Protokol for analyse af minimal hæmmende koncentration (MIC)
Den biofilmbaserede analyse af minimal hæmmende koncentration (MIC) er en essentiel metode til at vurdere antimikrobielle midlers effektivitet mod biofilmassocierede mikroorganismer, som udviser øget resistens på grund af deres beskyttende ekstracellulære matrix. Et afgørende trin i denne analyse er at løsne biofilmstrukturer for at frigøre indlejrede celler til en nøjagtig vurdering af levedygtigheden. Sonikatoren til multibrøndplader UIP400MTP letter denne proces ved at anvende fokuseret ultralyd til at generere kontrolleret kavitation, som effektivt løsner biofilmceller og dispergerer dem i en ensartet suspension. Denne præcise og reproducerbare nedbrydning af biofilm forbedrer MIC-analysers pålidelighed og prøvegennemløb og gør UIP400MTP til et essentielt værktøj til at fremme biofilmforskningen.
Hvorfor bør jeg bruge sonikering under MIC-analyser?
- Nøjagtige, reproducerbare data: Opnå ensartede cellesuspensioner, som eliminerer matrixens beskyttende virkning og sikrer, at dine kolonitællinger og målinger af optisk densitet reelt afspejler de antimikrobielle midlers effektivitet.
- Effektivitet med højt prøvegennemløb: Behandl en hel 96-brøndsplade samtidigt på blot 1–3 minutter, og erstat langsom, uensartet manuel skrabning med en strømlinet arbejdsgang.
- Bevaret cellelevedygtighed: Løsn forsigtigt indlejrede celler uden de fysiske skader, som skrabning forårsager, og oprethold højere overlevelsesrater til pålidelige MIC/MBEC-beregninger.
- Ingen risiko for krydskontaminering: Drag fordel af et kontaktfrit design med et kopformet ultralydshorn, der behandler alle brønde ensartet, uden at sonder berører de enkelte prøver eller brønde.
- Overensstemmelse med standarder: Tilpas din metodik til validerede brancheprotokoller som ASTM E2799-22, så dine data får større troværdighed i forbindelse med myndighedskrav eller publikation.
- Pålidelig screening af lægemidler og behandlinger: Stol på dine resultater fra følsomhedsbestemmelser, så du kan træffe bedre beslutninger om antimikrobiel effektivitet, resistensprofilering eller udvikling af behandlinger.
Øg dit laboratoriums kapacitet, samtidig med at cellernes levedygtighed bevares. Fortæl os, hvilken type mikroplade du bruger, og få anbefalinger til effektiv løsning af biofilm og dispersion af celler ved hjælp af sonikering med højt prøvegennemløb.
Sonikator til mikroplader UIP400MTP til præcist kontrollerbar løsning af biofilm i MIC- og MBEC-analyser.
Sonikering til løsning af biofilm
Den biofilmbaserede MIC-analyse måler typisk bakteriers levedygtighed eller væksthæmning ved hjælp af metoder som udpladning, kolonitælling eller måling af optisk densitet. Sonikering er et afgørende trin i biofilmbaserede MIC-analyser ved vurdering af biofilmassocierede mikroorganismers følsomhed over for antimikrobielle midler. Dens primære funktion er at løsne og dispergere celler, der er indlejret i biofilmmatrixen, i en ensartet suspension til nøjagtig analyse.
Biofilm er betydeligt mere resistente over for antimikrobielle midler end planktoniske celler, hvilket gør korrekt løsning afgørende for en nøjagtig analyse. Under denne proces genererer ultralydsbølger kontrolleret kavitation, som nedbryder biofilmmatrixen og frigør indlejrede celler i en ensartet suspension i genvindingsmediet. Dette trin muliggør præcise vurderinger af levedygtigheden af celler dispergeret fra biofilm ved hjælp af metoder som udpladning, fortynding og kolonitælling. Korrekt nedbrydning af biofilm ved sonikering forhindrer resterende matrixkomponenter i at beskytte cellerne, hvilket ellers kunne føre til en undervurdering af den antimikrobielle aktivitet. Sonikatoren til multibrøndplader UIP400MTP er særligt velegnet til dette formål og tilbyder præcise og reproducerbare sonikeringsbetingelser, som sikrer pålidelig klargøring af analyseplader med højt prøvegennemløb.
Hvorfor sonikering er nødvendig i biofilmbaserede analyser af minimal hæmmende koncentration
Måling af levedygtighed og celletælling kræver fuldstændig og pålidelig løsning og dispersion af enkeltceller. UIP400MTP fremmer ensartet løsning af biofilm og dispersion af celler uden at beskadige dem og giver dermed robuste analyseresultater.
- Biofilmens kompleksitet: Biofilm er strukturerede mikrobielle samfund, som er omsluttet af en matrix af ekstracellulære polymere stoffer (EPS), der beskytter mikroorganismerne og gør dem mere resistente over for antimikrobielle midler.
- Ensartet dispersion: For nøjagtigt at måle levedygtigheden af celler indlejret i biofilm eller deres følsomhed over for antimikrobielle midler skal biofilmen først løsnes og nedbrydes til en homogen suspension.
Mens standard-MIC måler planktonisk resistens, er sonikering essentiel i Biofilm-MIC- og MBEC-analyser for at sikre, at det korrekte udgangspunkt af celler genvindes.
Protokol for biofilmbaseret analyse af minimal hæmmende koncentration
Analysen af minimal hæmmende koncentration (MIC) bestemmer den laveste koncentration af et antimikrobielt middel, som er nødvendig for at hæmme mikroorganismers synlige vækst. Denne protokol er udviklet til biofilmassocierede mikroorganismer og anvender sonikatoren til multibrøndplader UIP400MTP til nedbrydning af biofilm.
Trin 1: Klargøring af bakterielt inokulum
- Klargør bakteriesuspensionen:
Dyrk bakterier i egnede medier til midten af den logaritmiske vækstfase.
Fortynd kulturen for at opnå en standardiseret celletæthed (f.eks. 0,5 McFarland-standard eller OD600 ~0,1). - Klargør antimikrobielle opløsninger:
Fortynd det antimikrobielle middel i et egnet medium for at fremstille en række koncentrationer (f.eks. serielle tofoldsfortyndinger). - Fordel i 96-brøndspladen:
Tilsæt de antimikrobielle opløsninger til brøndene i en standardplade med 96 brønde med et slutvolumen i hver brønd på ~150–200 µL.
Medtag vækstkontroller (uden antimikrobielt middel) og sterilitetskontroller (uden bakterielt inokulum).
Trin 2: Biofilmdannelse på låg med stifter
- Sæt låget med stifter på:
Anbring det særlige låg med stifter over de inokulerede brønde, og sørg for, at stifterne er helt nedsænket i bakteriesuspensionen. - Inkubér pladen:
Inkubér ved en passende temperatur (f.eks. 37°C) i et angivet tidsrum (f.eks. 24 timer) under statiske betingelser for at muliggøre biofilmdannelse på stifterne. - Skyl stifterne:
Fjern låget med stifter fra bakteriesuspensionen, og skyl forsigtigt i sterilt saltvand eller PBS for at fjerne løst fastsiddende planktoniske celler. - Eksponér for antimikrobielle midler:
Overfør låget med stifter til en ny 96-brøndsplade, som indeholder de tidligere fremstillede fortyndinger af det antimikrobielle middel.
Inkubér i et defineret tidsrum (f.eks. 24 timer) under statiske betingelser, så det antimikrobielle middel kan virke på biofilmene.
Trin 3: Eksponering for antimikrobielle midler
Sonikator til multibrøndplader UIP400MTP til prøveklargøring med højt prøvegennemløb
Trin 4: Sonikering med sonikatoren til mikroplader UIP400MTP
Sonikeringstrinnet er afgørende for at løsne biofilm fra lågene med stifter, så levedygtigheden kan vurderes. Følg disse trin for sonikatoren UIP400MTP:
- Klargør opstillingen:
Fyld hver brønd i en ny 96-brøndsplade med genvindingsmedium (f.eks. neutraliserende bouillon eller sterilt vækstmedium). - Overfør låget med stifter:
Fjern låget med stifter fra pladen til antimikrobiel behandling.
Skyl låget med stifter i sterilt saltvand eller PBS for at fjerne rester af antimikrobielle midler. - Placér pladen i sonikatoren:
Sæt låget med stifter på pladen med genvindingsmedium.
Anbring pladen med genvindingsmedium i sonikatoren UIP400MTP, og sørg for, at pladen står centreret og stabilt som beskrevet i manualen. - Justér sonikeringsparametrene:
Indstil sonikeringsparametrene på UIP400MTP (indstillingerne kan tilpasses biofilmen):
Amplitude: 70–100%.
Sonikeringstid: 1–3 minutter (tilpas efter biofilmens struktur) i cyklisk tilstand. - Sonikér:
Start sonikeringsprocessen. Ultralydsbølgerne vil nedbryde biofilmmatrixen og løsne cellerne, så de frigøres til genvindingsmediet. - Overvåg processen:
Brug den tilslutbare temperatursensor til at overvåge prøvetemperaturen i brøndene. UIP400MTP kan tilsluttes en laboratoriekøler til køling. - Håndtering efter sonikering:
Overfør straks genvindingsmediet, som indeholder de løsnede biofilm, til en ny steril plade til efterfølgende analyse.
(A) Plade med TSB tilsat 2% glukose anvendt til biofilmdannelse, genvinding af celler og bestemmelse af MIC og MBEC; (B) Låg med stifter til dannelse af stafylokokbiofilm.
Biofilmcellerne, som var dannet på stifterne, blev løsnet ved sonikering (Hielscher Ultrasound Technology) i 5 min i 96-brøndsplader med frisk dyrkningsmedium til genvinding af cellerne.
(Billede og studie: ©de Oliveira et al., 2016)
Trin 4: Vurdering af levedygtighed
Udplad og dyrk de løsnede biofilm:
- Udfør serielle fortyndinger af genvindingsmediet, og udplad på agar for at tælle kolonidannende enheder (CFU).
- Vurdér MIC:
Bestem MIC som den laveste koncentration af det antimikrobielle middel, der fuldstændigt hæmmer synlig mikrobiel vækst i genvindingsmediet.
Skift til præcis, kontaktfri sonikering for at sikre en ensartet cellesuspension og pålidelige MIC-resultater!
Hvem har gavn af sonikering under MIC-analyser?
- Producenter af medicinsk udstyr: Til at teste overfladebelægningers effektivitet og validere rengøringsprotokoller for udstyr, der er udsat for biofilmdannelse.
- Kliniske mikrobiologer: Til nøjagtigt at diagnosticere implantatassocierede infektioner (såsom PJI) ved at genvinde bakterier fra medicinsk udstyr.
- Lægemiddeludviklere: Til at vurdere nye antimikrobielle midlers effektivitet mod modstandsdygtige patogener indlejret i biofilm.
- Akademiske forskere: Til at gennemføre reproducerbare studier med højt prøvegennemløb af biofilmbiologi og mekanismer for antimikrobiel resistens.
- Industrielle kvalitetskontrolteams: Til at vurdere biologisk tilgroning og desinfektionsmidlers effektivitet i industrielle miljøer (f.eks. ved hjælp af ASTM E2799-22-standarder).
Design, fremstilling og rådgivning – kvalitet fremstillet i Tyskland
Hielschers ultralydsapparater er kendt for deres højeste kvalitets- og designstandarder. Robusthed og nem betjening gør det muligt at integrere vores ultralydsapparater problemfrit i industrianlæg. Hielschers sonikatorer håndterer nemt barske forhold og krævende miljøer.
Hielscher Ultrasonics er en ISO-certificeret virksomhed og lægger særlig vægt på højtydende ultralydsapparater med den nyeste teknologi og brugervenlighed. Hielschers ultralydsapparater er naturligvis CE-kompatible og opfylder kravene fra UL, CSA og RoHs.
Strømlin prøveklargøringen i 96-brøndsplader og analyseplader ved hjælp af sonikatoren til multibrøndplader UIP400MTP
Litteratur / referencer
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Ofte stillede spørgsmål
Hvad er MIC-analysen?
Analysen af minimal hæmmende koncentration (MIC) er en standardiseret test, som bruges til at bestemme den laveste koncentration af et antimikrobielt middel, der er nødvendig for at hæmme en mikroorganismes synlige vækst. Den udføres almindeligvis ved hjælp af mikrofortynding i bouillon eller agarfortyndingsmetoder, hvor mikroorganismer eksponeres for serielle fortyndinger af det antimikrobielle middel. MIC-analyser er afgørende for at vurdere antimikrobiel effektivitet, vejlede klinisk behandling og vurdere resistensniveauer hos både planktoniske og biofilmassocierede mikroorganismer.
Hvad er forskellen mellem den biofilmbaserede analyse af minimal hæmmende koncentration og MBIC-analysen?
Den biofilmbaserede analyse af minimal hæmmende koncentration (MIC) og analysen af minimal biofilmhæmmende koncentration (MBIC) er beslægtede, men adskiller sig i formål og metodik.
Den biofilmbaserede MIC-analyse vurderer den laveste koncentration af et antimikrobielt middel, der er nødvendig for at hæmme synlig biofilmvækst eller levedygtighed, med fokus på biofilmassocierede celler frem for planktoniske bakterier. Derimod måler MBIC-analysen specifikt et antimikrobielt middels evne til at forhindre biofilmdannelse frem for at behandle allerede dannede biofilm. Selvom begge analyser omhandler biofilmassocierede bakterier, beskæftiger den biofilmbaserede MIC-analyse sig med behandling, mens MBIC-analysen lægger vægt på forebyggelse. Dermed er de komplementære værktøjer til at undersøge antimikrobiel effektivitet mod biofilm.
Hvilke biofilm bruges i MIC-analyser?
Både mikrobielle biofilm og planktoniske celler bruges i analyser af minimal hæmmende koncentration (MIC) til at undersøge antimikrobiel effektivitet under forskellige betingelser.
- Planktoniske celler:
Planktoniske celler er fritsvævende mikrobielle enkeltceller, som fungerer som standardmodel for traditionelle MIC-analyser. Almindelige mikroorganismer omfatter Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus og Candida albicans. Disse analyser bestemmer den MIC, der er nødvendig for at hæmme væksten af fritlevende celler, og er afgørende for indledende antimikrobiel screening. - Biofilmassocierede celler:
Biofilmceller er mikroorganismer indlejret i en ekstracellulær matrix, som øger deres resistens over for antimikrobielle midler betydeligt. Biofilm-MIC-analyser omfatter ofte:- Gramnegative bakterier: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa og Klebsiella pneumoniae, som er kendt for biofilmdannelse ved infektioner og i industrielle miljøer.
- Grampositive bakterier: Staphylococcus aureus (herunder MRSA), Staphylococcus epidermidis og Enterococcus faecalis, som ofte er involveret i infektioner relateret til medicinsk udstyr.
- Svampe: Candida albicans og beslægtede arter, som har betydning ved biofilmrelaterede svampeinfektioner.
- Biofilm med blandede arter: Disse bruges undertiden til at efterligne naturlige polymikrobielle biofilm, såsom dem, der findes i kroniske sår eller ved industriel biologisk tilgroning.
Ved at sammenligne MIC-værdier for planktoniske celler og biofilmassocierede celler kan forskere vurdere biofilmenes øgede resistens og identificere midler, der er effektive mod disse mere modstandsdygtige mikrobielle samfund.
Hvad er forskellen mellem MIC og MBEC?
Den minimale hæmmende koncentration (MIC) er den laveste koncentration af et antimikrobielt middel, der er nødvendig for at forhindre biofilmdannelse, mens den minimale biofilmeradikerende koncentration (MBEC) er den laveste koncentration, der er nødvendig for at eradikere en etableret biofilm. MIC fokuserer på forebyggelse af biofilm, mens MBEC vurderer behandlingens effektivitet mod modne biofilm.
Hvilke plader bruges almindeligvis til MBEC-analyser?
Mikrotiterplader, som almindeligvis bruges til MBEC-analyser, er typisk 96-brøndsplader fremstillet af polystyren eller polypropylen. Disse materialer giver en egnet overflade til biofilmdannelse og er kemisk bestandige over for de antimikrobielle midler, der testes under analysen. Polystyrenplader foretrækkes i vid udstrækning på grund af deres optiske klarhed, som er fordelagtig ved efterfølgende analyser såsom spektrofotometriske eller fluorescensbaserede målinger. Disse pladers design omfatter aftagelige låg med stifter, som er essentielle for analysen, da biofilm dannes på stifterne, der er nedsænket i brøndene med vækstmedier. Standardiserede plader, såsom dem, der overholder MBEC-analyseprotokollen, er specifikt udviklet til at sikre reproducerbarhed og kompatibilitet med sonikatoren UIP400MTP eller andet behandlingsudstyr.
Hvad er plader med PEG-låg?
Plader med PEG-låg er specialiserede multibrøndpladesystemer, hvor låget er udstyret med små tappe eller stifter af polyethylenglykol (PEG), som rækker ned i hver brønd. Disse stifter giver en overflade til mikrobiel biofilmdannelse under kontrollerede betingelser og efterligner biofilmvækst under virkelige forhold. Designet gør det muligt for biofilm at udvikle sig på stifterne, mens brøndene indeholder vækstmedier eller antimikrobielle midler, hvilket muliggør test med højt prøvegennemløb af biofilmens følsomhed over for behandlinger, såsom i MBEC-, MBIC- og MIC-analyser.
Hvad er fordelen ved løsning af biofilm med ultralyd sammenlignet med celleskrabning?
Løsning af biofilm med ultralyd giver en betydelig fordel i forhold til celleskrabning ved at tilbyde en ikke-invasiv, ensartet og meget effektiv metode til at fjerne biofilm fra overflader. I modsætning til skrabning, som kan være uensartet og beskadige den underliggende overflade eller cellerne, trænger ultralydsbølger ind i biofilmmatrixen og nedbryder den uden at kompromittere tilstødende strukturers integritet. Denne metode sikrer reproducerbarhed, minimerer kontamineringsrisikoen og er særligt effektiv til anvendelser, der kræver præcis fjernelse af biofilm, såsom mikrobiologiske studier eller test af medicinsk udstyr. Læs mere om, hvordan sonikatoren UIP400MTP overgår celleskrabning!
Hielscher Ultrasonics fremstiller højtydende ultralydshomogenisatorer fra laboratoriestørrelse til industriel størrelse.
