પ્રોટીન પેલેટનું અલ્ટ્રાસોનિક દ્રાવ્યીકરણ
પ્રોટિઓમિક્સમાં નમૂનાની તૈયારી ક્યારેય ગૌણ બાબત હોતી નથી. તે એવો પાયો છે જેના પર ઓળખની ચોકસાઈ, પરિમાણનિર્ધારણની વિશ્વસનીયતા અને પુનરુત્પાદકતા નિર્ભર છે. પ્રોટીનના નમૂનાની તૈયારીમાં સતત રહેતા પડકારોમાંનો એક છે અવક્ષેપણ અથવા સાંદ્રીકરણનાં પગલાં પછી પ્રોટીન પેલેટને કાર્યક્ષમ રીતે ફરીથી ઓગાળવા. આ જ તબક્કે પ્રોટીન પેલેટનું અલ્ટ્રાસોનિક દ્રાવ્યીકરણ વધુ ને વધુ મહત્ત્વનું બન્યું છે. નિયંત્રિત સોનિકેશન લાગુ કરીને પ્રયોગશાળાઓ પ્રોટીનની પુનઃપ્રાપ્તિ સુધારી શકે છે, પેલેટના દ્રાવણને ઝડપી બનાવી શકે છે અને ત્યાર પછી થનારી માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી તથા જૈવરાસાયણિક વિશ્લેષણ માટે નમૂનાઓને વધુ અસરકારક રીતે તૈયાર કરી શકે છે.
પ્રોટીનનું દ્રાવ્યીકરણ: આધુનિક પ્રોટિઓમિક્સમાં સોનિકેશન શા માટે મહત્ત્વનું છે
એસિટોન, ઇથેનોલ, મિથેનોલ-ક્લોરોફોર્મ, એમોનિયમ સલ્ફેટ અથવા TCA વડે અવક્ષેપણ દરમિયાન ઘણી વાર પ્રોટીન પેલેટ બને છે. દૂષકો દૂર કરવા, પ્રોટીનને સાંદ્ર કરવા અને વિશ્લેષણ પહેલાં અર્કોને શુદ્ધ કરવા માટે આ કાર્યપ્રવાહોનો વ્યાપક ઉપયોગ થાય છે. તેમ છતાં, અવક્ષેપણ પૂર્ણ થયા પછી બનતા પેલેટને ફરીથી દ્રાવ્ય બનાવવું મુશ્કેલ હોઈ શકે છે. ગીચ સમુચ્ચયો, જલવિરાગી પ્રદેશો, પટલ સાથે સંકળાયેલા પ્રોટીન અને પરસ્પર પ્રબળ આંતરક્રિયા કરતા પ્રોટીન સંકુલો ઘણી વાર પરંપરાગત મિશ્રણ અથવા વોર્ટેક્સિંગ સામે પ્રતિકાર દર્શાવે છે. પરિણામે, અપૂર્ણ દ્રાવ્યીકરણથી નમૂનાનો વ્યય, પ્રોટીનનું પક્ષપાતપૂર્ણ પ્રતિનિધિત્વ અને પ્રયોગો વચ્ચે નબળી પુનરુત્પાદકતા સર્જાઈ શકે છે.
સોનિકેશન ચોક્કસપણે આ જ અવરોધને દૂર કરે છે. પ્રવાહી માધ્યમમાં યાંત્રિક ઊર્જા ઉત્પન્ન કરીને સોનિકેશન ગીચ પેલેટની રચનાઓને તોડે છે, બફરના પ્રવેશને પ્રોત્સાહન આપે છે અને એકત્રિત પદાર્થને દ્રાવણમાં વિખેરે છે. પરિણામે પ્રોટીનનું વધુ ઝડપી અને ઘણી વાર વધુ સંપૂર્ણ પુનઃદ્રાવણ થાય છે, જે મર્યાદિત નમૂનાઓ, જટિલ લાઇસેટ અથવા પડકારજનક પ્રોટિઓમિક લક્ષ્યો સાથે કામ કરતી વખતે ખાસ મૂલ્યવાન છે.
Microplate Sonicator UIP400MTP પ્રોટીનના નિષ્કર્ષણ અને પેલેટના દ્રાવ્યીકરણ માટે
પ્રોટીન પેલેટને દ્રાવ્ય બનાવવાનું શા માટે મુશ્કેલ છે
પ્રોટીનનું અવક્ષેપણ અસરકારક છે કારણ કે તે પ્રોટીનને દ્રાવણમાંથી બહાર આવવા મજબૂર કરે છે. જોકે, અવક્ષેપણને ઉપયોગી બનાવતી આ જ પ્રક્રિયા પેલેટમાંથી પ્રોટીનની પુનઃપ્રાપ્તિની સમસ્યા પણ સર્જે છે. પેલેટ બન્યા પછી પ્રોટીન અત્યંત ગીચ રીતે ગોઠવાઈ શકે છે અને આંશિક રીતે વિકૃત થઈ શકે છે. જલવિરાગી આંતરક્રિયાઓ તીવ્ર થઈ શકે છે, આંતરઅણુ બંધન વધી શકે છે અને કેટલાક પ્રોટીન ક્ષારો, લિપિડ, ન્યુક્લિક એસિડ અથવા મેટ્રિક્સના અન્ય ઘટકોને અંદર ફસાવી શકે છે. પ્રબળ દ્રાવ્યીકરણ બફરનો ઉપયોગ કરવામાં આવે ત્યારે પણ નિષ્ક્રિય પુનઃનિલંબન ઘણી વાર ધીમું અને અપૂર્ણ રહે છે.
પ્રોટિઓમિક્સમાં આ મહત્ત્વનું છે કારણ કે પેલેટનું અપૂર્ણ દ્રાવણ માત્ર કુલ ઉપજ ઘટાડતું નથી. તે ચોક્કસ પ્રોટીન વર્ગોને, ખાસ કરીને પટલ પ્રોટીન, સંરચનાત્મક પ્રોટીન અથવા સમુચ્ચય બનાવવાની વૃત્તિ ધરાવતા પ્રોટીન પ્રકારોને, પસંદગીપૂર્વક બાકાત રાખી શકે છે. તેનો અર્થ એ છે કે અંતિમ વિશ્લેષણાત્મક પરિણામ મૂળ નમૂનાની વાસ્તવિક રચનાને પ્રતિબિંબિત કરતું ન પણ રહે. ઉચ્ચ વિભેદનક્ષમતા ધરાવતા પ્રોટિઓમિક્સમાં, જ્યાં પ્રોટીનના પ્રમાણ અથવા અનુવાદોત્તર સંશોધનમાં સૂક્ષ્મ તફાવતો જૈવિક રીતે નિર્ણાયક હોઈ શકે છે, ત્યાં તૈયારીને કારણે ઊભો થતો આવો પક્ષપાત એક ગંભીર મર્યાદા છે.
સોનિકેશન પ્રોટીન પેલેટના દ્રાવ્યીકરણને કેવી રીતે સુધારે છે
અલ્ટ્રાસોનિક ઉપચાર નમૂનામાં ઉચ્ચ આવૃત્તિની યાંત્રિક ઊર્જા દાખલ કરીને દ્રાવ્યીકરણ સુધારે છે. આ ઊર્જા ગીચ પેલેટ પદાર્થને તોડવામાં મદદ કરે છે અને દ્રાવ્યીકરણ બફર તથા તેમાં સમાવિષ્ટ પ્રોટીન વચ્ચેનો સંપર્ક વધારે છે. માત્ર પ્રસરણ અને હાથથી મિશ્રણ કરવા પર આધાર રાખવાને બદલે, આ પ્રક્રિયા પેલેટને સક્રિય રીતે નાના અંશોમાં વિખેરે છે, જેને ઓગાળવા વધુ સરળ હોય છે.
તેની વ્યવહારિક અસર નોંધપાત્ર છે. સોનિકેશન નીચેના કાર્યો કરી શકે છે:
- ગીચ અથવા સહેલાઈથી ન ઓગળતા પ્રોટીન પેલેટના દ્રાવણને ઝડપી બનાવવું
- ઓછી દ્રાવ્યતા ધરાવતા અને એકત્રિત થયેલા પ્રોટીનની પુનઃપ્રાપ્તિ સુધારવી
- પ્રોટિઓમિક્સ કાર્યપ્રવાહોમાં તૈયારીનો સમય ઘટાડવો
- પાચન અને વિશ્લેષણ માટે વધુ સમાનસંગી નમૂનાઓ તૈયાર કરવામાં સહાય કરવી
આ સુધરેલું વિખેરણ ખાસ કરીને ત્યારે ઉપયોગી બને છે જ્યારે પેલેટને યુરિયા, થાયોયુરિયા, ડિટર્જન્ટ, કેઓટ્રોપિક પદાર્થો અથવા પ્રોટીઓમિક્સમાં સામાન્ય રીતે વપરાતા અન્ય અભિકર્મકો ધરાવતા બફરમાં ફરીથી નિલંબિત કરવામાં આવે છે. સોનિકેશન આ ઘટકોને પેલેટ સુધી પહોંચવામાં અને તેને વધુ કાર્યક્ષમ રીતે દ્રાવ્ય બનાવવામાં મદદ કરે છે, જેના પરિણામે નમૂનાનું વધુ સમાન દ્રાવણ મળે છે.
પ્રોટીઓમિક્સમાં અલ્ટ્રાસોનિક દ્રાવ્યીકરણના ફાયદા
અલ્ટ્રાસોનિક દ્રાવ્યીકરણનો મુખ્ય ફાયદો એ છે કે તે તૈયારીના એવા તબક્કાને નિયંત્રણક્ષમ અને કાર્યક્ષમ પ્રક્રિયામાં ફેરવે છે જેના મહત્ત્વને ઘણી વાર ઓછું આંકવામાં આવે છે. પ્રોટીઓમિક્સમાં તેની સીધી અસર વિશ્લેષણ પર પડે છે.
- પ્રથમ, સુધરેલું દ્રાવ્યીકરણ એ સંભાવના વધારે છે કે ઉત્સેચકીય પાચનમાં પ્રવેશતો નમૂનો સમગ્ર પ્રોટીન સમૂહનું પ્રતિનિધિત્વ કરે. ઉદાહરણ તરીકે, ટ્રિપ્સિન દ્વારા પાચન માટે પ્રોટીન પૂરતા પ્રમાણમાં ખુલ્લી સંરચનામાં અને દ્રાવણમાં સુલભ હોવા જરૂરી છે. જો પેલેટના કેટલાક ભાગો વણઓગળેલા રહે, તો તે પ્રોટીન વ્યવહારિક રીતે પેપ્ટાઇડ નિર્માણમાંથી અને તેથી તેમની શોધમાંથી બાકાત રહી જાય છે.
- બીજું, સોનિકેશન પુનરુત્પાદકતા સુધારી શકે છે. પેલેટનું હાથેથી પુનઃનિલંબન સ્વાભાવિક રીતે જ પરિવર્તનશીલ હોય છે, ખાસ કરીને જ્યારે જુદા સંચાલકો, પેલેટના જુદા કદ અથવા નમૂનાના જુદા મેટ્રિક્સ સામેલ હોય. નિયંત્રિત અલ્ટ્રાસોનિક ઉપચાર નમૂનાને આપવામાં આવતી ભૌતિક ઊર્જાનું માનકીકરણ કરે છે, જે અલગ અલગ તૈયારીઓ વચ્ચેની પરિવર્તનશીલતા ઘટાડી શકે છે અને ત્યારપછીની LC-MS અથવા જેલ આધારિત કાર્યપ્રવાહોમાં સુસંગતતા સુધારી શકે છે.
- ત્રીજું, ઓછી પ્રારંભિક સામગ્રીવાળા અને મૂલ્યવાન નમૂનાઓ માટે અલ્ટ્રાસોનિકેશન અત્યંત ઉપયોગી છે. ક્લિનિકલ પ્રોટીઓમિક્સ, બાયોમાર્કરની શોધ, કોષ સંવર્ધનના પ્રયોગો અને પેશીઓના અભ્યાસો ઘણી વાર મર્યાદિત સામગ્રી પર આધાર રાખે છે. દ્રાવ્યીકરણ દરમિયાન પ્રોટીનની કોઈ પણ હાનિ નમૂનાનું માહિતીલક્ષી મૂલ્ય ઘટાડે છે. કાર્યક્ષમ અલ્ટ્રાસોનિક પુનઃદ્રાવણ શક્ય તેટલા વધુ વિશ્લેષ્ય પદાર્થને જાળવવામાં મદદ કરે છે.
- છેલ્લે, સોનિકેશન કાર્યપ્રવાહની ઝડપ વધારવામાં મદદ કરે છે. અનેક નમૂનાઓ પર પ્રક્રિયા કરતી પ્રોટીઓમિક્સ પ્રયોગશાળાઓને વિશ્વસનીય અને ઓછો સમય લેતી તૈયારી પદ્ધતિઓની જરૂર પડે છે. ઝડપથી અને સંપૂર્ણપણે ઓગળતું પેલેટ સુવિધાજનક હોવા ઉપરાંત વિલંબ ઘટાડે છે, નમૂનાઓ સંભાળતી વખતે થતી ભૂલોનું જોખમ ઘટાડે છે અને નમૂનાઓ પર પ્રક્રિયા કરવાની ક્ષમતા વધારે છે.
સોનિકેશન અને પરંપરાગત પુનઃનિલંબન પદ્ધતિઓની તુલના
પરંપરાગત પેલેટ પુનઃનિલંબન પદ્ધતિઓમાં સામાન્ય રીતે પિપેટિંગ, હલાવવું, વોર્ટેક્સિંગ, લાંબા સમય સુધી ઇન્ક્યુબેશન અથવા વારંવાર ગરમ કરવાના તબક્કાઓનો સમાવેશ થાય છે. આ પદ્ધતિઓ ઢીલી રીતે સંકુલિત પેલેટ માટે કામ કરી શકે છે, પરંતુ અત્યંત સઘન અથવા જલવિરાગી પ્રોટીન સામગ્રી માટે તે ઘણી વાર પૂરતી અસરકારક રહેતી નથી. માત્ર યાંત્રિક મિશ્રણ પેલેટની સંરચનાને સંપૂર્ણપણે વિખંડિત કરવામાં નિષ્ફળ જઈ શકે છે, જેના કારણે દેખાતા સૂક્ષ્મ કણો અથવા ન દેખાતા અદ્રાવ્ય અંશો બાકી રહી જાય છે.
સોનિકેશન વધુ સક્રિય અને લક્ષિત અભિગમ પૂરો પાડે છે. બફરના ધીમા પ્રસરણ પર આધાર રાખવાને બદલે તે પેલેટને ભૌતિક રીતે વિખંડિત કરે છે અને ઝડપી સમાનાંગીકરણને પ્રોત્સાહન આપે છે. તે યોગ્ય પુનઃનિલંબન બફરની જરૂરિયાત દૂર કરતું નથી, પરંતુ તે બફરની કાર્યક્ષમતામાં નોંધપાત્ર વધારો કરે છે.
સંપૂર્ણપણે હાથેથી કરવામાં આવતી પદ્ધતિઓની સરખામણીમાં, અલ્ટ્રાસોનિક દ્રાવ્યીકરણ ઘણી વાર વધુ સારું પ્રક્રિયા નિયંત્રણ, વધુ કાર્યક્ષમતા અને કઠિન પ્રોટીઓમિક્સ ઉપયોગો માટે વધુ સારી અનુકૂળતા આપે છે. વિશ્લેષણની ગુણવત્તા અને કામગીરીની વિશ્વસનીયતા બંને ઇચ્છતી પ્રયોગશાળાઓ માટે આ બાબતો સોનિકેશનને એક આકર્ષક વિકલ્પ બનાવે છે.
અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોટીન પેલેટ દ્રાવ્યીકરણના શ્રેષ્ઠ ઉપયોગો
નીચેની બાબતોનો સમાવેશ કરતા કાર્યપ્રવાહોમાં અલ્ટ્રાસોનિક દ્રાવ્યીકરણ ખાસ કરીને લાભદાયક છે:
- માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી પહેલાં પ્રોટીનનું અવક્ષેપન,
- કોષ લાઇસેટ અથવા પેશીના અર્કમાંથી મળેલા પેલેટનું પુનઃદ્રાવણ,
- પટલસમૃદ્ધ અથવા એકત્રીકરણની વૃત્તિ ધરાવતા પ્રોટીનની પુનઃપ્રાપ્તિ,
- અને જ્યાં પુનરુત્પાદકતા અનિવાર્ય હોય ત્યાં માત્રાત્મક પ્રોટીઓમિક્સ માટે નમૂનાની તૈયારી.
જ્યારે પેલેટને સંગ્રહિત કરવામાં આવ્યા હોય, અતિશય સૂકવવામાં આવ્યા હોય અથવા જટિલ જૈવિક મેટ્રિક્સમાંથી બનાવવામાં આવ્યા હોય ત્યારે પણ તે અત્યંત ઉપયોગી છે. આવા કિસ્સાઓમાં નિષ્ક્રિય પુનઃનિલંબન ખાસ કરીને બિનકાર્યક્ષમ બની શકે છે, જ્યારે સોનિકેશન ઓછા હસ્તચાલિત હસ્તક્ષેપ સાથે નમૂનાને ફરી ઉપયોગયોગ્ય બનાવવામાં મદદ કરે છે.
VialTweeter સોનિકેટર દ્વારા એકસાથે 10 નમૂનાઓનું સોનિકેશન, દા.ત. પ્રોટીનના નિષ્કર્ષણ અને દ્રાવ્યીકરણ માટે
તમારા પ્રોટીન દ્રાવ્યીકરણ કાર્યપ્રવાહ માટે શ્રેષ્ઠ સોનિકેટર શોધો!
મૂલ્યવાન નમૂનાઓ, ઓછી પ્રારંભિક સામગ્રી અથવા ઊંચી નમૂના પ્રક્રિયા ક્ષમતા ધરાવતા પ્રોટીઓમિક્સ સાથે કામ કરતી પ્રયોગશાળાઓ માટે, Hielscher સોનિકેશનનાં અનેક સ્વરૂપો પ્રસ્તુત કરે છે, જેને કાર્યપ્રવાહ સાથે ચોકસાઈપૂર્વક અનુરૂપ બનાવી શકાય છે.
તમે Hielscher પ્રોબ પ્રકારનું સોનિકેટર, VialTweeter Multi-Tube Sonicator અથવા UIP400MTP Microplate Sonicator પસંદ કરો – દરેક અલ્ટ્રાસોનિકેટર મોડેલ નમૂનાની તૈયારીની અલગ પરિસ્થિતિને અનુરૂપ છે, અને બધાં એક જ મુખ્ય લાભ આપે છે: કાર્યક્ષમ અને નિયંત્રિત નમૂના પ્રક્રિયા માટે પુનરુત્પાદનીય અલ્ટ્રાસોનિક ઊર્જા પૂરી પાડે છે.
પ્રોબ પ્રકારનાં સોનિકેટર્સ
UP200Ht જેવા અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોબ્સ વ્યક્તિગત નમૂનાઓના સીધા સોનિકેશન માટે ખાસ કરીને યોગ્ય છે. પ્રોટીઓમિક્સ પ્રયોગશાળાઓમાં, જ્યારે નાના થી મધ્યમ કદના આયતનમાં પ્રોટીન પેલેટ્સને સઘન રીતે ફરીથી નિલંબિત કરવાની જરૂર હોય, ખાસ કરીને જ્યાં પદ્ધતિનું નિયંત્રણ અને પુનરાવર્તનીયતા મહત્વનાં હોય, ત્યારે UP200Ht એક ઉત્તમ વિકલ્પ છે. સીધું પ્રોબ સોનિકેશન સઘન પેલેટ સામગ્રીને ઝડપથી વિઘટિત કરી શકે છે અને દ્રાવણીકરણ બફર્સને એવા પ્રોટીન સુધી પહોંચવામાં મદદ કરી શકે છે, જે અન્યથા આંશિક રીતે અદ્રાવિત રહી જાય.
પ્રોબ પ્રકારનાં તમામ સોનિકેટર્સનો પરિચય!
VialTweeter Multi-Tube Sonicator
જ્યાં અનેક બંધ વાયલ પર સમાન પરિસ્થિતિઓમાં પ્રક્રિયા કરવી જરૂરી હોય, ત્યાં Multi-Tube Sonicator VialTweeter એક વિશિષ્ટ લાભ આપે છે. VialTweeter નિર્જંતુક પરિસ્થિતિઓમાં અનેક બંધ વાયલનું સોનિકેશન કરીને નાના આયતનવાળા નમૂનાઓનું સઘન સોનિકેશન કરવાની સુવિધા આપે છે. સમાન પરિસ્થિતિઓમાં અનેક પરીક્ષણ નળીઓમાં એકસાથે નમૂનાની તૈયારી કરવાની સુવિધા તથા બંધ વાયલમાં પ્રક્રિયા દરમિયાન પરસ્પર દૂષણ, નમૂનાની હાનિ અને એરોસોલની રચનાનું ઓછું જોખમ – આ બાબતોને કારણે VialTweeter નમૂનાની તૈયારી માટે એક વિશ્વસનીય સાધન બને છે. પ્રોટીઓમિક્સમાં, અનેક પુનરાવર્તિત નમૂનાઓ અથવા ક્લિનિકલ નમૂનાઓમાંથી મળેલા મૂલ્યવાન પેલેટ સંભાળતી વખતે આ અત્યંત પ્રાસંગિક છે, કારણ કે તેમાં નળીઓ વચ્ચેની સુસંગતતા નિર્ણાયક હોય છે.
VialTweeter વિશે વધુ જાણો!
Microplate Sonicator UIP400MTP
ઊંચી નમૂના પ્રક્રિયા ક્ષમતા ધરાવતી પ્રયોગશાળાઓ માટે, UIP400MTP માઇક્રોપ્લેટ સોનિકેટર સોનિકેશનના લાભોને પ્લેટ આધારિત કાર્યપ્રવાહો સુધી વિસ્તારે છે. UIP400MTP માઇક્રોપ્લેટ અને મલ્ટી-વેલ પ્લેટ સોનિકેટર તરીકે 96-વેલ સ્વરૂપો સહિતની પ્રમાણભૂત પ્લેટોમાં એકસમાન અલ્ટ્રાસોનિક પ્રક્રિયા માટે વર્ણવાય છે, અને પ્રોટીઓમિક્સ, નિદાન તથા ઔષધ શોધ જેવાં ક્ષેત્રોમાં સ્વચાલિત નમૂનાની તૈયારી માટે તેની યોગ્યતા પર ભાર મૂકવામાં આવે છે. આ પ્લેટફોર્મ અનેક નમૂનાઓની એકસાથે પ્રક્રિયા કરવા માટે રચાયેલું છે અને પરસ્પર દૂષણનું ઓછું જોખમ, ઓછી શ્રમ આવશ્યકતા, નમૂનાની સુધારેલી પુનઃપ્રાપ્તિ તથા સ્વચાલિત કાર્યપ્રવાહોમાં એકીકરણ જેવા લાભો આપે છે.
વ્યવહારુ પ્રોટીઓમિક્સમાં, તેનો અર્થ એ છે કે પેલેટનું દ્રાવ્યીકરણ, કોષલયન, નિષ્કર્ષણ અને સંબંધિત તૈયારીનાં પગલાંને ઘણી વધુ કાર્યક્ષમતાથી મોટા પાયે અમલમાં મૂકી શકાય છે. નમૂનાઓ પર એક પછી એક પ્રક્રિયા કરવાને બદલે, પ્રયોગશાળાઓ સુસંગત ઊર્જા આપીને આખી પ્લેટોનું સોનિકેશન કરી શકે છે. જ્યારે પણ કાર્યપ્રવાહોમાં નમૂના પ્રક્રિયા ક્ષમતા સાથે વિશ્લેષણાત્મક કડકાઈ જાળવવાની જરૂર હોય, ઉદાહરણ તરીકે સ્ક્રીનિંગ અભ્યાસો, માત્રાત્મક પ્રોટીઓમિક્સ અથવા માનકીકૃત નમૂના તૈયારી પ્રક્રિયાશૃંખલાઓમાં, ત્યારે આ મૂલ્યવાન છે. તેથી UIP400MTP માત્ર સગવડ આપતું સાધન નથી; તે સ્વચાલન, પુનરુત્પાદનીયતા અને સુદૃઢ, ઊંચી નમૂના પ્રક્રિયા ક્ષમતા ધરાવતા પ્રોટીઓમિક્સ તરફના વ્યાપક વલણને ટેકો આપતું પ્લેટફોર્મ છે.
UIP400MTP Microplate Sonicator વિશે વધુ જાણો!
ઊંચા નમૂના પ્રક્રિયા દરે પ્રોટીનનું નિષ્કર્ષણ અને દ્રાવણીકરણ માઇક્રોપ્લેટ સોનિકેટર UIP400MTP વડે
ડિઝાઇન, ઉત્પાદન અને પરામર્શ – જર્મનીમાં નિર્મિત ગુણવત્તા
Hielscher અલ્ટ્રાસોનિકેટર્સ તેમની સર્વોચ્ચ ગુણવત્તા અને ડિઝાઇનનાં ધોરણો માટે જાણીતા છે. મજબૂતાઈ અને સરળ સંચાલનને કારણે અમારા અલ્ટ્રાસોનિકેટર્સને ઔદ્યોગિક સુવિધાઓમાં સરળતાથી એકીકૃત કરી શકાય છે. Hielscher અલ્ટ્રાસોનિકેટર્સ કઠોર પરિસ્થિતિઓ અને પડકારજનક વાતાવરણમાં સરળતાથી કાર્ય કરે છે.
Hielscher Ultrasonics એક ISO પ્રમાણિત કંપની છે અને અદ્યતન ટેકનોલોજી તથા ઉપયોગમાં સરળતા ધરાવતા ઉચ્ચ કાર્યક્ષમતાવાળા અલ્ટ્રાસોનિકેટર્સ પર વિશેષ ભાર મૂકે છે. અલબત્ત, Hielscher અલ્ટ્રાસોનિકેટર્સ CE અનુરૂપ છે અને UL, CSA તથા RoHsની આવશ્યકતાઓ પૂરી કરે છે.
સાહિત્ય / સંદર્ભો
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet VialTweeter – Sonicator for Simultaneous Sample Preparation
- Susana Jorge, Kevin Pereira, Hugo López-Fernández, William LaFramboise, Rajiv Dhir, Javier Fernández-Lodeiro, Carlos Lodeiro, Hugo M. Santos, Jose L. Capelo-Martínez (2020): Ultrasonic-assisted extraction and digestion of proteins from solid biopsies followed by peptide sequential extraction hyphenated to MALDI-based profiling holds the promise of distinguishing renal oncocytoma from chromophobe renal cell carcinoma. Talanta, Volume 206, 2020.
- Lindemann C, Lupilova N, Müller A, Warscheid B, Meyer HE, Kuhlmann K, Eisenacher M, Leichert LI. (2013): Redox proteomics uncovers peroxynitrite-sensitive proteins that help Escherichia coli to overcome nitrosative stress. Journal of Biological Chemistry 288(27); 2013. 19698-714.
- Gonçalo Martins, Javier Fernández-Lodeiro, Jamila Djafari, Carlos Lodeiro, J.L. Capelo, Hugo M. Santos (2019): Label-free protein quantification after ultrafast digestion of complex proteomes using ultrasonic energy and immobilized-trypsin magnetic nanoparticles. Talanta, Volume 196, 2019. 262-270.
વારંવાર પૂછાતા પ્રશ્નો
પ્રોટીનના દ્રાવ્યીકરણ માટે અલ્ટ્રાસોનિક બાથ શા માટે યોગ્ય નથી?
અલ્ટ્રાસોનિક બાથમાં, સોનિકેશનના કાર્યસિદ્ધાંતરૂપ કેવિટેશન ખૂબ જ અસમાન રીતે થાય છે, જેના કારણે નમૂનાઓને જુદી જુદી સોનિકેશન સારવાર મળે છે. અલ્ટ્રાસોનિક બાથમાં નમૂનાની નળીઓની સ્થિતિના આધારે, દરેક નમૂના પર જુદી જુદી તીવ્રતાની અસર થાય છે. પ્રોટીઓમિક્સ તુલનાક્ષમતા પર આધાર રાખે છે. જો એક પેલેટ અધૂરી રીતે ઓગળે અને બીજું સંપૂર્ણપણે પુનઃનિલંબિત થાય, તો પરિણામી ડેટા વાસ્તવિક જૈવિક સ્થિતિને બદલે તૈયારીથી ઉદ્ભવેલો પક્ષપાત દર્શાવી શકે છે. અલ્ટ્રાસોનિક બાથની સરખામણીમાં, VialTweeter અથવા Microplate Sonicator UIP400MTP જેવા સંપર્કરહિત સોનિકેટરો અનેક નમૂનાઓને સમાન અલ્ટ્રાસોનિક પરિસ્થિતિઓમાં સમાંતર પ્રક્રિયા કરવાની સુવિધા આપીને વધુ પ્રમાણિત રીતે સંભાળવામાં મદદ કરે છે, જે પ્રયોગોમાં પુનરુત્પાદકતા સુધારવામાં મદદ કરી શકે છે. બાયોમાર્કર અભ્યાસો, તુલનાત્મક પ્રોટીઓમિક્સ અને અનેક જૈવિક અથવા તકનીકી પુનરાવર્તિત નમૂનાઓ ધરાવતી કાર્યપ્રણાલીઓમાં આ ખાસ ઉપયોગી છે.
પ્રોટીઓમિક્સમાં સૌથી સામાન્ય પરીક્ષણો કયાં છે?
પ્રોટીઓમિક્સમાં સૌથી સામાન્ય પરીક્ષણોમાં નમૂનાની તૈયારી અને વિશ્લેષણ દરમિયાન વપરાતાં પ્રોટીનના જથ્થાત્મક નિર્ધારણનાં પરીક્ષણો અને પ્રોટીનનાં લક્ષણો નક્કી કરવાની પદ્ધતિઓનો સમાવેશ થાય છે. વારંવાર વપરાતાં પરીક્ષણોમાં પ્રોટીનની સાંદ્રતા માપવા માટે બ્રેડફોર્ડ પરીક્ષણ, BCA પરીક્ષણ, લોરી પરીક્ષણ અને 280 nm પર UV શોષકતાનો સમાવેશ થાય છે. પ્રોટીઓમિક્સની વ્યાપક કાર્યપ્રણાલીઓમાં, પ્રોટીનની વિપુલતા, શુદ્ધતા, આણ્વિક વજન અને ઓળખનું મૂલ્યાંકન કરવા માટે SDS-PAGE, વેસ્ટર્ન બ્લોટિંગ, ELISA, જેલમાં પાચન અને માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી આધારિત વિશ્લેષણોનો પણ વ્યાપક ઉપયોગ થાય છે.
કૂમાસી બ્રિલિયન્ટ બ્લૂ શું છે?
કૂમાસી બ્રિલિયન્ટ બ્લૂ એક ટ્રાઇફેનાઇલમિથેન રંગક છે, જેનો પ્રોટીન વિજ્ઞાનમાં જેલમાં પ્રોટીનને રંગવા અને વર્ણમિતીય રીતે પ્રોટીનનું જથ્થાત્મક નિર્ધારણ કરવા માટે વ્યાપક ઉપયોગ થાય છે. તે મુખ્યત્વે ક્ષારીય અને એરોમેટિક એમિનો ઍસિડ અવશેષો સાથે, ખાસ કરીને આર્જિનિન સાથે, બંધાય છે અને પ્રોટીન સાથે બંધાતાં તેના વર્ણપટમાં સ્થાનાંતર થાય છે. આ ગુણધર્મ તેને ઇલેક્ટ્રોફોરેસિસ પછી પ્રોટીનને દૃશ્યમાન બનાવવા અને બ્રેડફોર્ડ પ્રોટીન પરીક્ષણ માટે ઉપયોગી બનાવે છે.
બ્રેડફોર્ડ પરીક્ષણ કેવી રીતે કાર્ય કરે છે?
બ્રેડફોર્ડ પરીક્ષણમાં અમ્લીય પરિસ્થિતિઓમાં પ્રોટીનના નમૂનાને કૂમાસી બ્રિલિયન્ટ બ્લૂ રંગક સાથે મિશ્રિત કરવામાં આવે છે. જ્યારે રંગક પ્રોટીન સાથે બંધાય છે, ત્યારે તેની મહત્તમ શોષકતાની તરંગલંબાઈ આશરે 465 nm પરથી 595 nm પર ખસે છે, જેના કારણે લાલાશ પડતા કથ્થાઈમાંથી વાદળી રંગમાં માપી શકાય એવો ફેરફાર થાય છે. 595 nm પર શોષકતામાં થતો વધારો એક નિર્ધારિત પરાસમાં પ્રોટીનની સાંદ્રતાના સમપ્રમાણમાં હોય છે, જે સામાન્ય રીતે બોવાઇન સીરમ આલ્બ્યુમિન વડે તૈયાર કરાયેલા પ્રમાણભૂત વક્ર સાથે સરખામણી કરીને જથ્થાત્મક નિર્ધારણ કરવાની સુવિધા આપે છે.
Hielscher Ultrasonics ઉચ્ચ કાર્યક્ષમતાવાળા અલ્ટ્રાસોનિક હોમોજેનાઇઝરો પ્રયોગશાળાના કદ થી ઔદ્યોગિક કદ સુધીના કદમાં બનાવે છે.

