Hielscher Ultrasonics
તમારી પ્રક્રિયા વિશે ચર્ચા કરતાં અમને આનંદ થશે.
અમને કૉલ કરો: +49 3328 437-420
અમને ઈમેલ મોકલો: [email protected]

નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વેન્સિંગ માટે અલ્ટ્રાસોનિક DNA ખંડન

નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વેન્સિંગ (NGS) માં જિનોમિક DNA ની સેરોનું અનુક્રમણ કરવા અને જિનોમ લાઇબ્રેરીઓ બનાવવા માટે જિનોમિક DNA નું વિશ્વસનીય કર્તન અને ખંડન જરૂરી છે. DNA નું DNA ખંડોમાં નિયંત્રિત ખંડન એ DNA નું અનુક્રમણ કરતાં પહેલાં જરૂરી નમૂના તૈયારીનું એક આવશ્યક પગલું છે. નિર્ધારિત લંબાઈના DNA ખંડો બનાવવા માટે અલ્ટ્રાસોનિકેશન એક કાર્યક્ષમ અને વિશ્વસનીય તકનીક તરીકે પુરવાર થયું છે. અલ્ટ્રાસોનિક DNA ખંડનના પ્રોટોકોલ પુનરુત્પાદનક્ષમ ખંડન પરિણામો આપે છે. Hielscher અલ્ટ્રાસોનિકેટરો જિનોમિક DNA ખંડોના કદનાં વિતરણોની વિશાળ શ્રેણી ઉત્પન્ન કરવામાં સક્ષમ છે, જેને સંચાલન પરિમાણો દ્વારા ચોકસાઈથી નિયંત્રિત કરી શકાય છે. Hielscher ની અલ્ટ્રાસોનિક DNA કર્તન પ્રણાલીઓ એકલ અને બહુવિધ વાયલો તેમજ માઇક્રોપ્લેટો માટે ઉપલબ્ધ હોવાથી, નમૂના તૈયારી અત્યંત કાર્યક્ષમ બને છે.

માહિતીની વિનંતી



મોટી સંખ્યામાં નમૂનાઓની તૈયારી માટે UIP400MTP Plate Sonicator: UIP400MTP મલ્ટિ-વેલ પ્લેટો, માઇક્રોટાઇટર પ્લેટો અને 96-વેલ પ્લેટોમાં નમૂનાઓનું એકસરખું સોનિકેશન કરીને કોષોનું વિઘટન કરે છે, પ્રોટીનનું નિષ્કર્ષણ કરે છે તથા DNA, RNA અને આલ્ફા-સિન્યુક્લિન તંતુઓનું ખંડીકરણ કરે છે.

UIP400MTP પ્લેટ સોનિકેટર ઉચ્ચ નમૂના પ્રસંસ્કરણ ક્ષમતાવાળી નમૂના તૈયારી માટે મલ્ટિ-વેલ, માઇક્રોટાઇટર પ્લેટો અને 96-વેલ પ્લેટોમાંના નમૂનાઓનું સમાનરૂપે સોનિકેશન કરે છે

અલ્ટ્રાસોનિક DNA ખંડનના ફાયદા

  • પુનરાવર્તનક્ષમ / પુનરુત્પાદનક્ષમ પરિણામો
  • નિર્ધારિત ખંડ લંબાઈ મેળવવા માટે ચોકસાઈથી સમાયોજિત કરી શકાય તેવું
  • ઝડપી પ્રસંસ્કરણ
  • સાતત્યપૂર્ણ DNA ખંડન પરિણામો
  • કોઈપણ નમૂના આયતન માટે ઉપકરણો (દા.ત., બહુવિધ વાયલો અથવા માઇક્રોપ્લેટો)
  • ઉચ્ચ નમૂના પ્રસંસ્કરણ ક્ષમતા
  • ચોક્કસ તાપમાન નિયંત્રણ
  • સરળ, વપરાશકર્તાને અનુકૂળ સંચાલન

નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વેન્સિંગ: લાઇબ્રેરી તૈયારી માટે અલ્ટ્રાસોનિક DNA ખંડન

નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વેન્સિંગ કરવા માટે (1) લાઇબ્રેરી તૈયારી, (2) અનુક્રમણ અને (3) ડેટા વિશ્લેષણ એ ત્રણ મૂળભૂત પગલાં હાથ ધરવાં આવશ્યક છે. લાઇબ્રેરી તૈયારી દરમિયાન DNAનું ખંડન કરવામાં આવે છે, ત્યારબાદ એક એડેનિન બેઝ ઉમેરીને ખંડોના છેડાઓનું સમારકામ (પોલિશિંગ) કરવામાં આવે છે અને લક્ષિત ખંડોને દ્વિસેરી DNAમાં રૂપાંતરિત કરવામાં આવે છે. અંતે, લિગેશન, PCR અથવા ટેગમેન્ટેશન દ્વારા કહેવાતા એડેપ્ટરો જોડવામાં આવે છે, જેથી અનુક્રમણ માટે અંતિમ લાઇબ્રેરી DNA ઉત્પાદનનું જથ્થાત્મક માપન કરી શકાય.
સોનિકેશનનો ઉપયોગ કરીને DNA ખંડન: ખાસ કરીને Illumina જેવી ટૂંકા રીડવાળી અનુક્રમણ તકનીકોનો ઉપયોગ કરવામાં આવે ત્યારે, જે લાંબા DNA ખંડોને સહેલાઈથી વાંચી શકતી નથી, DNA સેરોનું નિર્ધારિત કદના ખંડોમાં ખંડન કરવું આવશ્યક છે, જે અલ્ટ્રાસોનિકેશન દ્વારા વિશ્વસનીય રીતે કરી શકાય છે.
DNA, RNA અને ક્રોમેટિનના ખંડન માટે અલ્ટ્રાસોનિકેશનનો વિશ્વસનીય રીતે ઉપયોગ કરી શકાય છે.

નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વેન્સિંગ – લાઇબ્રેરી તૈયારી

નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વેન્સિંગ (NGS) પ્લેટફોર્મો માટે DNA અનુક્રમણ લાઇબ્રેરીઓની તૈયારીમાં અલ્ટ્રાસોનિક DNA ખંડનનો સામાન્ય રીતે ઉપયોગ થાય છે. આ તકનીકનો ઉપયોગ DNA અણુઓને ઇચ્છિત કદની શ્રેણીના નાના ખંડોમાં તોડવા માટે થાય છે, જે લાઇબ્રેરી તૈયારીનાં અનુગામી પગલાંને સરળ બનાવે છે. NGS કાર્યપ્રવાહોમાં લાઇબ્રેરી તૈયારીના પગલા દરમિયાન જિનોમિક DNAને અનુગામી પ્રસંસ્કરણ અને અનુક્રમણ માટે યોગ્ય નાના ટુકડાઓમાં ખંડિત કરવા માટે સામાન્ય રીતે અલ્ટ્રાસોનિક DNA ખંડન જરૂરી હોય છે. ઉપયોગમાં લેવાતા ચોક્કસ અનુક્રમણ પ્લેટફોર્મ માટે યોગ્ય કદની શ્રેણીના DNA ખંડો ઉત્પન્ન કરીને તે અનુક્રમણ પ્રયોગની સફળતા સુનિશ્ચિત કરવામાં નિર્ણાયક ભૂમિકા ભજવે છે.

નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વન્સિંગ (NGS)માં નમૂના તૈયારીના એક પગલા તરીકે અલ્ટ્રાસોનિક DNA ખંડનનો વારંવાર ઉપયોગ થાય છે.

0 – 15 min અલ્ટ્રાસોનિકેશનને આધીન કરાયેલા E. coli EDL933ના જિનોમિક DNAનું ઇલેક્ટ્રોફોરેટિક વિશ્લેષણ. L એ DNA લેડર દર્શાવે છે. (Basselet et al. 2008)

નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વેન્સિંગ – પ્રક્રિયાનાં પગલાં:

  • અલ્ટ્રાસોનિક DNA ખંડન: લાઇબ્રેરીના નિર્માણ પહેલાં જિનોમિક DNAનું નાના, વધુ સહેલાઈથી સંભાળી શકાય તેવા ટુકડાઓમાં ખંડન કરવામાં આવે છે. અલ્ટ્રાસોનિક ખંડનમાં ઉચ્ચ આવૃત્તિનાં ધ્વનિ તરંગોનો ઉપયોગ કરીને DNA અણુઓનું કર્તન કરી તેમને ઇચ્છિત કદની શ્રેણીના ખંડોમાં વિભાજિત કરવામાં આવે છે. આ પગલું નિર્ણાયક છે, કારણ કે તે પછીથી ઉત્પન્ન થતા અનુક્રમણ રીડ્સ ઉપયોગમાં લેવાતા અનુક્રમણ પ્લેટફોર્મ માટે યોગ્ય લંબાઈના હોય તે સુનિશ્ચિત કરવામાં મદદ કરે છે. અનુક્રમણ પ્રયોગની ચોક્કસ જરૂરિયાતોને આધારે ખંડોના કદની શ્રેણી સમાયોજિત કરી શકાય છે.
  • PCR દ્વારા ક્લોનલ પ્રવર્ધન: અલ્ટ્રાસોનિક વિખંડન પછી, અંતિમ DNA અનુક્રમણ લાઇબ્રેરીઓ બનાવવા માટે DNA ખંડોના છેડાઓનું સમારકામ, ઍડેપ્ટર લિગેશન અને PCR પ્રવર્ધન કરવામાં આવે છે. આ પગલાંમાં અનુક્રમણ પ્લેટફોર્મ સાથે જોડાવા માટે જરૂરી ઍડેપ્ટર અનુક્રમો ઉમેરવામાં આવે છે અને PCR પ્રવર્ધન માટે પ્રાઇમિંગ સ્થાનો પૂરાં પાડવામાં આવે છે, જેના દ્વારા વિખંડિત DNA અણુઓને અનુક્રમણ પ્રક્રિયા માટે તૈયાર કરવામાં આવે છે.
  • સંશ્લેષણ દ્વારા DNA અનુક્રમણ: અનુક્રમણ લાઇબ્રેરીઓ તૈયાર થઈ જાય પછી, સંશ્લેષણ દ્વારા DNA અનુક્રમણ (SBS) પ્રક્રિયા શરૂ થાય છે. SBS દરમિયાન, પૂરક શૃંખલામાં ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ ક્રમશઃ ઉમેરીને DNA અનુક્રમ નક્કી કરવામાં આવે છે. આ પગલામાં ન્યુક્લિયોટાઇડ સમાવી લેવાની, પ્રતિબિંબન કરવાની અને વિચ્છેદનની ચક્રીય પ્રતિક્રિયાઓનો સમાવેશ થાય છે, જેનાથી સમાવિષ્ટ ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ દ્વારા ઉત્સર્જિત પ્રતિદીપ્ત સંકેતોના આધારે DNA અનુક્રમ નક્કી કરી શકાય છે.
  • વિશાળ પાયે સમાંતર અનુક્રમણ: અંતિમ પગલામાં, અવકાશીય રીતે અલગ કરાયેલા, પ્રવર્ધિત DNA ટેમ્પ્લેટ્સનું એકસાથે વિશાળ પાયે સમાંતર રીતે અનુક્રમણ કરવામાં આવે છે. ઉચ્ચ નમૂના પ્રક્રિયા ક્ષમતા ધરાવતો આ અનુક્રમણ અભિગમ અનુક્રમણના એક જ રનમાં લાખોથી અબજો અનુક્રમણ રીડ્સ ઉત્પન્ન કરવાનું શક્ય બનાવે છે, જેનાથી DNA અનુક્રમો કાર્યક્ષમ રીતે અને ઝડપથી નક્કી કરી શકાય છે.

અલ્ટ્રાસોનિક DNA વિખંડન કેવી રીતે કાર્ય કરે છે?

સોનિકેશન, જેને ધ્વનિક નમૂના પ્રક્રિયા તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે, તે DNAનું વિખંડન કરવા માટે વ્યાપકપણે ઉપયોગમાં લેવાતી પદ્ધતિ છે. અલ્ટ્રાસોનિક DNA કર્તન માટે, નમૂનાઓને નિયંત્રિત પરિસ્થિતિમાં અલ્ટ્રાસોનિક તરંગોના સંપર્કમાં લાવવામાં આવે છે. અલ્ટ્રાસોનિક DNA વિખંડનનો કાર્યસિદ્ધાંત અલ્ટ્રાસાઉન્ડ તરંગો દ્વારા ઉત્પન્ન થતા કંપનો અને કેવિટેશન પર આધારિત છે. અલ્ટ્રાસોનિક (ધ્વનિક) કેવિટેશનથી ઉદ્ભવતાં કર્તન બળો ઉચ્ચ અણુભાર ધરાવતા DNA અણુઓને તોડે છે. તીવ્રતા (કંપવિસ્તાર, સમયગાળો), સ્પંદન મોડ અને તાપમાન જેવી સોનિકેશન સેટિંગ્સ DNAનું ચોક્કસ વિખંડન કરીને ઇચ્છિત નિશ્ચિત લંબાઈના DNA ખંડો મેળવવાનું શક્ય બનાવે છે. અલ્ટ્રાસોનિકેશનનો ઉપયોગ કરીને DNAને ઘણીવાર 100 થી 600 bp સુધીના ખંડોમાં ઘટાડવામાં આવે છે, જ્યારે વધુ હળવી અલ્ટ્રાસોનિક પરિસ્થિતિઓ લાગુ કરવામાં આવે ત્યારે 1300 bp સુધીના વધુ લાંબા DNA ખંડો મેળવી શકાય છે.

અલ્ટ્રાસોનિક હોમોજેનાઇઝરો DNAના શિયરિંગ માટે વિશ્વસનીય છે.

ChIP – ક્રોમેટિન ઇમ્યુનોપ્રિસિપિટેશન દરમિયાન અલ્ટ્રાસોનિક DNA કર્તન
CC-BY-SA.03 હેઠળ Jkwchuiની કૃતિમાંથી અનુકૂલિત

 

વિજ્ઞાન અને વિશ્લેષણમાં કોષ વિઘટન અને પ્રોટીન નિષ્કર્ષણ માટે યોગ્ય સોનિકેટર કેવી રીતે પસંદ કરવુંઆ માર્ગદર્શક વિડિયો સમજાવે છે કે પ્રયોગશાળા, વિશ્લેષણ અને સંશોધનમાં લયન, કોષ વિઘટન, પ્રોટીન અલગીકરણ તથા DNA અને RNA ના ખંડન જેવા નમૂના તૈયારીનાં કાર્યો માટે કયા પ્રકારનું સોનિકેટર શ્રેષ્ઠ છે. તમારા ઉપયોગ, નમૂનાના આયતન, નમૂનાઓની સંખ્યા અને પ્રક્રિયા ક્ષમતા માટે આદર્શ પ્રકારનું સોનિકેટર પસંદ કરો. Hielscher Ultrasonics પાસે તમારા માટે આદર્શ અલ્ટ્રાસોનિક હોમોજેનાઇઝર છે!
આ માર્ગદર્શક વિડિયો સમજાવે છે કે પ્રયોગશાળા, વિશ્લેષણ અને સંશોધનમાં લયન, કોષ વિઘટન, પ્રોટીન અલગીકરણ તથા DNA અને RNA ના ખંડન જેવા નમૂના તૈયારીનાં કાર્યો માટે કયા પ્રકારનું સોનિકેટર શ્રેષ્ઠ છે. તમારા ઉપયોગ, નમૂનાના આયતન, નમૂનાઓની સંખ્યા અને પ્રક્રિયા ક્ષમતા માટે આદર્શ પ્રકારનું સોનિકેટર પસંદ કરો. Hielscher Ultrasonics પાસે તમારા માટે આદર્શ અલ્ટ્રાસોનિક હોમોજેનાઇઝર છે!

 

DNAનું અપઘટન અટકાવવા માટે તાપમાન નિયંત્રણ

DNA નું દ્વિશૃંખલિત આણ્વિક સ્વરૂપ ઊંચા તાપમાન પ્રત્યે અત્યંત સંવેદનશીલ હોય છે, તેથી નમૂના તૈયારીનાં પગલાં દરમિયાન તાપમાનનું ચોક્કસ નિયંત્રણ વિશ્વસનીય વિશ્લેષણ પરિણામો માટે નિર્ણાયક પરિબળ છે.
તમે Hielscher ના પ્રોબ અલ્ટ્રાસોનિકેટરો, VialTweeter અથવા UIP400MTP નો ઉપયોગ કરતા હોવ – પ્લગ દ્વારા જોડી શકાય તેવા તાપમાન સેન્સર અને ઉપકરણના સ્માર્ટ સોફ્ટવેરને કારણે તાપમાનનું સતત નિરીક્ષણ અને નિયંત્રણ સુનિશ્ચિત થાય છે. તાપમાનને નિશ્ચિત શ્રેણીમાં જાળવવા માટે, તમે તાપમાનની ઉપરની અને નીચલી મર્યાદા સેટ કરી શકો છો. પરિણામે, તાપમાનની આ મર્યાદા વટાવતાં જ અલ્ટ્રાસોનિકેટર વિરામ લેશે અને તાપમાન સેટ કરેલા ∆T જેટલું ઘટે ત્યારે આપમેળે સોનિકેશન ચાલુ રાખશે.
Hielscher અલ્ટ્રાસોનિકેટરોનું અદ્યતન સોફ્ટવેર નમૂનાની પ્રક્રિયા માટેની આદર્શ પરિસ્થિતિઓ વિશ્વસનીય રીતે જળવાઈ રહે તે સુનિશ્ચિત કરે છે.

UIP400MTP મલ્ટિ-વેલ પ્લેટ અલ્ટ્રાસોનિકેટર વડે મોટા પ્રમાણમાં નમૂનાઓનું DNA વિખંડન

મલ્ટિ-વેલ પ્લેટના સોનિકેશન માટે અલ્ટ્રાસોનિક બહુ-નમૂના તૈયારી એકમ UIP400MTPછેલ્લા દાયકામાં જીવનવિજ્ઞાનમાં નમૂનાઓની સંખ્યામાં નોંધપાત્ર વધારો થયો છે. આનો અર્થ એ છે કે તુલના કરી શકાય તેવાં અને માન્ય પરિણામો મેળવવા માટે નમૂનાની તૈયારી અને વિશ્લેષણ દરમિયાન ખૂબ મોટી સંખ્યામાં નમૂનાઓનું (દા.ત., પ્રતિ માઇક્રોપ્લેટ 384, 1536, અથવા 3456 વેલ) સતત સમાન પરિસ્થિતિઓમાં પ્રસંસ્કરણ કરવું જરૂરી છે. UIP400MTP સાથે, Hielscher Ultrasonics મોટા પાયે નમૂનાઓના પ્રસંસ્કરણના વલણને અનુસરી રહ્યું છે. UIP400MTP એ માઇક્રોપ્લેટોનો ઉપયોગ કરીને નમૂનાની તૈયારી માટેનું અલ્ટ્રાસોનિકેટર છે. UIP400MTP વડે 6, 12, 24, 48, 96, 384, 1536, અથવા 3456 વેલ ધરાવતી પ્લેટોનું પ્રસંસ્કરણ કરી શકાય છે. માઇક્રોપ્લેટના પ્રકારના આધારે, દરેક વેલમાં સામાન્ય રીતે દસોના ક્રમમાં નેનોલિટરથી લઈને અનેક મિલિલિટર સુધીના આયતનનો નમૂનો સમાઈ શકે છે. જીવનવિજ્ઞાન સંશોધનમાં વ્યાપકપણે વપરાતા UIP400MTP નો ઉપયોગ ELISA (એન્ઝાઇમ-લિંક્ડ ઇમ્યુનોસોર્બન્ટ એસે) અથવા PCR જેવી પરીક્ષણ પદ્ધતિઓ પહેલાં નમૂનાની તૈયારી માટે, પ્રોટીન વિશ્લેષણ પહેલાં, તેમજ CHiP અને CHiP-seq પહેલાં ક્રોમેટિનની તૈયારી, હિસ્ટોનમાં થયેલા ફેરફારોની ઓળખ અને અન્ય વિશ્લેષણાત્મક પ્રક્રિયાઓ (દા.ત., જેલ ઇલેક્ટ્રોફોરેસિસ, માસ સ્પેક્ટ્રોમેટ્રી) માટે ખૂબ સામાન્ય રીતે થાય છે.
PCR પ્લેટની ઉચ્ચ નમૂના પ્રક્રિયા ક્ષમતા ધરાવતી પ્રક્રિયા વિશે વધુ વાંચો!

મલ્ટી-વેલ પ્લેટના સોનિકેશન માટે UIP400MTPUIP400MTP અલ્ટ્રાસોનિક હોમોજેનાઇઝર કોષભંજન, DNAના ખંડન, વિખેરણ અથવા સમાનગીકરણ માટે મલ્ટી-વેલ પ્લેટ અને માઇક્રોટાઇટર પ્લેટનું સોનિકેશન કરી શકે છે.
UIP400MTP અલ્ટ્રાસોનિક હોમોજેનાઇઝર કોષભંજન, DNAના ખંડન, વિખેરણ અથવા સમાનગીકરણ માટે મલ્ટી-વેલ પ્લેટ અને માઇક્રોટાઇટર પ્લેટનું સોનિકેશન કરી શકે છે.

10 સુધીની વાયલના નમૂનાની તૈયારી માટે VialTweeter

સંપૂર્ણ VialTweeter સેટઅપ: અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોસેસર UP200St સાથે જોડાયેલ VialTweeter સોનોટ્રોડVialTweeter એ પ્રયોગશાળામાં વ્યાપકપણે વપરાતું અલ્ટ્રાસોનિકેટર VialTweeter છે, જે એકસાથે 10 સુધીની વાયલનું અસરકારક અને સુવિધાજનક સોનિકેશન કરવાની સુવિધા આપે છે. વાયલ અને ટેસ્ટ ટ્યુબનું (દા.ત., Eppendorf વાયલ, ક્રાયો વાયલ, સેન્ટ્રિફ્યુજ ટ્યુબ) પરોક્ષ રીતે સોનિકેશન થતું હોવાથી, કોઈપણ પરસ્પર દૂષણ ટાળવામાં આવે છે. દરેક નમૂનાને સમાન અલ્ટ્રાસાઉન્ડ તીવ્રતા મળતી હોવાથી, સોનિકેશનનાં તમામ પરિણામો સમાન અને પુનઃઉત્પાદનક્ષમ હોય છે. VialTweeter અમારા અન્ય ડિજિટલ ઉપકરણોની જેમ તમામ સ્માર્ટ સુવિધાઓ (દા.ત., સ્માર્ટ મેનુ, પ્રોગ્રામ કરી શકાય તેવાં સેટિંગ્સ, તાપમાન નિયંત્રણ, રિમોટ કંટ્રોલ વગેરે) પ્રદાન કરે છે, જેથી વપરાશકર્તા માટે સર્વોચ્ચ સુવિધા સુનિશ્ચિત થાય છે.

માઇક્રોવેલ પ્લેટ માટે બહુ-આંગળીવાળા પ્રોબ

Hielscher ના 200 watts અલ્ટ્રાસોનિકેટર મોડેલો UP200ST અને UP200HT સાથે સમાન તીવ્રતાએ 4 નમૂનાઓનું એકસાથે સોનિકેશન કરવા માટે 4 પ્રોબ હેડ અથવા 4 સોનોટ્રોડઅલ્ટ્રાસોનિક પ્રોબ હોમોજેનાઇઝર UP200Ht અને UP200St માટે ઉપલબ્ધ, 4 અથવા 8 આંગળીઓવાળા બહુ-આંગળીવાળા પ્રોબ એકસાથે સમાન પરિસ્થિતિઓમાં અનેક નમૂનાઓનું સોનિકેશન કરવા માટેનો સુવિધાજનક વિકલ્પ છે. ઉદાહરણ તરીકે, સોનોટ્રોડ MTP-24-8-96 એ આઠ આંગળીઓવાળો પ્રોબ છે, જે સ્વયંસંચાલિત પ્રણાલીઓમાં સંકલન માટે અથવા મલ્ટી-વેલ પ્લેટના વેલમાં રહેલા નમૂનાઓની કાર્યક્ષમ હસ્તચાલિત તૈયારી માટે આદર્શ છે. બહુ-આંગળીવાળો સોનોટ્રોડ એવી પ્રયોગશાળાઓમાં સ્વચાલન માટે આદર્શ છે, જ્યાં મુખ્યત્વે પ્રમાણભૂત અલ્ટ્રાસોનિક સોનોટ્રોડનો ઉપયોગ કરીને બીકર અને ટેસ્ટ ટ્યુબમાં પ્રક્રિયા કરવામાં આવે છે. બહુ-આંગળીવાળા અને પ્રમાણભૂત પ્રોબને થોડી જ મિનિટોમાં ઝડપથી એકબીજાના સ્થાને બદલી શકાય છે, જેનાથી એક પ્રોબવાળું અલ્ટ્રાસોનિકેટર બહુવિધ પ્રોબવાળા અલ્ટ્રાસોનિક વિઘટકમાં રૂપાંતરિત થાય છે.

માહિતીની વિનંતી



DNAના ખંડન માટે Hielscher અલ્ટ્રાસોનિકેટર

Hielscher Ultrasonics DNA, RNA અને ક્રોમેટિનના ખંડન માટે વિવિધ અલ્ટ્રાસાઉન્ડ-આધારિત પ્લેટફોર્મ પ્રદાન કરે છે. આ વિવિધ પ્લેટફોર્મમાં અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોબ (સોનોટ્રોડ), અનેક ટ્યુબ અથવા મલ્ટી-વેલ પ્લેટમાં (દા.ત., 96-વેલ પ્લેટ, માઇક્રોટાઇટર પ્લેટ) એકસાથે નમૂનાની તૈયારી માટેના પરોક્ષ સોનિકેશન ઉપાયો, સોનોરિએક્ટર અને અલ્ટ્રાસોનિક કપહોર્નનો સમાવેશ થાય છે. DNAના શીયરિંગ માટેનાં તમામ પ્લેટફોર્મ આવૃત્તિ અનુસાર ટ્યૂન કરેલા, ઉચ્ચ કાર્યક્ષમતાવાળા અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોસેસરથી સંચાલિત થાય છે, જેમને ચોકસાઈપૂર્વક નિયંત્રિત કરી શકાય છે અને જે પુનઃઉત્પાદનક્ષમ પરિણામો આપે છે.

કોઈપણ સંખ્યા અને કદના નમૂનાઓ માટે અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોસેસર

Hielscher ના બહુવિધ નમૂનાઓ માટેના અલ્ટ્રાસોનિકેટરો VialTweeter (10 સુધીની ટેસ્ટ ટ્યુબ માટે) અને UIP400MTP (માઇક્રોપ્લેટો/ મલ્ટીવેલ પ્લેટો માટે) સાથે તીવ્ર અને ચોકસાઈપૂર્વક નિયંત્રિત કરી શકાય તેવા અલ્ટ્રાસોનિકેશનને કારણે નમૂનાઓના પ્રસંસ્કરણનો સમય ઘટાડવો સરળતાથી શક્ય બને છે, અને સાથે DNA ખંડોના કદનું ઇચ્છિત વિતરણ તથા પ્રાપ્તિમાત્રા પણ મળે છે. અલ્ટ્રાસોનિક DNA ખંડન નમૂનાની તૈયારીને કાર્યક્ષમ, વિશ્વસનીય અને પાયાવૃદ્ધિ કરી શકાય તેવી બનાવે છે. સતત નિયંત્રિત અલ્ટ્રાસાઉન્ડ લાગુ કરીને પ્રોટોકોલનો પાયો એક નમૂનાથી અનેક નમૂનાઓ સુધી રેખીય રીતે વધારી શકાય છે.
એકથી પાંચ આંગળીઓવાળા પ્રોબ અલ્ટ્રાસોનિકેટરો ઓછી સંખ્યામાં નમૂનાઓની તૈયારી માટે આદર્શ છે. Hielscher ના પ્રયોગશાળા અલ્ટ્રાસોનિકેટરો વિવિધ કદમાં ઉપલબ્ધ છે, જેથી અમે તમારા ઉપયોગ અને જરૂરિયાતો માટે તમને આદર્શ ઉપકરણની ભલામણ કરી શકીએ.

પ્રક્રિયાનું ચોક્કસ નિયંત્રણ

Hielscher અલ્ટ્રાસોનિકેટરોને બ્રાઉઝર નિયંત્રણ દ્વારા દૂરથી નિયંત્રિત કરી શકાય છે. સોનિકેશનના પરિમાણોનું નિરીક્ષણ કરી શકાય છે અને પ્રક્રિયાની જરૂરિયાતો અનુસાર તેમને ચોકસાઈથી સમાયોજિત કરી શકાય છે.સોનિકેશનની ચોકસાઈથી નિયંત્રિત કરી શકાય તેવી ગોઠવણો અત્યંત જરૂરી છે, કારણ કે અતિશય સોનિકેશન DNA, RNA અને ક્રોમેટિનનો નાશ કરી શકે છે, જ્યારે અપૂરતા અલ્ટ્રાસોનિક કર્તનથી DNA અને ક્રોમેટિનના અતિશય લાંબા ખંડો બને છે. Hielscher ના ડિજિટલ અલ્ટ્રાસોનિકેટરોમાં સોનિકેશનના પરિમાણો સરળતાથી ચોક્કસ રીતે ગોઠવી શકાય છે. એ જ પ્રક્રિયા ઝડપથી પુનરાવર્તિત કરવા માટે સોનિકેશનની ચોક્કસ ગોઠવણોને પ્રોગ્રામ કરેલી ગોઠવણ તરીકે પણ સાચવી શકાય છે.
સોનિકેશનની બધી પ્રક્રિયાઓ આપમેળે નોંધાય છે અને ઉપકરણમાં સંકલિત SD-કાર્ડ પર CSV ફાઇલ તરીકે સંગ્રહિત થાય છે. આનાથી કરવામાં આવેલા પ્રયોગોનું સચોટ દસ્તાવેજીકરણ થાય છે અને સોનિકેશનની પ્રક્રિયાઓની સરળતાથી સમીક્ષા કરી શકાય છે.
બ્રાઉઝર દ્વારા રિમોટ કંટ્રોલ વડે બધાં ડિજિટલ અલ્ટ્રાસોનિકેટરોને કોઈપણ પ્રમાણભૂત બ્રાઉઝરથી ચલાવી શકાય છે અને તેમનું નિરીક્ષણ કરી શકાય છે. વધારાનું સોફ્ટવેર ઇન્સ્ટોલ કરવાની જરૂર નથી, કારણ કે LAN જોડાણથી અત્યંત સરળ પ્લગ-એન્ડ-પ્લે સેટઅપ શક્ય બને છે.


અલ્ટ્રાસોનિક નમૂના તૈયારીમાં સર્વોચ્ચ ઉપયોગકર્તા-અનુકૂળતા

Hielscher ના બધાં અલ્ટ્રાસોનિકેટરો ઉચ્ચ કાર્યક્ષમતાવાળો અલ્ટ્રાસાઉન્ડ પ્રદાન કરવા માટે રચાયેલાં છે અને સાથે જ હંમેશાં અત્યંત વપરાશકર્તા-અનુકૂળ તથા ચલાવવામાં સરળ હોય છે. બધી ગોઠવણો સ્પષ્ટ મેનુમાં સુવ્યવસ્થિત છે, જેને રંગીન ટચ-ડિસ્પ્લે અથવા બ્રાઉઝર દ્વારા રિમોટ કંટ્રોલ વડે સરળતાથી ઍક્સેસ કરી શકાય છે. પ્રોગ્રામ કરી શકાય તેવી ગોઠવણો અને આપમેળે ડેટા નોંધવાની સુવિધા ધરાવતું સ્માર્ટ સોફ્ટવેર વિશ્વસનીય અને પુનરુત્પાદનક્ષમ પરિણામો માટે સોનિકેશનની શ્રેષ્ઠ ગોઠવણો સુનિશ્ચિત કરે છે. સ્પષ્ટ અને ઉપયોગમાં સરળ મેનુ ઇન્ટરફેસ Hielscher ના અલ્ટ્રાસોનિકેટરોને વપરાશકર્તા-અનુકૂળ અને કાર્યક્ષમ ઉપકરણો બનાવે છે.
નીચેનું કોષ્ટક અમારા પ્રયોગશાળાના અલ્ટ્રાસોનિકેટરોની અંદાજિત પ્રસંસ્કરણ ક્ષમતાનો ખ્યાલ આપે છે, જે DNA અને RNA ખંડન, કોષલયન તેમજ પ્રોટીન નિષ્કર્ષણ જેવાં નમૂના તૈયારીનાં કાર્યો માટે આદર્શ છે:

ઉપકરણ શક્તિ [W] પ્રકાર કદ [mL]
UIP400MTP 400 માઇક્રોપ્લેટો માટે 6 – 3456 કૂવાઓ
VialTweeter 200 10 સુધીની વાયલો માટે, ઉપરાંત ક્લેમ્પથી જોડવાની સુવિધા 0.5 – 1.5
UP50H 50 પ્રોબ પ્રકારનું 0.01 – 250
UP100H 100 પ્રોબ પ્રકારનું 0.01 – 500
UP200Ht 200 પ્રોબ પ્રકારનું 0.1 – 1000
UP200St 200 પ્રોબ પ્રકારનું 0.1 – 1000
UP400St 400 પ્રોબ પ્રકારનું 5.0 – 2000
CupHorn 200 CupHorn, સોનોરિએક્ટર 10 – 200
GDmini2 200 દૂષણમુક્ત પ્રવાહ કોષ

અમારો સંપર્ક કરો! / અમને પૂછો!

વધુ માહિતી માટે પૂછો

અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોસેસરો, ઉપયોગો અને કિંમત વિશે વધારાની માહિતી મેળવવા માટે કૃપા કરીને નીચે આપેલા ફોર્મનો ઉપયોગ કરો. આપની પ્રક્રિયા વિશે આપની સાથે ચર્ચા કરવામાં અને આપની જરૂરિયાતોને અનુરૂપ અલ્ટ્રાસોનિક સિસ્ટમ પ્રદાન કરવામાં અમને આનંદ થશે!





VialTweeter બહુ-નમૂના અલ્ટ્રાસોનિકેટર છે, જે ચોકસાઈથી નિયંત્રિત તાપમાનની પરિસ્થિતિઓમાં વિશ્વસનીય રીતે નમૂનાઓ તૈયાર કરવા દે છે.

બહુવિધ નમૂનાઓની તૈયારી માટેનું અલ્ટ્રાસોનિક એકમ VialTweeter એકસાથે 10 સુધીની વાયલોનું સોનિકેશન કરવાની સુવિધા આપે છે. ક્લેમ્પથી જોડાતા ઉપકરણ VialPress વડે તીવ્ર સોનિકેશન માટે આગળના ભાગ સામે 4 સુધીની વધારાની ટ્યુબોને દબાવી રાખી શકાય છે.


માઇક્રોટાઇટર પ્લેટોના વેલના સોનિકેશન માટે સોનોટ્રોડ MTP-24-8-96માં આઠ અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોબ છે.

સોનોટ્રોડ MTP-24-8-96માં માઇક્રોટાઇટર પ્લેટોના કૂવાઓનું સોનિકેશન કરવા માટે આઠ અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોબ છે.



સાહિત્ય / સંદર્ભો

જાણવા યોગ્ય તથ્યો

નેક્સ્ટ જનરેશન સીક્વેન્સિંગ શું છે?

નેક્સ્ટ જનરેશન સીક્વેન્સિંગ, જેને નેક્સ્ટ જેન સીક્વેન્સિંગ (NGS), ઉચ્ચ નમૂના પ્રક્રિયા ક્ષમતાવાળું સીક્વેન્સિંગ અથવા બીજી પેઢીનું સીક્વેન્સિંગ પણ કહેવામાં આવે છે, તે મોટા પાયે સમાંતર સીક્વેન્સિંગની પદ્ધતિને સૂચવે છે. તેમાં દરેક પ્રક્રિયા ચક્રમાં લાખો ખંડોમાં રહેલા DNAની અત્યંત મોટી (વિશાળ) માત્રાનું એકસાથે સમાંતર રીતે સીક્વેન્સિંગ કરવામાં આવે છે.
નેક્સ્ટ જનરેશન સીક્વેન્સિંગ કરવા માટેનાં ત્રણ મૂળભૂત પગલાં

  1. લાઇબ્રેરીની તૈયારી,
  2. સીક્વેન્સિંગ, અને
  3. ડેટાનું વિશ્લેષણ

જરૂરી છે.
લાઇબ્રેરીની તૈયારી દરમિયાન DNAની સેરોને ચોક્કસ લંબાઈના DNA ખંડોમાં વિભાજિત કરવી જરૂરી છે. DNAનું ખંડીકરણ કરવા માટે સોનિકેશન પસંદગીની પદ્ધતિઓમાંની એક છે.
DNA સીક્વેન્સિંગની પ્રક્રિયા દરમિયાન DNAમાં ન્યુક્લિયોટાઇડનો ક્રમ – જેને ન્યુક્લિક ઍસિડ અનુક્રમ કહેવામાં આવે છે – નક્કી કરવામાં આવે છે. ન્યુક્લિક ઍસિડ અનુક્રમ ચાર ન્યુક્લિયોટાઇડ બેઝ – એડેનિન, સાયટોસિન, ગ્વાનિન અને થાયમિન – થી બનેલો હોય છે, જે માહિતીને સંકેતબદ્ધ કરે છે.
નેક્સ્ટ જનરેશન સીક્વેન્સિંગ જીવન વિજ્ઞાન અને વ્યક્તિગત જરૂરિયાતોને અનુરૂપ ચિકિત્સામાં સંશોધનને આગળ ધપાવે છે, કારણ કે જિનોમિક સંશોધન, કેન્સર સંશોધન, દુર્લભ અને જટિલ રોગોના સંશોધન, સૂક્ષ્મજીવ સંશોધન, કૃષિ જિનોમિક્સ અને અન્ય ઘણાં સંશોધન ક્ષેત્રોમાં DNA અને RNA સીક્વેન્સિંગનો વ્યાપક ઉપયોગ થાય છે.

નેક્સ્ટ જનરેશન સીક્વેન્સિંગ અને સેંગર સીક્વેન્સિંગની તુલના

નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વન્સિંગ (NGS) દ્વારા ખૂબ મોટી સંખ્યામાં જિનોમિક નમૂનાઓનું અનુક્રમણ કરવું શક્ય છે, જ્યારે સેંગર સિક્વન્સિંગ (જેને શૃંખલા સમાપન પદ્ધતિ અથવા પ્રથમ પેઢીનું અનુક્રમણ પણ કહેવામાં આવે છે) માત્ર ઓછી સંખ્યામાં નમૂનાઓનું અનુક્રમણ કરવાની ક્ષમતા ધરાવે છે. સેંગર સિક્વન્સિંગમાં એક સમયે માત્ર એક જ DNA ખંડનું અનુક્રમણ થાય છે અને તે એક જ દિવસમાં પૂર્ણ કરી શકાય છે. તેની ચોકસાઈને કારણે સેંગર સિક્વન્સિંગને સુવર્ણ ધોરણની ટેક્નોલોજી પણ ગણવામાં આવે છે, જેનો ઉપયોગ નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વન્સિંગ દ્વારા મેળવેલાં પરિણામોની ખરાઈ કરવા માટે થાય છે.
સેંગર સિક્વન્સિંગમાં આશરે 800bp જેટલી વાંચન લંબાઈ પ્રાપ્ત થાય છે (સંવર્ધિત ન કરેલા DNA સાથે સામાન્ય રીતે 500–600bp). સેંગર સિક્વન્સિંગની વધુ લાંબી વાંચન લંબાઈ અન્ય અનુક્રમણ પદ્ધતિઓની સરખામણીમાં નોંધપાત્ર ફાયદા આપે છે, ખાસ કરીને જિનોમના પુનરાવર્તિત પ્રદેશોના અનુક્રમણમાં. ટૂંકાં વાંચનોના અનુક્રમ ડેટા સાથે સંકળાયેલો પડકાર ખાસ કરીને નવા જિનોમના અનુક્રમણમાં (de novo) અને અત્યંત પુનર્ગોઠવાયેલા જિનોમ ખંડોના અનુક્રમણમાં સમસ્યારૂપ બને છે; આવા ખંડો સામાન્ય રીતે કેન્સરના જિનોમમાં અથવા રચનાત્મક વિવિધતા દર્શાવતા રંગસૂત્રોના પ્રદેશોમાં જોવા મળે છે. [cp. Morozova and Marra, 2008]

DNA – ડિઓક્સિરાઇબોન્યુક્લિક એસિડ – તેનાં સ્વરૂપો અને કાર્યો

DNAના દરેક સ્વરૂપની વિશિષ્ટ લાક્ષણિકતાઓ અને ઉપયોગો હોય છે, જે કેન્સરવિજ્ઞાન, આનુવંશિકવિજ્ઞાન, ફોરેન્સિક વિજ્ઞાન અને ઉત્ક્રાંતિ જીવવિજ્ઞાન સહિતનાં અનેક સંશોધન ક્ષેત્રોમાં યોગદાન આપે છે. તમારા વિશ્લેષણના હેતુઓ માટે DNA અને RNAને અલગ પાડવા અને ખંડિત કરવા માટે Hielscher સોનિકેટર્સ અત્યંત કાર્યક્ષમ અને વિશ્વસનીય ઉકેલ છે. નીચેની યાદીમાં અમે DNAનાં વિશિષ્ટ સ્વરૂપો સમજાવીએ છીએ અને તેમના જૈવિક સંદર્ભ તથા કાર્યોના આધારે તેમનું વર્ગીકરણ કરીએ છીએ:

  • જિનોમિક DNA (gDNA)
    જિનોમિક DNA (gDNA): સજીવમાં રહેલો DNAનો સંપૂર્ણ સમૂહ, જેમાં કોડિંગ (જનીનો) અને નોન-કોડિંગ એમ બંને પ્રદેશોનો સમાવેશ થાય છે.
  • કોષબાહ્ય DNA
    પરિભ્રમણશીલ ગાંઠ DNA (ctDNA): ગાંઠના કોષો દ્વારા રક્તપ્રવાહમાં મુક્ત કરવામાં આવતા DNAના ખંડો.
    કોષમુક્ત DNA (cfDNA): વિવિધ પેશીઓમાંથી ઉદ્ભવતા અને રક્તપ્રવાહમાં મુક્તપણે પરિભ્રમણ કરતા જોવા મળતા DNAના ખંડો.
  • રંગસૂત્રબાહ્ય વર્તુળાકાર DNA (eccDNA): સુકોષકેન્દ્રી કોષોમાં રંગસૂત્રોની બહાર જોવા મળતા વર્તુળાકાર DNA અણુઓ.
    વાયરસજન્ય DNA: વાયરસમાંથી ઉદ્ભવતો DNA, જે યજમાનના જિનોમમાં સંકલિત થયેલો હોય છે અથવા એપિસોમલ DNA તરીકે હોય છે.
  • માઇટોકોન્ડ્રિયલ DNA
    માઇટોકોન્ડ્રિયલ DNA (mtDNA): માઇટોકોન્ડ્રિયામાં સ્થિત, માતા તરફથી વારસામાં મળતો અને ઊર્જા ઉત્પાદનમાં ભાગ લેતો DNA.
  • પ્લાઝ્મિડ DNA
    પ્લાઝ્મિડ DNA: નાના, વર્તુળાકાર DNA અણુઓ, જે રંગસૂત્રીય DNAથી સ્વતંત્ર રીતે પોતાની પ્રતિકૃતિ બનાવે છે, સામાન્ય રીતે બેક્ટેરિયામાં જોવા મળે છે અને આનુવંશિક ઇજનેરીમાં વપરાય છે.
  • કોષકેન્દ્રીય DNA
    કોષકેન્દ્રીય DNA (nDNA): સુકોષકેન્દ્રી કોષોના કોષકેન્દ્રમાં રહેલો DNA, જે સજીવના આનુવંશિક પદાર્થનો મોટાભાગનો હિસ્સો બનાવે છે.
  • એકલ-કોષ DNA
    એકલ-કોષ DNA (scDNA): એક જ કોષમાંથી નિષ્કર્ષિત કરેલો DNA, જેનો ઉપયોગ વ્યક્તિગત કોષના સ્તરે વિગતવાર જિનોમિક વિશ્લેષણ માટે થાય છે.
  • પુનઃસંયોજિત DNA
    પુનઃસંયોજિત DNA (rDNA): બહુવિધ સ્રોતોમાંથી આનુવંશિક પદાર્થને એકત્ર લાવવા માટે આનુવંશિક પુનઃસંયોજનની પ્રયોગશાળા પદ્ધતિઓ દ્વારા બનાવેલા DNA અણુઓ.
  • વિશિષ્ટ સ્વરૂપો
    પર્યાવરણીય DNA (eDNA): મૂળ સજીવોને અલગ પાડ્યા વિના પર્યાવરણીય નમૂનાઓ (માટી, પાણી)માંથી એકત્ર કરેલો DNA
    પ્રાચીન DNA (aDNA): પ્રાચીન નમૂનાઓમાંથી નિષ્કર્ષિત કરેલો DNA, જે ઉત્ક્રાંતિ જીવવિજ્ઞાન અને પ્રાચીન વસ્તીઓ વિશે સમજ આપે છે.
  • રંગસૂત્રીય DNA
    રંગસૂત્રીય DNA: કોષકેન્દ્રની અંદર રંગસૂત્રો બનાવતો DNA, જેમાં કોડિંગ અને નોન-કોડિંગ એમ બંને પ્રદેશોનો સમાવેશ થાય છે.
  • વાયરસજન્ય અને સંશ્લેષિત સ્વરૂપો
    વાયરસજન્ય DNA: વાયરસમાંથી પ્રાપ્ત થતો DNA, જે યજમાનના જિનોમમાં સંકલિત થયેલો હોઈ શકે છે અથવા સ્વતંત્ર એકમો તરીકે અસ્તિત્વ ધરાવી શકે છે.
    સંશ્લેષિત DNA: રાસાયણિક પ્રક્રિયાઓ દ્વારા કૃત્રિમ રીતે સંશ્લેષિત કરેલા DNA અનુક્રમો, જેનો ઉપયોગ ઘણી વાર સંશોધન અને જૈવપ્રૌદ્યોગિકીમાં થાય છે.

ઉચ્ચ કાર્યક્ષમતાવાળી અલ્ટ્રાસોનિક ટેકનોલોજી! Hielscher ની ઉત્પાદન શ્રેણીમાં સુઘડ પ્રયોગશાળા અલ્ટ્રાસોનિકેટરથી લઈને બેન્ચ પર મૂકીને વાપરવાના એકમો અને સંપૂર્ણ ઔદ્યોગિક અલ્ટ્રાસોનિક પ્રણાલીઓ સુધીનો સમગ્ર વ્યાપ આવરી લેવાય છે.

Hielscher Ultrasonics ઉચ્ચ કાર્યક્ષમતાવાળા અલ્ટ્રાસોનિક હોમોજેનાઇઝર્સ પ્રયોગશાળાના કદથી લઈને ઔદ્યોગિક કદ સુધી બનાવે છે.

તમારી પ્રક્રિયા વિશે ચર્ચા કરતાં અમને આનંદ થશે.

✕