પાશ્ચાત્ય બ્લોટિંગ માટે અલ્ટ્રાસોનિક લિસેસ
- પશ્ચિમ બ્લોટ પેશી homogenate અથવા સેલ અર્ક એક નમૂનો ચોક્કસ પ્રોટીન શોધ માટે વિશ્લેષણાત્મક પ્રક્રિયા છે.
- પશ્ચિમી બ્લોટ ચલાવવા માટે અથવા એન્ઝાઇમ પ્રવૃત્તિ માપવા, ઘણા એસે સામગ્રી (દા.ત. પ્રોટીન, ડીએનએ, subcellular ટુકડાઓ) કોષમાં entrapped વપરાશ જરૂરી છે.
- Sonication નિયંત્રિત સેલ ભંગાણ અને lysis માટે વિશ્વસનીય અને સરળ-થી-હેન્ડલ પદ્ધતિ છે.
અલ્ટ્રાસોનિક સેલ વિક્ષેપ
પેશીઓ અને સંસ્કારી કોશિકાઓમાંથી પ્રોટીન નિષ્કર્ષણ ઘણા જૈવિક બાયોકેમિકલ અને વિશ્લેષણાત્મક તકનીકો (પાનું, પશ્ચિમી શાહીચૂસ એલિસા, સામૂહિક spectrometry, વગેરે) અથવા પ્રોટીન શુદ્ધિકરણ માટે પ્રથમ પગલું છે. એક ઉચ્ચ પ્રોટીન ઉપજ મેળવવા માટે, સેલ સામગ્રી અને પેશીને અસરકારક ખોરવાયો હોવું જ જોઈએ / lysed. છોડ કોષ અથવા પ્રાણીઓની પેશીઓમાં હોય, sonication તમારા સેલ lysate સરળ અને ઝડપી તૈયાર કરવા માટે પદ્ધતિ છે.
Sonication લાભો
- ફાસ્ટ & કાર્યક્ષમ
- સરળ કામગીરી
- ઉચ્ચ પ્રોટીન ઉપજ
- પ્રજનન / પુનરાવર્તિત
- ચોક્કસપણે નિયંત્રિત
- સ્કેલેબલ
Immunoprecipitation પ્રોટોકૉલ પશ્ચિમી Immunoblotting માટે
એ reagents
ઉકેલો તૈયાર કરવા માટે, જેમ કે મિલી-ક્યૂ શુદ્ધ પાણી વાપરો.
- 1x ફોસ્ફેટ બફર સેલાઇન (PBS)
- 1x સેલ lysis બફર: 20 મીમી Tris (પીએચ 7.5), 150 એમએમ NaCl, 1 મિમી EDTA, 1 મિમી EGTA 1% ટ્રાઇટોન એક્સ 100, 2.5 mM સોડિયમ pyrophosphate, 1 મિમી β-glycerophosphate, 1 મિમી Na3VO4 1 યુજી / મિલી Leupeptin
મહત્વપૂર્ણ: ઉમેરો 1 મિમી PMSF તરત ઉપયોગ કરતા પહેલા. - 15 એમએલ પ્રોટીન A + 15 એમએલ પ્રોટીન જી IP માટે પૂરતી છે, પરંતુ તે તમારા પ્રાથમિક એન્ટીબોડી અને નમૂના વોલ્યુમ પર આધાર રાખે છે શકે છે. તમે પણ પહેલેથી મિશ્ર પ્રોટીન એ / જી agarose ઉપયોગ કરી શકો છો (દા.ત. પ્રોટીન એક સસલું માટે આઇજીજી નીચે ખેંચી અને માઉસ આઇજીજી માટે પ્રોટીન જી નીચે પુલ)
- 3X એસડીએસ નમૂના બફર: 187,5 mM Tris-HCl (25 ° C પર પીએચ 6.8), 6% W / વી એસડીએસ, 30% glycerol, 150 એમએમ DTT, ડબલ્યુ 0.03% / વી bromophenol વાદળી
સેલ Lysates ના બી તૈયારી
- કોષો લણણી. nondenaturing શરતો હેઠળ કોષો લણણી કરવા માટે, મીડિયા દૂર કરો અને બરફ ઠંડા પીબીએસ સાથે એક વખત કોષો કોગળા.
- પીબીએસ દૂર કરો અને દરેક પ્લેટ (10 સે.મી.) 0.5 મિલી બરફ ઠંડા 1x સેલ lysis બફર ઉમેરો અને 5 મિનિટ માટે બરફ પર પ્લેટો સેવન.
- પ્લેટો કોષો ઉઝરડા અને microcentrifuge ટ્યુબ પરિવહન કરે છે. બરફ પર રાખો.
- Sonicate બે વાર બરફ ઠંડા immunoprecipitation બફર 10 સેકન્ડ માટે (IP બફર: 50 એમએમ Tris-HCl [7.4 પીએચ], 150 એમએમ NaCl, 5 એમએમ EDTA 0.1% એનપી 40 અને બાધક મિશ્રણ). sonication માટે, વીયલટેવેટર અથવા ચકાસણી ultrasonicator જેમ UP100H અથવા Uf200 ः ટી સૌથી યોગ્ય છે.
- 4 ° C તાપમાને 10 મિનિટ માટે 15,000 ગ્રામ પર lysates સેન્ટ્રિફ્યુજ.
- નવી ટ્યુબ supernatant સ્થાનાંતરિત કરો. (જરૂરી હોય તો, lysate -80 ° C પર સંગ્રહિત કરી શકાય છે.)
- supernatant પ્રાથમિક એન્ટીબોડી ઉમેરો. પ્રાથમિક એન્ટીબોડી સાથે supernatant પ્રકાશ ચળવળ હેઠળ 4 ° C તાપમાને 1 એચ માટે સેવવામાંઆવે છે. પ્રાથમિક એન્ટીબોડી સામાન્ય રીતે એક રકમ 10x કરતાં પશ્ચિમ શાહીચૂસ માટે વપરાય છે વધારે એકાગ્રતાવાળી માં ઉમેરવામાં આવે છે. (તમે 100μL દીઠ 1μg સાથે શરૂ કરી શકો છો.)
- supernatant પછી પ્રોટીન એ agarose (Invitrogen) અને અન્ય 1 એચ માટે પ્રોટીન જી agarose સમાન માત્રામાં મિશ્રણ સાથે વધુ સેવવામાંઆવે છે.
- agarose ગોળો આઇપી બફર સાથે ત્રણ વખત ધોવા. પછીથી, 5 મિનિટ માટે 95 ° C તાપમાને ગરમી આપીને એસડીએસ-પૃષ્ઠ લોડ બફર સાથે બંધાયેલા પ્રોટીન કાઢવા.
સી Immunoprecipitation
- 200 એમએલ સેલ lysate લો અને પ્રાથમિક એન્ટીબોડી ઉમેરો. સૌમ્ય 4 ° C તાપમાને રાતોરાત રોકિંગ સાથે સેવન.
- ક્યાં પ્રોટીન એક અથવા G agarose માળા (50% મણકો સ્લરી 20 એમએલ) ઉમેરો. સૌમ્ય 4 ° C તાપમાને 1-3 કલાક માટે રોકિંગ સાથે સેવન.
- 4 ° C તાપમાને 30 સેકન્ડ માટે Microcentrifuge. વૉશ 1x સેલ lysis બફર 500 એમએલ સાથે પાંચ વખત પેલેટ. washes દરમિયાન બરફ પર રાખો.
- 20 એમએલ 3X એસડીએસ નમૂના બફર સાથે પેલેટ Resuspend. વોર્ટેક્સ, પછી 30 સેકન્ડ માટે microcentrifuge.
- ખાતે 14,000 એક્સ ગ્રામ 1 મિનિટ માટે 2-5 મિનિટ માટે 95-100 ° સે અને microcentrifuge નમૂનાની ગરમી.
- SDS પાનાની જેલ (12-15%) પર નમૂનો (15-30 એમએલ) લોડ કરો.
- પશ્ચિમી શાહીચૂસ દ્વારા નમૂના પૃથ્થકરણ.
ultrasonicator UP50H સાથે પશ્ચિમી બ્લોટ વિશ્લેષણ
નીચેના પ્રોટોકોલ Kriebisch એટ અલ અભ્યાસ કરવામાં આવ્યો હતો. (2011):
કુલ પ્રોટીન 1,25 સાથે સારવાર MC3T3-E1 કોષો અલગ કરવામાં આવી હતી (OH)2ડી3 (10-8 એમ) અથવા વાહન. કોષ એક બફર 50 એમએમ Tris HCl, પીએચ 8 (સિગ્મા-Aldrich) ધરાવતી સાથે lysed હતા; 150 એમએમ NaCl (ફિશર વૈજ્ઞાનિક); 0.1% સોડિયમ dodecyl સલ્ફેટ (એસડીએસ) (ફિશર વૈજ્ઞાનિક); 1% IGEPAL સીએ-630 (સિગ્મા-Aldrich) અને 0.5% સોડિયમ deoxycholate (મર્ક). સેલ lysate ચક્ર 1 2 × 10 s માટે sonicated અને 80 કંપવિસ્તારના આવી હતી UP50H અલ્ટ્રાસોનિક પ્રોસેસર (હાઈલેસ્ચર, અલ્ટ્રાસાઉન્ડ ટેકનોલોજી, ટેલ્ટો, જર્મની). ત્યારબાદ સામગ્રીને 10 મિનિટથી 14,000 આરપીએમ માટે કેન્દ્રિત કરવામાં આવી હતી અને પશ્ચિમ બ્લોટિંગ માટે સુપરનોટંટનો ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો હતો. નમૂના બફરમાં પચ્ચીસ μg પ્રોટીન ઉકાળીને અને ઘટતા એજન્ટ (ઇન્વિટેરજન) અને ત્યારબાદ 4-12% પોલીક્રીલામાઇડ ગેલ્સ (ઇન્વિટ્રૉજન) નો ઉપયોગ કરીને એસડીએસ-PAGE દ્વારા અલગ પાડવામાં આવે છે અને નેટ્રોસેએલ્લોઝ મેમ્બ્રેન (જીઇ હેલ્થ કેર) માં તબદીલ કરવામાં આવે છે. ટીબીએસ (10 એમએમ ટ્રિસ-એચસીએલ; પીએચ 7.6; 150 એમએમ નાઇકલ) માં 1% કેસિન (સીગ્મા-એલ્ડ્રિચ) અને 1% ટ્રીસ (1 એમ) સમાવિષ્ટ 1 એચ માટે પટ્ટા અવરોધિત કરવામાં આવ્યો હતો. અવરોધિત કર્યા પછી, કલાપ્રેમી એન્ટીબોડી (સસલા વિરોધી માનવ સીબીએસ 1/500, પ્રો. આર. બેનરજી, એન આર્બર, એમઆઇ, યુએસએના પ્રયોગશાળામાં વિકસિત) સાથે 4 થી ° સે પર થોડો આંદોલન સાથે રાતોરાત હતા. હોર્બરડિશ પેરોક્સિડાઝ (એચપીઆર) સાથેના સેક્સ્યુગેશન- કોનજ્યુગેટેડ ગૌણ એન્ટિબોડી (ડાકો) ઓરડાના તાપમાને 1 કલાક માટે કરવામાં આવ્યો હતો. બધા blots ઉન્નત chemiluminescence (Perkin Elmer) દ્વારા વિકસાવવામાં આવ્યા હતા.
પશ્ચિમી શાહીચૂસ વિશે
Blots વિશ્લેષણાત્મક પ્રક્રિયાઓ જ્યાં ડીએનએ આરએનએ અને પ્રોટીન એક વાહક પર સ્થાનાંતરિત થાય છે, જેથી તેઓ અલગ કરી શકે છે.
દક્ષિણ બ્લોટ ડીએનએ તપાસ, આરએનએ માટે ઉતરી બ્લોટ અને પ્રોટીન માટે પશ્ચિમી બ્લોટ માટે વપરાય છે.
પશ્ચિમી શાહીચૂસ પણ પ્રોટીન immunoblotting કહેવામાં આવે છે કારણ કે એક એન્ટીબોડી ખાસ તેના એન્ટિજેન શોધી માટે વપરાય છે. પશ્ચિમી શાહીચૂસ સૌથી મહત્વપૂર્ણ વિશ્લેષણ પદ્ધતિઓ એક નમૂના ચોક્કસ પ્રોટીન ચકાસવાનો છે. પશ્ચિમી બ્લોટ માં, પ્રોટીન તેમને શોધવા માટે અંતઃત્વચા પર immobilized મોનોક્લોનલ અથવા polyclonal એન્ટિબોડીઝ ઉપયોગ કરી રહ્યા છો.
એસડીએસ-પોલીઅક્રીલામેઇડ જેલ ઇલેક્ટ્રોફોરેસીસ (એસડીએસ-PAGE) દ્વારા મૂળ પ્રોટીન પોલિએપ્પાટાઇડની લંબાઈ દ્વારા 3-D માળખું અથવા વિકૃત પ્રોટીન દ્વારા અલગ કરવામાં આવે છે. પછી પ્રોટીનને કલા (ખાસ કરીને નાઇટ્રોસેલ્લોઝ અથવા પીવીડીએફ) માં સ્થાનાંતરિત કરવામાં આવે છે, જ્યાં તેઓ લક્ષ્ય પ્રોટીન માટે ચોક્કસ એન્ટિબોડીઝ સાથે રંગીન હોય છે. એન્ટિબોડીઝના ક્રોસ-પ્રતિક્રિયાના મુદ્દાને ઉકેલવા માટે જેલ ઇલેક્ટ્રોફોરેસિસના પગલાંને પશ્ચિમ બ્લોટ વિશ્લેષણમાં સમાવવામાં આવ્યા છે.
ત્યારબાદ, અલગ પ્રોટીન મેટ્રિક્સ (મોટે ભાગે એક નાઇટ્રોસેલ્લોઝ અથવા પીવીડીએફ પટલ) પર બદલાઈ જાય છે, જ્યાં તેઓ એન્ટિબોડીઝ સાથે રંગીન હોય છે. એન્ટિબોડીઝ ચકાસણી તરીકે કાર્ય કરે છે અને ખાસ કરીને લક્ષ્ય પ્રોટીનને પસંદ કરે છે. ચોક્કસ પ્રતિક્રિયાના સ્થાન અને તીવ્રતાના વિશ્લેષણમાં આપેલ નમૂનામાં લક્ષ્ય પ્રોટીનની અભિવ્યક્તિ વિગતો દર્શાવે છે. પશ્ચિમી બ્લોટિંગ લક્ષિત પ્રોટીન શોધી શકે છે જે જેલ ઇલેક્ટ્રોફોરેસિસના ઉચ્ચ રીઝોલ્યુશન અને ઇમ્યુનેસોએની ઉચ્ચ સંવેદનશીલતાને કારણે 1ng જેટલું નીચું છે. પાશ્ચાત્ય બ્લોટ પદ્ધતિનો ઉપયોગ મોલેક્યુલર બાયોલોજી, બાયોકેમિસ્ટ્રી, ઇમ્યુનોજેનેટિક્સ અને અન્ય મોલેક્યુલર રિસર્ચ ક્ષેત્રોમાં થાય છે.
અન્ય સંબંધિત તકનીકો ટપકું બ્લોટ વિશ્લેષણ, ઇમ્યુનોહિસ્ટોકેમિસ્ટ્રી અને immunocytochemistry જ્યાં એન્ટિબોડીઝ immunostaining દ્વારા પેશીઓ અને કોશિકાઓ પ્રોટીન શોધી કરવા માટે વપરાય છે, અને એન્ઝાઇમ સાથે જોડાયેલી immunosorbent નિબંધ (એલિસા) સમાવેશ થાય છે.
સાહિત્ય / સંદર્ભો
- Koch RJ, Barrette AM, Stern AD, et al. Validating Antibodies for Quantitative Western Blot Measurements with Microwestern Array. Sci Rep. 2018;8(1):11329. Published 2018 Jul 27. doi:10.1038/s41598-018-29436-0
- Carsten Kriebitzsch, Lieve Verlinden, Guy Eelen, Natasja M. van Schoor, Karin Swart, Paul Lips, Mark B. Meyer, J Wesley Pike, Steven Boonen, Carsten Carlberg, Victor Vitvitsky, Roger Bouillon, Ruma Banerjee, and Annemieke Verstuyf (2011): 1,25-dihydroxyvitamin D3 influences cellular homocysteine levels in murine pre-osteoblastic MC3T3-E1 cells by direct regulation of cystathionine β-synthase. J Bone Miner Res. 26(12), 2011. 2991–3000.
- Tahrin Mahmood, Ping-Chang Yang (2012): Western Blot: Technique, Theory, and Trouble Shooting. North American Journal of Medical Sciences. 4(9), 2012. 429-434.

વીયલટેવેટર અવાજ નમૂના પ્રેપ માટે