Next Gen Sequencing üçün ultrasəs DNT fraqmentasiyası
Next Generation Sequencing (NGS) genomik DNT zəncirlərini ardıcıllaşdırmaq və genom kitabxanalarını yaratmaq üçün genomik DNT-nin etibarlı kəsilməsini və parçalanmasını tələb edir. DNT-nin DNT fraqmentlərinə nəzarət edilən fraqmentasiyası DNT-nin ardıcıllaşdırılmasından əvvəl tələb olunan vacib nümunə hazırlama mərhələsidir. Ultrasonication müəyyən uzunluqda DNT parçalanması üçün effektiv və etibarlı texnika kimi sübut edilmişdir. Ultrasonik DNT parçalanma protokolları təkrarlana bilən parçalanma nəticələrinə nail olur. Hielscher ultrasonicators genomik DNT fraqment ölçüsü paylanması geniş istehsal qadirdir, əməliyyat parametrləri vasitəsilə dəqiq nəzarət. Hielscher ultrasəs DNT kəsmə sistemləri tək və çoxlu flakonlar, eləcə də mikroplitələr üçün mövcud olduğundan, nümunənin hazırlanması yüksək səmərəli olur.
UIP400MTP Plitə Sonicatoru yüksək məhsuldarlıqlı nümunə hazırlamaq üçün nümunələri çoxlu, mikrotitr lövhələrdə və 96 quyu boşqablarda bərabər şəkildə sonikləşdirir
- təkrarlana bilən / təkrarlana bilən nəticələr
- müəyyən fraqment uzunluğunu əldə etmək üçün dəqiq tənzimlənə bilər
- Sürətli emal
- ardıcıl DNT parçalanması nəticələri
- istənilən nümunə həcmi üçün cihazlar (məsələn, çoxlu flakonlar və ya mikroplitələr)
- yüksək ötürmə qabiliyyəti
- dəqiq temperatur nəzarəti
- sadə, istifadəçi dostu əməliyyat
Next-Gen Sequencing: Kitabxana Hazırlanması üçün Ultrasəs DNT Fragmentasiyası
Növbəti nəsil ardıcıllığını həyata keçirmək üçün (1) kitabxananın hazırlanması, (2) ardıcıllığın və (3) məlumatların təhlilinin üç əsas addımı yerinə yetirilməlidir. Kitabxananın hazırlanması zamanı DNT parçalanır, daha sonra fraqmentin ucları tək adenin bazası əlavə edilərək təmir edilir (cilalanır) və hədəf fraqmentlər cüt zəncirli DNT-yə çevrilir. Nəhayət, adlanan adapterlər ligasiya, PCR və ya etiketləmə yolu ilə bağlanır ki, son kitabxana DNT məhsulu ardıcıllıq üçün kəmiyyətcə ölçülə bilsin.
Sonication istifadə edərək DNT fraqmentasiyası: Xüsusilə daha uzun DNT fraqmentlərini asanlıqla oxuya bilməyən Illumina kimi qısa oxunan ardıcıllıq texnologiyaları zamanı DNT stendləri ultrasəslə etibarlı şəkildə əldə edilə bilən müəyyən ölçüyə parçalanmalıdır.
Ultrasonication etibarlı şəkildə DNT, RNT və xromatinin parçalanması üçün istifadə edilə bilər.
Next Gen Sequencing – kitabxananın hazırlanması
Ultrasonik DNT fraqmentasiyası adətən yeni nəsil ardıcıllıq (NGS) platformaları üçün DNT sıralama kitabxanalarının hazırlanmasında istifadə olunur. Bu texnika DNT molekullarını istədiyiniz ölçü diapazonunda daha kiçik fraqmentlərə parçalamaq üçün istifadə olunur ki, bu da kitabxananın hazırlanmasında sonrakı addımları asanlaşdırır. Ultrasəs DNT fraqmentasiyası adətən NGS iş axınlarının kitabxana hazırlığı mərhələsində genomik DNT-ni aşağı axın emal və ardıcıllıq üçün uyğun olan daha kiçik parçalara bölmək üçün tələb olunur. İstifadə olunan xüsusi ardıcıllıq platforması üçün uyğun ölçü diapazonunda DNT fraqmentləri yaratmaqla ardıcıllıq təcrübəsinin müvəffəqiyyətinin təmin edilməsində həlledici rol oynayır.
E. coli EDL933-ün genomik DNT-nin elektroforetik analizləri 0 – 15 dəqiqə ultrasəslənməyə məruz qalır. L DNT nərdivanını göstərir. (Basselet et al. 2008)
Növbəti nəsil ardıcıllığı – Proses Addımları:
- Ultrasonik DNT fraqmentasiyası: Kitabxana tikilməzdən əvvəl genomik DNT daha kiçik, daha idarə oluna bilən parçalara bölünür. Ultrasonik parçalanma, DNT molekullarını istədiyiniz ölçü diapazonunda fraqmentlərə kəsmək üçün yüksək tezlikli səs dalğalarından istifadə etməyi əhatə edir. Bu addım çox vacibdir, çünki o, sonradan yaradılan ardıcıllığın oxunuşlarının istifadə olunan ardıcıllıq platforması üçün uyğun uzunluqda olmasını təmin etməyə kömək edir. Fraqmentlərin ölçü diapazonu ardıcıllıq təcrübəsinin xüsusi tələblərinə əsasən tənzimlənə bilər.
- PCR ilə klonal gücləndirmə: Ultrasonik parçalanmadan sonra DNT fraqmentləri son təmir, adapter bağlaması və son DNT ardıcıllıq kitabxanalarını yaratmaq üçün PCR gücləndirilməsindən keçir. Bu addımlar sekvensləşdirmə platformasına bağlanmaq üçün lazım olan adapter ardıcıllıqlarını əlavə etməklə və PCR gücləndirilməsi üçün hazırlıq yerlərini təmin etməklə, parçalanmış DNT molekullarını ardıcıllıq prosesi üçün hazırlayır.
- Sintez yolu ilə DNT ardıcıllığı: Ardıcıllıq kitabxanaları hazırlandıqdan sonra sintez yolu ilə DNT ardıcıllığı (SBS) prosesi başlayır. SBS zamanı DNT ardıcıllığı tamamlayıcı zəncirdə nukleotidlərin ardıcıl əlavə edilməsi ilə müəyyən edilir. Bu addım daxil edilmiş nukleotidlərin yaydığı flüoresan siqnallara əsaslanaraq DNT ardıcıllığını təyin etməyə imkan verən nukleotidlərin birləşdirilməsi, görüntülənməsi və parçalanmasının siklik reaksiyalarını əhatə edir.
- Kütləvi Paralel Sıralama: Son mərhələdə, məkan olaraq ayrılmış, gücləndirilmiş DNT şablonları eyni vaxtda kütləvi şəkildə paralel şəkildə sıralanır. Bu yüksək məhsuldarlıqlı sekvensləşdirmə yanaşması, DNT ardıcıllığının səmərəli və sürətli müəyyənləşdirilməsinə imkan verərək, tək ardıcıllıqda milyonlarla milyardlarla ardıcıl oxunuş yaratmağa imkan verir.
Ultrasonik DNT fraqmentasiyası necə işləyir?
Akustik nümunə emalı kimi də tanınan sonication, DNT-ni parçalamaq üçün geniş istifadə olunan bir üsuldur. Ultrasəs DNT kəsimi üçün nümunələr nəzarət altında olan ultrasəs dalğalarına məruz qalır. Ultrasəs DNT parçalanmasının iş prinsipi ultrasəs dalğalarının yaratdığı vibrasiya və kavitasiyaya əsaslanır. Ultrasəs (akustik) kavitasiya nəticəsində yaranan kəsmə qüvvələri yüksək molekulyar ağırlıqlı DNT molekullarını qırır. İntensivlik (amplituda, müddət), pulsasiya rejimi və temperatur kimi sonication qəbulu DNT fraqmentlərinin müəyyən istənilən uzunluğuna qədər dəqiq DNT fraqmentasiyasına imkan verir. Ultrasəsləmə ilə DNT tez-tez 100-dən 600 bp-ə endirilirsə də, daha yumşaq ultrasəs şəraiti tətbiq edildikdə 1300 bp-ə qədər daha uzun DNT fraqmentləri əldə edilə bilər.
ChIP zamanı ultrasəs DNT kəsimi – xromatinin immunopresipitasiyası
CC-BY-SA.03 altında Jkwchui-dən uyğunlaşdırılmışdır
DNT deqradasiyasının qarşısını almaq üçün temperatur nəzarəti
DNT-nin ikiqat zəncirli molekulyar forması yüksək temperaturlara çox həssasdır, belə ki, nümunə hazırlama mərhələləri zamanı temperatur üzərində dəqiq nəzarət etibarlı analiz nəticələri üçün mühüm amildir.
Hielscher-in ultrasəs aparatlarından, VialTweeter və ya UIP400MTP-dən istifadə etməyinizdən asılı olmayaraq – qoşula bilən temperatur sensoru və smart cihaz proqramı sayəsində davamlı temperatur monitorinqi və nəzarəti təmin edilir. Müəyyən bir diapazonda temperatur saxlamaq üçün yuxarı və aşağı temperatur həddini təyin edə bilərsiniz. Nəticə etibarilə, ultrasəs cihazı bu temperatur həddi keçdikdən sonra fasilə verəcək və temperatur müəyyən edilmiş ∆T qədər aşağı salındıqda avtomatik olaraq sonikasiya etməyə davam edəcək.
Hielscher ultrasəs cihazının mürəkkəb proqramı ideal nümunə müalicə şəraitinin etibarlı saxlanmasını təmin edir.
UIP400MTP Çox Quyu Plitə Ultrasonikatoru ilə Kütləvi Nümunə DNT Parçalanması
Həyat elmində nümunələrin sayı son on ildə əhəmiyyətli dərəcədə artmışdır. Bu o deməkdir ki, müqayisə edilə bilən və etibarlı nəticələr əldə etmək üçün nümunənin hazırlanması və təhlili zamanı çox yüksək sayda nümunələr (məsələn, 384, 1536 və ya 3456 quyu) ardıcıl olaraq bərabər şəraitdə işlənməlidir. UIP400MTP ilə Hielscher Ultrasonics kütləvi nümunə emal tendensiyasını izləyir. UIP400MTP mikroplitələrdən istifadə edərək nümunə hazırlamaq üçün ultrasəs cihazıdır. UIP400MTP 6, 12, 24, 48, 96, 384, 1536 və ya 3456 quyu ilə lövhələri emal edə bilər. Mikroplatin növündən asılı olaraq, hər bir quyu adətən onlarla nanolitrdən bir neçə millilirə qədər nümunə həcmlərini saxlaya bilir. Həyat elmi tədqiqatlarında geniş şəkildə istifadə edilən UIP400MTP, ELISA (fermentlə əlaqəli immunosorbent analizi) və ya PCR kimi analizlərdən əvvəl, zülal analitikasından əvvəl, həmçinin CHiP və CHiP-seq, histon modifikasiyasından əvvəl xromatinin hazırlanması üçün çox geniş istifadə olunur. identifikasiya və digər analitik müalicələr (məsələn, gel elektroforezi, kütləvi spektrometriya).
PCR plitələrinin yüksək məhsuldarlıqlı emalı haqqında daha çox oxuyun!
10 flakona qədər nümunənin hazırlanması üçün VialTweeter
VialTweeter eyni vaxtda 10 flakonun effektiv və rahat sonikasiyasına imkan verən geniş istifadə olunan laboratoriya ultrasəs cihazı VialTweeterdir. Flakonlar və sınaq boruları (məsələn, Eppendorf flakonları, krio flakonlar, sentrifuqa boruları) dolayı yolla sonikləşdirildiyi üçün hər hansı çarpaz çirklənmənin qarşısı alınır. Eyni ultrasəs intensivliyi hər bir nümunəyə çatdırıldığından, bütün sonikasiya nəticələri homojen və təkrarlana bilir. VialTweeter, digər rəqəmsal cihazlarımız (məsələn, ağıllı menyu, proqramlaşdırıla bilən parametrlər, temperatur nəzarəti, uzaqdan idarəetmə və s.) kimi bütün ağıllı funksiyaları təklif edir ki, istifadəçinin ən yüksək rahatlığı təmin edilir.
Mikroqulu Plitələr üçün Çoxbarmaqlı Zondlar
Ultrasonik zond homogenizatorları UP200Ht və UP200St üçün mövcuddur, 4 və ya 8 barmaqlı çoxbarmaqlı zondlar eyni şəraitdə eyni vaxtda birdən çox nümunəni sonikasiya etmək üçün rahat seçimdir. Məsələn, sonotrode MTP-24-8-96, avtomatlaşdırılmış sistemlərə inteqrasiya və ya çox quyulu lövhələrin quyularının səmərəli əl ilə nümunə hazırlanması üçün ideal olan səkkiz barmaqlı zonddur. Çox barmaqlı sonotrode, standart ultrasəs sonotrodu istifadə edərək, əsasən beakers və sınaq borularının işləndiyi laboratoriyalar üçün avtomatlaşdırılmış üçün idealdır. Çoxbarmaqlı və standart zondlar bir neçə dəqiqə ərzində sürətlə dəyişdirilə bilər və tək zondlu ultrasəs cihazı çox problu ultrasəs pozucuya çevirir.
DNT fraqmentasiyası üçün Hielscher Ultrasonicators
Hielscher Ultrasonics DNT, RNT və xromatin parçalanması üçün müxtəlif ultrasəs əsaslı platformalar təklif edir. Bu müxtəlif platformalara ultrasəs zondları (sonotrotlar), çoxsaylı boruların və ya çox quyulu lövhələrin (məsələn, 96 quyulu lövhələr, mikrotiter lövhələr), sonoreaktorların və ultrasəs kuboklarının eyni vaxtda nümunə hazırlanması üçün dolayı sonikasiya həlləri daxildir. DNT-nin kəsilməsi üçün bütün platformalar dəqiq idarə olunan və təkrarlana bilən nəticələr verən, tezliyə uyğunlaşdırılmış, yüksək performanslı ultrasəs prosessorları ilə təchiz edilmişdir.
İstənilən Nümunə Sayı və Ölçü üçün Ultrasəs Prosessorları
Hielscher-in çox nümunəli ultrasəs aparatları VialTweeter (10-a qədər sınaq borusu üçün) və UIP400MTP (mikroplitələr/çoxqulu boşqablar üçün) ilə istənilən DNT fraqment ölçüsü paylanmasını və məhsuldarlığını əldə edərkən intensiv və dəqiq idarə olunan ultrasəsləmə sayəsində nümunənin emal vaxtını azaltmaq asan olur. . Ultrasəs DNT fraqmentasiyası nümunənin hazırlanmasını səmərəli, etibarlı və miqyaslı edir. Protokollar davamlı olaraq idarə olunan ultrasəs tətbiq etməklə birdən çoxsaylı nümunələrə xətti olaraq miqyaslana bilər.
Birdən beş barmağı olan zond ultrasəs cihazları daha kiçik nümunə nömrələrinin hazırlanması üçün idealdır. Hielscher-in laboratoriya ultrasəs aparatları müxtəlif ölçülərdə mövcuddur ki, biz sizə tətbiqiniz və tələbləriniz üçün ideal cihazı tövsiyə edə bilək.
dəqiq proses nəzarəti
Dəqiq idarə oluna bilən sonikasiya parametrləri çox vacibdir, çünki tam səslənmə DNT, RNT və xromatini məhv edə bilər, lakin qeyri-adekvat ultrasəs kəsmə çox uzun DNT və xromatin fraqmentləri ilə nəticələnir. Hielscher rəqəmsal ultrasəs cihazları asanlıqla dəqiq sonication parametrinə təyin edilə bilər. Xüsusi sonication parametrləri eyni prosedurun sürətli təkrarlanması üçün proqramlaşdırılmış parametr kimi də saxlanıla bilər.
Bütün sonikasiya avtomatik olaraq protokollaşdırılır və daxili SD kartda CSV faylı kimi saxlanılır. Bu, yerinə yetirilən sınaqların dəqiq sənədləşdirilməsinə imkan verir və sonikasiya işlərini asanlıqla nəzərdən keçirməyə imkan verir.
Brauzerin uzaqdan idarə edilməsi vasitəsilə bütün rəqəmsal ultrasəs cihazları istənilən standart brauzer vasitəsilə idarə oluna və izlənilə bilər. Əlavə proqram təminatının quraşdırılması tələb olunmur, çünki LAN bağlantısı çox sadə plug-n-play quraşdırmasına imkan verir.
Ultrasəs Nümunəsinin Hazırlanmasında Ən Yüksək İstifadəçi Dostluğu
Bütün Hielscher ultrasəs cihazları yüksək performanslı ultrasəs çatdırmaq üçün nəzərdə tutulmuşdur, eyni zamanda həmişə çox istifadəçi dostu və istifadəsi asan olur. Bütün parametrlər rəngli sensor displey və ya brauzerin uzaqdan idarəsi vasitəsilə asanlıqla əldə edilə bilən aydın menyuda yaxşı qurulmuşdur. Proqramlaşdırıla bilən parametrlərə və avtomatik məlumat qeydinə malik ağıllı proqram etibarlı və təkrarlana bilən nəticələr üçün optimal sonikasiya parametrlərini təmin edir. Təmiz və istifadəsi asan menyu interfeysi Hielscher ultrasəs cihazlarını istifadəçi dostu və səmərəli cihazlara çevirir.
Aşağıdakı cədvəl DNT və RNT fraqmentasiyası, hüceyrə lizisi və həmçinin zülalların çıxarılması kimi nümunə hazırlama işləri üçün ideal olan laboratoriya ultrasəs aparatlarımızın təxmini emal qabiliyyətinin göstəricisini verir:
| Cihaz | Güc [W] | Növ | Həcm [mL] |
|---|---|---|---|
| UIP400MTP | 400 | mikroplitələr üçün | 6 – 3456 quyu | VialTweeter | 200 | 10 flakona qədər üstəgəl bərkidilmə imkanı | 0.5 – 1.5 |
| UP50H | 50 | zond tipli | 0.01 – 250 |
| UP100H | 100 | zond tipli | 0.01 – 500 |
| UP200Ht | 200 | zond tipli | 0.1 – 1000 |
| UP200 St | 200 | zond tipli | 0.1 – 1000 |
| UP400St | 400 | zond tipli | 5.0 – 2000 |
| kubok | 200 | CupHorn, sonoreaktor | 10 – 200 |
| GDmini2 | 200 | çirklənməsiz axın hüceyrəsi |
Bizimlə əlaqə saxlayın! / Bizdən soruşun!
Ultrasəs çox nümunəli hazırlama qurğusu VialTweeter 10 flakonun eyni vaxtda sonikasiyasına imkan verir. Bağlayıcı VialPress cihazı ilə intensiv sonikasiya üçün 4-ə qədər əlavə boru ön tərəfə sıxışdırıla bilər.
MTP-24-8-96 sonotrode mikrotiter plitələrin quyularının sonikasiyası üçün səkkiz ultrasəs zonduna malikdir.
Ədəbiyyat / İstinadlar
- Qiyun Liang, Christoph Ratzke (2025): Lysing diverse bacteria with the Hielscher UIP400MTP for DNA sequencing. Protocol Uni Tübingen 2025.
- Poptsova, M., Il’icheva, I., Nechipurenko, D. et al. (2014): Non-random DNA fragmentation in next-generation sequencing. Scientific Reports 4, 4532; 2014.
- Basselet P., Wegrzyn G., Enfors S.-O., Gabig-Ciminska M. (2008): Sample processing for DNA chip array-based analysis of enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC). Microbial Cell Factories 7:29. 2008.
- Doublier S., Riganti Ch., Voena C., Costamagna C., Aldieri E., Pescarmona G., Ghigo D., Bosia A. (008): RhoA Silencing Reverts the Resistance to Doxorubicin in Human Colon Cancer Cells. Molecular Cancer Research 6(10), 2008.
- Fredlund E., Gidlund A., Olsen M., Börjesson T., Spliid N.H.H., Simonsson M. (2008): Method evaluation of Fusarium DNA extraction from mycelia and wheat for down-stream real-time PCR quantification and correlation to mycotoxin levels. Journal of Microbiological Methods 2008.
- Fritsche C., Sitz M., Weiland N., Breitling R., Pohl H.-D. (2007): Characterization of the growth behavior of Leishmania tarentolae – a new expression system for recombinant proteins. Journal of Basic Microbiology 47, 2007. 384–393.
- Ristola M., Arpiainen S., Saleem M. A., Mathieson P. W., Welsh G. I., Lehtonen S., Holthöfer H. (2009): Regulation of Neph3 gene in podocytes – key roles of transcription factors NF-κB and Sp1. BMC Molecular Biology 10:83, 2009.
- Rodriguez J., Vives L., Jorda M., Morales C., Munoz M., Vendrell E., Peinado M. A. (2008): Genome-wide tracking of unmethylated DNA Alu repeats in normal and cancer cells. Nucleic Acids Research Vol. 36, No. 3, 2008. 770-784.
- Weiske J. Huber O. (2006): The Histidine Triad Protein Hint1 Triggers Apoptosis Independent of Its Enzymatic Activity. The Journal of Biological chemistry. Vol. 281, No. 37, 2006. 27356–27366.
Bilməyə Dəyər Faktlar
Next Generation Sequencing nədir?
Növbəti nəsil Sequencing, həmçinin Next Gen Sequencing (NGS), yüksək məhsuldarlıq ardıcıllığı və ya ikinci nəsil sekvensiya, eyni vaxtda paralel olaraq milyonlarla fraqmentdən ibarət çox böyük (kütləvi) miqdarda DNT-nin ardıcıllıqla sıralandığı kütləvi paralel ardıcıllığın yanaşmasına aiddir. qaçış başına.
Növbəti nəsil ardıcıllığını həyata keçirmək üçün üç əsas addım
- kitabxananın hazırlanması,
- ardıcıllıq və
- məlumatların təhlili
tələb olunur.
Kitabxananın hazırlanması zamanı DNT zəncirləri müəyyən uzunluqdakı DNT fraqmentlərinə parçalanmalıdır. Sonikasiya DNT-ni parçalamaq üçün üstünlük verilən üsullardan biridir.
DNT-nin ardıcıllığı prosesi zamanı DNT-də nukleotidlərin sırası – nuklein turşusu ardıcıllığı kimi tanınan – müəyyən edilir. Nuklein turşusu ardıcıllığı dörd nukleotid əsasından - adenin, sitozin, guanin, timindən ibarətdir. – məlumat üçün hansı kod.
DNT və RNT ardıcıllığı genomik tədqiqatlar, xərçəng tədqiqatları, nadir və mürəkkəb xəstəliklərin tədqiqi, mikrobioloji tədqiqatlar, aqriqenomika və bir çox digər tədqiqat sahələrində geniş şəkildə istifadə edildiyi üçün gələcək nəsil ardıcıllığı həyat elmində və fərdiləşdirilmiş tibbdə tədqiqatlara təkan verir.
Növbəti Nəsil Sequencing vs Sanger Sequencing
Next Generation Sequencing (NGS) ilə kütləvi sayda genomik nümunələri ardıcıllıqla sıralamaq mümkün olsa da, Sanger Sequencing (həmçinin zəncir sonlandırma metodu və ya Birinci Nəsil Sequencing kimi tanınır) yalnız kiçik nümunə nömrələrini ardıcıllıqla sıralamaq qabiliyyətinə malikdir. Sanger ardıcıllığı bir anda yalnız bir DNT fraqmentini ardıcıllıqla sıralayır və bir gündə həyata keçirilə bilər. Dəqiqliyinə görə Sanger sekvensiyası həm də Yeni nəsil ardıcıllıqla əldə edilən nəticələri yoxlamaq üçün istifadə edilən qızıl standart texnologiya hesab olunur.
Sanger ardıcıllığı təqribən 800bp oxunma uzunluqlarına nail olur (zənginləşdirilməmiş DNT ilə adətən 500-600bp). Sanger sıralamasında daha uzun oxunma uzunluqları, xüsusilə genomun təkrarlanan bölgələrinin ardıcıllığı baxımından digər ardıcıllaşdırma metodlarına nisbətən əhəmiyyətli üstünlüklər göstərir. Qısa oxunan ardıcıllıq məlumatlarının çətinliyi xüsusilə yeni genomların (de novo) ardıcıllaşdırılmasında və yüksək dərəcədə yenidən qurulmuş genom seqmentlərinin, adətən xərçəng genomlarında və ya struktur dəyişkənliyi nümayiş etdirən xromosomların bölgələrində görülən seqmentlərin ardıcıllığında bir problemdir. [sp. Morozova və Marra, 2008]
DNT – Deoksiribonuklein turşusu – Onun formaları və funksiyaları
DNT-nin hər bir forması unikal xüsusiyyətlərə və tətbiqlərə malikdir və onkologiya, genetika, məhkəmə ekspertizası və təkamül biologiyası da daxil olmaqla geniş tədqiqat sahələrinə töhfə verir. Hielscher sonicatorları analiz məqsədləriniz üçün DNT və RNT-ni təcrid etmək və parçalamaq üçün yüksək səmərəli və etibarlı həlldir. Aşağıdakı siyahıda biz sizə DNT-nin spesifik formalarını izah edirik və onları bioloji kontekst və funksiyalarına görə təsnif edirik:
- Genomik DNT (gDNA)
Genomik DNT (gDNA): Həm kodlaşdıran (genlər), həm də kodlaşdırmayan bölgələr daxil olmaqla, orqanizmdə DNT-nin tam dəsti. - Hüceyrədənkənar DNT
Sirkulyasiya edən şiş DNT (ctDNA): Şiş hüceyrələri tərəfindən qan dövranına buraxılan DNT fraqmentləri.
Hüceyrəsiz DNT (cfDNA): Müxtəlif toxumalardan qaynaqlanan DNT fraqmentləri qan dövranında sərbəst dövr edir. - Ekstraxromosom dairəvi DNT (eccDNA): Dairəvi DNT molekulları eukaryotik hüceyrələrdə xromosomların xaricində tapılır.
Viral DNT: Viruslardan yaranan DNT ya ev sahibi genomuna inteqrasiya olunmuş, ya da epizomal DNT kimi. - mitoxondrial DNT
Mitoxondrial DNT (mtDNA): DNT mitoxondriyada yerləşir, ana tərəfindən miras alınır və enerji istehsalında iştirak edir. - plazmid DNT
Plazmid DNT: Xromosom DNT-dən asılı olmayaraq təkrarlanan kiçik, dairəvi DNT molekulları, adətən bakteriyalarda tapılır və gen mühəndisliyində istifadə olunur. - nüvə DNT
Nüvə DNT (nDNA): Bir orqanizmdə genetik materialın əksəriyyətini təşkil edən eukaryotik hüceyrələrin nüvəsində olan DNT. - Tək Hüceyrəli DNT
Tək Hüceyrəli DNT (scDNA): Tək hüceyrədən alınan DNT fərdi hüceyrə səviyyəsində ətraflı genomik analiz üçün istifadə olunur. - Rekombinant DNT
Rekombinant DNT (rDNT): Bir çox mənbədən olan genetik materialı bir araya gətirmək üçün genetik rekombinasiyanın laboratoriya üsulları ilə yaradılmış DNT molekulları. - Xüsusi formalar
Ətraf mühit DNT (eDNA): Mənbə orqanizmləri təcrid etmədən ətraf mühit nümunələrindən (torpaq, su) toplanmış DNT
Qədim DNT (aDNA): Qədim nümunələrdən əldə edilən DNT təkamül biologiyası və qədim populyasiyalar haqqında məlumat verir. - Xromosom DNT
Xromosom DNT: Hüceyrə nüvəsindəki xromosomları təşkil edən, həm kodlayan, həm də kodlaşdırmayan bölgələri əhatə edən DNT. - Viral və sintetik formalar
Viral DNT: Ya host genomlarına inteqrasiya oluna bilən və ya müstəqil varlıqlar kimi mövcud olan viruslardan əldə edilən DNT.
Sintetik DNT: Tədqiqat və biotexnologiyada tez-tez istifadə olunan kimyəvi proseslər nəticəsində yaradılan süni şəkildə sintez edilmiş DNT ardıcıllığı.
Hielscher Ultrasonics yüksək performanslı ultrasəs homogenizatorları istehsal edir laboratoriya üçün sənaye ölçüsü.