Lyse cellulaire des cellules BL21 par ultrasons
Les cellules BL21 sont une souche d’E. coli largement utilisée dans les laboratoires de recherche, en biotechnologie et dans la production industrielle en raison de leur capacité à exprimer des protéines de manière très efficace. La désintégration cellulaire, la lyse et l’extraction de protéines par ultrasons constituent la méthode courante pour isoler et recueillir les protéines ciblées à partir de l’intérieur cellulaire des cellules BL21. La sonication désintègre complètement la cellule et libère toutes les protéines piégées, rendant 100% de la protéine disponible.
Cellules BL21 pour l’expression de protéines
La cellule BL21 est une souche bactérienne d’E. coli chimiquement compétente, adaptée à la transformation et à l’expression de protéines à haut niveau au moyen d’un système d’induction ARN polymérase T7-IPTG. Les cellules BL21 permettent une expression protéique à haute efficacité de tout gène placé sous le contrôle d’un promoteur T7. La souche d’E. coli BL21(DE3) est une souche de production de protéines basée sur l’ARN polymérase T7, combinée à des vecteurs d’expression basés sur le promoteur T7, et elle est largement utilisée en laboratoire et dans l’industrie pour produire des protéines recombinantes. Dans BL21(DE3), l’expression du gène codant la protéine recombinante est transcrite par l’ARN polymérase T7 (T7 RNAP) codée chromosomiquement, qui transcrit huit fois plus vite que la RNAP conventionnelle d’E. coli. Cela rend la souche BL21(DE3) très efficace et en fait l’un des systèmes cellulaires d’expression de protéines les plus prisés.
Protocole de lyse par ultrasons et d’extraction de protéines à partir de cellules BL21
La lyse cellulaire des cellules BL21 est le plus souvent réalisée par sonication en combinaison avec du lauroylsarcosinate de sodium (également appelé sarkosyl) comme tampon de lyse. Les avantages de la désintégration cellulaire et de l’extraction de protéines par ultrasons résident dans la fiabilité, la reproductibilité ainsi que dans l’utilisation simple, sûre et rapide des ultrasonicateurs. Le protocole ci-dessous donne des instructions étape par étape pour la lyse des cellules BL21 par ultrasons :
- Afin d’éliminer les protéines chaperonnes, les culots bactériens BL21 ont été remis en suspension dans 50 ml de tampon Sodium Tris-EDTA (STE) glacé (composé de 10 mM Tris-HCL, pH 8,0, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, complété par 100 mM PMSF).
- Ensuite, 500 ul de lysozyme (10 mg/ ml) sont ajoutés et les cellules sont incubées sur glace pendant 15 min.
- Puis, 500 ul de DTT et 7 ml de sarkosyl (10% (p/v) préparé dans du tampon STE) sont ajoutés.
- Il est essentiel de maintenir tous les tampons de purification glacés et de garder les échantillons sur glace en permanence. Toutes les étapes de purification doivent, si possible, être effectuées en chambre froide.
- Pour la lyse par ultrasons et l’extraction de protéines, les échantillons sont soumis à la sonication dans le VialTweeter, ultrasonicateur MultiSample pendant 4 x 30 sec à 100% d’amplitude, avec un intervalle de 2 min entre chaque sonication. Alternativement, un homogénéisateur à ultrasons de type sonde avec micro-pointe, p. ex. UP200Ht avec S26d2 (3 x 30 sec, pause de 2 min. entre les cycles d’ultrasons, amplitude de 80%), peut être utilisé.
- Pour les étapes de purification ultérieures, les échantillons doivent être conservés sur glace ou, alternativement, stockés à -80°C jusqu’à la suite du traitement.
Désintégrateur cellulaire à ultrasons UP200St avec micro-pointe S26d2 pour la lyse et l’extraction de protéines
Lyse par ultrasons avec un contrôle précis de la température
Un contrôle précis et fiable de la température est crucial lors de la manipulation d’échantillons biologiques. Des températures élevées déclenchent une dégradation thermique des protéines dans les échantillons.
Comme toutes les techniques mécaniques de préparation d’échantillons, la sonication génère de la chaleur. Toutefois, la température des échantillons peut être bien contrôlée lors de l’utilisation du VialTweeter. Nous vous présentons différentes options pour surveiller et contrôler la température de vos échantillons pendant que vous les préparez pour l’analyse avec le VialTweeter et le VialPress.
- Surveillance de la température de l’échantillon : le processeur à ultrasons UP200St, qui pilote le VialTweeter, est équipé d’un logiciel intelligent et d’un capteur de température enfichable. Branchez le capteur de température sur l’UP200St et insérez la pointe du capteur de température dans l’un des tubes d’échantillon. Via l’écran tactile couleur numérique, vous pouvez définir dans le menu de l’UP200St une plage de température spécifique pour la sonication de vos échantillons. L’ultrasonicateur s’arrête automatiquement lorsque la température maximale est atteinte et reste en pause jusqu’à ce que la température de l’échantillon soit redescendue à la valeur inférieure du ∆ de température défini. La sonication reprend alors automatiquement. Cette fonction intelligente empêche la dégradation induite par la chaleur.
- Le bloc VialTweeter peut être prérefroidi. Placer le bloc VialTweeter (uniquement la sonotrode, sans transducteur !) au réfrigérateur ou au congélateur pour prérefroidir le bloc de titane aide à retarder la hausse de température dans l’échantillon. Si possible, l’échantillon lui-même peut également être prérefroidi.
- Utilisez de la glace sèche pour refroidir pendant la sonication. Utilisez un bac peu profond rempli de glace sèche et placez le VialTweeter sur la glace afin que la chaleur puisse se dissiper rapidement.
Des clients du monde entier utilisent le VialTweeter et le VialPress pour leurs travaux quotidiens de préparation d’échantillons dans des laboratoires biologiques, biochimiques, médicaux et cliniques. Grâce au logiciel intelligent et au contrôle de la température du processeur UP200St, la température est contrôlée de manière fiable et la dégradation des échantillons induite par la chaleur est évitée. La préparation d’échantillons par ultrasons avec le VialTweeter et le VialPress fournit des résultats hautement fiables et reproductibles !
Trouvez le désintégrateur à ultrasons optimal pour votre application de lyse
Hielscher Ultrasonics est un fabricant expérimenté de longue date de désintégrateurs cellulaires et d’homogénéisateurs à ultrasons haute performance pour les laboratoires, ainsi que de systèmes de paillasse et à l’échelle industrielle. La taille de votre culture de cellules bactériennes, votre objectif de recherche ou de production et le volume de cellules à traiter par heure ou par jour sont des facteurs essentiels pour trouver le désintégrateur cellulaire à ultrasons adapté à votre application.
Hielscher Ultrasonics propose diverses solutions pour la sonication simultanée de multi-échantillons (jusqu’à 10 flacons avec le VialTweeter) et d’échantillons en masse (c.-à-d. plaques de microtitration / plaques ELISA avec l’UIP400MTP), ainsi que l’ultrasonicateur de laboratoire classique de type sonde avec différents niveaux de puissance de 50 à 400 watts, jusqu’aux processeurs à ultrasons entièrement industriels d’une puissance allant jusqu’à 16 000 watts par unité pour la désintégration cellulaire et l’extraction de protéines à des fins commerciales dans le cadre d’une production à grande échelle. Tous les ultrasonicateurs Hielscher sont conçus pour un fonctionnement 24/7/365 à pleine charge. La robustesse et la fiabilité sont des caractéristiques essentielles de nos appareils à ultrasons.
Tous les homogénéisateurs à ultrasons numériques sont équipés d’un logiciel intelligent, d’un écran tactile couleur et d’un protocolage automatique des données, qui font de l’appareil à ultrasons un outil de travail pratique en laboratoire et dans les installations de production.
Indiquez-nous quel type de cellules, quel volume, à quelle fréquence et avec quel objectif vous devez traiter vos échantillons biologiques. Nous vous recommanderons le désintégrateur cellulaire à ultrasons le plus adapté aux exigences de votre procédé.
Le tableau ci-dessous vous donne une indication de la capacité de traitement approximative de nos systèmes à ultrasons, des homogénéisateurs portatifs compacts et des ultrasonicateurs MultiSample jusqu’aux processeurs à ultrasons industriels pour les applications commerciales :
| Volume du lot | Débit | Appareils recommandés |
|---|---|---|
| Plaques 96 puits / de microtitration | s.o. | UIP400MTP |
| 10 flacons de 0,5 à 1,5mL | s.o. | VialTweeter sur UP200St |
| 0,01 à 250mL | 5 à 100mL/min | UP50H |
| 0,01 à 500mL | 10 à 200mL/min | UP100H |
| 10 à 2000mL | 20 à 400mL/min | UP200Ht, UP400St |
| 0,1 à 20L | 0,2 à 4L/min | UIP2000hdT |
| 10 à 100L | 2 à 10L/min | UIP4000hdT |
| s.o. | 10 à 100L/min | UIP16000 |
| s.o. | supérieur | cluster de UIP16000 |
Contactez-nous ! / Posez-nous vos questions !
Sonicateur pour plaques UIP400MTP pour la désintégration cellulaire à haute cadence de traitement des échantillons dans des plaques 96 puits
Ultrasonicateur UP200Ht avec micro-pointe S26d2 de 2mm pour la sonication de petits échantillons
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Bon à savoir
Bactéries Escherichia coli
Escherichia coli est un type de bactérie non sporulante, à Gram négatif, caractérisée par sa forme de bâtonnet droit. Les bactéries E.coli sont présentes dans l’environnement, les aliments et l’intestin de l’homme et des animaux. E. coli est généralement mobile grâce à des flagelles péritriches, mais il existe aussi des types non mobiles. Les E.coli sont des organismes dits chimio-organotrophes anaérobies facultatifs, ce qui signifie qu’ils sont capables d’un métabolisme à la fois respiratoire et fermentaire. La plupart des types d’E.coli sont bénins et remplissent des fonctions utiles dans l’organisme, p. ex. en inhibant la croissance d’espèces bactériennes nuisibles, en synthétisant des vitamines, etc.
Les cellules bactériennes Escherichia coli de type dit B constituent une catégorie particulière de souches d’E.coli, largement utilisées en recherche pour étudier des mécanismes tels que la sensibilité aux bactériophages ou les systèmes de restriction-modification. En outre, les bactéries E.coli sont appréciées comme bêtes de somme fiables pour l’expression de protéines dans les laboratoires de biotechnologie et de sciences de la vie. Par exemple, E.coli est utilisée pour synthétiser des composés tels que des protéines et des oligosaccharides à l’échelle industrielle. En raison de caractéristiques spécifiques telles qu’une déficience en protéases, une faible production d’acétate à un niveau élevé de glucose et une perméabilité accrue, les cellules E. coli B sont les cellules hôtes les plus fréquemment utilisées pour la production de protéines issues du génie génétique.
Protéine recombinante
Les protéines recombinantes (rProt) gagnent une importance considérable dans de nombreux secteurs, notamment dans la production chimique, les industries pharmaceutique et cosmétique, la médecine humaine et vétérinaire, l’agriculture, l’alimentation ainsi que le traitement des déchets.
La production de protéines recombinantes nécessite l’utilisation d’un système d’expression. Comme systèmes cellulaires d’expression pour la production d’ADN recombinant, des cellules procaryotes comme eucaryotes peuvent être utilisées. Alors que les cellules bactériennes sont les plus utilisées pour l’expression de protéines en raison de facteurs tels que leur faible coût, leur facilité de mise à l’échelle et leurs conditions de milieu simples, les systèmes de mammifères, de levures, d’algues, d’insectes et acellulaires sont des alternatives établies. Le type de protéine, l’activité fonctionnelle ainsi que le rendement requis en protéine exprimée influencent le choix du système cellulaire utilisé pour l’expression de protéines.
Pour exprimer une protéine recombinante, une cellule donnée doit être transfectée avec un vecteur d’ADN contenant la matrice de l’ADN recombinant. Les cellules transfectées avec la matrice sont ensuite cultivées. Sous l’effet du mécanisme cellulaire, les cellules transcrivent et traduisent la protéine d’intérêt, produisant ainsi la protéine ciblée.
Comme les protéines exprimées sont piégées dans la matrice cellulaire, la cellule doit être lysée (désintégrée et rompue) pour libérer les protéines. Lors d’une étape de purification ultérieure, la protéine est séparée et purifiée.
La première protéine recombinante utilisée en thérapeutique a été l’insuline humaine recombinante en 1982. Aujourd’hui, plus de 170 types de protéines recombinantes sont produits dans le monde pour des traitements médicaux. Les protéines recombinantes couramment utilisées en médecine sont par exemple des hormones recombinantes, des interférons, des interleukines, des facteurs de croissance, des facteurs de nécrose tumorale, des facteurs de coagulation sanguine, des médicaments thrombolytiques et des enzymes destinés au traitement de maladies majeures telles que le diabète, le nanisme, l’infarctus du myocarde, l’insuffisance cardiaque congestive, l’apoplexie cérébrale, la sclérose en plaques, la neutropénie, la thrombocytopénie, l’anémie, l’hépatite, la polyarthrite rhumatoïde, l’asthme, la maladie de Crohn, ainsi que pour les thérapies anticancéreuses. (cf. Phuc V. Pham, in Omics Technologies and Bio-Engineering, 2018)
Bibliographie / Références
- Cheraghi S.; Akbarzade A.; Farhangi A.; Chiani M.; Saffari Z.; Ghassemi S.; Rastegari H.; Mehrabi M.R. (2010): Improved Production of L-lysine by Over-expression of Meso-diaminopimelate Decarboxylase Enzyme of Corynebacterium glutamicum in Escherichia coli. Pak J Biol Sci. 2010 May 15; 13(10), 2010. 504-508.
- LeThanh, H.; Neubauer, P.; Hoffmann, F. (2005): The small heat-shock proteins IbpA and IbpB reduce the stress load of recombinant Escherichia coli and delay degradation of inclusion bodies. Microb Cell Fact 4, 6; 2005.
- Martínez-Gómez A.I.; Martínez-Rodríguez S.; Clemente-Jiménez J.M.; Pozo-Dengra J.; Rodríguez-Vico F.; Las Heras-Vázquez F.J. (2007): Recombinant polycistronic structure of hydantoinase process genes in Escherichia coli for the production of optically pure D-amino acids. Appl Environ Microbiol. 73(5); 2007. 1525-1531.
- Kotowska M.; Pawlik K.; Smulczyk-Krawczyszyn A.; Bartosz-Bechowski H.; Kuczek K. (2009): Type II Thioesterase ScoT, Associated with Streptomyces coelicolor A3(2) Modular Polyketide Synthase Cpk, Hydrolyzes Acyl Residues and Has a Preference for Propionate. Appl Environ Microbiol. 75(4); 2009. 887-896.
Sonicateur VialTweeter pour la sonication simultanée de 10 échantillons, p. ex. pour désintégrer des cellules BL21
