Proteomik tədqiqat – Niyə Sonicator Nümunə Hazırlanması üçün Vacibdir
Proteomik tədqiqat hüceyrə biologiyası haqqında dərin fikirlər verir və zülalların və onların funksiyalarının hərtərəfli təhlilinə imkan verməklə bioloji sistemlər haqqında anlayışımızı genişləndirir. Proteomik tədqiqatların müvəffəqiyyətinin mərkəzi hissəsi yüksək keyfiyyətli nümunələrin hazırlanmasıdır ki, bu da çox vaxt mürəkkəb və əmək tutumlu nümunə hazırlığını əhatə edir. Sonication nümunə hazırlamaq üçün yaxşı qurulmuş və güclü bir vasitədir və ənənəvi üsullarla müqayisədə çoxsaylı üstünlüklər təklif edir. Zond tipli sonikatorlar, VialTweeter və UIP400MTP yüksək məhsuldarlıqlı plitə-sonikator kimi müxtəlif sonikator modelləri proteomik nümunə emalında unikal üstünlüklər təklif edir və etibarlı, təkrarlana bilən tədqiqat nəticələrinə yol açır.
Niyə Proteomik Tədqiqatlarım üçün Sonicatora ehtiyacım var?
Proteomik tədqiqatlar sahəsində sonikatora ehtiyac analiz üçün yüksək keyfiyyətli nümunələrin əldə edilməsinin kritik əhəmiyyətindən irəli gəlir. Proteomik tədqiqatlarda sonikasiyadan istifadə effektiv hüceyrə lizizini, təkmilləşdirilmiş zülal ekstraksiyasını, kompleks nümunələrin homogenləşdirilməsini, asanlaşdırılmış fermentativ həzmi, nümunənin çirklənməsinin azaldılmasını və yüksək məhsuldarlıqlı emal imkanlarını təmin etməklə etibarlı və təkrarlana bilən nəticələrə nail olmaq üçün vacibdir.
Proteomikada nümunənin hazırlanmasının əhəmiyyəti: Proteomik təcrübələrdə etibarlı və təkrarlana bilən nəticələrə nail olmaq nümunənin diqqətlə hazırlanmasından asılıdır. Hüceyrə lizizindən zülalın çıxarılmasına və təmizlənməsinə qədər artefaktları minimuma endirmək və nümunənin bütövlüyünü təmin etmək üçün hər bir addım dəqiqliklə yerinə yetirilməlidir. Bununla belə, mexaniki pozulma və kimyəvi lizis kimi ənənəvi üsullar natamam ekstraksiya, zülalın deqradasiyası və nümunənin çirklənməsi kimi problemlərə görə çox vaxt istənilən nəticələrin əldə edilməsində qısamüddətli olur.
Yüksək məhsuldarlıqlı sonikator UIP400MTP proteomikada nümunənin hazırlanması üçün.
Ultrasonication: Proteomik Nümunə Hazırlanmasında Oyun Dəyişdirici
Ultrasonikasiya, bioloji nümunələri pozmaq üçün yüksək tezlikli səs dalğalarından istifadə prosesi, proteomik nümunənin hazırlanmasında oyun dəyişdirici kimi ortaya çıxdı. Akustik enerjinin gücündən istifadə edərək, sonikatorlar sürətli və səmərəli hüceyrə lizisini, zülalların çıxarılmasını və fermentativ həzmini asanlaşdırır, daha yüksək məhsuldarlığa və yaxşılaşdırılmış nümunə təmizliyinə səbəb olur.
Protokol: Biofilm və Proteomik Analizdə Hielscher Multi-Nümunə Sonicatorlarından istifadə edərək Addım-addım Təlimat tapın!
Sonikasiya ilə asanlaşdırılan Nümunə Hazırlama Tapşırıqları
- Hüceyrə lizisi və zülal çıxarılması: Sonicators çox yönlü və dəqiqliyinə görə hüceyrə lizisi və zülal çıxarılması üçün idealdır. Ultrasəs enerjisinin idarə olunan partlayışlarını çatdırmaqla, sonikator hüceyrə membranlarını effektiv şəkildə pozur, onların bütövlüyünü pozmadan hüceyrədaxili zülalları buraxır. Bu, zülal-zülal qarşılıqlı əlaqəsi tədqiqatları və struktur proteomika kimi aşağı axın analizi üçün bütöv protein strukturları tələb edən proteomik tədqiqatlarda xüsusilə dəyərlidir.
- Yüksək məhsuldarlıqlı nümunə emal: UIP400MTP nömrəli sonikator yüksək məhsuldarlıqlı proteomik nümunə emalında misilsiz səmərəlilik təklif edir. UIP400MTP çox quyulu boşqab formatında ultrasəs enerjisindən istifadə etməklə çoxlu nümunələrin eyni vaxtda sonikasiyasına imkan verir, emal vaxtını və əmək xərclərini kəskin şəkildə azaldır. Bu, nümunə kitabxanalarının sürətli skrininqini və ya biomarkerin kəşfi və təsdiqi üçün yüksək nümunə ötürmə qabiliyyətini tələb edən genişmiqyaslı proteomik tədqiqatlarda xüsusilə faydalıdır.
- Protein yağıntılarından sonra artan məhsuldarlıq: Zülal yağıntısı zülalları konsentrasiya etmək və onları müxtəlif çirkləndiricilərdən təmizləmək üçün bioloji nümunələrin aşağı emalı zamanı adətən istifadə olunur. Sonikasiya, trikloroasetik turşu (TCA) zülalları sonradan ultrasəslə çökdürdükdə zülal məhsuldarlığını artırmaq üçün resuspenziya üçün təsirli bir üsul olaraq nümayiş etdirildi. Nümunələrin sonikasiyası, TCA yağıntısından sonra nümunə tamponunda elüsyonun ardınca ümumi zülal bərpasını artırır və təkrar istehsal və uyğunluq nisbətlərini yaxşılaşdırır.
- Proteolitik həzm: Ultrasonik yardımlı zülal həzmi sürət və səmərəlilik baxımından ənənəvi gecə həzmini əhəmiyyətli dərəcədə üstələyir. Sonikasiya mürəkkəb proteomların sürətli reduksiyasına, alkilasiyasına və proteolitik həzminə imkan verir, adi 12-24 saatdan bir neçə dəqiqəyə qədər tələb olunan vaxtı azaldır. Bu ultrasəs yanaşması nəinki iş axınını sürətləndirir, həm də proteomik analizlərdə təkrar istehsal və ardıcıllığı artırır. Ətraflı burada oxuyun!
- Nümunə Homogenləşdirmə və Tampon Qarışığı: Sonication nümunənin homogenləşməsini, hüceyrənin həll edilməsini və proteomik iş axınlarında buferin qarışdırılmasını asanlaşdırır.
VialTweeter Multi-Tube Sonicator 10-a qədər nümunənin eyni vaxtda sonikasiyası üçün, məsələn, hüceyrələri pozmaq və zülalları çıxarmaq üçün.
Proteomik Nümunələrim üçün Ən Yaxşı Sonicator
Hielscher Ultrasonics, dizaynları ideal nümunə hazırlığını mümkün edən müxtəlif sonikator modelləri təklif edir.
Kiçik və ya yüksək nümunə nömrələrini, dəqiqə və ya böyük həcmləri sonikasiya etməyinizdən asılı olmayaraq – Hielscher, proteinlə əlaqəli tətbiqiniz üçün ən uyğun sonikatora malikdir.
Flakonlar və stəkanlar – Zond tipli Sonicator: Klassik zond tipli sonikator flakonlarda və ya stəkanda tək nümunələr proses olduqda, daha kiçik nümunə nömrələri üçün laboratoriya homogenizatoru kimi geniş istifadə olunur. Mikro-ucu ilə laboratoriya homogenizatorları UP50H və ya UP100H nümunənin birbaşa ultrasəslənməsi üçün istifadə olunan tipik zond/buynuz-sonikatorlardır.
96-Quyu Plitələr/Mikrotitr Plitələr – UIP400MTP Plate-Sonicator: Nümunələrin sayının artması və 96, 384 və ya 1536 quyuya malik çoxlu quyuların və mikroplitələrin istifadəsi ilə UIP400MTP yüksək məhsuldarlıqlı plitə sonikatoru birdən çox nümunənin eyni vaxtda sonikasiyasına və qarışdırılmasına imkan verir, zülalın yumşaq, lakin effektiv izolyasiyasını, eləcə də hərtərəfli qarışdırma və vahid formada işləməyi təmin edir. reagentlərin dispersiyası. Bu, xüsusilə mürəkkəb nümunə matrisləri və ya çoxlu nümunə preparatlarını əhatə edən proteomik təcrübələrdə faydalıdır, burada homojenlik dəqiq və təkrarlana bilən nəticələr üçün vacibdir.
10 flakona qədər – The VialTweeter: Eppendorf boruları kimi bir neçə flakonla eyni vaxtda işləyirsinizsə, VialTweeter seçdiyiniz alətdir. VialTweeter eyni vaxtda 10-a qədər qapalı flakon və ya borunu sonikləşdirməyə imkan verən unikal dizayn təklif edir. Çarpaz çirklənmə və hava yolu ilə çirklənmə tamamilə qarşısı alınır.
Bir neçə flakon və ya tək gəmi – Kubok Horn: UP200St_TD-Cuphorn, flakon tutucusundan istifadə edərək eyni vaxtda bir neçə flakonu emal etməyə və ya CupHorn su banyosuna fərdi bir qab yerləşdirməyə imkan verən güclü sonikatordur.
Biz kömək etmək üçün buradayıq
Texniki heyətimiz ultrasəs sahəsində mütəxəssislərdir və tələblərinizə cavab verən və tədqiqatınızı uğura çevirən ən uyğun sonikatoru tövsiyə etməyi yaxşı bilir. Sonicatorlar proteomik tədqiqatda əvəzolunmaz vasitələrə çevrildikcə, nümunə hazırlamada misilsiz səmərəlilik, çox yönlülük və təkrar istehsal imkanları təklif edərək, Hielscher sizə mükəmməl sonikator modelini təqdim etməklə sonikasiyanın ən effektiv və etibarlı olduğuna əmin olur. Hüceyrə lizizindən zülal çıxarılmasına və daha çox, ultrasəsləmə ənənəvi üsulları üstələyərək tədqiqatçılara proteomik elmin sərhədlərini aşmağa imkan verir. Proteomik tədqiqatlar inkişaf etməyə davam etdikcə, sonikatorlar etibarlı nəticələrə töhfə verən və zülalların mürəkkəb dünyasını və onların funksiyalarını anlamağa kömək edən əsas nümunə hazırlama vasitəsidir.
- yüksək səmərəlilik
- yüksək məhsuldarlıq
- ən müasir texnologiya
- Təkrarlana bilən, təkrarlana bilən nəticələr
- etibarlılıq & möhkəmlik
- tənzimlənən, dəqiq proses nəzarəti
- stəkanlar, flakonlar, borular, mikroplitələr üçün
- istənilən nümunə həcmi üçün
- ağıllı proqram təminatı
- ağıllı funksiyalar (məsələn, proqramlaşdırıla bilən, məlumatların protokollaşdırılması, uzaqdan idarəetmə)
- idarə etmək asan və təhlükəsizdir
- aşağı təmir
- CIP (yerində təmiz)
Dizayn, İstehsalat və Konsaltinq – Keyfiyyətli Almaniya istehsalı
Hielscher ultrasəs cihazları ən yüksək keyfiyyət və dizayn standartları ilə tanınır. Sağlamlıq və asan əməliyyat ultrasəs aparatlarımızın sənaye obyektlərinə rahat inteqrasiyasına imkan verir. Kobud şərtlər və tələbkar mühitlər Hielscher ultrasəs cihazları tərəfindən asanlıqla idarə olunur.
Hielscher Ultrasonics, ISO sertifikatlı bir şirkətdir və ən müasir texnologiya və istifadəçi dostu olan yüksək performanslı ultrasəs cihazlarına xüsusi diqqət yetirir. Əlbəttə ki, Hielscher ultrasəs cihazları CE-yə uyğundur və UL, CSA və RoHs tələblərinə cavab verir.
Aşağıdakı cədvəl DNT və RNT parçalanması, hüceyrə lizisi, DNT və zülalların təcrid edilməsi, proteolitik həzm və ya biofilmin ayrılması kimi nümunə hazırlama işləri üçün ideal olan laboratoriya ultrasəs aparatlarımızın təxmini emal qabiliyyətinin göstəricisini verir:
| sonikator | Güc [W] | Növ | Həcm [mL] |
|---|---|---|---|
| UIP400MTP | 400 | mikroplitələr üçün | 6 – 3456 quyu | VialTweeter | 200 | 10 flakona qədər üstəgəl bərkidilmə imkanı | 0.5 – 1.5 |
| UP50H | 50 | zond tipli | 0.01 – 250 |
| UP100H | 100 | zond tipli | 0.01 – 500 |
| UP200Ht | 200 | zond tipli | 0.1 – 1000 |
| UP200 St | 200 | zond tipli | 0.1 – 1000 |
| UP400St | 400 | zond tipli | 5.0 – 2000 |
| kubok | 200 | CupHorn, sonoreaktor | 10 – 200 |
| GDmini2 | 200 | çirklənməsiz axın hüceyrəsi |
Bizimlə əlaqə saxlayın! / Bizdən soruşun!
Ultrasonik Kubok Horn zülal izolyasiyası və DNT-nin parçalanması üçün eyni şəraitdə çoxsaylı nümunələrin eyni vaxtda, yüksək effektiv nümunə hazırlığı üçün.
Fakt vərəqləri – Proteomika üçün Hielscher Sonicator Modelləri
Sonikasiya və Proteomika ilə bağlı Tez-tez verilən suallar
Sonikasiya disulfid bağlarını poza bilərmi?
Yüksək gücdə sonikasiya zülal çıxarılması zamanı kovalent bağları poza bilər. Bununla belə, sonikasiya nümunələrə uyğun olaraq idarə olunan güc səviyyələrində aparıldıqda. ulrasonication disulfid bağlarının qırılması ilə nəticələnməyəcəkdir. Buna görə amplituda, güc, vaxt və temperatur kimi ultrasəs proses parametrlərinə dəqiq nəzarət çox vacibdir. Hielscher sonicators sizə bu parametrlər üzərində tam nəzarəti verir.
Sonikasiya peptid bağlarını poza bilərmi?
Sonication bərk peptidləri daha kiçik hissəciklərə bölmək yolu ilə peptidlərin həll edilməsini artırmaq üçün təsirli bir üsuldur. Bununla belə, sonikasiyadan sonra peptid məhlulunda gelləşmə, bulanıqlıq və ya görünən flokulyasiyaların olması halında, bu, peptid yalnız məhlul matrisi daxilində dayandırıldığı halda, natamam həll olunduğunu göstərir.
Belə hallarda, tam həll edilməsinə nail olmaq üçün daha güclü bir həllediciyə ehtiyac yaranır. Əgər həll problem olaraq davam edərsə, siz uçucu bufer məhlulunu liyofilləşdirə və çıxara bilərsiniz. Sonradan, bu qurudulmuş nümunə peptidlərin həllolma qabiliyyətini artırmaq üçün alternativ həlledicilərin tədqiqinə imkan verir və beləliklə, optimal həlledici sisteminin müəyyən edilməsinə imkan verir.
Ədəbiyyat / İstinadlar
- Lindemann C, Lupilova N, Müller A, Warscheid B, Meyer HE, Kuhlmann K, Eisenacher M, Leichert LI. (2013): Redox proteomics uncovers peroxynitrite-sensitive proteins that help Escherichia coli to overcome nitrosative stress. Journal of Biological Chemistry 288(27); 2013. 19698-714.
- Gonçalo Martins, Javier Fernández-Lodeiro, Jamila Djafari, Carlos Lodeiro, J.L. Capelo, Hugo M. Santos (2019): Label-free protein quantification after ultrafast digestion of complex proteomes using ultrasonic energy and immobilized-trypsin magnetic nanoparticles. Talanta, Volume 196, 2019. 262-270.
- Andreas Hofmann, Bertran Gerrits, Alexander Schmidt, Thomas Bock, Damaris Bausch-Fluck, Rudolf Aebersold, Bernd Wollscheid (2010): Proteomic cell surface phenotyping of differentiating acute myeloid leukemia cells.
Blood, Volume 116, Issue 13; 2010. e26-e34. - Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 2011.
- Fic, E., Kedracka-Krok, S., Jankowska, U., Pirog, A. and Dziedzicka-Wasylewska, M. (2010): Comparison of protein precipitation methods for various rat brain structures prior to proteomic analysis. Electrophoresis, 31; 2020. 3573-3579.
- Manadas B.J., Vougas K., Fountoulakis M., Duarte C.B. (2006): Sample sonication after trichloroacetic acid precipitation increases protein recovery from cultured hippocampal neurons, and improves resolution and reproducibility in two-dimensional gel electrophoresis. Electrophoresis 27(9); 2006. 1825-1831.
- Pooreydy, B., Jafari, M., Tajik, F., Karimi, M., Rezaei-Tavirani, M., Ghassempour, A., Rezadoost, H., & Khodabandeh, M. (2013): Organelle Isolation for Proteomics: Mitochondria from Peripheral Blood Mononuclear Cells. Archives of Advances in Biosciences 4, 2013.
Hielscher Ultrasonics yüksək performanslı ultrasəs homogenizatorları istehsal edir laboratoriya üçün sənaye ölçüsü.