サンプル前処理のためのプローブ型ソニケーション:包括的ガイド
プローブタイプの超音波処理は、細胞を破砕し、DNAをせん断し、液体サンプル中の粒子を分散させる強力なツールです。ライフサイエンス、微生物学、臨床分析におけるあらゆる技術と同様、超音波処理も、特に熱に敏感な材料を扱う場合は、サンプルへのダメージを避けるために慎重に最適化する必要があります。以下のヒントを参考にしてください。 – 試料を氷上に置く、超音波処理の振幅を制御する、パルスモードを使用する、ソノトロードの浸漬深さを最適化する、など。 – は、効果的で再現性のある結果を得ることができます。最終的に、最適化された超音波処理プロトコールは、下流のアプリケーションの成功を保証し、貴重なサンプルの完全性を維持します。
ソニケーション – 試料調製に不可欠なステップ
プローブタイプの超音波処理は、生物学、化学、材料研究のサンプル前処理に広く用いられている技術である。このプロセスでは、超音波エネルギーを使用して、細胞をばらばらにしたり、DNAをせん断したり、ナノ粒子を分散させたり、溶液を乳化させたりする。プローブ(ソノトロード、ホーン、ソノプローブ)を介して液体試料に高エネルギーの超音波を送信し、プローブ型超音波処理によって局所的な高圧、乱流、キャビテーション領域を形成し、細胞構造を機械的に破壊したり、粒子を均質に分散させたりする。しかし、この技術は、サンプル、特にタンパク質や核酸のような敏感な生物学的物質に損傷を与えないよう、慎重に最適化する必要があります。このガイドでは、プローブタイプの超音波処理について、効果的なサンプル前処理のための実践的なヒントを示します。
超音波ホモジナイザー UP200Ht は、サンプルの前処理、溶解、抽出、DNA断片化、溶解のために研究室でよく使われている。
- 振幅設定の調整
ソニケーションの振幅とは、プローブから発生する振動の大きさを指す。振幅が大きいほど、強い超音波エネルギーが得られますが、発熱が大きく、試料が劣化するリスクが高まります。対照的に、振幅が小さいほど超音波は穏やかになり、サンプルの完全性を維持しながら熱の蓄積を抑えることができます。
特定の用途によっては、短時間に高振幅をかけるよりも、低振幅を長時間かけた方が良い結果が得られるかもしれません。このアプローチは、サンプルの十分な破壊や混合を確保しながら、熱劣化の可能性を低減します。 - 自動データプロトコルの使用
Hielscher社製デジタルソニケーターのスマートメニューには、自動データ記録が搭載されています。ソニケーターのスイッチを入れた瞬間に、エネルギー入力(合計と正味)、振幅、パワー、時間、周波数などの重要なデータが自動的に記録されます。 – 温度と圧力センサーを接続すれば、温度と圧力もモニターされます。すべてのデータは、内蔵のSDカードにCSVファイルとして日付とタイムスタンプとともに書き込まれます。 - エネルギー入力の最適化:適切な量の超音波出力を得る
特定のエネルギー投入量(Ws/mL)による超音波処理の最適化は、時間ベースのプロトコルよりも再現性が高く、定量可能なアプローチを提供する。超音波処理の時間は依然として要因の一つであるが、最終的にサンプルの破壊の程度を決定するのは、単位体積当たりに供給される総エネルギーである。不十分なエネルギー入力は、不完全な溶解や分散を引き起こす可能性があり、一方、過剰な入力は、特に敏感な生物学的システムや高分子システムにおいて、分子分解、タンパク質変性、過熱を引き起こす可能性があります。
ヒント 低い比エネルギー入力(試料の種類にもよるが、通常10~50Ws/mLの範囲)から開始し、必要に応じて段階的に増加させる。物理的変化(濁度、粘度、粒子分散など)を評価し、過度の発泡、温度上昇、試料の変色など、過度のソニケーションの指標に注意しながら、プロセスをモニターする。熱的または機械的ストレスを最小限に抑えながら、目標エネルギー量に達するように、振幅、パルス周期、および持続時間を適宜調整する。 - パルスモードを使用して熱の蓄積を最小限に抑える
Hielscher社製ソニケーターは、特に温度に敏感なサンプルに有効なパルスモードで操作することができます。パルスモードは、超音波処理と静止段階を交互に行い、パルスの間に試料を冷却します。これにより、急激な温度上昇を防ぎ、熱による劣化のリスクを最小限に抑えます。 - 温度管理の重要性:サンプルを冷やさない
ソニケーションは超音波エネルギーを液体に伝え、乱流と摩擦によって熱を発生させる。これを放置すると、温度が上昇し、タンパク質、酵素、核酸などの敏感な生物学的サンプルを劣化させる可能性がある。これを軽減するためには、超音波処理中の温度管理が重要である。
オーバーヒートを防ぐ最も簡単で効果的な方法の一つは、超音波処理中、サンプルを氷の上に置いておくことです。これにより、安定した低温を維持し、サンプルを熱劣化から保護することができます。
全てのHielscher社製デジタルソニケーターは温度モニター機能を備えています。プラグイン可能な温度センサーがサンプルの温度を連続的に測定します。プログラムに設定された上限温度に達するとソニケーターは自動的に停止し、設定温度デルタの下限に達すると直ちに超音波処理を継続します。
さらに、こんなこともできる:- 超音波処理を開始する前に、サンプルチューブを氷上に置く。
- 長時間のソニケーションが必要な場合は、定期的にソニケーションを一時停止し、冷却する。
- ソニケーション後のサンプルをさらに安定させるため、氷上に置いておく。
タンパク質は高温になるとすぐに変性してしまうため、これはタンパク質サンプルにとって特に重要です。サンプルを低温に保つことで、ウェスタンブロッティング、酵素アッセイ、質量分析など、下流のアプリケーションのためにサンプルの機能的完全性を保つことができます。
- 試料に適したソノトロードサイズ
ライフサイエンスや微生物学において、サンプルの超音波処理に適切なサイズのソノトロードを選択することは、最適なエネルギー伝達を確保し、細胞や生体分子を効果的に破壊するために極めて重要です。適切なサイズのソノトロードは、細胞壁の破壊、細胞の溶解、サンプルのホモジナイズに不可欠なキャビテーションを効率的に行うことができます。試料の量や種類に対してソノトロードが大きすぎたり小さすぎたりすると、超音波処理にムラが生じたり、加熱が過剰になったり、細胞の破砕が不十分になったりして、実験結果が損なわれる可能性があります。したがって、適切なサイズのソノトロードを選択することで、サンプルの完全性を維持し、実験の再現性を確保することができます。 - 正しいプローブの深さ:発泡と均一な露光を避ける
プローブの設置は、超音波処理において重要でありながら見落とされがちな要素です。プローブの深さを適切にすることで、効率的なエネルギー伝達とサンプル混合が可能になります。プローブが浅すぎると、過度の泡立ちが発生し、気泡が捕捉されて超音波処理の効果が低下することがあります。プローブが深すぎると、十分な循環が得られず、サンプルの超音波処理にムラが生じる可能性があります。
理想的なプローブの深さは、通常、チューブまたは容器内の液体の高さの 1/4 から 1/3 の間です。発泡を起こさずにエネルギー伝達を最大化する最適な位置を見つけるために、さまざまな深さで実験してください。
大きな試料容器では、試料全体を均一に超音波処理するために、ソノトロードを試料中でゆっくり動かすとよい。
マルチサンプルソニケーターCupHornまたはUIP400MTPを使用する場合は、マニュアルに記載されているとおりにカップホーンに水を入れてください。 - 超音波処理プロセスの最適化サンプルに合わせる
プローブ型超音波処理を成功させる鍵は、最適化です。細胞、組織、化学物質など、サンプルによって超音波エネルギーに対する反応は異なるため、特定のニーズに合わせてプロセスを調整することが重要です。最適化の際に考慮すべき要素には以下が含まれます:
サンプル量: 容量が大きくなると、超音波処理時間を長くするか、振幅を大きくする必要があるかもしれない。
試料の粘度: 粘性のあるサンプルは、十分な破砕を達成するために、より強力な超音波処理を必要とする場合がある。
望ましい結果 強靭な組織を溶解する場合は、より強力な超音波処理が必要かもしれないが、DNAの剪断には短時間の超音波処理で十分かもしれない。
パラメーターを系統的にテストし、改良することによって – 振幅、時間、プローブの深さなど、お客様独自のサンプルに合わせて超音波処理を最適化することができます。
お客様のサンプル前処理タスクに適したソニッケーターを見つける
Hielscher Ultrasonicsは、お客様のサンプル前処理に必要なソニケーターをフルレンジで取り揃えています。サンプルの種類、量、具体的な用途など、重要な要素をお聞かせください。弊社の専門家チームが、お客様の研究実験に最適な超音波ホモジナイザーをご提案いたします。
下の表は、ラボ用超音波処理装置の処理能力の目安です:
| 推奨デバイス | バッチ量 | 流量 |
|---|---|---|
| UIP400MTP 96ウェルプレートソニケーター | マルチウェル/マイクロタイタープレート | n.a. |
| 超音波カップホーン | バイアルまたはビーカー用カップホーン | n.a. |
| GDmini2 | 超音波マイクロフローリアクター | n.a. |
| バイアルツイーター | 00.5〜1.5mL | n.a. |
| UP100H | 1〜500mL | 10~200mL/分 |
| UP200Ht, UP200St | 10〜1000mL | 20~200mL/分 |
| UP400ST | 10〜2000mL | 20~400mL/分 |
| 超音波ふるい振とう機 | n.a. | n.a. |
Hielscher Ultrasonics社は、ISO認証取得企業であり、最先端の技術と使いやすさを特徴とする高性能超音波振動子に特に重点を置いています。もちろん、Hielscherの超音波装置はCEに準拠しており、UL、CSA、RoHsの要件を満たしています。
Hielscher Ultrasonics社は、サンプル前処理や臨床分析用の強力な非接触ソニケーターを提供しています。 マルチウェルプレートソニケーターUIP400MTP、 バイアルトゥイーター カップホーン そして GDmini2フローソニケーター サンプルに触れることなく処理する。
- 高性能
- 最先端技術
- 信頼性 & 堅牢性
- 調整可能で正確なプロセス制御
- バッチ & インライン
- どのボリュームに対しても
- インテリジェント・ソフトウェア
- スマート機能(プログラマブル、データプロトコール、リモートコントロールなど)
- 操作が簡単で安全
- ローメンテナンス
- CIP(クリーンインプレイス)
10サンプル同時超音波処理用VialTweeterソニケーター、 例:細胞の破壊、タンパク質の抽出、DNAの剪断
文献・参考文献
- Claudia Lindemann, Nataliya Lupilova, Alexandra Müller, Bettina Warscheid, Helmut E. Meyer, Katja Kuhlmann, Martin Eisenacher, Lars I. Leichert (2013): Redox Proteomics Uncovers Peroxynitrite-Sensitive Proteins that Help Escherichia coli to Overcome Nitrosative Stress. J Biol Chem. 2013 Jul 5; 288(27): 19698–19714.
- Turrini, Federica; Donno, Dario; Beccaro, Gabriele; Zunin, Paola; Pittaluga, Anna; Boggia, Raffaella (2019): Pulsed Ultrasound-Assisted Extraction as an Alternative Method to Conventional Maceration for the Extraction of the Polyphenolic Fraction of Ribes nigrum Buds: A New Category of Food Supplements Proposed by The FINNOVER Project. Foods. 8. 466; 2019
- Giricz Z., Varga Z.V., Koncsos G., Nagy C.T., Görbe A., Mentzer R.M. Jr, Gottlieb R.A., Ferdinandy P. (2017): Autophagosome formation is required for cardioprotection by chloramphenicol. Life Science Oct 2017. 11-16.
- Hemida, Yasmine (2016): Effect of Rapamycin as an Inhibitor of the mTOR Cell Cycle Entry Complex on the Selective Lysis of Human Leukemia Cells Lines in Vitro Using 20 kHz Pulsed Low-Frequency Ultrasound. Honors Capstone Projects – All. 942, 2016.
- Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 1, 2011.
- Priego-Capote, Feliciano; Castro, María (2004): Analytical uses of ultrasound – I. Sample preparation. TrAC Trends in Analytical Chemistry 23, 2004. 644-653.
- Welna, Maja; Szymczycha-Madeja, Anna; Pohl, Pawel (2011): Quality of the Trace Element Analysis: Sample Preparation Steps. In: Wide Spectra of Quality Control; InTechOpen 2011.
よくある質問
ソニケーションの目的は?
超音波処理の目的は、音波(通常、超音波の範囲)を使って試料中の粒子を攪拌し、細胞の破砕、均質化、分子構造の破壊などのプロセスを促進することである。生物学、化学、材料科学の分野で、混合を促進し、反応を促進し、細胞内容物を放出するために一般的に使用される。
ソニケーション・テクニックとは?
超音波処理技術では、強力な超音波(通常、周波数20 – 30 kHz)を用いて、液体媒体中に急速な振動を発生させる。これらの振動は、音響キャビテーションとして知られるプロセスである微細な気泡の形成と崩壊を引き起こす。このキャビテーションにより局所的な高圧と高温が発生し、細胞を破壊したり、粒子を分散させたり、化学反応を促進させたりすることができる。超音波処理技術は、細胞溶解、抽出、DNAせん断、ホモジナイゼーション、ナノ粒子合成などの用途に研究室で広く使用されている。
ソニケーション用の試料はどのように準備するのか?
超音波処理用の試料を調製するには、試料(通常、液体または浮遊固形物)を適切な容器(多くの場合、ガラスフラスコ、プラスチックチューブ、マルチウェルプレートなど)に入れ、超音波振動に対応し、流出を防ぐのに十分な容積を確保する。必要であれば、所望の濃度を維持し、超音波処理中の過熱を防ぐため、試料を緩衝液または溶媒で希釈する。熱に敏感なサンプルの場合は、容器を氷浴または冷却ジャケットに部分的に浸し、超音波によって発生する熱を放散させる。ソニケーターのプローブは、効率的なエネルギー伝達を確実にするために適切な位置に設置される。振幅、時間、パルスモードなどのパラメータは、実験の特定の要件に基づいて設定されます。
ソニケーションはDNAを壊すのか?
そう、超音波処理はDNAを切断する可能性がある。超音波処理中に発生する高エネルギーの超音波は、局所的な高圧と高熱を発生させることでDNA分子をせん断し、DNA鎖に機械的ストレスを与える。その結果、DNAが細かく断片化される。DNA切断の程度は、超音波処理の時間と強度に依存する。クロマチン免疫沈降(ChIP)や次世代シーケンサー(NGS)ライブラリー調製のようないくつかの実験では、超音波処理はDNAの剪断を制御する信頼性の高い技術として使用される。



