Lisi delle cellule BL21 mediante ultrasuoni
Le cellule BL21 appartengono a un ceppo di E. coli ampiamente utilizzato nei laboratori di ricerca, nella biotecnologia e nella produzione industriale grazie alla loro capacità di esprimere proteine con elevata efficienza. La disgregazione cellulare, la lisi e l’estrazione delle proteine mediante ultrasuoni costituiscono il metodo comunemente utilizzato per isolare e raccogliere le proteine bersaglio dall’interno delle cellule BL21. Il trattamento a ultrasuoni disgrega completamente la cellula e rilascia tutte le proteine intrappolate, rendendo disponibile il 100% delle proteine.
Cellule BL21 per l’espressione proteica
BL21 è un ceppo batterico di E. coli chimicamente competente, adatto alla trasformazione e all’espressione proteica ad alto livello mediante un sistema di induzione RNA polimerasi T7-IPTG. Le cellule BL21 consentono l’espressione proteica ad alta efficienza di qualsiasi gene sotto il controllo di un promotore T7. Il ceppo di E. coli BL21(DE3) è un ceppo per la produzione di proteine basato sulla RNA polimerasi T7, abbinato a vettori di espressione basati sul promotore T7, ed è ampiamente utilizzato nei laboratori e nell’industria per produrre proteine ricombinanti. In BL21(DE3), l’espressione del gene che codifica la proteina ricombinante viene trascritta dalla RNA polimerasi T7 (T7 RNAP) codificata a livello cromosomico, che trascrive otto volte più velocemente della RNAP convenzionale di E. coli. Ciò rende il ceppo BL21(DE3) altamente efficiente e lo rende uno dei sistemi cellulari preferiti per l’espressione proteica.
Protocollo per la lisi a ultrasuoni e l’estrazione delle proteine dalle cellule BL21
La lisi delle cellule BL21 viene eseguita principalmente mediante ultrasuoni in combinazione con lauroil sarcosinato di sodio (noto anche come sarkosyl) come tampone di lisi. I vantaggi della disgregazione cellulare e dell’estrazione delle proteine mediante ultrasuoni risiedono nell’affidabilità, nella riproducibilità e nel funzionamento semplice, sicuro e rapido dei sonicatori. Il protocollo seguente fornisce istruzioni passo dopo passo per la lisi a ultrasuoni delle cellule BL21:
- Per rimuovere le proteine chaperone, i pellet batterici BL21 sono stati risospesi in 50 ml di tampone sodio-Tris-EDTA (STE) freddo come il ghiaccio (costituito da 10 mM Tris-HCL, pH 8,0, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, con l’aggiunta di 100 mM PMSF).
- Quindi si aggiungono 500 ul di lisozima (10 mg/ ml) e si incubano le cellule su ghiaccio per 15 min.
- Successivamente si aggiungono 500 ul di DTT e 7 ml di sarkosyl (10% (w/v) preparato in tampone STE).
- È essenziale mantenere tutti i tamponi di purificazione freddi come il ghiaccio e tenere sempre i campioni su ghiaccio. Se possibile, tutte le fasi di purificazione devono essere eseguite in una camera fredda.
- Per la lisi a ultrasuoni e l’estrazione delle proteine, i campioni vengono sottoposti a sonicazione nel sonicatore multicampione VialTweeter per 4 x 30 sec al 100% di ampiezza, con un intervallo di 2 min tra una sonicazione e l’altra. In alternativa, si può utilizzare un omogeneizzatore a ultrasuoni a sonda con micropunta, ad esempio UP200Ht con S26d2 (3 x 30 sec, pausa di 2 min. tra i cicli a ultrasuoni, ampiezza dell’80%).
- Per le successive fasi di purificazione, i campioni devono essere mantenuti su ghiaccio oppure conservati a -80°C fino all’ulteriore trattamento.
Disgregatore cellulare a ultrasuoni UP200St con micropunta S26d2 per la lisi e l’estrazione delle proteine
Lisi a ultrasuoni con controllo preciso della temperatura
Un controllo preciso e affidabile della temperatura è fondamentale quando si manipolano campioni biologici. Le temperature elevate innescano la degradazione delle proteine nei campioni indotta dal calore.
Come tutte le tecniche meccaniche di preparazione dei campioni, la sonicazione genera calore. Tuttavia, utilizzando VialTweeter, la temperatura dei campioni può essere controllata efficacemente. Vi presentiamo diverse opzioni per monitorare e controllare la temperatura dei vostri campioni durante la preparazione con VialTweeter e VialPress per l’analisi.
- Monitoraggio della temperatura del campione: il processore a ultrasuoni UP200St, che aziona VialTweeter, è dotato di un software intelligente e di un sensore di temperatura collegabile. Collegate il sensore di temperatura a UP200St e inserite la punta del sensore in una delle provette contenenti i campioni. Tramite il display digitale touch a colori, potete impostare nel menu di UP200St un intervallo di temperatura specifico per la sonicazione dei campioni. Il sonicatore si arresta automaticamente quando viene raggiunta la temperatura massima e rimane in pausa finché la temperatura del campione non scende al valore inferiore dell’intervallo di temperatura ∆ impostato. La sonicazione riprende quindi automaticamente. Questa funzione intelligente previene la degradazione indotta dal calore.
- Il blocco VialTweeter può essere preraffreddato. Collocate il blocco VialTweeter (solo il sonotrodo, senza trasduttore!) nel frigorifero o nel congelatore: il preraffreddamento del blocco in titanio contribuisce a ritardare l’aumento della temperatura nel campione. Se possibile, si può preraffreddare anche il campione stesso.
- Utilizzate ghiaccio secco per raffreddare durante la sonicazione. Riempite un vassoio poco profondo con ghiaccio secco e collocate VialTweeter sul ghiaccio in modo che il calore possa dissiparsi rapidamente.
Clienti di tutto il mondo utilizzano VialTweeter e VialPress per la preparazione quotidiana dei campioni nei laboratori biologici, biochimici, medici e clinici. Grazie al software intelligente e al controllo della temperatura del processore UP200St, la temperatura viene controllata in modo affidabile e si evita la degradazione dei campioni indotta dal calore. La preparazione dei campioni a ultrasuoni con VialTweeter e VialPress offre risultati altamente affidabili e riproducibili!
Trovate il disgregatore a ultrasuoni ottimale per la vostra applicazione di lisi
Hielscher Ultrasonics è un produttore con una lunga esperienza nella realizzazione di disgregatori cellulari e omogeneizzatori a ultrasuoni ad alte prestazioni per laboratori, sistemi da banco e sistemi su scala industriale. Le dimensioni della vostra coltura di cellule batteriche, il vostro obiettivo di ricerca o produzione e il volume di cellule da trattare ogni ora o ogni giorno sono fattori essenziali per individuare il disgregatore cellulare a ultrasuoni adatto alla vostra applicazione.
Hielscher Ultrasonics offre diverse soluzioni per la sonicazione simultanea di più campioni (fino a 10 fiale con VialTweeter) e di campioni in grandi quantità (ossia piastre per microtitolazione / piastre ELISA con UIP400MTP), oltre al classico sonicatore da laboratorio a sonda con diversi livelli di potenza da 50 a 400 watt, fino a processori a ultrasuoni completamente industriali con una potenza fino a 16.000 watt per unità, per la disgregazione cellulare e l’estrazione delle proteine su scala commerciale in grandi impianti produttivi. Tutti i sonicatori Hielscher sono progettati per il funzionamento 24/7/365 a pieno carico. Robustezza e affidabilità sono caratteristiche fondamentali dei nostri dispositivi a ultrasuoni.
Tutti gli omogeneizzatori digitali a ultrasuoni sono dotati di software intelligente, display touch a colori e registrazione automatica dei dati, che rendono il dispositivo a ultrasuoni uno strumento di lavoro pratico nei laboratori e negli impianti di produzione.
Comunicateci quale tipo di cellule, quale volume, con quale frequenza e con quale obiettivo dovete trattare i vostri campioni biologici. Vi consiglieremo il disgregatore cellulare a ultrasuoni più adatto alle esigenze del vostro processo.
La tabella seguente fornisce un’indicazione della capacità di trattamento approssimativa dei nostri sistemi a ultrasuoni, dagli omogeneizzatori portatili compatti e dai sonicatori multicampione ai processori a ultrasuoni industriali per applicazioni commerciali:
| Volume del lotto | Portata | Dispositivi consigliati |
|---|---|---|
| Piastre a 96 pozzetti / per microtitolazione | n.a. | UIP400MTP |
| 10 fiale da 0,5 a 1,5mL ciascuna | n.a. | VialTweeter su UP200St |
| Da 0,01 a 250mL | Da 5 a 100mL/min | UP50H |
| Da 0,01 a 500mL | Da 10 a 200mL/min | UP100H |
| Da 10 a 2000mL | Da 20 a 400mL/min | UP200Ht, UP400St |
| Da 0,1 a 20L | Da 0,2 a 4L/min | UIP2000hdT |
| Da 10 a 100L | Da 2 a 10L/min | UIP4000hdT |
| n.a. | Da 10 a 100L/min | UIP16000 |
| n.a. | superiore | gruppo di UIP16000 |
Contattateci! / Chiedeteci informazioni!
Sonicatore per piastre UIP400MTP per la disgregazione cellulare con elevata capacità di trattamento dei campioni in piastre a 96 pozzetti
Sonicatore UP200Ht con micropunta S26d2 da 2mm per la sonicazione di piccoli campioni
Scoprite come utilizzare il vostro omogeneizzatore tissutale a ultrasuoni per preparare soluzioni tampone in modo efficiente e affidabile!
Informazioni utili
Batteri Escherichia coli
Escherichia coli è un tipo di batterio non sporigeno, Gram-negativo, caratterizzato dalla forma di bastoncello diritto. I batteri E.coli sono presenti nell’ambiente, negli alimenti e nell’intestino di esseri umani e animali. E. coli è generalmente mobile grazie ai flagelli peritrichi, ma esistono anche tipi non mobili. Gli E.coli sono organismi chemioorganotrofi anaerobi facoltativi, il che significa che sono capaci sia di metabolismo respiratorio sia di metabolismo fermentativo. La maggior parte dei tipi di E.coli è innocua e svolge funzioni utili nell’organismo, ad esempio inibendo la crescita di specie batteriche nocive, sintetizzando vitamine, ecc.
Le cellule batteriche di Escherichia coli del cosiddetto tipo B costituiscono una categoria particolare di ceppi di E.coli, ampiamente utilizzati nella ricerca per studiare meccanismi quali la sensibilità ai batteriofagi o i sistemi di restrizione-modificazione. Inoltre, i batteri E.coli sono apprezzati come strumenti affidabili per l’espressione proteica nei laboratori di biotecnologia e scienze della vita. Ad esempio, gli E.coli vengono utilizzati per sintetizzare composti come proteine e oligosaccaridi su scala industriale. Grazie a caratteristiche specifiche quali la carenza di proteasi, la bassa produzione di acetato in presenza di livelli elevati di glucosio e la maggiore permeabilità, le cellule di E. coli B sono le cellule ospiti più frequentemente utilizzate per la produzione di proteine ottenute mediante ingegneria genetica.
Proteina ricombinante
Le proteine ricombinanti (rProt) stanno acquisendo notevole importanza in numerosi settori, tra cui la produzione chimica, l’industria farmaceutica, la cosmetica, la medicina umana e veterinaria, l’agricoltura, l’industria alimentare e il trattamento dei rifiuti.
La produzione di proteine ricombinanti richiede l’uso di un sistema di espressione. Come sistemi cellulari di espressione per la produzione di DNA ricombinante si possono utilizzare sia cellule procariotiche sia cellule eucariotiche. Sebbene le cellule batteriche siano le più utilizzate per l’espressione proteica grazie a fattori quali il basso costo, la facilità di aumento della scala e le semplici condizioni dei terreni di coltura, i sistemi basati su cellule di mammifero, lieviti, alghe, insetti e i sistemi privi di cellule rappresentano alternative consolidate. Il tipo di proteina, l’attività funzionale e la resa richiesta della proteina espressa influenzano la scelta del sistema cellulare utilizzato per l’espressione proteica.
Per esprimere una proteina ricombinante, una determinata cellula deve essere trasfettata con un vettore di DNA contenente lo stampo di DNA ricombinante. Le cellule trasfettate con lo stampo vengono quindi coltivate. Per effetto dei meccanismi cellulari, le cellule trascrivono e traducono la proteina di interesse, producendo così la proteina bersaglio.
Poiché le proteine espresse sono intrappolate nella matrice cellulare, la cellula deve essere lisata (disgregata e rotta) per rilasciare le proteine. In una successiva fase di purificazione, la proteina viene separata e purificata.
La prima proteina ricombinante utilizzata a fini terapeutici è stata l’insulina umana ricombinante nel 1982. Oggi vengono prodotti in tutto il mondo più di 170 tipi di proteine ricombinanti per trattamenti medici. Tra le proteine ricombinanti comunemente utilizzate in medicina figurano, ad esempio, ormoni ricombinanti, interferoni, interleuchine, fattori di crescita, fattori di necrosi tumorale, fattori della coagulazione del sangue, farmaci trombolitici ed enzimi per il trattamento di importanti malattie quali diabete, nanismo, infarto miocardico, insufficienza cardiaca congestizia, apoplessia cerebrale, sclerosi multipla, neutropenia, trombocitopenia, anemia, epatite, artrite reumatoide, asma, malattia di Crohn e per le terapie oncologiche. (cfr. Phuc V. Pham, in Omics Technologies and Bio-Engineering, 2018)
Bibliografia / Riferimenti
- Cheraghi S.; Akbarzade A.; Farhangi A.; Chiani M.; Saffari Z.; Ghassemi S.; Rastegari H.; Mehrabi M.R. (2010): Improved Production of L-lysine by Over-expression of Meso-diaminopimelate Decarboxylase Enzyme of Corynebacterium glutamicum in Escherichia coli. Pak J Biol Sci. 2010 May 15; 13(10), 2010. 504-508.
- LeThanh, H.; Neubauer, P.; Hoffmann, F. (2005): The small heat-shock proteins IbpA and IbpB reduce the stress load of recombinant Escherichia coli and delay degradation of inclusion bodies. Microb Cell Fact 4, 6; 2005.
- Martínez-Gómez A.I.; Martínez-Rodríguez S.; Clemente-Jiménez J.M.; Pozo-Dengra J.; Rodríguez-Vico F.; Las Heras-Vázquez F.J. (2007): Recombinant polycistronic structure of hydantoinase process genes in Escherichia coli for the production of optically pure D-amino acids. Appl Environ Microbiol. 73(5); 2007. 1525-1531.
- Kotowska M.; Pawlik K.; Smulczyk-Krawczyszyn A.; Bartosz-Bechowski H.; Kuczek K. (2009): Type II Thioesterase ScoT, Associated with Streptomyces coelicolor A3(2) Modular Polyketide Synthase Cpk, Hydrolyzes Acyl Residues and Has a Preference for Propionate. Appl Environ Microbiol. 75(4); 2009. 887-896.
Sonicatore VialTweeter per la sonicazione simultanea di 10 campioni, ad esempio per disgregare le cellule BL21
