Mikrobiome Tədqiqat və Klinik Təhlil Sonication tərəfindən sadələşdirilmişdir
Sonication, yüksək məhsuldarlıqlı nümunə hazırlığını asanlaşdıran mikrobiom tədqiqatlarında və klinik analizdə geniş istifadə olunan güclü bir texnikadır. Ultrasəs metodu mikroorqanizmlər kimi mürəkkəb bioloji nümunələrin emalı üçün xüsusilə təsirlidir. Sonikasiyanın istifadəsi hüceyrə lizisini, nuklein turşularının, zülalların və metabolitlərin çıxarılmasını və təhlilini asanlaşdırır, mikrob icmalarını və onların sağlamlıq və xəstəlikdəki rollarını daha dərindən başa düşməyə imkan verir. Hielscher yüksək məhsuldarlıqlı sonikatorlar onların dəqiqliyi, səmərəliliyi və təkrarlana bilən nəticələri ilə məşhurdur və onları mikrobiom tədqiqatları üçün əla seçim edir.
Mikrobiom Tədqiqatında Yüksək Verimli Sonikasiyadan Yararlanın
96 quyu boşqab sonikatoru UIP400MTP yüksək məhsuldarlıqlı nümunə hazırlamaqla mikrobiom tədqiqatını asanlaşdırır
96 Quyu Plitəli Sonicator UIP400MTP ilə yüksək məhsuldarlıqlı nümunənin hazırlanması
Mikrobiom Tədqiqatında Sonikasiyanın Tətbiqləri
Effektiv Hüceyrə Lizisi
Sonikasiya qram-müsbət bakteriyalar və göbələklər kimi sərt hüceyrə divarları olanlar da daxil olmaqla mikrob hüceyrələrinin parçalanmasında yüksək effektivliyə malikdir. Ultrasəs dalğaları nümunədə kavitasiya qabarcıqları əmələ gətirir, bu qabarcıqlar çökür və açıq hüceyrə divarlarını və membranlarını qıran şok dalğaları yaradır. Bu proses hüceyrənin hərtərəfli pozulmasını və DNT, RNT və zülallar kimi hüceyrədaxili məzmunun səmərəli şəkildə sərbəst buraxılmasını təmin edir.
Nəzarət olunan DNT fraqmentasiyası
Növbəti nəsil ardıcıllığı kimi tətbiqlər üçün çox vaxt DNT-ni daha kiçik, vahid fraqmentlərə kəsmək lazımdır. Sonication tədqiqatçılara istədiyiniz ölçüdə DNT fraqmentlərini əldə etməyə imkan verən parçalanma prosesi üzərində dəqiq nəzarəti təmin edir. Bu nəzarət ardıcıllıq kitabxanalarının hazırlanması və yüksək keyfiyyətli ardıcıllıq məlumatlarının təmin edilməsi üçün vacibdir.
Təkmilləşdirilmiş Nümunə Homogenləşməsi
Mikrobiom tədqiqatlarında nümunələr çox vaxt müxtəlif mikroorqanizmlərin qarışığını ehtiva edir. Sonikasiya ardıcıl və təkrarlana bilən nəticələri təmin edərək, nümunə daxilində bu mikroorqanizmlərin vahid paylanmasına nail olmağa kömək edir. Bu homojenləşdirmə, mikrob bolluğunun müəyyən edilməsi və ya xüsusi metabolik fəaliyyətlərin ölçülməsi kimi dəqiq kəmiyyət təhlili üçün çox vacibdir.
Etibarlı metabolitlərin çıxarılması
Etibarlı metabolitlərin sonikasiya yolu ilə çıxarılması bioloji nümunələrdən kiçik molekulların təcrid edilməsi üçün metabolomikada geniş istifadə olunan texnikadır. Sonication hüceyrə membranlarını pozan, hüceyrədaxili metabolitlərin bir həllediciyə salınmasını asanlaşdıran mexaniki vibrasiyalardan istifadə edir. Bu üsul səmərəli, təkrar istehsal oluna bilən və müxtəlif nümunə növləri ilə uyğundur, bu da onu yüksək məhsuldarlıq və hədəflənmiş metabolomik tədqiqatlar üçün dəyərli alət edir. Ultrasəs metabolitlərinin çıxarılması haqqında daha çox oxuyun!
“Nəcis mikrobiom nümunələrinin vahid və ardıcıl bakterial lizisi üçün UIP400MTP sonikatorunuzdan istifadə edərək fantastik təcrübəmizə görə sizə təşəkkür etmək üçün yazıram. Biz yüksək ötürmə qabiliyyəti olan lizis texnologiyası üçün zərfi sıxışdırırıq və alətiniz bu tapşırığa çox uyğundur. Əsas məqamlardan bəziləri bunlardır:
- Əməliyyat asanlığı - alətdən istifadə etmək asandır və menyu seçimlərindən istifadə etməklə fərdiləşdirmə sadədir
- Yüksək ötürmə qabiliyyəti - bir anda 96 nümunə ilə plitələrlə işləmək üçün əladır
- Bütün gəmilərin hətta sonikasiyası - cihaz bizim tətbiqimiz üçün çox vacib olan bütün quyulara eyni miqdarda sonikasiya verə bildi.
- Hielscher komandasının dəstəyi - dəstək əla idi, siz hər zaman məşqdə yanımızda oldunuz, suallarımızı cavablandırdınız və problemlərimizi həll etdiniz, məqsədimizə çatmağımıza kömək edən təkliflərlə.
Protokollarımızı optimallaşdırmaq üçün işləyərkən köməyinizə və köməyinizə görə bir daha təşəkkür edirik.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Baş elmi işçi – Intus Biosciences
Mikrobiomun Tədqiqi və Diaqnostikasında Sonication Necə Tətbiq olunur?
Metabolomika, metagenomika və metaproteomika mikrobiom tədqiqatlarında bir-birinə bağlıdır, çünki onlar birlikdə mikrob icmaları və onların funksiyaları haqqında hərtərəfli anlayışı təmin edirlər. Lizis, zülalların təmizlənməsi və DNT / RNT fraqmentasiyası 96 quyu boşqab sonikatoru UIP400MTP-dən istifadə etməklə sadələşdirilmiş nümunə hazırlama mərhələləridir.
Metabolomika və Metabolom Analizi
Metabolomika bioloji sistem daxilində kiçik molekullu metabolitlərin sistematik tədqiqini əhatə edir. Mikrobiom tədqiqatlarında sonikasiya mikrob hüceyrələrini parçalamaq, hüceyrədaxili metabolitləri buraxmaq üçün istifadə olunur. Yüksək nümunə nömrələri 96 quyu boşqab sonikatoru UIP400MTP istifadə edərək tez emal edilə bilər. Çıxarılan metabolitlər daha sonra kütlə spektrometriyası (MS) və nüvə maqnit rezonans (NMR) spektroskopiyası kimi qabaqcıl üsullardan istifadə edilməklə kəmiyyəti müəyyən edilir. Nəticədə əldə edilən məlumatlar mikrobiomun metabolik vəziyyətinin şəklini təqdim edir, biokimyəvi fəaliyyətlər və mikrob icmaları daxilində qarşılıqlı əlaqələr haqqında anlayışları ortaya qoyur.
Metagenomika və Metatranskriptomiya
Metagenomika ətraf mühit nümunələrindən birbaşa əldə edilən genetik materialın hərtərəfli təhlilini əhatə edir. Sonikasiya yüksək keyfiyyətli DNT çıxarmaq üçün mikrob hüceyrələrini parçalayaraq bu prosesdə həlledici rol oynayır, daha sonra mövcud mikrob növlərini müəyyən etmək və kəmiyyətini müəyyən etmək üçün ardıcıllıqla. Metatranskriptomikada RNT müxtəlif mikrob icmalarında gen ifadə profillərini öyrənmək üçün oxşar sonikasiya üsullarından istifadə etməklə çıxarılır. DNT və RNT ardıcıllığı üçün nuklein turşuları müəyyən baza cüt uzunluğuna qədər parçalanmalıdır. Bütün bu tapşırıqlar UIP400MTP yüksək məhsuldarlıqlı sonikator tərəfindən etibarlı və tez yerinə yetirilir!
proteomika
Proteomik analizlər mikrob hüceyrələrindən zülalların çıxarılmasını tələb edir. Sonication, zülalları məhlula buraxaraq, hüceyrələri pozmaq üçün effektiv şəkildə istifadə olunur. Bu zülallar daha sonra mikrobiomdakı funksional rollarını və metabolik yollarda iştirakını başa düşmək üçün təmizlənə və təhlil edilə bilər. UIP400MTP çox quyulu boşqab sonikatoru ilə siz mikrob icmalarında zülallar tərəfindən idarə olunan bioloji proseslərə dair fikirlər əldə etmək üçün təkrarlana bilən nəticələr yaradaraq, bir neçə dəqiqə ərzində liziz və zülal çıxarılması tapşırığını yerinə yetirə bilərsiniz.
metaproteomika
Metaproteomika mikrobioma daxilində funksional ifadə və qarşılıqlı əlaqəni anlamaq üçün kollektiv zülal tərkibini öyrənərək proteomik analizi bütün mikrob icmalarına genişləndirir. Sonication hüceyrələri lizis etmək, zülalları sərbəst buraxmaq üçün istifadə olunur, sonra təmizlənir və kütləvi spektrometriya kimi üsullarla təhlil edilir. Bu yanaşma müxtəlif mühitlərdə mikrob icmalarının aktiv bioloji prosesləri və uyğunlaşmaları haqqında ətraflı məlumat verir.
UIP400MTP çox quyulu boşqab sonikatorunun yüksək məhsuldarlıqlı emal gücündən faydalanın və mikrobiom tədqiqatınızı və təhlilinizi asanlaşdırın!
UIP400MTP yüksək məhsuldarlıqlı sonikator çox quyulu boşqablarda, 96 quyu boşqablarda, borularda və Petri qablarında mikrobiom tədqiqatları üçün.
Mikrobiom diaqnostikasında yüksək məhsuldarlıqlı nümunənin hazırlanması üçün UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator.
Çox quyulu boşqab sonikatoru UIP400MTP, məsələn, mikrobiomun tədqiqi və diaqnostikasında yüksək məhsuldarlıqlı nümunənin hazırlanmasını asanlaşdırır.
96 quyu boşqab sonikatoru UIP400MTP: Ultrasəs ötürücü maye bütün quyuları əhatə edir və hər bir nümunənin vahid sonikasiyasını təmin edir.
UIP400MTP Çox Quyu Plitə Sonicatorunun Əsas Xüsusiyyətləri
| Yüksək Verimli Sonikasiya | 96 quyu və digər çoxqulu plitələr üçün mükəmməl uyğunlaşdırılmış UIP400MTP birdən çox nümunənin eyni vaxtda, eyni sonikasiyasına imkan verir, nümunənin hazırlanması müddətini əhəmiyyətli dərəcədə qısaldır və yüksək nümunə sayı testinin məhsuldarlığını artırır. |
| Seçdiyiniz Çoxquyulu Plakadan istifadə edin | UIP400MTP istənilən standart çoxqulu plitələrin, PCR lövhələrinin və ya mikrotiter plitələrin sonikasiya edilməsi üçün nəzərdə tutulmuşdur. Təcrübələriniz üçün ən uyğun boşqab seçirsiniz. UIP400MTP xüsusi istehlak materiallarını tələb etmədiyi üçün bu, sizə çoxlu pula qənaət edir! |
| Kontaktsız ultrasəs | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP nümunəyə heç bir şey daxil etmədən intensiv ultrasəs tətbiq edir. Ealed çoxqulu plitələri, qapalı qabları və flakonları sonikləşdirə bilərsiniz. Hielscher sizə hər hansı qeyri-standart flakon və ya qablar üçün xüsusi hazırlanmış nümunə sahibləri təqdim edir. |
| Dəqiqlik və Nəzarət | Dəqiq nəzarət və ağıllı proqram ultrasəs parametrlərini xüsusi emal ehtiyaclarınıza optimal şəkildə uyğunlaşdırmağa imkan verir. Siz hər bir sınaq üçün maksimum sonication səmərəliliyi və effektivliyi əldə edirsiniz. |
| Temperatur nəzarəti | Sonikasiya üçün xüsusi bir temperatur təyin edin. UIP400MTP nömrəli sonikator nümunənin temperaturunu izləyə və sonikasiyanı müvafiq olaraq tənzimləyə bilər. Sirkulyasiya edən soyuducu maye, dəqiq temperatur nəzarəti üçün boşqabdakı hər quyunu soyuyur. |
| Protokollaşdırma və Uzaqdan İdarəetmə | Hər sonication run bir kompüter nəzarət edilə bilər. Proqram təminatının quraşdırılmasına ehtiyac yoxdur. UIP400MTP-ni uzaqdan idarə etmək və izləmək üçün istənilən əməliyyat sistemində (məsələn, MacOS, Windows, Android, iOS və ya Linux) standart brauzerinizdən (məsələn, Chrome, Firefox, Edge və ya Safari) istifadə edə bilərsiniz. Hər bir sonication run qiymətləndirmə və sənədlər üçün ətraflı sonication protokolu istehsal edir. Protokol faylı qeyri-mülkiyyət CSV formatındadır və onu seçdiyiniz proqramla, məsələn, Microsoft Excel, Apple Nömrələri və ya OpenOffice Calc ilə aça bilərsiniz. |
| Möhkəm və Etibarlı | Almaniyada ən yüksək keyfiyyət standartlarına uyğun dizayn edilmiş və tikilmiş UIP400MTP təkcə güclü deyil, həm də olduqca davamlıdır. Onun dizaynı sənaye standartlarına cavab verir və tələbkar laboratoriya mühitində gündəlik istifadənin çətinliyinə asanlıqla dözür. UIP400MTP-ni yüksək məhsuldarlıqlı əməliyyatlarda davamlı olaraq 24 saat, həftədə 7 gün istifadə edə bilərsiniz. |
- yüksək səmərəlilik
- ən müasir texnologiya
- etibarlılıq & möhkəmlik
- tənzimlənən, dəqiq proses nəzarəti
- ağıllı proqram təminatı
- ağıllı funksiyalar (məsələn, proqramlaşdırıla bilən, məlumatların protokollaşdırılması, uzaqdan idarəetmə)
- idarə etmək asan və təhlükəsizdir
- aşağı təmir
- CIP (yerində təmiz)
Dizayn, İstehsalat və Konsaltinq – Keyfiyyətli Almaniya istehsalı
Hielscher ultrasəs cihazları ən yüksək keyfiyyət və dizayn standartları ilə tanınır. Sağlamlıq və asan əməliyyat ultrasəs aparatlarımızın sənaye obyektlərinə rahat inteqrasiyasına imkan verir. Kobud şərtlər və tələbkar mühitlər Hielscher ultrasəs cihazları tərəfindən asanlıqla idarə olunur.
Hielscher Ultrasonics, ISO sertifikatlı bir şirkətdir və ən müasir texnologiya və istifadəçi dostu olan yüksək performanslı ultrasəs cihazlarına xüsusi diqqət yetirir. Əlbəttə ki, Hielscher ultrasəs cihazları CE-yə uyğundur və UL, CSA və RoHs tələblərinə cavab verir.
Təmassız sonikator UIP400MTP mikrobiom nümunəsinin çox quyulu lövhələrdə hazırlanması üçün.
Ədəbiyyat / İstinadlar
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- InfoGraphic UIP400MTP – 96-well plate Ultrasonicator for High-Throughput Sample Prep – english – Hielscher Ultrasonics
- Jannike L. Krause, Sven-Bastiaan Haange, Stephanie S. Schäpe, Beatrice Engelmann, Ulrike Rolle-Kampczyk, Katarina Fritz-Wallace, Zhipeng Wang, Nico Jehmlich, Dominique Türkowsky, Kristin Schubert, Judith Pöppe, Katrin Bote, Uwe Rösler, Gunda Herberth, Martin von Bergen (2020): The glyphosate formulation Roundup® LB plus influences the global metabolome of pig gut microbiota in vitro. Science of The Total Environment, Volume 745, 2020.
- Tröscher-Mußotter, Johanna; Sáenz, Johan; Grindler, Sandra; Meyer, Jennifer; Kononov, Susanne; Mezger, Beate; Borda, Daniel; Frahm, Jana; Dänicke, Sven; Camarinha-Silva, Amelia; Huber, Korinna; Seifert, Jana (2021): Microbiome Clusters Disclose Physiologic Variances in Dairy Cows Challenged by Calving and Lipopolysaccharides. mSystems 2021.
- Jannike Lea Krause, Beatrice Engelmann, Stephanie Serena Schaepe, Ulrike Rolle-Kampczyk, Nico Jehmlich, Hyun-Dong Chang, Ulla Slanina, Maximillian Hoffman, Jörg Lehmann, Ana Claudia Zenclussen, Gunda Herberth, Martin von Bergen, Sven-Bastiaan Haange (2024): DSS treatment does not affect murine colonic microbiota in absence of thehost. Gut Microbes 2024.
Mikrobiom Tədqiqatları haqqında Tez-tez verilən suallar
Sonication bakteriyalara nə edir?
Sonikasiya yüksək tezlikli səs dalğalarından istifadə edərək bakteriya hüceyrələrini pozur, şok dalğaları və mexaniki qüvvələr yaradan kavitasiyaya səbəb olur, hüceyrə lizisinə və hüceyrədaxili məzmunun sərbəst buraxılmasına səbəb olur.
Mikrobiomları öyrənmək üçün hansı üsullardan istifadə olunur?
Mikrobiomları öyrənmək üsullarına 16S rRNA gen ardıcıllığı və metagenomika kimi DNT ardıcıllığı üsulları, həmçinin mikrob funksiyalarını və qarşılıqlı təsirləri təhlil etmək üçün transkriptomika, proteomika və metabolomika daxildir. Yaradılan geniş məlumatları şərh etmək üçün bioinformatika alətləri istifadə olunur.
Mikrobiom Analizində istifadə olunan Texnikalar hansılardır?
Mikrobiom analizində istifadə olunan üsullara taksonomik profilləşdirmə üçün 16S rRNA gen ardıcıllığı, hərtərəfli genetik analiz üçün metagenomik ardıcıllıq, gen ifadəsini öyrənmək üçün metatranskriptomika, zülalları təhlil etmək üçün metaproteomika və metabolik məhsulları müəyyən etmək üçün metabolomika daxildir. Bioinformatika vasitələri məlumatların işlənməsi və şərhi üçün vacibdir.
Mikrobiom tədqiqatında metabolomika, metagenomika və metaproteomika nədir?
Mikrobiom tədqiqatlarında metabolomika mikroblar tərəfindən istehsal olunan kiçik molekulları və metabolitləri təhlil edərək, onların metabolik fəaliyyətləri haqqında məlumat verir. Metagenomika mikrob icmalarının genetik tərkibini və funksional potensialını başa düşmək üçün onların kollektiv genomlarının ardıcıllığını nəzərdə tutur. Metaproteomika mikrobiomun bütün protein tərkibini öyrənir, genlərin funksional ifadəsini və zülalların mikrob icmasında oynadığı rolları aşkar edir.
Mikrobiom tədqiqatında bakteriya koloniyaları nədir?
Mikrobiom tədqiqatlarında bakteriya koloniyaları, görünən çoxluqlar meydana gətirən, bərk böyümə mühitində tək və ya bir neçə hüceyrədən yetişdirilən bakteriya qruplarıdır. Bu koloniyalar mikrob icması daxilində spesifik bakteriya ştammlarının xüsusiyyətlərini, müxtəlifliyini və funksiyalarını öyrənmək üçün istifadə edilən klonal populyasiyaları təmsil edir.
Hielscher Ultrasonics yüksək performanslı ultrasəs homogenizatorları istehsal edir laboratoriya üçün sənaye ölçüsü.