Πρωτεομική Έρευνα – Γιατί ένας υπερήχων είναι απαραίτητος για την προετοιμασία του δείγματος
Η πρωτεομική έρευνα δίνει βαθιά γνώση της κυτταρικής βιολογίας και διευρύνει την κατανόησή μας για τα βιολογικά συστήματα, επιτρέποντας την ολοκληρωμένη ανάλυση των πρωτεϊνών και των λειτουργιών τους. Κεντρικό στοιχείο της επιτυχίας των πρωτεομικών μελετών είναι η προετοιμασία δειγμάτων υψηλής ποιότητας, η οποία συχνά περιλαμβάνει πολύπλοκη και εντατική προετοιμασία δειγμάτων. Κατεργασία με υπερήχους είναι ένα καθιερωμένο και ισχυρό εργαλείο για την προετοιμασία δειγμάτων, προσφέροντας πολλά πλεονεκτήματα έναντι των παραδοσιακών μεθόδων. Διάφορα μοντέλα υπερήχων όπως οι υπερήχων τύπου καθετήρα, το VialTweeter και ο UIP400MTP υψηλής απόδοσης υπερηχητικός πλάκας προσφέρουν μοναδικά πλεονεκτήματα στην πρωτεομική επεξεργασία δειγμάτων και ανοίγουν το δρόμο για αξιόπιστα, αναπαραγώγιμα ερευνητικά αποτελέσματα.
Γιατί χρειάζομαι έναν υπερηχητή για την πρωτεομική μου έρευνα;
Στον τομέα της πρωτεομικής έρευνας, η ανάγκη για έναν υπερήχων πηγάζει από την κρίσιμη σημασία της επίτευξης δειγμάτων υψηλής ποιότητας για ανάλυση. Η χρήση υπερήχων στην πρωτεομική έρευνα είναι απαραίτητη για την επίτευξη αξιόπιστων και αναπαραγώγιμων αποτελεσμάτων εξασφαλίζοντας αποτελεσματική κυτταρική λύση, βελτιωμένη εκχύλιση πρωτεϊνών, ομογενοποίηση σύνθετων δειγμάτων, διευκολυνόμενη ενζυματική πέψη, μείωση της μόλυνσης του δείγματος και δυνατότητες επεξεργασίας υψηλής απόδοσης.
Η σημασία της προετοιμασίας του δείγματος στην πρωτεομική: Η επίτευξη αξιόπιστων και αναπαραγώγιμων αποτελεσμάτων σε πρωτεομικά πειράματα εξαρτάται από τη σχολαστική προετοιμασία του δείγματος. Από την κυτταρική λύση έως την εκχύλιση και τον καθαρισμό πρωτεϊνών, κάθε βήμα πρέπει να εκτελείται με ακρίβεια για να ελαχιστοποιηθούν τα τεχνουργήματα και να διασφαλιστεί η ακεραιότητα του δείγματος. Ωστόσο, οι συμβατικές μέθοδοι όπως η μηχανική διαταραχή και η χημική λύση συχνά υπολείπονται στην επίτευξη των επιθυμητών αποτελεσμάτων λόγω ζητημάτων όπως η ατελής εκχύλιση, η αποικοδόμηση πρωτεϊνών και η μόλυνση του δείγματος.
Υπερήχων υψηλής απόδοσης UIP400MTP Για την προετοιμασία του δείγματος στην πρωτεομική
Υπερήχους: Ένα παιχνίδι-changeer στην πρωτεομική προετοιμασία δείγματος
Υπερήχους, η διαδικασία χρήσης ηχητικών κυμάτων υψηλής συχνότητας για να διαταράξει τα βιολογικά δείγματα, έχει προκύψει ως game-changer στην πρωτεομική προετοιμασία δείγματος. Αξιοποιώντας τη δύναμη της ακουστικής ενέργειας, οι υπερήχων διευκολύνουν την ταχεία και αποτελεσματική κυτταρική λύση, την εκχύλιση πρωτεϊνών και την ενζυματική πέψη, οδηγώντας σε υψηλότερες αποδόσεις και βελτιωμένη καθαρότητα δείγματος.
Εργασίες προετοιμασίας δειγμάτων που διευκολύνονται από κατεργασία με υπερήχους
- Κυτταρική λύση και εκχύλιση πρωτεϊνών: Οι υπερήχων είναι ιδανικοί για κυτταρική λύση και εκχύλιση πρωτεϊνών λόγω της ευελιξίας και της ακρίβειάς τους. Με την παροχή ελεγχόμενων εκρήξεων υπερηχητικής ενέργειας, ένας υπερήχων διαταράσσει αποτελεσματικά τις κυτταρικές μεμβράνες, απελευθερώνοντας ενδοκυτταρικές πρωτεΐνες χωρίς να διακυβεύεται η ακεραιότητά τους. Αυτό είναι ιδιαίτερα πολύτιμο σε πρωτεομικές μελέτες που απαιτούν άθικτες πρωτεϊνικές δομές για κατάντη ανάλυση, όπως μελέτες αλληλεπίδρασης πρωτεϊνών-πρωτεϊνών και δομική πρωτεομική.
- Επεξεργασία δειγμάτων υψηλής απόδοσης: Ο υπερήχων UIP400MTP πλάκας προσφέρει απαράμιλλη αποτελεσματικότητα στην πρωτεομική επεξεργασία δειγμάτων υψηλής απόδοσης. Αξιοποιώντας την υπερηχητική ενέργεια σε μορφή πλάκας πολλαπλών φρεατίων, η UIP400MTP επιτρέπει την ταυτόχρονη υπερήχηση πολλαπλών δειγμάτων, μειώνοντας δραστικά το χρόνο επεξεργασίας και το κόστος εργασίας. Αυτό είναι ιδιαίτερα επωφελές σε πρωτεομικές μελέτες μεγάλης κλίμακας που απαιτούν ταχεία διαλογή βιβλιοθηκών δειγμάτων ή υψηλή απόδοση δειγμάτων για ανακάλυψη και επικύρωση βιοδεικτών.
- Αυξημένες αποδόσεις μετά από καθίζηση πρωτεΐνης: Η καθίζηση πρωτεϊνών χρησιμοποιείται συνήθως στην κατάντη επεξεργασία βιολογικών δειγμάτων προκειμένου να συγκεντρωθούν πρωτεΐνες και να καθαριστούν από διάφορους ρύπους. Κατεργασία με υπερήχους έχει αποδειχθεί ως αποτελεσματική τεχνική για επαναιώρηση για την αύξηση των πρωτεϊνικών αποδόσεων όταν το τριχλωροξικό οξύ (TCA) καθιζάνει πρωτεΐνες όπου στη συνέχεια υπερήχων. Κατεργασία με υπερήχους των δειγμάτων, μετά από καθίζηση TCA ακολουθούμενη από έκλουση στο ρυθμιστικό διάλυμα δείγματος, αυξάνει τη συνολική ανάκτηση πρωτεϊνών και βελτιώνει την αναπαραγωγιμότητα και τις αναλογίες αντιστοίχισης.
- Ομογενοποίηση δείγματος και ανάμιξη ρυθμιστικού διαλύματος: Κατεργασία με υπερήχους διευκολύνει την ομογενοποίηση του δείγματος, τη διαλυτοποίηση των κυττάρων και την ανάμιξη ρυθμιστικού διαλύματος σε ροές εργασίας πρωτεομικής.
ViaTweeter υπερήχων για την ταυτόχρονη υπερήχηση έως και 10 δειγμάτων, π.χ. για τη διάσπαση των κυττάρων και την εξαγωγή πρωτεϊνών
Ο καλύτερος υπερήχων για τα πρωτεομικά μου δείγματα
Hielscher Υπέρηχοι προσφέρει διάφορα μοντέλα υπερήχων, των οποίων τα σχέδια καθιστούν δυνατή την ιδανική προετοιμασία δείγματος.
Είτε θέλετε να υπερήχων μικρούς ή υψηλούς αριθμούς δειγμάτων, λεπτούς ή μεγάλους όγκους – Hielscher έχει το πιο κατάλληλο υπερήχων για την εφαρμογή που σχετίζονται με πρωτεΐνες σας.
Φιαλίδια και ποτήρια ζέσεως – Ο ηχητικός τύπος ανιχνευτή: Ο κλασικός υπερηχητής τύπου καθετήρα χρησιμοποιείται ευρέως ως ομογενοποιητής εργαστηρίου για μικρότερους αριθμούς δειγμάτων, όταν τα μεμονωμένα δείγματα σε φιαλίδια ή ποτήρια ζέσεως είναι διαδικασίες. Οι ομογενοποιητές εργαστηρίου UP50H ή UP100H με μικρο-άκρη είναι τυπικοί ανιχνευτές / κέρατο-υπερήχων που χρησιμοποιούνται για άμεση υπερήχους του δείγματος.
Πλάκες 96 φρεατίων / πλάκες μικροτιτλοδότησης – Το UIP400MTP Plate-Sonicator: Με την αύξηση του αριθμού των δειγμάτων και τη χρήση πολλαπλών φρεατίων και μικροπλακών με 96, 384 ή 1536 πηγάδια, UIP400MTP υπερηχητικός πλάκας υψηλής απόδοσης επιτρέπει τη βελτιωμένη ταυτόχρονη υπερήχηση και ανάδευση πολλαπλών δειγμάτων, εξασφαλίζοντας απαλή, αλλά αποτελεσματική απομόνωση πρωτεϊνών καθώς και διεξοδική ανάμειξη και ομοιόμορφη διασπορά αντιδραστηρίων. Αυτό είναι ιδιαίτερα επωφελές σε πρωτεομικά πειράματα που περιλαμβάνουν πολύπλοκες μήτρες δειγμάτων ή πολλαπλά παρασκευάσματα δειγμάτων, όπου η ομοιογένεια είναι κρίσιμη για ακριβή και αναπαραγώγιμα αποτελέσματα.
έως 10 φιαλίδια – Το VialTweeter: Εάν εργάζεστε με πολλά φιαλίδια όπως σωλήνες Eppendorf ταυτόχρονα, το VialTweeter είναι το εργαλείο της επιλογής σας. Το VialTweeter προσφέρει ένα μοναδικό σχεδιασμό που επιτρέπει την υπερήχηση έως και 10 κλειστών φιαλιδίων ή σωλήνων ταυτόχρονα. Η διασταυρούμενη μόλυνση και η αερομεταφερόμενη μόλυνση αποφεύγονται εντελώς.
Πολλά φιαλίδια ή μεμονωμένα αγγεία – Το CupHorn: Το UP200St_TD-Cuphorn είναι ένας ισχυρός υπερηχητής, ο οποίος σας επιτρέπει να επεξεργαστείτε είτε πολλά φιαλίδια ταυτόχρονα χρησιμοποιώντας τη θήκη φιαλιδίου είτε να τοποθετήσετε ένα μεμονωμένο δοχείο στο λουτρό νερού CupHorn.
Είμαστε εδώ για να σας βοηθήσουμε
Το τεχνικό προσωπικό μας είναι ειδικοί στην υπερήχων και πολύ έμπειροι στο να σας προτείνουμε τον καταλληλότερο υπερηχητή που πληροί τις απαιτήσεις σας και μετατρέπει την έρευνά σας σε επιτυχία. Καθώς οι υπερήχων έχουν γίνει απαραίτητα εργαλεία στην πρωτεομική έρευνα, προσφέροντας απαράμιλλη αποτελεσματικότητα, ευελιξία και αναπαραγωγιμότητα στην προετοιμασία δειγμάτων, Hielscher διασφαλίζει ότι η υπερήχηση είναι πιο αποτελεσματική και αξιόπιστη παρέχοντάς σας το τέλειο μοντέλο υπερήχων. Από την κυτταρική λύση έως την εκχύλιση πρωτεϊνών και πέρα, υπερήχους ξεπερνά τις παραδοσιακές μεθόδους, εξουσιοδοτώντας τους ερευνητές να ωθήσουν τα όρια της πρωτεομικής επιστήμης. Καθώς η πρωτεομική έρευνα συνεχίζει να εξελίσσεται, οι υπερήχων είναι ένα σημαντικό εργαλείο προετοιμασίας δείγματος, συμβάλλοντας σε αξιόπιστα αποτελέσματα και βοηθώντας στην κατανόηση του πολύπλοκου κόσμου των πρωτεϊνών και των λειτουργιών τους.
- υψηλή απόδοση
- υψηλή απόδοση
- Τεχνολογία αιχμής
- Αναπαραγώγιμα, επαναλαμβανόμενα αποτελέσματα
- αξιοπιστία & Ευρωστία
- Ρυθμιζόμενος, ακριβής έλεγχος της διαδικασίας
- για ποτήρια, φιαλίδια, σωλήνες, μικροπλάκες
- για οποιονδήποτε όγκο δείγματος
- έξυπνο λογισμικό
- έξυπνες λειτουργίες (π.χ. προγραμματιζόμενες, πρωτόκολλο δεδομένων, τηλεχειριστήριο)
- εύκολο και ασφαλές στη λειτουργία
- χαμηλή συντήρηση
- CIP (επιτόπιος καθαρισμός)
Σχεδιασμός, Κατασκευή και Συμβουλευτική – Ποιότητα Made in Germany
Hielscher υπερήχων είναι γνωστή για την υψηλότερη ποιότητα και τα πρότυπα σχεδιασμού τους. Η ευρωστία και η εύκολη λειτουργία επιτρέπουν την ομαλή ενσωμάτωση των υπερήχων μας σε βιομηχανικές εγκαταστάσεις. Οι σκληρές συνθήκες και τα απαιτητικά περιβάλλοντα αντιμετωπίζονται εύκολα από τους υπερήχους Hielscher.
Hielscher Υπέρηχοι είναι μια πιστοποιημένη εταιρεία ISO και δίνουν ιδιαίτερη έμφαση σε υψηλής απόδοσης υπερήχων που διαθέτουν state-of-the-art τεχνολογία και φιλικότητα προς το χρήστη. Φυσικά, Hielscher υπερήχων είναι CE συμβατό και πληρούν τις απαιτήσεις των UL, CSA και RoHs.
Ο παρακάτω πίνακας σας δίνει μια ένδειξη της κατά προσέγγιση ικανότητας επεξεργασίας των εργαστηριακών υπερήχων μας, οι οποίοι είναι ιδανικοί για εργασίες προετοιμασίας δειγμάτων όπως ο κατακερματισμός DNA και RNA, η κυτταρική λύση καθώς και η απομόνωση DNA και πρωτεϊνών:
| Συσκευή | Ισχύς [W] | Δακτυλογραφώ | Όγκος [mL] |
|---|---|---|---|
| UIP400MTP | 400 | για μικροπλάκες | 6 – 3456 πηγάδια | VialTweeter | 200 | για έως 10 φιαλίδια συν δυνατότητα σύσφιξης | 0.5 – 1.5 |
| UP50Η | 50 | Τύπος αισθητήρα | 0.01 – 250 |
| UP100Η | 100 | Τύπος αισθητήρα | 0.01 – 500 |
| UP200Ht | 200 | Τύπος αισθητήρα | 0.1 – 1000 |
| UP200St | 200 | Τύπος αισθητήρα | 0.1 – 1000 |
| UP400St | 400 | Τύπος αισθητήρα | 5.0 – 2000 |
| Cuphorn | 200 | CupHorn, sonoreactor | 10 – 200 |
| GDmini2 | 200 | κύτταρο ροής χωρίς μόλυνση |
Επικοινωνήστε μαζί μας! / Ρωτήστε μας!
Υπερήχων CupHorn για την ταυτόχρονη, εξαιρετικά αποτελεσματική προετοιμασία δείγματος πολλαπλών δειγμάτων υπό τις ίδιες συνθήκες για απομόνωση πρωτεϊνών και κατακερματισμό DNA.
Ενημερωτικά δελτία – Hielscher Sonicator μοντέλα για πρωτεομική
Συχνές ερωτήσεις σχετικά με κατεργασία με υπερήχους και πρωτεομική
Μπορεί η υπερήχηση να σπάσει δισουλφιδικούς δεσμούς;
Κατεργασία με υπερήχους σε υψηλή ισχύ μπορεί να σπάσει ομοιοπολικούς δεσμούς κατά τη διάρκεια της εκχύλισης πρωτεϊνών. Ωστόσο, όταν υπερήχηση διεξάγεται σε ελεγχόμενα επίπεδα ισχύος που ταιριάζουν με τα δείγματα. Η ulrasonication δεν θα έχει ως αποτέλεσμα τη θραύση των δισουλφιδικών δεσμών. Αυτός είναι ο λόγος για τον οποίο ακριβώς ο έλεγχος των παραμέτρων της διαδικασίας υπερήχων όπως το πλάτος, η ισχύς, ο χρόνος και η θερμοκρασία είναι τόσο σημαντικές. Hielscher υπερήχων σας δίνουν τον πλήρη έλεγχο αυτών των παραμέτρων.
Μπορεί η υπερήχηση να σπάσει πεπτιδικούς δεσμούς;
Κατεργασία με υπερήχους είναι μια αποτελεσματική μέθοδος για την ενίσχυση της διαλυτοποίησης πεπτιδίων με κατακερματισμό στερεών πεπτιδίων σε μικρότερα σωματίδια. Ωστόσο, εάν μετά την υπερήχηση, το πεπτιδικό διάλυμα παρουσιάζει ζελατινοποίηση, θολερότητα ή παρουσία ορατών κροκιδωτών, υποδεικνύει ατελή διάλυση, με το πεπτίδιο απλώς να αιωρείται εντός της μήτρας του διαλύματος.
Σε τέτοιες περιπτώσεις, προκύπτει η ανάγκη για έναν ισχυρότερο διαλύτη για να επιτευχθεί πλήρης διάλυση. Εάν η διάλυση επιμένει ως πρόκληση, μπορείτε να λυοφιλοποιήσετε και να αφαιρέσετε το πτητικό ρυθμιστικό διάλυμα. Στη συνέχεια, αυτό το αποξηραμένο δείγμα επιτρέπει τη διερεύνηση εναλλακτικών διαλυτών για την προώθηση της διαλυτότητας των πεπτιδίων, επιτρέποντας έτσι την ταυτοποίηση ενός βέλτιστου συστήματος διαλυτών.
Βιβλιογραφία / Αναφορές
- Lindemann C, Lupilova N, Müller A, Warscheid B, Meyer HE, Kuhlmann K, Eisenacher M, Leichert LI. (2013): Redox proteomics uncovers peroxynitrite-sensitive proteins that help Escherichia coli to overcome nitrosative stress. Journal of Biological Chemistry 288(27); 2013. 19698-714.
- Andreas Hofmann, Bertran Gerrits, Alexander Schmidt, Thomas Bock, Damaris Bausch-Fluck, Rudolf Aebersold, Bernd Wollscheid (2010): Proteomic cell surface phenotyping of differentiating acute myeloid leukemia cells.
Blood, Volume 116, Issue 13; 2010. e26-e34. - Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 2011.
- Fic, E., Kedracka-Krok, S., Jankowska, U., Pirog, A. and Dziedzicka-Wasylewska, M. (2010): Comparison of protein precipitation methods for various rat brain structures prior to proteomic analysis. Electrophoresis, 31; 2020. 3573-3579.
- Manadas B.J., Vougas K., Fountoulakis M., Duarte C.B. (2006): Sample sonication after trichloroacetic acid precipitation increases protein recovery from cultured hippocampal neurons, and improves resolution and reproducibility in two-dimensional gel electrophoresis. Electrophoresis 27(9); 2006. 1825-1831.
- Pooreydy, B., Jafari, M., Tajik, F., Karimi, M., Rezaei-Tavirani, M., Ghassempour, A., Rezadoost, H., & Khodabandeh, M. (2013): Organelle Isolation for Proteomics: Mitochondria from Peripheral Blood Mononuclear Cells. Archives of Advances in Biosciences 4, 2013.
Hielscher Υπέρηχοι κατασκευάζει υψηλής απόδοσης υπερήχων ομογενοποιητές από εργαστήριο προς βιομηχανικό μέγεθος.