Yüksək məhsuldarlıqlı ultrasəslə emal sayəsində asanlaşan metabolomika
Metabolomika sidik, zərdab, plazma, nəcis və tüpürcək kimi müxtəlif bioloji mayelərdə kiçik molekulları səciyyələndirmək və onların miqdarını müəyyən etmək üçün yüksək məhsuldarlıqlı üsullardan istifadə edən, özünəməxsus metabolik xüsusiyyətləri üzə çıxaran tədqiqat sahəsidir. Çoxquyulu lövhələr üçün nəzərdə tutulmuş yüksək məhsuldarlıqlı UIP400MTP sonikatoru bu nümunələrdə hüceyrələrin lizisi üçün güclü vasitədir və sonrakı analiz üçün metabolitlərin sərbəstləşməsini asanlaşdırır. Bu dəqiq və etibarlı yanaşma metabolomika üçün vacibdir; burada tədqiqatın dəqiq planlaşdırılması, nümunələrin diqqətlə hazırlanması, platformanın optimal qurulması, məlumatların hərtərəfli təhlili və mənalı bioloji şərhi başlıca əhəmiyyət daşıyır. Metabolomikada həm karbohidratlar, lipidlər və amin turşuları kimi konkret molekul siniflərinə yönələn hədəfli yanaşmalardan, həm də nümunədəki metabolik profillərə geniş baxış verən və metabolik siqnal ötürülməsinin mürəkkəbliyini üzə çıxaran hədəfsiz üsullardan istifadə olunur.
UIP400MTP çoxquyulu lövhələrdə hüceyrə lizisi və metabolit ekstraksiyası üçün təmassız, yüksək məhsuldarlıqlı sonikatordur
96-quyulu lövhə sonikatoru UIP400MTP ilə yüksək məhsuldarlıqlı nümunə hazırlığı
Təmassız UIP400MTP sonikatorunun 96-quyulu lövhələrlə birlikdə istifadəsi yüksək məhsuldarlıqlı homogenləşdirmə və metabolit ekstraksiyası üçün səmərəli üsuldur. Bu quruluş nümunə ilə birbaşa təmasın qarşısını alır və bir neçə nümunəni eyni vaxtda emal edərkən çarpaz çirklənmə riskini azaldır.
96-quyulu lövhə sonikatoru UIP400MTP ilə homogenləşdirmə üçün addım-addım protokol
- Metabolomik nümunələrin hazırlanması
Nümunələrin yerləşdirilməsi: Hər nümunəni (məsələn, nəcis, bağırsaq toxuması və ya bağırsaq mənfəzinin möhtəviyyatı) 96-quyulu lövhənin və ya mikrolövhənin ayrı-ayrı quyularına yerləşdirin.
Həlledici: Metanol, etanol, asetonitril, xloroform kimi üzvi həlledicilər və onların (sulu) qarışıqları metabolit ekstraksiyası üçün vacibdir və hüceyrədaxili metabolitlərin hüceyrə matrisindən sərbəstləşməsinə kömək edir. Hər quyu üçün 100–300 µL həlledici istifadə edin və nümunənin tam batması üçün həcmin kifayət qədər olmasını təmin edin.
Daxili standartlar: İstəyə görə, sonrakı metabolomik analiz zamanı normallaşdırma üçün hər quyuya daxili standartlar əlavə edin. - Akustik əlaqə mühitinin hazırlanması
Su səviyyəsi: 96-quyulu lövhəni təlimatda təsvir edildiyi kimi su (akustik əlaqə mühiti) ilə doldurulmuş ultrasəslə emal platformasına yerləşdirin. - UIP400MTP parametrlərinin sazlanması
Güc parametrləri: Səmərəli homogenləşdirmə üçün ultrasəs amplitudunu maksimum gücün 50–80%-nə tənzimləyin.
İmpuls rejimi: Soyumaya imkan vermək və nümunənin həddindən artıq qızmasının qarşısını almaq üçün ultrasəslə emal dövrünü növbələşən impulslarla işləməyə sazlayın (məsələn, 30 saniyə AÇIQ, 30 saniyə SÖNÜLÜ).
Ümumi müddət: Nümunənin mürəkkəbliyindən və parçalanmaya davamlılığından asılı olaraq 4–10 dəqiqə.
Temperatura nəzarət: İstiliyə həssas metabolitləri qorumaq üçün ultrasəslə emal zamanı suyu 4–8°C-də saxlamaq məqsədilə laboratoriya soyuducusundan istifadə edin. - Ultrasəslə emal prosesi
Ultrasəslə emal dövrlərini başlatmaq üçün UIP400MTP cihazını işə salın.
UIP400MTP interfeysi vasitəsilə prosesi izləyin.
Kavitasiya təsiri quyulardakı nümunələri homogenləşdirəcək və hüceyrələri lizisə uğradaraq hüceyrədaxili metabolitləri həllediciyə sərbəstləşdirəcək. - Ultrasəslə emaldan sonra
Sentrifuqalama: Ultrasəslə emaldan sonra, lazım gələrsə, lövhənin möhtəviyyatını toplama sınaq borularına köçürün. Həll olmayan qalıqları və hüceyrə materialını çökdürmək üçün 4.000–6.000 × g-də 10 dəqiqə sentrifuqalayın.
Supernatantın toplanması: Analiz üçün hər quyudakı supernatantı ehtiyatla yeni sınaq borularına və ya lövhələrə köçürün.
İstəyə bağlı qurutma: Qatılaşdırma tələb olunarsa, supernatantları vakuum konsentratoru (məsələn, SpeedVac) ilə qurudun, sonra uyğun həlledicinin kiçik həcmində yenidən həll edin.
UIP400MTP çoxquyulu lövhə sonikatorunun yüksək məhsuldarlıqlı emal imkanlarından yararlanın və metabolomik tədqiqatlarınızı və analizlərinizi asanlaşdırın!
UIP400MTP yüksək məhsuldarlıqlı sonikatoru çoxquyulu lövhələrdə, 96-quyulu lövhələrdə, sınaq borularında və Petri qablarında metabolomik tədqiqatlar üçün.
Metabolomik tədqiqatlarda yüksək məhsuldarlıqlı nümunə hazırlığı üçün UIP400MTP çoxquyulu lövhə sonikatoru.
UIP400MTP ilə təmassız ultrasəslə emalın prinsipi
UIP400MTP ultrasəs dalğalarını akustik əlaqə mühiti (məsələn, su) vasitəsilə dolayı yolla 96-quyulu lövhənin quyularına ötürür. Bu dalğalar sonikatorun zondu ilə nümunə arasında fiziki təmas olmadan hüceyrələri parçalayan və metabolitləri sərbəstləşdirən kavitasiya yaradır.
“Nəcis mikrobiomu nümunələrində bakteriyaların bərabər və ardıcıl lizisi üçün UIP400MTP sonikatorunuzdan istifadə zamanı qazandığımız möhtəşəm təcrübəyə görə sizə təşəkkür etmək üçün yazıram. Biz yüksək məhsuldarlıqlı lizis texnologiyasının imkanlarının sərhədlərini genişləndiririk və cihazınız bu iş üçün çox uyğundur. Əsas üstünlüklərdən bəziləri bunlardır:
- İstifadə rahatlığı – cihazdan istifadə etmək asandır və menyu seçimləri vasitəsilə fərdi sazlama sadədir
- Yüksək məhsuldarlıq – eyni vaxtda 96 nümunə ilə lövhələrin emalı üçün əladır
- Bütün qabların bərabər ultrasəslə emalı – cihaz bütün quyulara eyni miqdarda ultrasəs təsiri çatdıra bildi və bu, bizim tətbiqimiz üçün həlledici əhəmiyyət daşıyırdı
- Hielscher komandasının dəstəyi – dəstək əla idi; təlim zamanı, suallarımıza cavab vermək və problemləri həll etmək üçün hər zaman yanımızda oldunuz və məqsədimizə çatmağımıza kömək edən təkliflər verdiniz.
Protokollarımızı optimallaşdırmaq üzərində işləyərkən göstərdiyiniz köməyə və dəstəyə görə bir daha təşəkkür edirik.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Baş elmi direktor – Intus Biosciences
Çoxquyulu lövhə sonikatoru UIP400MTP, məsələn, metabolit tədqiqatlarında və analizlərində yüksək məhsuldarlıqlı nümunə hazırlığını asanlaşdırır.
96-quyulu lövhə sonikatoru UIP400MTP: Ultrasəsi ötürən maye bütün quyuları əhatə edir və hər nümunənin bərabər ultrasəslə emalını təmin edir
UIP400MTP çoxquyulu lövhə sonikatorunun əsas xüsusiyyətləri
| Yüksək məhsuldarlıqlı ultrasəslə emal | 96-quyulu və digər çoxquyulu lövhələr üçün mükəmməl uyğun olan UIP400MTP bir neçə nümunənin eyni vaxtda, eyni qaydada ultrasəslə emalına imkan verir, nümunə hazırlığı müddətini əhəmiyyətli dərəcədə qısaldır və çoxsaylı nümunələrin sınaqlarında emal məhsuldarlığını artırır. |
| Seçdiyiniz çoxquyulu lövhədən istifadə edin | UIP400MTP istənilən standart çoxquyulu lövhəni, PCR lövhəsini və ya mikrotitr lövhəsini ultrasəslə emal etmək üçün nəzərdə tutulub. Təcrübələriniz üçün ən uyğun lövhəni özünüz seçirsiniz. UIP400MTP yalnız istehsalçıya məxsus sərf materialları tələb etmədiyindən, bu, sizə xeyli pul qənaət etməyə imkan verir! |
| Təmassız ultrasəslə emal | Çoxquyulu lövhə sonikatoru UIP400MTP nümunəyə heç nə daxil etmədən intensiv ultrasəs tətbiq edir. Hermetik bağlanmış çoxquyulu lövhələri, qapalı qabları və flakonları ultrasəslə emal edə bilərsiniz. Hielscher istənilən qeyri-standart flakon və ya qab üçün sizə xüsusi hazırlanmış nümunə tutacaqları təqdim edir. |
| Dəqiqlik və nəzarət | Dəqiq idarəetmə və ağıllı proqram təminatı ultrasəs parametrlərini konkret emal ehtiyaclarınıza optimal şəkildə uyğunlaşdırmağa imkan verir. Hər təcrübə üçün maksimum ultrasəslə emal səmərəliliyi və nəticəliliyi əldə edirsiniz. |
| Temperatura nəzarət | Ultrasəslə emalınız üçün konkret temperatur təyin edin. UIP400MTP lövhə sonikatoru nümunənin temperaturunu izləyə və ultrasəslə emalı buna uyğun tənzimləyə bilər. Təkrar dövr edən soyuducu maye temperatura dəqiq nəzarət üçün lövhədəki hər quyunu soyudur. |
| Qeydəalma və uzaqdan idarəetmə | Hər ultrasəslə emal seansı kompüterdən idarə oluna bilər. Proqram təminatının quraşdırılması tələb olunmur. UIP400MTP cihazını uzaqdan idarə etmək və izləmək üçün istənilən əməliyyat sistemində (məsələn, MacOS, Windows, Android, iOS və ya Linux) adi brauzerinizdən (məsələn, Chrome, Firefox, Edge və ya Safari) istifadə edə bilərsiniz. Hər ultrasəslə emal seansı qiymətləndirmə və sənədləşdirmə üçün ətraflı ultrasəslə emal qeydi yaradır. Qeyd faylı mülkiyyət məhdudiyyətli olmayan CSV formatındadır və onu seçdiyiniz proqramla, məsələn, Microsoft Excel, Apple Numbers və ya OpenOffice Calc ilə aça bilərsiniz. |
| Möhkəm və etibarlı | Almaniyada ən yüksək keyfiyyət standartlarına uyğun layihələndirilmiş və istehsal edilmiş UIP400MTP həm güclüdür, həm də olduqca davamlıdır. Onun konstruksiyası sənaye standartlarına cavab verir və yüksək tələblərin olduğu laboratoriya mühitində gündəlik istifadənin çətinliklərinə asanlıqla tab gətirir. UIP400MTP cihazını yüksək məhsuldarlıqlı əməliyyatlarda gündə 24 saat, həftədə 7 gün fasiləsiz istifadə edə bilərsiniz. |
- yüksək səmərəlilik
- ən müasir texnologiya
- etibarlılıq və möhkəmlik
- tənzimlənən, dəqiq proses idarəetməsi
- ağıllı proqram təminatı
- ağıllı funksiyalar (məsələn, proqramlaşdırılma imkanı, məlumatların qeydə alınması, uzaqdan idarəetmə)
- asan və təhlükəsiz istifadə
- az texniki qulluq tələbi
- CIP (yerində təmizləmə)
Layihələndirmə, istehsal və məsləhət xidmətləri – Almaniya istehsalının keyfiyyəti
Hielscher ultrasəs cihazları ən yüksək keyfiyyət və dizayn standartları ilə tanınır. Möhkəmlik və istifadə rahatlığı ultrasəs cihazlarımızın sənaye müəssisələrinə problemsiz inteqrasiyasına imkan verir. Hielscher ultrasəs cihazları ağır şəraitdə və yüksək tələblərin olduğu mühitlərdə asanlıqla işləyir.
Hielscher Ultrasonics ISO sertifikatlı şirkətdir və ən müasir texnologiya və istifadə rahatlığı ilə seçilən yüksək məhsuldarlıqlı ultrasəs cihazlarına xüsusi diqqət yetirir. Əlbəttə, Hielscher ultrasəs cihazları CE tələblərinə uyğundur və UL, CSA və RoHs tələblərinə cavab verir.
Təmassız UIP400MTP sonikatoru mikrolövhələrdə metabolomik nümunələrin hazırlanması üçün.
Ədəbiyyat / İstinadlar
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Metabolomik tədqiqatlar haqqında tez-tez verilən suallar
Mikrobiom nədir?
Mikrobiom insan orqanizmi kimi müəyyən bir mühitdə yaşayan mikroorqanizmlərin, o cümlədən bakteriyaların, virusların, göbələklərin və arxeyaların, eləcə də onların genetik materialının məcmusudur. O, qidalanma, həyat tərzi və ətraf mühit kimi amillərin təsiri ilə formalaşır və maddələr mübadiləsinə, immun funksiyaya və patogenlərdən qorunmaya təsir edərək sahib orqanizmin sağlamlığında mühüm rol oynayır.
Metabolomika nədir?
Metabolomika bioloji sistemdə metabolik proseslər zamanı yaranan kiçik molekulların, yəni metabolitlərin hərtərəfli öyrənilməsidir. Hüceyrə funksiyalarını, metabolik yolları və onların genetik, ətraf mühitlə bağlı və ya patoloji dəyişikliklərə necə cavab verdiyini anlamaq üçün bu molekulların müəyyənləşdirilməsini, miqdarının təyin edilməsini və analizini əhatə edir.
Metabolom nədir?
Metabolom müəyyən bir vaxtda hüceyrə, toxuma və ya orqanizm kimi bioloji sistemdə mövcud olan kiçik molekulların, yəni metabolitlərin tam məcmusudur. O, sistemin biokimyəvi fəaliyyətini və fizioloji vəziyyətini əks etdirərək maddələr mübadiləsi və onun ətraf mühitlə qarşılıqlı əlaqələri haqqında məlumat verir.
Hielscher Ultrasonics yüksək məhsuldarlıqlı ultrasəs homogenizatorlarını laboratoriya ölçüsündən sənaye ölçüsünədək istehsal edir.