Élesztősejtek lízise mikrolemezekben nagy intenzitású ultrahangos kezeléssel
A mikrobiológusok és élettudományi kutatók, akik Saccharomyces cerevisiae, Pichia pastoris / Komagataella phaffii és más élesztőrendszerek vizsgálatával foglalkoznak, ismerik a kihívást: az élesztősejtek ellenállóak, a reprodukálható lízis nehéz lehet, és a minták kézi feltárása gyorsan szűk keresztmetszetté válik, amikor sok törzset, klónt, tenyésztési körülményt vagy expressziós konstrukciót kell szűrni.
Nagy mintaáteresztő képességű élesztőlízis mikrobiológiai, molekuláris biológiai és fehérjeanalitikai alkalmazásokhoz
A Hielscher mikrolemez-kezelő ultrahangos készülékei, például a UIP400MTP (400 W) és a UIP550MTP (550 W), nagy mintaáteresztő képességű megoldást kínálnak az élesztősejtek mechanikai lízisére közvetlenül mikrolemezekben. A minták szondával történő, egyenkénti feldolgozása helyett teljes mikrolemezek kezelhetők ultrahanggal, egységes körülmények között. Ez gyorsabbá, reprodukálhatóbbá és a modern mikrobiológiai, fehérjeexpressziós, enzimszűrési és omikai munkafolyamatokba könnyebben integrálhatóvá teszi az ultrahangos élesztőlízist.
Akár rekombináns fehérjéket szeretne felszabadítani P. pastoris sejtekből, élesztőlizátumokat készítene enzimvizsgálatokhoz, S. cerevisiae sejteket tárna fel fehérjeanalízishez, vagy élesztőklónok tucatjait szűrné párhuzamosan, a Hielscher mikrolemez-kezelő ultrahangos készülékei erőteljes, kavitáción alapuló sejtfeltárást biztosítanak a folyamat pontos szabályozásával.
Reprodukálható lízisre van szüksége S. cerevisiae, P. pastoris vagy más élesztőtörzsek esetében, mikrolemezekben? Adja meg a lemezformátumot, a mintatérfogatot, a sejtsűrűséget és a célanalitot. Segítünk meghatározni a megfelelő ultrahangos kezelési paramétereket a UIP400MTP vagy UIP550MTP készüléket használó munkafolyamatához.
Hielscher ultrahangos készülék többlyukú lemezekhez, élesztőlízis céljára – minta-előkészítés nagy mintaáteresztő képességgel
Miért igényelnek az élesztősejtek hatékony mechanikai lízist?
Az élesztősejtek lízise nehezebb, mint sok baktérium- vagy emlőssejté, mert merev sejtfal védi őket, amely főként poliszacharidokból, glükánokból, mannoproteinekből és kitinből áll. Ez a sejtfal mechanikai stabilitást biztosít, ugyanakkor korlátozza az intracelluláris fehérjék, nukleinsavak, metabolitok és enzimek felszabadulását.
A hagyományos élesztőlízis-módszerek közé tartozik a gyöngyös mechanikai feltárás, az enzimes emésztés, a fagyasztási–felolvasztási ciklusok, a kémiai lízis és a szondás ultrahangos kezelés. Ezek a módszerek hatékonyak lehetnek, de korlátaik is vannak. A gyöngyös mechanikai feltárás törmeléket juttathat a mintába és felmelegedést okozhat, az enzimes emésztés növelheti a költségeket és a változékonyságot, az egyedi minták szondás ultrahangos kezelése pedig időigényes, amikor nagyszámú mintát kell feldolgozni.
A nagy intenzitású, fókuszált ultrahangos kavitáció úgy küszöböli ki ezeket a korlátokat, hogy intenzív mechanikai nyíróerőket, nyomásingadozásokat és mikroáramlásokat fejt ki az élesztőszuszpenzióban. Ennek eredménye a sejtfalak és membránok gyors felszakítása, az intracelluláris összetevők jobb felszabadulása és a lemezformátumban végzett, nagyfokú reprodukálhatóságot biztosító minta-előkészítés.
Mikrolemezek ultrahangos kezelése élesztőminták párhuzamos előkészítéséhez
A Hielscher UIP400MTP és UIP550MTP készülékeket mikrolemezek, többlyukú lemezek, PCR-lemezek és megfelelő mintatartó állványok egyenletes ultrahangos kezelésére tervezték. A szondás ultrahangos kezeléssel ellentétben a mintákat nem kell egyenként kezelni. A teljes lemezt szabályozott ultrahangos energia éri, így a munkafolyamat különösen alkalmas a minták párhuzamos feldolgozására.
Ez különösen hasznos a következőkhöz:
- A S. cerevisiae mutánsainak vagy expressziós törzseinek szűrése
- A P. pastoris / K. phaffii klónjainak lízise rekombináns fehérjeexpresszió után
- Élesztőlizátumok előkészítése enzimvizsgálatokhoz
- Fehérjekivonás SDS-PAGE, Western blot, ELISA, LC-MS/MS vagy aktivitásvizsgálatokhoz
- Intracelluláris metabolitok felszabadítása metabolomikai vizsgálatokhoz
- DNS- és RNS-minták előkészítése megfelelő utólagos tisztítás után
- Lízispufferek, adalékanyagok és extrakciós körülmények optimalizálása nagy mintaáteresztő képességgel
Hogyan tárja fel az ultrahangos kavitáció az élesztősejteket?
Az ultrahangos kezelés során a fókuszált, nagy teljesítményű ultrahang váltakozó összenyomódási és ritkulási ciklusokat hoz létre a folyékony mintában. Megfelelő intenzitás esetén ezek a nyomásingadozások akusztikus kavitációt idéznek elő. Kavitációs buborékok keletkeznek, rezegnek és összeomlanak, helyi nyíróerőket, mikrosugarakat, turbulenciát és erős nyomásgradienseket létrehozva.
Az élesztőszuszpenziókban ezek a mechanikai hatások gyengítik és felszakítják a sejtfalat és a sejtmembránt. Az intracelluláris fehérjék, enzimek, nukleinsavak és metabolitok a lízispufferbe szabadulnak fel. Mivel a folyamat mechanikai jellegű, számos különböző pufferrendszerrel alkalmazható, és kombinálható proteázgátlókkal, redukálószerekkel, detergensekkel, sókkal vagy enyhe enzimes előkezeléssel.
Általános protokoll: élesztősejtek lízise mikrolemezekben
Az alábbi protokoll gyakorlati kiindulópontot ad az élesztőlízishez a Hielscher UIP400MTP vagy UIP550MTP mikrolemez-kezelő ultrahangos készülék használatával. A paramétereket az élesztőtörzs, a sejtsűrűség, a célmolekula, a pufferösszetétel, a lemeztípus és az ezt követő vizsgálat szerint kell optimalizálni.
1. Gyűjtse be és mossa meg az élesztősejteket
Tenyésszen Saccharomyces, Pichia, Hansenula, Debaryomyces vagy más élesztőtörzset a kívánt tenyésztési körülmények között. Gyűjtse be a sejteket centrifugálással, és távolítsa el a tápközeget. Mossa meg a sejtüledéket hideg desztillált vízzel, PBS-sel vagy a kiválasztott lízispufferrel, hogy eltávolítsa a tápközeg maradványait, amelyek zavarhatják a későbbi elemzést.
Fehérjekivonás esetén tartsa hidegen a mintákat, és dolgozzon gyorsan. Ha a proteázok problémát jelenthetnek, hűtsön elő minden puffert és fogyóeszközt.
2. Szuszpendálja újra a sejtüledéket
Szuszpendálja újra az élesztősejt-üledéket megfelelő hideg lízispufferben. A hatékony fehérjefelszabadításhoz gyakran előnyös a nagy sejtsűrűség. Kiindulásként használjon megközelítőleg 10–20% w/v nedves sejtüledéket vagy OD600 > 10 értéknek megfelelő sűrű szuszpenziót, a vizsgálattól függően.
Egy tipikus, élesztőből történő fehérjekivonáshoz használt lízispuffer a következőket tartalmazhatja:
- pufferrendszer, például Tris-HCl, foszfátpuffer vagy HEPES
- só, például NaCl vagy KCl
- proteázgátló-koktél
- opcionálisan redukálószer, például DTT vagy β-merkaptoetanol
- opcionálisan detergens, például Triton X-100, NP-40, SDS vagy CHAPS, a későbbi feldolgozással való kompatibilitástól függően
- opcionálisan foszfatázgátlók foszforilációs vizsgálatokhoz
Nehezen feltárható élesztőtörzsek vagy nagyon kíméletes fehérjekivonás esetén az ultrahangos kezelés előtt rövid előkezelés alkalmazható Zymolyase, Lyticase vagy más sejtfalemésztő enzimmel. Ez az enzimes előkezelés opcionális, de javíthatja a lízis hatékonyságát vagy csökkentheti a szükséges ultrahang-intenzitást.
3. Vigye át a mintákat megfelelő mikrolemezbe
Adagolja az élesztőszuszpenziót ultrahangos kezelésre alkalmas mikrolemezbe. A kerek aljú lemezeket gyakran előnyben részesítik, mert javítják a minták összegyűjtését és csökkentik a holttereket. A reprodukálhatóság javítása érdekében minden lyukban azonos mintatérfogatot használjon.
Zárja le a lemezt megfelelő zárólappal vagy fóliával a párolgás, az aeroszolképződés és a keresztszennyeződés megelőzésére. Győződjön meg arról, hogy a lezárás kompatibilis a kiválasztott hőmérséklettel és ultrahangos kezelési körülményekkel.
A jellemző munkatérfogatok a lemezformátumtól és az alkalmazástól függenek. Gyakori formátumok a 96 lyukú lemezek, a mélylyukú lemezek, a PCR-lemezek és a megfelelő csőtartó állványok.
4. Állítsa be a hűtést
Az élesztőlízis nagy ultrahang-intenzitást igényel, és a mechanikai feltárás hőt termel. Ezért a hőmérséklet szabályozása kritikus fontosságú, különösen fehérje-, enzim-, RNS- vagy foszforilációs elemzések esetén.
Alkalmazzon megfelelő hűtési stratégiát, például:
- előhűtött lízispuffer
- előhűtött mikrolemezek
- hűtési szünetek az ultrahangos kezelési szakaszok között
- az ultrahangos kezelési platform külső hűtése, ahol alkalmazható
A cél az, hogy a minta kellően hideg maradjon a fehérjedenaturáció, az enziminaktiváció, az RNS-lebomlás és a hő által okozott mintaváltozékonyság megelőzéséhez.
5. Kezelje ultrahanggal az élesztőszuszpenziót
Helyezze a lezárt lemezt a Hielscher UIP400MTP vagy UIP550MTP mikrolemez-kezelő ultrahangos készülékbe, és válasszon impulzusos ultrahangos kezelési programot. Az impulzusos működés ajánlott, mert lehetővé teszi a mechanikai feltárást az ON fázisokban és a hőleadást az OFF fázisokban.
Kiindulópontként az élesztősejtek líziséhez:
| Paraméter | Ajánlott kiindulási tartomány | Cél |
|---|---|---|
| Amplitúdó | 60–100% | Nagy kavitációs intenzitás az ellenálló élesztősejtekhez |
| Impulzusos üzemmód | 10–30 sec ON / 30–60 sec OFF | Hatékony lízis szabályozott hőfelhalmozódással |
| Összesített ON-idő | 5–15 min | Állítsa be a törzs, a sűrűség és a célmolekula szerint |
| Hőmérséklet | Tartsa hidegen a mintákat | Védje a fehérjéket, enzimeket, RNS-t és metabolitokat |
| A lemez lezárása | Ajánlott | Megelőzi a párolgást, az aeroszolképződést és a keresztszennyeződést |
Különösen ellenálló élesztőszuszpenziók, sűrű P. pastoris biomassza vagy nehéz rekombinánsfehérje-kivonás esetén fokozatosan növelje az összesített ON-időt. Hőérzékeny fehérjék vagy enzimvizsgálatok esetén használjon rövidebb impulzusokat, hosszabb hűtési szüneteket és alacsonyabb kiindulási amplitúdót.
Nagy mintaáteresztő képességű élesztőlízis többlyukú lemezekben a UIP400MTP készülékkel
6. Derítse a lizátumot
Az ultrahangos kezelés után centrifugálja a mikrolemezt, vagy vigye át a mintákat csövekbe centrifugáláshoz. Távolítsa el a sejttörmeléket megfelelő sebességen és hőmérsékleten végzett centrifugálással. Gyűjtse össze a felülúszót a későbbi elemzéshez.
Az alkalmazástól függően a lizátum a következőkre használható:
- fehérjék mennyiségi meghatározása
- enzimaktivitás-vizsgálatok
- SDS-PAGE és Western blot
- ELISA és immunvizsgálatok
- LC-MS/MS proteomika
- metabolitelemzés
- DNS- vagy RNS-tisztítás
7. Optimalizálja és dokumentálja a módszert
A reprodukálható élesztőlízis érdekében dokumentáljon minden releváns paramétert, beleértve a törzset, a tenyésztési körülményeket, az OD600-értéket, a nedves sejttömeget, a pufferösszetételt, a lemeztípust, a mintatérfogatot, az amplitúdót, az impulzusciklust, az összesített ON-időt, a hűtési módszert és a minta végső hőmérsékletét.
Ha a Hielscher ultrahangos készülék automatikus adatrögzítéssel rendelkezik, a folyamatadatok felhasználhatók dokumentálásra, módszerfejlesztésre, méretnövelésre és minőség-ellenőrzésre.
Optimalizálási tippek az élesztőlízishez
A maximális fehérjefelszabadításhoz használjon sűrű élesztőszuszpenziókat, nagy ultrahang-intenzitást és elegendő összesített ON-időt. Érzékeny fehérjék esetén csökkentse az amplitúdót, hosszabbítsa meg a hűtési szüneteket, és a kezelés teljes időtartama alatt tartsa hidegen a lemezt.
Ha a lízis nem teljes, fokozatosan növelje az ultrahangos kezelés idejét, próbáljon ki enzimes előkezelést, csökkentse a minta viszkozitását, vagy optimalizálja a puffert. Ha a fehérjék lebomlanak vagy elveszítik aktivitásukat, javítsa a hűtést, rövidítse le az ON szakaszokat, adjon hozzá gátlószereket, és ellenőrizze, hogy a detergensrendszer kompatibilis-e a célfehérjével.
Mivel az élesztőtörzsek sejtfalszerkezete, növekedési fázisa, expressziós rendszere és biomasszasűrűsége jelentősen eltér, egy rövid optimalizálási mátrix alkalmazása ajánlott. Például teszteljen három amplitúdót, két impulzusciklust és két összesített ON-időt, majd értékelje a lízis hatékonyságát és a fehérjék épségét.
Akár néhány vizsgálati lemezt dolgoz fel, akár nagy mintaáteresztő képességű élesztőszűrést végez, a Hielscher segíthet kiválasztani a megfelelő mikrolemez-kezelő ultrahangos készüléket és kidolgozni egy megbízható lízisprotokollt. Vegye fel velünk a kapcsolatot, és adja meg az élesztőtörzsét, a munkafolyamatát és a mintaáteresztő képességgel kapcsolatos igényeit!
A Hielscher mikrolemez-kezelő ultrahangos készülékeinek előnyei az élesztőlízisben
A Hielscher mikrolemez-kezelő ultrahangos készülékei ideálisak olyan laboratóriumok számára, amelyeknek sok mintán reprodukálható lízisre van szükségük. Kiküszöbölik a szondás ultrahangos kezelés lassú, mintánkénti kezelését, és csökkentik a szonda kézi pozicionálásából, a bemerülési mélységből és az egyes minták kezelése közötti eltérésekből eredő változékonyságot.
A legfontosabb előnyök:
- Nagy mintaáteresztő képességű feldolgozás: Kezeljen ultrahanggal sok élesztőmintát párhuzamosan, mikrolemezekben vagy kompatibilis mintatartó állványokban.
- Reprodukálható körülmények: Azonos ultrahangos kezelési körülmények minden lyukban az egyenletes, összehasonlítható líziseredményekért.
- Nincs szonda által okozott keresztszennyeződés: A minták az ultrahangos kezelés alatt lezárva maradnak, csökkentve a minták közötti anyagátvitelt és a tisztítási lépéseket.
- Ellenálló sejtekhez is alkalmas: A nagy intenzitású ultrahang elősegíti az élesztősejtek sejtfalának felszakítását.
- Hatékony munkafolyamat: Ideális törzsek, klónok, expressziós körülmények és lízispufferek szűréséhez.
- Hatékony munkafolyamat: Programozható beállítások, automatizált adatnaplózás és alkalmasság a laboratóriumi automatizálásra.
Alkalmazások az élesztő-biotechnológiában és az élettudományi kutatásban
A mikrolemezekben végzett ultrahangos élesztőlízis számos kutatási és szűrési munkafolyamatot támogat. Rekombináns fehérjeexpresszió esetén a P. pastoris és S. cerevisiae klónok párhuzamosan lizálhatók az expressziós szintek vagy az enzimaktivitás összehasonlításához. A rendszerbiológiában és az omikai vizsgálatokban a standardizált lízis javítja a különböző körülmények közötti összehasonlíthatóságot. A mikrobiológiában az ultrahangos kezelés elősegíti a lizátumok gyors előkészítését több törzsből, különböző tápközeg-körülményekből vagy stresszkezelésekből.
A jellemző alkalmazási területek:
- fehérjekivonás élesztőből
- rekombináns fehérjék szűrése
- enzimaktivitás-szűrés
- klónszelekció transzformáció után
- fermentációoptimalizálás
- proteomikai minta-előkészítés
- metabolomikai minta-előkészítés
- sejtfalfeltárási vizsgálatok
- nagy mintaáteresztő képességű mikrobiológiai vizsgálatok
A megbízható élesztőlízis szabályozott ultrahangos kezeléssel kezdődik
Az élesztőlízis nehézzé válhat a mintaszám növekedésével, de a Hielscher mikrolemez-kezelő ultrahangos készülékei gyorsabbá, tisztábbá és reprodukálhatóbbá teszik a folyamatot. A UIP400MTP és UIP550MTP lehetővé teszi a kutatók számára teljes lemezek feldolgozását meghatározott ultrahangos körülmények között, javítva a mintaáteresztő képességet, miközben csökkenti a kézi kezelést.
A mikrobiológusok, molekuláris biológusok, fehérjekutatók és biotechnológiai laboratóriumok számára a mikrolemezek ultrahangos kezelése hatékony eszköz az élesztő intracelluláris összetevőinek hatékony és reprodukálható felszabadítására.
Gyakran ismételt kérdések az élesztősejtek mikrolemezekben végzett ultrahangos líziséről
Lizálhatók az élesztősejtek ultrahangos kezeléssel?
Igen. Az élesztősejtek, például a Saccharomyces cerevisiae és a Pichia pastoris, nagy intenzitású ultrahangos kezeléssel lizálhatók. Az ultrahangos kavitáció erős mechanikai nyíróerőket hoz létre, amelyek felszakítják az élesztősejtek sejtfalát és membránját, felszabadítva a fehérjéket, enzimeket, nukleinsavakat és metabolitokat.
Miért nehezebb az élesztősejtek lízise, mint a baktériumsejteké?
Az élesztősejtek vastag és mechanikailag ellenálló sejtfala főként glükánokból, mannoproteinekből és kitinből áll. Ez a merev szerkezet nehezebbé teszi az élesztősejtek feltárását, mint sok baktérium- vagy emlőssejtét. Ezért az élesztőlízis általában nagyobb intenzitást, hosszabb feldolgozást vagy opcionális enzimes előkezelést igényel.
Mely Hielscher ultrahangos készülékek alkalmasak mikrolemezekben végzett élesztőlízisre?
A Hielscher UIP400MTP és UIP550MTP alkalmas nagy mintaáteresztő képességű élesztőlízisre mikrolemezekben. A UIP400MTP ideális a rutinszerű párhuzamos minta-előkészítéshez, míg a UIP550MTP nagyobb ultrahangteljesítményt biztosít az igényes lízisfeladatokhoz, sűrű szuszpenziókhoz és ellenálló élesztőtörzsekhez.
Lizálható a Pichia pastoris mikrolemez-kezelő ultrahangos készülékben?
Igen. A Pichia pastoris, más néven Komagataella phaffii, mikrolemezekben végzett nagy intenzitású ultrahangos kezeléssel lizálható. Mivel a P. pastoris sűrű biomasszát képezhet és ellenálló sejtfallal rendelkezik, ajánlott az amplitúdó, az impulzusciklus, a hűtés és a teljes ultrahangos kezelési idő optimalizálása.
Melyek az élesztőlízis jellemző ultrahangos kezelési paraméterei?
Hasznos kiindulási tartomány az 50–80% amplitúdó, az impulzusos működés, például 10–30 másodperc ON és 30–60 másodperc OFF, valamint az 5–15 perc összesített ON-idő. A pontos paraméterek az élesztőtörzstől, a sejtsűrűségtől, a mintatérfogattól, a lemeztípustól, a puffertől és a célmolekulától függenek.
Miért kell az élesztőlízist impulzusos üzemmódban végezni?
Az impulzusos üzemmód csökkenti a hőfelhalmozódást az ultrahangos kezelés során. Az ON fázisban az ultrahangos kavitáció feltárja a sejteket. Az OFF fázisban a minta lehűlhet. Ez azért fontos, mert a túlzott hő denaturálhatja a fehérjéket, csökkentheti az enzimaktivitást, lebonthatja az RNS-t és ronthatja a reprodukálhatóságot.
Szükséges enzimes előkezelés az élesztősejtek ultrahangos kezelése előtt?
Az enzimes előkezelés nem mindig szükséges, de javíthatja a lízis hatékonyságát. Az olyan enzimek, mint a Zymolyase vagy a Lyticase, részlegesen megemésztik az élesztősejtek sejtfalát, és csökkenthetik a teljes lízishez szükséges ultrahang-intenzitást vagy időt. Ez hasznos lehet érzékeny fehérjék vagy nehezen feltárható törzsek esetén.
Hogyan előzhető meg a túlmelegedés az élesztő ultrahangos kezelése során?
Használjon előhűtött puffereket, impulzusos üzemmódot, hűtési szüneteket és hűtött lemezelrendezést. Tartsa lezárva a mikrolemezt, és ahol lehetséges, figyelje a hőmérsékletet. Érzékeny fehérjék esetén alkalmazzon rövidebb ON szakaszokat, hosszabb OFF szakaszokat, és hideg körülmények között dolgozza fel a mintákat.
Kiválthatja a mikrolemezek ultrahangos kezelése a gyöngyös mechanikai feltárást az élesztőlízisben?
Sok munkafolyamatban igen. A mikrolemezek ultrahangos kezelése kiválthatja a gyöngyös mechanikai feltárást, ha tiszta, reprodukálható és párhuzamos lízisre van szükség. Elkerülhető vele a gyöngyök kezelése, egyszerűsíti a fogyóeszközök használatát és az automatizálást. Azonban minden alkalmazást validálni kell a lízishozam, a fehérjék épsége és a vizsgálati teljesítmény összehasonlításával.
Alkalmas a mikrolemezek ultrahangos kezelése fehérjék élesztőből történő kivonására?
Igen. A mikrolemezek ultrahangos kezelése jól alkalmazható fehérjék élesztőből történő kivonására, különösen akkor, amikor sok klónt vagy tenyésztési körülményt kell összehasonlítani. A proteázgátlók, a hideg pufferek és a szabályozott impulzusbeállítások segítenek megőrizni a fehérjék minőségét.
Használható ugyanaz a módszer DNS-, RNS- és fehérjekivonásra?
Ugyanaz az alapvető ultrahangos kezelési elv alkalmazható, de a puffert és a folyamatkörülményeket a célmolekulához kell igazítani. A fehérjékkel végzett munkafolyamatok proteázgátlást és hőmérséklet-szabályozást igényelnek. Az RNS-sel végzett munkafolyamatok RNáz-mentes kezelést és erőteljes hűtést igényelnek. A DNS-sel végzett munkafolyamatok eltérő lízis- és tisztítási körülményeket igényelhetnek attól függően, hogy ép genomi DNS vagy fragmentált DNS a kívánt termék.
Milyen lemeztípust kell használni az élesztőlízishez?
Használjon ultrahangos kezelésre alkalmas mikrolemezt vagy mélylyukú lemezt megfelelő lezárással. A kerek aljú lemezek gyakran hasznosak a szuszpenziók kezeléséhez. A lemeznek ellen kell állnia a kiválasztott ultrahangos kezelési körülményeknek, a minta hőmérsékletének és a centrifugálási lépéseknek.
Honnan tudhatom, hogy az élesztőlízis teljes?
A lízis hatékonysága ellenőrizhető mikroszkópiával, fehérjehozammal, enzimaktivitással, a viszkozitás csökkenésével, SDS-PAGE elemzéssel, DNS-/RNS-hozammal vagy egy ismert lízismódszerrel való összehasonlítással. Módszerfejlesztés során értékelje a felszabadított célmolekula hozamát és minőségét egyaránt.
UIP400MTP vagy UIP550MTP: melyik mikrolemez-kezelő ultrahangos készüléket válassza?
A UIP400MTP nagy teljesítményű mikrolemez-kezelő ultrahangos készülék rutinszerű, nagy mintaáteresztő képességű minta-előkészítéshez, beleértve az élesztőlízist, a fehérjekivonást, a DNS nyírását, a biofilmek leválasztását és a vizsgálatok előkészítését. Alkalmas olyan laboratóriumok számára, amelyeknek standard lemezformátumokban reprodukálható ultrahangos kezelésre van szükségük.
A UIP550MTP nagyobb ultrahangteljesítményt biztosít, és akkor ajánlott, amikor az igényesebb alkalmazások erősebb akusztikus intenzitást, rövidebb feldolgozási időket, nagyobb mintaterhelést vagy erőteljesebb feltárási körülményeket igényelnek. Élesztőlízis esetén a UIP550MTP különösen hasznos sűrű biomasszához, nehezen feltárható törzsekhez, nagyobb munkatérfogatokhoz és nagy mintaáteresztő képességű expressziós szűréshez.
Automatizálható a mikrolemezekben végzett ultrahangos élesztőlízis?
Igen. A mikrolemez-alapú ultrahangos kezelés jól alkalmazható automatizált laboratóriumi munkafolyamatokban, mert a minták lemezformátumban maradnak. Ez támogatja a pipettázórendszerekkel, a lemezkezeléssel, a centrifugálással, a vizsgálat-előkészítéssel és a nagy mintaáteresztő képességű szűrési munkafolyamatokkal való integrációt.
Szakirodalom / Hivatkozások
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP550MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics 2024.
