Sonikacja typu sondowego do przygotowywania próbek: Kompleksowy przewodnik
Sonikacja jest potężnym narzędziem do rozbijania komórek, ścinania DNA i rozpraszania cząstek w ciekłych próbkach. Podobnie jak wszystkie techniki w naukach przyrodniczych, mikrobiologii i analizie klinicznej, sonikacja wymaga starannej optymalizacji, aby uniknąć uszkodzenia próbki, szczególnie podczas pracy z materiałami wrażliwymi na ciepło. Postępując zgodnie ze wskazówkami – takie jak trzymanie próbek na lodzie, kontrolowanie amplitudy sonikacji, używanie trybu impulsowego i optymalizacja głębokości zanurzenia sonotrody. – można osiągnąć skuteczne i powtarzalne wyniki. Ostatecznie, dobrze zoptymalizowany protokół sonikacji zapewnia sukces dalszych zastosowań i zachowuje integralność cennych próbek.
sonikacja – Niezbędny krok w przygotowaniu próbki
Sonikacja jest szeroko stosowaną techniką przygotowywania próbek w badaniach biologicznych, chemicznych i materiałowych. Proces ten polega na wykorzystaniu energii ultradźwiękowej do rozbijania komórek, ścinania DNA, rozpraszania nanocząstek lub emulgowania roztworów. Przesyłając wysokoenergetyczne fale ultradźwiękowe przez ciekłą próbkę za pomocą sondy (sonotroda, róg, sonoproba), sonikacja typu sondy tworzy zlokalizowane obszary wysokiego ciśnienia, turbulencji i kawitacji, które mechanicznie rozbijają struktury komórkowe lub jednorodnie rozpraszają cząstki. Technika ta wymaga jednak starannej optymalizacji, aby uniknąć uszkodzenia próbki, szczególnie wrażliwych materiałów biologicznych, takich jak białka i kwasy nukleinowe. Niniejszy przewodnik dotyczący sonikacji typu sondy zawiera praktyczne wskazówki dotyczące skutecznego przygotowania próbki.

Ultradźwiękowy homogenizator laboratoryjny UP200Ht jest popularny w laboratoriach badawczych do przygotowywania próbek, lizy, ekstrakcji, fragmentacji i rozpuszczania DNA.
- Dostosuj ustawienia amplitudy
Amplituda sonikacji odnosi się do wielkości drgań wytwarzanych przez sondę. Wyższe amplitudy zapewniają bardziej intensywną energię ultradźwiękową, ale generują więcej ciepła, zwiększając ryzyko degradacji próbki. Natomiast niższe amplitudy zapewniają łagodniejszą sonikację, zmniejszając gromadzenie się ciepła przy jednoczesnym zachowaniu integralności próbki.
W zależności od konkretnego zastosowania, stosowanie niższej amplitudy przez dłuższy czas może zapewnić lepsze wyniki niż stosowanie bardzo wysokiej amplitudy w krótkich seriach. Takie podejście zmniejsza ryzyko degradacji termicznej, zapewniając jednocześnie odpowiednie rozerwanie lub wymieszanie próbki. - Korzystanie z automatycznego protokołowania danych
Inteligentne menu wszystkich echosond cyfrowych Hielscher posiada funkcję automatycznego zapisu danych. Po włączeniu sondy, wszystkie ważne dane, takie jak energia wejściowa (całkowita i netto), amplituda, moc, czas – Nawet temperatura i ciśnienie są monitorowane, jeśli podłączono czujniki temperatury i ciśnienia. Wszystkie dane są zapisywane z datą i godziną jako plik CSV na wbudowanej karcie SD.
- Optymalizacja energii wejściowej: Uzyskaj odpowiednią moc ultradźwięków
Optymalizacja przetwarzania ultradźwiękowego za pomocą określonego wkładu energii (Ws? ml) oferuje bardziej powtarzalne i wymierne podejście niż protokoły oparte na czasie. Podczas gdy czas trwania sonikacji pozostaje czynnikiem, to całkowita dostarczona energia na jednostkę objętości ostatecznie określa stopień zakłócenia próbki. Niewystarczający wkład energii może skutkować niepełną lizą lub dyspersją, podczas gdy nadmierny wkład może powodować degradację molekularną, denaturację białek lub przegrzanie - szczególnie w przypadku wrażliwych systemów biologicznych lub polimerowych.
Nasza rada: Rozpocznij od niskich nakładów energii właściwej - zwykle w zakresie 10-50 Ws? ml, w zależności od rodzaju próbki - i stopniowo zwiększaj w razie potrzeby. Monitoruj proces, oceniając zmiany fizyczne (np. zmętnienie, lepkość, rozproszenie cząstek) i obserwuj wskaźniki nadmiernej sonikacji, takie jak nadmierne pienienie, wzrost temperatury lub odbarwienie próbki. Dostosuj odpowiednio amplitudę, cykl impulsu i czas trwania, aby osiągnąć docelową dawkę energii przy jednoczesnym zminimalizowaniu naprężeń termicznych lub mechanicznych. - Tryb pulsacyjny minimalizuje gromadzenie się ciepła
Sonikatory Hielscher mogą pracować w trybie impulsowym, co jest szczególnie przydatne w przypadku próbek wrażliwych na temperaturę. Tryb impulsowy przełącza się między fazami sonikacji i spoczynku, umożliwiając schłodzenie próbki między impulsami. Zapobiega to gwałtownym skokom temperatury, minimalizując ryzyko degradacji wywołanej ciepłem. - Znaczenie kontroli temperatury: Chłodzenie próbek
Sonikacja przenosi energię ultradźwiękową do cieczy, generując ciepło z powodu turbulencji i tarcia. Pozostawienie tego bez kontroli może prowadzić do podwyższonych temperatur, które mogą degradować wrażliwe próbki biologiczne, takie jak białka, enzymy i kwasy nukleinowe. Aby to złagodzić, kontrola temperatury ma kluczowe znaczenie podczas sonikacji.
Jednym z najprostszych i najskuteczniejszych sposobów zapobiegania przegrzaniu jest utrzymywanie próbek na lodzie podczas całego procesu sonikacji. Pomaga to utrzymać stabilną, niską temperaturę i chroni próbkę przed degradacją termiczną.
Wszystkie sondy cyfrowe Hielscher posiadają funkcję monitorowania temperatury. Podłączany czujnik temperatury mierzy w sposób ciągły temperaturę próbki. Zgodnie z ustawionym limitem temperatury w programie, sonikator automatycznie zatrzymuje się po osiągnięciu górnej granicy temperatury i kontynuuje sonikację, gdy tylko zostanie osiągnięta dolna granica ustawionej delty temperatury.
Dodatkowo możesz:- Umieścić probówkę z próbką na lodzie przed rozpoczęciem procesu sonikacji.
- Jeśli konieczne są dłuższe sesje, należy okresowo wstrzymywać sonikację, aby umożliwić chłodzenie.
- Przechowywać próbkę na lodzie po sonikacji, aby dodatkowo ją ustabilizować.
Jest to szczególnie ważne w przypadku próbek białkowych, ponieważ białka mogą szybko denaturować w podwyższonej temperaturze. Przechowywanie próbek w niskiej temperaturze pozwala zachować ich integralność funkcjonalną dla dalszych zastosowań, takich jak Western blotting, testy enzymatyczne lub spektrometria mas.
- Odpowiedni rozmiar sonotrody dla próbki
Wybór odpowiedniego rozmiaru sonotrody do sonikacji próbek w naukach przyrodniczych i mikrobiologii ma kluczowe znaczenie dla zapewnienia optymalnego transferu energii i skutecznego rozbijania komórek lub biomolekuł. Odpowiednio dobrana sonotroda pozwala na skuteczną kawitację, która jest niezbędna do rozbijania ścian komórkowych, lizy komórek i homogenizacji próbek. Jeśli sonotroda jest zbyt duża lub zbyt mała dla objętości lub rodzaju próbki, może to prowadzić do nierównomiernej sonikacji, nadmiernego nagrzewania lub niewystarczającego rozbicia komórek, potencjalnie zagrażając wynikom eksperymentalnym. Dlatego wybór odpowiedniego rozmiaru sonotrody pomaga zachować integralność próbki i zapewnia powtarzalność eksperymentów.
- Prawidłowa głębokość sondy: Unikanie pienienia i równomierna ekspozycja
Umieszczenie sondy jest krytycznym, ale często pomijanym czynnikiem w sonikacji. Odpowiednia głębokość sondy zapewnia skuteczny transfer energii i mieszanie próbek. Jeśli sonda jest zbyt płytka, może wystąpić nadmierne pienienie, które może uwięzić pęcherzyki powietrza i zmniejszyć skuteczność sonikacji. Jeśli sonda jest zbyt głęboka, może nie osiągnąć odpowiedniej cyrkulacji, co prowadzi do nierównomiernej sonikacji próbki.
Idealna głębokość sondy wynosi zazwyczaj od 1/4 do 1/3 wysokości cieczy w rurce lub pojemniku. Eksperymentuj z różnymi głębokościami, aby znaleźć optymalną pozycję, która maksymalizuje transfer energii bez powodowania pienienia.
Duży pojemnik na próbki może skorzystać z powolnego przesuwania sonotrody przez próbkę, aby zapewnić równomierną sonikację całej próbki.
W przypadku korzystania z modeli CupHorn lub UIP400MTP sonikatora wielopróbkowego należy napełnić cuphorn zgodnie z opisem w instrukcji. - Optymalizacja procesu sonikacji: Dostosuj do próbki
Kluczem do udanej sonikacji jest optymalizacja. Ponieważ różne próbki, w tym komórki, tkanki i substancje chemiczne, różnie reagują na energię ultradźwiękową, ważne jest, aby dostosować proces do konkretnych potrzeb. Czynniki, które należy wziąć pod uwagę podczas optymalizacji obejmują:
Objętość próbki: Większe objętości mogą wymagać dłuższych czasów sonikacji lub wyższych amplitud.
Lepkość próbki: Lepkie próbki mogą wymagać bardziej intensywnej sonikacji, aby osiągnąć wystarczające rozdrobnienie.
Pożądany wynik: W przypadku lizy twardych tkanek może być wymagany bardziej intensywny reżim sonikacji, podczas gdy krótsza sonikacja może wystarczyć do ścinania DNA.
Poprzez systematyczne testowanie i udoskonalanie parametrów – takie jak amplituda, czas trwania i głębokość sondy - można zoptymalizować proces sonikacji dla unikalnej próbki.
Znajdź sonikator odpowiedni do zadania przygotowania próbki
Hielscher Ultrasonics oferuje pełne spektrum sonikatorów do przygotowywania próbek. Poinformuj nas o ważnych czynnikach, takich jak rodzaj próbki, objętość i konkretne zastosowanie, nad którym pracujesz. Nasz zespół ekspertów chętnie skonsultuje się z Tobą, oferując najbardziej odpowiedni homogenizator ultradźwiękowy do Twoich eksperymentów badawczych.
Poniższa tabela przedstawia przybliżoną wydajność przetwarzania naszych ultrasonografów laboratoryjnych:
Polecane urządzenia | Wielkość partii | natężenie przepływu |
---|---|---|
Sonikator do płytek 96-dołkowych UIP400MTP | Płytki wielodołkowe? mikrotitracyjne | b.d. |
Ultradźwiękowy CupHorn | CupHorn do fiolek lub zlewek | b.d. |
GDmini2 | ultradźwiękowy reaktor mikroprzepływowy | b.d. |
VialTweeter | 0.5-1,5 mL | b.d. |
UP100H | 1 do 500mL | 10-200mL/min |
UP200Ht, UP200St | 10 do 1000 ml | 20 do 200 ml/min |
UP400St | 10 do 2000mL | 20-400mL/min |
Ultradźwiękowy wytrząsacz sitowy | b.d. | b.d. |
Hielscher Ultrasonics jest firmą posiadającą certyfikat ISO i kładzie szczególny nacisk na wysokowydajne ultradźwięki z najnowocześniejszą technologią i łatwością obsługi. Oczywiście ultradźwięki Hielscher są zgodne z CE i spełniają wymagania UL, CSA i RoHs.

Hielscher Ultrasonics dostarcza potężne bezkontaktowe sonikatory do przygotowywania próbek i analizy klinicznej. Sonikator wielodołkowy UIP400MTP, VialTweeter, CupHorn i sonikator przepływu GDmini2 przetwarzanie próbek bez ich dotykania.
- wysoka wydajność
- najnowocześniejsza technologia
- niezawodność & solidność
- regulowana, precyzyjna kontrola procesu
- partia & inline
- dla dowolnego wolumenu
- inteligentne oprogramowanie
- inteligentne funkcje (np. programowalne, protokołowanie danych, zdalne sterowanie)
- Łatwa i bezpieczna obsługa
- niskie koszty utrzymania
- CIP (clean-in-place)

Sonikator VialTweeter do jednoczesnej sonikacji 10 próbek, np. do rozbijania komórek, ekstrakcji białek i ścinania DNA.
Literatura? Referencje
- Claudia Lindemann, Nataliya Lupilova, Alexandra Müller, Bettina Warscheid, Helmut E. Meyer, Katja Kuhlmann, Martin Eisenacher, Lars I. Leichert (2013): Redox Proteomics Uncovers Peroxynitrite-Sensitive Proteins that Help Escherichia coli to Overcome Nitrosative Stress. J Biol Chem. 2013 Jul 5; 288(27): 19698–19714.
- Turrini, Federica; Donno, Dario; Beccaro, Gabriele; Zunin, Paola; Pittaluga, Anna; Boggia, Raffaella (2019): Pulsed Ultrasound-Assisted Extraction as an Alternative Method to Conventional Maceration for the Extraction of the Polyphenolic Fraction of Ribes nigrum Buds: A New Category of Food Supplements Proposed by The FINNOVER Project. Foods. 8. 466; 2019
- Giricz Z., Varga Z.V., Koncsos G., Nagy C.T., Görbe A., Mentzer R.M. Jr, Gottlieb R.A., Ferdinandy P. (2017): Autophagosome formation is required for cardioprotection by chloramphenicol. Life Science Oct 2017. 11-16.
- Hemida, Yasmine (2016): Effect of Rapamycin as an Inhibitor of the mTOR Cell Cycle Entry Complex on the Selective Lysis of Human Leukemia Cells Lines in Vitro Using 20 kHz Pulsed Low-Frequency Ultrasound. Honors Capstone Projects – All. 942, 2016.
- Fernandes, Luz; Santos, Hugo; Nunes-Miranda, J.; Lodeiro, Carlos; Capelo, Jose (2011): Ultrasonic Enhanced Applications in Proteomics Workflows: single probe versus multiprobe. Journal of Integrated OMICS 1, 2011.
- Priego-Capote, Feliciano; Castro, María (2004): Analytical uses of ultrasound – I. Sample preparation. TrAC Trends in Analytical Chemistry 23, 2004. 644-653.
- Welna, Maja; Szymczycha-Madeja, Anna; Pohl, Pawel (2011): Quality of the Trace Element Analysis: Sample Preparation Steps. In: Wide Spectra of Quality Control; InTechOpen 2011.
często zadawane pytania
Jaki jest cel sonikacji?
Celem sonikacji jest wykorzystanie fal dźwiękowych, zazwyczaj w zakresie ultradźwiękowym, do mieszania cząstek w próbce, ułatwiając procesy takie jak rozbicie komórek, homogenizacja i rozpad struktur molekularnych. Jest powszechnie stosowany w zastosowaniach biologicznych, chemicznych i materiałoznawczych w celu poprawy mieszania, promowania reakcji lub uwalniania zawartości komórkowej.
Na czym polega technika sonikacji?
Technika sonikacji polega na wykorzystaniu intensywnych fal ultradźwiękowych (zwykle o częstotliwości pomiędzy 20 – 30 kHz) do generowania szybkich wibracji w ciekłym medium. Wibracje te powodują powstawanie i zapadanie się mikroskopijnych pęcherzyków, proces znany jako kawitacja akustyczna. Kawitacja ta tworzy lokalne wysokie ciśnienie i temperaturę, które mogą rozbijać komórki, rozpraszać cząsteczki lub ułatwiać reakcje chemiczne. Technika sonikacji jest szeroko stosowana w laboratoriach do takich zastosowań, jak liza komórek, ekstrakcja, ścinanie DNA, homogenizacja i synteza nanocząstek.
Jak przygotować próbkę do sonikacji?
Aby przygotować próbkę do sonikacji, materiał próbki (zazwyczaj ciecz lub zawieszone ciała stałe) umieszcza się w odpowiednim pojemniku, często szklanej kolbie, plastikowej rurce lub płytce wielodołkowej, o wystarczającej objętości, aby pomieścić drgania ultradźwiękowe i zapobiec rozlaniu. W razie potrzeby próbkę rozcieńcza się buforem lub rozpuszczalnikiem, aby utrzymać pożądane stężenie i zapobiec przegrzaniu podczas sonikacji. W przypadku próbek wrażliwych na ciepło, pojemnik jest następnie częściowo zanurzany w łaźni lodowej lub płaszczu chłodzącym, aby rozproszyć ciepło generowane przez fale ultradźwiękowe. Sonda sonikatora jest odpowiednio ustawiona, aby zapewnić efektywny transfer energii. Parametry takie jak amplituda, czas i tryb impulsu są ustawiane w oparciu o specyficzne wymagania eksperymentu.
Czy sonikacja uszkadza DNA?
Tak, sonikacja może uszkodzić DNA. Fale ultradźwiękowe o wysokiej energii generowane podczas sonikacji mogą ścinać cząsteczki DNA, tworząc zlokalizowane obszary wysokiego ciśnienia i ciepła, co prowadzi do mechanicznego naprężenia nici DNA. Powoduje to fragmentację DNA na mniejsze kawałki. Zakres pęknięcia DNA zależy od czasu trwania i intensywności sonikacji. W niektórych eksperymentach, takich jak immunoprecypitacja chromatyny (ChIP) lub przygotowanie biblioteki sekwencjonowania nowej generacji (NGS), sonikacja jest stosowana jako niezawodna technika kontrolowanego ścinania DNA.

Hielscher Ultrasonics produkuje wysokowydajne homogenizatory ultradźwiękowe od laboratorium do rozmiar przemysłowy.