Assay sonikering – Analysen-på-én gang Sonicator UIP400MTP
Sonikering er en væsentlig teknik i laboratorieprotokoller, især til applikationer som kromatinimmunpræcipitation (ChIP) analyser. Ved at bruge ultralydsenergi til at nedbryde celler, skære DNA og opløse kromatin, gør sonikering det muligt for forskere at forberede prøver mere effektivt og reproducerbart. Hielscher multi-brønds plade sonikere er blandt de mest avancerede og effektive værktøjer, der er tilgængelige til dette formål, og strømliner arbejdsgange med høj kapacitet ved at rumme op til 96-brønds plader.
Vigtige fordele ved multi-brønds pladesonikere til analyser
Hielscher berøringsfri 96-brønds pladesonikere, såsom UIP400MTP, tilbyder en meget pålidelig og kontrolleret tilgang til cellelyse og kromatinklipning. Dette berøringsfrie design sikrer, at hver brønd behandles ensartet, hvilket giver ensartede resultater på tværs af høje prøveantal. Med denne soniker kan forskere udføre flere processer, herunder:
- Cellelyse: Effektiv sonikering bryder åbne cellemembraner og frigiver cellulært indhold.
- DNA- og RNA-klipning: Ultralydsbølger med høj intensitet fragmenterer DNA og RNA til ønskede størrelser, hvilket er afgørende for downstream-analyser.
- Kromatin-fragmentering: Klipning af kromatin i mindre stykker til downstream-analyser, såsom kromatinimmunudfældning (ChIP), DNA-sekventering eller andre epigenetiske undersøgelser. Læs mere om kromatinfragmentering ved hjælp af UIP400MTP!
- Opløselighed: Forbedrer opløseligheden af prøvekomponenter, hvilket hjælper med at fremstille ensartede, reproducerbare analyseprøver.
Disse funktioner er afgørende for prøveforberedelse med høj kapacitet og prøveminiaturisering, da de giver forskere mulighed for at behandle flere prøver med minimal risiko for krydskontaminering.
Betydningen af sonikering i ChIP-analyser
Kromatinimmunudfældning (ChIP) assays afhænger af præcis kromatinklipning for at give DNA-fragmenter af en optimal størrelse, typisk mellem 200-600 basepar (bp). Disse fragmenter er nødvendige for effektiv immunudfældning, nøjagtig topopløsning og pålidelige resultater i ChIP-Seq-analyser. Hielscher UIP400MTP Assay-At-Once sonikeren er specielt velegnet til ChIP-protokoller, der giver ensartet kromatinfragmentering på tværs af flere brønde. Fordelene ved denne præcision i ChIP-arbejdsgange omfatter:
- Højt udbytte af kromatin: Effektiv sonikering frigiver en større mængde kromatin fra hver prøve.
- Konsistens på tværs af prøver: Multi-brønd-sonikeren opretholder ensartede fragmentstørrelser på tværs af alle brønde, hvilket reducerer variabiliteten i ChIP-analyser.
- Forbedret følsomhed og opløsning i ChIP-seq: Korrekt fragmenteret DNA sikrer klarere topopløsning, en kritisk faktor for at detektere præcise protein-DNA-interaktioner.
Rollen af pålidelig sonikering i vellykkede analyser
For analyser, der involverer et højt antal prøver, såsom i klinisk diagnostik eller lægemiddelopdagelse, er reproducerbarhed og gennemstrømning afgørende. Hielscher multi-brønds pladesonikere giver en løsning ved at lette ensartet prøveforberedelse på tværs af et stort antal brønde. Denne konsistens forbedrer ikke kun analysens robusthed, men forbedrer også den samlede arbejdsgangseffektivitet, hvilket sparer tid og ressourcer i laboratoriet.
Hielscher multi-brønds plade sonikere er uvurderlige i analyseprotokoller, især dem, der kræver behandling med høj gennemstrømning. Ved at sikre pålidelig cellelyse, DNA-klipning og opløselighed optimerer disse sonikere prøveforberedelsen for nøjagtige og reproducerbare resultater. For forskere, der arbejder med ChIP-analyser, tilbyder UIP400MTP-sonikeren et robust værktøj, der forbedrer kromatinudbyttet, fragmentkonsistens og analysefølsomhed - hvilket i sidste ende fører til mere vellykkede eksperimenter og klarere indsigt.
Nøglefunktioner i UIP400MTP Multiwell Sonicator
Høj gennemstrømning sonikering | Perfekt egnet til 96-brønde og andre multiwell-plader, giver UIP400MTP mulighed for samtidig, identisk sonikering af flere prøver, hvilket forkorter varigheden af prøveforberedelsen betydeligt og øger gennemstrømningen af test med højt prøveantal. |
Brug Multiwell-pladen efter eget valg | UIP400MTP er designet til at sonikere alle standard multiwell-plader, PCR-plader eller mikrotiterplader. Du vælger den plade, der passer bedst til dine eksperimenter. Da UIP400MTP ikke kræver proprietære forbrugsstoffer, sparer du mange penge! |
Ikke-kontakt ultralydbehandling | Multiwell Plate Sonicator anvender UIP400MTP intens ultralyd uden at indsætte noget i prøven. Du kan sonikere ealed multiwell plader, lukkede kar og hætteglas. Hielscher leverer dig tilpassede prøveholdere til alle ikke-standardiserede hætteglas eller beholdere. |
Præcision og kontrol | Præcisionskontrol og smart software giver dig mulighed for at indstille ultralydsparametrene, så de passer optimalt til dine specifikke behandlingsbehov. Du får maksimal sonikeringseffektivitet og effektivitet til hvert eksperiment. |
Temperaturkontrol | Indstil en bestemt temperatur for din sonikering. Den UIP400MTP plade sonicator kan overvåge sample temperatur og justere sonikeringen i overensstemmelse hermed. En recirkulerende kølevæske afkøler hver brønd i pladen for præcis temperaturkontrol. |
Protokol og fjernbetjening | Hver sonikeringskørsel kan styres fra en computer. Ingen softwareinstallation er nødvendig. Du kan bruge din standardbrowser (f.eks. Chrome, Firefox, Edge eller Safari) på ethvert operativsystem (f.eks. MacOS, Windows, Android, iOS eller Linux) til at styre og overvåge UIP400MTP eksternt. Hver sonikeringskørsel producerer en detaljeret sonikeringsprotokol til evaluering og dokumentation. Protokolfilen er i et ikke-proprietært CSV-format, som du kan åbne med dit foretrukne program, f.eks. Microsoft Excel, Apple Numbers eller OpenOffice Calc. |
Robust og pålidelig | Designet og bygget i Tyskland efter højeste kvalitetsstandarder, UIP400MTP er ikke kun kraftfuld, men også bemærkelsesværdigt holdbar. Dens design opfylder industrielle standarder og modstår nemt belastningerne ved daglig brug i et krævende laboratoriemiljø. Du kan bruge UIP400MTP uafbrudt 24 timer, 7 dage om ugen i operationer med høj kapacitet. |
Hvordan UIP400MTP letter assay-miniaturisering
Hielscher multi-brønds plade soniker spiller UIP400MTP en afgørende rolle i miniaturiseringen af analyser, hvilket gør det muligt for forskere og klinikere at nedskalere analysevolumener uden at gå på kompromis med nøjagtighed eller præcision. Denne evne er uvurderlig på tværs af områder som mikrobiologi, lægemiddelopdagelse, diagnostik, personlig medicin og klinisk diagnostik, hvor miniaturiserede analyser giver mulighed for mere effektive, omkostningseffektive og hurtige test.
- Berøringsfri sonikering i 96-brønds plader
UIP400MTP's berøringsfri sonikeringsteknologi er ideel til miniaturiserede analyseformater. Ved at rumme 96-brønds plader kan denne soniker behandle meget små prøvevolumener samtidigt på tværs af flere brønde. Traditionelle sonikeringsmetoder kæmper ofte med konsistens ved lavere volumener på grund af ujævn energifordeling, men UIP400MTP leverer ensartede ultralydsbølger på tværs af alle brønde og opretholder pålidelige resultater selv i miniaturiserede formater.
- Præcision og ensartethed på tværs af prøver
Miniaturisering kræver præcis kontrol over prøveforberedelse, da mindre mængder kan være mere følsomme over for variationer. Den fokuserede sonikering, der leveres af UIP400MTP, sikrer, at hver brønd modtager et identisk niveau af sonikering, hvilket er afgørende for at opretholde nøjagtighed og reproducerbarhed på tværs af alle prøver. Denne konsistens er nøglen inden for områder som lægemiddelopdagelse og klinisk diagnostik, hvor selv små variationer kan påvirke resultaterne. Læs mere om fokuseret sonikering! - Effektiv cellelyse og DNA-klipning i reducerede mængder
Med mindre volumener bliver effektiv cellelyse og DNA-klipning mere udfordrende, men de er afgørende for at generere analyseresultater af høj kvalitet. UIP400MTP's højintensive ultralydsbølger er kraftige nok til at opnå effektiv celleforstyrrelse og DNA-klipning selv i reducerede mængder. Denne evne giver forskere mulighed for at opnå den nødvendige kvalitet af lysater og DNA-fragmenter uden at skulle opskalere volumener, hvilket gør det til et ideelt værktøj til miniaturiserede arbejdsgange.
- Omkostningsbesparelser og ressourceeffektivitet
Miniaturiserede analyser forbruger færre reagenser og reducerer prøvespild, hvilket især er gavnligt, når man arbejder med sjældne eller dyre prøver. UIP400MTP understøtter dette ved at muliggøre prøveforberedelse med høj kapacitet i små mængder, hvilket giver forskerne mulighed for at maksimere deres ressourcer. På områder som personlig medicin, hvor patientafledte prøver kan være begrænsede, er denne effektivitet særlig fordelagtig. - Øget gennemløb og hastighed
Ved at reducere analysevolumener hjælper UIP400MTP laboratorier med at behandle flere prøver på kortere tid, hvilket øger gennemstrømningen betydeligt. Denne hurtige behandling er afgørende inden for områder med høj efterspørgsel som diagnostik og lægemiddelopdagelse, hvor tidsfølsomme resultater direkte kan påvirke patientpleje eller forskningsresultater. Miniaturiserede analyser kombineret med UIP400MTP's kapacitet med høj kapacitet giver mulighed for hurtigere test og analyse i stor skala. - Understøtter automatisering og screening med høj kapacitet
UIP400MTP's kompatibilitet med alle standard pladeformater med flere brønde muliggør problemfri integration med automatiserede systemer, der bruges til screening med høj kapacitet. Denne integration er en stor fordel inden for områder som mikrobiologi og lægemiddelopdagelse, hvor hurtig, automatiseret behandling er afgørende for screening af store stofbiblioteker eller analyse af adskillige mikrobielle stammer.
UIP400MTP letter assayminiaturisering ved at levere pålidelig sonikering til små mængder, hvilket sikrer præcision og konsistens på tværs af prøver. Dens evne til at håndtere miniaturiserede analyser med høj nøjagtighed, reproducerbarhed og effektivitet gør det muligt for forskere og klinikere at nedskalere volumener og samtidig opnå hurtigere, omkostningseffektive resultater af høj kvalitet på tværs af forskellige forsknings- og kliniske områder.
Analyser lettet af UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator
Multi-brønds pladesonikeren UIP400MTP bruges til analyser, der involverer celleforstyrrelse for at frigive proteiner og biomolekyler, biofilmforskning og antimikrobiel testning, såsom:
- ELISA: Sonikering anvendes, når prøvepræparatet involverer at bryde celler op for at opnå proteinekstrakter.
- MBEC-analyser (minimum biofilmudryddelseskoncentration): Til bestemmelse af koncentrationen af antimikrobielle stoffer, der er nødvendig for at udrydde etablerede biofilm. Læs mere om brug af UIP400MTP til MBEC-assays inklusive protokol.
- MBIC-analyser (minimum biofilmhæmmende koncentration): Til vurdering af antibiotikas evne til at forhindre biofilmdannelse.
- Kvantificeringsanalyser af biofilm: Til at forstyrre biofilm for at måle biomasse eller cellelevedygtighed ved hjælp af metoder som CFU-tællinger eller spektrofotometri.
- Lægemiddelscreening med høj kapacitet: Til evaluering af effektiviteten af antimikrobielle forbindelser mod biofilmdannende bakterier i multi-brøndsformater.
- Ekstracellulær matrixekstraktion: ECM-ekstraktion er et vigtigt prøveforberedelsestrin før adskillige analyser. Find protokollen for high-through ekstracellulær matrixekstraktion med UIP400MTP her!
- PMCA: Proteinfejlfoldning cyklisk amplifikation er et uundværligt trin for pålidelig priondetektion. Lær, hvordan UIP400MTP letter PMCA med høj kapacitet for robuste resultater!
Litteratur / Referencer
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- UIP400MTP-Multi-well-Plate-Sonicator-Infographic
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Ofte stillede spørgsmål
Hvad er Assay Sonication?
Assay-sonikering er en teknik, der bruger ultralydsbølger til at forstyrre celler, skære DNA og opløse proteiner eller kromatin, hvilket muliggør effektiv prøveforberedelse til biokemiske analyser.
Hvad er et assay?
Et assay er en laboratorieprocedure, der bruges til at måle tilstedeværelsen, mængden eller aktiviteten af et specifikt stof eller analyt i en prøve, ofte for at vurdere biologiske, kemiske eller biokemiske egenskaber. Assays er en almindelig procedure i kliniske laboratorier, biovidenskab, molekylærbiologi, farmakologi, miljøbiologi og minedrift.
Hvad er forskellen mellem analyse og test?
Vilkårene “Undersøgelse” og “test” bruges ofte i flæng, men de har forskellige betydninger i videnskabelige sammenhænge:
- Undersøgelse: Et assay er en præcis, kvantitativ eller semikvantitativ analyseprocedure, der er designet til at måle tilstedeværelsen, mængden eller den funktionelle aktivitet af et specifikt stof (analysand) i en prøve. Assays er typisk veldefinerede, reproducerbare protokoller, der bruges til at vurdere renhed, koncentration eller biologisk aktivitet. De bruges ofte i biokemiske, farmakologiske eller kemiske analyser.
- Test: En test er et bredere udtryk, der refererer til enhver metode eller proces, der bruges til at evaluere en prøve eller et systems egenskaber eller funktionalitet. Test kan være kvalitative eller kvantitative, og de kan variere fra simple vurderinger (f.eks. pH-test) til mere komplekse evalueringer. I modsætning til analyser kræver test muligvis ikke så høj grad af specificitet eller kvantitativ måling.
Sammenfattende, mens alle analyser er tests, er ikke alle tests assays. Assays er normalt mere specifikke og kvantitative, hvorimod test kan omfatte en bred vifte af procedurer med varierende specificitet og detaljer.
Hvad er de tre typer analyser?
De tre hovedtyper af analyser er:
- Biokemiske analyser: Disse analyser måler aktiviteten eller koncentrationen af specifikke molekyler (såsom enzymer, substrater eller metabolitter) i biokemiske reaktioner. De bruges i vid udstrækning til at analysere enzymkinetik, bindingsaffiniteter og metaboliske veje.
- Cellebaserede analyser: Cellebaserede analyser vurderer virkningerne af forbindelser, proteiner eller andre stoffer på levende celler. De måler parametre som cellelevedygtighed, proliferation, cytotoksicitet, signalveje og genekspression, hvilket giver indsigt i cellulære responser og lægemiddeleffekter.
- Immunanalyser: Immunanalyser bruger antistoffer til at påvise og kvantificere specifikke antigener eller analytter i en prøve. Almindelige typer omfatter ELISA (enzym-linked immunosorbent assay), western blotting og immunfluorescens. Disse analyser er meget udbredt i diagnostik og forskning til påvisning af proteiner, hormoner og patogener.
Hver af disse analyser er afgørende i forskning, diagnostik og lægemiddeludvikling, da de giver kvantitative eller kvalitative data om forskellige biologiske eller kemiske egenskaber.
Hvad er de vigtigste analyser inden for biovidenskab og mikrobiologi?
- Enzymbundet immunosorbentanalyse (ELISA): ELISA er et meget anvendt immunassay til at påvise og kvantificere specifikke proteiner, antistoffer eller antigener i biologiske prøver. Det er uvurderligt til diagnosticering af sygdomme, sporing af immunresponser og detektion af biomarkører. Sonikering bruges til at lyse celler eller væv for at frigive målproteiner, hvis man analyserer intracellulære komponenter.
- Polymerasekædereaktion (PCR) analyser: PCR og varianter heraf (såsom qPCR og RT-PCR) amplificerer DNA eller RNA, hvilket muliggør hurtig påvisning og kvantificering af specifikt genetisk materiale. Disse analyser er afgørende for patogendetektion, genetiske undersøgelser og diagnostik. Sonikering bruges til DNA-ekstraktion fra celler eller væv, især hvis man studerer mikrobielle eller eukaryote celler med robuste cellevægge eller membraner.
- Western Blotting: Denne teknik detekterer og kvantificerer specifikke proteiner i en prøve, hvilket giver information om proteinekspression, molekylvægt og post-translationelle modifikationer. Det bruges i vid udstrækning inden for molekylærbiologi og sygdomsforskning. Sonikering bruges til lysering af celler eller væv til frigivelse og forskydning af proteiner og forbereder dem til analyse.
- Reporter Gene Assays: Disse analyser måler genekspression og regulatorisk aktivitet ved at introducere reportergener som GFP eller luciferase i celler. De bruges i vid udstrækning til at studere genekspression, promotoraktivitet og virkningerne af lægemidler på signalveje. Sonikering bruges undertiden, hvis lysering af celler til at analysere reportergenprodukter, såsom enzymer som luciferase, i cellebaserede analyser.
- Kromatinimmunpræcipitation (ChIP) analyser: ChIP-analyser undersøger protein-DNA-interaktioner, hvilket giver forskere mulighed for at studere transkriptionsfaktorer, histonmodifikationer og epigenetisk regulering af genekspression, vigtig i genreguleringsundersøgelser og sygdomsforskning. Sonikering er et vigtigt skridt til at skære kromatin i passende fragmentstørrelser, hvilket muliggør effektiv immunudfældning.
- Luminex analyser: Disse multiplex perlebaserede assays måler samtidig flere analytter (f.eks. cytokiner, hormoner) inden for en enkelt prøve, hvilket er nyttigt i immunologi, onkologi og biomarkøropdagelse. Sonikering bruges til fremstilling af celle- eller vævslysater til måling af intracellulære analytter, men det er ikke nødvendigt for plasma- eller serumprøver.

Hielscher Ultrasonics fremstiller højtydende ultralydshomogenisatorer fra Lab til industriel størrelse.