MBEC-analyseprotokol med sonikatoren UIP400MTP til 96-brøndsplader
MBEC-analysen bruges til at bestemme den koncentration af antimikrobielle midler, der er nødvendig for at eliminere biofilm dannet på stiftlåg. For at vurdere biofilmens levedygtighed skal biofilmen først løsnes fra stiftlågene på en 96-brøndsplade. Sonikering er den mest pålidelige og effektive metode til denne løsrivelse. Sonikatoren UIP400MTP til flerbrøndsplader er specielt udviklet til at behandle analyseplader med maksimal effektivitet og brugervenlighed og dermed effektivisere og fremskynde MBEC-analyser med høj prøvekapacitet.
Sonikering til løsrivelse af biofilm
Sonikering er et afgørende trin i analyser af minimumskoncentrationen til eradikation af biofilm (MBEC) og muliggør effektiv løsrivelse af biofilmceller fra den overflade, de er fastgjort til. Biofilm er i deres natur strukturerede samfund af mikroorganismer indlejret i en ekstracellulær matrix, som gør dem væsentligt mere resistente over for antimikrobielle midler end planktoniske celler. Under MBEC-analyser anvender sonikering ultralydsbølger til at frembringe kontrolleret kavitation, som bryder biofilmmatricen op og frigiver de indlejrede celler til en suspension. Dette trin sikrer, at biofilmcellerne fordeles jævnt i restitutionsmediet, hvilket muliggør nøjagtige vurderinger af levedygtigheden ved udpladning, fortynding eller spektrofotometriske metoder. Uden korrekt løsrivelse af biofilmen kan resterende matrixkomponenter beskytte cellerne og føre til en undervurdering af den antimikrobielle effekt. Sonikering er derfor uundværlig for at opnå pålidelige og reproducerbare MBEC-værdier, som afspejler de testede midlers reelle eradikationspotentiale. Sonikatoren UIP400MTP til flerbrøndsplader muliggør enkel prøveforberedelse med høj prøvekapacitet i analyseplader.
Sonikatoren UIP400MTP til flerbrøndsplader letter prøveforberedelsen med høj prøvekapacitet i analyseplader.
Analyseprotokol for minimumskoncentrationen til eradikation af biofilm (MBEC)
Trin 1: Dannelse af biofilm
- Forbered bakteriesuspensionen:
Dyrk bakterier i egnede medier, indtil de er i den logaritmiske vækstfase.
Fortynd bakteriekulturen til en defineret optisk densitet (f.eks. OD600 ~0,1). - Inokulér 96-brøndspladen:
Tilsæt bakteriesuspensionen (f.eks. 150–200 µL) til hver brønd i en standardmikrotiterplade med 96 brønde. - Sæt stiftlåget på:
Anbring stiftlåget på den inokulerede plade, så biofilm kan dannes på stifternes overflader. - Inkubér pladen:
Inkubér opstillingen ved en passende temperatur (f.eks. 37°C) i 24–48 timer uden omrystning for at fremme biofilmvækst.
Trin 2: Behandling med antimikrobielle midler
- Forbered antimikrobielle opløsninger:
Forbered en række koncentrationer af antimikrobielle midler i friske medier.
Eksponér biofilmene for antimikrobielle midler:
Fjern stiftlåget fra bakteriekulturen, og skyl det i steril saltvandsopløsning eller PBS for at fjerne planktoniske celler.
Anbring stiftlåget i en ny 96-brøndsplade, der indeholder de antimikrobielle opløsninger. - Inkubér pladen:
Inkubér i en defineret periode (f.eks. 24 timer), så biofilmene eksponeres for de antimikrobielle midler.
Sonikatoren UIP400MTP til flerbrøndsplader til prøveforberedelse med høj prøvekapacitet
Trin 3: Sonikering med sonikatoren UIP400MTP til 96-brøndsplader
Sonikeringstrinnet er afgørende for at løsne biofilmene fra stiftlågene, så levedygtigheden kan vurderes. Følg disse trin ved brug af sonikatoren UIP400MTP:
- Forbered opstillingen:
Fyld hver brønd i en ny 96-brøndsplade med restitutionsmedium (f.eks. neutraliserende bouillon eller frisk vækstmedium). - Overfør stiftlåget:
Fjern stiftlåget fra pladen til antimikrobiel behandling.
Skyl stiftlåget i steril saltvandsopløsning eller PBS for at fjerne rester af antimikrobielle midler. - Placér pladen og sonikatoren:
Sæt stiftlåget på pladen med restitutionsmedium.
Anbring pladen med restitutionsmedium på platformen på sonikatoren UIP400MTP, og sørg for, at pladen er centreret og står stabilt. - Justér sonikeringsparametrene:
Indstil sonikeringsparametrene på UIP400MTP (indstillingerne kan tilpasses biofilmen):
Amplitude: 70–100%.
Sonikeringstid: 1–3 minutter (justér efter biofilmens robusthed) i cyklustilstand. - Sonikér:
Start sonikeringsprocessen. Ultralydsvibrationerne vil løsne biofilmene fra stifternes overflader og overføre dem til restitutionsmediet. - Overvåg processen:
Brug temperatursensoren med stiktilslutning til at overvåge prøvetemperaturen i brøndene. UIP400MTP kan tilsluttes en laboratoriekøler til køling. - Håndtering efter sonikering:
Overfør straks restitutionsmediet (som nu indeholder løsrevne biofilm) til en ny steril plade til efterfølgende analyse.
(A) Plade med TSB med 2% glukose anvendt til biofilmdannelse, genvinding af celler og
bestemmelse af MIC og MBCB; (B) Låg med stifter til dannelse af stafylokokbiofilm. bestemmelse af MIC og MBCB; (B) Låg med stifter til dannelse af stafylokokbiofilm.
Biofilmcellerne, der var dannet på stifterne, blev løsnet ved sonikering (Hielscher Ultrasound Technology) i 5 min i 96-brøndsplader med frisk dyrkningsmedium til genvinding af cellerne.
(Billede og undersøgelse: ©de Oliveira et al., 2016)
Trin 4: Vurdering af levedygtighed
Udplad og dyrk de løsrevne biofilm:
- Foretag seriefortyndinger af restitutionsmediet, og udplad på agar for at tælle kolonidannende enheder (CFU).
Brug alternativt en kolorimetrisk eller fluorescensbaseret levedygtighedsanalyse. - Registrér resultaterne:
Bestem MBEC som den laveste koncentration af det antimikrobielle middel, der eliminerede påviselig levedygtighed i biofilmen.
Design, fremstilling og rådgivning – kvalitet fremstillet i Tyskland
Hielschers ultralydsapparater er kendt for deres højeste standarder for kvalitet og design. Robusthed og nem betjening gør det muligt at integrere vores ultralydsapparater problemfrit i industrianlæg. Hielschers sonikatorer håndterer let barske forhold og krævende miljøer.
Hielscher Ultrasonics er en ISO-certificeret virksomhed og lægger særlig vægt på højtydende ultralydsapparater med den nyeste teknologi og brugervenlighed. Hielschers ultralydsapparater er naturligvis CE-kompatible og opfylder kravene i UL, CSA og RoHs.
Effektivisér prøveforberedelsen i 96-brøndsplader og analyseplader ved hjælp af sonikatoren UIP400MTP til flerbrøndsplader
Litteratur / referencer
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Microplate Sonicator Validated in Peer-Reviewed Proteomics Study
Ofte stillede spørgsmål
Hvad er MBEC-analysen?
Analysen af minimumskoncentrationen til eradikation af biofilm (MBEC) er en standardiseret metode, der bruges til at bestemme den laveste koncentration af et antimikrobielt middel, som er nødvendig for at eradikere biofilmassocierede bakterier. Den omfatter dyrkning af biofilm på specialiserede overflader, eksponering af dem for forskellige koncentrationer af antimikrobielle midler og vurdering af de løsrevne cellers levedygtighed efter opbrydning af biofilmen, typisk ved sonikering, for at evaluere behandlingens effekt.
Hvad er forskellen mellem MBIC og MBEC?
Minimumskoncentrationen til hæmning af biofilm (MBIC) er den laveste koncentration af et antimikrobielt middel, der er nødvendig for at forhindre biofilmdannelse, mens minimumskoncentrationen til eradikation af biofilm (MBEC) er den laveste koncentration, der er nødvendig for at eradikere en etableret biofilm. MBIC fokuserer på forebyggelse af biofilm, mens MBEC vurderer behandlingens effekt mod modne biofilm.
Hvilke plader bruges almindeligvis til MBEC-analyser?
Mikrotiterplader, der almindeligvis bruges til MBEC-analyser, er typisk 96-brøndsplader fremstillet af polystyren eller polypropylen. Disse materialer giver en egnet overflade til biofilmdannelse og er kemisk resistente over for de antimikrobielle midler, der testes under analysen. Polystyrenplader foretrækkes i vid udstrækning på grund af deres optiske klarhed, som er fordelagtig ved efterfølgende analyser såsom spektrofotometriske eller fluorescensbaserede målinger. Disse pladers design omfatter aftagelige stiftlåg, som er afgørende for analysen, da biofilm dannes på stifterne, der er nedsænket i brøndene med vækstmedier. Standardiserede plader, såsom dem, der overholder MBEC-analyseprotokollen, er specielt udviklet til at sikre reproducerbarhed og kompatibilitet med sonikatoren UIP400MTP eller andet behandlingsudstyr.
Hvad er plader med PEG-låg?
Plader med PEG-låg er specialiserede flerbrøndspladesystemer, hvor låget er udstyret med små tappe eller stifter af polyethylenglykol (PEG), som strækker sig ned i hver brønd. Disse stifter giver en overflade til dannelse af mikrobiel biofilm under kontrollerede forhold og efterligner biofilmvækst under virkelige forhold. Designet gør det muligt for biofilm at udvikle sig på stifterne, mens brøndene indeholder vækstmedier eller antimikrobielle midler, hvilket muliggør test med høj prøvekapacitet af biofilms følsomhed over for behandlinger, såsom i MBEC- og MBIC-analyser.
Hielscher Ultrasonics fremstiller højtydende ultralydshomogenisatorer fra laboratoriestørrelse til industristørrelse.