Sonikering til assays – Assay-at-Once-sonikatoren UIP400MTP
Sonikering er en væsentlig teknik i laboratorieprotokoller, især til anvendelser som assays til kromatinimmunpræcipitation (ChIP). Ved at bruge ultralydsenergi til at nedbryde celler, fragmentere DNA ved forskydning og solubilisere kromatin gør sonikering det muligt for forskere at klargøre prøver mere effektivt og reproducerbart. Hielschers sonikatorer til multibrøndsplader er blandt de mest avancerede og effektive værktøjer til dette formål og effektiviserer arbejdsgange med højt prøvegennemløb ved at kunne rumme plader med op til 96 brønde.
Vigtigste fordele ved sonikatorer til multibrøndsplader til assays
Hielschers berøringsfri sonikatorer til 96-brøndsplader, såsom UIP400MTP, tilbyder en yderst pålidelig og kontrolleret tilgang til cellelyse og fragmentering af kromatin ved forskydning. Dette berøringsfri design sikrer, at hver brønd behandles ensartet, hvilket giver konsistente resultater ved store prøveantal. Med denne sonikator kan forskere udføre flere processer, herunder:
- Cellelyse: Effektiv sonikering bryder cellemembraner op og frigiver celleindholdet.
- Fragmentering af DNA og RNA ved forskydning: Ultralydsbølger med høj intensitet fragmenterer DNA og RNA til de ønskede størrelser, hvilket er væsentligt for efterfølgende assays.
- Kromatinfragmentering: Fragmentering af kromatin ved forskydning til mindre stykker til efterfølgende analyser, såsom kromatinimmunpræcipitation (ChIP), DNA-sekventering eller andre epigenetiske undersøgelser. Læs mere om kromatinfragmentering med UIP400MTP!
- Solubilisering: Øger prøvekomponenternes opløselighed og understøtter klargøringen af ensartede, reproducerbare prøver til assays.
Disse funktioner er væsentlige for prøveklargøring med højt prøvegennemløb og miniaturisering af prøver, da de gør det muligt for forskere at behandle flere prøver med minimal risiko for krydskontaminering.
Betydningen af sonikering i ChIP-assays
Assays til kromatinimmunpræcipitation (ChIP) er afhængige af præcis fragmentering af kromatin ved forskydning for at opnå DNA-fragmenter med en optimal størrelse, typisk mellem 200–600 basepar (bp). Disse fragmenter er nødvendige for effektiv immunpræcipitation, præcis topopløsning og pålidelige resultater i ChIP-Seq-assays. Hielscher UIP400MTP Assay-At-Once-sonikatoren er særligt velegnet til ChIP-protokoller og giver ensartet kromatinfragmentering på tværs af flere brønde. Fordelene ved denne præcision i ChIP-arbejdsgange omfatter:
- Højt kromatinudbytte: Effektiv sonikering frigiver en større mængde kromatin fra hver prøve.
- Konsistens på tværs af prøver: Sonikatoren til multibrøndsplader opretholder konsistente fragmentstørrelser i alle brønde og reducerer dermed variationen i ChIP-assays.
- Forbedret følsomhed og opløsning i ChIP-Seq: Korrekt fragmenteret DNA sikrer tydeligere topopløsning, hvilket er en afgørende faktor ved påvisning af præcise protein-DNA-interaktioner.
Pålidelig sonikerings rolle i vellykkede assays
For assays med store prøveantal, såsom inden for klinisk diagnostik eller lægemiddelopdagelse, er reproducerbarhed og prøvegennemløb væsentlige. Sonikatorerne til multibrøndsplader fra Hielscher tilbyder en løsning ved at muliggøre ensartet prøveklargøring i et stort antal brønde. Denne konsistens forbedrer ikke kun assayets robusthed, men øger også den samlede effektivitet i arbejdsgangen og sparer tid og ressourcer i laboratoriet.
Sonikatorerne til multibrøndsplader fra Hielscher er uvurderlige i assayprotokoller, især dem, der kræver behandling med højt prøvegennemløb. Ved at sikre pålidelig cellelyse, fragmentering af DNA ved forskydning og solubilisering optimerer disse sonikatorer prøveklargøringen, så der opnås præcise og reproducerbare resultater. For forskere, der arbejder med ChIP-assays, tilbyder sonikatoren UIP400MTP et robust værktøj, der forbedrer kromatinudbyttet, fragmenternes konsistens og assayets følsomhed – hvilket i sidste ende fører til mere vellykkede forsøg og klarere indsigt.
Vigtigste egenskaber ved sonikatoren UIP400MTP til multibrøndsplader
| Sonikering med højt prøvegennemløb | UIP400MTP er perfekt egnet til 96-brøndsplader og andre multibrøndsplader og muliggør samtidig, identisk sonikering af flere prøver, hvilket forkorter prøveklargøringstiden betydeligt og øger prøvegennemløbet ved testning af store prøveantal. |
| Brug den multibrøndsplade, du foretrækker | UIP400MTP er udviklet til at sonikere alle standardmultibrøndsplader, PCR-plader eller mikrotiterplader. Du vælger den plade, der er bedst egnet til dine forsøg. Da UIP400MTP ikke kræver proprietære forbrugsvarer, sparer du mange penge! |
| Berøringsfri ultralydsbehandling | Sonikatoren til multibrøndsplader UIP400MTP anvender intens ultralyd uden at indføre noget i prøven. Du kan sonikere forseglede multibrøndsplader, lukkede beholdere og hætteglas. Hielscher leverer specialtilpassede prøveholdere til alle hætteglas eller beholdere, der ikke er standard. |
| Præcision og kontrol | Præcis styring og intelligent software gør det muligt at indstille ultralydsparametrene, så de passer optimalt til dine specifikke behandlingsbehov. Du får maksimal sonikeringseffektivitet og virkning i hvert forsøg. |
| Temperaturstyring | Indstil en bestemt temperatur til din sonikering. Pladesonikatoren UIP400MTP kan overvåge prøvetemperaturen og justere sonikeringen derefter. En recirkulerende kølevæske køler hver brønd i pladen for at opnå præcis temperaturstyring. |
| Proceslogning og fjernstyring | Hver sonikeringskørsel kan styres fra en computer. Der kræves ingen softwareinstallation. Du kan bruge din sædvanlige browser (f.eks. Chrome, Firefox, Edge eller Safari) på ethvert operativsystem (f.eks. MacOS, Windows, Android, iOS eller Linux) til at fjernstyre og overvåge UIP400MTP. Hver sonikeringskørsel genererer en detaljeret sonikeringslog til evaluering og dokumentation. Logfilen er i et ikke-proprietært CSV-format, som du kan åbne med dit foretrukne program, f.eks. Microsoft Excel, Apple Numbers eller OpenOffice Calc. |
| Robust og pålidelig | UIP400MTP er udviklet og fremstillet i Tyskland efter de højeste kvalitetsstandarder og er ikke blot kraftfuld, men også bemærkelsesværdigt holdbar. Dens design opfylder industrielle standarder og modstår let belastningerne ved daglig brug i et krævende laboratoriemiljø. Du kan bruge UIP400MTP kontinuerligt 24 timer i døgnet, 7 dage om ugen i processer med højt prøvegennemløb. |
Sådan understøtter UIP400MTP miniaturisering af assays
Hielschers sonikator til multibrøndsplader UIP400MTP spiller en afgørende rolle i miniaturiseringen af assays og gør det muligt for forskere og klinikere at reducere assayvolumener uden at gå på kompromis med nøjagtighed eller præcision. Denne egenskab er uvurderlig inden for områder som mikrobiologi, lægemiddelopdagelse, diagnostik, personlig medicin og klinisk diagnostik, hvor miniaturiserede assays muliggør mere effektiv, omkostningseffektiv og hurtig testning.
- Berøringsfri sonikering i 96-brøndsplader
UIP400MTP’s berøringsfri sonikeringsteknologi er ideelt egnet til miniaturiserede assayformater. Ved at kunne rumme 96-brøndsplader kan denne sonikator behandle meget små prøvevolumener samtidigt i flere brønde. Traditionelle sonikeringsmetoder har ofte svært ved at opnå konsistens ved mindre volumener på grund af ujævn energifordeling, men UIP400MTP leverer ensartede ultralydsbølger til alle brønde og opretholder pålidelige resultater selv i miniaturiserede formater. - Præcision og ensartethed på tværs af prøver
Miniaturisering kræver præcis kontrol med prøveklargøringen, da mindre volumener kan være mere følsomme over for variationer. Den fokuserede sonikering, som UIP400MTP leverer, sikrer, at hver brønd modtager et identisk sonikeringsniveau, hvilket er væsentligt for at opretholde nøjagtighed og reproducerbarhed på tværs af alle prøver. Denne konsistens er afgørende inden for områder som lægemiddelopdagelse og klinisk diagnostik, hvor selv små variationer kan påvirke resultaterne. Læs mere om fokuseret sonikering! - Effektiv cellelyse og fragmentering af DNA ved forskydning i reducerede volumener
Ved mindre volumener bliver effektiv cellelyse og fragmentering af DNA ved forskydning mere udfordrende, men de er afgørende for at opnå assayresultater af høj kvalitet. UIP400MTP’s ultralydsbølger med høj intensitet er kraftige nok til at opnå effektiv celledisruption og fragmentering af DNA ved forskydning selv i reducerede volumener. Denne egenskab gør det muligt for forskere at opnå den nødvendige kvalitet af lysater og DNA-fragmenter uden at skulle øge volumenerne, hvilket gør den til et ideelt værktøj til miniaturiserede arbejdsgange. - Omkostningsbesparelser og ressourceeffektivitet
Miniaturiserede assays bruger færre reagenser og reducerer prøvespild, hvilket er særligt fordelagtigt ved arbejde med sjældne eller dyre prøver. UIP400MTP understøtter dette ved at muliggøre prøveklargøring med højt prøvegennemløb i små volumener, så forskere kan udnytte deres ressourcer maksimalt. Inden for områder som personlig medicin, hvor der kan være begrænsede mængder patientprøver, er denne effektivitet særligt fordelagtig. - Øget prøvegennemløb og hastighed
Ved at reducere assayvolumener hjælper UIP400MTP laboratorier med at behandle flere prøver på kortere tid, hvilket øger prøvegennemløbet betydeligt. Denne hurtige behandling er afgørende inden for områder med stor efterspørgsel som diagnostik og lægemiddelopdagelse, hvor tidskritiske resultater direkte kan påvirke patientbehandling eller forskningsresultater. Miniaturiserede assays kombineret med UIP400MTP’s kapacitet til højt prøvegennemløb muliggør hurtigere testning og analyse i stor skala. - Understøtter automatisering og screening med højt prøvegennemløb
UIP400MTP’s kompatibilitet med alle standardformater af multibrøndsplader muliggør problemfri integration med automatiserede systemer, der anvendes til screening med højt prøvegennemløb. Denne integration er en stor fordel inden for områder som mikrobiologi og lægemiddelopdagelse, hvor hurtig, automatiseret behandling er væsentlig for screening af store stofbiblioteker eller analyse af talrige mikrobielle stammer.
UIP400MTP understøtter miniaturisering af assays ved at levere pålidelig sonikering af små volumener og sikre præcision og konsistens på tværs af prøver. Dens evne til at håndtere miniaturiserede assays med høj nøjagtighed, reproducerbarhed og effektivitet gør det muligt for forskere og klinikere at reducere volumenerne og samtidig opnå hurtigere, omkostningseffektive resultater af høj kvalitet inden for forskellige forskningsområder og kliniske områder. Læs mere!
Assays, der understøttes af sonikatoren til multibrøndsplader UIP400MTP
Sonikatoren til multibrøndsplader UIP400MTP bruges til assays, der omfatter celledisruption for at frigive proteiner og biomolekyler, biofilmforskning og antimikrobiel testning, såsom:
- ELISA: Sonikering bruges, når prøveklargøringen omfatter opbrydning af celler for at opnå proteinekstrakter.
- MBEC-assays (minimal biofilmeradikationskoncentration): Til bestemmelse af den koncentration af antimikrobielle midler, der kræves for at eradikere etablerede biofilm. Læs mere om brugen af UIP400MTP til MBEC-assays, inklusive protokol.
- MBIC-assays (minimal biofilmhæmmende koncentration): Til vurdering af antimikrobielle midlers evne til at forhindre biofilmdannelse.
- Assays til kvantificering af biofilm: Til disruption af biofilm for at måle biomasse eller cellelevedygtighed ved hjælp af metoder som CFU-tællinger eller spektrofotometri.
- Lægemiddelscreening med højt prøvegennemløb: Til evaluering af antimikrobielle forbindelsers effektivitet mod biofilmdannende bakterier i multibrøndsformater.
- Ekstraktion af ekstracellulær matrix: ECM-ekstraktion er et væsentligt trin i prøveklargøringen før talrige assays. Find protokollen til ekstraktion af ekstracellulær matrix med højt prøvegennemløb med UIP400MTP her!
- PMCA: Cyklisk amplifikation af proteinfejlfoldning er et uundværligt trin til pålidelig prionpåvisning. Læs, hvordan UIP400MTP muliggør PMCA med højt prøvegennemløb og robuste resultater!
Litteratur / referencer
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- UIP400MTP-Multi-well-Plate-Sonicator-Infographic
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Ofte stillede spørgsmål
Hvad er sonikering til assays?
Sonikering til assays er en teknik, der bruger ultralydsbølger til at destruere celler, fragmentere DNA ved forskydning og solubilisere proteiner eller kromatin, hvilket muliggør effektiv prøveklargøring til biokemiske assays.
Hvad er et assay?
Et assay er en laboratorieprocedure, der bruges til at måle tilstedeværelsen, mængden eller aktiviteten af et bestemt stof eller en analyt i en prøve, ofte for at vurdere biologiske, kemiske eller biokemiske egenskaber. Assays er en almindelig procedure i kliniske laboratorier, inden for biovidenskab, molekylærbiologi, farmakologi, miljøbiologi og minedrift.
Hvad er forskellen mellem et assay og en test?
Begreberne “assay” og “test” bruges ofte i flæng, men har forskellige betydninger i videnskabelige sammenhænge:
- Assay: Et assay er en præcis, kvantitativ eller semikvantitativ analyseprocedure, der er udviklet til at måle tilstedeværelsen, mængden eller den funktionelle aktivitet af et bestemt stof (en analyt) i en prøve. Assays er typisk veldefinerede, reproducerbare protokoller, der bruges til at vurdere renhed, koncentration eller biologisk aktivitet. De bruges ofte i biokemiske, farmakologiske eller kemiske analyser.
- Test: En test er et bredere begreb, der henviser til enhver metode eller proces, som bruges til at evaluere en prøves eller et systems egenskaber eller funktionalitet. Tests kan være kvalitative eller kvantitative og kan spænde fra enkle vurderinger (f.eks. en pH-test) til mere komplekse evalueringer. I modsætning til assays kræver tests muligvis ikke en lige så høj grad af specificitet eller kvantitativ måling.
Sammenfattende er alle assays tests, men ikke alle tests er assays. Assays er normalt mere specifikke og kvantitative, mens tests kan omfatte en bred vifte af procedurer med varierende specificitet og detaljeringsgrad.
Hvad er de tre typer assays?
De tre hovedtyper af assays er:
- Biokemiske assays: Disse assays måler aktiviteten eller koncentrationen af bestemte molekyler (såsom enzymer, substrater eller metabolitter) i biokemiske reaktioner. De anvendes i vid udstrækning til at analysere enzymkinetik, bindingsaffiniteter og metaboliske reaktionsveje.
- Cellebaserede assays: Cellebaserede assays vurderer virkningerne af forbindelser, proteiner eller andre stoffer på levende celler. De måler parametre som cellelevedygtighed, proliferation, cytotoksicitet, signalveje og genekspression og giver indsigt i cellulære responser og lægemidlers virkninger.
- Immunassays: Immunassays bruger antistoffer til at påvise og kvantificere bestemte antigener eller analytter i en prøve. Almindelige typer omfatter ELISA (enzymkoblet immunosorbentassay), western blotting og immunfluorescens. Disse assays anvendes i vid udstrækning inden for diagnostik og forskning til påvisning af proteiner, hormoner og patogener.
Hvert af disse assays er væsentligt inden for forskning, diagnostik og lægemiddeludvikling, da de giver kvantitative eller kvalitative data om forskellige biologiske eller kemiske egenskaber.
Hvad er de vigtigste assays inden for biovidenskab og mikrobiologi?
- Enzymkoblet immunosorbentassay (ELISA): ELISA er et meget anvendt immunassay til at påvise og kvantificere bestemte proteiner, antistoffer eller antigener i biologiske prøver. Det er uvurderligt til diagnosticering af sygdomme, overvågning af immunresponser og påvisning af biomarkører. Sonikering bruges til at lysere celler eller væv for at frigive målproteiner, når intracellulære komponenter analyseres.
- Assays med polymerasekædereaktion (PCR): PCR og dens varianter (såsom qPCR og RT-PCR) amplificerer DNA eller RNA og muliggør hurtig påvisning og kvantificering af specifikt genetisk materiale. Disse assays er afgørende inden for patogenpåvisning, genetiske undersøgelser og diagnostik. Sonikering bruges til DNA-ekstraktion fra celler eller væv, især ved undersøgelse af mikrobielle eller eukaryote celler med robuste cellevægge eller membraner.
- Western blotting: Denne teknik påviser og kvantificerer bestemte proteiner i en prøve og giver information om proteinekspression, molekylvægt og posttranslationelle modifikationer. Den anvendes i vid udstrækning inden for molekylærbiologi og sygdomsforskning. Sonikering bruges til at lysere celler eller væv for at frigive og fragmentere proteiner ved forskydning og dermed klargøre dem til analyse.
- Reportergenassays: Disse assays måler genekspression og regulatorisk aktivitet ved at indføre reportergener som GFP eller luciferase i celler. De anvendes i vid udstrækning til at undersøge genekspression, promotoraktivitet og lægemidlers virkninger på signalveje. Sonikering bruges undertiden ved lysering af celler for at analysere reportergenprodukter, såsom enzymer som luciferase, i cellebaserede assays.
- Assays til kromatinimmunpræcipitation (ChIP): ChIP-assays undersøger protein-DNA-interaktioner og gør det muligt for forskere at studere transkriptionsfaktorer, histonmodifikationer og epigenetisk regulering af genekspression, hvilket er vigtigt i undersøgelser af genregulering og sygdomsforskning. Sonikering er et centralt trin til at fragmentere kromatin ved forskydning til passende fragmentstørrelser, hvilket muliggør effektiv immunpræcipitation. Læs mere om kromatinfragmentering med ultralyd!
- Luminex-assays: Disse multipleksassays baseret på mikrokugler måler samtidigt flere analytter (f.eks. cytokiner og hormoner) i en enkelt prøve og er nyttige inden for immunologi, onkologi og opdagelse af biomarkører. Sonikering bruges til at klargøre celle- eller vævslysater for at måle intracellulære analytter, men er ikke nødvendig for plasma- eller serumprøver.
Hielscher Ultrasonics fremstiller højtydende ultralydshomogenisatorer fra laboratoriestørrelse til industristørrelse.


