Պրոտեոմիկ հետազոտություն – Ինչու է Sonicator-ն անփոխարինելի նմուշի պատրաստման համար
Պրոտեոմիկ հետազոտությունը խորը պատկերացումներ է տալիս բջջային կենսաբանության վերաբերյալ և ընդլայնում է կենսաբանական համակարգերի մեր ըմբռնումը` հնարավորություն տալով կատարել սպիտակուցների և դրանց գործառույթների համապարփակ վերլուծություն: Պրոտեոմիական ուսումնասիրությունների հաջողության մեջ առանցքային նշանակություն ունի բարձրորակ նմուշների պատրաստումը, որը հաճախ ներառում է նմուշների բարդ և աշխատատար պատրաստում: Sonication-ը նմուշների պատրաստման լավ կայացած և հզոր գործիք է, որն առաջարկում է բազմաթիվ առավելություններ ավանդական մեթոդների նկատմամբ: Ձայնային սարքերի տարբեր մոդելներ, ինչպիսիք են զոնդային տիպի sonicators-ը, VialTweeter-ը և UIP400MTP բարձր թողունակությամբ ափսե-ձայնացնող սարքը, առաջարկում են եզակի առավելություններ պրոտեոմային նմուշների մշակման մեջ և ճանապարհ են հարթում հուսալի, վերարտադրելի հետազոտական արդյունքների համար:
Ինչու՞ ինձ պետք է Sonicator իմ պրոտեոմիկ հետազոտության համար:
Պրոտեոմային հետազոտության ոլորտում ձայնային սարքի անհրաժեշտությունը բխում է վերլուծության համար բարձրորակ նմուշներ ձեռք բերելու կարևոր նշանակությունից: Sonication-ի օգտագործումը պրոտեոմիական հետազոտություններում կարևոր է հուսալի և վերարտադրելի արդյունքների հասնելու համար՝ ապահովելով բջիջների արդյունավետ լիզացիա, բարելավված սպիտակուցի արդյունահանում, բարդ նմուշների համասեռացում, հեշտացված ֆերմենտային մարսողություն, նմուշների աղտոտվածության նվազեցում և բարձր թողունակության մշակման հնարավորություններ:
Նմուշի պատրաստման կարևորությունը պրոտեոմիկայի մեջ. Պրոտեոմային փորձարկումներում հուսալի և վերարտադրելի արդյունքների հասնելը կախված է նմուշի մանրակրկիտ պատրաստումից: Բջիջների լիզումից մինչև սպիտակուցի արդյունահանում և մաքրում, յուրաքանչյուր քայլ պետք է կատարվի ճշգրտությամբ՝ նվազագույնի հասցնելու արտեֆակտները և ապահովելու նմուշի ամբողջականությունը: Այնուամենայնիվ, սովորական մեթոդները, ինչպիսիք են մեխանիկական խափանումը և քիմիական լուծարումը, հաճախ չեն կարողանում ցանկալի արդյունքներ ապահովել՝ կապված այնպիսի խնդիրների, ինչպիսիք են թերի արդյունահանումը, սպիտակուցի քայքայումը և նմուշների աղտոտումը:
Բարձր թողունակությամբ Sonicator UIP400MTP նմուշի պատրաստման համար պրոտեոմիկայի մեջ
Ultrasonication. A Game-Changer in Proteomic Sample Preparation
Ուլտրաձայնացումը՝ կենսաբանական նմուշները խաթարելու համար բարձր հաճախականության ձայնային ալիքների օգտագործման գործընթացը, առաջացել է որպես խաղափոխիչ պրոտեոմային նմուշի պատրաստման մեջ: Օգտվելով ակուստիկ էներգիայի հզորությունից՝ ձայնային սարքերը նպաստում են բջիջների արագ և արդյունավետ լուծմանը, սպիտակուցի արդյունահանմանը և ֆերմենտային մարսմանը, ինչը հանգեցնում է ավելի բարձր բերքատվության և նմուշների մաքրության բարելավմանը:
Նմուշի պատրաստման առաջադրանքները, որոնք նպաստում են Sonication-ին
- Բջջային լիզի և սպիտակուցի արդյունահանում. Sonicators-ը իդեալական է բջիջների լիզի և սպիտակուցի արդյունահանման համար՝ շնորհիվ իր բազմակողմանիության և ճշգրտության: Հաղորդելով ուլտրաձայնային էներգիայի վերահսկվող պայթյունները, ձայնային սարքերը արդյունավետորեն խախտում են բջջային մեմբրանները՝ ազատելով ներբջջային սպիտակուցները՝ չվնասելով դրանց ամբողջականությունը: Սա հատկապես արժեքավոր է պրոտեոմիկ հետազոտություններում, որոնք պահանջում են անձեռնմխելի սպիտակուցային կառուցվածքներ ներքևում գտնվող վերլուծության համար, ինչպիսիք են սպիտակուց-սպիտակուց փոխազդեցության ուսումնասիրությունները և կառուցվածքային պրոտեոմիկան:
- Բարձր թողունակության նմուշների մշակում. UIP400MTP ափսեի ձայնագրիչն առաջարկում է անզուգական արդյունավետություն բարձր թողունակությամբ պրոտեոմիկ նմուշների մշակման մեջ: Օգտագործելով ուլտրաձայնային էներգիան բազմաբնակարան ափսեի ձևաչափով, UIP400MTP-ը հնարավորություն է տալիս մի քանի նմուշների միաժամանակյա ձայնագրում, ինչը կտրուկ նվազեցնում է մշակման ժամանակը և աշխատուժի ծախսերը: Սա հատկապես ձեռնտու է պրոտեոմիական լայնածավալ հետազոտություններում, որոնք պահանջում են նմուշների գրադարանների արագ զննում կամ նմուշի բարձր թողունակություն՝ բիոմարկերի հայտնաբերման և վավերացման համար:
- Սպիտակուցային տեղումներից հետո բերքատվության բարձրացում. Սպիտակուցների տեղումները սովորաբար օգտագործվում են կենսաբանական նմուշների ներքևի հոսքի մշակման ժամանակ՝ սպիտակուցները խտացնելու և տարբեր աղտոտիչներից դրանք մաքրելու համար: Sonication-ը ցուցադրվել է որպես ռեզուսպենզիայի արդյունավետ տեխնիկա՝ սպիտակուցի ելքը մեծացնելու համար, երբ տրիքլորքացախաթթվով (TCA) նստեցվում են սպիտակուցները, որտեղ այնուհետև հնչում է: Նմուշների արտահոսքը, TCA տեղումներից հետո, որին հաջորդում է նմուշի բուֆերում զտումը, մեծացնում է սպիտակուցի ընդհանուր վերականգնումը և բարելավում վերարտադրելիությունը և համապատասխանող գործակիցները:
- Նմուշի համասեռացում և բուֆերային խառնուրդ. Sonication-ը հեշտացնում է նմուշների համասեռացումը, բջիջների լուծարումը և բուֆերային խառնուրդը պրոտեոմիկայի աշխատանքային հոսքերում:
VialTweeter sonicator մինչև 10 նմուշների միաժամանակյա ձայնագրման համար, օրինակ՝ բջիջները խանգարելու և սպիտակուցներ հանելու համար
Լավագույն Sonicator իմ Proteomic նմուշների համար
Hielscher Ultrasonics-ն առաջարկում է ձայնային սարքերի տարբեր մոդելներ, որոնց դիզայնը հնարավոր է դարձնում նմուշի իդեալական պատրաստումը:
Անկախ նրանից, թե դուք պետք է ձայնագրեք փոքր կամ բարձր նմուշի համարներ, րոպե կամ մեծ ծավալներ – Hielscher-ն ունի ամենահարմար ձայնային սարքը ձեր սպիտակուցի հետ կապված կիրառման համար:
Շշեր և բաժակներ – Զոնդի տիպի Sonicator. Դասական զոնդի տիպի sonicator-ը լայնորեն օգտագործվում է որպես լաբորատոր համասեռացուցիչ ավելի փոքր նմուշների համար, երբ սրվակների կամ բաժակների մեջ առանձին նմուշներ են մշակվում: Լաբորատոր հոմոգենիզատորները UP50H կամ UP100H միկրո ծայրով տիպիկ զոնդ-/եղջյուր-ձայնացնող սարքեր են, որոնք օգտագործվում են նմուշի ուղղակի ուլտրաձայնային ձայնագրման համար:
96-հորատանցքերի թիթեղներ/ Microtiter Plates – The UIP400MTP Plate-Sonicator: Նմուշների քանակի աճով և 96, 384 կամ 1536 հորերով բազմահորերի և միկրոսալերի օգտագործմամբ, UIP400MTP բարձր թողունակությամբ ափսեի ձայնագրիչ սարքը թույլ է տալիս պարզեցված միաժամանակյա ձայնագրման և բազմակի նմուշների ակտիվացում՝ ապահովելով սպիտակուցի նուրբ, բայց արդյունավետ մեկուսացում, ինչպես նաև մանրակրկիտ խառնում: ռեակտիվների ցրումը. Սա հատկապես ձեռնտու է պրոտեոմային փորձերի դեպքում, որոնք ներառում են բարդ նմուշի մատրիցներ կամ բազմակի նմուշների պատրաստում, որտեղ միատարրությունը կարևոր է ճշգրիտ և վերարտադրելի արդյունքների համար:
մինչև 10 սրվակ – The VialTweeter: Եթե դուք միաժամանակ աշխատում եք մի քանի սրվակներով, ինչպիսիք են Eppendorf խողովակները, VialTweeter-ը ձեր ընտրած գործիքն է: VialTweeter-ն առաջարկում է եզակի դիզայն, որը թույլ է տալիս միաժամանակ ձայնավորել մինչև 10 փակ սրվակ կամ խողովակ: Խաչաձև աղտոտումը և օդային վարակը լիովին խուսափել է:
Մի քանի սրվակներ կամ առանձին անոթներ – The CupHorn: UP200St_TD-Cuphorn-ը հզոր ձայնային սարք է, որը հնարավորություն է տալիս միաժամանակ մշակել մի քանի սրվակներ՝ օգտագործելով սրվակի պահարանը, կամ առանձին անոթ տեղադրել CupHorn ջրային բաղնիքում:
Մենք այստեղ ենք օգնելու համար
Մեր տեխնիկական անձնակազմը փորձագետ է ուլտրաձայնային ոլորտում և քաջատեղյակ է ձեզ առաջարկելու ամենահարմար ձայնային սարքը, որը կբավարարի ձեր պահանջները և ձեր հետազոտությունը վերածում է հաջողության: Քանի որ sonicators-ը դարձել է պրոտեոմային հետազոտության անփոխարինելի գործիքներ, որոնք առաջարկում են անզուգական արդյունավետություն, բազմակողմանիություն և վերարտադրելիություն նմուշների պատրաստման ժամանակ, Hielscher-ը վստահեցնում է, որ ձայնային ձայնագրումն ամենաարդյունավետն ու հուսալին է՝ ապահովելով ձեզ կատարյալ ձայնային սարքի մոդել: Բջիջների լիզից մինչև սպիտակուցների արդյունահանում և դրանից դուրս, ուլտրաձայնային ախտահանումը գերազանցում է ավանդական մեթոդներին, հնարավորություն տալով հետազոտողներին առաջ տանել պրոտեոմիական գիտության սահմանները: Քանի որ պրոտեոմիկ հետազոտությունները շարունակում են զարգանալ, sonicators-ը նմուշների նախապատրաստման հիմնական գործիքն է, որը նպաստում է հուսալի արդյունքներին և օգնում է հասկանալ սպիտակուցների բարդ աշխարհը և դրանց գործառույթները:
- բարձր արդյունավետություն
- բարձր թողունակություն
- գերժամանակակից տեխնոլոգիա
- Վերարտադրելի, կրկնվող արդյունքներ
- հուսալիություն & ամրություն
- կարգավորելի, ճշգրիտ գործընթացի վերահսկում
- բաժակների, սրվակների, խողովակների, միկրոափսեների համար
- ցանկացած նմուշի ծավալի համար
- խելացի ծրագրակազմ
- խելացի գործառույթներ (օրինակ՝ ծրագրավորվող, տվյալների արձանագրություն, հեռակառավարում)
- հեշտ և անվտանգ գործելու համար
- ցածր սպասարկում
- CIP (մաքուր տեղում)
Դիզայն, արտադրություն և խորհրդատվություն – Որակյալ Արտադրված է Գերմանիայում
Hielscher ուլտրաձայնային սարքերը հայտնի են իրենց բարձր որակի և դիզայնի չափանիշներով: Հզորությունը և հեշտ շահագործումը թույլ են տալիս մեր ուլտրաձայնային սարքերի սահուն ինտեգրումը արդյունաբերական օբյեկտներում: Կոպիտ պայմանները և պահանջկոտ միջավայրերը հեշտությամբ կառավարվում են Hielscher ուլտրաձայնային սարքերի կողմից:
Hielscher Ultrasonics-ը ISO սերտիֆիկացված ընկերություն է և հատուկ շեշտադրում է կատարում բարձր արդյունավետության ուլտրաձայնային սարքերի վրա, որոնք բնութագրվում են ժամանակակից տեխնոլոգիաներով և օգտագործողների համար հարմարավետությամբ: Իհարկե, Hielscher ուլտրաձայնային սարքերը համապատասխանում են ԵԽ-ին և համապատասխանում են UL, CSA և RoH-ների պահանջներին:
Ստորև բերված աղյուսակը ցույց է տալիս մեր լաբորատոր ուլտրաձայնային սարքերի մոտավոր մշակման կարողությունները, որոնք իդեալական են նմուշների պատրաստման առաջադրանքների համար, ինչպիսիք են ԴՆԹ-ի և ՌՆԹ-ի մասնատումը, բջիջների լիզը, ինչպես նաև ԴՆԹ-ի և սպիտակուցի մեկուսացումը:
| Սարք | Հզորությունը [Վտ] | Տիպ | Ծավալը [մլ] |
|---|---|---|---|
| UIP400MTP | 400 | միկրոսալերի համար | 6 – 3456 հոր | VialTweeter | 200 թ | մինչև 10 սրվակի համար, գումարած սեղմման հնարավորություն | 0.5 – 1.5 |
| UP50H | 50 | զոնդային տիպ | 0.01 – 250 |
| UP100H | 100 | զոնդային տիպ | 0.01 – 500 |
| UP200Ht | 200 թ | զոնդային տիպ | 0.1 – 1000 |
| UP200 St | 200 թ | զոնդային տիպ | 0.1 – 1000 |
| UP400 Փ | 400 | զոնդային տիպ | 5.0 – 2000 թ |
| բաժակի եղջյուր | 200 թ | CupHorn, ձայնային ռեակտոր | 10 – 200 թ |
| GDmini2 | 200 թ | աղտոտվածությունից ազատ հոսքի բջիջ |
Կապ մեզ հետ: / Հարցրեք մեզ:
Ուլտրաձայնային CupHorn սպիտակուցի մեկուսացման և ԴՆԹ-ի մասնատման համար մի քանի նմուշների միաժամանակյա, բարձր արդյունավետությամբ նմուշի պատրաստման համար:
Փաստաթերթեր – Hielscher Sonicator մոդելներ Proteomics-ի համար
Հաճախակի տրվող հարցեր Sonication-ի և Proteomics-ի վերաբերյալ
Հնարավո՞ր է ձայնային ազդեցությամբ կոտրել դիսուլֆիդային կապերը:
Բարձր հզորությամբ ձայնագրումը կարող է կոտրել կովալենտային կապերը սպիտակուցի արդյունահանման ժամանակ: Այնուամենայնիվ, երբ sonication-ն իրականացվում է վերահսկվող հզորության մակարդակներում, որոնք համապատասխանում են նմուշներին: Ուլտրաձայնացումը չի հանգեցնի դիսուլֆիդային կապերի խզմանը: Ահա թե ինչու ճշգրիտ վերահսկումը ուլտրաձայնային գործընթացի պարամետրերի վրա, ինչպիսիք են ամպլիտուդը, հզորությունը, ժամանակը և ջերմաստիճանը, այդքան կարևոր են: Hielscher sonicators-ը ձեզ լիովին վերահսկում է այս պարամետրերը:
Հնարավո՞ր է, որ հնչյունավորումը կոտրել է պեպտիդային կապերը:
Sonication-ը պեպտիդների լուծույթն ուժեղացնելու արդյունավետ մեթոդ է՝ պինդ պեպտիդները մասնատելով ավելի փոքր մասնիկների: Այնուամենայնիվ, եթե հետձայնացումից հետո պեպտիդային լուծույթը դրսևորում է ժելացիա, պղտորություն կամ տեսանելի ֆլոկուլյատների առկայություն, դա ցույց է տալիս թերի լուծարումը, իսկ պեպտիդը պարզապես կասեցված է լուծույթի մատրիցում:
Նման դեպքերում, ամբողջական տարրալուծման հասնելու համար ավելի հզոր լուծիչի անհրաժեշտություն է առաջանում: Եթե լուծարումը շարունակվի որպես մարտահրավեր, դուք կարող եք լիոֆիլացնել և հեռացնել ցնդող բուֆերային լուծույթը: Այնուհետև, այս չորացրած նմուշը թույլ է տալիս այլընտրանքային լուծիչներ ուսումնասիրել՝ խթանելու պեպտիդների լուծելիությունը՝ այդպիսով հնարավորություն տալով բացահայտել լուծիչների օպտիմալ համակարգի նույնականացումը:
Գրականություն / Հղումներ
- Lindemann C, Lupilova N, Müller A, Warscheid B, Meyer HE, Kuhlmann K, Eisenacher M, Leichert LI. (2013): Redox proteomics uncovers peroxynitrite-sensitive proteins that help Escherichia coli to overcome nitrosative stress. Journal of Biological Chemistry 288(27); 2013. 19698-714.
- Andreas Hofmann, Bertran Gerrits, Alexander Schmidt, Thomas Bock, Damaris Bausch-Fluck, Rudolf Aebersold, Bernd Wollscheid (2010): Proteomic cell surface phenotyping of differentiating acute myeloid leukemia cells.
Blood, Volume 116, Issue 13; 2010. e26-e34. - Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 2011.
- Fic, E., Kedracka-Krok, S., Jankowska, U., Pirog, A. and Dziedzicka-Wasylewska, M. (2010): Comparison of protein precipitation methods for various rat brain structures prior to proteomic analysis. Electrophoresis, 31; 2020. 3573-3579.
- Manadas B.J., Vougas K., Fountoulakis M., Duarte C.B. (2006): Sample sonication after trichloroacetic acid precipitation increases protein recovery from cultured hippocampal neurons, and improves resolution and reproducibility in two-dimensional gel electrophoresis. Electrophoresis 27(9); 2006. 1825-1831.
- Pooreydy, B., Jafari, M., Tajik, F., Karimi, M., Rezaei-Tavirani, M., Ghassempour, A., Rezadoost, H., & Khodabandeh, M. (2013): Organelle Isolation for Proteomics: Mitochondria from Peripheral Blood Mononuclear Cells. Archives of Advances in Biosciences 4, 2013.
Hielscher Ultrasonics-ը արտադրում է բարձր արդյունավետության ուլտրաձայնային հոմոգենիզատորներ լաբորատորիա դեպի արդյունաբերական չափս.