Ultrahangos DNS-fragmentálás új generációs szekvenáláshoz
Az új generációs szekvenálás (NGS) a genomi DNS megbízható nyírását és fragmentálását igényli a genomi DNS-szálak szekvenálásához és genomkönyvtárak létrehozásához. A DNS szabályozott feldarabolása DNS-fragmentumokra alapvető minta-előkészítési lépés, amelyet a DNS szekvenálása előtt kell elvégezni. Az ultrahangos kezelés bizonyítottan hatékony és megbízható technika a DNS meghatározott hosszúságú fragmentumokra történő darabolására. Az ultrahangos DNS-fragmentálási protokollok reprodukálható fragmentálási eredményeket biztosítanak. A Hielscher ultrahangos készülékei a genomi DNS-fragmentumok méreteloszlásának széles tartományát képesek előállítani, amely az üzemi paraméterekkel pontosan szabályozható. Mivel a Hielscher ultrahangos DNS-nyíró rendszerei egyetlen mintacsőhöz, több mintacsőhöz, valamint mikrolemezekhez is elérhetők, a minta-előkészítés rendkívül hatékonnyá válik.
A UIP400MTP lemezes ultrahangos készülék nagy mintaáteresztő képességű minta-előkészítésre szolgál, és egyenletes ultrahangos kezelést biztosít a többlyukú lemezekben, mikrotiterlemezekben és 96 lyukú lemezekben lévő mintáknak
- megismételhető / reprodukálható eredmények
- pontosan beállítható a meghatározott fragmentumhossz eléréséhez
- gyors feldolgozás
- következetes DNS-fragmentálási eredmények
- készülékek bármilyen mintatérfogathoz (pl. több mintacsőhöz vagy mikrolemezekhez)
- nagy mintaáteresztő képesség
- pontos hőmérséklet-szabályozás
- egyszerű, felhasználóbarát működtetés
Új generációs szekvenálás: ultrahangos DNS-fragmentálás könyvtárkészítéshez
Az új generációs szekvenálás elvégzéséhez három alapvető lépést kell végrehajtani: (1) könyvtárkészítés, (2) szekvenálás és (3) adatelemzés. A könyvtárkészítés során a DNS-t fragmentálják, majd a fragmentumok végeit egyetlen adeninbázis hozzáadásával javítják (simítják), és a célfragmentumokat kétszálú DNS-sé alakítják. Végül úgynevezett adaptereket kapcsolnak hozzájuk ligálással, PCR-rel vagy tagmentálással, hogy a végső DNS-könyvtártermék mennyisége meghatározható legyen a szekvenáláshoz.
DNS-fragmentálás ultrahangos kezeléssel: Különösen az olyan rövid leolvasású szekvenálási technológiák alkalmazásakor, mint az Illumina, amelyek nem képesek könnyen leolvasni a hosszabb DNS-fragmentumokat, a DNS-szálakat meghatározott méretű fragmentumokra kell darabolni, ami ultrahangos kezeléssel megbízhatóan megvalósítható.
Az ultrahangos kezelés megbízhatóan alkalmazható DNS, RNS és kromatin fragmentálására.
Új generációs szekvenálás – könyvtárkészítés
Az ultrahangos DNS-fragmentálást gyakran alkalmazzák az új generációs szekvenálási (NGS) platformokhoz szükséges DNS-szekvenálási könyvtárak készítése során. Ezzel a technikával a DNS-molekulákat kisebb, a kívánt mérettartományba eső fragmentumokra bontják, ami megkönnyíti a könyvtárkészítés további lépéseit. Az ultrahangos DNS-fragmentálásra jellemzően az NGS-munkafolyamatok könyvtárkészítési lépésében van szükség, hogy a genomi DNS-t a további feldolgozásra és szekvenálásra alkalmas kisebb darabokra bontsák. Kulcsfontosságú szerepet játszik a szekvenálási kísérlet sikerének biztosításában azáltal, hogy az alkalmazott szekvenálási platformnak megfelelő mérettartományú DNS-fragmentumokat hoz létre.
Az E. coli EDL933 genomi DNS-ének elektroforetikus elemzése 0 – 15 min ultrahangos kezelés után. Az L a DNS-létrát jelöli. (Basselet et al. 2008)
Új generációs szekvenálás – a folyamat lépései:
- Ultrahangos DNS-fragmentálás: A könyvtár létrehozása előtt a genomi DNS-t kisebb, könnyebben kezelhető darabokra fragmentálják. Az ultrahangos fragmentálás során nagy frekvenciájú hanghullámokkal nyírják a DNS-molekulákat a kívánt mérettartományba eső fragmentumokra. Ez a lépés kulcsfontosságú, mert segít biztosítani, hogy a később keletkező szekvenálási leolvasások hossza megfelelő legyen az alkalmazott szekvenálási platformhoz. A fragmentumok mérettartománya a szekvenálási kísérlet egyedi követelményei alapján beállítható.
- Klonális amplifikáció PCR-rel: Az ultrahangos fragmentálás után a DNS-fragmentumokon végjavítást, adapterligálást és PCR-amplifikációt végeznek a végső DNS-szekvenálási könyvtárak létrehozásához. Ezek a lépések a szekvenálási platformhoz való kötődéshez szükséges adapterszekvenciák hozzáadásával és a PCR-amplifikációhoz szükséges primerkötő helyek biztosításával készítik elő a fragmentált DNS-molekulákat a szekvenálási folyamathoz.
- DNS-szekvenálás szintézissel: A szekvenálási könyvtárak elkészítése után megkezdődik a szintézissel történő DNS-szekvenálás (SBS) folyamata. Az SBS során a DNS-szekvenciát a komplementer szálhoz egymás után hozzáadott nukleotidok alapján határozzák meg. Ez a lépés a nukleotidbeépülés, a képalkotás és a hasítás ciklikusan ismétlődő reakcióit foglalja magában, amelyek lehetővé teszik a DNS-szekvencia meghatározását a beépült nukleotidok által kibocsátott fluoreszcens jelek alapján.
- Tömegesen párhuzamos szekvenálás: Az utolsó lépésben a térben elkülönített, amplifikált DNS-templátokat egyidejűleg, tömegesen párhuzamos módon szekvenálják. Ez a nagy áteresztőképességű szekvenálási megközelítés egyetlen szekvenálási futtatás során milliónyi vagy akár milliárdnyi leolvasás létrehozását teszi lehetővé, így a DNS-szekvenciák hatékonyan és gyorsan meghatározhatók.
Hogyan működik az ultrahangos DNS-fragmentálás?
Az ultrahangos kezelés, más néven akusztikus mintafeldolgozás, a DNS fragmentálásának széles körben alkalmazott módszere. Az ultrahangos DNS-nyírás során a mintákat szabályozott körülmények között ultrahanghullámoknak teszik ki. Az ultrahangos DNS-fragmentálás működési elve az ultrahanghullámok által létrehozott rezgéseken és kavitáción alapul. Az ultrahangos (akusztikus) kavitációból származó nyíróerők feldarabolják a nagy molekulatömegű DNS-molekulákat. Az ultrahangos kezelés beállításai, például az intenzitás (amplitúdó, időtartam), a pulzáló üzemmód és a hőmérséklet, lehetővé teszik a DNS pontos fragmentálását a kívánt hosszúságú DNS-fragmentumokra. Bár ultrahangos kezeléssel a DNS-t gyakran 100 és 600 bp közötti hosszúságúra darabolják, enyhébb ultrahangos körülmények alkalmazásával hosszabb, akár 1300 bp hosszúságú DNS-fragmentumok is előállíthatók.
Ultrahangos DNS-nyírás ChIP – kromatin-immunprecipitáció – során
Jkwchui munkája alapján átdolgozva, CC-BY-SA.03 licenc alatt
Hőmérséklet-szabályozás a DNS lebomlásának megelőzésére
A DNS kétszálú molekuláris szerkezete rendkívül érzékeny az emelkedett hőmérsékletre, ezért a minta-előkészítési lépések során a hőmérséklet pontos szabályozása kulcsfontosságú a megbízható elemzési eredményekhez.
Akár a Hielscher szondás ultrahangos készülékeit, akár a VialTweeter vagy a UIP400MTP készüléket használja, a csatlakoztatható hőmérséklet-érzékelő és az intelligens készülékszoftver biztosítja a hőmérséklet folyamatos felügyeletét és szabályozását. A hőmérséklet adott tartományon belül tartásához felső és alsó hőmérsékleti határérték állítható be. Ennek megfelelően az ultrahangos készülék szünetelteti a kezelést, amint a hőmérséklet meghaladja ezt a határértéket, és automatikusan folytatja az ultrahangos kezelést, amikor a hőmérséklet a beállított ∆T értékkel csökkent.
A Hielscher ultrahangos készülékeinek fejlett szoftvere biztosítja az ideális mintakezelési körülmények megbízható fenntartását.
Nagyszámú minta DNS-fragmentálása a UIP400MTP többlyukú lemezekhez készült ultrahangos készülékkel
Az élettudományokban a minták száma jelentősen nőtt az elmúlt évtizedben. Ez azt jelenti, hogy rendkívül sok mintát (pl. mikrolemezenként 384, 1536 vagy 3456 mintatartó lyuk tartalmát) kell a minta-előkészítés és az elemzés során következetesen azonos körülmények között feldolgozni az összehasonlítható és érvényes eredmények eléréséhez. A UIP400MTP készülékkel a Hielscher Ultrasonics követi a nagyszámú minta feldolgozásának trendjét. A UIP400MTP mikrolemezeket használó minta-előkészítésre szolgáló ultrahangos készülék. A UIP400MTP 6, 12, 24, 48, 96, 384, 1536 vagy 3456 lyukú lemezek feldolgozására képes. A mikrolemez típusától függően az egyes lyukak jellemzően néhány tíz nanolitertől több milliliterig terjedő mintatérfogatot képesek befogadni. Az élettudományi kutatásban széles körben alkalmazott UIP400MTP készüléket igen gyakran használják minta-előkészítésre olyan vizsgálatok előtt, mint az ELISA (enzimhez kapcsolt immunszorbens vizsgálat) vagy a PCR, fehérjeanalitikai vizsgálatok előtt, továbbá kromatin-előkészítésre CHiP és CHiP-seq előtt, hisztonmódosítások azonosításához és egyéb analitikai kezelésekhez (pl. gélelektroforézis, tömegspektrometria).
Olvasson többet a PCR-lemezek nagy mintaáteresztő képességű feldolgozásáról!
A VialTweeter akár 10 mintacső előkészítéséhez
A VialTweeter széles körben használt laboratóriumi ultrahangos készülék, a VialTweeter, amely akár 10 mintacső egyidejű, hatékony és kényelmes ultrahangos kezelését teszi lehetővé. Mivel a mintacsövek és kémcsövek (pl. Eppendorf-csövek, kriocsövek, centrifugacsövek) közvetett ultrahangos kezelésben részesülnek, minden keresztszennyeződés elkerülhető. Mivel minden minta azonos ultrahang-intenzitást kap, az összes ultrahangos kezelés eredménye homogén és reprodukálható. A VialTweeter a többi digitális készülékünkhöz hasonlóan minden intelligens funkciót kínál (pl. intelligens menü, programozható beállítások, hőmérséklet-szabályozás, távvezérlés stb.), így a legmagasabb szintű felhasználói kényelem biztosított.
Többujjas szondák mikrokutakat tartalmazó lemezekhez
Az UP200Ht és UP200St szondás ultrahangos homogenizátorokhoz elérhető, 4 vagy 8 ujjas szondák kényelmes lehetőséget kínálnak több minta egyidejű, azonos körülmények közötti ultrahangos kezelésére. Az MTP-24-8-96 szonotróda például nyolcujjas szonda, amely ideális automatizált rendszerekbe történő integráláshoz vagy a többlyukú lemezek lyukaiban lévő minták hatékony kézi előkészítéséhez. A többujjas szonotróda ideális a laboratóriumi automatizáláshoz olyan laboratóriumokban, ahol többnyire főzőpoharak és kémcsövek tartalmát dolgozzák fel hagyományos ultrahangos szonotródával. A többujjas és a hagyományos szondák néhány percen belül gyorsan felcserélhetők, így az egyszondás ultrahangos készülék többszondás ultrahangos feltáró készülékké alakítható.
Hielscher ultrahangos készülékek DNS-fragmentáláshoz
A Hielscher Ultrasonics különféle ultrahang-alapú platformokat kínál DNS, RNS és kromatin fragmentálásához. Ezek a különböző platformok ultrahangos szondákat (szonotródákat), több cső vagy többlyukú lemez (pl. 96 lyukú lemezek, mikrotiterlemezek) egyidejű minta-előkészítéséhez használható közvetett ultrahangos kezelési megoldásokat, szonoreaktorokat és ultrahangos csészeszonotródákat foglalnak magukban. Minden DNS-nyíró platformot frekvenciahangolt, nagy teljesítményű ultrahangos processzorok működtetnek, amelyek pontosan szabályozhatók és reprodukálható eredményeket biztosítanak.
Ultrahangos processzorok bármilyen mintaszámhoz és mintamérethez
A Hielscher több minta kezelésére szolgáló VialTweeter (akár 10 kémcsőhöz) és UIP400MTP (mikrolemezekhez / többlyukú lemezekhez) ultrahangos készülékeivel az intenzív és pontosan szabályozható ultrahangos kezelés révén könnyen csökkenthető a mintafeldolgozási idő, miközben a kívánt DNS-fragmentum-méreteloszlás és hozam is elérhető. Az ultrahangos DNS-fragmentálás hatékonnyá, megbízhatóvá és skálázhatóvá teszi a minta-előkészítést. Folyamatosan szabályozott ultrahang alkalmazásával a protokollok egyetlen mintáról nagyszámú mintára lineárisan skálázhatók.
Az egy–öt ujjas szondás ultrahangos készülékek ideálisak kisebb számú minta előkészítéséhez. A Hielscher laboratóriumi ultrahangos készülékei különböző méretekben érhetők el, így az alkalmazásához és követelményeihez ideális készüléket tudjuk ajánlani.
Pontos folyamatszabályozás
Az ultrahangos kezelés pontosan szabályozható beállításai kulcsfontosságúak, mivel a túlzott ultrahangos kezelés tönkreteheti a DNS-t, az RNS-t és a kromatint, míg a nem megfelelő ultrahangos nyírás túl hosszú DNS- és kromatinfragmentumokat eredményez. A Hielscher digitális ultrahangos készülékein könnyen beállíthatók az ultrahangos kezelés pontos paraméterei. Az egyedi ultrahangos kezelési beállítások programozott beállításként is elmenthetők ugyanazon eljárás gyors megismétléséhez.
Minden ultrahangos kezelést automatikusan naplóznak, és CSV-fájlként tárolnak egy beépített SD-kártyán. Ez lehetővé teszi az elvégzett kísérletek pontos dokumentálását és az ultrahangos kezelési futtatások egyszerű felülvizsgálatát.
A böngészőalapú távvezérléssel minden digitális ultrahangos készülék működtethető és felügyelhető bármely szokványos böngészőből. Nincs szükség további szoftver telepítésére, mivel a LAN-kapcsolat rendkívül egyszerű, csatlakoztatás után azonnal használható üzembe helyezést tesz lehetővé.
A legmagasabb szintű felhasználóbarát működés az ultrahangos minta-előkészítésben
Minden Hielscher ultrahangos készüléket úgy terveztek, hogy nagy teljesítményű ultrahangot biztosítson, miközben mindig rendkívül felhasználóbarát és könnyen kezelhető marad. Az összes beállítás jól strukturált, áttekinthető menüben található, amely színes érintőkijelzőn vagy böngészőalapú távvezérléssel könnyen elérhető. A programozható beállításokat és automatikus adatrögzítést kínáló intelligens szoftver optimális ultrahangos kezelési beállításokat biztosít a megbízható és reprodukálható eredményekhez. Az áttekinthető és könnyen használható menüfelület felhasználóbarát és hatékony készülékekké teszi a Hielscher ultrahangos készülékeit.
Az alábbi táblázat tájékoztatást ad laboratóriumi ultrahangos készülékeink hozzávetőleges feldolgozási kapacitásáról; ezek ideálisak olyan minta-előkészítési feladatokhoz, mint a DNS és az RNS fragmentálása, a sejtlízis és a fehérjekivonás:
| Készülék | Teljesítmény [W] | Típus | Térfogat [mL] |
|---|---|---|---|
| UIP400MTP | 400 | mikrolemezekhez | 6 – 3456 lyuk | VialTweeter | 200 | akár 10 mintacsőhöz, további rászorítási lehetőséggel | 0,5 – 1,5 |
| UP50H | 50 | szondás | 0,01 – 250 |
| UP100H | 100 | szondás | 0,01 – 500 |
| UP200Ht | 200 | szondás | 0,1 – 1000 |
| UP200St | 200 | szondás | 0,1 – 1000 |
| UP400St | 400 | szondás | 5,0 – 2000 |
| CupHorn | 200 | CupHorn, szonoreaktor | 10 – 200 |
| GDmini2 | 200 | szennyeződésmentes átfolyó cella |
Lépjen kapcsolatba velünk! / Kérdezzen tőlünk!
A több minta előkészítésére szolgáló ultrahangos készülék, a VialTweeter, akár 10 mintacső egyidejű ultrahangos kezelését teszi lehetővé. A VialPress rászorító eszközzel akár 4 további cső szorítható az elülső felülethez intenzív ultrahangos kezelés céljából.
Az MTP-24-8-96 szonotróda nyolc ultrahangos szondával rendelkezik a mikrotiterlemezek lyukaiban lévő minták ultrahangos kezeléséhez.
Szakirodalom / Hivatkozások
- Qiyun Liang, Christoph Ratzke (2025): Lysing diverse bacteria with the Hielscher UIP400MTP for DNA sequencing. Protocol Uni Tübingen 2025.
- Poptsova, M., Il’icheva, I., Nechipurenko, D. et al. (2014): Non-random DNA fragmentation in next-generation sequencing. Scientific Reports 4, 4532; 2014.
- Basselet P., Wegrzyn G., Enfors S.-O., Gabig-Ciminska M. (2008): Sample processing for DNA chip array-based analysis of enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC). Microbial Cell Factories 7:29. 2008.
- Wang Y., Joshu C.E., Curtis S.D., Douville C., Burk V.A., Ru M., Popoli M., Ptak J., Dobbyn L., Silliman N., Coresh J., Boerwinkle E., Prizment A., Bettegowda C., Kinzler K.W., Papadopoulos N., Platz E.A., Vogelstein B. (2025): Detection of cancers three years prior to diagnosis using plasma cell-free DNA. Cancer Discovery 2025 May.
- Doublier S., Riganti Ch., Voena C., Costamagna C., Aldieri E., Pescarmona G., Ghigo D., Bosia A. (008): RhoA Silencing Reverts the Resistance to Doxorubicin in Human Colon Cancer Cells. Molecular Cancer Research 6(10), 2008.
- Fredlund E., Gidlund A., Olsen M., Börjesson T., Spliid N.H.H., Simonsson M. (2008): Method evaluation of Fusarium DNA extraction from mycelia and wheat for down-stream real-time PCR quantification and correlation to mycotoxin levels. Journal of Microbiological Methods 2008.
- Fritsche C., Sitz M., Weiland N., Breitling R., Pohl H.-D. (2007): Characterization of the growth behavior of Leishmania tarentolae – a new expression system for recombinant proteins. Journal of Basic Microbiology 47, 2007. 384–393.
- Ristola M., Arpiainen S., Saleem M. A., Mathieson P. W., Welsh G. I., Lehtonen S., Holthöfer H. (2009): Regulation of Neph3 gene in podocytes – key roles of transcription factors NF-κB and Sp1. BMC Molecular Biology 10:83, 2009.
- Rodriguez J., Vives L., Jorda M., Morales C., Munoz M., Vendrell E., Peinado M. A. (2008): Genome-wide tracking of unmethylated DNA Alu repeats in normal and cancer cells. Nucleic Acids Research Vol. 36, No. 3, 2008. 770-784.
- Weiske J. Huber O. (2006): The Histidine Triad Protein Hint1 Triggers Apoptosis Independent of Its Enzymatic Activity. The Journal of Biological chemistry. Vol. 281, No. 37, 2006. 27356–27366.
Hasznos tudnivalók
Mi az új generációs szekvenálás?
Az új generációs szekvenálás, más néven Next Gen Sequencing (NGS), nagy áteresztőképességű szekvenálás vagy második generációs szekvenálás, olyan tömegesen párhuzamos szekvenálási megközelítés, amelyben futtatásonként több millió fragmentum igen nagy (tömeges) mennyiségű DNS-ét szekvenálják egyidejűleg, párhuzamosan.
Az új generációs szekvenáláshoz a következő három alapvető lépés
- a könyvtárkészítés,
- a szekvenálás és
- az adatelemzés
elvégzése szükséges.
A könyvtárkészítés során a DNS-szálakat meghatározott hosszúságú DNS-fragmentumokra kell darabolni. Az ultrahangos kezelés a DNS-fragmentálás egyik előnyben részesített technikája.
A DNS-szekvenálás során meghatározzák a DNS nukleotidjainak sorrendjét – az úgynevezett nukleinsav-szekvenciát. A nukleinsav-szekvenciát négy nukleotidbázis alkotja – adenin, citozin, guanin és timin –, amelyek információt kódolnak.
Az új generációs szekvenálás előmozdítja az élettudományi és a személyre szabott orvoslási kutatásokat, mivel a DNS- és RNS-szekvenálást széles körben alkalmazzák a genomikai kutatásban, a rákkutatásban, a ritka és összetett betegségek kutatásában, a mikrobiális kutatásban, az agrárgenomikában és számos más kutatási területen.
Új generációs szekvenálás és Sanger-szekvenálás
Míg az új generációs szekvenálással (NGS) rendkívül nagyszámú genomi minta szekvenálható, a Sanger-szekvenálás (más néven láncterminációs módszer vagy első generációs szekvenálás) csak kis számú minta szekvenálására képes. A Sanger-szekvenálás egyszerre csak egyetlen DNS-fragmentumot szekvenál, és egyetlen nap alatt elvégezhető. Pontossága miatt a Sanger-szekvenálást arany standard technológiának is tekintik, amelyet az új generációs szekvenálással kapott eredmények ellenőrzésére használnak.
A Sanger-szekvenálás hozzávetőleg 800bp leolvasási hosszt ér el (nem dúsított DNS esetén jellemzően 500–600bp). A Sanger-szekvenálás hosszabb leolvasásai jelentős előnyöket nyújtanak más szekvenálási módszerekkel szemben, különösen a genom ismétlődő régióinak szekvenálásakor. A rövid leolvasású szekvenciaadatok jelentette kihívás különösen új genomok (de novo) szekvenálásakor és nagymértékben átrendeződött genomszakaszok szekvenálásakor okoz problémát; ilyenek jellemzően a daganatos genomokban vagy a kromoszómák strukturális variációt mutató régióiban fordulnak elő. [cp. Morozova and Marra, 2008]
DNS – dezoxiribonukleinsav – formái és funkciói
A DNS minden formájának egyedi jellemzői és alkalmazásai vannak, amelyek a kutatási területek széles köréhez járulnak hozzá, beleértve az onkológiát, a genetikát, az igazságügyi tudományokat és az evolúcióbiológiát. A Hielscher ultrahangos készülékei rendkívül hatékony és megbízható megoldást kínálnak a DNS és az RNS izolálására és fragmentálására az Ön elemzési céljaihoz. Az alábbi listában ismertetjük a DNS egyes formáit, és biológiai környezetük, valamint funkcióik alapján kategorizáljuk őket:
- Genomi DNS (gDNA)
Genomi DNS (gDNA): Egy szervezet teljes DNS-állománya, amely a kódoló (gének) és a nem kódoló régiókat egyaránt tartalmazza. - Extracelluláris DNS
Keringő tumor-DNS (ctDNA): A daganatsejtek által a véráramba kibocsátott DNS-fragmentumok.
Sejtmentes DNS (cfDNA): Különböző szövetekből származó, a véráramban szabadon keringő DNS-fragmentumok. - Extrakromoszomális cirkuláris DNS (eccDNA): Az eukarióta sejtekben a kromoszómákon kívül található kör alakú DNS-molekulák.
Virális DNS: Vírusokból származó DNS, amely a gazdaszervezet genomjába integrálódva vagy episzomális DNS-ként van jelen. - Mitokondriális DNS
Mitokondriális DNS (mtDNA): A mitokondriumokban található, anyai ágon öröklődő és az energiatermelésben részt vevő DNS. - Plazmid-DNS
Plazmid-DNS: Kisméretű, kör alakú DNS-molekulák, amelyek a kromoszomális DNS-től függetlenül replikálódnak, gyakran találhatók baktériumokban, és a géntechnológiában használják őket. - Sejtmag-DNS
Sejtmag-DNS (nDNA): Az eukarióta sejtek sejtmagjában található DNS, amely egy szervezet genetikai anyagának többségét alkotja. - Egyetlen sejtből származó DNS
Egyetlen sejtből származó DNS (scDNA): Egyetlen sejtből kivont DNS, amelyet egyedi sejtszintű, részletes genomikai elemzésre használnak. - Rekombináns DNS
Rekombináns DNS (rDNA): A genetikai rekombináció laboratóriumi módszereivel létrehozott DNS-molekulák, amelyek több forrásból származó genetikai anyagot egyesítenek. - Speciális formák
Környezeti DNS (eDNA): Környezeti mintákból (talaj, víz), a forrásszervezetek izolálása nélkül gyűjtött DNS
Ősi DNS (aDNA): Ősi mintákból kivont DNS, amely betekintést nyújt az evolúcióbiológiába és az ősi populációkba. - Kromoszomális DNS
Kromoszomális DNS: A sejtmag kromoszómáit alkotó DNS, amely kódoló és nem kódoló régiókat egyaránt tartalmaz. - Virális és szintetikus formák
Virális DNS: Vírusokból származó DNS, amely a gazdaszervezetek genomjába integrálódhat, vagy önálló egységként létezhet.
Szintetikus DNS: Kémiai folyamatokkal mesterségesen szintetizált DNS-szekvenciák, amelyeket gyakran használnak a kutatásban és a biotechnológiában.
A Hielscher Ultrasonics nagy teljesítményű ultrahangos homogenizátorokat gyárt a laboratóriumi mérettől az ipari méretig.