નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વન્સિંગ (એનજીએસ) ને જીનોમિક ડીએનએ સેરને ક્રમ આપવા અને જીનોમ લાઇબ્રેરીઓ બનાવવા માટે જીનોમિક ડીએનએના વિશ્વસનીય શીયરિંગ અને ફ્રેગમેન્ટેશનની જરૂર છે. ડીએનએના ડીએનએના ટુકડાઓમાં નિયંત્રિત વિભાજન એ ડીએનએનો ક્રમ થાય તે પહેલાં આવશ્યક નમૂના તૈયારીનું પગલું છે. અલ્ટ્રાસોનિકેશન ચોક્કસ લંબાઈના ડીએનએ ફ્રેગમેન્ટેશન માટે કાર્યક્ષમ અને વિશ્વસનીય તકનીક તરીકે સાબિત થયું છે. અલ્ટ્રાસોનિક ડીએનએ ફ્રેગમેન્ટેશન પ્રોટોકોલ પ્રજનનક્ષમ ફ્રેગમેન્ટેશન પરિણામો પ્રાપ્ત કરે છે. Hielscher ultrasonicators જીનોમિક ડીએનએ ફ્રેગમેન્ટ સાઇઝ વિતરણની વિશાળ શ્રેણીનું ઉત્પાદન કરવા સક્ષમ છે, જે ઓપરેટિંગ પરિમાણો દ્વારા ચોક્કસપણે નિયંત્રિત કરી શકાય છે. Hielscher અલ્ટ્રાસોનિક DNA શીયરિંગ સિસ્ટમ્સ સિંગલ અને બહુવિધ શીશીઓ તેમજ માઇક્રોપ્લેટ્સ માટે ઉપલબ્ધ હોવાથી, નમૂનાની તૈયારી અત્યંત કાર્યક્ષમ બને છે.

નેક્સ્ટ-જનરલ સિક્વન્સિંગ: લાઇબ્રેરી તૈયારી માટે અલ્ટ્રાસોનિક ડીએનએ ફ્રેગમેન્ટેશન

નેક્સ્ટ-જનરેશન સિક્વન્સીંગ હાથ ધરવા માટે, (1) લાઇબ્રેરી તૈયારી, (2) સિક્વન્સિંગ, અને (3) ડેટા વિશ્લેષણના ત્રણ મૂળભૂત પગલા લેવા જરૂરી છે. લાઇબ્રેરીની તૈયારી દરમિયાન, ડીએનએને ટુકડા કરવામાં આવે છે, પછી એક એડેનાઇન બેઝ ઉમેરીને ટુકડાઓના અંતને સમારકામ (પોલિશ્ડ) કરવામાં આવે છે અને લક્ષ્યના ટુકડાઓ ડબલ-સ્ટ્રેન્ડ ડીએનએમાં રૂપાંતરિત થાય છે. છેલ્લે કહેવાતા એડેપ્ટરોને લિગેશન, પીસીઆર અથવા ટેગમેન્ટેશન દ્વારા જોડવામાં આવે છે જેથી અંતિમ લાઇબ્રેરી ડીએનએ પ્રોડક્ટને સિક્વન્સિંગ માટે પ્રમાણિત કરી શકાય.
Sonication નો ઉપયોગ કરીને DNA ફ્રેગમેન્ટેશન: ખાસ કરીને જ્યારે ઇલુમિના જેવી ટૂંકી વાંચી સિક્વન્સીંગ ટેકનોલોજી, જે લાંબા સમય સુધી ડીએનએના ટુકડાઓ સહેલાઇથી વાંચી શકતી નથી, ત્યારે ડીએનએ સ્ટેન્ડ ચોક્કસ કદમાં વિભાજીત હોવા જોઈએ જે અલ્ટ્રાસોનિકેશન દ્વારા વિશ્વસનીય રીતે મેળવી શકાય છે.
ડીએનએ, આરએનએ અને ક્રોમેટિન ફ્રેગમેન્ટેશન માટે અલ્ટ્રાસોનિકેશનનો વિશ્વસનીય ઉપયોગ કરી શકાય છે.

અલ્ટ્રાસોનિક ડીએનએ ફ્રેગમેન્ટેશન કેવી રીતે કામ કરે છે?

સોનિકેશન, જેને એકોસ્ટિક સેમ્પલ પ્રોસેસિંગ તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે, ડીએનએના ટુકડા કરવા માટે વ્યાપકપણે ઉપયોગમાં લેવાતી પદ્ધતિ છે. અલ્ટ્રાસોનિક ડીએનએ શીયરિંગ માટે, નમૂનાઓ નિયંત્રિત સ્થિતિ હેઠળ અલ્ટ્રાસોનિક તરંગોના સંપર્કમાં આવે છે. અલ્ટ્રાસોનિક ડીએનએ ફ્રેગમેન્ટેશનનું કાર્ય સિદ્ધાંત અલ્ટ્રાસાઉન્ડ તરંગો દ્વારા પેદા થતા સ્પંદનો અને પોલાણ પર આધારિત છે. અલ્ટ્રાસોનિક (એકોસ્ટિક) પોલાણના પરિણામે arંચા પરમાણુ વજન ડીએનએ અણુઓને તોડી નાખે છે. તીવ્રતા (કંપનવિસ્તાર, અવધિ), પલ્સેશન મોડ અને તાપમાન જેવા સોનિકેશનનું સેટિંગ ચોક્કસ ડીએનએ ટુકડાઓની ચોક્કસ લંબાઈ સુધી ડીએનએ ફ્રેગમેન્ટેશન માટે પરવાનગી આપે છે. જ્યારે અલ્ટ્રાસોનિકેશનનો ઉપયોગ કરીને ડીએનએ ઘણીવાર 100 થી 600 બીપી સુધી ઘટાડવામાં આવે છે, જ્યારે હળવી અલ્ટ્રાસોનિક શરતો લાગુ કરવામાં આવે છે ત્યારે 1300 બીપી સુધીના લાંબા ડીએનએ ટુકડાઓ મેળવી શકાય છે.

ડીએનએ અધોગતિ અટકાવવા તાપમાન નિયંત્રણ

ડીએનએનો ડબલ-સ્ટ્રેન્ડેડ મોલેક્યુલર આકાર એલિવેટેડ તાપમાન માટે અત્યંત સંવેદનશીલ હોય છે જેથી વિશ્વસનીય વિશ્લેષણ પરિણામો માટે નમૂના તૈયાર કરવાના પગલાં દરમિયાન તાપમાન પર ચોક્કસ નિયંત્રણ મહત્વનું પરિબળ છે.
તમે Hielscher ની ચકાસણી અલ્ટ્રાસોનેટર્સ, VialTweeter અથવા UIP400MTP નો ઉપયોગ કરી રહ્યા છો – પ્લગેબલ તાપમાન સેન્સર અને સ્માર્ટ ડિવાઇસ સોફ્ટવેરને કારણે સતત તાપમાન મોનિટરિંગ અને નિયંત્રણ સુનિશ્ચિત થયેલ છે. ચોક્કસ શ્રેણીમાં તાપમાન જાળવવા માટે, તમે ઉપલા અને નીચલા તાપમાનની મર્યાદા સેટ કરી શકો છો. પરિણામે, અલ્ટ્રાસોનેટર આ તાપમાનની મર્યાદા ઓળંગી જાય કે તરત જ થોભશે અને જ્યારે તાપમાન setT દ્વારા ઘટાડવામાં આવે ત્યારે આપમેળે સોનિકેટ કરવાનું ચાલુ રાખશે.
Hielscher અલ્ટ્રાસોનિકેટર્સનું અત્યાધુનિક સોફ્ટવેર આદર્શ નમૂના સારવાર શરતોની વિશ્વસનીય જાળવણીની ખાતરી કરે છે.

UIP400MTP મલ્ટી-વેલ પ્લેટ અલ્ટ્રાસોનેટર સાથે માસ સેમ્પલ DNA ફ્રેગમેન્ટેશન

છેલ્લા દાયકામાં જીવન વિજ્ inાનમાં નમૂનાની સંખ્યામાં નોંધપાત્ર વધારો થયો છે. આનો અર્થ થાય છે કે તુલનાત્મક અને માન્ય પરિણામો મેળવવા માટે સતત સમાન શરતો હેઠળ નમૂનાની તૈયારી અને વિશ્લેષણ દરમિયાન નમૂનાઓની ખૂબ numbersંચી સંખ્યા (દા.ત., 384, 1536 અથવા 3456 કુવાઓ) પર પ્રક્રિયા કરવી આવશ્યક છે. UIP400MTP સાથે, Hielscher Ultrasonics સામૂહિક નમૂના પ્રક્રિયાના વલણને અનુસરી રહ્યું છે. UIP400MTP માઇક્રોપ્લેટ્સનો ઉપયોગ કરીને નમૂનાની તૈયારી માટે અલ્ટ્રાસોનેટર છે. UIP400MTP 6, 12, 24, 48, 96, 384, 1536 અથવા 3456 કુવાઓ સાથે પ્લેટો પર પ્રક્રિયા કરી શકે છે. માઇક્રોપ્લેટ પ્રકાર પર આધાર રાખીને, દરેક કૂવો સામાન્ય રીતે દસ નેનોલીટર્સથી કેટલાક મિલિલીટર વચ્ચે નમૂનાના જથ્થાને પકડી શકે છે. જીવન વિજ્ scienceાન સંશોધનમાં વ્યાપકપણે ઉપયોગમાં લેવાતા, UIP400MTP નો ઉપયોગ સામાન્ય રીતે ELISA (એન્ઝાઇમ-લિન્ક્ડ ઇમ્યુનોસોર્બન્ટ એસે) અથવા PCR, પ્રોટીન એનાલિટિક્સ પહેલા, તેમજ CHiP અને CHiP-seq, હિસ્ટોન ફેરફાર પહેલાં ક્રોમેટિન તૈયારી માટે નમૂના તૈયાર કરવા માટે થાય છે. ઓળખ, અને અન્ય વિશ્લેષણાત્મક સારવાર (દા.ત., જેલ ઇલેક્ટ્રોફોરેસીસ, માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી).

10 શીશીઓ સુધી નમૂનાની તૈયારી માટેનું VialTweeter

VialTweeter એક વ્યાપકપણે ઉપયોગમાં લેબ અલ્ટ્રાસોનિકેટર VialTweeter છે જે એક સાથે 10 શીશીઓ સુધી અસરકારક અને આરામદાયક sonication માટે પરવાનગી આપે છે. શીશીઓ અને પરીક્ષણ નળીઓ (દા.ત., એપેન્ડોર્ફ શીશીઓ, ક્રાયો શીશીઓ, સેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ) પરોક્ષ રીતે સોનેટેડ હોવાથી, કોઈપણ ક્રોસ-દૂષણ ટાળવામાં આવે છે. દરેક નમૂનામાં સમાન અલ્ટ્રાસાઉન્ડ તીવ્રતા પહોંચાડવામાં આવે છે, બધા sonication પરિણામો એકરૂપ અને પ્રજનનક્ષમ છે. VialTweeter અમારા અન્ય ડિજિટલ ઉપકરણો (દા.ત., સ્માર્ટ મેનૂ, પ્રોગ્રામેબલ સેટિંગ્સ, ટેમ્પરેચર કંટ્રોલ, રિમોટ કંટ્રોલ વગેરે) જેવી તમામ સ્માર્ટ સુવિધાઓ આપે છે જેથી ઉચ્ચતમ વપરાશકર્તા-આરામ સુનિશ્ચિત થાય.

માઇક્રોવેલ પ્લેટ્સ માટે મલ્ટી-ફિંગર પ્રોબ્સ

અલ્ટ્રાસોનિક ચકાસણી હોમોજેનાઇઝર્સ UP200Ht અને UP200St માટે ઉપલબ્ધ, 4 અથવા 8 આંગળીઓવાળી મલ્ટી-ફિંગર ચકાસણીઓ એક જ સમયે એક જ સમયે અનેક નમૂનાને સોનિકેટ કરવા માટે આરામદાયક વિકલ્પ છે. દાખલા તરીકે, સોનોટ્રોડ એમટીપી-24-8-96 એ આઠ આંગળીની ચકાસણી છે, જે સ્વચાલિત સિસ્ટમોમાં એકીકરણ માટે અથવા મલ્ટી-વેલ પ્લેટોના કુવાઓના કાર્યક્ષમ મેન્યુઅલ નમૂના તૈયાર કરવા માટે આદર્શ છે. મલ્ટી-ફિંગર સોનોટ્રોડ પ્રયોગશાળાઓ માટે સ્વચાલિત માટે આદર્શ છે, જ્યાં મોટેભાગે બીકર અને ટેસ્ટ ટ્યુબ પ્રમાણભૂત અવાજ સોનોટ્રોડનો ઉપયોગ કરીને પ્રક્રિયા કરવામાં આવે છે. મલ્ટી-ફિંગર અને સ્ટાન્ડર્ડ પ્રોબ્સ સિંગલ-પ્રોબ અલ્ટ્રાસોનિકેટરને મલ્ટિ-પ્રોબ અલ્ટ્રાસોનિક ડિસપ્ટરમાં પરિવર્તિત કરીને થોડીવારમાં ઝડપથી આંતર-બદલી શકાય છે.

ડીએનએ ફ્રેગમેન્ટેશન માટે Hielscher Ultrasonicators

Hielscher Ultrasonics DNA, RNA અને chromatin ફ્રેગમેન્ટેશન માટે વિવિધ અલ્ટ્રાસાઉન્ડ આધારિત પ્લેટફોર્મ આપે છે. આ વિવિધ પ્લેટફોર્મમાં અલ્ટ્રાસોનિક ચકાસણીઓ (સોનોટ્રોડ્સ), બહુવિધ ટ્યુબ અથવા મલ્ટી-વેલ પ્લેટ્સ (દા.ત., 96-વેલ પ્લેટ્સ, માઇક્રોટિટર પ્લેટ્સ), સોનોરેક્ટર્સ અને અલ્ટ્રાસોનિક ક્યુફોર્ન્સના એક સાથે નમૂના તૈયાર કરવા માટે પરોક્ષ સોનિકેશન સોલ્યુશન્સનો સમાવેશ થાય છે. ડીએનએ શિયરિંગ માટેના તમામ પ્લેટફોર્મ્સ ફ્રીક્વન્સી-ટ્યુન, ઉચ્ચ-પ્રદર્શન અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોસેસર્સ દ્વારા સંચાલિત છે, જે ચોક્કસપણે નિયંત્રિત છે અને પુનroઉત્પાદનક્ષમ પરિણામો આપે છે.

કોઈપણ નમૂના નંબર અને કદ માટે અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોસેસર્સ

Hielscher ના મલ્ટિ-સેમ્પલ અલ્ટ્રાસોનિકેટર્સ VialTweeter (10 ટેસ્ટ ટ્યુબ સુધી) અને UIP400MTP (માઇક્રોપ્લેટ્સ/ મલ્ટીવેલ પ્લેટ્સ માટે) સાથે ઇચ્છિત ડીએનએ ફ્રેગમેન્ટ સાઇઝ ડિસ્ટ્રિબ્યુશન અને ઉપજ પ્રાપ્ત કરતી વખતે તીવ્ર અને ચોક્કસપણે નિયંત્રિત અલ્ટ્રાસોનિકેશનને કારણે નમૂના પ્રોસેસિંગ સમય ઘટાડવાનું સરળતાથી શક્ય બને છે. . અલ્ટ્રાસોનિક ડીએનએ ફ્રેગમેન્ટેશન નમૂનાની તૈયારીને કાર્યક્ષમ, વિશ્વસનીય અને સ્કેલેબલ બનાવે છે. સતત નિયંત્રિત અલ્ટ્રાસાઉન્ડનો ઉપયોગ કરીને પ્રોટોકોલને રેખીય રીતે એકથી અસંખ્ય નમૂનાઓ સુધી સ્કેલ કરી શકાય છે.
નાના નમૂના નંબરો તૈયાર કરવા માટે એકથી પાંચ આંગળીઓવાળા ચકાસણી અલ્ટ્રાસોનિકેટર્સ આદર્શ છે. Hielscher ની લેબોરેટરી અલ્ટ્રાસોનિકેટર વિવિધ કદમાં ઉપલબ્ધ છે જેથી અમે તમને તમારી અરજી અને જરૂરિયાતો માટે આદર્શ ઉપકરણની ભલામણ કરી શકીએ.

ચોક્કસ પ્રક્રિયા નિયંત્રણ

ચોક્કસ નિયંત્રિત sonication સેટિંગ્સ નિર્ણાયક છે કારણ કે સંપૂર્ણ sonification DNA, RNA અને chromatin નો નાશ કરી શકે છે, પરંતુ અપર્યાપ્ત અલ્ટ્રાસોનિક શીયરિંગના પરિણામો ખૂબ લાંબા DNA અને chromatin ટુકડાઓમાં પરિણમે છે. Hielscher માતાનો ડિજિટલ ultrasonicators સરળતાથી ચોક્કસ sonication પરિમાણ માટે સુયોજિત કરી શકાય છે. ચોક્કસ સોનિકેશન સેટિંગ્સને સમાન પ્રક્રિયાના ઝડપી પુનરાવર્તન માટે પ્રોગ્રામ કરેલ સેટિંગ તરીકે પણ સાચવી શકાય છે.
તમામ sonication આપમેળે પ્રોટોકોલ્ડ અને બિલ્ટ-ઇન SD-card પર CSV ફાઇલ તરીકે સંગ્રહિત થાય છે. આ પરફોર્મ કરેલા ટ્રાયલ્સના સચોટ દસ્તાવેજીકરણ માટે પરવાનગી આપે છે અને સોનિકેશન રનને સરળતાથી રિવાઇઝ કરવાનું શક્ય બનાવે છે.
બ્રાઉઝર રિમોટ કંટ્રોલ દ્વારા, બધા ડિજિટલ અલ્ટ્રાસોનિકેટર્સ કોઈપણ સ્ટાન્ડર્ડ બ્રાઉઝર દ્વારા સંચાલિત અને મોનિટર કરી શકાય છે. વધારાના સ softwareફ્ટવેરની સ્થાપના જરૂરી નથી, કારણ કે લેન કનેક્શન ખૂબ જ સરળ પ્લગ-એન-પ્લે સેટઅપને મંજૂરી આપે છે.

અલ્ટ્રાસોનિક નમૂનાની તૈયારીમાં સૌથી વધુ વપરાશકર્તા-મિત્રતા

બધા Hielscher ultrasonicators ઉચ્ચ પ્રદર્શન અલ્ટ્રાસાઉન્ડ પહોંચાડવા માટે રચાયેલ છે, જ્યારે તે જ સમયે હંમેશા ખૂબ જ વપરાશકર્તા મૈત્રીપૂર્ણ અને કામ કરવા માટે સરળ છે. તમામ સેટિંગ્સ સ્પષ્ટ મેનુમાં સારી રીતે રચાયેલ છે, જે રંગીન ટચ-ડિસ્પ્લે અથવા બ્રાઉઝર રિમોટ કંટ્રોલ દ્વારા સરળતાથી edક્સેસ કરી શકાય છે. પ્રોગ્રામેબલ સેટિંગ્સ અને ઓટોમેટિક ડેટા રેકોર્ડિંગ સાથેનું સ્માર્ટ સોફ્ટવેર વિશ્વસનીય અને પ્રજનનક્ષમ પરિણામો માટે શ્રેષ્ઠ સોનિકેશન સેટિંગ્સની ખાતરી કરે છે. સ્વચ્છ અને ઉપયોગમાં સરળ મેનુ ઇન્ટરફેસ Hielscher ultrasonicators ને વપરાશકર્તા મૈત્રીપૂર્ણ અને કાર્યક્ષમ ઉપકરણોમાં ફેરવે છે.
નીચે આપેલ કોષ્ટક તમને અમારી લેબ અલ્ટ્રાસોનિકેટર્સની અંદાજિત પ્રોસેસિંગ ક્ષમતાનો સંકેત આપે છે, જે DNA અને RNA ફ્રેગમેન્ટેશન, સેલ લિસીસ તેમજ પ્રોટીન નિષ્કર્ષણ જેવા નમૂના તૈયારી કાર્યો માટે આદર્શ છે: