Εκχύλιση πρωτεϊνών από ιστό όγκου υποβοηθούμενη με υπερήχους – Πρωτόκολλο
Το παρόν πρωτόκολλο περιγράφει μια μέθοδο εκχύλισης πρωτεϊνών από ιστό όγκου υποβοηθούμενης με υπερήχους, η οποία βελτιώνει την τυπική ροή εργασίας λύσης με ουρία του CPTAC προσθέτοντας ένα ελεγχόμενο στάδιο κατεργασίας με υπερήχους μέσω κεφαλής κατά τη διάρρηξη του ιστού. Βασιζόμενη στην καθιερωμένη στρατηγική προετοιμασίας πρωτεώματος και φωσφοπρωτεώματος μεγάλου βάθους του CPTAC, αυτή η τροποποίηση βελτιώνει τη διάρρηξη των κυττάρων και των υποκυτταρικών δομών, μειώνει το ιξώδες του δείγματος και ενισχύει την απελευθέρωση πρωτεϊνών που συνήθως ανακτώνται δυσκολότερα μόνο με λύση με ουρία, ιδιαίτερα πρωτεϊνών δεσμευμένων σε μεμβράνες και πρωτεϊνών που δεσμεύονται στο DNA ή σχετίζονται με τον πυρήνα. Στη μελέτη στην οποία βασίζεται το πρωτόκολλο, η ροή εργασίας με υποβοήθηση υπερήχων αύξησε την ανίχνευση τόσο πρωτεϊνών όσο και φωσφοπεπτιδίων, διατηρώντας παράλληλα τη συμβατότητα με τα επόμενα στάδια πέψης κατά CPTAC, σήμανσης TMT, κλασμάτωσης, εμπλουτισμού φωσφοπεπτιδίων και ανάλυσης LC-MS/MS.
Εκχύλιση πρωτεϊνών από ιστό όγκου υποβοηθούμενη με υπερήχους για πρωτεωμική και φωσφοπρωτεωμική ανάλυση μεγάλου βάθους
Το ακόλουθο πρωτόκολλο είναι βελτιστοποιημένο για την εκχύλιση πρωτεϊνών από κρυοκονιοποιημένο ιστό όγκου σε ρυθμιστικό διάλυμα λύσης με ουρία 8 M: Ένα πρόσθετο στάδιο κατεργασίας με υπερήχους μέσω κεφαλής βελτιώνει την ανάκτηση κατηγοριών πρωτεϊνών που είναι δύσκολο να ανακτηθούν, ιδιαίτερα πρωτεϊνών που σχετίζονται με μεμβράνες και με το DNA ή τον πυρήνα, πριν από την πέψη και την επακόλουθη ανάλυση LC-MS/MS. Στη μελέτη των Li et al. (2025), στην οποία βασίζεται το πρωτόκολλο, η προσθήκη κατεργασίας με υπερήχους αύξησε την ανίχνευση πρωτεϊνών που σχετίζονται με μεμβράνες και με τον πυρήνα και υποστήριξε κάλυψη μεγάλου βάθους με >12.000 πρωτεΐνες και >25.000 φωσφοπεπτίδια στο πλαίσιο της ροής εργασίας τους.
Κεφαλή υπερήχων UP200St για εκχύλιση πρωτεϊνών στην πρωτεωμική
Πεδίο εφαρμογής του πρωτοκόλλου
Χρησιμοποιήστε αυτή τη διαδικασία για:
- νωπό κατεψυγμένο, κρυοκονιοποιημένο ιστό όγκου
- κυτταρικά ιζήματα ή άλλα βιολογικά δείγματα για τα οποία η εκχύλιση με βάση την ουρία είναι ήδη καθιερωμένη
- ροές εργασίας ολικής πρωτεωμικής και φωσφοπρωτεωμικής που χρησιμοποιούν πέψη με θρυψίνη και προαιρετική σήμανση TMT
Η μελέτη των Li et al. (2025) αναφέρει ότι η ροή εργασίας εφαρμόζεται επίσης σε άλλους τύπους δειγμάτων, όπως κυτταρικές σειρές, αίμα και ούρα, ωστόσο ενδέχεται να απαιτείται βελτιστοποίηση ανάλογα με τον τύπο του δείγματος.
Βελτιστοποιημένη ροή εργασίας προετοιμασίας δειγμάτων με ενσωματωμένο στάδιο κατεργασίας με υπερήχους. Η βελτιστοποιημένη ροή εργασίας και ο πειραματικός σχεδιασμός βασίζονται στο πρωτόκολλο προετοιμασίας δειγμάτων του CPTAC για ολική πρωτεωμική και φωσφοπρωτεωμική ανάλυση.
Μελέτη και διάγραμμα: ©Li et al., 2025
Αρχή λειτουργίας
Η αρχική μελέτη πρόσθεσε κατεργασία με υπερήχους στην τυπική ροή εργασίας λύσης με ουρία του CPTAC και διαπίστωσε βελτιωμένη ανίχνευση πρωτεϊνών που σχετίζονται με μεμβράνες και πυρήνες. Οι συγγραφείς αναφέρουν ότι οι παράμετροι κατεργασίας με υπερήχους πρέπει να ρυθμίζονται με ακρίβεια ανάλογα με το μέγεθος και τη συγκέντρωση του δείγματος – με την επιλογή του μεγέθους του ηχοτροδίου, της εισροής ενέργειας και του χρονισμού των παλμών.
Ενδεικτικά, για τα Hielscher UP200Ht και UP200St, αυτό σημαίνει:
- χρησιμοποιήστε το πλάτος ταλάντωσης και την παλμική λειτουργία ως κύριες μεταβλητές ελέγχου
- διατηρήστε τα δείγματα κρύα καθ’ όλη τη διάρκεια (δηλαδή σε πάγο)
- ξεκινήστε με συντηρητικές ρυθμίσεις
- βελτιστοποιήστε με κριτήρια τη διαύγεια του δείγματος, τη θερμοκρασία, την απόδοση σε πρωτεΐνες και την ποιότητα των πεπτιδίων στα επόμενα στάδια
Και τα δύο μοντέλα συσκευών υπερήχων Hielscher ισχύος 200 watts, UP200Ht και UP200St, έχουν σχεδιαστεί για μικρούς και μεσαίους όγκους δειγμάτων, με ρυθμιζόμενο πλάτος ταλάντωσης και ρυθμίσεις παλμών· και οι δύο ομογενοποιητές υπερήχων παρέχουν ψηφιακό έλεγχο μέσω οθόνης αφής για ακριβή ρύθμιση των παραμέτρων, αυτοματοποιημένη καταγραφή δεδομένων, συνδεόμενο αισθητήρα θερμοκρασίας, τηλεχειρισμό και φωτισμό δείγματος.
Αντιδραστήρια για εκχύλιση πρωτεϊνών υποβοηθούμενη με υπερήχους
Ρυθμιστικό διάλυμα λύσης με ουρία
Παρασκευάστε φρέσκο διάλυμα αμέσως πριν από τη χρήση:
- 8 M ουρία
- 75 mM NaCl
- 50 mM Tris, pH 8,0
- 1 mM EDTA
- 2 µg/mL απροτινίνη
- 10 µg/mL λευπεπτίνη
- 1 mM PMSF
- 10 mM NaF
- 20 µM PUGNAc
- Μείγμα αναστολέων φωσφατασών 2, 1:100 (v/v)
- Μείγμα αναστολέων φωσφατασών 3, 1:100 (v/v)
Η ουρία πρέπει να έχει διαλυθεί πλήρως πριν από την προσθήκη των πρόσθετων· οι αναστολείς θα πρέπει να προστίθενται αμέσως πριν από τη χρήση· το ρυθμιστικό διάλυμα θα πρέπει να διατηρείται σε πάγο· και μετά την προσθήκη των πρόσθετων συνιστάται ήπια ανάδευση με κυκλικές κινήσεις αντί για έντονη ανάδευση σε αναμείκτη τύπου vortex.
Πρόσθετα αντιδραστήρια:
- Αντιδραστήρια προσδιορισμού πρωτεϊνών με τη μέθοδο BCA
- 50 mM Tris-HCl, pH 8,0
- DTT
- Ιωδοακεταμίδιο
- LysC
- Θρυψίνη
- Μυρμηκικό οξύ
- Αντιδραστήρια TMT, εάν χρησιμοποιείται πολυπλεγμένη ποσοτική πρωτεωμική
- Αντιδραστήρια IMAC, εάν πραγματοποιείται εμπλουτισμός φωσφοπεπτιδίων
Συσκευή υπερήχων UP200Ht με μικρορύγχος S26d2 για την προετοιμασία δειγμάτων
Εξοπλισμός για την εκχύλιση πρωτεϊνών με υποβοήθηση υπερήχων
Απαιτούμενος εξοπλισμός
Συνιστώμενη επιλογή κεφαλής υπερήχων
Για δείγματα περίπου 200–1000 µL, χρησιμοποιήστε ηχοτρόδιο μικρής διαμέτρου κατάλληλο για άμεση επεξεργασία μικρών όγκων με υψηλή ένταση. Η Hielscher προσφέρει ηχοτρόδια πολλών διαμέτρων, ενώ οι μικρότερες διάμετροι του άκρου παρέχουν υψηλότερη ένταση στο άκρο.
Πρακτική σημείωση: Χρησιμοποιήστε τη μικρότερη κεφαλή υπερήχων που εξασφαλίζει αποτελεσματική ανάμειξη χωρίς υπερβολικό αφρισμό ή επαφή με το τοίχωμα του δοχείου.
Εάν εργάζεστε με πολλά δείγματα ταυτόχρονα, θα μπορούσατε να εξετάσετε τη συσκευή υπερήχων πολλαπλών σωληναρίων VialTweeter ή τη συσκευή υπερήχων μικροπλακών UIP400MTP!
Οδηγίες βήμα προς βήμα: Διαδικασία εκχύλισης πρωτεϊνών με υποβοήθηση υπερήχων
A. Πρόψυξη και προετοιμασία
- Ψύξτε τη φυγόκεντρο στους 4°C.
- Παρασκευάστε φρέσκο ρυθμιστικό διάλυμα λύσης με ουρία και διατηρήστε το σε πάγο.
- Τοποθετήστε το UP200Ht ή το UP200St σε βάση στήριξης μέσα σε ηχομονωτικό θάλαμο.
- Προετοιμάστε ένα λουτρό πάγου αρκετά μεγάλο ώστε να συγκρατεί τα σωληνάρια των δειγμάτων όρθια και σταθερά.
Η παρασκευή φρέσκου ρυθμιστικού διαλύματος και ο χειρισμός σε ψυχρές συνθήκες είναι κρίσιμης σημασίας.
B. Αρχική εκχύλιση με ουρία
- Διατηρήστε τον κρυοκονιοποιημένο ιστό σε πάγο.
- Προσθέστε 200 µL ψυχρού ρυθμιστικού διαλύματος λύσης με ουρία ανά 50 mg υγρού ιστού.
- Αναμείξτε σε vortex για 5–10 s σε υψηλή ταχύτητα.
- Επωάστε για 15 min στους 4°C.
- Επαναλάβετε το βήμα ανάμειξης σε vortex και επώασης ακόμη μία φορά.
- Φυγοκεντρήστε στα 20.000g για 10 min στους 4°C.
- Μεταφέρετε το λύμα/υπερκείμενο σε καθαρό σωληνάριο χαμηλής δέσμευσης.
C. Κατεργασία με υπερήχους με χρήση του UP200Ht ή του UP200St
Αρχικές συνθήκες κατεργασίας με υπερήχους
- Πλάτος ταλάντωσης: ξεκινήστε από 20–30%
- Διάρκεια παλμού: 5 s ενεργοποίησης
- Ψύξη: 2 min σε πάγο μεταξύ των παλμών
- Αριθμός κύκλων: 4 κύκλοι
- Συνολικός χρόνος ενεργού κατεργασίας με υπερήχους: 20 s
- Συνολικός χρόνος διαδικασίας, συμπεριλαμβανομένης της ψύξης: περίπου 8–10 min
Βήματα κατεργασίας με υπερήχους
- Μεταφέρετε το λύμα σε σωληνάριο κατάλληλο για κατεργασία με υπερήχους. Χρησιμοποιήστε ένα στενό σωληνάριο με λεπτά τοιχώματα που επιτρέπει καλή ανταλλαγή θερμότητας και ασφαλή εμβάπτιση της κεφαλής υπερήχων.
- Τοποθετήστε το σωληνάριο σε λουτρό πάγου. Η δημοσίευση χαρακτηρίζει την ψύξη κατά την κατεργασία με υπερήχους κρίσιμη για την αποφυγή θερμικής βλάβης.
- Βυθίστε το άκρο της κεφαλής υπερήχων στο δείγμα. Διατηρήστε το άκρο επαρκώς βυθισμένο για σταθερή σπηλαίωση, αλλά μην το αφήνετε να αγγίζει το τοίχωμα ή τον πυθμένα του σωληναρίου.
- Εφαρμόστε έναν παλμό 5 s στο αρχικό πλάτος ταλάντωσης.
- Επαναφέρετε αμέσως το δείγμα πλήρως στον πάγο για 2 min.
- Επαναλάβετε μέχρι να ολοκληρωθούν 4 κύκλοι.
- Ελέγξτε το λύμα μετά τον κύκλο.
- Συνεχίστε μόνο εάν χρειάζεται, εφαρμόζοντας έναν επιπλέον παλμό 5 s κάθε φορά, ακολουθούμενο πάντοτε από πλήρη ψύξη.
- Σταματήστε μόλις το λύμα γίνει πιο ομοιόμορφο και λιγότερο νηματοειδές/ιξώδες.
Το τελικό σημείο είναι ένα πιο ημιδιαφανές λύμα που σχηματίζει σταγόνες αντί για συνεχή ιξώδη ροή. - Φυγοκεντρήστε σε περίπου 16.000g για 15 min στους 4°C.
- Μεταφέρετε το διαυγασμένο υπερκείμενο σε νέο σωληνάριο και μετρήστε τη συγκέντρωση πρωτεϊνών.
Σύγκριση συνολικής πρωτεωμικής και φωσφοπρωτεωμικής μεταξύ δειγμάτων που υποβλήθηκαν και δειγμάτων που δεν υποβλήθηκαν σε κατεργασία με υπερήχους.
a. Αριθμός ταυτοποιημένων πρωτεϊνών (συνολική πρωτεωμική) σε όλους τους καρκινικούς ιστούς PDX με ή χωρίς κατεργασία με υπερήχους. b. Αριθμός ταυτοποιημένων φωσφοπεπτιδίων (εμπλουτισμός IMAC) σε όλους τους καρκινικούς ιστούς PDX με ή χωρίς κατεργασία με υπερήχους. Καταμετρήθηκαν μόνο πρωτεΐνες και φωσφοπεπτίδια με λόγο αφθονίας μεγαλύτερο ή ίσο με το 25ο εκατοστημόριο. Ο λόγος αφθονίας υπολογίστηκε μεταξύ δειγμάτων του ίδιου τύπου.
Μελέτη και γραφήματα: ©Li et al., 2025
Επακόλουθη πέψη και ανάλυση
Μετά την κατεργασία με υπερήχους και τη διαύγαση, συνεχίστε όπως περιγράφεται στην αρχική ροή εργασίας τύπου CPTAC:
- Αραιώστε το λύμα 1:3 (v/v) με 50 mM Tris-HCl pH 8,0 ώστε να μειωθεί η συγκέντρωση ουρίας σε <2 M.
- Προσθέστε LysC σε αναλογία 1 mAU ανά 50 µg πρωτεΐνης και επωάστε για 2 h στους 25°C.
- Προσθέστε θρυψίνη σε αναλογία 1:49 ένζυμο:υπόστρωμα (w/w) και πραγματοποιήστε πέψη καθ’ όλη τη διάρκεια της νύχτας στους 25°C.
- Τερματίστε την αντίδραση με μυρμηκικό οξύ σε τελική συγκέντρωση 1%.
- Συνεχίστε με αφαλάτωση, σήμανση TMT, κλασμάτωση, εμπλουτισμό φωσφοπεπτιδίων και LC-MS/MS, όπως απαιτείται.
Διαφορική έκφραση φωσφοπεπτιδίων από MS με σήμανση TMT.
a. Ο βασικός υπότυπος, με επισήμανση ορισμένων ανθρώπινων φωσφοπεπτιδίων (αρχή και τέλος της protein-sequence) που παρουσιάζουν αυξημένη έκφραση στα δείγματα που υποβλήθηκαν σε κατεργασία με υπερήχους σε σύγκριση με τα δείγματα που δεν υποβλήθηκαν σε κατεργασία με υπερήχους. b. Ο αυλικός υπότυπος, με επισήμανση ορισμένων ανθρώπινων φωσφοπεπτιδίων (αρχή και τέλος της protein_sequence) που παρουσιάζουν αυξημένη έκφραση στα δείγματα που υποβλήθηκαν σε κατεργασία με υπερήχους σε σύγκριση με τα δείγματα που δεν υποβλήθηκαν σε κατεργασία με υπερήχους. c. Εμπλουτισμένες οδοί KEGG βάσει των πρωτεϊνών των φωσφοπεπτιδίων με αυξημένη έκφραση στον βασικό υπότυπο όγκων που υποβλήθηκε σε κατεργασία με υπερήχους. d. Εμπλουτισμένες οδοί KEGG βάσει των πρωτεϊνών των φωσφοπεπτιδίων με αυξημένη έκφραση στον αυλικό υπότυπο όγκων που υποβλήθηκε σε κατεργασία με υπερήχους.
Μελέτη και γραφήματα: ©Li et al., 2025
Σχεδιασμός, κατασκευή και συμβουλευτικές υπηρεσίες – Ποιότητα κατασκευής από τη Γερμανία
Οι συσκευές υπερήχων της Hielscher είναι γνωστές για τα υψηλότερα πρότυπα ποιότητας και σχεδιασμού τους. Η ανθεκτικότητα και η εύκολη λειτουργία επιτρέπουν την ομαλή ενσωμάτωση των συσκευών υπερήχων μας σε βιομηχανικές εγκαταστάσεις. Οι συσκευές υπερήχων της Hielscher ανταποκρίνονται με ευκολία σε αντίξοες συνθήκες και απαιτητικά περιβάλλοντα.
Η Hielscher Ultrasonics είναι εταιρεία πιστοποιημένη κατά ISO και δίνει ιδιαίτερη έμφαση σε συσκευές υπερήχων υψηλών επιδόσεων που διαθέτουν τεχνολογία αιχμής και είναι φιλικές προς τον χρήστη. Φυσικά, οι συσκευές υπερήχων της Hielscher συμμορφώνονται με το CE και πληρούν τις απαιτήσεις των UL, CSA και RoHs.
Συσκευή υπερήχων UIP400MTP για πλάκες πολλαπλών βοθρίων για εκχύλιση πρωτεϊνών από δείγματα με υψηλή διεκπεραιωτική ικανότητα
Βιβλιογραφία / Αναφορές
- Li Q.K.; Lih T.M.; Clark D.J.; Chen L.; Schnaubelt M.; Zhang H. (2025): Sonication-assisted protein extraction improves proteomic detection of membrane-bound and DNA-binding proteins from tumor tissues. Nature Protocols 2025 Aug;20(8):2083-2099.
- Stadlmann, J., Taubenschmid, J., Wenzel, D. et al. (2017): Comparative glycoproteomics of stem cells identifies new players in ricin toxicity. Nature 549, 2017. 538–542
- Jakob, S., Steinchen, W., Hanßmann, J. et al. (2024): The virulence regulator VirB from Shigella flexneri uses a CTP-dependent switch mechanism to activate gene expression. Nature Communications 15, 318 (2024).
- Jorge S., Capelo J.L., LaFramboise W., Dhir R., Lodeiro C., Santos H.M. (2019): Development of a Robust Ultrasonic-Based Sample Treatment To Unravel the Proteome of OCT-Embedded Solid Tumor Biopsies. Journal of Proteome Research 2019 Jul 5;18(7):2979-2986.
- Mertins P, Tang LC, Krug K, et al. (2018): Reproducible workflow for multiplexed deep-scale proteome and phosphoproteome analysis of tumor tissues by liquid chromatography-mass spectrometry. (Initial CPTAC protocol). Nature Protocols 7, 2018. 1632-1661.
Συχνές ερωτήσεις
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ της εκχύλισης πρωτεϊνών από φυτικό ιστό και της εκχύλισης από ιστό θηλαστικών;
Η εκχύλιση πρωτεϊνών από φυτικό ιστό είναι συνήθως δυσκολότερη από ό,τι από ιστό θηλαστικών, επειδή τα φυτικά κύτταρα έχουν άκαμπτο κυτταρικό τοίχωμα πλούσιο σε κυτταρίνη, άφθονους πολυσακχαρίτες, φαινολικές ενώσεις, χρωστικές και ενεργά ενδογενή ένζυμα που μπορούν να παρεμποδίσουν τη διαλυτοποίηση των πρωτεϊνών, να επιμολύνουν τα εκχυλίσματα ή να προάγουν την αποικοδόμηση των πρωτεϊνών. Αντίθετα, ο ιστός θηλαστικών δεν διαθέτει κυτταρικό τοίχωμα και γενικά διαρρηγνύεται ευκολότερα με χημικά μέσα, αν και συχνά περιέχει περισσότερα λιπίδια, εξωκυττάρια μήτρα και πρωτεάσες, που μπορούν και πάλι να δυσχεράνουν την εκχύλιση. Ως αποτέλεσμα, τα πρωτόκολλα για φυτικούς ιστούς απαιτούν συνήθως εντονότερη μηχανική διάρρηξη, άλεση σε χαμηλή θερμοκρασία και πρόσθετα όπως PVPP ή αναγωγικούς παράγοντες, ή καθαρισμό με βάση τη φαινόλη, ενώ ο ιστός θηλαστικών υποβάλλεται συχνότερα σε επιτυχή επεξεργασία με ρυθμιστικά διαλύματα που περιέχουν απορρυπαντικά, όπως το RIPA, ή με συστήματα λύσης με βάση την ουρία. Τόσο ο φυτικός ιστός όσο και ο ιστός θηλαστικών μπορούν να υποστούν αποτελεσματική λύση με κατεργασία με υπερήχους!
Πώς μπορεί να βελτιωθεί η εκχύλιση πρωτεϊνών από ιστό με χρήση ρυθμιστικού διαλύματος RIPA;
Η εκχύλιση πρωτεϊνών από ιστό με ρυθμιστικό διάλυμα RIPA μπορεί να βελτιωθεί με τη βελτιστοποίηση τόσο της διάρρηξης όσο και της προστασίας του δείγματος. Τα σημαντικότερα μέτρα είναι η διατήρηση του ιστού και του ρυθμιστικού διαλύματος σε χαμηλή θερμοκρασία, η χρήση πρόσφατα παρασκευασμένων αναστολέων πρωτεασών και φωσφατασών, ο σχολαστικός λεπτοτεμαχισμός ή η κονιοποίηση του ιστού πριν από τη λύση, η διατήρηση κατάλληλης αναλογίας ρυθμιστικού διαλύματος προς ιστό και η προσθήκη ενός σταδίου μηχανικής διάρρηξης, όπως η ομογενοποίηση ή η σύντομη κατεργασία με υπερήχους με ανιχνευτή, για τη διάσπαση του πυκνού ιστού και τη μείωση του ιξώδους. Η απόδοση της εκχύλισης βελτιώνεται επίσης όταν τα λύματα επωάζονται σε πάγο με διαλείπουσα ανάμειξη και ακολουθεί φυγοκέντρηση υψηλής ταχύτητας υπό ψύξη για την απομάκρυνση των αδιάλυτων υπολειμμάτων. Για ινώδεις ιστούς, ιστούς πλούσιους σε λιπίδια ή ιστούς με έντονη δομική οργάνωση, η επανάληψη της εκχύλισης μία φορά ή η αύξηση του χρόνου έκθεσης στο απορρυπαντικό μπορεί να βελτιώσει την ανάκτηση, αλλά θα πρέπει να αποφεύγονται η υπερβολική κατεργασία με υπερήχους ή ο παρατεταμένος χειρισμός σε θερμοκρασία δωματίου, επειδή μπορούν να προκαλέσουν μετουσίωση των πρωτεϊνών ή να αυξήσουν την πρωτεόλυση.
Ποιες απαιτήσεις ασφάλειας πρέπει να τηρούνται κατά την εκχύλιση πρωτεϊνών με υπερήχους;
Πραγματοποιείτε την κατεργασία με υπερήχους με εμβαπτιζόμενο ηχοτρόδιο μέσα σε ηχομονωτικό θάλαμο ή με κατάλληλα μέσα προστασίας της ακοής. Το πρωτόκολλο της πηγής προειδοποιεί ειδικά για τον επιβλαβή ακουστό θόρυβο που παράγεται κατά την κατεργασία με υπερήχους.
Φοράτε προστατευτικά γυαλιά, εργαστηριακή ποδιά και γάντια.
Κρατάτε το ηχοτρόδιο μακριά από το δέρμα και μην υποβάλλετε ποτέ σε κατεργασία με υπερήχους ένα ανοικτό δοχείο χωρίς προστασία από πιτσιλίσματα.
Χειρίζεστε το PMSF και τους άλλους αναστολείς σύμφωνα με τους τοπικούς κανόνες χημικής ασφάλειας.
Διατηρείτε τα δείγματα σε πάγο για να μειώσετε τις βλάβες των πρωτεϊνών που προκαλούνται από τη θερμότητα· η δημοσίευση επισημαίνει επανειλημμένα ότι ο έλεγχος της θερμοκρασίας είναι κρίσιμος.
Η συσκευή υπερήχων VialTweeter επιταχύνει και βελτιώνει την εκχύλιση πρωτεϊνών στην πρωτεωμική
Η Hielscher Ultrasonics κατασκευάζει ομογενοποιητές υπερήχων υψηλών επιδόσεων από εργαστηριακή έως βιομηχανική κλίμακα.