PMCA für den Hochdurchsatz-Nachweis von Prionen mit dem Sonicator UIP400MTP
Der UIP400MTP Multi-Well-Platten-Sonicator bietet eine leistungsstarke Lösung für die Probenvorbereitung mit hohem Durchsatz bei der zyklischen Amplifikation von Proteinfehlfaltungen (PMCA). Durch die gleichmäßige Energieverteilung über mehrere Vertiefungen und die Einhaltung präziser Beschallungsparameter ermöglicht dieses System die gleichzeitige Verarbeitung zahlreicher Proben mit außergewöhnlicher Reproduzierbarkeit. Diese Fähigkeiten sind von entscheidender Bedeutung für die Optimierung der PMCA zum Nachweis von Prionen in niedrigen Konzentrationen in schwierigen biologischen Proben, wie z. B. Speichel, bei denen Assay-Inhibitoren die Ergebnisse verschleiern können.
Prionenkrankheiten, wie die Chronic Wasting Disease (CWD) bei Hirschartigen und die Creutzfeldt-Jakob-Krankheit (CJD) beim Menschen, sind neurodegenerative Erkrankungen, die durch fehlgefaltete Prionproteine (PrPSc). Bei diesen Krankheiten sind oft geringe Mengen infektiöser Prionen in Körperflüssigkeiten wie Speichel, Blut und Urin vorhanden, was die Diagnose und Forschung erschwert. Die horizontale Übertragung von CWD durch Prionen, die in der Umweltmatrix ausgeschieden werden, hat besonders große Auswirkungen auf das Wildtiermanagement und die ökologische Gesundheit. Auch bei Krankheiten wie der Creutzfeldt-Jakob-Krankheit ist die zuverlässige Amplifikation fehlgefalteter Prionproteine aus menschlichen Proben von entscheidender Bedeutung für eine verbesserte Diagnostik und das Verständnis des Krankheitsverlaufs.
Hocheffiziente Amplifikation von Proteinfehlfaltungen mit dem Hochdurchsatzsonicator UIP400MTP
Die Anwendung eines modifizierten PMCA-Protokolls ermöglicht es, gängige Assay-Inhibitoren (z. B. Muzine im Speichel) zu umgehen und eine hohe Sensitivität beim Nachweis von Prionen zu erreichen, die andernfalls mit Techniken wie der quakenden Echtzeit-Konversion (RT-QuIC) nicht nachweisbar oder unklar wären. Diese Fortschritte verbessern den Prionennachweis für verschiedene Krankheiten und machen PMCA zu einem unverzichtbaren Instrument für die Prionenforschung und -diagnostik. Der Multi-Well-Platten-Sonicator UIP400MTP ermöglicht die PMCA-Beschallung zahlreicher Proben in Mikroplatten (z. B. 6-, 24- oder 96-Well-Platten) oder Fläschchen in einem Röhrchen-Rack im Hochdurchsatzverfahren.
Protokoll für die zyklische Amplifikation der Proteinfehlfaltung (PMCA) im Hochdurchsatzverfahren
Das folgende Protokoll ermöglicht die effiziente Verarbeitung einer großen Anzahl von Proben unter genau denselben Bedingungen, um zuverlässige Forschungsergebnisse zu erzielen.
Probenvorbereitung
Ausgangsmaterial:
Proben vorbereiten durch:
- Resuspendieren der Sarkosyl-Extraktionspellets in PMCA-Substrat.
- Direktes Versetzen von Gehirnhomogenaten oder Blutproben mit Prionensamen.
Substrat:
- Verwenden Sie ein 10%iges (wt/vol) Gehirnhomogenat von transgenen Mäusen, die PrP überexprimierenC (z. B. Tg-Mäuse).
- Homogenisieren Sie das Hirngewebe in:
– 1× PBS.
– 150 mM NaCl.
– 1% Triton X-100. - Lagern Sie das Substrat bis zur Verwendung bei -80ºC.
Probenaufbau in Mikroplatte oder Röhrchen:
Röhren:
- 90 μl Gehirnhomogenat-Substrat zugeben und mit 10 μl Probe (z. B. Blut, Gehirnhomogenat oder Sarkosylpellet) ansetzen.
- Geben Sie 3 Teflonkügelchen (1,59 mm oder 2,38 mm Durchmesser) in jedes 0,2-mL-Röhrchen.
- Montieren Sie die Röhren in einem mit dem UIP400MTP-Sonicator kompatiblen Gestell.
6-Well-Mikroplatte:
- 5 mL Gehirnhomogenat-Substrat hinzufügen und mit 500 μL Probe pro Vertiefung aussäen.
- In jede Vertiefung 3 Teflonkügelchen geben.
PMCA-Verfahren
Platzierung:
Setzen Sie das Röhrchengestell oder die 6-Well-Mikroplatte gemäß den Anweisungen des Herstellers in den UIP400MTP-Sonicator.
Radsport-Programm:
Führen Sie 144 PMCA-Zyklen wie folgt durch:
- Inkubation: 29 Minuten und 30 Sekunden bei 37°C.
- Beschallung: 30 Sekunden bei 60 % Amplitude.
- Überwachen Sie die Temperatur: Verwenden Sie den steckbaren Temperatursensor zur Überwachung der Probentemperatur und programmieren Sie das UIP400MTP auf eine maximale Temperatur von 48-50°C.
Nachfolgende Runden:
Nach Abschluss der ersten Runde von 144 Zyklen übertragen Sie ein Aliquot des amplifizierten Materials:
- 10-fache Verdünnung in frischem transgenem Maushirn-Homogenat-Substrat.
- Führen Sie für die folgenden Runden 96 PMCA-Zyklen durch, wobei Sie die gleichen Beschallungsparameter beibehalten.
- Fahren Sie mit der gewünschten Anzahl von Runden fort (normalerweise bis zu 5).
Nachweis von PrPSc
- Proteinase K Verdauung:
– Die Proben 1 Stunde lang mit Proteinase K (50 μg/mL) bei 37 °C behandeln.
– Beenden Sie den Verdau durch Zugabe von SDS-Probenpuffer und 10 Minuten langes Sieden. - Western-Blot-Analyse:
– Analysieren Sie die verdauten Proben mit:
– 6H4 oder PRC1 Anti-PrP-Antikörper.
– SDS-PAGE durchführen und zum Nachweis auf PVDF-Membranen übertragen.
Verarbeiten Sie mehr Proben für zuverlässigere Ergebnisse
Der Multi-Well-Platten-Sonicator UIP400MTP verbessert die Effizienz und Skalierbarkeit der zyklischen Amplifikation von Proteinfehlfaltung (PMCA) erheblich und behebt die traditionell zeitaufwändige Natur des Verfahrens. Das System ermöglicht die gleichzeitige Verarbeitung von bis zu 96 Proben in einer 96-Well-Platte und rationalisiert so die PMCA-Workflows bei gleichzeitiger Einhaltung präziser und einheitlicher Beschallungsbedingungen in allen Wells. Diese Hochdurchsatzfähigkeit minimiert die manuelle Handhabung, reduziert arbeitsintensive Schritte und gewährleistet die Reproduzierbarkeit, was es zu einem unverzichtbaren Werkzeug für die Prionenforschung macht. Ob bei der Untersuchung der Chronic Wasting Disease oder der Creutzfeldt-Jakob-Krankheit, das UIP400MTP erleichtert groß angelegte Studien mit größerer Effizienz und ermöglicht es den Forschern, die Anforderungen moderner diagnostischer und wissenschaftlicher Anwendungen zu erfüllen.
Literatur / Literaturhinweise
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
Mikroplatten-Sonicator UIP400MTP für PMCA mit hohem Durchsatz
Häufig gestellte Fragen
Was sind Prionen?
Prionen sind fehlgefaltete Proteine, die eine anormale Faltung normaler zellulärer Proteine, insbesondere im Gehirn, hervorrufen können. Im Gegensatz zu Bakterien oder Viren verfügen Prionen nicht über Nukleinsäuren und vermehren sich durch einen selbsttätigen Mechanismus, der zu fortschreitenden neurodegenerativen Erkrankungen wie der Creutzfeldt-Jakob-Krankheit, der bovinen spongiformen Enzephalopathie (Rinderwahnsinn) und der Traberkrankheit bei Schafen führt. Ihre Resistenz gegenüber den üblichen Sterilisationsverfahren unterstreicht ihre einzigartige Pathogenität und stellt in der Medizin und Forschung eine große Herausforderung dar.
Was ist die PMCA-Methode?
Die Protein Misfolding Cyclic Amplification (PMCA) ist eine Labortechnik zur Vervielfältigung fehlgefalteter Prionproteine (PrP^Sc) in vitro. Sie ahmt die Umwandlung des normalen zellulären Prionproteins (PrP^C) in seine fehlgefaltete infektiöse Form (PrP^Sc) nach, die ein Kennzeichen von Prionenkrankheiten ist. Der Prozess umfasst Zyklen von Inkubation und Beschallung, um die Aggregation von PrP^Sc zu beschleunigen, was ihn zu einem leistungsfähigen Instrument für den Nachweis geringer Prionenkonzentrationen macht.
Welche Proteinfehlfaltung verursacht die Creutzfeldt-Jakob-Krankheit?
Die Creutzfeldt-Jakob-Krankheit (CJD) wird durch die Fehlfaltung des Prionproteins (PrP) verursacht. Die normale Isoform (PrPC) nimmt eine abnorme, β-Faltblatt-reiche Konformation an (PrPSc), das infektiös wird und im Gehirn Amyloid-Aggregate bildet, die zur Neurodegeneration führen.
Was ist die zyklische Amplifikation der Proteinfehlfaltung bei infektiösen Prionen?
Protein Misfolding Cyclic Amplification (PMCA) ist eine Methode zur Vervielfältigung der infektiösen Form von Prionen (PrPSc) durch wiederholte Inkubation von normalem PrPC mit geringen Mengen an PrPSc. Während jedes Zyklus wird PrPSc katalysiert die Fehlfaltung von PrPCund die Beschallung fragmentiert die Aggregate und schafft so mehr Keimstellen. Dies imitiert die Prionenreplikation in vivo und ermöglicht einen empfindlichen Prionennachweis in biologischen Proben.
Wie kommt es zu einer Fehlfaltung von PrP?
PrP-Fehlfaltung zum pathogenen PrPSc Formular kann durch ausgelöst werden:
- Spontane Fehlfaltung bei sporadischen Prionenerkrankungen.
- Genetische Mutationen im PRNP-Gen (z. B. familiäre Prionenerkrankungen).
- Exposition gegenüber infektiösem PrPSc durch kontaminierte Lebensmittel, medizinische Verfahren oder andere Mittel.
- Umwelt- oder Strukturfaktoren wie pH-Wert, Metallionen oder Co-Faktoren, die PrP destabilisierenC.
Was ist der RT-QuIC-Test?
Real-Time Quaking-Induced Conversion (RT-QuIC) ist ein hochempfindlicher diagnostischer Assay für Prionenerkrankungen. Er detektiert PrPSc durch Verstärkung seiner Fähigkeit zur Umwandlung von rekombinantem PrPC in fehlgefaltete Aggregate. Der Test basiert auf dem Fluoreszenznachweis der Amyloidfibrillenbildung und eignet sich daher für die Diagnose von Krankheiten wie CJK in der Zerebrospinalflüssigkeit (CSF) oder anderen Geweben.
Hielscher Ultrasonics fertigt Hochleistungs-Ultraschall-Homogenisatoren vom Labor bis zum voll-kommerziellen Industriemaßstab.

