Metabolomik mit Hochdurchsatz-Ultraschallbehandlung erleichtern
Die Metabolomik ist ein Forschungsgebiet, das Hochdurchsatzverfahren einsetzt, um kleine Moleküle in verschiedenen biologischen Flüssigkeiten wie Urin, Serum, Plasma, Fäzes und Speichel zu charakterisieren und zu quantifizieren und dabei einzigartige metabolische Signaturen aufzudecken. Das für Multiwell-Platten konzipierte Hochdurchsatz-Ultraschallgerät UIP400MTP ist ein leistungsstarkes Werkzeug zur Lyse von Zellen in diesen Proben und erleichtert die Freisetzung von Metaboliten für nachfolgende Analysen. Dieser präzise und zuverlässige Ansatz ist für die Metabolomik von entscheidender Bedeutung, da hier ein sorgfältiges Studiendesign, eine gewissenhafte Probenvorbereitung, eine optimierte Einrichtung der Analyseplattform, eine umfassende Datenanalyse und eine aussagekräftige biologische Interpretation im Vordergrund stehen. Die Metabolomik nutzt sowohl zielgerichtete Ansätze, die sich auf bestimmte Molekülklassen wie Kohlenhydrate, Lipide und Aminosäuren konzentrieren, als auch ungerichtete Verfahren, die einen breiten Überblick über die metabolischen Profile einer Probe liefern und die vielschichtige Komplexität der metabolischen Signalübertragung aufzeigen.
Hochdurchsatz-Probenvorbereitung mit dem 96-Well-Platten-Ultraschallgerät UIP400MTP
Der Einsatz des berührungslosen Ultraschallgeräts UIP400MTP in Kombination mit 96-Well-Platten ist eine effiziente Methode zur Homogenisierung und Metabolitenextraktion im Hochdurchsatz. Dieser Aufbau vermeidet den direkten Kontakt mit der Probe und verringert dadurch das Risiko einer Kreuzkontamination, während mehrere Proben gleichzeitig verarbeitet werden.
Schritt-für-Schritt-Protokoll zur Homogenisierung mit dem 96-Well-Ultraschallgerät UIP400MTP
- Vorbereitung der Proben für die Metabolomik
Einbringen der Proben: Geben Sie jede Probe (z. B. Fäzes, Darmgewebe oder Darmlumeninhalt) in einzelne Wells einer 96-Well-Platte oder Mikroplatte.
Lösungsmittel: Organische Lösungsmittel wie Methanol, Ethanol, Acetonitril, Chloroform und ihre (wässrigen) Gemische sind für die Metabolitenextraktion unerlässlich und unterstützen die Freisetzung intrazellulärer Metaboliten aus der zellulären Matrix. Verwenden Sie 100–300 µL Lösungsmittel pro Well und stellen Sie sicher, dass das Volumen ausreicht, um die Probe vollständig einzutauchen.
Interne Standards: Geben Sie optional interne Standards in jedes Well, um eine Normalisierung bei der nachfolgenden metabolomischen Analyse zu ermöglichen. - Vorbereitung des Kopplungsmediums
Wasserstand: Stellen Sie die 96-Well-Platte wie im Handbuch beschrieben auf die mit Wasser (dem Kopplungsmedium) gefüllte Beschallungsplattform. - Parameterkonfiguration des UIP400MTP
Leistungseinstellungen: Stellen Sie die Ultraschallamplitude für eine effiziente Homogenisierung auf 50–80% der maximalen Leistung ein.
Pulsmodus: Stellen Sie den Beschallungszyklus auf abwechselnde Pulse ein (z. B. 30 Sekunden EIN, 30 Sekunden AUS), um eine Abkühlung zu ermöglichen und eine Überhitzung der Proben zu verhindern.
Gesamtdauer: 4–10 Minuten, abhängig von der Komplexität und Widerstandsfähigkeit der Probe.
Temperaturregelung: Verwenden Sie ein Laborkühlgerät, um das Wasser während der Beschallung bei 4–8°C zu halten und wärmeempfindliche Metaboliten zu schützen. - Beschallungsprozess
Starten Sie das UIP400MTP für die Beschallungszyklen.
Überwachen Sie den Prozess über die Bedienoberfläche des UIP400MTP.
Die Kavitation homogenisiert die Proben und lysiert die Zellen in den Wells, wodurch intrazelluläre Metaboliten in das Lösungsmittel freigesetzt werden. - Nach der Beschallung
Zentrifugation: Überführen Sie nach der Beschallung den Inhalt der Platte bei Bedarf in Sammelröhrchen. Zentrifugieren Sie für 10 Minuten bei 4.000–6.000 × g, um unlösliche Rückstände und Zellmaterial als Pellet abzutrennen.
Entnahme des Überstands: Überführen Sie den Überstand aus jedem Well vorsichtig in neue Röhrchen oder Platten zur Analyse.
Optionale Trocknung: Trocknen Sie die Überstände mit einem Vakuumkonzentrator (z. B. SpeedVac), falls eine Aufkonzentrierung erforderlich ist, und rekonstituieren Sie sie anschließend in einem kleinen Volumen des geeigneten Lösungsmittels.
Nutzen Sie die hohe Verarbeitungskapazität des Multiwell-Platten-Ultraschallgeräts UIP400MTP im Hochdurchsatz und erleichtern Sie Ihre metabolomische Forschung und Analyse!
Hochdurchsatz-Ultraschallgerät UIP400MTP für die metabolomische Forschung in Multiwell-Platten, 96-Well-Platten, Röhrchen und Petrischalen.
Prinzip der berührungslosen Beschallung mit dem UIP400MTP
Das UIP400MTP überträgt Ultraschallwellen indirekt über ein Kopplungsmedium (z. B. Wasser) auf die Wells einer 96-Well-Platte. Diese Wellen erzeugen Kavitation, die Zellen aufschließt und Metaboliten freisetzt, ohne dass ein physischer Kontakt zwischen der Sonotrode des Ultraschallgeräts und der Probe besteht.
„Ich schreibe Ihnen, um mich für die hervorragenden Erfahrungen mit Ihrem Ultraschallgerät UIP400MTP bei der gleichmäßigen und konsistenten bakteriellen Lyse von fäkalen Mikrobiomproben zu bedanken. Wir erweitern die Grenzen der Hochdurchsatz-Lysetechnologie, und Ihr Gerät eignet sich sehr gut für diese Aufgabe. Einige der wichtigsten Vorteile sind:
- Einfache Bedienung – das Gerät ist leicht zu bedienen, und die Anpassung über die Menüoptionen ist unkompliziert
- Hoher Probendurchsatz – hervorragend für die Verarbeitung von Platten mit 96 Proben gleichzeitig geeignet
- Gleichmäßige Beschallung aller Gefäße – das Gerät konnte alle Wells im gleichen Umfang beschallen, was für unsere Anwendung entscheidend war
- Unterstützung durch das Hielscher-Team – die Unterstützung war ausgezeichnet. Sie waren bei der Schulung, bei der Beantwortung unserer Fragen und bei der Lösung von Problemen immer für uns da und haben uns mit Vorschlägen geholfen, unser Ziel zu erreichen.
Vielen Dank nochmals für Ihre Hilfe und Unterstützung bei der Optimierung unserer Protokolle.“
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Wissenschaftlicher Leiter – Intus Biosciences
Das Multiwell-Platten-Ultraschallgerät UIP400MTP erleichtert die Hochdurchsatz-Probenvorbereitung, z. B. in der Metabolitenforschung und -analyse.
Wichtige Merkmale des Multiwell-Platten-Ultraschallgeräts UIP400MTP
| Hochdurchsatz-Beschallung | Das UIP400MTP eignet sich optimal für 96-Well-Platten und andere Multiwell-Platten und ermöglicht die gleichzeitige, identische Beschallung mehrerer Proben. Dadurch wird die Dauer der Probenvorbereitung erheblich verkürzt und der Probendurchsatz bei Untersuchungen mit großen Probenzahlen erhöht. |
| Verwenden Sie die Multiwell-Platte Ihrer Wahl | Das UIP400MTP ist für die Beschallung aller gängigen Multiwell-Platten, PCR-Platten oder Mikrotiterplatten konzipiert. Sie wählen die Platte, die sich am besten für Ihre Experimente eignet. Da das UIP400MTP keine proprietären Verbrauchsmaterialien benötigt, sparen Sie viel Geld! |
| Berührungslose Ultraschallbehandlung | Das Multiwell-Platten-Ultraschallgerät UIP400MTP überträgt intensiven Ultraschall, ohne dass etwas in die Probe eingeführt wird. Sie können versiegelte Multiwell-Platten, geschlossene Gefäße und Vials beschallen. Hielscher liefert Ihnen maßgeschneiderte Probenhalter für sämtliche Vials oder Gefäße, die keinem Standardformat entsprechen. |
| Präzision und Steuerung | Eine präzise Steuerung und intelligente Software ermöglichen es Ihnen, die Ultraschallparameter optimal auf Ihre spezifischen Verarbeitungsanforderungen abzustimmen. Bei jedem Experiment erzielen Sie maximale Beschallungseffizienz und Wirksamkeit. |
| Temperaturregelung | Stellen Sie eine bestimmte Temperatur für Ihre Beschallung ein. Das Platten-Ultraschallgerät UIP400MTP kann die Probentemperatur überwachen und die Beschallung entsprechend anpassen. Eine zirkulierende Kühlflüssigkeit kühlt jedes Well der Platte und ermöglicht eine präzise Temperaturregelung. |
| Protokollierung und Fernsteuerung | Jeder Beschallungslauf kann von einem Computer aus gesteuert werden. Eine Softwareinstallation ist nicht erforderlich. Sie können Ihren Standardbrowser (z. B. Chrome, Firefox, Edge oder Safari) auf jedem Betriebssystem (z. B. MacOS, Windows, Android, iOS oder Linux) verwenden, um das UIP400MTP aus der Ferne zu steuern und zu überwachen. Jeder Beschallungslauf erzeugt ein detailliertes Beschallungsprotokoll zur Auswertung und Dokumentation. Die Protokolldatei liegt im nicht proprietären CSV-Format vor und lässt sich mit Ihrem bevorzugten Programm öffnen, z. B. Microsoft Excel, Apple Numbers oder OpenOffice Calc. |
| Robust und zuverlässig | Das nach höchsten Qualitätsstandards in Deutschland entwickelte und gefertigte UIP400MTP ist sowohl leistungsstark als auch bemerkenswert langlebig. Seine Konstruktion erfüllt industrielle Standards und hält den Belastungen des täglichen Einsatzes in einer anspruchsvollen Laborumgebung problemlos stand. Sie können das UIP400MTP im Hochdurchsatzbetrieb kontinuierlich 24 Stunden täglich, 7 Tage pro Woche einsetzen. |
- hohe Effizienz
- modernste Technologie
- Zuverlässigkeit und Robustheit
- einstellbare, präzise Prozesssteuerung
- intelligente Software
- intelligente Funktionen (z. B. Programmierbarkeit, Datenprotokollierung, Fernsteuerung)
- einfach und sicher zu bedienen
- wartungsarm
- CIP (Reinigung im eingebauten Zustand)
Entwicklung, Fertigung und Beratung – Qualität Made in Germany
Die Ultraschallgeräte von Hielscher sind für ihre höchsten Qualitäts- und Konstruktionsstandards bekannt. Robustheit und einfache Bedienung ermöglichen die reibungslose Integration unserer Ultraschallgeräte in industrielle Anlagen. Die Ultraschallgeräte von Hielscher bewältigen raue Bedingungen und anspruchsvolle Umgebungen problemlos.
Hielscher Ultrasonics ist ein ISO-zertifiziertes Unternehmen und legt besonderen Wert auf leistungsstarke Ultraschallgeräte mit modernster Technologie und hoher Benutzerfreundlichkeit. Selbstverständlich sind die Ultraschallgeräte von Hielscher CE-konform und erfüllen die Anforderungen von UL, CSA und RoHs.
Berührungsloses Ultraschallgerät UIP400MTP zur metabolomischen Probenvorbereitung in Mikroplatten.
Literatur / Referenzen
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Häufig gestellte Fragen zur metabolomischen Forschung
Was ist das Mikrobiom?
Das Mikrobiom bezeichnet die Gesamtheit der Mikroorganismen, einschließlich Bakterien, Viren, Pilzen und Archaeen, sowie ihres genetischen Materials in einer bestimmten Umgebung wie dem menschlichen Körper. Es spielt eine entscheidende Rolle für die Gesundheit des Wirts, indem es den Stoffwechsel, die Immunfunktion und den Schutz vor Krankheitserregern beeinflusst. Zugleich wird es durch Faktoren wie Ernährung, Lebensstil und Umwelt geprägt.
Was ist Metabolomik?
Metabolomik ist die umfassende Untersuchung von Metaboliten, also kleinen Molekülen, die während Stoffwechselprozessen in einem biologischen System entstehen. Sie umfasst die Identifizierung, Quantifizierung und Analyse dieser Moleküle, um zelluläre Funktionen und Stoffwechselwege sowie deren Reaktionen auf genetische, umweltbedingte oder pathologische Veränderungen zu verstehen.
Was ist das Metabolom?
Das Metabolom ist die Gesamtheit aller kleinen Moleküle beziehungsweise Metaboliten, die zu einem bestimmten Zeitpunkt in einem biologischen System wie einer Zelle, einem Gewebe oder einem Organismus vorhanden sind. Es spiegelt die biochemische Aktivität und den physiologischen Zustand des Systems wider und bietet Einblicke in den Stoffwechsel und seine Wechselwirkungen mit der Umwelt.
Hielscher Ultrasonics fertigt Hochleistungs-Ultraschallhomogenisatoren vom Laborgerät bis zur industriellen Baugröße.


