Az ultrahangos kezelés egyszerűsíti a mikrobiomkutatást és a klinikai elemzést
Az ultrahangos kezelés hatékony technika, amelyet széles körben alkalmaznak a mikrobiomkutatásban és a klinikai elemzésben, és amely nagy mintaáteresztő képességű minta-előkészítést tesz lehetővé. Az ultrahangos módszer különösen hatékony az összetett biológiai minták, például a mikroorganizmusokat tartalmazó minták feldolgozásában. Az ultrahangos kezelés megkönnyíti a sejtlízist, valamint a nukleinsavak, fehérjék és metabolitok kinyerését és elemzését, lehetővé téve a mikrobiális közösségek és az egészségben, illetve a betegségekben betöltött szerepük mélyebb megértését. A Hielscher nagy mintaáteresztő képességű ultrahangos kezelőberendezései pontosságukról, hatékonyságukról és reprodukálható eredményeikről ismertek, így kiváló választást jelentenek a mikrobiomvizsgálatokhoz.
Használja ki a nagy mintaáteresztő képességű ultrahangos kezelés előnyeit a mikrobiomkutatásban
A 96 lyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés nagy mintaáteresztő képességű minta-előkészítéssel egyszerűsíti a mikrobiomkutatást
Nagy mintaáteresztő képességű minta-előkészítés a 96 lyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezéssel
Az ultrahangos kezelés alkalmazásai a mikrobiomkutatásban
Hatékony sejtlízis
Az ultrahangos kezelés rendkívül hatékony a mikrobiális sejtek lízisében, beleértve az ellenálló sejtfalú sejteket, például a Gram-pozitív baktériumokat és a gombákat is. Az ultrahanghullámok kavitációs buborékokat hoznak létre a mintában, amelyek összeomlanak, és olyan lökéshullámokat keltenek, amelyek felszakítják a sejtfalakat és a membránokat. Ez a folyamat átfogó sejtfeltárást és az intracelluláris összetevők, például a DNS, az RNS és a fehérjék hatékony felszabadítását biztosítja.
Szabályozott DNS-fragmentálás
Az olyan alkalmazásokhoz, mint az új generációs szekvenálás, gyakran szükséges a DNS nyírással történő feldarabolása kisebb, egyenletes méretű fragmentumokra. Az ultrahangos kezelés lehetővé teszi a fragmentálási folyamat pontos szabályozását, így a kutatók a kívánt méretű DNS-fragmentumokat állíthatják elő. Ez a szabályozhatóság kulcsfontosságú a szekvenálási könyvtárak előkészítéséhez és a kiváló minőségű szekvenciaadatok biztosításához.
Hatékonyabb mintahomogenizálás
A mikrobiomkutatásban a minták gyakran mikroorganizmusok változatos keverékét tartalmazzák. Az ultrahangos kezelés elősegíti e mikroorganizmusok egyenletes eloszlását a mintán belül, biztosítva a következetes és reprodukálható eredményeket. Ez a homogenizálás elengedhetetlen a pontos mennyiségi elemzéshez, például a mikroorganizmusok abundanciájának meghatározásához vagy meghatározott metabolikus aktivitások méréséhez.
Megbízható metabolitextrakció
Az ultrahangos kezeléssel végzett megbízható metabolitextrakció a metabolomikában széles körben alkalmazott technika a kis molekulák biológiai mintákból történő izolálására. Az ultrahangos kezelés olyan mechanikai rezgéseket alkalmaz, amelyek megbontják a sejtmembránokat, elősegítve az intracelluláris metabolitok felszabadulását az oldószerbe. Ez a módszer hatékony, reprodukálható és különféle mintatípusokkal kompatibilis, így értékes eszköz a nagy mintaáteresztő képességű és célzott metabolomikai vizsgálatokhoz. Olvasson többet az ultrahangos metabolitextrakcióról!
„Azért írok, hogy megköszönjem a kiváló tapasztalatokat, amelyeket az Önök UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezésének használata során szereztünk a székletből származó mikrobiomminták egyenletes és következetes bakteriális lízisében. A nagy mintaáteresztő képességű lízistechnológia határait feszegetjük, és az Önök készüléke kiválóan alkalmas erre a feladatra. Néhány kiemelkedő előny:
- Egyszerű kezelés – a készülék könnyen használható, és a menüpontok segítségével egyszerűen testre szabható
- Nagy mintaáteresztő képesség – kiválóan alkalmas lemezek kezelésére, egyszerre 96 mintával
- Minden edény egyenletes ultrahangos kezelése – a készülék minden lyukban azonos mértékű ultrahangos kezelést tudott biztosítani, ami alkalmazásunk szempontjából döntő fontosságú volt
- A Hielscher csapatának támogatása – a támogatás kiváló volt, a képzés során mindig számíthattunk Önökre, megválaszolták kérdéseinket és megoldották a problémákat, olyan javaslatokkal, amelyek segítettek elérni a célunkat.
Még egyszer köszönjük a segítséget és a támogatást, amelyet protokolljaink optimalizálása során nyújtottak.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – tudományos igazgató – Intus Biosciences
Hogyan alkalmazzák az ultrahangos kezelést a mikrobiomkutatásban és a diagnosztikában?
A metabolomika, a metagenomika és a metaproteomika összefonódik a mikrobiomkutatásban, mivel együttesen átfogó képet nyújtanak a mikrobiális közösségekről és azok működéséről. A lízis, a fehérjetisztítás és a DNS / RNS fragmentálása alapvető minta-előkészítési lépések, amelyeket a 96 lyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés használata egyszerűsít.
Metabolomika és metabolomelemzés
A metabolomika a biológiai rendszerekben található kis molekulájú metabolitok szisztematikus vizsgálatával foglalkozik. A mikrobiomkutatásban az ultrahangos kezelést a mikrobiális sejtek lízisére használják, felszabadítva az intracelluláris metabolitokat. A 96 lyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezéssel nagyszámú minta dolgozható fel gyorsan. A kinyert metabolitok mennyiségét ezután korszerű technikákkal, például tömegspektrometriával (MS) és mágneses magrezonancia-spektroszkópiával (NMR) határozzák meg. Az így kapott adatok pillanatképet adnak a mikrobiom metabolikus állapotáról, betekintést nyújtva a mikrobiális közösségeken belüli biokémiai aktivitásokba és kölcsönhatásokba.
Metagenomika és metatranszkriptomika
A metagenomika a közvetlenül környezeti mintákból kinyert genetikai anyag átfogó elemzésével foglalkozik. Az ultrahangos kezelés kulcsfontosságú szerepet játszik ebben a folyamatban: a mikrobiális sejtek lízisével kiváló minőségű DNS nyerhető ki, amelyet ezután szekvenálnak a jelen lévő mikrobiális fajok azonosításához és mennyiségi meghatározásához. A metatranszkriptomikában hasonló ultrahangos kezelési módszerekkel nyerik ki az RNS-t a különböző mikrobiális közösségek génexpressziós profiljainak vizsgálatához. A DNS- és RNS-szekvenáláshoz a nukleinsavakat meghatározott bázispárhosszúságú fragmentumokra kell bontani. Mindezeket a feladatokat megbízhatóan és gyorsan végzi el a nagy mintaáteresztő képességű UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés!
Proteomika
A proteomikai elemzésekhez ki kell nyerni a fehérjéket a mikrobiális sejtekből. Az ultrahangos kezelést hatékonyan alkalmazzák a sejtek feltárására, amelynek során a fehérjék az oldatba kerülnek. Ezeket a fehérjéket ezután tisztítani és elemezni lehet, hogy megértsük a mikrobiomban betöltött funkcionális szerepüket és a metabolikus útvonalakban való részvételüket. A többlyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezéssel perceken belül elvégezhető a lízis és a fehérjeextrakció, reprodukálható eredményeket biztosítva a mikrobiális közösségekben a fehérjék által vezérelt biológiai folyamatok megismeréséhez.
Metaproteomika
A metaproteomika a proteomikai elemzést teljes mikrobiális közösségekre terjeszti ki, és azok összesített fehérjetartalmát vizsgálja a mikrobiomon belüli funkcionális expresszió és kölcsönhatások megértéséhez. Az ultrahangos kezelést a sejtek lízisére használják, felszabadítva a fehérjéket, amelyeket ezután tisztítanak, és például tömegspektrometriás technikákkal elemeznek. Ez a megközelítés részletes betekintést nyújt a különféle környezetekben élő mikrobiális közösségek aktív biológiai folyamataiba és alkalmazkodásába.
Használja ki a többlyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés nagy mintaáteresztő képességét, és könnyítse meg mikrobiomkutatását és -elemzését!
Nagy mintaáteresztő képességű UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés mikrobiomkutatáshoz többlyukú lemezekben, 96 lyukú lemezekben, csövekben és Petri-csészékben.
Többlyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés nagy mintaáteresztő képességű minta-előkészítéshez a mikrobiomdiagnosztikában.
A többlyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés megkönnyíti a nagy mintaáteresztő képességű minta-előkészítést, például a mikrobiomkutatásban és a diagnosztikában.
96 lyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés: az ultrahangot közvetítő folyadék minden lyukat körülvesz, és minden minta egyenletes ultrahangos kezelését biztosítja
A többlyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés fő jellemzői
| Nagy mintaáteresztő képességű ultrahangos kezelés | A 96 lyukú és más többlyukú lemezekhez tökéletesen alkalmas UIP400MTP lehetővé teszi több minta egyidejű, azonos ultrahangos kezelését, jelentősen lerövidítve a minta-előkészítés időtartamát és növelve a nagyszámú mintával végzett vizsgálatok mintaáteresztő képességét. |
| Használja az Ön által választott többlyukú lemezt | Az UIP400MTP bármilyen szabványos többlyukú lemez, PCR-lemez vagy mikrotiterlemez ultrahangos kezelésére készült. Ön választhatja ki a kísérleteihez legmegfelelőbb lemezt. Mivel az UIP400MTP nem igényel gyártóspecifikus fogyóeszközöket, sok pénzt takaríthat meg! |
| Érintésmentes ultrahangos kezelés | A többlyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés intenzív ultrahangot alkalmaz anélkül, hogy bármit a mintába helyezne. Lezárt többlyukú lemezeket, zárt edényeket és fiolákat is kezelhet ultrahanggal. A Hielscher bármilyen nem szabványos fiolához vagy edényhez egyedi mintatartókat biztosít Önnek. |
| Pontosság és szabályozás | A precíz szabályozás és az intelligens szoftver lehetővé teszi az ultrahangos paraméterek beállítását úgy, hogy azok optimálisan megfeleljenek az Ön sajátos feldolgozási igényeinek. Minden kísérlethez maximális ultrahangos kezelési hatékonyságot és eredményességet kap. |
| Hőmérséklet-szabályozás | Állítson be meghatározott hőmérsékletet az ultrahangos kezeléshez. Az UIP400MTP lemezekhez készült ultrahangos kezelőberendezés képes figyelni a minta hőmérsékletét, és ennek megfelelően módosítani az ultrahangos kezelést. A keringtetett hűtőfolyadék a lemez minden lyukát hűti a pontos hőmérséklet-szabályozás érdekében. |
| Naplózás és távvezérlés | Minden ultrahangos kezelési menet számítógépről vezérelhető. Nincs szükség szoftvertelepítésre. Szokásos böngészőjével (például Chrome, Firefox, Edge vagy Safari) bármely operációs rendszeren (például MacOS, Windows, Android, iOS vagy Linux) távolról vezérelheti és felügyelheti az UIP400MTP készüléket. Minden ultrahangos kezelési menet részletes kezelési jegyzőkönyvet hoz létre az értékeléshez és a dokumentáláshoz. A jegyzőkönyvfájl nem gyártóspecifikus CSV-formátumú, amelyet az Ön által választott programmal, például Microsoft Excel, Apple Numbers vagy OpenOffice Calc segítségével nyithat meg. |
| Strapabíró és megbízható | A Németországban, a legmagasabb minőségi követelmények szerint tervezett és gyártott UIP400MTP nemcsak nagy teljesítményű, hanem rendkívül tartós is. Kialakítása megfelel az ipari szabványoknak, és könnyedén ellenáll a napi használat megterhelésének egy nagy igénybevételt jelentő laboratóriumi környezetben. Az UIP400MTP nagy mintaáteresztő képességű műveletekhez folyamatosan használható a nap 24 órájában, a hét 7 napján. |
- nagy hatékonyság
- csúcstechnológia
- megbízhatóság és strapabíróság
- állítható, pontos folyamatszabályozás
- intelligens szoftver
- intelligens funkciók (például programozhatóság, adatnaplózás, távvezérlés)
- egyszerű és biztonságos kezelés
- kis karbantartási igény
- CIP (helyben történő tisztítás)
Tervezés, gyártás és tanácsadás – Németországban készült minőség
A Hielscher ultrahangos berendezései a legmagasabb minőségi és tervezési követelményekről ismertek. Strapabíróságuk és egyszerű kezelésük lehetővé teszi ultrahangos berendezéseink zökkenőmentes beillesztését az ipari létesítményekbe. A Hielscher ultrahangos berendezései könnyedén megbirkóznak a zord körülményekkel és a nagy igénybevételt jelentő környezetekkel.
A Hielscher Ultrasonics ISO-tanúsítvánnyal rendelkező vállalat, amely különös hangsúlyt fektet a csúcstechnológiát és felhasználóbarát kialakítást ötvöző, nagy teljesítményű ultrahangos berendezésekre. A Hielscher ultrahangos berendezései természetesen megfelelnek a CE előírásainak, valamint az UL, a CSA és a RoHs követelményeinek.
Érintésmentes UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés mikrobiomminták előkészítéséhez többlyukú lemezekben.
Szakirodalom / Hivatkozások
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- InfoGraphic UIP400MTP – 96-well plate Ultrasonicator for High-Throughput Sample Prep – english – Hielscher Ultrasonics
- Jannike L. Krause, Sven-Bastiaan Haange, Stephanie S. Schäpe, Beatrice Engelmann, Ulrike Rolle-Kampczyk, Katarina Fritz-Wallace, Zhipeng Wang, Nico Jehmlich, Dominique Türkowsky, Kristin Schubert, Judith Pöppe, Katrin Bote, Uwe Rösler, Gunda Herberth, Martin von Bergen (2020): The glyphosate formulation Roundup® LB plus influences the global metabolome of pig gut microbiota in vitro. Science of The Total Environment, Volume 745, 2020.
- Tröscher-Mußotter, Johanna; Sáenz, Johan; Grindler, Sandra; Meyer, Jennifer; Kononov, Susanne; Mezger, Beate; Borda, Daniel; Frahm, Jana; Dänicke, Sven; Camarinha-Silva, Amelia; Huber, Korinna; Seifert, Jana (2021): Microbiome Clusters Disclose Physiologic Variances in Dairy Cows Challenged by Calving and Lipopolysaccharides. mSystems 2021.
- Jannike Lea Krause, Beatrice Engelmann, Stephanie Serena Schaepe, Ulrike Rolle-Kampczyk, Nico Jehmlich, Hyun-Dong Chang, Ulla Slanina, Maximillian Hoffman, Jörg Lehmann, Ana Claudia Zenclussen, Gunda Herberth, Martin von Bergen, Sven-Bastiaan Haange (2024): DSS treatment does not affect murine colonic microbiota in absence of thehost. Gut Microbes 2024.
Gyakran ismételt kérdések a mikrobiomkutatásról
Mit tesz az ultrahangos kezelés a baktériumokkal?
Az ultrahangos kezelés nagyfrekvenciás hanghullámok segítségével tárja fel a baktériumsejteket, kavitációt idézve elő, amely lökéshullámokat és mechanikai erőket hoz létre, sejtlízishez és az intracelluláris összetevők felszabadulásához vezetve.
Milyen módszereket alkalmaznak a mikrobiomok vizsgálatára?
A mikrobiomok vizsgálatára alkalmazott módszerek közé tartoznak a DNS-szekvenálási technikák, például a 16S rRNS-gén szekvenálása és a metagenomika, valamint a transzkriptomika, a proteomika és a metabolomika a mikrobiális funkciók és kölcsönhatások elemzésére. A keletkező hatalmas adatmennyiség értelmezéséhez bioinformatikai eszközöket használnak.
Milyen technikákat alkalmaznak a mikrobiomelemzésben?
A mikrobiomelemzésben alkalmazott technikák közé tartozik a 16S rRNS-gén szekvenálása a taxonómiai profilalkotáshoz, a metagenomikai szekvenálás az átfogó genetikai elemzéshez, a metatranszkriptomika a génexpresszió vizsgálatához, a metaproteomika a fehérjék elemzéséhez és a metabolomika az anyagcseretermékek azonosításához. A bioinformatikai eszközök elengedhetetlenek az adatok feldolgozásához és értelmezéséhez.
Mit jelent a metabolomika, a metagenomika és a metaproteomika a mikrobiomkutatásban?
A mikrobiomkutatásban a metabolomika a mikrobák által termelt kis molekulákat és metabolitokat elemzi, betekintést nyújtva metabolikus aktivitásukba. A metagenomika a mikrobiális közösségek összesített genomjainak szekvenálását foglalja magában genetikai összetételük és funkcionális potenciáljuk megértéséhez. A metaproteomika a mikrobiom teljes fehérjetartalmát vizsgálja, feltárva a gének funkcionális expresszióját és a fehérjék mikrobiális közösségen belüli szerepét.
Mik a baktériumkolóniák a mikrobiomkutatásban?
A mikrobiomkutatásban a baktériumkolóniák egyetlen vagy néhány sejtből szilárd táptalajon kinövesztett baktériumcsoportok, amelyek látható telepeket alkotnak. Ezek a kolóniák klonális populációkat képviselnek, amelyeket a mikrobiális közösségen belüli meghatározott baktériumtörzsek jellemzőinek, sokféleségének és funkcióinak vizsgálatára használnak.
A Hielscher Ultrasonics nagy teljesítményű ultrahangos homogenizátorokat gyárt a laboratóriumi mérettől az ipari méretig.