Proteomikas pētījumi – Kāpēc Sonicator ir nepieciešams paraugu sagatavošanai
Proteomikas pētījumi sniedz dziļu ieskatu šūnu bioloģijā un paplašina mūsu izpratni par bioloģiskajām sistēmām, ļaujot visaptveroši analizēt proteīnus un to funkcijas. Proteomikas pētījumu panākumu pamatā ir augstas kvalitātes paraugu sagatavošana, kas bieži ietver sarežģītu un darbietilpīgu paraugu sagatavošanu. Ultraskaņas apstrāde ir labi izveidots un spēcīgs līdzeklis paraugu sagatavošanai, piedāvājot daudzas priekšrocības salīdzinājumā ar tradicionālajām metodēm. Dažādi sonikatoru modeļi, piemēram, zondes tipa sonikatori, VialTweeter un UIP400MTP augstas caurlaidspējas plāksnes sonikators, piedāvā unikālas priekšrocības proteomic paraugu apstrādē un paver ceļu uzticamiem, reproducējamiem pētījumu rezultātiem.
Kāpēc man ir nepieciešams Sonicator manam proteomikas pētījumam?
Proteomikas pētījumu jomā nepieciešamība pēc ultraskaņas apstrādes izriet no kritiskās nozīmes iegūt augstas kvalitātes paraugus analīzei. Ultraskaņas izmantošana proteomikas pētījumos ir būtiska, lai sasniegtu ticamus un reproducējamus rezultātus, nodrošinot efektīvu šūnu līzi, uzlabotu olbaltumvielu ekstrakciju, kompleksu paraugu homogenizāciju, atvieglotu fermentatīvo gremošanu, paraugu piesārņojuma samazināšanu un augstas caurlaidspējas apstrādes iespējas.
Parauga sagatavošanas nozīme proteomikā: Uzticamu un reproducējamu rezultātu sasniegšana proteomikas eksperimentos ir atkarīga no rūpīgas paraugu sagatavošanas. No šūnu līzes līdz olbaltumvielu ekstrakcijai un attīrīšanai katrs solis jāveic precīzi, lai samazinātu artefaktus un nodrošinātu parauga integritāti. Tomēr tradicionālās metodes, piemēram, mehāniski traucējumi un ķīmiskā līze, bieži vien nespēj sasniegt vēlamos rezultātus tādu problēmu dēļ kā nepilnīga ekstrakcija, olbaltumvielu degradācija un paraugu piesārņojums.
Augstas caurlaidspējas ultraskaņas UIP400MTP parauga sagatavošanai proteomikā.
Ultrasonication: spēles mainītājs proteomic paraugu sagatavošanā
Ultrasonication, process, kurā tiek izmantoti augstfrekvences skaņas viļņi, lai izjauktu bioloģiskos paraugus, ir kļuvis par spēles mainītāju proteomikas paraugu sagatavošanā. Izmantojot akustiskās enerģijas spēku, ultraskaņas apstrādātāji veicina ātru un efektīvu šūnu līzi, olbaltumvielu ekstrakciju un fermentatīvo gremošanu, kā rezultātā tiek iegūta augstāka raža un uzlabota paraugu tīrība.
Protokols: atrodiet soli pa solim instrukciju, izmantojot Hielscher vairāku paraugu ultraskaņas aparātus biofilmā un proteomikas analīzē šeit!
Paraugu sagatavošanas uzdevumi, ko atvieglo ultraskaņas apstrāde
- Šūnu līze un olbaltumvielu ekstrakcija: Ultraskaņas aparāti ir ideāli piemēroti šūnu līzei un olbaltumvielu ekstrakcijai, pateicoties tās daudzpusībai un precizitātei. Nodrošinot kontrolētus ultraskaņas enerģijas pārrāvumus, ultraskaņas apstrādātāji efektīvi izjauc šūnu membrānas, atbrīvojot intracelulāros proteīnus, neapdraudot to integritāti. Tas ir īpaši vērtīgi proteomikas pētījumos, kuros nepieciešamas neskartas olbaltumvielu struktūras lejupējai analīzei, piemēram, olbaltumvielu un olbaltumvielu mijiedarbības pētījumos un strukturālajā proteomikā.
- Augstas caurlaidspējas paraugu apstrāde: UIP400MTP plāksnes sonikators piedāvā nepārspējamu efektivitāti augstas caurlaidspējas proteomikas paraugu apstrādē. Izmantojot ultraskaņas enerģiju vairāku urbumu plāksnes formātā, UIP400MTP ļauj vienlaicīgi apstrādāt ar ultraskaņu vairākus paraugus, krasi samazinot apstrādes laiku un darbaspēka izmaksas. Tas ir īpaši izdevīgi liela mēroga proteomikas pētījumos, kas prasa ātru paraugu bibliotēku pārbaudi vai augstu paraugu caurlaidspēju biomarķieru atklāšanai un validācijai.
- Palielināta raža pēc olbaltumvielu izgulsnēšanas: Olbaltumvielu izgulsnēšanos parasti izmanto bioloģisko paraugu lejupējā apstrādē, lai koncentrētu olbaltumvielas un attīrītu tās no dažādiem piesārņotājiem. Ultraskaņas apstrāde ir pierādīta kā efektīva metode atkārtotas suspensijas palielināšanai, lai palielinātu olbaltumvielu ražu, kad trihloretiķskābe (TCA) izgulsnēja proteīnus, ja pēc tam tos apstrādāja ar ultraskaņu. Paraugu apstrāde ar ultraskaņu pēc TCA nogulsnēšanas, kam seko eluēšana parauga buferšķīdumā, palielina kopējo olbaltumvielu atgūšanu un uzlabo reproducējamību un atbilstības koeficientus.
- Proteolītiskā gremošana: Ultrasoniski atbalstīta olbaltumvielu gremošana ātruma un efektivitātes ziņā ievērojami pārspēj tradicionālo nakts gremošanu. Ultraskaņas apstrāde ļauj ātri samazināt, alkilēt un proteolītiski sagremot kompleksus proteomus, samazinot laiku, kas nepieciešams no parastajām 12–24 stundām līdz tikai dažām minūtēm. Šī ultraskaņas pieeja ne tikai paātrina darbplūsmu, bet arī uzlabo reproducējamību un konsekvenci proteomikas analīzēs. Vairāk lasi šeit!
- Paraugu homogenizācija un bufera sajaukšana: Ultraskaņas apstrāde atvieglo paraugu homogenizāciju, šūnu šķīdību un bufera sajaukšanu proteomikas darbplūsmās.
VialTweeter Multi-Tube Sonicator vienlaicīgai ultraskaņas apstrādei līdz 10 paraugiem, piemēram, lai izjauktu šūnas un ekstrahētu proteīnus.
Labākais Sonicator maniem Proteomic paraugiem
Hielscher Ultrasonics piedāvā dažādus sonikatoru modeļus, kuru dizains padara iespējamu ideālu paraugu sagatavošanu.
Neatkarīgi no tā, vai jums ir nepieciešams apstrādāt mazus vai lielus paraugu skaitus, minūtes vai lielus apjomus – Hielscher ir vispiemērotākais ultraskaņas apstrādātājs jūsu ar proteīniem saistītajam lietojumam.
Flakoni un vārglāzes – Zondes tipa Sonicator: Klasiskais zondes tipa sonikators tiek plaši izmantots kā laboratorijas homogenizators mazākam paraugu skaitam, kad atsevišķi paraugi flakonos vai vārglāzēs ir procesi. Laboratorijas homogenizatori UP50H vai UP100H ar mikro-galu ir tipiski zondes / ragu ultraskaņas aparāti, ko izmanto tiešai parauga ultrasonikācijai.
96 urbumu plates / mikrotitrēšanas plāksnes – The UIP400MTP Plate-Sonicator: Palielinoties paraugu skaitam un izmantojot multiwells un mikroplates ar 96 , 384 vai 1536 urbumiem, UIP400MTP augstas caurlaidspējas plāksnes ultraskaņas apstrādātājs ļauj racionalizēt vienlaicīgu vienlaicīgu ultraskaņas apstrādi un vairāku paraugu sajaukšanu, nodrošinot maigu, bet efektīvu olbaltumvielu izolāciju, kā arī rūpīgu sajaukšanu un vienmērīgu reaģentu dispersiju. Tas ir īpaši izdevīgi proteomikas eksperimentos, kas ietver sarežģītas paraugu matricas vai vairāku paraugu sagatavošanu, kur homogenitāte ir kritiska, lai iegūtu precīzus un reproducējamus rezultātus.
līdz 10 flakoniem – The VialTweeter: Ja vienlaikus strādājat ar vairākiem flakoniem, piemēram, Eppendorf mēģenēm, VialTweeter ir jūsu izvēlēts rīks. VialTweeter piedāvā unikālu dizainu, kas ļauj vienlaikus apstrādāt līdz pat 10 slēgtiem flakoniem vai mēģenēm. Šķērskontaminācija un gaisa piesārņojums ir pilnībā novērsts.
vairāki flakoni vai viens trauks – The CupHorn: UP200St_TD-Cuphorn ir spēcīgs ultraskaņas apstrādātājs, kas ļauj apstrādāt vai nu vairākus flakonus vienlaicīgi, izmantojot flakona turētāju, vai arī ievietot atsevišķu trauku CupHorn ūdens vannā.
Mēs esam šeit, lai palīdzētu
Mūsu tehniskais personāls ir ultraskaņas eksperti un labi pārzina, iesakot jums vispiemērotāko sonikatoru, kas atbilst jūsu prasībām un pārvērš jūsu pētījumus par panākumiem. Tā kā ultraskaņas aparāti ir kļuvuši par neaizstājamiem proteomikas pētījumu instrumentiem, piedāvājot nepārspējamu efektivitāti, daudzpusību un reproducējamību paraugu sagatavošanā, Hielscher pārliecinās, ka ultraskaņas apstrāde ir visefektīvākā un uzticamākā, nodrošinot perfektu ultraskaņas modeli. No šūnu līzes līdz olbaltumvielu ekstrakcijai un tālāk, ultrasonication apsteidz tradicionālās metodes, dodot iespēju pētniekiem virzīt proteomic zinātnes robežas. Tā kā proteomikas pētījumi turpina attīstīties, ultraskaņas apstrādātāji ir galvenais paraugu sagatavošanas rīks, kas veicina ticamus rezultātusa un palīdz izprast proteīnu sarežģīto pasauli un to funkcijas.
- augsta efektivitāte
- augsta caurlaidspēja
- vismodernākās tehnoloģijas
- Reproducējami, atkārtojami rezultāti
- uzticamība & Stabilitāti
- regulējama, precīza procesa vadība
- vārglāzēm, flakoniem, mēģenēm, mikroplatēm
- jebkuram parauga tilpumam
- inteliģenta programmatūra
- viedās funkcijas (piemēram, programmējamas, datu protokolēšana, tālvadības pults);
- viegli un droši lietojams
- zema apkope
- CIP (tīrā vietā)
Projektēšana, ražošana un konsultācijas – Kvalitāte ražots Vācijā
Hielscher ultrasonikatori ir labi pazīstami ar saviem augstākajiem kvalitātes un dizaina standartiem. Robustums un viegla darbība ļauj vienmērīgi integrēt mūsu ultrasonikatorus rūpnieciskajās iekārtās. Hielscher ultrasonikatori viegli apstrādā neapstrādātus apstākļus un prasīgu vidi.
Hielscher Ultrasonics ir ISO sertificēts uzņēmums un īpašu uzsvaru liek uz augstas veiktspējas ultrasonikatoriem, kas piedāvā vismodernākās tehnoloģijas un lietotājdraudzīgumu. Protams, Hielscher ultrasonikatori atbilst CE prasībām un atbilst UL, CSA un RoHs prasībām.
Zemāk redzamajā tabulā ir sniegta norāde par mūsu laboratorijas ultrasonikatoru aptuveno apstrādes jaudu, kas ir ideāli piemēroti paraugu sagatavošanas uzdevumiem, piemēram, DNS un RNS sadrumstalotībai, šūnu līzei, DNS un olbaltumvielu izolācijai, proteolītiskai gremošanai vai bioplēves atdalīšanai:
| Sonicator | Jauda [W] | Tips | Tilpums [ml] |
|---|---|---|---|
| UIP400MTP | 400 | mikroplatēm | 6 – 3456 akas | VialTweeter | 200 | līdz 10 flakoniem un iespīlējama iespēja | 0.5 – 1.5 |
| UP50H | 50 | zondes tipa | 0.01 – 250 |
| UP100H | 100 | zondes tipa | 0.01 – 500 |
| UP200Ht | 200 | zondes tipa | 0.1 – 1000 |
| UP200St | 200 | zondes tipa | 0.1 – 1000 |
| UP400St | 400 | zondes tipa | 5.0 – 2000 |
| Cuphorn | 200 | CupHorn, sonoreaktors | 10 – 200 |
| GDmini2 | 200 | no piesārņojuma brīvas plūsmas šūna |
Sazinieties ar mums! / Jautājiet mums!
Ultraskaņas CupHorn vienlaicīgai, ļoti iedarbīgai vairāku paraugu sagatavošanai vienādos apstākļos olbaltumvielu izolēšanai un DNS fragmentācijai.
Faktu lapas – Hielscher Sonicator modeļi proteomikai
Bieži uzdotie jautājumi par ultraskaņu un proteomiku
Vai ultraskaņas apstrāde var izjaukt disulfīda saites?
Ultraskaņas apstrāde ar lielu jaudu var pārtraukt kovalentās saites olbaltumvielu ekstrakcijas laikā. Tomēr, ja ultraskaņas apstrāde tiek veikta kontrolētā jaudas līmenī, kas atbilst paraugiem. Ulrasonication neizraisīs disulfīdu saišu pārrāvumu. Tāpēc tik svarīgi ir precīzi kontrolēt ultraskaņas procesa parametrus, piemēram, amplitūdu, jaudu, laiku un temperatūru. Hielscher sonikatori dod jums pilnīgu kontroli pār šiem parametriem.
Vai ultraskaņas apstrāde var pārtraukt peptīdu saites?
Ultraskaņas apstrāde ir efektīva metode peptīdu šķīdības uzlabošanai, sadalot cietos peptīdus mazākās daļiņās. Tomēr, ja pēc ultraskaņas apstrādes peptīdu šķīdumam piemīt gelācija, duļķainība vai redzamu flokulātu klātbūtne, tas norāda uz nepilnīgu izšķīšanu, peptīdam tikai suspendējoties šķīduma matricā.
Šādos gadījumos rodas nepieciešamība pēc spēcīgāka šķīdinātāja, lai panāktu pilnīgu izšķīšanu. Ja izšķīdināšana saglabājas kā izaicinājums, jūs varat liofilizēt un noņemt gaistošo buferšķīdumu. Pēc tam šis izžāvētais paraugs ļauj izpētīt alternatīvus šķīdinātājus, lai veicinātu peptīdu šķīdību, tādējādi ļaujot noteikt optimālu šķīdinātāju sistēmu.
Literatūra / Atsauces
- Lindemann C, Lupilova N, Müller A, Warscheid B, Meyer HE, Kuhlmann K, Eisenacher M, Leichert LI. (2013): Redox proteomics uncovers peroxynitrite-sensitive proteins that help Escherichia coli to overcome nitrosative stress. Journal of Biological Chemistry 288(27); 2013. 19698-714.
- Gonçalo Martins, Javier Fernández-Lodeiro, Jamila Djafari, Carlos Lodeiro, J.L. Capelo, Hugo M. Santos (2019): Label-free protein quantification after ultrafast digestion of complex proteomes using ultrasonic energy and immobilized-trypsin magnetic nanoparticles. Talanta, Volume 196, 2019. 262-270.
- Andreas Hofmann, Bertran Gerrits, Alexander Schmidt, Thomas Bock, Damaris Bausch-Fluck, Rudolf Aebersold, Bernd Wollscheid (2010): Proteomic cell surface phenotyping of differentiating acute myeloid leukemia cells.
Blood, Volume 116, Issue 13; 2010. e26-e34. - Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 2011.
- Fic, E., Kedracka-Krok, S., Jankowska, U., Pirog, A. and Dziedzicka-Wasylewska, M. (2010): Comparison of protein precipitation methods for various rat brain structures prior to proteomic analysis. Electrophoresis, 31; 2020. 3573-3579.
- Manadas B.J., Vougas K., Fountoulakis M., Duarte C.B. (2006): Sample sonication after trichloroacetic acid precipitation increases protein recovery from cultured hippocampal neurons, and improves resolution and reproducibility in two-dimensional gel electrophoresis. Electrophoresis 27(9); 2006. 1825-1831.
- Pooreydy, B., Jafari, M., Tajik, F., Karimi, M., Rezaei-Tavirani, M., Ghassempour, A., Rezadoost, H., & Khodabandeh, M. (2013): Organelle Isolation for Proteomics: Mitochondria from Peripheral Blood Mononuclear Cells. Archives of Advances in Biosciences 4, 2013.
Hielscher Ultrasonics ražo augstas veiktspējas ultraskaņas homogenizatorus no Lab līdz rūpnieciskais izmērs.