Liza komórek drożdży w mikropłytkach za pomocą sonikacji o wysokiej intensywności
Mikrobiolodzy i badacze nauk o życiu pracujący z Saccharomyces cerevisiae, Pichia pastoris / Komagataella phaffii, a także z innymi systemami drożdżowymi, znają to wyzwanie: komórki drożdży są wytrzymałe, uzyskanie powtarzalnej lizy może być trudne, a ręczne rozbijanie próbek szybko staje się wąskim gardłem, gdy konieczne są badania przesiewowe wielu szczepów, klonów, warunków hodowli lub konstruktów ekspresyjnych.
Wysokoprzepustowa liza drożdży w mikrobiologii, biologii molekularnej i analityce białek
Sonikatory do mikropłytek Hielscher, takie jak UIP400MTP (400 W) i UIP550MTP (550 W), zapewniają wysokoprzepustowe rozwiązanie do mechanicznej lizy komórek drożdży bezpośrednio w mikropłytkach. Zamiast przetwarzać próbki pojedynczo za pomocą sonotrody, można poddawać sonikacji całe mikropłytki w jednolitych warunkach. Dzięki temu ultradźwiękowa liza drożdży jest szybsza, bardziej powtarzalna i łatwiejsza do włączenia do nowoczesnych procedur mikrobiologicznych, ekspresji białek, badań przesiewowych enzymów i badań omicznych.
Niezależnie od tego, czy potrzebujesz uwolnić białka rekombinowane z P. pastoris, przygotować lizaty drożdży do oznaczeń enzymatycznych, rozbić komórki S. cerevisiae do analizy białek, czy równolegle przeprowadzić badania przesiewowe dziesiątek klonów drożdży, sonikatory do mikropłytek Hielscher zapewniają intensywne rozbijanie komórek oparte na kawitacji z precyzyjną kontrolą procesu.
Potrzebujesz powtarzalnej lizy S. cerevisiae, P. pastoris lub innych szczepów drożdży w mikropłytkach? Podaj nam format płytki, objętość próbki, gęstość komórek i docelowy analit. Pomożemy Ci określić odpowiednie parametry sonikacji dla Twojej procedury z wykorzystaniem UIP400MTP lub UIP550MTP.
Sonikator do płytek wielodołkowych Hielscher do lizy drożdży – wysokoprzepustowe przygotowanie próbek
Dlaczego komórki drożdży wymagają wydajnej lizy mechanicznej
Komórki drożdży trudniej poddają się lizie niż wiele komórek bakteryjnych lub ssaczych, ponieważ chroni je sztywna ściana komórkowa zbudowana głównie z polisacharydów, glukanów, mannoprotein i chityny. Ta ściana komórkowa zapewnia stabilność mechaniczną, ale także ogranicza uwalnianie wewnątrzkomórkowych białek, kwasów nukleinowych, metabolitów i enzymów.
Konwencjonalne metody lizy drożdży obejmują rozbijanie za pomocą kulek, trawienie enzymatyczne, cykle zamrażania i rozmrażania, lizę chemiczną oraz sonikację za pomocą sonotrody. Metody te mogą być skuteczne, ale mają również ograniczenia. Rozbijanie za pomocą kulek może wprowadzać zanieczyszczenia stałe i powodować nagrzewanie, trawienie enzymatyczne może zwiększać koszty i zmienność, a sonikacja pojedynczych próbek za pomocą sonotrody jest czasochłonna, gdy trzeba przetworzyć dużą liczbę próbek.
Skupiona kawitacja ultradźwiękowa o wysokiej intensywności pozwala przezwyciężyć te ograniczenia, oddziałując na zawiesinę drożdży silnymi mechanicznymi siłami ścinającymi, wahaniami ciśnienia i mikroprzepływami. Rezultatem jest szybkie rozbijanie ścian i błon komórkowych, lepsze uwalnianie składników wewnątrzkomórkowych oraz wysoce powtarzalne przygotowanie próbek w formacie płytkowym.
Sonikacja mikropłytek do równoległego przygotowania próbek drożdży
Urządzenia Hielscher UIP400MTP i UIP550MTP są przeznaczone do równomiernej sonikacji mikropłytek, płytek wielodołkowych, płytek PCR i odpowiednich statywów na próbki. W przeciwieństwie do sonikacji za pomocą sonotrody próbki nie wymagają indywidualnego przetwarzania. Cała płytka jest poddawana działaniu kontrolowanej energii ultradźwiękowej, dzięki czemu procedura bardzo dobrze nadaje się do równoległego przetwarzania próbek.
Jest to szczególnie przydatne w przypadku:
- Badań przesiewowych S. cerevisiae – mutantów lub szczepów ekspresyjnych
- Lizy klonów P. pastoris / K. phaffii po ekspresji białek rekombinowanych
- Przygotowania lizatów drożdży do oznaczeń enzymatycznych
- Ekstrakcji białek do SDS-PAGE, Western blot, ELISA, LC-MS/MS lub badań aktywności
- Uwalniania metabolitów wewnątrzkomórkowych do badań metabolomicznych
- Przygotowania próbek DNA i RNA po odpowiednim oczyszczaniu na dalszym etapie
- Wysokoprzepustowej optymalizacji buforów do lizy, dodatków i warunków ekstrakcji
Jak kawitacja ultradźwiękowa rozbija komórki drożdży
Podczas sonikacji skupione ultradźwięki o wysokiej mocy generują w ciekłej próbce naprzemienne cykle sprężania i rozrzedzania. Przy wystarczającej intensywności te wahania ciśnienia wywołują kawitację akustyczną. Pęcherzyki kawitacyjne powstają, oscylują i zapadają się, wytwarzając lokalne siły ścinające, mikrostrugi, turbulencje i silne gradienty ciśnienia.
W zawiesinach drożdży te efekty mechaniczne osłabiają i rozrywają ścianę komórkową oraz błonę komórkową. Wewnątrzkomórkowe białka, enzymy, kwasy nukleinowe i metabolity są uwalniane do buforu do lizy. Ponieważ proces ma charakter mechaniczny, można go stosować z wieloma różnymi układami buforowymi i łączyć z inhibitorami proteaz, środkami redukującymi, detergentami, solami lub łagodną enzymatyczną obróbką wstępną.
Ogólny protokół: liza komórek drożdży w mikropłytkach
Poniższy protokół stanowi praktyczny punkt wyjścia do lizy drożdży za pomocą sonikatora do mikropłytek Hielscher UIP400MTP lub UIP550MTP. Parametry należy zoptymalizować w zależności od szczepu drożdży, gęstości komórek, docelowej cząsteczki, składu buforu, typu płytki i oznaczenia wykonywanego na dalszym etapie.
1. Zbierz i przemyj komórki drożdży
Hoduj Saccharomyces, Pichia, Hansenula, Debaryomyces lub inny szczep drożdży w pożądanych warunkach hodowli. Zbierz komórki przez wirowanie i usuń pożywkę hodowlaną. Przemyj osad zimną wodą destylowaną, PBS lub wybranym buforem do lizy, aby usunąć pozostałości składników pożywki, które mogą zakłócać analizę na dalszym etapie.
Podczas ekstrakcji białek utrzymuj próbki w niskiej temperaturze i pracuj szybko. Jeśli proteazy stanowią problem, wstępnie schłodź wszystkie bufory i materiały zużywalne.
2. Ponownie zawieś osad komórkowy
Ponownie zawieś osad drożdży w odpowiednim zimnym buforze do lizy. Wysoka gęstość komórek często sprzyja wydajnemu uwalnianiu białek. Jako punkt wyjścia zastosuj około 10–20% w/v mokrego osadu komórkowego lub gęstą zawiesinę odpowiadającą OD600 > 10, w zależności od oznaczenia.
Typowy bufor do lizy drożdży stosowany do ekstrakcji białek może zawierać:
- układ buforowy, taki jak Tris-HCl, bufor fosforanowy lub HEPES
- sól, taką jak NaCl lub KCl
- koktajl inhibitorów proteaz
- opcjonalny środek redukujący, taki jak DTT lub β-merkaptoetanol
- opcjonalny detergent, taki jak Triton X-100, NP-40, SDS lub CHAPS, w zależności od zgodności z procedurami na dalszych etapach
- opcjonalne inhibitory fosfataz do badań fosforylacji
W przypadku szczepów drożdży trudnych do lizy lub bardzo łagodnej ekstrakcji białek przed sonikacją można zastosować krótką obróbkę wstępną z użyciem Zymolyase, Lyticase lub innego enzymu trawiącego ścianę komórkową. Ta enzymatyczna obróbka wstępna jest opcjonalna, ale może poprawić wydajność lizy lub zmniejszyć wymaganą intensywność ultradźwięków.
3. Przenieś próbki do odpowiedniej mikropłytki
Rozdziel zawiesinę drożdży do mikropłytki przystosowanej do sonikacji. Często preferowane są płytki z okrągłym dnem, ponieważ ułatwiają pobieranie próbek i ograniczają martwe strefy. Stosuj jednakowe objętości próbek we wszystkich dołkach, aby poprawić powtarzalność.
Uszczelnij płytkę odpowiednią matą lub folią uszczelniającą, aby zapobiec parowaniu, powstawaniu aerozoli i zanieczyszczeniu krzyżowemu. Upewnij się, że uszczelnienie jest zgodne z wybraną temperaturą i warunkami sonikacji.
Typowe objętości robocze zależą od formatu płytki i zastosowania. Popularne formaty obejmują płytki 96-dołkowe, płytki z głębokimi dołkami, płytki PCR lub odpowiednie statywy na probówki.
4. Przygotuj chłodzenie
Liza drożdży wymaga wysokiej intensywności ultradźwięków, a mechaniczne rozbijanie generuje ciepło. Kontrola temperatury ma zatem kluczowe znaczenie, zwłaszcza w analizach białek, enzymów, RNA lub fosforylacji.
Zastosuj odpowiednią strategię chłodzenia, taką jak:
- wstępnie schłodzony bufor do lizy
- wstępnie schłodzone mikropłytki
- przerwy na chłodzenie między okresami sonikacji
- zewnętrzne chłodzenie platformy do sonikacji, gdy ma to zastosowanie
Celem jest utrzymanie próbki w temperaturze wystarczająco niskiej, aby zapobiec denaturacji białek, inaktywacji enzymów, degradacji RNA i zmienności próbek wywołanej ciepłem.
5. Poddaj zawiesinę drożdży sonikacji
Umieść uszczelnioną płytkę w sonikatorze do mikropłytek Hielscher UIP400MTP lub UIP550MTP i wybierz program sonikacji impulsowej. Zaleca się pracę impulsową, ponieważ umożliwia ona mechaniczne rozbijanie podczas faz ON i odprowadzanie ciepła podczas faz OFF.
Jako punkt wyjścia do lizy komórek drożdży:
| Parametr | Zalecany zakres początkowy | Cel |
|---|---|---|
| Amplituda | 60–100% | Wysoka intensywność kawitacji dla wytrzymałych komórek drożdży |
| Tryb impulsowy | 10–30 sec ON / 30–60 sec OFF | Wydajna liza z kontrolowanym gromadzeniem ciepła |
| Łączny czas ON | 5–15 min | Dostosuj do szczepu, gęstości i docelowej cząsteczki |
| Temperatura | Utrzymuj próbki w niskiej temperaturze | Chroń białka, enzymy, RNA i metabolity |
| Uszczelnienie płytki | Zalecane | Zapobiega parowaniu, powstawaniu aerozoli i zanieczyszczeniu krzyżowemu |
W przypadku zawiesin drożdży o bardzo wysokiej odporności, gęstej biomasy P. pastoris lub trudnej ekstrakcji białek rekombinowanych stopniowo zwiększaj łączny czas ON. W przypadku białek wrażliwych na ciepło lub oznaczeń enzymatycznych stosuj krótsze impulsy, dłuższe przerwy na chłodzenie i niższą amplitudę początkową.
Wysokoprzepustowa liza drożdży w płytkach wielodołkowych za pomocą UIP400MTP
6. Sklaruj lizat
Po sonikacji odwiruj mikropłytkę lub przenieś próbki do probówek w celu wirowania. Usuń resztki komórkowe przez wirowanie z odpowiednią prędkością i w odpowiedniej temperaturze. Zbierz supernatant do analizy na dalszym etapie.
W zależności od zastosowania lizat można wykorzystać do:
- ilościowego oznaczania białek
- oznaczeń aktywności enzymatycznej
- SDS-PAGE i Western blot
- ELISA i oznaczeń immunologicznych
- badań proteomicznych LC-MS/MS
- analizy metabolitów
- oczyszczania DNA lub RNA
7. Zoptymalizuj i udokumentuj metodę
Aby uzyskać powtarzalną lizę drożdży, dokumentuj wszystkie istotne parametry, w tym szczep, warunki hodowli, OD600, mokrą masę komórek, skład buforu, typ płytki, objętość próbki, amplitudę, cykl impulsowy, łączny czas ON, metodę chłodzenia i końcową temperaturę próbki.
Jeśli sonikator Hielscher jest wyposażony w automatyczną rejestrację danych, dane procesowe można wykorzystać do dokumentacji, opracowywania metod, zwiększania skali i kontroli jakości.
Wskazówki dotyczące optymalizacji lizy drożdży
Aby uzyskać maksymalne uwalnianie białek, stosuj gęste zawiesiny drożdży, wysoką intensywność ultradźwięków i wystarczający łączny czas ON. W przypadku wrażliwych białek zmniejsz amplitudę, wydłuż przerwy na chłodzenie i utrzymuj płytkę w niskiej temperaturze przez cały proces.
Jeśli liza jest niepełna, stopniowo wydłużaj czas sonikacji, przetestuj enzymatyczną obróbkę wstępną, zmniejsz lepkość próbki lub zoptymalizuj bufor. Jeśli białka ulegają degradacji lub tracą aktywność, popraw chłodzenie, skróć okresy ON, dodaj inhibitory i sprawdź, czy układ detergentów jest zgodny z docelowym białkiem.
Ponieważ szczepy drożdży znacznie różnią się budową ściany komórkowej, fazą wzrostu, systemem ekspresji i gęstością biomasy, zaleca się niewielką macierz optymalizacyjną. Na przykład przetestuj trzy amplitudy, dwa cykle impulsowe i dwa łączne czasy ON, a następnie oceń wydajność lizy i integralność białek.
Niezależnie od tego, czy przetwarzasz kilka płytek do oznaczeń, czy prowadzisz wysokoprzepustowe badania przesiewowe drożdży, Hielscher może pomóc Ci wybrać odpowiedni sonikator do mikropłytek i opracować niezawodny protokół lizy. Skontaktuj się z nami, podając szczep drożdży, procedurę i wymagania dotyczące wydajności przetwarzania próbek!
Zalety sonikatorów do mikropłytek Hielscher w lizie drożdży
Sonikatory do mikropłytek Hielscher są idealne dla laboratoriów, które potrzebują powtarzalnej lizy wielu próbek. Eliminują powolne przetwarzanie pojedynczych próbek charakterystyczne dla sonikacji za pomocą sonotrody i ograniczają zmienność wynikającą z ręcznego pozycjonowania sonotrody, głębokości zanurzenia oraz różnic w postępowaniu z poszczególnymi próbkami.
Najważniejsze zalety obejmują:
- Wysokoprzepustowe przetwarzanie: Poddawaj wiele próbek drożdży równoległej sonikacji w mikropłytkach lub kompatybilnych statywach na próbki.
- Powtarzalne warunki: Jednakowe warunki sonikacji we wszystkich dołkach zapewniają jednolite, porównywalne wyniki lizy.
- Brak zanieczyszczenia krzyżowego przez sonotrodę: Próbki pozostają szczelnie zamknięte podczas sonikacji, co ogranicza przenoszenie materiału między próbkami i liczbę etapów czyszczenia.
- Odpowiednie dla wytrzymałych komórek: Ultradźwięki o wysokiej intensywności wspomagają rozbijanie ścian komórkowych drożdży.
- Wydajna procedura: Idealne do badań przesiewowych szczepów, klonów, warunków ekspresji i buforów do lizy.
- Wydajna procedura: Programowalne ustawienia, automatyczna rejestracja danych i możliwość zastosowania w automatyzacji laboratoryjnej.
Zastosowania w biotechnologii drożdży i badaniach nauk o życiu
Ultradźwiękowa liza drożdży w mikropłytkach wspomaga wiele procedur badawczych i przesiewowych. W ekspresji białek rekombinowanych klony P. pastoris i S. cerevisiae można poddawać równoległej lizie, aby porównywać poziomy ekspresji lub aktywność enzymatyczną. W biologii systemowej i badaniach omicznych standaryzowana liza poprawia porównywalność wyników uzyskiwanych w różnych warunkach. W mikrobiologii sonikacja wspomaga szybkie przygotowanie lizatów z wielu szczepów, hodowli w różnych warunkach pożywkowych lub po zastosowaniu czynników stresowych.
Typowe obszary zastosowań obejmują:
- ekstrakcję białek z drożdży
- badania przesiewowe białek rekombinowanych
- badania przesiewowe aktywności enzymatycznej
- selekcję klonów po transformacji
- optymalizację fermentacji
- przygotowanie próbek do badań proteomicznych
- przygotowanie próbek do badań metabolomicznych
- badania rozbijania ścian komórkowych
- wysokoprzepustowe oznaczenia mikrobiologiczne
Niezawodna liza drożdży zaczyna się od kontrolowanej sonikacji
Liza drożdży może być trudna, gdy liczba próbek wzrasta, ale sonikatory do mikropłytek Hielscher sprawiają, że proces jest szybszy, czystszy i bardziej powtarzalny. UIP400MTP i UIP550MTP umożliwiają badaczom przetwarzanie całych płytek w określonych warunkach ultradźwiękowych, zwiększając wydajność przetwarzania próbek i ograniczając ręczne czynności.
Dla mikrobiologów, biologów molekularnych, badaczy białek i laboratoriów biotechnologicznych sonikacja mikropłytek jest skutecznym narzędziem do wydajnego i powtarzalnego uwalniania wewnątrzkomórkowych składników drożdży.
Najczęściej zadawane pytania dotyczące lizy komórek drożdży przez sonikację mikropłytek
Czy komórki drożdży można poddawać lizie przez sonikację?
Tak. Komórki drożdży, takich jak Saccharomyces cerevisiae i Pichia pastoris, można poddawać lizie przez sonikację o wysokiej intensywności. Kawitacja ultradźwiękowa generuje silne mechaniczne siły ścinające, które rozbijają ścianę i błonę komórkową drożdży, uwalniając białka, enzymy, kwasy nukleinowe i metabolity.
Dlaczego komórki drożdży trudniej poddają się lizie niż komórki bakteryjne?
Komórki drożdży mają grubą i mechanicznie odporną ścianę komórkową zbudowaną głównie z glukanów, mannoprotein i chityny. Ta sztywna struktura sprawia, że drożdże trudniej rozbić niż wiele komórek bakteryjnych lub ssaczych. Dlatego liza drożdży zwykle wymaga wyższej intensywności, dłuższego przetwarzania lub opcjonalnej enzymatycznej obróbki wstępnej.
Które sonikatory Hielscher nadają się do lizy drożdży w mikropłytkach?
Hielscher UIP400MTP i UIP550MTP nadają się do wysokoprzepustowej lizy drożdży w mikropłytkach. UIP400MTP jest idealny do rutynowego równoległego przygotowania próbek, natomiast UIP550MTP zapewnia wyższą moc ultradźwiękową do wymagających zadań lizy, gęstych zawiesin i wytrzymałych szczepów drożdży.
Czy Pichia pastoris można poddawać lizie w sonikatorze do mikropłytek?
Tak. Pichia pastoris, znane również jako Komagataella phaffii, można poddawać lizie przez sonikację mikropłytek o wysokiej intensywności. Ponieważ P. pastoris może tworzyć gęstą biomasę i ma wytrzymałą ścianę komórkową, zaleca się optymalizację amplitudy, cyklu impulsowego, chłodzenia i całkowitego czasu sonikacji.
Jakie są typowe parametry sonikacji do lizy drożdży?
Przydatny zakres początkowy to amplituda 50–80%, praca impulsowa, na przykład 10–30 sekund ON i 30–60 sekund OFF, oraz 5–15 minut łącznego czasu ON. Dokładne parametry zależą od szczepu drożdży, gęstości komórek, objętości próbki, typu płytki, buforu i docelowej cząsteczki.
Dlaczego lizę drożdży należy prowadzić w trybie impulsowym?
Tryb impulsowy ogranicza gromadzenie ciepła podczas sonikacji. W fazie ON kawitacja ultradźwiękowa rozbija komórki. W fazie OFF próbka może się schłodzić. Jest to ważne, ponieważ nadmierne ciepło może denaturować białka, obniżać aktywność enzymów, powodować degradację RNA i pogarszać powtarzalność.
Czy przed sonikacją komórek drożdży wymagana jest enzymatyczna obróbka wstępna?
Enzymatyczna obróbka wstępna nie zawsze jest wymagana, ale może poprawić wydajność lizy. Enzymy takie jak Zymolyase lub Lyticase częściowo trawią ścianę komórkową drożdży i mogą zmniejszyć intensywność ultradźwięków lub czas potrzebny do pełnej lizy. Może to być przydatne w przypadku wrażliwych białek lub szczepów trudnych do lizy.
Jak zapobiegać przegrzewaniu podczas sonikacji drożdży?
Stosuj wstępnie schłodzone bufory, tryb impulsowy, przerwy na chłodzenie i chłodzony układ do przetwarzania płytki. Utrzymuj mikropłytkę szczelnie zamkniętą i monitoruj temperaturę, gdy jest to możliwe. W przypadku wrażliwych białek stosuj krótsze okresy ON, dłuższe okresy OFF i przetwarzaj próbki w niskiej temperaturze.
Czy sonikacja mikropłytek może zastąpić rozbijanie za pomocą kulek w lizie drożdży?
W wielu procedurach tak. Sonikacja mikropłytek może zastąpić rozbijanie za pomocą kulek, gdy wymagana jest czysta, powtarzalna i równoległa liza. Pozwala uniknąć manipulowania kulkami, upraszcza dobór i stosowanie materiałów zużywalnych oraz automatyzację. Każde zastosowanie należy jednak zwalidować, porównując wydajność lizy, integralność białek i skuteczność oznaczeń.
Czy sonikacja mikropłytek nadaje się do ekstrakcji białek z drożdży?
Tak. Sonikacja mikropłytek dobrze nadaje się do ekstrakcji białek z drożdży, zwłaszcza gdy trzeba porównać wiele klonów lub warunków hodowli. Inhibitory proteaz, zimne bufory i kontrolowane ustawienia impulsów pomagają zachować jakość białek.
Czy tę samą metodę można stosować do ekstrakcji DNA, RNA i białek?
Można zastosować tę samą podstawową zasadę sonikacji, ale bufor i warunki procesu należy dostosować do docelowej cząsteczki. Procedury dotyczące białek wymagają hamowania aktywności proteaz i kontroli temperatury. Procedury dotyczące RNA wymagają pracy w warunkach wolnych od RNaz i intensywnego chłodzenia. Procedury dotyczące DNA mogą wymagać różnych warunków lizy i oczyszczania w zależności od tego, czy pożądane jest nienaruszone genomowe DNA, czy pofragmentowane DNA.
Jakiego typu płytki należy używać do lizy drożdży?
Użyj mikropłytki lub płytki z głębokimi dołkami przystosowanej do sonikacji, z odpowiednim uszczelnieniem. Płytki z okrągłym dnem są często przydatne podczas pracy z zawiesinami. Płytka powinna wytrzymać wybrane warunki sonikacji, temperaturę próbki i etapy wirowania.
Jak sprawdzić, czy liza drożdży jest pełna?
Wydajność lizy można sprawdzić za pomocą mikroskopii, uzysku białek, aktywności enzymatycznej, zmniejszenia lepkości, analizy SDS-PAGE, uzysku DNA/RNA lub porównania ze znaną metodą lizy. Podczas opracowywania metody oceniaj zarówno uzysk, jak i jakość uwolnionej docelowej cząsteczki.
UIP400MTP czy UIP550MTP: który sonikator do mikropłytek wybrać?
UIP400MTP to sonikator do mikropłytek o dużej mocy, przeznaczony do rutynowego wysokoprzepustowego przygotowania próbek, w tym lizy drożdży, ekstrakcji białek, ścinania DNA, odrywania biofilmu i przygotowania do oznaczeń. Nadaje się do laboratoriów, które potrzebują powtarzalnej sonikacji w standardowych formatach płytek.
UIP550MTP zapewnia wyższą moc ultradźwiękową i jest zalecany, gdy bardziej wymagające zastosowania wymagają większej intensywności akustycznej, krótszych czasów przetwarzania, większych ilości materiału w próbkach lub bardziej intensywnych warunków rozbijania. W lizie drożdży UIP550MTP jest szczególnie przydatny do gęstej biomasy, szczepów trudnych do lizy, większych objętości roboczych i wysokoprzepustowych badań przesiewowych ekspresji.
Czy lizę drożdży przez sonikację mikropłytek można zautomatyzować?
Tak. Sonikacja w mikropłytkach dobrze nadaje się do zautomatyzowanych procedur laboratoryjnych, ponieważ próbki pozostają w formacie płytkowym. Ułatwia to integrację z systemami pipetowania, obsługą płytek, wirowaniem, przygotowaniem do oznaczeń i procedurami wysokoprzepustowych badań przesiewowych.
Literatura / źródła
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP550MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics 2024.
