Yüksək Verimli Sonikasiya ilə Asanlaşdırılan Metabolomika
Metabolomika sidik, zərdab, plazma, nəcis və tüpürcək kimi müxtəlif biomayelərdəki kiçik molekulları səciyyələndirmək və kəmiyyətini təyin etmək üçün yüksək məhsuldarlıqlı üsullardan istifadə edən tədqiqat sahəsidir və unikal metabolik imzaları açır. Çox quyulu lövhələr üçün nəzərdə tutulmuş yüksək məhsuldarlıqlı sonikator UIP400MTP, aşağı axın analizi üçün metabolitlərin buraxılmasını asanlaşdıraraq, bu nümunələrdə hüceyrələrin parçalanması üçün güclü vasitədir. Bu dəqiq və etibarlı yanaşma dəqiq tədqiqat dizaynının, dəqiq nümunə hazırlığının, optimallaşdırılmış platformanın qurulmasının, hərtərəfli məlumatların təhlilinin və mənalı bioloji şərhin əsas olduğu metabolomika üçün vacibdir. Metabolomikada həm karbohidratlar, lipidlər və amin turşuları kimi molekulların xüsusi siniflərinə diqqət yetirən məqsədyönlü yanaşmalar, həm də metabolik siqnalın mürəkkəb mürəkkəbliyini aşkar edən nümunə daxilində metabolik profillərə geniş baxış təqdim edən qeyri-məqsədli üsullar istifadə olunur.
UIP400MTP çox quyulu lövhələrdə hüceyrə lizisi və metabolitlərin çıxarılması üçün təmassız, yüksək məhsuldarlıqlı sonikatordur.
96 Quyu Plitəli Sonicator UIP400MTP ilə yüksək məhsuldarlıqlı nümunənin hazırlanması
Təmassız sonikator UIP400MTP-nin 96 quyulu lövhələrlə birlikdə istifadəsi yüksək məhsuldarlıqlı homogenləşmə və metabolitlərin çıxarılması üçün səmərəli üsuldur. Bu quraşdırma nümunə ilə birbaşa təmasın qarşısını alır, eyni vaxtda birdən çox nümunəni emal edərkən çarpaz çirklənmə riskini azaldır.
96 Quyulu Sonicator UIP400MTP ilə Homogenləşdirmə üçün Addım-addım Protokol
- Metabolomik nümunələrin hazırlanması
Nümunə Yerləşdirmə: Hər bir nümunəni (məsələn, nəcis, bağırsaq toxuması və ya luminal məzmun) 96 quyuluq boşqabın və ya mikroplağın ayrı-ayrı quyularına paylayın.
Həlledici: Metanol, etanol, asetonitril, xloroform və onların (sulu) qarışıqları kimi üzvi həlledicilər, hüceyrədaxili metabolitlərin hüceyrə matrisindən sərbəst buraxılmasına kömək edən metabolitlərin çıxarılması üçün vacibdir. Nümunəni tam suya batırmaq üçün kifayət qədər həcm təmin edərək hər quyu üçün 100-300 µL həlledici istifadə edin.
Daxili standartlar: İsteğe bağlı olaraq, aşağı axın metabolik analiz zamanı normallaşma üçün hər bir quyuya daxili standartlar əlavə edin. - Bağlama Orta Quraşdırma
Su səviyyəsi: 96 quyu boşqabını təlimatda təsvir olunduğu kimi su (birləşdirmə mühiti) ilə doldurulmuş sonikasiya platformasına qoyun. - UIP400MTP Parametr Konfiqurasiyası
Güc Parametrləri: Effektiv homojenləşdirmə üçün ultrasəs amplitüdünü maksimum gücün 50-80%-nə tənzimləyin.
Nəbz rejimi: Soyutmaya imkan vermək və nümunənin həddindən artıq istiləşməsinin qarşısını almaq üçün sonikasiya dövrünü alternativ impulslara (məsələn, 30 saniyə ON, 30 saniyə SÖNDÜR) təyin edin.
Ümumi vaxt: Nümunənin mürəkkəbliyindən və sərtliyindən asılı olaraq 4-10 dəqiqə.
Temperatur nəzarəti: İstiliyə həssas metabolitləri qorumaq üçün sonikasiya zamanı suyu 4-8°C-də saxlamaq üçün laboratoriya soyuducudan istifadə edin. - sonication prosesi
Sonikasiya dövrləri üçün UIP400MTP-ni işə salın.
UIP400MTP interfeysi vasitəsilə prosesi izləyin.
Kavitasiya effekti nümunələri homogenləşdirəcək və hüceyrədaxili metabolitləri həllediciyə buraxaraq quyuların içərisində hüceyrələri lize edəcək. - PostSonication
sentrifuqalama: Sonikasiyadan sonra, lazım gələrsə, boşqab məzmununu toplama borularına köçürün. Həll olunmayan zibil və hüceyrə materialını qranullaşdırmaq üçün 10 dəqiqə ərzində 4000-6000 × g-də sentrifuqa edin.
Supernatant kolleksiyası: Hər bir quyudan olan supernatantı diqqətlə analiz üçün yeni borulara və ya lövhələrə köçürün.
İsteğe bağlı Qurutma: Əgər konsentrasiya tələb olunarsa, vakuum konsentratoru (məsələn, SpeedVac) istifadə edərək supernatantları qurutun, sonra müvafiq həlledicidən kiçik həcmdə yenidən hazırlayın.
UIP400MTP çox quyulu boşqab sonikatorunun yüksək məhsuldarlıqlı emal gücündən faydalanın və metabolomik tədqiqatınızı və təhlilinizi asanlaşdırın!
UIP400MTP yüksək məhsuldarlıqlı sonikator çox quyulu boşqablarda, 96 quyu boşqablarda, borularda və Petri qablarında metabolomik tədqiqatlar üçün.
Metabolomik tədqiqatlarda yüksək məhsuldarlıqlı nümunə hazırlamaq üçün UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator.
UIP400MTP ilə təmassız sonikasiya prinsipi
UIP400MTP ultrasəs dalğalarını 96 quyu boşqabının quyularına dolayı yolla birləşdirici mühit (məsələn, su) vasitəsilə tətbiq edir. Bu dalğalar hüceyrələri pozan və sonikator probu ilə nümunə arasında fiziki təmas olmadan metabolitləri buraxan kavitasiya yaradır.
“Nəcis mikrobiom nümunələrinin vahid və ardıcıl bakterial lizisi üçün UIP400MTP sonikatorunuzdan istifadə edərək fantastik təcrübəmizə görə sizə təşəkkür etmək üçün yazıram. Biz yüksək ötürmə qabiliyyəti olan lizis texnologiyası üçün zərfi sıxışdırırıq və alətiniz bu tapşırığa çox uyğundur. Əsas məqamlardan bəziləri bunlardır:
- Əməliyyat asanlığı – alətdən istifadə etmək asandır və menyu seçimlərindən istifadə etməklə fərdiləşdirmə sadədir
- yüksək ötürmə qabiliyyəti – plitələrlə işləmək üçün əladır, eyni anda 96 nümunə ilə
- Bütün gəmilərin hətta sonication – cihaz bizim tətbiqimiz üçün çox vacib olan bütün quyulara eyni miqdarda sonikasiya verə bildi
- Hielscher komandasından dəstək – dəstək əla idi, siz həmişə təlimlərdə yanımızda oldunuz, suallarımızı cavablandırdınız və problemlərimizi həll etdiniz, məqsədimizə çatmağımıza kömək edən təkliflərlə.
Protokollarımızı optimallaşdırmaq üçün işləyərkən köməyinizə və köməyinizə görə bir daha təşəkkür edirik.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Baş elmi işçi – Intus Biosciences
Çox quyulu boşqab sonikatoru UIP400MTP, məsələn, metabolitlərin tədqiqi və təhlili zamanı yüksək məhsuldarlıqlı nümunənin hazırlanmasını asanlaşdırır.
96 quyu boşqab sonikatoru UIP400MTP: Ultrasəs ötürücü maye bütün quyuları əhatə edir və hər bir nümunənin vahid sonikasiyasını təmin edir.
UIP400MTP Çox Quyu Plitə Sonicatorunun Əsas Xüsusiyyətləri
| Yüksək Verimli Sonikasiya | 96 quyu və digər çoxqulu plitələr üçün mükəmməl uyğunlaşdırılmış UIP400MTP birdən çox nümunənin eyni vaxtda, eyni sonikasiyasına imkan verir, nümunənin hazırlanması müddətini əhəmiyyətli dərəcədə qısaldır və yüksək nümunə sayı testinin məhsuldarlığını artırır. |
| Seçdiyiniz Çoxquyulu Plakadan istifadə edin | UIP400MTP istənilən standart çoxqulu plitələrin, PCR lövhələrinin və ya mikrotiter plitələrin sonikasiya edilməsi üçün nəzərdə tutulmuşdur. Təcrübələriniz üçün ən uyğun boşqab seçirsiniz. UIP400MTP xüsusi istehlak materiallarını tələb etmədiyi üçün bu, sizə çoxlu pula qənaət edir! |
| Kontaktsız ultrasəs | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP nümunəyə heç bir şey daxil etmədən intensiv ultrasəs tətbiq edir. Ealed çoxqulu plitələri, qapalı qabları və flakonları sonikləşdirə bilərsiniz. Hielscher sizə hər hansı qeyri-standart flakon və ya qablar üçün xüsusi hazırlanmış nümunə sahibləri təqdim edir. |
| Dəqiqlik və Nəzarət | Dəqiq nəzarət və ağıllı proqram ultrasəs parametrlərini xüsusi emal ehtiyaclarınıza optimal şəkildə uyğunlaşdırmağa imkan verir. Siz hər bir sınaq üçün maksimum sonication səmərəliliyi və effektivliyi əldə edirsiniz. |
| Temperatur nəzarəti | Sonikasiya üçün xüsusi bir temperatur təyin edin. UIP400MTP nömrəli sonikator nümunənin temperaturunu izləyə və sonikasiyanı müvafiq olaraq tənzimləyə bilər. Sirkulyasiya edən soyuducu maye, dəqiq temperatur nəzarəti üçün boşqabdakı hər quyunu soyuyur. |
| Protokollaşdırma və Uzaqdan İdarəetmə | Hər sonication run bir kompüter nəzarət edilə bilər. Proqram təminatının quraşdırılmasına ehtiyac yoxdur. UIP400MTP-ni uzaqdan idarə etmək və izləmək üçün istənilən əməliyyat sistemində (məsələn, MacOS, Windows, Android, iOS və ya Linux) standart brauzerinizdən (məsələn, Chrome, Firefox, Edge və ya Safari) istifadə edə bilərsiniz. Hər bir sonication run qiymətləndirmə və sənədlər üçün ətraflı sonication protokolu istehsal edir. Protokol faylı qeyri-mülkiyyət CSV formatındadır və onu seçdiyiniz proqramla, məsələn, Microsoft Excel, Apple Nömrələri və ya OpenOffice Calc ilə aça bilərsiniz. |
| Möhkəm və Etibarlı | Almaniyada ən yüksək keyfiyyət standartlarına uyğun dizayn edilmiş və tikilmiş UIP400MTP təkcə güclü deyil, həm də olduqca davamlıdır. Onun dizaynı sənaye standartlarına cavab verir və tələbkar laboratoriya mühitində gündəlik istifadənin çətinliyinə asanlıqla dözür. UIP400MTP-ni yüksək məhsuldarlıqlı əməliyyatlarda davamlı olaraq 24 saat, həftədə 7 gün istifadə edə bilərsiniz. |
- yüksək səmərəlilik
- ən müasir texnologiya
- etibarlılıq & möhkəmlik
- tənzimlənən, dəqiq proses nəzarəti
- ağıllı proqram təminatı
- ağıllı funksiyalar (məsələn, proqramlaşdırıla bilən, məlumatların protokollaşdırılması, uzaqdan idarəetmə)
- idarə etmək asan və təhlükəsizdir
- aşağı təmir
- CIP (yerində təmiz)
Dizayn, İstehsalat və Konsaltinq – Keyfiyyətli Almaniya istehsalı
Hielscher ultrasəs cihazları ən yüksək keyfiyyət və dizayn standartları ilə tanınır. Sağlamlıq və asan əməliyyat ultrasəs aparatlarımızın sənaye obyektlərinə rahat inteqrasiyasına imkan verir. Kobud şərtlər və tələbkar mühitlər Hielscher ultrasəs cihazları tərəfindən asanlıqla idarə olunur.
Hielscher Ultrasonics, ISO sertifikatlı bir şirkətdir və ən müasir texnologiya və istifadəçi dostu olan yüksək performanslı ultrasəs cihazlarına xüsusi diqqət yetirir. Əlbəttə ki, Hielscher ultrasəs cihazları CE-yə uyğundur və UL, CSA və RoHs tələblərinə cavab verir.
Təmassız sonikator UIP400MTP mikroplitələrdə metabolomik nümunənin hazırlanması üçün.
Ədəbiyyat / İstinadlar
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Metabolomik Araşdırmalar haqqında Tez-tez verilən suallar
Mikrobiom nədir?
Mikrobiom, insan orqanizmi kimi müəyyən bir mühitdə yaşayan bakteriya, virus, göbələk və arxeya da daxil olmaqla mikroorqanizmlərin kollektiv birliyinə, habelə onların genetik materialına aiddir. Pəhriz, həyat tərzi və ətraf mühit kimi amillərlə formalaşarkən maddələr mübadiləsinə, immun funksiyasına və patogenlərdən qorunmağa təsir edərək ev sahibinin sağlamlığında mühüm rol oynayır.
Metabolomika nədir?
Metabolomika bioloji sistem daxilində metabolik proseslər zamanı əmələ gələn kiçik molekullar olan metabolitlərin hərtərəfli öyrənilməsidir. Hüceyrə funksiyalarını, metabolik yolları və onların genetik, ətraf mühit və ya patoloji dəyişikliklərə necə reaksiya verdiyini başa düşmək üçün bu molekulların identifikasiyası, kəmiyyətinin müəyyən edilməsi və təhlili daxildir.
Metabolom nədir?
Metabolom müəyyən bir zamanda hüceyrə, toxuma və ya orqanizm kimi bioloji sistem daxilində mövcud olan kiçik molekulların və ya metabolitlərin tam dəstidir. O, sistemin biokimyəvi fəaliyyətini və fizioloji vəziyyətini əks etdirir, maddələr mübadiləsi və onun ətraf mühitlə qarşılıqlı əlaqəsi haqqında məlumat verir.
Hielscher Ultrasonics yüksək performanslı ultrasəs homogenizatorları istehsal edir laboratoriya üçün sənaye ölçüsü.