Recherche protéomique – Pourquoi un sonicateur est indispensable pour la préparation des échantillons

La recherche protéomique permet d'approfondir la biologie cellulaire et d'élargir notre compréhension des systèmes biologiques en permettant l'analyse complète des protéines et de leurs fonctions. La réussite des études protéomiques repose sur la préparation d'échantillons de haute qualité, ce qui implique souvent une préparation complexe et laborieuse. La sonication est un outil puissant et bien établi pour la préparation des échantillons, qui offre de nombreux avantages par rapport aux méthodes traditionnelles. Différents modèles de sonicateurs, tels que les sonicateurs à sonde, le VialTweeter et le sonicateur à plaque à haut débit UIP400MTP, offrent des avantages uniques dans le traitement des échantillons protéomiques et ouvrent la voie à des résultats de recherche fiables et reproductibles.

Pourquoi ai-je besoin d'un sonicateur pour mes recherches en protéomique ?

Sonicateur à sonde pour la désintégration et la lyse des cellules, par exemple l'allicine et les composés soufrés de l'ail et de l'oignonDans le domaine de la recherche protéomique, le besoin d'un sonicateur découle de l'importance cruciale d'obtenir des échantillons de haute qualité pour l'analyse. L'utilisation de la sonication dans la recherche protéomique est essentielle pour obtenir des résultats fiables et reproductibles en assurant une lyse cellulaire efficace, une meilleure extraction des protéines, une homogénéisation des échantillons complexes, une digestion enzymatique facilitée, une réduction de la contamination des échantillons et des capacités de traitement à haut débit.
 
L'importance de la préparation des échantillons en protéomique : L'obtention de résultats fiables et reproductibles dans les expériences de protéomique dépend d'une préparation méticuleuse des échantillons. De la lyse cellulaire à l'extraction et à la purification des protéines, chaque étape doit être exécutée avec précision pour minimiser les artefacts et garantir l'intégrité de l'échantillon. Cependant, les méthodes conventionnelles telles que la rupture mécanique et la lyse chimique ne permettent souvent pas d'obtenir les résultats souhaités en raison de problèmes tels qu'une extraction incomplète, la dégradation des protéines et la contamination de l'échantillon.

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L'UIP400MTP est un sonicateur à haut débit pour les puits multiples tels que les plaques à 96 puits et les plaques de microtitration. En protéomique, ce sonicateur pour plaques facilite la préparation d'un grand nombre d'échantillons.

Sonicateur à haut débit UIP400MTP pour la préparation d'échantillons en protéomique

 

Ce tutoriel explique quel type de sonicateur est le mieux adapté à vos tâches de préparation d'échantillons telles que la lyse, la désintégration cellulaire, l'isolement des protéines, la fragmentation de l'ADN et de l'ARN dans les laboratoires, l'analyse et la recherche. Choisissez le type de sonicateur idéal pour votre application, votre volume d'échantillon, votre nombre d'échantillons et votre débit. Hielscher Ultrasonics a l'homogénéisateur à ultrasons idéal pour vous !

Comment trouver le sonicateur parfait pour la désintégration des cellules et l'extraction des protéines en science et analyse

Vignette vidéo

 

Ultrasonication : Un changement de donne dans la préparation des échantillons protéomiques

L'ultrasonication, qui consiste à utiliser des ondes sonores à haute fréquence pour perturber les échantillons biologiques, a changé la donne dans la préparation des échantillons protéomiques. En exploitant la puissance de l'énergie acoustique, les sonicateurs facilitent la lyse cellulaire, l'extraction des protéines et la digestion enzymatique de manière rapide et efficace, ce qui permet d'obtenir des rendements plus élevés et d'améliorer la pureté des échantillons.

Tâches de préparation des échantillons facilitées par la sonication

  • Lyse cellulaire et extraction de protéines : Les sonicateurs sont idéaux pour la lyse cellulaire et l'extraction des protéines en raison de leur polyvalence et de leur précision. En délivrant des salves contrôlées d'énergie ultrasonique, un sonicateur perturbe efficacement les membranes cellulaires, libérant les protéines intracellulaires sans compromettre leur intégrité. Ceci est particulièrement utile dans les études protéomiques nécessitant des structures protéiques intactes pour l'analyse en aval, telles que les études d'interaction protéine-protéine et la protéomique structurelle.
  • Traitement des échantillons à haut débit : Le sonificateur de plaques UIP400MTP offre une efficacité inégalée dans le traitement d'échantillons protéomiques à haut débit. En exploitant l'énergie ultrasonique dans un format de plaque multi-puits, l'UIP400MTP permet la sonication simultanée de plusieurs échantillons, ce qui réduit considérablement le temps de traitement et les coûts de main-d'œuvre. Ceci est particulièrement bénéfique pour les études protéomiques à grande échelle nécessitant un criblage rapide des bibliothèques d'échantillons ou un débit élevé d'échantillons pour la découverte et la validation de biomarqueurs.
  • Augmentation des rendements après précipitation des protéines : La précipitation des protéines est couramment utilisée dans le traitement en aval des échantillons biologiques afin de concentrer les protéines et de les purifier de divers contaminants. La sonication a été démontrée comme une technique efficace de remise en suspension pour augmenter les rendements en protéines lorsque les protéines précipitées à l'acide trichloracétique (TCA) étaient ensuite soniquées. La sonication des échantillons, après précipitation au TCA suivie d'une élution dans un tampon d'échantillon, augmente la récupération des protéines totales et améliore la reproductibilité et les rapports d'appariement.
  • Homogénéisation des échantillons et mélange des tampons : La sonication facilite l'homogénéisation des échantillons, la solubilisation des cellules et le mélange des tampons dans les flux de travail de la protéomique.
VialTweeter au processeur ultrasonique UP200ST

Sonicateur VialTweeter pour la sonication simultanée de jusqu'à 10 échantillons, par exemple pour désintégrer des cellules et extraire des protéines

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Le meilleur sonicateur pour mes échantillons protéomiques

Hielscher Ultrasonics propose différents modèles de sonicateurs, dont la conception permet une préparation idéale des échantillons.
Qu'il s'agisse de sonifier de petits ou de grands nombres d'échantillons, de minuscules ou de grands volumes – Hielscher dispose du sonicateur le mieux adapté à votre application liée aux protéines.

Fioles et béchers – Le sonicateur à sonde : Le sonicateur classique à sonde est largement utilisé comme homogénéisateur de laboratoire pour les petits nombres d'échantillons, lorsque des échantillons individuels dans des flacons ou des béchers sont traités. Les homogénéisateurs de laboratoire UP50H ou UP100H avec micro-pointe sont des sonificateurs à sonde et à cornet typiques utilisés pour l'ultrasonisation directe de l'échantillon.

Plaques de 96 puits/plaques de microtitration – Le sonificateur de plaques UIP400MTP : Avec l'augmentation du nombre d'échantillons et l'utilisation de multipuits et de microplaques à 96, 384 ou 1536 puits, le sonificateur de plaques à haut débit UIP400MTP permet une sonication et une agitation simultanées et rationalisées de plusieurs échantillons, garantissant une isolation douce mais efficace des protéines ainsi qu'un mélange minutieux et une dispersion uniforme des réactifs. Ceci est particulièrement avantageux dans les expériences protéomiques impliquant des matrices d'échantillons complexes ou des préparations d'échantillons multiples, où l'homogénéité est essentielle pour obtenir des résultats précis et reproductibles.

jusqu'à 10 flacons – Le VialTweeter : Si vous travaillez avec plusieurs flacons ou tubes Eppendorf à la fois, le VialTweeter est l'outil qu'il vous faut. Le VialTweeter offre une conception unique qui permet de soniquer jusqu'à 10 flacons ou tubes fermés simultanément. La contamination croisée et la contamination par l'air sont totalement évitées.

Plusieurs flacons ou un seul flacon – Le CupHorn : L'UP200St_TD-Cuphorn est un sonicateur puissant qui vous permet de traiter simultanément plusieurs flacons à l'aide du porte-flacon ou de placer un récipient individuel dans le bain-marie CupHorn.

Nous sommes là pour vous aider

Notre équipe technique est composée d'experts en ultrasons et sait vous recommander le sonicateur le mieux adapté à vos besoins et à la réussite de vos recherches. Les sonicateurs sont devenus des outils indispensables dans la recherche protéomique, offrant une efficacité, une polyvalence et une reproductibilité inégalées dans la préparation des échantillons. Hielscher s'assure que la sonication est la plus efficace et la plus fiable en vous fournissant le modèle de sonicateur parfait. De la lyse cellulaire à l'extraction des protéines et au-delà, l'ultrasonication surpasse les méthodes traditionnelles, permettant aux chercheurs de repousser les limites de la science protéomique. Alors que la recherche protéomique continue d'évoluer, les sonicateurs constituent un outil majeur de préparation des échantillons, contribuant à l'obtention de résultats fiables et aidant à comprendre le monde complexe des protéines et de leurs fonctions.

Pourquoi Hielscher Ultrasonics?

  • haute efficacité
  • à haut débit
  • Une technologie de pointe
  • Des résultats reproductibles et répétables
  • fiabilité & robustesse
  • contrôle du processus réglable et précis
  • pour béchers, flacons, tubes, microplaques
  • pour tout volume d'échantillon
  • logiciels intelligents
  • fonctions intelligentes (par exemple, programmable, protocole de données, contrôle à distance)
  • Facile et sûr à utiliser
  • Faible entretien
  • CIP (clean-in-place)

Conception, fabrication et conseil – Qualité Made in Germany

Les ultrasons Hielscher sont réputés pour leur qualité et leur conception de haut niveau. La robustesse et la facilité d'utilisation permettent une intégration harmonieuse de nos ultrasons dans les installations industrielles. Les conditions difficiles et les environnements exigeants sont facilement gérés par les ultrasons Hielscher.

Hielscher Ultrasonics est une entreprise certifiée ISO et met l'accent sur les ultrasons de haute performance, dotés d'une technologie de pointe et d'une grande convivialité. Bien entendu, les ultrasons Hielscher sont conformes à la norme CE et répondent aux exigences des normes UL, CSA et RoHs.

Le tableau ci-dessous vous donne une indication de la capacité de traitement approximative de nos ultrasons de laboratoire, qui sont idéaux pour les tâches de préparation d'échantillons telles que la fragmentation de l'ADN et de l'ARN, la lyse cellulaire ainsi que l'isolement de l'ADN et des protéines :

Dispositif [W] Type Volume [ml]
UIP400MTP 400 pour les microplaques 6 – 3456 puits
VialTweeter 200 pour un maximum de 10 flacons, avec possibilité de fixation par pincement 00,5 – 1,5
UP50H 50 Sonde de type 0.01 – 250
UP100H 100 Sonde de type 0.01 – 500
UP200Ht 200 Sonde de type 0.1 – 1000
UP200St 200 Sonde de type 0.1 – 1000
UP400St 400 Sonde de type 5.0 – 2000
Corne de cuivre 200 CupHorn, sonoréacteur dix – 200
GDmini2 200 cellule d'écoulement sans contamination

Contactez nous! / Demandez nous!

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Veuillez utiliser le formulaire ci-dessous pour demander des informations supplémentaires sur les sonicateurs pour la recherche protéomique, les détails d'application et les prix. Nous serons heureux de discuter avec vous de la préparation de vos échantillons et de vous proposer un sonicateur répondant à vos exigences de recherche !









Veuillez prendre note de notre Politique de confidentialité.


Cornet à ultrasons pour la préparation simultanée de plusieurs échantillons dans les mêmes conditions pour l'isolement des protéines et la fragmentation de l'ADN.

cuphorn à ultrasons pour la préparation simultanée et très efficace de plusieurs échantillons dans les mêmes conditions pour l'isolement des protéines et la fragmentation de l'ADN.



Fiches d'information – Modèles Hielscher Sonicator pour la protéomique

  • Fiche d'information UP100H – Sonicateur à sonde puissant de 100 watts
  • Fiche technique UIP400MTP – Sonicateur à haut débit pour plaques multipuits
  • Fiche d'information VialTweeter – Sonication simultanée de flacons fermés

  • Questions fréquemment posées concernant la sonication et la protéomique

    La sonication peut-elle rompre les liaisons disulfures ?

    La sonication à haute puissance peut rompre les liaisons covalentes lors de l'extraction des protéines. Toutefois, lorsque la sonication est effectuée à des niveaux de puissance contrôlés correspondant aux échantillons, elle n'entraîne pas la rupture des liaisons disulfures. C'est pourquoi il est si important de contrôler avec précision les paramètres du processus ultrasonique tels que l'amplitude, la puissance, la durée et la température. Les sonicateurs Hielscher vous permettent de contrôler entièrement ces paramètres.

    La sonication peut-elle rompre les liaisons peptidiques ?

    La sonication est une méthode efficace pour améliorer la solubilisation des peptides en fragmentant les peptides solides en particules plus petites. Cependant, si après la sonication, la solution peptidique présente une gélification, une turbidité ou la présence de floculats visibles, cela indique une dissolution incomplète, le peptide étant simplement en suspension dans la matrice de la solution.
    Dans de tels cas, il est nécessaire d'utiliser un solvant plus puissant pour obtenir une dissolution complète. Si la dissolution reste un problème, il est possible de lyophiliser et d'éliminer la solution tampon volatile. Par la suite, cet échantillon séché permet d'explorer d'autres solvants pour favoriser la solubilité du peptide, ce qui permet d'identifier un système de solvants optimal.

    Littérature / Références


    Des ultrasons de haute performance ! La gamme de produits Hielscher couvre l'ensemble du spectre, depuis les ultrasons compacts de laboratoire jusqu'aux systèmes ultrasoniques industriels complets, en passant par les unités de paillasse.

    Hielscher Ultrasonics fabrique des homogénéisateurs à ultrasons de haute performance à partir d'une technologie de pointe. laboratoires à taille industrielle.


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