Ultrahangos minta-előkészítés tömegspektrometriához
A tömegspektrometria (MS) a modern kutatás és ipar leghatékonyabb analitikai technikái közé tartozik. Teljesítménye azonban alapvetően egy kritikus, a mérést megelőző tényezőtől függ: a minta-előkészítéstől. Az ultrahangos minta-előkészítés – különösen a szondás és az érintkezésmentes ultrahangos kezelés – a hatékony, reprodukálható és skálázható tömegspektrometriás munkafolyamatok arany standardjává vált.
Miért határozza meg a minta-előkészítés az MS sikerét?
A minta-előkészítés nem mellékes lépés – közvetlenül meghatározza az MS érzékenységét, pontosságát és reprodukálhatóságát. A nem megfelelő előkészítés a következőkhöz vezethet:
- Nem teljes sejtlízis vagy fehérjeextrakció
- Az emésztés alacsony hatékonysága
- Mátrixhatások és ionszuppresszió
- A minta heterogenitása és alacsony reprodukálhatóság
- Kis mennyiségben jelen lévő analitok elvesztése
Az MS modern alkalmazásai – proteomika, metabolomika, lipidomika, gyógyszerészeti analízis és klinikai diagnosztika – rendkívül hatékony, standardizált és szennyeződésmentes előkészítési módszereket igényelnek. Az ultrahangos kezelés szabályozott mechanikai energia bevitelével teljesíti ezeket a követelményeket: javítja az extrakciót, a diszpergálást és a reakciókinetikát anélkül, hogy megváltoztatná a molekuláris integritást.
A minták ultrahangos kezelése MS előtt: előnyök és hasznok
Az ultrahangos minta-előkészítés az akusztikus kavitációra – mikroszkopikus buborékok keletkezésére és összeomlására – támaszkodik, amely intenzív nyíróerőket és helyi energiát hoz létre. Ez a mechanizmus számos előnyt kínál a mechanikai vagy kizárólag kémiai módszerekkel szemben.
Fő előnyök az MS munkafolyamataiban
- Hatékony sejtfeltárás és extrakció: Az ultrahang lehetővé teszi a sejtek, szövetek és mikroorganizmusok gyors és teljes lízisét, biztosítva a fehérjék, metabolitok, lipidek és nukleinsavak nagy arányú kinyerését.
- Hatékonyabb enzimatikus emésztés: Az ultrahangos kezelés a szubsztrát hozzáférhetőségének és az anyagátadásnak a javításával felgyorsítja a proteolitikus emésztést (például a tripszinalapú munkafolyamatokban), így az emésztés időtartamát gyakran órákról percekre csökkenti. Tudjon meg többet a minták ultrahanggal javított emésztéséről!
- Jobb homogenizálás és diszpergálás: A részecskék és cseppek egyenletes eloszlása minimalizálja a minta heterogenitását, és javítja az analitikai reprodukálhatóságot.
- Kevesebb kémiai adalékanyag: Az ultrahang helyettesítheti vagy csökkentheti az ionizációt zavaró, illetve további tisztítási lépéseket igénylő agresszív detergensek és oldószerek használatát.
- Skálázhatóság és standardizálás: A pontosan szabályozható amplitúdó, energiabevitel és kezelési idő, valamint a lezárt minták érintkezésmentes ultrahangos kezelése lehetővé teszi a módszerek átvitelét a kutatás-fejlesztésből a rutinanalízisbe.
A UIP400MTP mikrolemez-kezelő ultrahangos készülék megbízható minta-előkészítést és a meglévő laboratóriumi munkafolyamatokba való egyszerű integrációt biztosít
Példa az MS ultrahangos minta-előkészítési protokolljára
Az alábbiakban egy proteomikai és metabolomikai munkafolyamatokhoz alkalmas általános protokoll található. A paramétereket a mintatípus és az ezt követő MS követelményei alapján kell optimalizálni.
Példa: ultrahangos sejtlízis és fehérjeextrakció
Minta: emlőssejtek vagy emlősszövet
Térfogat: 200–1000 µL
Puffer: az MS követelményeinek megfelelő lízispuffer (például ammónium-hidrogén-karbonát-alapú)
Eljárás:
- Helyezze a mintát megfelelő csőbe vagy fiolába (szükség esetén jégre).
- Helyezze be az ultrahangos szondát, vagy helyezze a csövet az érintkezésmentes ultrahangos kezeléshez való tartóba.
- Végezze az ultrahangos kezelést impulzusüzemmódban (például 5–10 másodperc bekapcsolva / 5–10 másodperc kikapcsolva).
- Tartsa fenn a hőmérséklet-szabályozást a termikus bomlás elkerülése érdekében.
- Folytassa az ultrahangos kezelést a teljes lízis és homogenizálás eléréséig.
- Szükség esetén centrifugálja a mintát a törmelék eltávolításához.
- Folytassa az emésztéssel, a tisztítással és az MS elvégzésével.
Az ultrahangos kezelés jellemző paraméterei:
- Frekvencia: 20–30 kHz
- Amplitúdó: 20–70% (a minta keménységétől függően)
- Teljes energiabevitel: Ws/mL-ben meghatározva, módszerspecifikus és reprodukálható
Hogyan válassza ki az ideális ultrahangos készüléket az MS eljárásához?
A megfelelő ultrahangos készülék kiválasztása az analitikai céloktól, a minta jellemzőitől és a mintafeldolgozási kapacitással kapcsolatos követelményektől függ.
Fő kiválasztási szempontok
A minta típusa és ellenálló képessége:
A kemény szövetek és mikroorganizmusok esetében előnyösek a szondás rendszerek, míg az érzékeny vagy a szennyeződés szempontjából kritikus mintákhoz az érintkezésmentes ultrahangos kezelés kedvezőbb.
Mintatérfogat és mintafeldolgozási kapacitás:
A kis térfogatú mintákat nagy mintafeldolgozási kapacitással kezelő munkafolyamatok többmintás tartókat vagy automatizálásra előkészített rendszereket igényelhetnek.
Reprodukálhatóság és megfelelőség:
A digitális vezérlés, az adatnaplózás és a pontos energiabevitel elengedhetetlen az MS szabályozott alkalmazási környezeteiben.
Hőmérséklet-szabályozás:
A hőmérsékletre érzékeny analitok impulzusos ultrahangos kezelést és hűtési tartozékokat igényelnek.
Skálázhatóság: Válasszon olyan platformot, amely a protokoll újratervezése nélkül támogatja mind a módszerfejlesztést, mind a rutinszerű működést.
A Hielscher ultrahangos készülékeket úgy tervezték, hogy megfeleljenek ezeknek a kritériumoknak, stabil teljesítményt, pontos vezérlést és hosszú távú megbízhatóságot kínálva az MS területén működő laboratóriumok számára.
Szakirodalom / Hivatkozások
- D. López-Ferrer, J. L. Capelo, J. Vázquez (2005): Ultra Fast Trypsin Digestion of Proteins by High Intensity Focused Ultrasound. Journal of Proteome Research 4, 5; 2005. 1569–1574.
- Collins BC, Hunter CL, Liu Y, Schilling B, Rosenberger G, Bader SL, Chan DW, Gibson BW, Gingras AC, Held JM, Hirayama-Kurogi M, Hou G, Krisp C, Larsen B, Lin L, Liu S, Molloy MP, Moritz RL, Ohtsuki S, Schlapbach R, Selevsek N, Thomas SN, Tzeng SC, Zhang H, Aebersold R. (2017): Multi-laboratory assessment of reproducibility, qualitative and quantitative performance of SWATH-mass spectrometry. Nat Commun. 2017 Aug 21;8(1):291.
- Viñas, Pilar; Garcia, Ignacio; Campillo, Natalia; Rivas, Ricardo; Hernández-Córdoba, Manuel (2012): Ultrasound-assisted emulsification microextraction coupled with gas chromatography-mass spectrometry using the Taguchi design method for bisphenol migration studies from thermal printer paper, toys and baby utensils. Analytical and bioanalytical chemistry. 404. 671-8.
- FactSheet VialTweeter Single-Tube Sonicator VT26dxx – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet VialTweeter Multi-Sample Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
Gyakran ismételt kérdések
Mi a tömegspektrometria alapelve?
A tömegspektrometria a molekulákat gázfázisú ionokká alakítja, majd elektromágneses terekben méri a tömeg/töltés arányukat (m/z), így azonosítja őket és meghatározza mennyiségüket.
Mi a tömegspektrometria 4 szakasza?
A tömegspektrometria négy szakasza a minta ionizációja töltéssel rendelkező részecskék létrehozásához, az ionok gyorsítása elektromos térrel, az ionok szétválasztása tömeg/töltés arányuk szerint a tömeganalizátorban, valamint az ionok detektálása mérhető jel létrehozásához.
Mi a tömegspektrometria 3 típusa?
A tömegspektrometria három fő típusa a kvadrupól tömegspektrometria, amely oszcilláló elektromos terekkel választja szét az ionokat; a repülési időn alapuló tömegspektrometria, amely az ionokat egy rögzített távolságon mért repülési idejük alapján különbözteti meg; valamint az ioncsapdás tömegspektrometria, amely az ionokat elektromágneses térben tartja, és tömeg/töltés arányuk szerint egymás után engedi ki őket.
A Hielscher Ultrasonics nagy teljesítményű ultrahangos homogenizátorokat gyárt a laboratóriumi mérettől az ipari méretig.


