A metabolomikát megkönnyíti a nagy áteresztőképességű szonikáció
A metabolomika az a kutatási terület, amely nagy áteresztőképességű technikákat alkalmaz a különböző biofluidumok, például vizelet, szérum, plazma, széklet és nyál kis molekuláinak jellemzésére és számszerűsítésére, egyedi metabolikus aláírásokat feltárva. A nagy áteresztőképességű szonikátor UIP400MTP, amelyet többlyukú lemezekhez terveztek, hatékony eszköz a sejtek lizálására ezekben a mintákban, megkönnyítve a metabolitok felszabadulását a downstream elemzéshez. Ez a precíz és megbízható megközelítés elengedhetetlen a metabolomikához, ahol a pontos vizsgálattervezés, az aprólékos mintaelőkészítés, az optimalizált platformbeállítás, az átfogó adatelemzés és az értelmes biológiai értelmezés a legfontosabb. A metabolomika mind célzott megközelítéseket alkalmaz, amelyek a molekulák bizonyos osztályaira, például szénhidrátokra, lipidekre és aminosavakra összpontosítanak, mind a nem célzott technikákat, amelyek széles körű áttekintést nyújtanak a mintán belüli metabolikus profilokról, feltárva a metabolikus jelátvitel bonyolult összetettségét.
A UIP400MTP egy érintésmentes, nagy áteresztőképességű szonikátor sejtlízishez és metabolit-extrakcióhoz többlyukú lemezeken
Nagy áteresztőképességű mintaelőkészítés a 96 lyukú lemezes szonikátorral UIP400MTP
Az érintésmentes ultrahangos UIP400MTP használata 96 lyukú lemezekkel kombinálva hatékony módszer a nagy áteresztőképességű homogenizáláshoz és a metabolitok extrakciójához. Ez a beállítás elkerüli a mintával való közvetlen érintkezést, csökkentve a keresztszennyeződés kockázatát több minta egyidejű feldolgozása során.
Lépésről lépésre protokoll homogenizáláshoz 96 lyukú szonikátorral UIP400MTP
- Metabolomikus minták előkészítése
A minta elhelyezése: Minden mintát (pl. székletet, bélszövetet vagy luminális tartalmat) adagoljon egy 96 lyukú lemez vagy mikrolemez egyedi vájataiba.
Oldószer: A szerves oldószerek, például a metanol, etanol, acetonitril, kloroform és ezek (vizes) keverékei elengedhetetlenek a metabolitok extrakciójához, elősegítve az intracelluláris metabolitok felszabadulását a sejtmátrixból. Vájatonként 100–300 μl oldószert használjon, biztosítva ezzel a minta teljes merítéséhez szükséges térfogatot.
Belső standardok: Opcionálisan adjon hozzá belső standardokat minden lyukhoz normalizáláshoz a későbbi metabolomikai elemzés során. - Csatlakozó közeg beállítása
Vízszint: Helyezze a 96well lemezt a vízzel (a kapcsolóközeggel) töltött ultrahangos platformra a kézikönyvben leírtak szerint. - UIP400MTP Paraméterek konfigurálása
Energiagazdálkodási beállítások: Állítsa be az ultrahangos amplitúdót a maximális teljesítmény 50–80% -ára a hatékony homogenizálás érdekében.
Impulzus mód: Állítsa be az ultrahangos ciklust alternatív impulzusokra (pl. 30 másodperc BE, 30 másodperc KI), hogy lehetővé tegye a hűtést és megakadályozza a minta túlmelegedését.
Teljes idő: 4–10 perc, a minta összetettségétől és szívósságától függően.
Hőmérséklet-szabályozás: Használjon laboratóriumi hűtőt, hogy a vizet 4–8 ° C-on tartsa szonikálás közben, hogy megvédje a hőérzékeny metabolitokat. - szonikációs folyamat
Indítsa el a UIP400MTP szonikációs ciklusokhoz.
Figyelje a folyamatot a UIP400MTP felületen keresztül.
A kavitációs hatás homogenizálja a mintákat és a liózus sejteket a vájatokban, felszabadítva az intracelluláris metabolitokat az oldószerbe. - PostSonication
Centrifugálás: Az ultrahangos kezelés után szükség esetén vigye át a lemez tartalmát a gyűjtőcsövekbe. Centrifugáljuk 4000–6000 × g hőmérsékleten 10 percig, hogy oldhatatlan törmeléket és sejtes anyagot pelletáljunk.
Felülúszó gyűjtemény: Óvatosan vigyük át a felülúszót minden vájatból új csövekbe vagy lemezekbe elemzés céljából.
Opcionális szárítás: Ha koncentrációra van szükség, vákuumkoncentrátor (pl. SpeedVac) segítségével szárítsuk meg a felülúszókat, majd kis térfogatú megfelelő oldószerben oldjuk fel.
Használja ki a UIP400MTP többlyukú lemezes szonikátor nagy áteresztőképességét, és könnyítse meg metabolomikai kutatását és elemzését!
UIP400MTP nagy áteresztőképességű szonikátor többlyukú lemezek, 96 lyukú lemezek, csövek és Petri-csészék metabolómiai kutatásához.
UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator nagy áteresztőképességű mintaelőkészítéshez metabolomikai kutatásokban.
Az érintésmentes szonikálás elve UIP400MTP
A UIP400MTP ultrahangos hullámokat alkalmaz egy 96 lyukú lemez kútjaira közvetetten, egy csatoló közegen (pl. Víz) keresztül. Ezek a hullámok kavitációt hoznak létre, amely megzavarja a sejteket és felszabadítja a metabolitokat anélkül, hogy fizikai érintkezésbe kerülne az ultrahangos szonda és a minta között.
“Azért írok, hogy megköszönjem fantasztikus tapasztalatainkat a UIP400MTP szonikátor használatával a széklet mikrobiom minták egységes és következetes bakteriális líziséhez. A nagy áteresztőképességű lízis technológia határait feszegetjük, és az Ön műszere kiválóan alkalmas a feladatra. Néhány a legfontosabb kiemelések közül:
- Könnyű kezelhetőség – A hangszer könnyen használható, és a testreszabás egyszerű a menüválasztásokkal
- Nagy áteresztőképesség – Kiválóan alkalmas lemezek kezelésére, egyszerre 96 mintával
- Még az összes hajó szonikálása – A készülék képes volt ugyanolyan mennyiségű szonikációt szállítani az összes kútba, ami döntő fontosságú volt alkalmazásunk szempontjából
- Támogatás a Hielscher csapatától – A támogatás kiváló volt, mindig ott voltál mellettünk a képzésen, hogy válaszolj a kérdéseinkre és foglalkozz a problémákkal, olyan javaslatokkal, amelyek segítettek elérni a célunkat.
Még egyszer köszönjük segítségét és segítségét, miközben protokolljaink optimalizálásán dolgoztunk.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Tudományos főigazgató – Intus Biosciences
A többlyukú lemezes szonikátor UIP400MTP megkönnyíti a nagy áteresztőképességű minta előkészítését, pl. a metabolitok kutatásában és elemzésében.
96-lyukú lemezes szonikátor UIP400MTP: Az ultrahang-átadó folyadék körülveszi az összes kutat, és minden minta egyenletes szonikálását biztosítja
A UIP400MTP többlyukú lemezes szonikátor főbb jellemzői
| Nagy áteresztőképességű szonikáció | Tökéletesen alkalmas 96-lyukú és más többlyukú lemezekhez, a UIP400MTP lehetővé teszi több minta egyidejű, azonos szonikálását, jelentősen lerövidítve a minta előkészítésének időtartamát és növelve a nagy mintaszámú tesztelés teljesítményét. |
| Használja az Ön által választott többlyukú lemezt | A UIP400MTP úgy tervezték, hogy szonikálja a szabványos multiwell lemezeket, PCR lemezeket vagy mikrotiter lemezeket. Ön kiválasztja a kísérleteihez legmegfelelőbb lemezt. Mivel a UIP400MTP nem igényel szabadalmaztatott fogyóeszközöket, ez sok pénzt takarít meg! |
| Érintés nélküli ultrahangos kezelés | A Multiwell Plate Sonicator intenzív ultrahangot alkalmaz UIP400MTP anélkül, hogy bármit is behelyezne a mintába. Szonikálhatja az ealed multiwell lemezeket, zárt edényeket és injekciós üvegeket. A Hielscher testreszabott mintatartókat szállít minden nem szabványos injekciós üveghez vagy edényhez. |
| Precizitás és ellenőrzés | A precíziós vezérlés és az intelligens szoftver lehetővé teszi az ultrahangos paraméterek optimális beállítását az Ön egyedi feldolgozási igényeinek megfelelően. Maximális szonikációs hatékonyságot és hatékonyságot kap minden kísérlethez. |
| hőmérséklet-szabályozás | Állítson be egy adott hőmérsékletet az ultrahangos kezeléshez. A UIP400MTP lemezes szonikátor figyelemmel kísérheti a minta hőmérsékletét, és ennek megfelelően beállíthatja az ultrahangos kezelést. A recirkulációs hűtőfolyadék lehűti a lemez minden vájatát a pontos hőmérséklet-szabályozás érdekében. |
| Protokollálás és távvezérlés | Minden szonikációs futás számítógépről vezérelhető. Nincs szükség szoftver telepítésére. Használhatja szabványos böngészőjét (pl. Chrome, Firefox, Edge vagy Safari) bármely operációs rendszeren (pl. MacOS, Windows, Android, iOS vagy Linux) a UIP400MTP távoli vezérléséhez és felügyeletéhez. Minden szonikációs futás részletes szonikációs protokollt hoz létre az értékeléshez és a dokumentációhoz. A protokollfájl nem védett CSV formátumú, amelyet a kívánt programmal, például Microsoft Excel, Apple Numbers vagy OpenOffice Calc programmal nyithat meg. |
| Robusztus és megbízható | A Németországban a legmagasabb minőségi előírásoknak megfelelően tervezett és gyártott UIP400MTP nemcsak erőteljes, hanem rendkívül tartós is. Kialakítása megfelel az ipari szabványoknak, és könnyen ellenáll a mindennapi használat megpróbáltatásainak egy igényes laboratóriumi környezetben. A UIP400MTP folyamatosan használhatja a hét 7 napján, 24 órában nagy átviteli sebességű műveletekben. |
- nagy hatékonyság
- A legkorszerűbb technológia
- megbízhatóság & Erőteljesség
- állítható, precíz folyamatvezérlés
- intelligens szoftver
- intelligens funkciók (pl. programozható, adatprotokoll, távirányító)
- könnyen és biztonságosan kezelhető
- Alacsony karbantartási igény
- CIP (helyben tisztítható)
Tervezés, gyártás és tanácsadás – Németországban gyártott minőség
A Hielscher ultrahangos készülékek jól ismertek a legmagasabb minőségi és tervezési szabványokról. A robusztusság és a könnyű kezelhetőség lehetővé teszi ultrahangos készülékeink zökkenőmentes integrálását ipari létesítményekbe. A durva körülmények és az igényes környezetek könnyen kezelhetők Hielscher ultrasonicators.
Hielscher Ultrasonics egy ISO tanúsítvánnyal rendelkező cég, és különös hangsúlyt fektet a nagy teljesítményű ultrasonicatorokra, amelyek a legmodernebb technológiát és felhasználóbarátságot mutatják. Természetesen a Hielscher ultrasonicators CE-kompatibilis és megfelel az UL, CSA és RoHs követelményeinek.
Érintésmentes ultrahangos UIP400MTP metabolómiai mintaelőkészítéshez mikrolemezeken.
Irodalom / Hivatkozások
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Gyakran ismételt kérdések a metabolomikai kutatásról
Mi a mikrobiom?
A mikrobiom a mikroorganizmusok kollektív közösségére utal, beleértve a baktériumokat, vírusokat, gombákat és archeákat, valamint genetikai anyagukat, amelyek egy adott környezetben, például az emberi testben élnek. Kritikus szerepet játszik a gazdaszervezet egészségében azáltal, hogy befolyásolja az anyagcserét, az immunrendszer működését és a kórokozók elleni védelmet, miközben olyan tényezők alakítják, mint az étrend, az életmód és a környezet.
Mi az a metabolomika?
A metabolomika a metabolitok átfogó vizsgálata, amelyek a biológiai rendszeren belüli anyagcsere-folyamatok során keletkező kis molekulák. Ez magában foglalja ezeknek a molekuláknak az azonosítását, mennyiségi meghatározását és elemzését, hogy megértsük a sejtfunkciókat, az anyagcsere-útvonalakat és azt, hogy hogyan reagálnak a genetikai, környezeti vagy patológiai változásokra.
Mi az a metabolom?
A metabolom a biológiai rendszerben, például egy sejtben, szövetben vagy szervezetben egy adott időpontban jelen lévő kis molekulák vagy metabolitok teljes halmaza. Tükrözi a rendszer biokémiai aktivitását és fiziológiai állapotát, betekintést nyújtva az anyagcserébe és annak kölcsönhatásába a környezettel.
Hielscher Ultrasonics gyárt nagy teljesítményű ultrahangos homogenizátorok labor hoz ipari méret.