Metabolomika nagy mintaáteresztő képességű ultrahangos kezeléssel
A metabolomika olyan kutatási terület, amely nagy áteresztőképességű technikákat alkalmaz a különféle biológiai folyadékokban, például a vizeletben, a szérumban, a plazmában, a székletben és a nyálban található kis molekulák jellemzésére és mennyiségi meghatározására, feltárva az egyedi metabolikus mintázatokat. A többlyukú lemezekhez tervezett, nagy mintaáteresztő képességű UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés hatékony eszköz az ezekben a mintákban található sejtek lizálására, elősegítve a metabolitok felszabadulását a későbbi elemzéshez. Ez a precíz és megbízható megközelítés alapvető a metabolomikában, ahol kiemelkedően fontos a pontos vizsgálattervezés, a gondos minta-előkészítés, az optimalizált platformbeállítás, az átfogó adatelemzés és az érdemi biológiai értelmezés. A metabolomika célzott megközelítéseket is alkalmaz, amelyek meghatározott molekulacsoportokra, például szénhidrátokra, lipidekre és aminosavakra összpontosítanak, valamint nem célzott technikákat is, amelyek széles körű áttekintést nyújtanak a mintán belüli metabolikus profilokról, feltárva a metabolikus jelátvitel összetettségét.
Nagy áteresztőképességű minta-előkészítés a 96 lyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezéssel
Az érintkezésmentes UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés 96 lyukú lemezekkel együtt használva hatékony módszert kínál a nagy mintaáteresztő képességű homogenizáláshoz és metabolitextrakcióhoz. Ez az elrendezés elkerüli a mintával való közvetlen érintkezést, csökkentve a keresztszennyeződés kockázatát, miközben egyszerre több mintát dolgoz fel.
Lépésről lépésre követhető homogenizálási protokoll a 96 lyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezéssel
- Metabolomikai minták előkészítése
Minták elhelyezése: Adagolja az egyes mintákat (például székletet, bélszövetet vagy béllumentartalmat) egy 96 lyukú lemez vagy mikrolemez különálló lyukaiba.
Oldószer: A szerves oldószerek, például a metanol, az etanol, az acetonitril, a kloroform és ezek (vizes) keverékei nélkülözhetetlenek a metabolitextrakcióhoz, mivel elősegítik az intracelluláris metabolitok felszabadulását a sejtmátrixból. Lyukanként 100–300 µL oldószert használjon, ügyelve arra, hogy az oldószer térfogata elegendő legyen a minta teljes bemerítéséhez.
Belső standardok: Opcionálisan adjon belső standardokat minden lyukhoz a későbbi metabolomikai elemzés során végzett normalizáláshoz. - A csatolóközeg beállítása
Vízszint: Helyezze a 96 lyukú lemezt a vízzel (a csatolóközeggel) feltöltött ultrahangos kezelőplatformra a kézikönyvben leírtak szerint. - A UIP400MTP paramétereinek beállítása
Teljesítménybeállítások: A hatékony homogenizáláshoz állítsa az ultrahang amplitúdóját a maximális teljesítmény 50–80%-ára.
Impulzusüzemmód: Állítsa be az ultrahangos kezelési ciklust váltakozó impulzusokra (például 30 másodperc BE, 30 másodperc KI), hogy lehetővé tegye a hűlést és megelőzze a minta túlmelegedését.
Teljes idő: 4–10 perc, a minta összetettségétől és ellenálló képességétől függően.
Hőmérséklet-szabályozás: Használjon laboratóriumi hűtőberendezést, hogy az ultrahangos kezelés során a víz hőmérsékletét 4–8°C-on tartsa a hőérzékeny metabolitok védelme érdekében. - Az ultrahangos kezelés folyamata
Indítsa el a UIP400MTP berendezést az ultrahangos kezelési ciklusok végrehajtásához.
Kövesse nyomon a folyamatot a UIP400MTP kezelőfelületén.
A kavitációs hatás homogenizálja a mintákat és lizálja a lyukakban található sejteket, felszabadítva az intracelluláris metabolitokat az oldószerbe. - Az ultrahangos kezelés után
Centrifugálás: Az ultrahangos kezelés után szükség esetén helyezze át a lemez tartalmát gyűjtőcsövekbe. Centrifugálja 4 000–6 000 × g mellett 10 percig, hogy az oldhatatlan törmelék és a sejtes anyag pelletet képezzen.
A felülúszó begyűjtése: Óvatosan helyezze át a felülúszót minden lyukból új csövekbe vagy lemezekbe az elemzéshez.
Opcionális szárítás: Ha koncentrálás szükséges, szárítsa meg a felülúszókat vákuumkoncentrátorral (például SpeedVac berendezéssel), majd oldja fel újra kis térfogatú, megfelelő oldószerben.
Használja ki a többlyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés nagy mintaáteresztő képességét, és könnyítse meg metabolomikai kutatásait és elemzéseit!
UIP400MTP nagy mintaáteresztő képességű ultrahangos kezelőberendezés metabolomikai kutatásokhoz többlyukú lemezekben, 96 lyukú lemezekben, csövekben és Petri-csészékben.
Az érintkezésmentes ultrahangos kezelés elve a UIP400MTP berendezéssel
A UIP400MTP közvetetten, csatolóközegen (például vízen) keresztül juttat ultrahanghullámokat a 96 lyukú lemez lyukaiba. Ezek a hullámok kavitációt hoznak létre, amely feltárja a sejteket és felszabadítja a metabolitokat anélkül, hogy az ultrahangos kezelőberendezés szondája fizikailag érintkezne a mintával.
„Azért írok, hogy megköszönjem a kiváló tapasztalatokat, amelyeket az Önök UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezésével szereztünk a székletmikrobiom-mintákban található baktériumok egyenletes és következetes lizálása során. A nagy áteresztőképességű lízistechnológia határait feszegetjük, és az Önök készüléke kiválóan alkalmas erre a feladatra. Néhány kiemelkedő előnye:
- Egyszerű kezelés – a készülék könnyen használható, és a menüpontok segítségével egyszerűen testre szabható
- Nagy mintaáteresztő képesség – kiválóan alkalmas lemezek kezelésére, egyszerre 96 mintával
- Minden edény egyenletes ultrahangos kezelése – a készülék minden lyukban azonos mértékű ultrahangos kezelést biztosított, ami döntő fontosságú volt az alkalmazásunkban
- A Hielscher csapatának támogatása – a támogatás kiváló volt, a betanítás során mindig számíthattunk Önökre, megválaszolták kérdéseinket és kezelték a problémákat, olyan javaslatokkal, amelyek segítettek elérni a célunkat.
Még egyszer köszönjük a segítséget és a támogatást, amelyet protokolljaink optimalizálásához nyújtottak.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – tudományos igazgató – Intus Biosciences
A többlyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés megkönnyíti a nagy áteresztőképességű minta-előkészítést, például a metabolitkutatásban és -elemzésben.
A többlyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés fő jellemzői
| Nagy mintaáteresztő képességű ultrahangos kezelés | A 96 lyukú és más többlyukú lemezekhez tökéletesen megfelelő UIP400MTP lehetővé teszi több minta egyidejű, azonos ultrahangos kezelését, jelentősen lerövidítve a minta-előkészítés időtartamát és növelve a nagy mintaszámú vizsgálatok mintaáteresztő képességét. |
| Használja az Ön által választott többlyukú lemezt | A UIP400MTP bármely szabványos többlyukú lemez, PCR-lemez vagy mikrotiterlemez ultrahangos kezelésére készült. Ön választhatja ki a kísérleteihez legmegfelelőbb lemezt. Mivel a UIP400MTP nem igényel gyártóspecifikus fogyóeszközöket, jelentős összeget takaríthat meg! |
| Érintkezésmentes ultrahangos kezelés | A többlyukú lemezekhez készült UIP400MTP ultrahangos kezelőberendezés intenzív ultrahangot alkalmaz anélkül, hogy bármit a mintába helyezne. Lezárt többlyukú lemezeket, zárt edényeket és fiolákat is kezelhet ultrahanggal. A Hielscher bármilyen nem szabványos fiolához vagy edényhez egyedi mintatartókat biztosít. |
| Pontosság és szabályozás | A precíz szabályozás és az intelligens szoftver lehetővé teszi, hogy az ultrahangos paramétereket optimálisan az egyedi feldolgozási igényeihez igazítsa. Minden kísérletben maximális ultrahangos kezelési hatékonyságot és eredményességet érhet el. |
| Hőmérséklet-szabályozás | Állítson be meghatározott hőmérsékletet az ultrahangos kezeléshez. A UIP400MTP lemezkezelő ultrahangos berendezés képes figyelni a minta hőmérsékletét, és ennek megfelelően módosítani az ultrahangos kezelést. A keringetett hűtőfolyadék a lemez minden lyukát hűti a pontos hőmérséklet-szabályozás érdekében. |
| Naplózás és távvezérlés | Minden ultrahangos kezelési folyamat számítógépről vezérelhető. Nincs szükség szoftvertelepítésre. A UIP400MTP távoli vezérléséhez és felügyeletéhez bármely operációs rendszeren (például MacOS, Windows, Android, iOS vagy Linux) használhatja szokásos böngészőjét (például Chrome, Firefox, Edge vagy Safari). Minden ultrahangos kezelési folyamat részletes kezelési naplót készít az értékeléshez és a dokumentáláshoz. A naplófájl nem gyártóspecifikus CSV-formátumú, így megnyithatja az Ön által választott programmal, például Microsoft Excel, Apple Numbers vagy OpenOffice Calc használatával. |
| Strapabíró és megbízható | A Németországban, a legmagasabb minőségi követelmények szerint tervezett és gyártott UIP400MTP nagy teljesítményű és rendkívül tartós. Kialakítása megfelel az ipari szabványoknak, és könnyedén ellenáll az igényes laboratóriumi környezetben végzett mindennapi használat megpróbáltatásainak. A UIP400MTP nagy mintaáteresztő képességet igénylő műveletekben folyamatosan, napi 24 órában, a hét 7 napján használható. |
- nagy hatékonyság
- csúcstechnológia
- megbízhatóság és strapabíróság
- állítható, pontos folyamatszabályozás
- intelligens szoftver
- intelligens funkciók (például programozhatóság, adatnaplózás, távvezérlés)
- egyszerű és biztonságos kezelés
- csekély karbantartási igény
- CIP (helyben történő tisztítás)
Tervezés, gyártás és tanácsadás – Németországban készült minőség
A Hielscher ultrahangos készülékek a legmagasabb minőségi és tervezési követelmények teljesítéséről ismertek. Strapabíróságuk és egyszerű kezelésük lehetővé teszi ultrahangos készülékeink zökkenőmentes integrálását az ipari létesítményekbe. A Hielscher ultrahangos készülékek könnyedén megbirkóznak a zord körülményekkel és az igényes környezetekkel.
A Hielscher Ultrasonics ISO-tanúsítvánnyal rendelkező vállalat, amely különös hangsúlyt fektet a csúcstechnológiát és felhasználóbarát működést kínáló, nagy teljesítményű ultrahangos készülékekre. A Hielscher ultrahangos készülékek természetesen megfelelnek a CE előírásainak, valamint az UL, CSA és RoHs követelményeinek.
UIP400MTP érintkezésmentes ultrahangos kezelőberendezés metabolomikai minták előkészítéséhez mikrolemezekben.
Szakirodalom / Hivatkozások
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Gyakran ismételt kérdések a metabolomikai kutatásról
Mi a mikrobiom?
A mikrobiom egy adott környezetben, például az emberi szervezetben élő mikroorganizmusok – köztük baktériumok, vírusok, gombák és archeák – teljes közösségét, valamint genetikai anyagukat jelenti. Meghatározó szerepet játszik a gazdaszervezet egészségében azáltal, hogy befolyásolja az anyagcserét, az immunműködést és a kórokozók elleni védelmet, miközben olyan tényezők alakítják, mint az étrend, az életmód és a környezet.
Mi a metabolomika?
A metabolomika a metabolitok átfogó vizsgálata; ezek olyan kis molekulák, amelyek egy biológiai rendszer anyagcsere-folyamatai során keletkeznek. Magában foglalja e molekulák azonosítását, mennyiségi meghatározását és elemzését a sejtfunkciók, az anyagcsereútvonalak, valamint a genetikai, környezeti vagy kóros változásokra adott válaszaik megértése érdekében.
Mi a metabolom?
A metabolom egy biológiai rendszerben, például egy sejtben, szövetben vagy szervezetben egy adott időpontban jelen lévő kis molekulák, vagyis metabolitok teljes összessége. Tükrözi a rendszer biokémiai aktivitását és élettani állapotát, betekintést nyújtva az anyagcserébe és annak a környezettel való kölcsönhatásaiba.
A Hielscher Ultrasonics nagy teljesítményű ultrahangos homogenizátorokat gyárt a laboratóriumi mérettől az ipari méretig.


