초음파 처리와 SARS-CoV-2 코로나바이러스 비활성화에 대한 프로토콜
Hielscher VialTweeter는 코로나바이러스 SARS-COV-2를 비활성화하는 데 사용되는 독특한 초음파 다중 샘플 준비 장치입니다. VialTweeter는 최대 10개의 샘플 바이알을 동시에 준비할 수 있게 해주며 대량 시료 처리를 위한 이상적인 단위입니다.
VialTweeter와 SARS-CoV-2 코로나바이러스의 불활성화
고착을 제거한 후, 단층은 1mL MEM/5% FBS로 세포를 긁어내고 히엘셔 초음파 프로세서를 사용하여 1mL MEM/5% FBS로 세포를 긁어내고 초음파 처리(3× 10초, 100% 출력 및 진폭으로 10초 끄기)로 인산염 완충식식식염(PBS)으로 세 번 세척하였다. UP200St 위드 바이알트위터 첨부 파일. 수퍼나일체는 10분 동안 3000g의 원심분리로 10분 간 ×. 아래 의 Welch 외에 의해 SARS-CoV-2 코로나바이러스 비활성화에 대한 전체 프로토콜을 여기에서 읽어보십시오.
세포 및 바이러스
베로 E6 세포 (베로 C1008; ATCC CRL-1586은 10%(v/v) 태아 종아리 혈청(FCS)으로 보충된 수정된 이글의 최소 필수 매체(MEM)에서 배양되었다. 사용된 바이러스는 SARS-CoV-2 균주 hCOV-19/잉글랜드/2/2020, 29/01/2020에 영국에 있는 첫번째 참을성 있는 클러스터에서 PHE에 의해 격리되었습니다. 이 바이러스는 통로 1에서 얻어졌고 2 또는 3 통로에서 비활성화 연구에 사용되었습니다.
SARS-CoV-2 불활성화에 사용되는 시약 및 화학 물질뿐만 아니라 시약 세포 독성제거에 대한 과학적 보고서를 참조하십시오.(2020).
SARS-CoV-2 비활성화
상용 제품의 경우, 바이러스 제제(조직 배양액, 1× 10에 이르는 티터6 1 × 10까지8 PFU/ml)는 제조업체의 사용 지침, 사용 가능 시, 또는 시험 실험실에서 특별히 요청한 농도 및 시간에 대해 시약으로 삼중시약으로 처리하였다. 제조업체가 농도 범위를 부여한 경우, 시료에 대한 제품의 가장 낮은 비율(즉, 테스트 제품의 가장 낮은 권장 농도)을 테스트했습니다. 시편 수송관 시약은 시약에 대한 시료 액의 부피 비율이 제조사에 의해 지정되지 않는 한 10부분량의 조직 배양액을 10부량의 시약을 사용하여 시험하였다. 세제, 고정제 및 용매는 표시된 시간에 대한 표시된 농도에서 테스트되었습니다. 모든 비활성화 단계는 주변 실온(18 ~ 25°C)에서 수행되었습니다. 대체 샘플 유형의 테스트를 위해 바이러스는 1:9의 비율로 표시된 샘플 매트릭스로 스파이크된 다음 위와 같이 테스트 시약으로 처리되었습니다. 모든 실험에는 테스트 시약 대신 PBS의 동등한 부피를 가진 삼중 대조군 모의 처리 샘플을 포함하였다. 필요한 접촉 시간 직후, 처리된 샘플의 1mL은 적절히 선택된 여과 매트릭스를 사용하여 처리되었다. 불활성화 테스트를 위한 시약 제거는 피어스 4mL 세제 제거 스핀 컬럼(Thermo Fisher)을 사용하여 더 큰 스핀 컬럼 형식으로 수행되거나, SM2 바이오 비즈, 세바크릴 S-400HR 또는 세바덱스 LH-20을 사용하여 빈 피어스 10mL 용량 원심분리기 컬럼(Thermo Fisher)을 채우고 4mL 포장 비드/리하이드를 제공하였다. Amicon 필터를 사용하여 정화를 위해, 2 × 500μl 샘플은 이전에 설명된 방법에 의해 2개의 원심 필터를 사용하여 정제한 다음 함께 풀을 하였다. 글루타랄데히드 제거를 사용한 포름알데히드와 포름알데히드의 경우, 1개의 필터를 1× 500μl 샘플 부피와 함께 사용되었고, 500μl PBS에서 처리한 후 재중단되고 400ul MEM/5% FBS에 추가되었습니다. 감염의 불활성화를 위해 단층층, 12.5 cm2 베로 E6 셀의 플라스크 (2.5 × 106 2.5mL MEM/5% FBS의 세포/플라스크는 MOI 0.001에 감염되어 37°C/5% CO에서 배양되었습니다.2 24 시간 동안. 수퍼나탄트제거, 5mL의 포름알데히드, 또는 포름알데히드 및 글루타랄데히드를 15분 또는 60분 동안 실온에서 사용하여 고정된 세포. 고정을 제거하고, 단층은 1mL MEM / 5 % FBS로 세포를 긁어 전에 PBS와 세 번 세척하고 초음파 (3 × 10 초, 100 % 전력 및 진폭에서 10 초 오프) VialTweeter 첨부 (Hielscher 초음파 기술)와 UP200St를 사용하여. 수퍼나일체는 10분 동안 3000g의 원심분리로 10분 간 ×.
Hielscher VialTweeter의 사용을 포함한 전체 프로토콜은 여기에서 찾을 수 있습니다.
Welch, Stephen R.; Davies, Katherine A.; Buczkowski, Hubert; Hettiarachchi, Nipunadi; Green, Nicole; Arnold, Ulrike; Jones, Matthew; Hannah, Matthew J.; Evans, Reah; Burton, Christopher; Burton, Jane E.; Guiver, Malcolm; Cane, Patricia A.; Woodford, Neil; Bruce, Christine B.; Roberts, Allen D. G.; Killip, Marian J. (2020): Inactivation analysis of SARS-CoV-2 by specimen transport media, nucleic acid extraction reagents, detergents and fixatives. Journal of Clinical Microbiology. Accepted Manuscript Posted Online 24 August 2020.
정교한 초음파 디임브레이터 및 세포 파괴자
다중 시료 초음파 처리기 VialTweeter는 생물학, 생화학 및 임상 실험실에서 시료 준비를 위한 많은 초음파 솔루션 중 하나에 불과합니다. Hielscher 초음파는 세포 용해, 세포 추출, 조직 균질화, 용해성, 용해화, 용해, 용해, 용해, 샘플 탈기 등과 같은 응용 분야에 이상적인 초음파 분해제를 제공합니다.
직접 또는 간접 초음파 처리를 선호하는 경우 시간과 매일 처리해야 하는 샘플 수와 초음파 샘플 치료의 대상이 무엇인지 알려주십시오. 우리는 당신에게 당신의 일상 업무 루틴에 가장 적합한 초음파 장치를 추천합니다!
Hielscher 초음파 프로세서에는 스마트 소프트웨어, 자동 데이터 기록, 온도 제어, 초음파 처리 지속 시간, 사이클/펄스 모드뿐만 아니라 샘플 조명 및 브라우저 리모컨을 위한 쉬운 사전 설정 옵션이 장착되어 있습니다. 우리는 당신의 연구와 작업 루틴이 가능한 한 편리하고 성공적이 될 수 있도록 가능한 한 스마트 우리의 초음파 장치를 만들기 위해 노력하고 있습니다.
VialTweeter와 초음파 샘플 준비의 프로토콜을 포함하여 더 많은 응용 프로그램을 보려면 여기를 클릭하십시오!
연락주세요! / 저희에게 물어보세요!
문학 / 참고 문헌
- Welch, Stephen R.; Davies, Katherine A.; Buczkowski, Hubert; Hettiarachchi, Nipunadi; Green, Nicole; Arnold, Ulrike; Jones, Matthew; Hannah, Matthew J.; Evans, Reah; Burton, Christopher; Burton, Jane E.; Guiver, Malcolm; Cane, Patricia A.; Woodford, Neil; Bruce, Christine B.; Roberts, Allen D. G.; Killip, Marian J. (2020): Inactivation analysis of SARS-CoV-2 by specimen transport media, nucleic acid extraction reagents, detergents and fixatives. Journal of Clinical Microbiology 58(11), 2020.
- Natacha S. Ogando; Tim J. Dalebout; Jessika C. Zevenhoven-Dobbe; Ronald W. Limpens; Yvonne van der Meer; Leon Caly; Julian Druce; Jutte J. C. de Vries; Marjolein Kikkert; Montserrat Bárcena; Igor Sidorov; Eric J. Snijder (2020): SARS-coronavirus-2 replication in Vero E6 cells: replication kinetics, rapid adaptation and cytopathology. bioRxiv posted 20 April 2020.
알만한 가치가있는 사실
베로 세포는 무엇입니까?
베로 E6, 또한 베로 C1008로 알려진 (ATCC 번호. CRL-1586)은 베로 76으로부터 클론 세포주이며 SARS-CoV 및 SARS-CoV-2 코로나바이러스의 연구에 사용된다. 베로 세포는 세포 배양에 사용되는 세포의 계보입니다. '베로’ 혈통은 아프리카 녹색 원숭이 (클로로세버스 sp.)에서 추출 된 신장 상피 세포로부터 분리되었다.
Vero E6 세포는 일부 접촉 억제를 나타내므로 천천히 복제되는 바이러스를 전파하는 데 적합합니다. 베로 E6 세포주들은 일반적으로 코로나바이러스 SARS-CoV 및 SARS-CoV-2의 세포병리학을 조사하는 데 사용되며 베로 세포(아프리카 녹색 원숭이 신장 세포)는 안지오텐신 변환 효소 2(ACE2) 수용체의 풍부한 발현을 나타낸다. ACE2 수용체는 SARS-CoV-2 코로나바이러스를 위한 주요 도킹 사이트입니다.
예를 들어, Ogando 외. (2020) SARS-CoV-2 발견 – SARS-CoV에 비해 – 세포내 바이러스 RNA의 상부를 생성하였으나, 약 50배 덜 전염성 바이러스 자손은 배양 배지로부터 회수되었다. 더욱이, 그들은 코로나바이러스 복제의 3개의 확립된 억제제에 2개의 바이러스의 감도가 매우 유사하다는 것을 결정했습니다(Remdesivir, Alisporivir 및 클로로퀸)는 매우 유사하지만, SARS-CoV-2 감염은 페기드 인터페론 알파를 가진 세포의 전처리에 실질적으로 더 민감했다. 두 바이러스 의 중요한 차이점은 사실입니다 – 베로 E6 세포에서 패디징 시 – SARS-CoV-2는 분명히 스파이크 단백질 유전자에 있는 적응성 돌연변이를 취득하기 위하여 강한 선택 압력을 받고 있습니다. 이러한 돌연변이는 S1 및 S2 도메인을 연결하는 영역에서 '후린과 같은 분열 부위'를 변경하거나 삭제하고 플라크 애사에서 매우 눈에 띄는 현상 변화를 초래합니다.