ ჩვენი ფანტასტიკური გამოცდილებისთვის თქვენი UIP400MTP სონიკატორის გამოყენებით ფეკალური მიკრობიომის ნიმუშების ერთგვაროვანი და თანმიმდევრული ბაქტერიული ლიზისისთვის. ჩვენ ვაყენებთ კონვერტს მაღალი გამტარუნარიანობის ლიზისის ტექნოლოგიისთვის და თქვენი ინსტრუმენტი კარგად არის შესაფერისი ამოცანისთვის. ზოგიერთი ძირითადი მაჩვენებლებია:
- მუშაობის სიმარტივე - ინსტრუმენტი მარტივი გამოსაყენებელია და პერსონალიზაცია მარტივია მენიუს არჩევის გამოყენებით
- მაღალი გამტარუნარიანობა - შესანიშნავია ფირფიტების დასამუშავებლად, ერთდროულად 96 ნიმუშით
- ყველა ჭურჭლის გახმოვანებაც კი - მოწყობილობას შეეძლო ყველა ჭაბურღილში იგივე რაოდენობის გაჟონვის მიწოდება, რაც გადამწყვეტი იყო ჩვენი განაცხადისთვის
- Hielscher-ის გუნდის მხარდაჭერა - მხარდაჭერა იყო შესანიშნავი, თქვენ ყოველთვის იყავით ჩვენთან ერთად ტრენინგზე, რომ უპასუხეთ ჩვენს კითხვებს და პრობლემების გადასაჭრელად, წინადადებებით, რომლებიც დაგვეხმარა ჩვენი მიზნის მიღწევაში.
კიდევ ერთხელ გმადლობთ თქვენი დახმარებისა და დახმარებისთვის, რადგან ჩვენ ვმუშაობდით ჩვენი პროტოკოლების ოპტიმიზაციაზე.”
მარკ დ. დრისკოლი, ფ. – მთავარი მეცნიერი თანამშრომელი – Intus Biosciences
როგორ გამოიყენება Sonication მიკრობიომის კვლევასა და დიაგნოსტიკაში?
მეტაბოლომიკა, მეტაგენომიკა და მეტაპროტეომიკა გადაჯაჭვულია მიკრობიომის კვლევაში, რადგან ისინი ერთობლივად უზრუნველყოფენ მიკრობული თემებისა და მათი ფუნქციების ყოვლისმომცველ გაგებას. ლიზისი, ცილის გაწმენდა და დნმ/რნმ-ის ფრაგმენტაცია არის ნიმუშის მომზადების აუცილებელი საფეხურები, რომლებიც გამარტივებულია 96 ჭაბურღილის ფირფიტის სონიკატორის UIP400MTP-ის გამოყენებით.
მეტაბოლომიკა და მეტაბოლომის ანალიზი
მეტაბოლომიკა მოიცავს ბიოლოგიურ სისტემაში მცირე მოლეკულური მეტაბოლიტების სისტემატურ შესწავლას. მიკრობიომის კვლევისას, სონიკა გამოიყენება მიკრობული უჯრედების დასალიზებლად, უჯრედშიდა მეტაბოლიტების გასათავისუფლებლად. ნიმუშების მაღალი რაოდენობა შეიძლება სწრაფად დამუშავდეს 96 ჭაბურღილის ფირფიტის სონიკატორის UIP400MTP გამოყენებით. შემდეგ მოპოვებული მეტაბოლიტების რაოდენობრივი შეფასება ხდება მოწინავე ტექნიკის გამოყენებით, როგორიცაა მასის სპექტრომეტრია (MS) და ბირთვული მაგნიტური რეზონანსული (NMR) სპექტროსკოპია. მიღებული მონაცემები გვაწვდის მიკრობიომის მეტაბოლური მდგომარეობის სურათს, რომელიც ავლენს ბიოქიმიურ აქტივობებსა და ურთიერთქმედებებს მიკრობული თემებში.
მეტაგენომიკა და მეტატრანსკრიპტომიკა
მეტაგენომიკა მოიცავს გენეტიკური მასალის ყოვლისმომცველ ანალიზს, რომელიც აღებულია უშუალოდ გარემოს ნიმუშებიდან. სონიფიკაცია გადამწყვეტ როლს თამაშობს ამ პროცესში მიკრობული უჯრედების ლიზირებით მაღალი ხარისხის დნმ-ის ამოსაღებად, რომელიც შემდეგ რიგდება მიკრობული სახეობების იდენტიფიცირებისთვის და რაოდენობრივად. მეტატრანსკრიპტომიკაში, რნმ ამოღებულია მსგავსი სონიკაციის მეთოდების გამოყენებით, რათა შეისწავლოს გენის ექსპრესიის პროფილები სხვადასხვა მიკრობული თემებში. დნმ-ისა და რნმ-ის თანმიმდევრობისთვის ნუკლეინის მჟავები უნდა იყოს ფრაგმენტირებული ფუძის წყვილის გარკვეულ სიგრძეზე. ყველა ეს ამოცანა საიმედოდ და სწრაფად შესრულებულია UIP400MTP მაღალი გამტარუნარიანობის სონაქტორის მიერ!
პროტეომიკა
პროტეომიური ანალიზები მოითხოვს ცილების ამოღებას მიკრობული უჯრედებიდან. Sonication ეფექტურად გამოიყენება უჯრედების დასაშლელად, ხსნარში ცილების გათავისუფლებისთვის. შემდეგ ეს ცილები შეიძლება გაიწმინდოს და გაანალიზდეს, რათა გაიგოს მათი ფუნქციური როლები მიკრობიომში და მათი მონაწილეობა მეტაბოლურ გზებში. UIP400MTP მრავალ ჭაბურღილის ფირფიტის სონიკატორით, შეგიძლიათ შეასრულოთ ლიზისა და ცილის ექსტრაქცია რამდენიმე წუთში, შექმნათ რეპროდუცირებადი შედეგები მიკრობულ თემებში პროტეინების მიერ გამოწვეული ბიოლოგიური პროცესების შესახებ ინფორმაციის მისაღებად.
მეტაპროტეომიკა
Metaproteomics ავრცელებს პროტეომიურ ანალიზს მთელ მიკრობულ თემებზე, სწავლობს კოლექტიური ცილის შემცველობას მიკრობიომში ფუნქციური გამოხატვისა და ურთიერთქმედების გასაგებად. Sonication გამოიყენება უჯრედების ლიზისთვის, ათავისუფლებს ცილებს, რომლებიც შემდეგ იწმინდება და ანალიზდება ტექნიკის საშუალებით, როგორიცაა მასის სპექტრომეტრია. ეს მიდგომა იძლევა დეტალურ ინფორმაციას სხვადასხვა გარემოში მიკრობული თემების აქტიური ბიოლოგიური პროცესებისა და ადაპტაციების შესახებ.
ისარგებლეთ UIP400MTP მრავალ ჭაბურღილის ფირფიტის სონიკატორის მაღალი გამტარუნარიანობით და ხელი შეუწყეთ მიკრობიომის კვლევასა და ანალიზს!
UIP400MTP მაღალი გამტარიანობის sonicator მიკრობიომის კვლევისთვის მრავალ ჭაბურღილ თეფშებში, 96 ჭაბურღილ თეფშებში, მილებში და პეტრის ჭურჭელში.
UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator მაღალი გამტარუნარიანობის ნიმუშის მომზადებისთვის მიკრობიომის დიაგნოსტიკაში.
მრავალ ჭაბურღილის ფირფიტის სონიკატორი UIP400MTP აადვილებს მაღალი წარმადობის ნიმუშის მომზადებას, მაგ. მიკრობიომის კვლევასა და დიაგნოსტიკაში.
96 ჭაბურღილის ფირფიტის სონიკატორი UIP400MTP: ულტრაბგერითი გადამცემი სითხე აკრავს ყველა ჭაბურღილს და უზრუნველყოფს თითოეული ნიმუშის ერთგვაროვან გაჟღერებას
UIP400MTP მრავალ ჭაბურღილის ფირფიტის Sonicator-ის ძირითადი მახასიათებლები
| მაღალი გამტარიანობის sonication | იდეალურად შეეფერება 96 ჭაბურღილს და სხვა მრავალსაჭიან ფირფიტებს, UIP400MTP საშუალებას იძლევა რამდენიმე ნიმუშის ერთდროული, იდენტური გაჟონვა, რაც მნიშვნელოვნად ამცირებს ნიმუშის მომზადების ხანგრძლივობას და ზრდის ნიმუშის მაღალი რაოდენობის ტესტირების გამტარუნარიანობას. |
| გამოიყენეთ Multiwell Plate თქვენი არჩევანი | UIP400MTP შექმნილია ნებისმიერი სტანდარტული მულტიბელური ფირფიტების, PCR ფირფიტების ან მიკროტიტრული ფირფიტების ზონირებისთვის. თქვენ ირჩევთ ფირფიტას, რომელიც ყველაზე შესაფერისია თქვენი ექსპერიმენტებისთვის. ვინაიდან UIP400MTP არ საჭიროებს საკუთრებაში არსებულ სახარჯო მასალას, ეს დაზოგავს დიდ ფულს! |
| უკონტაქტო ულტრაბგერითი | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP იყენებს ინტენსიურ ულტრაბგერას ნიმუშში რაიმეს ჩასმის გარეშე. თქვენ შეგიძლიათ სონიკატორით დახურული ჭურჭელი და ფლაკონები. Hielscher აწვდის თქვენ მორგებულ ნიმუშის დამჭერებს ნებისმიერი არასტანდარტული ფლაკონებისთვის ან ჭურჭლისთვის. |
| სიზუსტე და კონტროლი | ზუსტი კონტროლი და ჭკვიანი პროგრამული უზრუნველყოფა საშუალებას გაძლევთ დააყენოთ ულტრაბგერითი პარამეტრები თქვენი სპეციფიკური დამუშავების საჭიროებებისთვის ოპტიმალურად. ყოველი ექსპერიმენტისთვის თქვენ მიიღებთ ხმის გამომუშავების მაქსიმალურ ეფექტურობას და ეფექტურობას. |
| ტემპერატურის კონტროლი | დააყენეთ სპეციფიკური ტემპერატურა თქვენი გაჟონვისთვის. UIP400MTP ფირფიტის სონიკატორს შეუძლია სინჯის ტემპერატურის მონიტორინგი და შესაბამისად დაარეგულიროს სონიკი. რეცირკულირებადი გამაგრილებელი სითხე აცივდება თითოეულ ჭაბურღილში ტემპერატურის ზუსტი კონტროლისთვის. |
| პროტოკოლირება და დისტანციური მართვა | თითოეული sonication გაშვება შეიძლება კონტროლდებოდეს კომპიუტერიდან. არ არის საჭირო პროგრამული უზრუნველყოფის ინსტალაცია. თქვენ შეგიძლიათ გამოიყენოთ თქვენი სტანდარტული ბრაუზერი (მაგ. Chrome, Firefox, Edge ან Safari) ნებისმიერ ოპერაციულ სისტემაზე (მაგ. MacOS, Windows, Android, iOS ან Linux) UIP400MTP დისტანციურად გასაკონტროლებლად და მონიტორინგისთვის. ყოველი სონიკაციის გაშვება აწარმოებს დეტალურ სონიკაციის პროტოკოლს შეფასებისა და დოკუმენტაციისთვის. პროტოკოლის ფაილი არის არასაკუთრების CSV ფორმატში, რომელიც შეგიძლიათ გახსნათ სასურველი პროგრამით, მაგ.: Microsoft Excel, Apple Numbers ან OpenOffice Calc. |
| მტკიცე და საიმედო | შექმნილი და აშენებული გერმანიაში უმაღლესი ხარისხის სტანდარტების შესაბამისად, UIP400MTP არა მხოლოდ ძლიერი, არამედ საოცრად გამძლეა. მისი დიზაინი აკმაყოფილებს სამრეწველო სტანდარტებს და ადვილად უძლებს ყოველდღიური გამოყენების სირთულეებს მომთხოვნი ლაბორატორიული გარემოში. თქვენ შეგიძლიათ გამოიყენოთ UIP400MTP მუდმივად 24 საათის განმავლობაში, კვირაში 7 დღე მაღალი გამტარუნარიანობის ოპერაციებში. |
- მაღალი ეფექტურობის
- უახლესი ტექნოლოგია
- საიმედოობა & სიმტკიცე
- რეგულირებადი, ზუსტი პროცესის კონტროლი
- ინტელექტუალური პროგრამული უზრუნველყოფა
- ჭკვიანი ფუნქციები (მაგ., პროგრამირებადი, მონაცემთა პროტოკოლირება, დისტანციური მართვა)
- მარტივი და უსაფრთხო ფუნქციონირება
- დაბალი მოვლა
- CIP (სუფთა ადგილზე)
დიზაინი, წარმოება და კონსულტაცია – ხარისხი დამზადებულია გერმანიაში
Hielscher ულტრაბგერითები ცნობილია მათი უმაღლესი ხარისხისა და დიზაინის სტანდარტებით. გამძლეობა და მარტივი მუშაობა საშუალებას იძლევა ჩვენი ულტრაბგერითი აპარატების გლუვი ინტეგრაცია სამრეწველო ობიექტებში. უხეში პირობები და მომთხოვნი გარემო ადვილად უმკლავდება Hielscher ულტრაბგერითებს.
Hielscher Ultrasonics არის ISO სერთიფიცირებული კომპანია და განსაკუთრებული აქცენტი კეთდება მაღალი ხარისხის ულტრაბგერაზე, რომელიც აღჭურვილია უახლესი ტექნოლოგიით და მომხმარებლის კეთილგანწყობით. რა თქმა უნდა, Hielscher ულტრაბგერითები შეესაბამება CE და აკმაყოფილებს UL, CSA და RoHs მოთხოვნებს.
უკონტაქტო sonicator UIP400MTP მიკრობიომის ნიმუშის მომზადებისთვის მრავალ ჭაბურღილის ფირფიტებში.
ლიტერატურა / ლიტერატურა
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- InfoGraphic UIP400MTP – 96-well plate Ultrasonicator for High-Throughput Sample Prep – english – Hielscher Ultrasonics
- Jannike L. Krause, Sven-Bastiaan Haange, Stephanie S. Schäpe, Beatrice Engelmann, Ulrike Rolle-Kampczyk, Katarina Fritz-Wallace, Zhipeng Wang, Nico Jehmlich, Dominique Türkowsky, Kristin Schubert, Judith Pöppe, Katrin Bote, Uwe Rösler, Gunda Herberth, Martin von Bergen (2020): The glyphosate formulation Roundup® LB plus influences the global metabolome of pig gut microbiota in vitro. Science of The Total Environment, Volume 745, 2020.
- Tröscher-Mußotter, Johanna; Sáenz, Johan; Grindler, Sandra; Meyer, Jennifer; Kononov, Susanne; Mezger, Beate; Borda, Daniel; Frahm, Jana; Dänicke, Sven; Camarinha-Silva, Amelia; Huber, Korinna; Seifert, Jana (2021): Microbiome Clusters Disclose Physiologic Variances in Dairy Cows Challenged by Calving and Lipopolysaccharides. mSystems 2021.
- Jannike Lea Krause, Beatrice Engelmann, Stephanie Serena Schaepe, Ulrike Rolle-Kampczyk, Nico Jehmlich, Hyun-Dong Chang, Ulla Slanina, Maximillian Hoffman, Jörg Lehmann, Ana Claudia Zenclussen, Gunda Herberth, Martin von Bergen, Sven-Bastiaan Haange (2024): DSS treatment does not affect murine colonic microbiota in absence of thehost. Gut Microbes 2024.
ხშირად დასმული კითხვები მიკრობიომის კვლევის შესახებ
რას აკეთებს Sonication ბაქტერიებს?
Sonication არღვევს ბაქტერიულ უჯრედებს მაღალი სიხშირის ხმის ტალღების გამოყენებით, რაც იწვევს კავიტაციას, რომელიც წარმოქმნის დარტყმის ტალღებს და მექანიკურ ძალებს, რაც იწვევს უჯრედის ლიზას და უჯრედშიდა შიგთავსის განთავისუფლებას.
რა მეთოდები გამოიყენება მიკრობიომების შესასწავლად?
მიკრობიომების შესწავლის მეთოდები მოიცავს დნმ-ის თანმიმდევრობის მეთოდებს, როგორიცაა 16S rRNA გენის თანმიმდევრობა და მეტაგენომიკა, ასევე ტრანსკრიპტომიკა, პროტეომიკა და მეტაბოლომიკა მიკრობული ფუნქციების და ურთიერთქმედებების გასაანალიზებლად. ბიოინფორმატიკის ხელსაწყოები გამოიყენება გენერირებული დიდი მონაცემების ინტერპრეტაციისთვის.
რა ტექნიკა გამოიყენება მიკრობიომის ანალიზში?
მიკრობიომის ანალიზში გამოყენებული ტექნიკა მოიცავს 16S rRNA გენის თანმიმდევრობას ტაქსონომიური პროფილირებისთვის, მეტაგენომიური თანმიმდევრობა ყოვლისმომცველი გენეტიკური ანალიზისთვის, მეტატრანსკრიპტომიკა გენის ექსპრესიის შესასწავლად, მეტაპროტეომიკა ცილების ანალიზისთვის და მეტაბოლომიკა მეტაბოლური პროდუქტების იდენტიფიცირებისთვის. ბიოინფორმატიკის ხელსაწყოები აუცილებელია მონაცემთა დამუშავებისა და ინტერპრეტაციისთვის.
რა არის მეტაბოლომიკა, მეტაგენომიკა და მეტაპროტეომიკა მიკრობიომის კვლევაში?
მიკრობიომის კვლევაში, მეტაბოლომიკა აანალიზებს მიკრობების მიერ წარმოქმნილ მცირე მოლეკულებს და მეტაბოლიტებს, რაც უზრუნველყოფს მათ მეტაბოლურ აქტივობებს. მეტაგენომიკა გულისხმობს მიკრობული თემების კოლექტიური გენომის თანმიმდევრობას მათი გენეტიკური შემადგენლობისა და ფუნქციური პოტენციალის გასაგებად. Metaproteomics სწავლობს მიკრობიომის მთლიან ცილის შემცველობას, ავლენს გენების ფუნქციურ გამოხატულებას და ცილების როლს მიკრობული საზოგადოებაში.
რა არის ბაქტერიული კოლონიები მიკრობიომის კვლევაში?
მიკრობიომის კვლევაში ბაქტერიული კოლონიები არის ბაქტერიების ჯგუფები, რომლებიც იზრდება ერთი ან რამდენიმე უჯრედიდან მყარ ზრდის გარემოზე, რომლებიც ქმნიან ხილულ კლასტერებს. ეს კოლონიები წარმოადგენს კლონურ პოპულაციებს, რომლებიც გამოიყენება მიკრობული თემის ფარგლებში სპეციფიკური ბაქტერიული შტამების მახასიათებლების, მრავალფეროვნებისა და ფუნქციების შესასწავლად.
Hielscher Ultrasonics აწარმოებს მაღალი ხარისხის ულტრაბგერითი ჰომოგენიზატორებისგან ლაბორატორია რომ სამრეწველო ზომა.