Cellelyse af BL21-celler ved ultralyd
BL21-celler er en stamme af E. coli, der anvendes i vid udstrækning i forskningslaboratorier, bioteknologi og industriel produktion på grund af deres evne til at udtrykke proteiner meget effektivt. Celleopbrydning, lyse og proteinekstraktion med ultralyd er den almindelige metode til at isolere og opsamle målproteinerne fra BL21-cellernes indre. Ultralydsbehandling opbryder cellen fuldstændigt og frigiver alle indkapslede proteiner, så 100% af proteinet bliver tilgængeligt.
BL21-celler til proteinekspression
BL21 er en kemisk kompetent E. coli-bakteriestamme, der er velegnet til transformation og proteinekspression på højt niveau ved hjælp af et T7 RNA-polymerase-IPTG-induktionssystem. BL21-celler muliggør højeffektiv proteinekspression af ethvert gen, der er under kontrol af en T7-promotor. E. coli-stammen BL21(DE3) er en T7 RNA-polymerasebaseret proteinproduktionsstamme, som kombineres med T7-promotorbaserede ekspressionsvektorer og anvendes i vid udstrækning i laboratorier og industrien til at producere rekombinante proteiner. I BL21(DE3) transskriberes ekspressionen af det gen, der koder for det rekombinante protein, af den kromosomalt kodede T7 RNA-polymerase (T7 RNAP), som transskriberer otte gange hurtigere end konventionel E. coli RNAP. Dette gør stammen BL21(DE3) yderst effektiv og til et af de mest foretrukne cellesystemer til proteinekspression.
Protokol for ultralydslyse og proteinekstraktion fra BL21-celler
Cellelyse af BL21-celler udføres oftest ved hjælp af ultralydsbehandling i kombination med natriumlauroylsarcosinat (også kendt som sarkosyl) som lysebuffer. Fordelene ved celleopbrydning og proteinekstraktion med ultralyd ligger i pålideligheden, reproducerbarheden samt den enkle, sikre og hurtige betjening af ultralydsapparater. Protokollen nedenfor giver en trinvis vejledning i ultralydslyse af BL21-celler:
- For at fjerne chaperonproteinerne blev BL21-bakteriepellets resuspenderet i 50 ml iskold natrium-Tris-EDTA-buffer (STE) (bestående af 10 mM Tris-HCL, pH 8,0, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl tilsat 100 mM PMSF).
- Derefter tilsættes 500 ul lysozym (10 mg/ ml), og cellerne inkuberes på is i 15 min.
- Efterfølgende tilsættes 500 ul DTT og 7 ml sarkosyl (10% (w/v) fremstillet i STE-buffer).
- Det er afgørende at holde alle oprensningsbuffere iskolde og holde prøverne på is hele tiden. Alle oprensningstrin bør om muligt udføres i kølerummet.
- Til ultralydslyse og proteinekstraktion sonikeres prøverne i VialTweeter MultiSample Ultrasonicator i 4 x 30 sek. ved 100% amplitude med et interval på 2 min mellem hver sonikering. Alternativt kan en ultralydshomogenisator af probetypen med mikrospids, f.eks. UP200Ht med S26d2 (3 x 30 sek., 2 min. pause mellem ultralydscyklusserne, 80% amplitude), anvendes.
- Til yderligere oprensningstrin skal prøverne holdes på is eller alternativt opbevares ved -80°C indtil videre behandling.
Ultralydscelleopbryder UP200St med mikrospids S26d2 til lyse og proteinekstraktion
Ultralydslyse under præcis temperaturkontrol
Præcis og pålidelig temperaturkontrol er afgørende ved håndtering af biologiske prøver. Høje temperaturer igangsætter termisk induceret proteinnedbrydning i prøverne.
Som alle mekaniske teknikker til prøveforberedelse udvikler sonikering varme. Prøvernes temperatur kan dog kontrolleres godt ved brug af VialTweeter. Vi præsenterer forskellige muligheder for at overvåge og kontrollere temperaturen i dine prøver, mens du forbereder dem til analyse med VialTweeter og VialPress.
- Overvågning af prøvetemperaturen: Ultralydsprocessoren UP200St, som driver VialTweeter, er udstyret med intelligent software og en temperaturføler, der kan tilsluttes. Tilslut temperaturføleren til UP200St, og før temperaturfølerens spids ind i et af prøverørene. Via den digitale farveberøringsskærm kan du i menuen på UP200St indstille et bestemt temperaturområde for sonikeringen af dine prøver. Ultralydsapparatet stopper automatisk, når den maksimale temperatur nås, og holder pause, indtil prøvetemperaturen er faldet til den nedre værdi af den indstillede temperatur ∆. Derefter starter sonikeringen automatisk igen. Denne smarte funktion forhindrer varmeinduceret nedbrydning.
- Blokken til VialTweeter kan forkøles. Sæt blokken til VialTweeter (kun sonotroden uden transducer!) i køleskabet eller fryseren for at forkøle titanblokken, hvilket hjælper med at forsinke temperaturstigningen i prøven. Om muligt kan selve prøven også forkøles.
- Brug tøris til køling under sonikering. Brug en lav bakke fyldt med tøris, og anbring VialTweeter på isen, så varmen hurtigt kan afledes.
Kunder over hele verden bruger VialTweeter og VialPress til deres daglige prøveforberedelse i biologiske, biokemiske, medicinske og kliniske laboratorier. Med den intelligente software og temperaturkontrol i processoren UP200St styres temperaturen pålideligt, og varmeinduceret nedbrydning af prøverne undgås. Prøveforberedelse med ultralyd ved hjælp af VialTweeter og VialPress giver yderst pålidelige og reproducerbare resultater!
Find den optimale ultralydscelleopbryder til din lyseanvendelse
Hielscher Ultrasonics er en producent med mange års erfaring inden for højtydende ultralydscelleopbrydere og homogenisatorer til laboratorier, bordmodeller og systemer i industriel skala. Størrelsen af din bakteriecellekultur, dit forsknings- eller produktionsmål og mængden af celler, der skal behandles pr. time eller dag, er afgørende faktorer for at finde den rette ultralydscelleopbryder til din anvendelse.
Hielscher Ultrasonics tilbyder forskellige løsninger til samtidig sonikering af flere prøver (op til 10 hætteglas med VialTweeter) og store antal prøver (dvs. mikrotiterplader / ELISA-plader med UIP400MTP) samt det klassiske ultralydsapparat af probetypen til laboratorier med forskellige effektniveauer fra 50 til 400 watt og ultralydsprocessorer til fuld industriel anvendelse med op til 16.000watt pr. enhed til kommerciel celleopbrydning og proteinekstraktion i storskalaproduktion. Alle ultralydsapparater fra Hielscher er bygget til drift 24/7/365 under fuld belastning. Robusthed og pålidelighed er centrale egenskaber ved vores ultralydsapparater.
Alle digitale ultralydshomogenisatorer er udstyret med smart software, farveberøringsskærm og automatisk datalogning, som gør ultralydsapparatet til et praktisk arbejdsredskab i laboratorier og produktionsanlæg.
Fortæl os, hvilken type celler, hvilket volumen, hvor ofte og med hvilket mål du skal behandle dine biologiske prøver. Vi anbefaler den ultralydscelleopbryder, der er bedst egnet til dine proceskrav.
Tabellen nedenfor giver dig en indikation af den omtrentlige behandlingskapacitet for vores ultralydssystemer fra kompakte håndholdte homogenisatorer og MultiSample Ultrasonicators til industrielle ultralydsprocessorer til kommercielle anvendelser:
| Batchvolumen | Volumenstrøm | Anbefalede apparater |
|---|---|---|
| 96-brøndsplader / mikrotiterplader | n.a. | UIP400MTP |
| 10 hætteglas à 0,5 til 1,5mL | n.a. | VialTweeter på UP200St |
| 0,01 til 250mL | 5 til 100mL/min | UP50H |
| 0,01 til 500mL | 10 til 200mL/min | UP100H |
| 10 til 2000mL | 20 til 400mL/min | UP200Ht, UP400St |
| 0,1 til 20L | 0,2 til 4L/min | UIP2000hdT |
| 10 til 100L | 2 til 10L/min | UIP4000hdT |
| n.a. | 10 til 100L/min | UIP16000 |
| n.a. | større | en klynge af UIP16000 |
Kontakt os! / Spørg os!
UIP400MTP pladesonikator til celleopbrydning med høj prøvegennemstrømning i 96-brøndsplader
Ultralydsapparat UP200Ht med 2mm mikrospids S26d2 til sonikering af små prøver
Læs mere om, hvordan du kan bruge din ultralydsvævshomogenisator til effektiv og pålidelig fremstilling af bufferopløsninger!
Værd at vide
Escherichia coli-bakterier
Escherichia coli er en bakterietype, som ikke danner sporer, er gramnegativ og er kendetegnet ved sin form som en lige stav. E.coli-bakterier findes i miljøet, fødevarer samt menneskers og dyrs tarme. E. coli er normalt bevægelig ved hjælp af peritrike flageller, men der findes også ubevægelige typer. E.coli er såkaldte fakultativt anaerobe kemoorganotrofe organismer, hvilket betyder, at de er i stand til både respiratorisk og fermentativ metabolisme. De fleste E.coli-typer er harmløse og udfører nyttige funktioner i kroppen, f.eks. ved at undertrykke væksten af skadelige bakteriearter, syntetisere vitaminer osv.
Escherichia coli-bakterieceller af den såkaldte B-type er en særlig kategori af E.coli-stammer, som anvendes i vid udstrækning i forskning til at undersøge mekanismer såsom bakteriofagfølsomhed eller restriktions-modifikationssystemer. Desuden værdsættes E.coli-bakterier som en pålidelig arbejdshest til proteinekspression i bioteknologiske og biovidenskabelige laboratorier. For eksempel bruges E.coli til at syntetisere forbindelser såsom proteiner og oligosakkarider i industriel skala. På grund af specifikke egenskaber såsom proteasemangel, lav acetatproduktion ved et højt glukoseniveau og øget permeabilitet er E. coli B-celler de hyppigst anvendte værtsceller til produktion af genteknologisk fremstillede proteiner.
Rekombinant protein
Rekombinante proteiner (rProt) får betydeligt større betydning i mange brancher, herunder kemisk produktion, lægemidler, kosmetik, human- og veterinærmedicin, landbrug, fødevarer samt affaldsbehandling.
Produktionen af rekombinant protein kræver brug af et ekspressionssystem. Som ekspresserende cellesystemer til produktion af rekombinant DNA kan både prokaryote og eukaryote celler anvendes. Bakterieceller anvendes mest til proteinekspression på grund af faktorer såsom lave omkostninger, nem opskalering og enkle dyrkningsmediebetingelser, mens systemer baseret på pattedyr, gær, alger og insekter samt cellefrie systemer er etablerede alternativer. Proteintypen, den funktionelle aktivitet samt det nødvendige udbytte af udtrykt protein påvirker valget af det cellesystem, der anvendes til proteinekspression.
For at udtrykke rekombinant protein skal en bestemt celle transfekteres med en DNA-vektor, der indeholder skabelonen for rekombinant DNA. De celler, der er transfekteret med skabelonen, dyrkes derefter. Som følge af den cellulære mekanisme transskriberer og translaterer cellerne det protein, der er af interesse, og producerer dermed målproteinet.
Da de udtrykte proteiner er indkapslet i den cellulære matrix, skal cellen lyseres (opbrydes og brydes i stykker) for at frigive proteinerne. I et efterfølgende oprensningstrin adskilles og oprenses proteinet.
Det første rekombinante protein, der blev anvendt til behandling, var rekombinant humant insulin i 1982. I dag produceres mere end 170 typer rekombinant protein på verdensplan til medicinske behandlinger. Almindeligt anvendte rekombinante proteiner inden for medicin er for eksempel rekombinante hormoner, interferoner, interleukiner, vækstfaktorer, tumornekrosefaktorer, blodkoagulationsfaktorer, trombolytiske lægemidler og enzymer til behandling af alvorlige sygdomme såsom diabetes, dværgvækst, myokardieinfarkt, kongestivt hjertesvigt, cerebral apopleksi, multipel sklerose, neutropeni, trombocytopeni, anæmi, hepatitis, reumatoid artritis, astma, Crohns sygdom og til kræftbehandlinger. (jf. Phuc V. Pham, i Omics Technologies and Bio-Engineering, 2018)
Litteratur / Referencer
- Cheraghi S.; Akbarzade A.; Farhangi A.; Chiani M.; Saffari Z.; Ghassemi S.; Rastegari H.; Mehrabi M.R. (2010): Improved Production of L-lysine by Over-expression of Meso-diaminopimelate Decarboxylase Enzyme of Corynebacterium glutamicum in Escherichia coli. Pak J Biol Sci. 2010 May 15; 13(10), 2010. 504-508.
- LeThanh, H.; Neubauer, P.; Hoffmann, F. (2005): The small heat-shock proteins IbpA and IbpB reduce the stress load of recombinant Escherichia coli and delay degradation of inclusion bodies. Microb Cell Fact 4, 6; 2005.
- Martínez-Gómez A.I.; Martínez-Rodríguez S.; Clemente-Jiménez J.M.; Pozo-Dengra J.; Rodríguez-Vico F.; Las Heras-Vázquez F.J. (2007): Recombinant polycistronic structure of hydantoinase process genes in Escherichia coli for the production of optically pure D-amino acids. Appl Environ Microbiol. 73(5); 2007. 1525-1531.
- Kotowska M.; Pawlik K.; Smulczyk-Krawczyszyn A.; Bartosz-Bechowski H.; Kuczek K. (2009): Type II Thioesterase ScoT, Associated with Streptomyces coelicolor A3(2) Modular Polyketide Synthase Cpk, Hydrolyzes Acyl Residues and Has a Preference for Propionate. Appl Environ Microbiol. 75(4); 2009. 887-896.
VialTweeter sonikator til samtidig sonikering af 10 prøver, f.eks. til opbrydning af BL21-celler
