Hielscher Ultrasonics
Örömmel megvitatjuk a folyamatot.
Hívjon minket: +49 3328 437-420
Írjon nekünk: info@hielscher.com

E. coli ultrahangos lízise

  • Az E. coli baktériumok a leggyakrabban használt baktériumok a mikrobiológiában és a biotechnológiában.
  • Az ultrahangos sejtzavarók megbízható és reprodukálható eredményeket adnak az E. coli lízisére.
  • Az intenzív, mégis pontosan szabályozható kavitációs és nyíróerők teljes zavart és magas extrakciós hozamot eredményeznek (pl. fehérjék, DNS).

Miért az E. coli ultrahangos sejtzavara az előnyben részesített módszer?

Az ultrahangos homogenizátorok vagy szonda típusú ultrahangos készülékek számos előnyt kínálnak az E. coli lízis számára, mivel az intenzív ultrahang hatékonyan megzavarja a sejtfalakat és a membránokat. A szonda típusú ultrahangos készülékeket széles körben használják E. coli lízisre a következő okok miatt:

  • A sejtfalak hatékony megzavarása: Az E. coli félig merev sejtfala peptidoglikánból áll, amelyet nehéz lehet feltörni a hagyományos lízis módszerekkel. A szonda típusú ultrahangos készülék intenzív ultrahangos hullámokat generál, amelyek kavitációs buborékokat hoznak létre a sejteket körülvevő folyadékban. Amikor ezek a buborékok összeomlanak, nagy sebességű folyadéksugarakat és lökéshullámokat generálnak, amelyek a sejtfalak mechanikai megzavarását eredményezik, hatékonyan felszabadítva a sejttartalmat, például a biomolekulákat.
  • Fokozott penetráció: A szonda / sonotrode által generált ultrahangos hullámok mélyen behatolhatnak a mintába, elérve nagyobb számú E. coli sejtet és egyenletesen kezelve őket. Ez segít biztosítani, hogy a lízis egyenletesebb legyen az egész mintában, ami nagyobb sejtzavar-hatékonyságot eredményez.
  • Csökkentett feldolgozási idő: A szonda típusú ultrahangos készülék által szállított energia erősen koncentrált és lokalizált, ami gyors és hatékony sejtlízishez vezet. Más módszerekhez képest, mint például a gyöngyverés vagy az enzimatikus lízis, az ultrahangos kezelés perceken vagy akár másodperceken belül elérheti az E. coli lízist. Míg sok alternatív technika, mint például a fagyasztás-felolvasztás több fordulós kezelést igényel, az ultrahangos lízis egyetlen folyamatlépésben nyitja meg a sejteket.
  • Hőmérséklet-szabályozás: A legmodernebb ultrahangos készülékek hőmérséklet-érzékelőkkel és intelligens szoftverekkel vannak felszerelve, amelyek lehetővé teszik a maximális folyamathőmérséklet beállítását. Az ultrahangos készülék automatikusan szünetel, amikor eléri a hőmérsékleti határértéket, és elindítja az ultrahangos folyamatot, amikor elér egy beállított hőmérsékleti pontot. A minták jégfürdőben történő hűtése egyszerű módszer a minta hőmérsékletének alacsonyan tartására és a hő okozta mintalebomlás megelőzésére.
  • Méretezhetőség: A szonda típusú ultrahangos készülékek különböző méretekben kaphatók, a kézi eszközöktől a nagyszabású ipari modellekig. Ez alkalmassá teszi őket kis mennyiségek laboratóriumi feldolgozására vagy nagyobb biofeldolgozási alkalmazásokra, például vakcinagyártásra vagy molekulák bioszintézisére.
  • Sokoldalúság: Az ultrahangos készülékek különböző alkalmazásokhoz használhatók a sejtlízisen túl, mint például a DNS-nyírás, fehérje extrakció, szövethomogenizálás, nanorészecske diszperzió, és emulgeálás. Ezért a szonda típusú ultrahangos készülékbe történő befektetés sokoldalúságot biztosít a kutatási vagy ipari környezetben.
  • A szonda típusú ultrahangos készülékek, mint például a UP200St megbízható szövethomogenizátorok és sejttörők, ezért széles körben használják a minta előkészítéséhez a genetikában, pl. E.coli lízishez

    Az E.coli sejtekből történő fehérjekivonást hatékonyan végezzük a ultrahangos szonda UP200St

    A szonda típusú ultrahangos készülék számos előnnyel jár az E. coli lízis számára. Az ultrahangos folyamatparaméterek megbízható és pontos ellenőrzése lehetővé teszi a működési paraméterek, például a teljesítmény, az időtartam és a mintakezelés optimalizálását a kívánt eredmények elérése érdekében.
     

    Információkérés




    Vegye figyelembe a Adatvédelem.




     

    Ez a bemutató elmagyarázza, hogy milyen típusú szonikátor a legjobb a mintaelőkészítési feladatokhoz, például lízishez, sejtzavarokhoz, fehérjeizoláláshoz, DNS és RNS fragmentációhoz laboratóriumokban, elemzésben és kutatásban. Válassza ki az ideális szonikátor típust az alkalmazáshoz, a minta térfogatához, a minta számához és az áteresztőképességhez. A Hielscher Ultrasonics ideális ultrahangos homogenizátorral rendelkezik az Ön számára!

    Hogyan találjuk meg a tökéletes szonikátort a sejtek megzavarásához és a fehérje extrakcióhoz a tudományban és az elemzésben

    Videó indexképe

    Az ultrahangos DNS-fragmentációt gyakran használják mintaelőkészítési lépésként a következő generációs szekvenálásban (NGS)

    Az E. coli EDL933 genomi DNS-ének elektroforetikus elemzése 0-15 perces ultrahangos kezelésnek van kitéve. L jelzi a DNS-létrát.
    (tanulmány és kép: ©Basselet et al. 2008)

    Sejtzavar ultrahangos kavitációval

    Az ultrahangos szonda típusú homogenizátorok kb. 20 000 ciklus másodpercenként (20kHz-en), és kavitációt okoznak folyadékokban vagy szuszpenziókban. Akusztikus kavitáció vákuumszerű nyomások és magas hőmérsékletek mikroszkopikus területei, amelyek szétszakítják a sejteket. Bár a hőmérséklet elérheti a több ezer Celsius fokot, a kavitációs térfogatok olyan kicsiek, hogy nem melegítik jelentősen a folyamatot. Az ultrahang által generált akusztikus kavitáció és nyíróerők perforálják vagy megszakítják a baktériumsejtek, például az E.coli sejtmembránját. A Hielscher ultrahangos készülékek lehetővé teszik a folyamatparaméterek, például az ultrahangos intenzitás, amplitúdó, energiabevitel és hőmérséklet pontos szabályozását. Ezáltal az ultrahangos lízis folyamat optimálisan beállítható a sejttípushoz, a sejtkultúrához és a folyamat céljához.
     

    Az ultrahangos lízis előnyei

    • a lízis pontos szabályozása (intenzitás, amplitúdó, hőmérséklet)
    • Megbízható, reprodukálható eredmények
    • optimális adaptáció adott mintákhoz
    • hőmérséklet-szabályozás
    • nagyon kicsi és nagyon nagy mintákhoz (μl-től literig)
    • Tisztán mechanikai kezelés
    • felhasználóbarát, biztonságos működés
    • Lineáris skálázás a laboratóriumtól a termelésig
    A VialTweeter ultrahangos készülék lehetővé teszi akár 10 injekciós üveg egyidejű mintaelőkészítését azonos folyamatfeltételek mellett. (Kattintson a nagyításhoz!)

    VialMagassugárzó ultrahangos lízishez

    Információkérés




    Vegye figyelembe a Adatvédelem.




    Ultrahangos homogenizátor vs más lízis technikák

    Míg a kémiai és enzimatikus lízis problémás lehet – Mivel a kémiai lízis megváltoztathatja a fehérjeszerkezeteket és tisztítási problémákat okozhat, az enzimatikus lízis hosszú inkubációs időt igényel, és nem reprodukálható – Az ultrahangos zavar kifinomult, gyors sejtzavar-módszer.
    Az ultrahangos lízis csak mechanikai erőkön alapul. Nem adnak hozzá vegyi anyagokat, az szonikálás nyíróerőkkel megszakítja a sejtfalat. A kémiai lízis megváltoztathatja a fehérje szerkezetét és tisztítási problémákat okozhat. Az enzimatikus zavarok hosszú inkubációs időt igényelnek, és nem reprodukálhatók. Az E.coli baktériumsejtek ultrahangos sejtzavarása gyors, egyszerű, megbízható és reprodukálható. Ezért használják a Hielscher ultrasonicatorokat a biológiai és biokémiai laboratóriumokban szerte a világon a minta előkészítéséhez, pre-ananlitikumokhoz, in vitro diagonsztikákhoz és sokrétű vizsgálatokhoz.

    Általános ajánlások az ultrahangos lízishez

    szonikáció a legnépszerűbb technika nagyon kicsi, közepes és nagy mennyiségű sejtszuszpenzió lizálására – pikolitertől 100L / óráig (ultrahangos áramlási cellával). A sejteket folyékony nyírással és kavitációval lizáljuk. A DNS-t szonikálás közben is nyírják, ezért nem szükséges DNázt adni a sejtszuszpenzióhoz.
     

    Hőmérséklet-szabályozás ultrahangos E.coli lízis során
    Ultrahangos sejtromboló UP100H (100W) sejtzavarhoz és növényi vegyületek kivonásához.A minta előhűtésével és a minta jégen történő ultrahangos kezelés során tartásával a minta termikus lebomlása könnyen megakadályozható.
    Ideális esetben a mintákat jéghidegen kell tartani a lízis során, de a legtöbb minta esetében elegendő, ha a hőmérséklet nem emelkedik a tenyészet vagy a szövetforrás hőmérséklete fölé. Ezért ajánlott, hogy tartsa a szuszpenziót jégen, és szonikálni több rövid ultrahangos impulzus 5-10 másodperc és szünetek 10-30 másodperc. A szünetek alatt a hő eloszlahat az alacsony hőmérséklet helyreállítása érdekében. Nagyobb cellamintákhoz különböző hűtőköpenyes áramlási cellás reaktorok állnak rendelkezésre.
    Olvassa el itt részletes tippeket és ajánlásokat a sikeres ultrahangos lízishez!

    Protokollok az E. coli lizátumok ultrahangos előállításához

    A kutatók Hielscher ultrahangos homogenizátorokat használnak az E.coli sejtek megzavarására. Az alábbiakban különböző tesztelt és bevált protokollokat talál az E.coli lízishez Hielscher ultrahangos homogenizátorokkal különböző E. coli-val kapcsolatos alkalmazásokhoz.
     

    Ez a videoklip bemutatja a Hielscher ultrahangos homogenizátor UP100H, egy ultrahangos készülék, amelyet széles körben használnak a minták előkészítéséhez laboratóriumokban.

    Ultrahangos homogenizátor UP100H

    Videó indexképe

    Sejtnövekedés, E. coli sejtkivonatok térhálósítása és előkészítése ultrahanggal

    A SeqA és RNS polimeráz esetében a ChIP-Chip E. coli MG1655 vagy MG1655 ΔseqA-t 37°C-on OD-vé növesztettük600 kb. 0,15 50 ml LB-ben (+ 0,2% glükóz), mielőtt 27 μl formaldehidet (37%) adtunk hozzá ml-es táptalajonként (végső koncentráció 1%). A térhálósítást lassú rázással (100 ford./perc) végeztük szobahőmérsékleten 20 percig, majd 10 ml 2,5 M glicinnel (végső koncentráció 0,5 M) kioltottuk. Hősokk-kísérletekhez az E. coli MG1655-öt 65 ml-es LB táptalajban 30°C-on tenyésztették OD-ig600 körülbelül 0,3. Ezt követően 30 ml tenyészetet átvittünk egy 43 °C-ra előmelegített lombikba, a maradékot pedig 30 °C-on tároltuk. A térhálósítás és a keresztkötés a fent leírtak szerint történt, azzal a különbséggel, hogy a sejteket 5 percig 30 vagy 43 °C-on tartották, mielőtt szobahőmérsékleten további lassú rázást végeztek volna. A sejteket centrifugálással gyűjtöttük össze, és kétszer hideg TBS-sel (pH7,5) mostuk. 1 ml lízispufferben (10 mM Tris (pH 8,0), 20% szacharóz, 50 mM NaCl, 10 mM EDTA, 10 mg / ml lizozim) és 37 ° C-on 30 percig történő inkubálás után, majd 4 ml IP puffer hozzáadásával a sejteket jégen ultrahanggal ultrahangoztuk 12-szer 30 másodperc és 30 másodperces szünetek a Hielscher ultrahangos processzor UP400St 100% -os teljesítménybeállítással. 9000 g-n 10 percig tartó centrifugálás után a felülúszó 800 μl aliquot részét -20 °C-on tároltuk. (Waldminghaus 2010)
     

    Az enzimek túltermelése és tisztítása ultrahangos szondával

    Ultrasonicator UP100H egy laboratóriumi homogenizátor, amelyet gyakran használnak a sejttenyésztő lemezek mintaelőkészítéséhez.A dekahisztidin (His10) címkével ellátott fehérjék túltermelése érdekében az E. coli BL21(DE3) pET19b konstrukciókkal transzformálódott. Egy éjszakán át tartó prekultúrát centrifugálással gyűjtöttünk be, és 1% -ot használtunk egy expressziós kultúra beoltására. A pET19mgtB-t hordozó sejteket 22°C-on tenyésztettük, amíg az optikai sűrűség 600 nm-en (OD600) 0,7 volt. A tenyészetet 17 °C-ra vittük át, és 100 μM IPTG-vel indukáltuk. 16 óra elteltével a tenyészetet centrifugálással 7 500 × g-n 4 °C-on gyűjtöttük be. A sejteket 50 mM-os foszfátpufferes sóoldatban (PBS) szuszpendálták 0,3 M NaCl-val pH 7,4-en, és ultrahanggal megszakították egy S2 mikro-csúcs sonotroddal a Hielscher ultrasonicatorban UP200St 0,5 ciklusban és 75% amplitúdóval.
    A dekahisztidinnel jelölt GtfC túltermelését 37°C-on indukáltuk OD-n600 0,6 100 μM IPTG-vel. A sejteket ezután 4 órán át inkubáltuk, begyűjtöttük és lizáltuk az MgtB fent leírtak szerint.
    A nyers sejtkivonatokat 15 000 × g-on és 4 °C-on centrifugálták a sejttörmelék leülepedésére. A tisztított kivonatokat 1 ml-es HisTrap FF nyersolaj oszlopokra töltöttük ÄKTAprime Plus rendszer segítségével. Az enzimeket a gyártó His-címkével ellátott fehérjék gradiens elúciójára vonatkozó protokollja szerint tisztítottuk. Az eluált fehérjeoldatokat kétszer dializáltuk 1000 térfogatrész 50 mM PBS-sel szemben, pH 7,4, 0,3 M NaCl-lal szemben 4°C-on. A tisztítást 12% SDS-PAGE elemezte. A fehérje koncentrációját Bradford-módszerrel határoztuk meg Roti-Quant alkalmazásával. (Rabausch et al. 2013)
     

    Fehérje ultrahangos extrakciója E. coli baktériumokból
    A kérdéses csalifehérjét (ebben az esetben az Arabidopsis thaliana MTV1-jét) GST-címkével olvasztják össze, és BL21 Escherichia coli (E. coli) sejtekben expresszálják.

    1. Vegyünk egy pelletet GST-MTV1-ből és GST-ből (ami 50 ml baktériumtenyészetnek felel meg), és szuszpendáljuk újra mindegyiket 2,5 ml jéghideg extrakciós pufferben.
    2. Használjon ultrahangos készüléket UP100H (MS3 mikrotip-sonotrodával felszerelve kis mennyiségekhez kb. 2-5 ml), hogy megzavarja a baktériumsejteket, amíg lizálódnak, amit csökkent opacitás és fokozott viszkozitás jelez. Ezt jégen kell elvégezni, és ajánlott időközönként szonikálni (pl. 10 másodperces szonikálás, majd 10 másodperces szünet jégen és így tovább). Ügyelni kell arra, hogy ne szonikáljon túl nagy intenzitással. Ha habzást vagy fehér csapadék képződését észlelik, az intenzitást csökkenteni kell.
    3. Vigyük át a lizált baktériumoldatot 1,5 ml-es mikrocentrifugacsövekbe, és centrifugáljuk 4 °C-on, 16 000 × g hőmérsékleten 20 percig.

     

    Az ultrahangos szondák az akusztikus kavitáció erőit használják a sejtek megzavarására és a molekulák és a DNS kivonására E.coli.

    Szonda típusú ultrahangos készülékek, például a UP400St használja az akusztikus kavitáció működési elvét az E.coli hatékony líziséhez.

    A rekombináns fehérje expressziós elemzése és tisztítása szonikálással

    Az E. coli pelletet ultrahanggal ultrahangosították UP100H. Ebből a célból a sejtpelletet hűtött lízispufferben (50 mM Tris-HCl pH=7,5, 100 mM NaCl, 5 mM DTT, 1 mM PMSF) szuszpendálták, és jégen 10 percig hűtötték. Ezután a sejtszuszpenziót 10 rövid, 10 másodperces sorozatokkal ultrahanggal ultrahanggal láttuk el, majd 30 másodperces intervallumot követtünk a hűtéshez. Végül a cellatörmeléket ultracentrifugálással távolították el 4 °C-on 15 percig 14000 fordulat / perc sebességgel. Az rPR expresszió megerősítésére a felülúszót 12%-os poliakrilamid gélen futtattuk, és SDS-PAGE és Western blot módszerrel elemeztük. Az rPR tisztítását Ni2+-NTA gyantával (Invitrogen, USA) végeztük a gyártói útmutató szerint. Ebben a szakaszban natív tisztítási módszert alkalmaztunk. A tisztított fehérje tisztaságát elektroforézissel mértük fel a 12%-os poliakrilamid gélen, majd ezt követően Coomassie kékfestéssel. A tisztított fehérje koncentrációját Micro BCA fehérje vizsgálati készlettel (PIERCE, USA) mértük. (Azarnezhad et al. 2016)
     

    Ez a videó bemutatja a 200 wattos ultrahangos csészeszarvat a laboratóriumi minták diszpergálására, homogenizálására, kivonására vagy gáztalanítására.

    Ultrahangos cuphorn (200 watt)

    Videó indexképe

    Ultrahangos homogenizátorok E. coli lízishez

    Hielscher Ultrasonics tervez, gyárt és szállít nagy teljesítményű ultrahangos homogenizátorok a megbízható és hatékony lízis E. coli baktériumok és más sejttípusok, szövetek és sejtkultúrák.
    Az ultrahangos szondák széles portfóliója, valamint a közvetett szonikációs rendszerek lehetővé teszik számunkra, hogy ideális ultrahangos szövethomogenizátort kínáljunk Önnek a sejtzavarokhoz és az extrakciós alkalmazáshoz.

    Tervezés, gyártás és tanácsadás – Németországban gyártott minőség

    A Hielscher ultrahangos készülékek távolról vezérelhetők a böngésző vezérlésével. Az ultrahangos paraméterek figyelemmel kísérhetők és pontosan beállíthatók a folyamat követelményeihez.A Hielscher ultrahangos készülékek jól ismertek a legmagasabb minőségi és tervezési szabványokról. Intelligens szoftver, intuitív menü, programozható beállítások és automatikus adatprotokollálás csak néhány jellemzője a Hielscher ultrasonicators. A robusztusság és a könnyű kezelhetőség lehetővé teszi ultrahangos készülékeink zökkenőmentes integrálását a kutatási és biotechnológiai létesítményekbe. Még a durva körülmények és az igényes környezetek is könnyen kezelhetők Hielscher ultrasonicators.

    Hielscher Ultrasonics egy ISO tanúsítvánnyal rendelkező cég, és különös hangsúlyt fektet a nagy teljesítményű ultrasonicatorokra, amelyek a legmodernebb technológiát és felhasználóbarátságot mutatják. Természetesen a Hielscher ultrasonicators CE-kompatibilis és megfelel az UL, CSA és RoHs követelményeinek.

    Az alábbi táblázat jelzi ultrahangos készülékeink hozzávetőleges feldolgozási kapacitását:

    Kötegelt mennyiség Áramlási sebesség Ajánlott eszközök
    Több lyukú / mikrotiter lemezek n.a. UIP400MTP
    CupHorn injekciós üvegekhez vagy főzőpohárhoz n.a. Ultrahangos CupHorn
    ultrahangos mikro-flow reaktor n.a. GDmini2
    legfeljebb 10 injekciós üveg 0,5-1,5 ml n.a. VialMagassugárzó
    0.5-től 1,5 ml-ig n.a. VialMagassugárzó
    1–500 ml 10–200 ml/perc UP100H
    10 és 2000 ml között 20–400 ml/perc UP200Ht, UP400ST
    0.1-től 20L-ig 0.2-től 4 liter/percig UIP2000hdT
    10–100 liter 2–10 l/perc UIP4000
    n.a. 10–100 l/perc UIP16000
    n.a. Nagyobb klaszter UIP16000

    Kapcsolat! / Kérdezzen tőlünk!

    További információ kérése

    Kérjük, használja az alábbi űrlapot, hogy további információkat kérjen az ultrahangos szövethomogenizátorokról és sejttörőkről, lízis alkalmazások és árak. Örömmel megvitatjuk Önnel a folyamatot, és kínálunk Önnek egy ultrahangos homogenizátort, amely megfelel az Ön igényeinek!









    Kérjük, vegye figyelembe a Adatvédelem.




    A videó bemutatja az ultrahangos mintaelőkészítő rendszert UIP400MTP, amely lehetővé teszi bármely standard többlyukú lemez megbízható mintaelőkészítését nagy intenzitású ultrahanggal. A UIP400MTP tipikus alkalmazásai közé tartozik a sejtlízis, a DNS, az RNS és a kromatin nyírása, valamint a fehérje extrakció.

    Ultrahangos UIP400MTP több lyukú lemez ultrahangos kezeléshez

    Videó indexképe

    További protokollok az ultrahangos E. coli lízishez

    Allicinnel módosított fehérjék E. coli-ban ultrahangos VialTweeter használatával

    VialTweeter az ultrahangos processzor UP200STA szulfhidril-tartalom meghatározása 5,5′-ditiobisz(2-nitrobenzoesav) (DTNB) analitikával
    Egy E. coli MG1655 éjszakai kultúrát használtunk a MOPS minimális táptalaj (1:100) beoltására. A tenyészetet aerob módon termesztették, amíg el nem érték a 0,4-es A600-at. A tenyészetet három 15 ml-es tenyészetre osztottuk stresszkezelés céljából. A kezeletlen kultúra negatív kontrollként szolgált. 0,79 mM allicint (128 μg ml-1) vagy 1 mM diamidot adtunk a fennmaradó két tenyészet egyikéhez. A tenyészeteket 15 percig inkubáltuk. Minden tenyészetből 5 ml-t centrifugálással gyűjtöttünk be (8,525 × g, 4°C, 10 perc). A sejteket kétszer átmostuk 1 ml PBS-sel (137 mM NaCl, 2,7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4, pH 7,4, használat előtt anaerob módon tároltuk) és centrifugáltuk (13 000 × g, 4°C, 10 perc). A sejteket újra szuszpendálták lízispufferben (PBS 6 mM guanidinium-HCl-lel, pH 7,4), mielőtt 4 ° C-on ultrahanggal (VialMagassugárzó ultrasonicator, Hielscher GmbH, Németország) (3 × 1 perc). A sejttörmeléket centrifugálással pelletáltuk (13 000 × g, 4 °C, 15 perc). A felülúszót egy mágneses keverőrúddal ellátott 3,5 ml-es QS-makróküvettába (10 mm) helyeztük át, és 1 ml lízispufferrel kevertük össze. A minták kihalását 412 nm-en figyeltük meg egy Jasco V-650 spektrofotométerrel, amely PSC-718 hőmérséklet-szabályozott cellatartóval volt felszerelve szobahőmérsékleten. 100 μl 3 mM ditiobisz (2-nitrobenzoesav) oldatot adtunk hozzá. A kihalást addig figyelték, amíg el nem érte a telítettséget. A tiolkoncentráció kiszámítását a ε kioltási együttható segítségével végeztük412 = 13 700 m-1 centiméter-1 tio-2-nitrobenzoesav (TNB) esetében. A celluláris tiolkoncentrációkat az E. coli sejtek 6,7 × 10 térfogata alapján számították ki-15 liter és A600 = 0,5 cellasűrűség (1 × 10-nek felel meg8 sejtek ml-1 kultúra). (Müller et al. 2016)
     

    In vivo glutation meghatározás ultrahangos cellatörővel

    Az E.coli MG1655-öt MOPS minimális táptalajban termesztettük 200 ml össztérfogatban, amíg el nem érték a 0,5-ös A600-at. A tenyészetet stresszkezelés céljából 50 ml-es tenyészetekre osztottuk. 15 perc 0,79 mM allicinnel, 1 mM diamiddal vagy dimetil-szulfoxiddal (kontroll) végzett inkubálás után a sejteket 4000 g-on 4 °C-on 10 percig gyűjtöttük. A sejteket kétszer átmostuk KPE pufferrel, mielőtt a pelleteket 700 μl KPE pufferben reszuszpendáltuk. A deproteinációhoz 300l 10% (tömeg / v) szulfoszalicilsavat adtunk hozzá a sejtek ultrahangos kezeléssel történő megszakítása előtt (3 x 1 perc; VialMagassugárzó ultrahangos készülék). A felülúszókat centrifugálás után gyűjtöttük össze (30 perc, 13 000 g, 4 °C). A szulfoszalicilsav koncentrációt 3 térfogatrész KPE puffer hozzáadásával 1%-ra csökkentettük. Az összes glutation és GSSG mérését a fent leírtak szerint végeztük. A celluláris glutation koncentrációkat 6,7 E. coli sejttérfogat alapján számították ki×10-15 liter és a cellasűrűség A600 0,5 (egyenértékű 1×108 sejtek ml-1 kultúra). A GSH-koncentrációkat úgy számították ki, hogy az összes glutationból kivonták a 2[GSSG]-t. (Müller et al. 2016)

    Az emberi mAspAT expressziója E. coli-ban ultrahangos homogenizátorral

    Ultrahangos sejtdiszruptor UP400St (400W) intracelluláris anyag kivonására (pl. Fehérjék, organellák, DNS, RNS stb.)Az E. coli BL21 (DE3) egyetlen telepe, amely expressziós vektort tartalmaz 30 ml Luria-Bertani (LB) táptalajban, amely 100 μg/ml ampicillint tartalmaz, majd 37 °C-on tenyésztik az optikai sűrűségig (OD600) elérte a 0,6-ot. A sejteket centrifugálással 4000 × g-on 10 percig gyűjtöttük, majd 100 μg/ml ampicillint tartalmazó 3 literes friss LB táptalajban szuszpendáltuk.
    Ezt követően fehérjeexpressziót indukáltunk 1 mM izopropil-β-ᴅ-1-tiogalaktopiranoziddal (IPTG) 20 órán keresztül 16 ° C-on. A sejteket centrifugálással 8000 × g-on 15 percig gyűjtöttük, és A pufferrel (20 mM NaH2PO4, 0,5 M NaCl, pH 7,4) mostuk. Körülbelül 45 g (nedves tömegű) sejteket nyertünk 3 literes tenyészetből. Centrifugálás után a sejtpelleteket 40 ml (1 L tenyészethez) jéghideg extrakciós pufferben szuszpendáltuk A, és ultrahanggal jéghideg hőmérsékleten lizáltuk a Hielscher ultrahangos cellatörővel UP400St. A sejtlízist 12 000 fordulat / perc sebességgel centrifugáltuk 15 percig, hogy elválasszuk az oldható (felülúszó) és a kicsapódott (pellet) frakciókat. (Jiang et al. 2015)
     



    Tények, amelyeket érdemes tudni

    E.coli

    Az Escherichia coli (E. coli) az Escherichia nemzetségbe tartozó Gram-negatív, fakultatívan anaerob, rúd alakú, coliform baktérium, amely általában melegvérű szervezetek (endotermek) alsó bélrendszerében található. Számos E. coli törzs (vagy altípus) létezik, amelyek különböző tulajdonságokkal rendelkeznek. A legtöbb E. coli törzs ártalmatlan az emberre, pl. a B és K-12 törzsek, amelyeket általában laboratóriumi kutatási alkalmazásokhoz használnak. Egyes törzsek azonban károsak és súlyos betegséget okozhatnak.
    Az E. coli fontos szerepet játszik a modern biológiai tervezésben és az ipari mikrobiológiában, mivel a baktériumok könnyen manipulálhatók. Gyakori laboratóriumi alkalmazások, amelyek gyakran magukban foglalják az E. coli használatát, pl. rekombináns dezoxiribonukleinsav (DNS) előállítására vagy modellszervezetként való működésre.
    Az E. coli nagyon sokoldalú gazdaszervezet heterológ fehérjék előállításához, és számos fehérjeexpressziós rendszer áll rendelkezésre az E. coli rekombináns fehérjéinek előállítására. A fehérjék magas szintű expresszióját lehetővé tevő plazmidok segítségével géneket lehet bejuttatni a baktériumokba, ami lehetővé teszi az ilyen fehérjék nagy mennyiségben történő előállítását ipari fermentációs folyamatokban.
    Az E.coli-t sejtgyárakként használják inzulin előállítására. További alkalmazások közé tartozik a módosított E. coli sejtek felhasználása vakcinák és immobilizált enzimek kifejlesztésére és előállítására, bioüzemanyagok előállítására, valamint bioremediációra.
    A K-12 törzs az E. coli mutáns formája, amely túlexpresszálja az alkalikus foszfatáz (ALP) enzimet. Ez a mutáció az enzimet folyamatosan kódoló gén hibája miatt következik be. Ha egy gén gátlás nélkül állít elő terméket, ezt konstitutív aktivitásnak nevezzük. Ezt a specifikus mutáns formát az ALP enzim izolálására és tisztítására használják.
    Az E. coli baktériumokat sejtgyárakként is széles körben használják. A módosított mikrobák (pl. baktériumok) és növényi sejtek úgynevezett sejtgyárakként használhatók. Ezek a genetikailag módosított sejtek molekulákat, vegyi anyagokat, polimereket, fehérjéket és egyéb anyagokat állítanak elő, amelyeket például a gyógyszeriparban, az élelmiszeriparban és a vegyiparban használnak. Annak érdekében, hogy felszabadítsák az ilyen biomérnöki sejtek belsejében előállított molekulákat, az ultrahangos lízis gyakori módszer a sejtfalak megzavarására és a célanyagok átadására a környező folyadékba. Tudjon meg többet a biomódosított sejtek líziséről!

    Ultrahangos DNS-nyírás

    Az ultrahangos nyíróerők általánosan használt módszer a molekulák, organellák és fehérjék felszabadítására a sejt belsejéből, valamint a DNS-szálak darabokra bontására. Az akusztikus kavitáció megszakítja a sejtfalakat és a membránokat, hogy kivonja a DNS-t a sejtekből, és körülbelül 600 töredéket hozzon létre – 800 bp hosszú, ami ideális az elemzéshez.
    Kattintson ide, ha többet szeretne megtudni a DNS-fragmentáció ultrahangos homogenizátorairól!

    Irodalom / Hivatkozások


    Nagy teljesítményű ultrahangos! A Hielscher termékcsalád lefedi a teljes spektrumot a kompakt laboratóriumi ultrahangos készülékeken keresztül a teljes ipari ultrahangos rendszerekig.

    Hielscher Ultrasonics gyárt nagy teljesítményű ultrahangos homogenizátorok labor hoz ipari méret.

    Örömmel megvitatjuk a folyamatot.

    Let's get in contact.