მეტაბოლომიკა, რომელსაც ხელს უწყობს მაღალი გამტარუნარიანობის სონიკაცია
მეტაბოლომიკა არის კვლევის სფერო, რომელიც იყენებს მაღალი გამტარუნარიანობის ტექნიკას სხვადასხვა ბიოფლუიდში, როგორიცაა შარდი, შრატი, პლაზმა, განავალი და ნერწყვი, მცირე მოლეკულების დასახასიათებლად და რაოდენობრივი განსაზღვრისთვის, რაც ავლენს უნიკალურ მეტაბოლურ ხელწერას. მაღალი გამტარუნარიანობის სონიკატორი UIP400MTP, რომელიც განკუთვნილია მრავალჭაბურღილიანი ფირფიტებისთვის, არის მძლავრი ინსტრუმენტი ამ ნიმუშებში უჯრედების ლიზისისთვის, რაც ხელს უწყობს მეტაბოლიტების გამოთავისუფლებას შემდგომი ანალიზისთვის. ეს ზუსტი და საიმედო მიდგომა აუცილებელია მეტაბოლომიკისთვის, სადაც უმნიშვნელოვანესია კვლევის ზუსტი დიზაინი, ნიმუშის ზედმიწევნით მომზადება, პლატფორმის ოპტიმიზებული დაყენება, მონაცემთა ყოვლისმომცველი ანალიზი და მნიშვნელოვანი ბიოლოგიური ინტერპრეტაცია. მეტაბოლომიკა იყენებს როგორც მიზანმიმართულ მიდგომებს, რომლებიც ფოკუსირებულია მოლეკულების კონკრეტულ კლასებზე, როგორიცაა ნახშირწყლები, ლიპიდები და ამინომჟავები, ასევე არამიზანმიმართულ ტექნიკას, რომელიც იძლევა ნიმუშში მეტაბოლური პროფილების ფართო მიმოხილვას და ავლენს მეტაბოლური სიგნალიზაციის რთულ სირთულეს.
UIP400MTP არის უკონტაქტო, მაღალი გამტარიანობის სონიკატორი უჯრედების ლიზისისა და მეტაბოლიტების ექსტრაქციისთვის მრავალ ჭაბურღილის ფირფიტებში
მაღალი გამტარუნარიანობის ნიმუშის მომზადება 96 ჭაბურღილის ფირფიტის სონიკატორით UIP400MTP
უკონტაქტო სონიკატორის UIP400MTP გამოყენება 96 ჭაბურღილ ფირფიტებთან ერთად არის ეფექტური მეთოდი მაღალი გამტარუნარიანობის ჰომოგენიზაციისა და მეტაბოლიტების ექსტრაქციისთვის. ეს პარამეტრი თავიდან აიცილებს ნიმუშთან პირდაპირ კონტაქტს, ამცირებს ჯვარედინი დაბინძურების რისკს რამდენიმე ნიმუშის ერთდროულად დამუშავებისას.
ნაბიჯ-ნაბიჯ პროტოკოლი ჰომოგენიზაციისთვის 96 ჭაბურღილის სონიკატორით UIP400MTP
- მეტაბოლური ნიმუშების მომზადება
ნიმუშის განთავსება: გაანაწილეთ თითოეული ნიმუში (მაგ. განავალი, ნაწლავის ქსოვილი ან სანათურის შიგთავსი) 96 ჭაბურღილიანი ფირფიტის ან მიკროფირფიტის ცალკეულ ჭებში.
გამხსნელი: ორგანული გამხსნელები, როგორიცაა მეთანოლი, ეთანოლი, აცეტონიტრილი, ქლოროფორმი და მათი (წყლიანი) ნარევები, აუცილებელია მეტაბოლიტების ექსტრაქციისთვის, რაც ხელს უწყობს უჯრედშიდა მეტაბოლიტების გამოყოფას უჯრედული მატრიქსიდან. გამოიყენეთ 100–300 μL გამხსნელი თითო ჭაბურღილში, რათა უზრუნველყოთ საკმარისი მოცულობა ნიმუშის სრულად ჩაძირვისთვის.
შიდა სტანდარტები: სურვილისამებრ, დაამატეთ შიდა სტანდარტები თითოეულ ჭაბურღილში შემდგომი მეტაბოლომიკური ანალიზისას ნორმალიზებისთვის. - შეერთების საშუალების მომზადება
წყლის დონე: მოათავსეთ 96 ჭაბურღილიანი ფირფიტა სონიკაციის პლატფორმაზე, რომელიც სავსეა წყლით (შეერთების საშუალებით), როგორც ეს აღწერილია სახელმძღვანელოში. - UIP400MTP პარამეტრის კონფიგურაცია
სიმძლავრის პარამეტრები: დაარეგულირეთ ულტრაბგერითი ამპლიტუდა მაქსიმალური სიმძლავრის 50–80%-მდე ეფექტური ჰომოგენიზაციისთვის.
პულსის რეჟიმი: დააყენეთ სონიკაციის ციკლი მონაცვლეობით იმპულსებზე (მაგ. 30 წამი ჩართვა, 30 წამი გამორთვა), რათა მოხდეს გაცივება და თავიდან იქნას აცილებული ნიმუშის გადახურება.
სულ დრო: 4–10 წუთი, ნიმუშის სირთულისა და სიმტკიცის მიხედვით.
ტემპერატურის კონტროლი: გამოიყენეთ ლაბორატორიული ჩილერი, რათა შეინარჩუნოთ წყალი 4–8°C ტემპერატურაზე სონიკაციის დროს სითბოსადმი მგრძნობიარე მეტაბოლიტების დასაცავად. - სონიკაციის პროცესი
გაუშვით UIP400MTP სონიკაციის ციკლებისთვის.
პროცესის მონიტორინგი UIP400MTP ინტერფეისის საშუალებით.
კავიტაციის ეფექტი ახდენს ნიმუშების ჰომოგენიზაციას და უჯრედების ლიზისს ჭაბურღილების შიგნით და უჯრედშიდა მეტაბოლიტებს ათავისუფლებს გამხსნელში. - PostSonication
ცენტრიფუგაცია: გახმოვანების შემდეგ, საჭიროების შემთხვევაში, ფირფიტის შიგთავსი გადაიტანეთ შეგროვების მილებში. ცენტრიფუგირება მოახდინეთ 4000–6000 × გ-ზე 10 წუთის განმავლობაში უხსნადი ნამსხვრევებისა და ფიჭური მასალის დასალექად.
ზენატანის შეგროვება: ფრთხილად გადაიტანეთ ზენატანი თითოეული ჭაბურღილიდან ახალ მილებში ან ფილებში ანალიზისთვის.
სურვილისამებრ გაშრობა: გააშრეთ ზენატანები ვაკუუმ-კონცენტრატორის გამოყენებით (მაგ. SpeedVac), თუ საჭიროა კონცენტრაცია, შემდეგ აღადგინეთ შესაბამისი გამხსნელის მცირე მოცულობით.
ისარგებლეთ UIP400MTP მრავალ ჭაბურღილის ფირფიტის სონიკატორის მაღალი გამტარუნარიანობით და ხელი შეუწყეთ თქვენს მეტაბოლურ კვლევას და ანალიზს!
UIP400MTP მაღალი გამტარუნარიანობის სონიკატორი მეტაბოლური კვლევისთვის მრავალ ჭაბურღილ თეფშებში, 96 ჭაბურღილიან თეფშებში, მილებში და პეტრის ჭურჭელში.
UIP400MTP მრავალჭაბურღილიანი ფირფიტის სონიკატორი მაღალი გამტარუნარიანობის ნიმუშის მომზადებისთვის მეტაბოლურ კვლევაში.
უკონტაქტო გაჟღერების პრინციპი UIP400MTP-ით
UIP400MTP ულტრაბგერით ტალღებს ამოქმედებს 96 ჭაბურღილიანი ფირფიტის ჭაბურღილებზე არაპირდაპირად, შეერთების საშუალების (მაგ. წყლის) მეშვეობით. ეს ტალღები ქმნიან კავიტაციას, რომელიც არღვევს უჯრედებს და ათავისუფლებს მეტაბოლიტებს სონიკატორის ზონდსა და ნიმუშს შორის ფიზიკური კონტაქტის გარეშე.
“მე ვწერ, რომ მადლობა გადაგიხადოთ ფეკალური მიკრობიომის ნიმუშების ერთგვაროვანი და თანმიმდევრული ბაქტერიული ლიზისისთვის თქვენი UIP400MTP სონიკატორის გამოყენების ფანტასტიკური გამოცდილებისთვის. ჩვენ მაღალი გამტარუნარიანობის ლიზისის ტექნოლოგიის საზღვრებს ვაფართოებთ და თქვენი ინსტრუმენტი ამ ამოცანას კარგად შეესაბამება. ზოგიერთი ძირითადი უპირატესობაა:
- მუშაობის სიმარტივე – ინსტრუმენტი მარტივი გამოსაყენებელია და პერსონალიზაცია მარტივია მენიუს არჩევანის გამოყენებით
- მაღალი გამტარუნარიანობა – შესანიშნავია ფირფიტების დასამუშავებლად, ერთდროულად 96 ნიმუშით
- ყველა ჭურჭლის თანაბარი სონიკაცია – მოწყობილობამ შეძლო ყველა ჭაბურღილზე სონიკაციის იგივე რაოდენობის მიწოდება, რაც გადამწყვეტი იყო ჩვენი აპლიკაციისთვის
- მხარდაჭერა Hielscher გუნდისგან – მხარდაჭერა იყო შესანიშნავი, თქვენ ყოველთვის იყავით ჩვენს გვერდით ტრენინგზე, უპასუხეთ ჩვენს კითხვებს და პრობლემების გადასაჭრელად, წინადადებებით, რომლებიც დაგვეხმარა ჩვენი მიზნის მიღწევაში.
კიდევ ერთხელ გმადლობთ თქვენი დახმარებისა და მხარდაჭერისთვის, რადგან ჩვენ ვმუშაობდით ჩვენი პროტოკოლების ოპტიმიზაციაზე.”
მარკ დ. დრისკოლი, Ph.D. – მთავარი სამეცნიერო დირექტორი – Intus Biosciences
მრავალ ჭაბურღილის სონიკატორი UIP400MTP აადვილებს ნიმუშის მაღალი გამტარუნარიანობის მომზადებას, მაგ., მეტაბოლიტების კვლევასა და ანალიზში.
96 ჭაბურღილის ფირფიტის სონიკატორი UIP400MTP: ულტრაბგერას გამტარი სითხე აკრავს ყველა ჭაბურღილს და უზრუნველყოფს თითოეული ნიმუშის ერთგვაროვან სონიკაციას
UIP400MTP მრავალჭაბურღილიანი ფირფიტის სონიკატორის ძირითადი მახასიათებლები
| მაღალი გამტარუნარიანობის სონიკაცია | იდეალურად შეეფერება 96 ჭაბურღილიან და სხვა მრავალჭაბურღილიან ფირფიტებს, UIP400MTP საშუალებას იძლევა რამდენიმე ნიმუშის ერთდროული, იდენტური სონიკაციისა, რაც მნიშვნელოვნად ამცირებს ნიმუშის მომზადების ხანგრძლივობას და ზრდის ნიმუშების დიდი რაოდენობის ტესტირების გამტარუნარიანობას. |
| გამოიყენეთ თქვენთვის სასურველი მრავალჭაბურღილიანი ფირფიტა | UIP400MTP შექმნილია ნებისმიერი სტანდარტული მრავალჭაბურღილიანი ფირფიტის, PCR ფირფიტის ან მიკროტიტრული ფირფიტის სონიკაციისთვის. თქვენ ირჩევთ ფირფიტას, რომელიც ყველაზე შესაფერისია თქვენი ექსპერიმენტებისთვის. ვინაიდან UIP400MTP არ საჭიროებს ფირმის საკუთარ სახარჯო მასალას, ეს დიდ თანხას გიზოგავთ! |
| უკონტაქტო ულტრაბგერითი | მრავალჭაბურღილიანი ფირფიტის სონიკატორი UIP400MTP იყენებს ინტენსიურ ულტრაბგერას ნიმუშში რაიმეს ჩასმის გარეშე. შეგიძლიათ დალუქული მრავალჭაბურღილიანი ფირფიტების, დახურული ჭურჭლისა და ფლაკონების სონიკაცია. Hielscher მოგაწვდით მორგებულ ნიმუშის დამჭერებს ნებისმიერი არასტანდარტული ფლაკონისთვის ან ჭურჭლისთვის. |
| სიზუსტე და კონტროლი | ზუსტი კონტროლი და ჭკვიანი პროგრამული უზრუნველყოფა საშუალებას გაძლევთ ულტრაბგერითი პარამეტრები ოპტიმალურად მოარგოთ თქვენს კონკრეტულ დამუშავების საჭიროებებს. ყოველი ექსპერიმენტისთვის თქვენ მიიღებთ სონიკაციის მაქსიმალურ ეფექტურობას და შედეგიანობას. |
| ტემპერატურის კონტროლი | დააყენეთ კონკრეტული ტემპერატურა თქვენი სონიკაციისთვის. UIP400MTP ფირფიტის სონიკატორს შეუძლია ნიმუშის ტემპერატურის მონიტორინგი და სონიკაციის შესაბამისად რეგულირება. მოცირკულირე გამაგრილებელი სითხე აცივებს ფირფიტის თითოეულ ჭაბურღილს ტემპერატურის ზუსტი კონტროლისთვის. |
| პროტოკოლირება და დისტანციური მართვა | თითოეული სონიკაციის ციკლი შეიძლება კონტროლდებოდეს კომპიუტერიდან. პროგრამული უზრუნველყოფის ინსტალაცია საჭირო არ არის. თქვენ შეგიძლიათ გამოიყენოთ თქვენი სტანდარტული ბრაუზერი (მაგ. Chrome, Firefox, Edge ან Safari) ნებისმიერ ოპერაციულ სისტემაზე (მაგ. MacOS, Windows, Android, iOS ან Linux) UIP400MTP-ის დისტანციურად გასაკონტროლებლად და მონიტორინგისთვის. ყოველი სონიკაციის ციკლი ქმნის დეტალურ სონიკაციის პროტოკოლს შეფასებისა და დოკუმენტაციისთვის. პროტოკოლის ფაილი არის არასაკუთრებითი CSV ფორმატის, რომელიც შეგიძლიათ გახსნათ სასურველი პროგრამით, მაგ.: Microsoft Excel, Apple Numbers ან OpenOffice Calc. |
| მტკიცე და საიმედო | შექმნილი და დამზადებული გერმანიაში უმაღლესი ხარისხის სტანდარტების შესაბამისად, UIP400MTP არა მხოლოდ ძლიერი, არამედ საოცრად გამძლეცაა. მისი დიზაინი აკმაყოფილებს სამრეწველო სტანდარტებს და ადვილად უძლებს მომთხოვნ ლაბორატორიულ გარემოში ყოველდღიური გამოყენების სირთულეებს. თქვენ შეგიძლიათ გამოიყენოთ UIP400MTP უწყვეტად, დღე-ღამეში 24 საათი, კვირაში 7 დღე, მაღალი გამტარუნარიანობის ოპერაციებში. |
- მაღალი ეფექტურობა
- უახლესი ტექნოლოგია
- საიმედოობა & სიმტკიცე
- რეგულირებადი, ზუსტი პროცესის კონტროლი
- ინტელექტუალური პროგრამული უზრუნველყოფა
- ჭკვიანი ფუნქციები (მაგ., პროგრამირებადი, მონაცემთა პროტოკოლირება, დისტანციური მართვა)
- მარტივი და უსაფრთხო ფუნქციონირება
- მცირე მოვლა-პატრონობა
- CIP (ადგილზე წმენდა)
დიზაინი, წარმოება და კონსულტაცია – ხარისხი დამზადებულია გერმანიაში
Hielscher ულტრაბგერითი აპარატები ცნობილია უმაღლესი ხარისხისა და დიზაინის სტანდარტებით. გამძლეობა და მარტივი ექსპლუატაცია საშუალებას იძლევა ჩვენი ულტრაბგერითი აპარატები უპრობლემოდ ინტეგრირდეს სამრეწველო ობიექტებში. Hielscher ულტრაბგერითი აპარატები ადვილად უმკლავდება მძიმე პირობებსა და მომთხოვნ გარემოს.
Hielscher Ultrasonics არის ISO სერთიფიცირებული კომპანია და განსაკუთრებული აქცენტი კეთდება მაღალი წარმადობის ულტრაბგერით აპარატებზე, რომლებიც აღჭურვილია უახლესი ტექნოლოგიით და მომხმარებლისთვის მოხერხებულია. რა თქმა უნდა, Hielscher ულტრაბგერითი აპარატები შეესაბამება CE-ს და აკმაყოფილებს UL, CSA და RoHs მოთხოვნებს.
უკონტაქტო სონიკატორი UIP400MTP მიკროფირფიტებში მეტაბოლური ნიმუშის მომზადებისთვის.
ლიტერატურა / წყაროები
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
ხშირად დასმული კითხვები მეტაბოლომიკის კვლევის შესახებ
რა არის მიკრობიომი?
მიკრობიომი ეხება მიკროორგანიზმების კოლექტიურ საზოგადოებას, მათ შორის ბაქტერიებს, ვირუსებს, სოკოებს და არქეებს, ისევე როგორც მათ გენეტიკურ მასალას, რომელიც ბინადრობს კონკრეტულ გარემოში, როგორიცაა ადამიანის სხეული. ის გადამწყვეტ როლს თამაშობს მასპინძლის ჯანმრთელობაში მეტაბოლიზმზე, იმუნურ ფუნქციაზე და პათოგენებისგან დაცვაზე ზემოქმედებით, ხოლო ფორმირდება ისეთი ფაქტორებით, როგორიცაა დიეტა, ცხოვრების წესი და გარემო.
რა არის მეტაბოლომიკა?
მეტაბოლომიკა არის მეტაბოლიტების ყოვლისმომცველი შესწავლა, რომლებიც წარმოადგენენ მცირე მოლეკულებს, რომლებიც წარმოიქმნება ბიოლოგიურ სისტემაში მეტაბოლური პროცესების დროს. ის მოიცავს ამ მოლეკულების იდენტიფიკაციას, რაოდენობრივ განსაზღვრას და ანალიზს, რათა გავიგოთ უჯრედული ფუნქციები, მეტაბოლური გზები და ისიც, თუ როგორ რეაგირებენ ისინი გენეტიკურ, გარემოსმიერ ან პათოლოგიურ ცვლილებებზე.
რა არის მეტაბოლომი?
მეტაბოლომი არის მცირე მოლეკულების, ანუ მეტაბოლიტების, სრული ნაკრები, რომლებიც მოცემულ დროს იმყოფება ბიოლოგიურ სისტემაში, როგორიცაა უჯრედი, ქსოვილი ან ორგანიზმი. ის ასახავს სისტემის ბიოქიმიურ აქტივობას და ფიზიოლოგიურ მდგომარეობას და იძლევა წარმოდგენას მეტაბოლიზმსა და მის ურთიერთქმედებაზე გარემოსთან.
Hielscher Ultrasonics აწარმოებს მაღალი ხარისხის ულტრაბგერით ჰომოგენიზატორებს ლაბორატორიულიდან სამრეწველო ზომამდე. სამრეწველო ზომა.