Πρωτεωμική έρευνα – Γιατί μια συσκευή υπερήχων είναι απαραίτητη για την προετοιμασία δειγμάτων
Η πρωτεωμική έρευνα προσφέρει βαθιά γνώση της κυτταρικής βιολογίας και διευρύνει την κατανόησή μας για τα βιολογικά συστήματα, επιτρέποντας την ολοκληρωμένη ανάλυση των πρωτεϊνών και των λειτουργιών τους. Καθοριστική για την επιτυχία των πρωτεωμικών μελετών είναι η παρασκευή δειγμάτων υψηλής ποιότητας, η οποία συχνά περιλαμβάνει πολύπλοκη και απαιτητική σε εργασία προετοιμασία δειγμάτων. Η κατεργασία με υπερήχους αποτελεί ένα καθιερωμένο και ισχυρό εργαλείο για την προετοιμασία δειγμάτων, προσφέροντας πολυάριθμα πλεονεκτήματα έναντι των παραδοσιακών μεθόδων. Διάφορα μοντέλα συσκευών υπερήχων, όπως οι συσκευές υπερήχων τύπου ακίδας, το VialTweeter και η συσκευή υπερήχων υψηλής δυναμικότητας UIP400MTP για πλάκες, προσφέρουν μοναδικά πλεονεκτήματα στην επεξεργασία πρωτεωμικών δειγμάτων και ανοίγουν τον δρόμο για αξιόπιστα, αναπαραγώγιμα ερευνητικά αποτελέσματα.
Γιατί χρειάζομαι μια συσκευή υπερήχων για την πρωτεωμική μου έρευνα;
Στον τομέα της πρωτεωμικής έρευνας, η ανάγκη για μια συσκευή υπερήχων προκύπτει από την κρίσιμη σημασία της εξασφάλισης δειγμάτων υψηλής ποιότητας για ανάλυση. Η χρήση της κατεργασίας με υπερήχους στην πρωτεωμική έρευνα είναι απαραίτητη για την επίτευξη αξιόπιστων και αναπαραγώγιμων αποτελεσμάτων, καθώς εξασφαλίζει αποτελεσματική κυτταρική λύση, βελτιωμένη εκχύλιση πρωτεϊνών, ομογενοποίηση σύνθετων δειγμάτων, διευκόλυνση της ενζυμικής πέψης, μείωση της επιμόλυνσης των δειγμάτων και δυνατότητα επεξεργασίας μεγάλου αριθμού δειγμάτων.
Η σημασία της προετοιμασίας δειγμάτων στην πρωτεωμική: Η επίτευξη αξιόπιστων και αναπαραγώγιμων αποτελεσμάτων στα πρωτεωμικά πειράματα εξαρτάται από τη σχολαστική προετοιμασία των δειγμάτων. Από την κυτταρική λύση έως την εκχύλιση και τον καθαρισμό των πρωτεϊνών, κάθε βήμα πρέπει να εκτελείται με ακρίβεια, ώστε να ελαχιστοποιούνται τα τεχνουργήματα και να διασφαλίζεται η ακεραιότητα των δειγμάτων. Ωστόσο, οι συμβατικές μέθοδοι, όπως η μηχανική διάρρηξη και η χημική λύση, συχνά δεν επιτυγχάνουν τα επιθυμητά αποτελέσματα λόγω προβλημάτων όπως η ατελής εκχύλιση, η αποικοδόμηση των πρωτεϊνών και η επιμόλυνση των δειγμάτων.
Συσκευή υπερήχων υψηλής δυναμικότητας UIP400MTP για την προετοιμασία δειγμάτων στην πρωτεωμική.
Κατεργασία με υπερήχους: Μια επαναστατική εξέλιξη στην προετοιμασία πρωτεωμικών δειγμάτων
Η κατεργασία με υπερήχους, δηλαδή η διαδικασία χρήσης ηχητικών κυμάτων υψηλής συχνότητας για τη διάρρηξη βιολογικών δειγμάτων, έχει αναδειχθεί σε επαναστατική εξέλιξη στην προετοιμασία πρωτεωμικών δειγμάτων. Αξιοποιώντας την ισχύ της ακουστικής ενέργειας, οι συσκευές υπερήχων διευκολύνουν την ταχεία και αποτελεσματική κυτταρική λύση, την εκχύλιση πρωτεϊνών και την ενζυμική πέψη, οδηγώντας σε υψηλότερες αποδόσεις και βελτιωμένη καθαρότητα των δειγμάτων.
Πρωτόκολλο: Βρείτε εδώ οδηγίες βήμα προς βήμα για τη χρήση συσκευών υπερήχων πολλαπλών δειγμάτων της Hielscher στην ανάλυση βιοϋμενίων και στην πρωτεωμική ανάλυση!
Εργασίες προετοιμασίας δειγμάτων που διευκολύνονται με την κατεργασία με υπερήχους
- Κυτταρική λύση και εκχύλιση πρωτεϊνών: Οι συσκευές υπερήχων είναι ιδανικές για την κυτταρική λύση και την εκχύλιση πρωτεϊνών χάρη στην ευελιξία και την ακρίβειά τους. Παρέχοντας ελεγχόμενους παλμούς ενέργειας υπερήχων, μια συσκευή υπερήχων διαρρηγνύει αποτελεσματικά τις κυτταρικές μεμβράνες, απελευθερώνοντας ενδοκυτταρικές πρωτεΐνες χωρίς να διακυβεύεται η ακεραιότητά τους. Αυτό είναι ιδιαίτερα πολύτιμο σε πρωτεωμικές μελέτες που απαιτούν ακέραιες πρωτεϊνικές δομές για ανάλυση σε επόμενα στάδια, όπως οι μελέτες αλληλεπιδράσεων μεταξύ πρωτεϊνών και η δομική πρωτεωμική.
- Επεξεργασία δειγμάτων υψηλής δυναμικότητας: Η συσκευή υπερήχων UIP400MTP για πλάκες προσφέρει απαράμιλλη αποδοτικότητα στην επεξεργασία πρωτεωμικών δειγμάτων υψηλής δυναμικότητας. Αξιοποιώντας την ενέργεια υπερήχων σε διάταξη πλάκας πολλαπλών βοθρίων, το UIP400MTP επιτρέπει την ταυτόχρονη κατεργασία πολλαπλών δειγμάτων με υπερήχους, μειώνοντας δραστικά τον χρόνο επεξεργασίας και το κόστος εργασίας. Αυτό είναι ιδιαίτερα ωφέλιμο σε πρωτεωμικές μελέτες μεγάλης κλίμακας που απαιτούν ταχεία διαλογή βιβλιοθηκών δειγμάτων ή υψηλή δυναμικότητα επεξεργασίας δειγμάτων για την ανακάλυψη και την επικύρωση βιοδεικτών.
- Αυξημένες αποδόσεις μετά την κατακρήμνιση πρωτεϊνών: Η κατακρήμνιση πρωτεϊνών χρησιμοποιείται συνήθως στη μεταγενέστερη επεξεργασία βιολογικών δειγμάτων για τη συμπύκνωση των πρωτεϊνών και τον καθαρισμό τους από διάφορες προσμείξεις. Η κατεργασία με υπερήχους έχει αποδειχθεί αποτελεσματική τεχνική επαναιώρησης για την αύξηση της απόδοσης ανάκτησης πρωτεϊνών, όταν οι πρωτεΐνες που κατακρημνίστηκαν με τριχλωροοξικό οξύ (TCA) υποβλήθηκαν στη συνέχεια σε κατεργασία με υπερήχους. Η κατεργασία των δειγμάτων με υπερήχους, μετά την κατακρήμνιση με TCA και την επακόλουθη έκλουση σε ρυθμιστικό διάλυμα δείγματος, αυξάνει τη συνολική ανάκτηση πρωτεϊνών και βελτιώνει την αναπαραγωγιμότητα και τις αναλογίες αντιστοίχισης.
- Πρωτεολυτική πέψη: Η υποβοηθούμενη από υπερήχους πέψη πρωτεϊνών υπερέχει σημαντικά της παραδοσιακής ολονύκτιας πέψης ως προς την ταχύτητα και την αποτελεσματικότητα. Η κατεργασία με υπερήχους επιτρέπει την ταχεία αναγωγή, αλκυλίωση και πρωτεολυτική πέψη σύνθετων πρωτεωμάτων, μειώνοντας τον απαιτούμενο χρόνο από τις συνήθεις 12–24 ώρες σε μόλις λίγα λεπτά. Αυτή η προσέγγιση με υπερήχους όχι μόνο επιταχύνει τη ροή εργασίας, αλλά ενισχύει επίσης την αναπαραγωγιμότητα και τη συνέπεια των πρωτεωμικών αναλύσεων. Διαβάστε περισσότερα εδώ!
- Φωσφοπρωτεωμική: Η κατεργασία με υπερήχους ενισχύει τις ροές εργασίας της φωσφοπρωτεωμικής κυρίως βελτιώνοντας την αποτελεσματικότητα της κυτταρικής λύσης και την εκχύλιση πρωτεϊνών, ιδιαίτερα πρωτεϊνών που είναι ισχυρά δεσμευμένες ή συνδέονται με μεμβράνες. Οι μηχανικές δυνάμεις διάτμησης που δημιουργούνται κατά την κατεργασία με υπερήχους διαρρηγνύουν κυτταρικές και υποκυτταρικές δομές, διευκολύνοντας την απελευθέρωση φωσφορυλιωμένων πρωτεϊνών που διαφορετικά θα μπορούσαν να παραμείνουν απρόσιτες. Αυτό οδηγεί σε αυξημένη κάλυψη του πρωτεώματος και βελτιωμένη ανίχνευση φωσφοπεπτιδίων χαμηλής αφθονίας. Επιπλέον, η ελεγχόμενη κατεργασία με υπερήχους μπορεί να συμβάλει στη μείωση του ιξώδους του δείγματος (π.χ. μέσω κατακερματισμού των νουκλεϊκών οξέων), γεγονός που βελτιώνει τη μεταγενέστερη ενζυμική πέψη και την αποτελεσματικότητα του εμπλουτισμού φωσφοπεπτιδίων, αποδίδοντας τελικά πιο αναπαραγώγιμα και πληρέστερα προφίλ φωσφορυλίωσης. Διαβάστε περισσότερα εδώ!
- Προετοιμασία δειγμάτων με τη βοήθεια φίλτρου (FASP): Στις ροές εργασίας FASP, η κατεργασία με υπερήχους συμβάλλει ενισχύοντας τη διαλυτοποίηση και την ομογενοποίηση των πρωτεϊνών πριν από τη διήθηση. Η αποτελεσματική διάρρηξη των κυττάρων και διάσπαση των πρωτεϊνικών συσσωματωμάτων εξασφαλίζει ότι οι πρωτεΐνες εκτίθενται πλήρως σε μετουσιωτικούς παράγοντες όπως η ουρία, γεγονός κρίσιμο για την αποτελεσματική συγκράτησή τους στο φίλτρο και την επακόλουθη πέψη. Η κατεργασία με υπερήχους βοηθά επίσης στη μείωση του ιξώδους του δείγματος, επιτρέποντας ομαλότερη διήθηση και ελαχιστοποιώντας την απόφραξη του φίλτρου. Ως αποτέλεσμα, η πρωτεολυτική πέψη (συνήθως με θρυψίνη) γίνεται πιο αποτελεσματική και ομοιόμορφη, βελτιώνοντας την ανάκτηση πεπτιδίων και τη συνολική αναπαραγωγιμότητα του πρωτοκόλλου FASP. Διαβάστε περισσότερα εδώ!
- Ομογενοποίηση δειγμάτων και ανάμειξη ρυθμιστικών διαλυμάτων: Η κατεργασία με υπερήχους διευκολύνει την ομογενοποίηση δειγμάτων, τη διαλυτοποίηση κυττάρων και την ανάμειξη ρυθμιστικών διαλυμάτων στις ροές εργασίας της πρωτεωμικής.
Συσκευή υπερήχων πολλαπλών σωληναρίων VialTweeter για την ταυτόχρονη κατεργασία με υπερήχους έως και 10 δειγμάτων, π.χ. για τη διάρρηξη κυττάρων και την εκχύλιση πρωτεϊνών.
Η καλύτερη συσκευή υπερήχων για τα πρωτεωμικά μου δείγματα
Η Hielscher Ultrasonics προσφέρει διάφορα μοντέλα συσκευών υπερήχων, ο σχεδιασμός των οποίων καθιστά δυνατή την ιδανική προετοιμασία δειγμάτων.
Είτε χρειάζεται να υποβάλετε σε κατεργασία με υπερήχους μικρό ή μεγάλο αριθμό δειγμάτων, ελάχιστους ή μεγάλους όγκους – η Hielscher διαθέτει την καταλληλότερη συσκευή υπερήχων για την εφαρμογή σας που αφορά πρωτεΐνες.
Φιαλίδια και ποτήρια ζέσεως – Η συσκευή υπερήχων τύπου καθετήρα: Η κλασική συσκευή υπερήχων τύπου καθετήρα χρησιμοποιείται ευρέως ως εργαστηριακός ομογενοποιητής για μικρότερο αριθμό δειγμάτων, όταν υποβάλλονται σε επεξεργασία μεμονωμένα δείγματα σε φιαλίδια ή ποτήρια ζέσεως. Οι εργαστηριακοί ομογενοποιητές UP50H ή UP100H με μικροακίδα είναι τυπικές συσκευές υπερήχων με καθετήρα/ηχοτρόδιο τύπου κέρατος, που χρησιμοποιούνται για την άμεση κατεργασία του δείγματος με υπερήχους.
Πλάκες 96 βοθρίων/Πλάκες μικροτιτλοδότησης – Η συσκευή υπερήχων για πλάκες UIP400MTP: Καθώς αυξάνεται ο αριθμός των δειγμάτων και χρησιμοποιούνται πλάκες πολλαπλών βοθρίων και μικροπλάκες με 96, 384 ή 1536 βοθρία, η συσκευή υπερήχων για πλάκες UIP400MTP υψηλής δυναμικότητας επεξεργασίας επιτρέπει την απλοποιημένη ταυτόχρονη κατεργασία με υπερήχους και ανακίνηση πολλαπλών δειγμάτων, εξασφαλίζοντας ήπια αλλά αποτελεσματική απομόνωση πρωτεϊνών, καθώς και σχολαστική ανάμειξη και ομοιόμορφη διασπορά των αντιδραστηρίων. Αυτό είναι ιδιαίτερα πλεονεκτικό σε πρωτεωμικά πειράματα που περιλαμβάνουν σύνθετες μήτρες δειγμάτων ή πολλαπλές προετοιμασίες δειγμάτων, όπου η ομοιογένεια είναι κρίσιμη για ακριβή και αναπαραγώγιμα αποτελέσματα.
Έως 10 φιαλίδια – Το VialTweeter: Εάν εργάζεστε με πολλά φιαλίδια, όπως σωληνάρια Eppendorf, ταυτόχρονα, το VialTweeter είναι το εργαλείο της επιλογής σας. Το VialTweeter διαθέτει μοναδικό σχεδιασμό που επιτρέπει την ταυτόχρονη κατεργασία έως 10 κλειστών φιαλιδίων ή σωληναρίων με υπερήχους. Η διασταυρούμενη επιμόλυνση και η αερογενής επιμόλυνση αποφεύγονται πλήρως.
Πολλά φιαλίδια ή μεμονωμένα δοχεία – Το CupHorn: Το UP200St_TD-Cuphorn είναι μια ισχυρή συσκευή υπερήχων, η οποία σας επιτρέπει είτε να επεξεργάζεστε πολλά φιαλίδια ταυτόχρονα χρησιμοποιώντας την υποδοχή φιαλιδίων είτε να τοποθετείτε ένα μεμονωμένο δοχείο στο υδατόλουτρο CupHorn.
Είμαστε εδώ για να βοηθήσουμε
Το τεχνικό προσωπικό μας αποτελείται από ειδικούς στους υπερήχους, με εκτεταμένη εμπειρία στην πρόταση της καταλληλότερης συσκευής υπερήχων που καλύπτει τις απαιτήσεις σας και οδηγεί την έρευνά σας στην επιτυχία. Καθώς οι συσκευές υπερήχων έχουν καταστεί απαραίτητα εργαλεία στην πρωτεωμική έρευνα, προσφέροντας απαράμιλλη αποδοτικότητα, ευελιξία και αναπαραγωγιμότητα στην προετοιμασία δειγμάτων, η Hielscher διασφαλίζει ότι η κατεργασία με υπερήχους είναι η πλέον αποτελεσματική και αξιόπιστη, παρέχοντάς σας το ιδανικό μοντέλο συσκευής υπερήχων. Από την κυτταρική λύση έως την εκχύλιση πρωτεϊνών και πέρα από αυτές, η κατεργασία με υπερήχους υπερέχει των παραδοσιακών μεθόδων, δίνοντας στους ερευνητές τη δυνατότητα να διευρύνουν τα όρια της πρωτεωμικής επιστήμης. Καθώς η πρωτεωμική έρευνα συνεχίζει να εξελίσσεται, οι συσκευές υπερήχων αποτελούν βασικό εργαλείο προετοιμασίας δειγμάτων, συμβάλλοντας σε αξιόπιστα αποτελέσματα και βοηθώντας στην κατανόηση του πολύπλοκου κόσμου των πρωτεϊνών και των λειτουργιών τους.
- υψηλή αποδοτικότητα
- υψηλή διεκπεραιωτική ικανότητα
- τεχνολογία αιχμής
- αναπαραγώγιμα, επαναλήψιμα αποτελέσματα
- αξιοπιστία & ανθεκτικότητα
- ρυθμιζόμενος, ακριβής έλεγχος της διεργασίας
- για ποτήρια ζέσεως, φιαλίδια, σωληνάρια, μικροπλάκες
- για οποιονδήποτε όγκο δείγματος
- ευφυές λογισμικό
- έξυπνες λειτουργίες (π.χ. δυνατότητα προγραμματισμού, καταγραφή δεδομένων, απομακρυσμένος έλεγχος)
- εύκολος και ασφαλής χειρισμός
- χαμηλές απαιτήσεις συντήρησης
- CIP (επιτόπιος καθαρισμός)
Σχεδιασμός, κατασκευή και συμβουλευτική – Ποιότητα κατασκευασμένη στη Γερμανία
Οι συσκευές υπερήχων της Hielscher είναι ευρέως γνωστές για τα υψηλότερα πρότυπα ποιότητας και σχεδιασμού τους. Η ανθεκτικότητα και ο εύκολος χειρισμός επιτρέπουν την ομαλή ενσωμάτωση των συσκευών υπερήχων μας σε βιομηχανικές εγκαταστάσεις. Οι συσκευές υπερήχων της Hielscher ανταποκρίνονται εύκολα σε αντίξοες συνθήκες και απαιτητικά περιβάλλοντα.
Η Hielscher Ultrasonics είναι εταιρεία πιστοποιημένη κατά ISO και δίνει ιδιαίτερη έμφαση σε συσκευές υπερήχων υψηλών επιδόσεων που διαθέτουν τεχνολογία αιχμής και είναι φιλικές προς τον χρήστη. Φυσικά, οι συσκευές υπερήχων της Hielscher συμμορφώνονται με το CE και πληρούν τις απαιτήσεις των UL, CSA και RoHs.
Ο παρακάτω πίνακας παρέχει μια ένδειξη της κατά προσέγγιση δυναμικότητας επεξεργασίας των εργαστηριακών συσκευών υπερήχων μας, οι οποίες είναι ιδανικές για εργασίες προετοιμασίας δειγμάτων όπως ο κατακερματισμός DNA και RNA, η κυτταρική λύση, η απομόνωση DNA και πρωτεϊνών, η πρωτεολυτική πέψη ή η αποκόλληση βιοϋμενίου:
| Συσκευή υπερήχων | Ισχύς [W] | Τύπος | Όγκος [mL] |
|---|---|---|---|
| UIP400MTP | 400 | για μικροπλάκες | 6 – 3456 βοθρία | VialTweeter | 200 | για έως 10 φιαλίδια, με επιπλέον δυνατότητα στερέωσης με σφιγκτήρα | 0,5 – 1,5 |
| UP50H | 50 | τύπου ακίδας | 0,01 – 250 |
| UP100H | 100 | τύπου ακίδας | 0,01 – 500 |
| UP200Ht | 200 | τύπου ακίδας | 0,1 – 1000 |
| UP200St | 200 | τύπου ακίδας | 0,1 – 1000 |
| UP400St | 400 | τύπου ακίδας | 5,0 – 2000 |
| CupHorn | 200 | CupHorn, αντιδραστήρας υπερήχων | 10 – 200 |
| GDmini2 | 200 | κυψελίδα ροής χωρίς επιμόλυνση |
Επικοινωνήστε μαζί μας! / Ρωτήστε μας!
CupHorn υπερήχων για την ταυτόχρονη, ιδιαίτερα αποτελεσματική προετοιμασία πολλαπλών δειγμάτων υπό τις ίδιες συνθήκες για απομόνωση πρωτεϊνών και κατακερματισμό DNA.
Τεχνικά δελτία – Μοντέλα συσκευών υπερήχων της Hielscher για την πρωτεωμική
Συχνές ερωτήσεις σχετικά με την κατεργασία με υπερήχους και την πρωτεωμική
Από ποια δείγματα εκχυλίζονται οι πρωτεΐνες;
Οι πρωτεΐνες εκχυλίζονται από ένα ευρύ φάσμα βιολογικών δειγμάτων, συμπεριλαμβανομένων καλλιεργημένων κυττάρων, ζωικών και ανθρώπινων ιστών, αίματος, πλάσματος, ορού, ούρων, εγκεφαλονωτιαίου υγρού, σάλιου, φυτικών ιστών, μικροβιακών κυττάρων όπως βακτήρια και ζυμομύκητες, καθώς και υποκυτταρικών κλασμάτων όπως πυρήνες, μεμβράνες, μιτοχόνδρια ή εξωκυτταρικά κυστίδια. Η επιλογή του δείγματος εξαρτάται από το βιολογικό ερώτημα, επειδή διαφορετικοί τύποι δειγμάτων παρέχουν πρόσβαση σε διαφορετικά τμήματα του πρωτεώματος, όπως οι πρωτεΐνες ολόκληρου του κυττάρου, οι εκκρινόμενες πρωτεΐνες, οι μεμβρανικές πρωτεΐνες ή οι ιστοειδικές πρωτεΐνες σηματοδότησης.
Διαβάστε το πρωτόκολλο προετοιμασίας πρωτεϊνικών δειγμάτων με υποβοήθηση κατεργασίας με υπερήχους χωρίς επαφή πριν από τη φασματομετρία μάζας (MS)!
Εδώ θα βρείτε ένα πρωτόκολλο προετοιμασίας δειγμάτων υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας για πρωτεωμική τύπου shotgun!
Κάντε κλικ εδώ για ένα πρωτόκολλο εκχύλισης πρωτεϊνών από ιστό όγκου με υποβοήθηση κατεργασίας με υπερήχους!
Ανακαλύψτε σημειώσεις εφαρμογής για την εκχύλιση πρωτεϊνών από εξωκυτταρικά κυστίδια για πρωτεωμική τύπου shotgun!
Μπορεί η κατεργασία με υπερήχους να διασπάσει δισουλφιδικούς δεσμούς;
Η κατεργασία με υπερήχους σε υψηλή ισχύ μπορεί να διασπάσει ομοιοπολικούς δεσμούς κατά την εκχύλιση πρωτεϊνών. Ωστόσο, όταν η κατεργασία με υπερήχους πραγματοποιείται σε ελεγχόμενα επίπεδα ισχύος προσαρμοσμένα στα δείγματα, δεν θα προκαλέσει διάσπαση των δισουλφιδικών δεσμών. Γι’ αυτό είναι τόσο σημαντικός ο ακριβής έλεγχος των παραμέτρων της διεργασίας υπερήχων, όπως το πλάτος ταλάντωσης, η ισχύς, ο χρόνος και η θερμοκρασία. Οι συσκευές υπερήχων Hielscher σας παρέχουν πλήρη έλεγχο αυτών των παραμέτρων.
Μπορεί η κατεργασία με υπερήχους να διασπάσει πεπτιδικούς δεσμούς;
Η κατεργασία με υπερήχους είναι μια αποτελεσματική μέθοδος για την ενίσχυση της διαλυτοποίησης πεπτιδίων μέσω του κατακερματισμού στερεών πεπτιδίων σε μικρότερα σωματίδια. Ωστόσο, εάν μετά την κατεργασία με υπερήχους το διάλυμα πεπτιδίων εμφανίζει σχηματισμό γέλης, θολότητα ή παρουσία ορατών κροκιδωμάτων, αυτό υποδηλώνει ατελή διάλυση, με το πεπτίδιο να βρίσκεται απλώς σε αιώρηση εντός της μήτρας του διαλύματος.
Σε τέτοιες περιπτώσεις, απαιτείται ένας ισχυρότερος διαλύτης για να επιτευχθεί πλήρης διάλυση. Εάν η διάλυση εξακολουθεί να παρουσιάζει δυσκολίες, θα μπορούσατε να πραγματοποιήσετε λυοφιλίωση και να απομακρύνετε το πτητικό ρυθμιστικό διάλυμα. Στη συνέχεια, αυτό το αποξηραμένο δείγμα επιτρέπει τη διερεύνηση εναλλακτικών διαλυτών για την ενίσχυση της διαλυτότητας του πεπτιδίου, καθιστώντας έτσι δυνατό τον προσδιορισμό ενός βέλτιστου συστήματος διαλυτών.
Βιβλιογραφία / Αναφορές
- Lindemann C, Lupilova N, Müller A, Warscheid B, Meyer HE, Kuhlmann K, Eisenacher M, Leichert LI. (2013): Redox proteomics uncovers peroxynitrite-sensitive proteins that help Escherichia coli to overcome nitrosative stress. Journal of Biological Chemistry 288(27); 2013. 19698-714.
- Gonçalo Martins, Javier Fernández-Lodeiro, Jamila Djafari, Carlos Lodeiro, J.L. Capelo, Hugo M. Santos (2019): Label-free protein quantification after ultrafast digestion of complex proteomes using ultrasonic energy and immobilized-trypsin magnetic nanoparticles. Talanta, Volume 196, 2019. 262-270.
- Andreas Hofmann, Bertran Gerrits, Alexander Schmidt, Thomas Bock, Damaris Bausch-Fluck, Rudolf Aebersold, Bernd Wollscheid (2010): Proteomic cell surface phenotyping of differentiating acute myeloid leukemia cells.
Blood, Volume 116, Issue 13; 2010. e26-e34. - Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 2011.
- Fic, E., Kedracka-Krok, S., Jankowska, U., Pirog, A. and Dziedzicka-Wasylewska, M. (2010): Comparison of protein precipitation methods for various rat brain structures prior to proteomic analysis. Electrophoresis, 31; 2020. 3573-3579.
- Manadas B.J., Vougas K., Fountoulakis M., Duarte C.B. (2006): Sample sonication after trichloroacetic acid precipitation increases protein recovery from cultured hippocampal neurons, and improves resolution and reproducibility in two-dimensional gel electrophoresis. Electrophoresis 27(9); 2006. 1825-1831.
- Pooreydy, B., Jafari, M., Tajik, F., Karimi, M., Rezaei-Tavirani, M., Ghassempour, A., Rezadoost, H., & Khodabandeh, M. (2013): Organelle Isolation for Proteomics: Mitochondria from Peripheral Blood Mononuclear Cells. Archives of Advances in Biosciences 4, 2013.
Η Hielscher Ultrasonics κατασκευάζει ομογενοποιητές υπερήχων υψηλών επιδόσεων από εργαστηριακή έως βιομηχανική κλίμακα.