Bioteknisten solujen ultraäänilyysi teollisessa tuotannossa
Biomuokattuja bakteerilajeja, kuten E. colia, sekä geneettisesti muunnettuja nisäkäs- ja kasvisolutyyppejä käytetään laajalti biotekniikassa molekyylien ilmentämiseen. Näiden syntetisoitujen biomolekyylien vapauttamiseksi tarvitaan luotettava solujen häiriötekniikka. Korkean suorituskyvyn ultrasonication on todistettu menetelmä tehokkaalle ja luotettavalle solulyysille – helposti skaalattavissa suuriin tuotantomääriin. Hielscher Ultrasonics tarjoaa sinulle korkean suorituskyvyn ultraäänilaitteita tehokkaaseen solulyysiin, jotta voidaan tuottaa suuria määriä korkealaatuisia biomolekyylejä.
Molekyylien uuttaminen solutehtaista
Monenlaisten biomolekyylien tuottamiseen voidaan käyttää erilaisia muokattuja mikrobeja ja kasvisoluja mikrobisolutehtaina, mukaan lukien Escherichia coli, Bacillus subtilis, Pseudomonas putida, Streptomyces, Corynebacterium glutamicum, Lactococcus lacti, syanobakteerit, Saccharomyces cerevisiae, Pichia pastoris, Yarrowia lipolytica, Nicotiana benthamiana ja levät. Nämä solutehtaat voivat tuottaa proteiineja, lipidejä, biokemikaaleja, polymeerejä, biopolttoaineita ja öljykemikaaleja, joita käytetään elintarvikkeina tai raaka-aineina teollisissa sovelluksissa. Solutehtaina käytettäviä soluja viljellään suljetuissa bioreaktoreissa, joissa niillä voidaan saavuttaa korkea hyötysuhde, spesifisyys ja alhainen energiantarve.
Kohdemolekyylien eristämiseksi biomuokatuista soluviljelmistä solut on hajotettava niin, että solunsisäinen materiaali vapautuu. Ultraäänisolujen häiritsijät ovat vakiintuneita erittäin luotettavana ja tehokkaana tekniikkana solujen hajoamiseen ja yhdisteiden vapautumiseen.
Ultraäänisolujen häiritsijöiden edut
Ei-lämpöisenä, lievänä, mutta erittäin tehokkaana teknologiana ultraäänihäiritsijöitä käytetään laboratoriossa ja teollisuudessa solujen hajottamiseen ja korkealaatuisten uutteiden tuottamiseen, esimerkiksi molekyylien eristämiseen solutehtaista.
- Erittäin tehokas
- Ei-terminen, ihanteellinen lämpötilaherkille aineille
- Luotettavat, toistettavat tulokset
- Tarkka käsittelyn ohjaus
- Lineaarinen skaalautuva suurempiin tuotantomääriin
- Saatavana teolliseen tuotantokapasiteettiin
Teho-ultraääni mikrobisolutehtaiden tehokkaaseen hajottamiseen
Ultraäänisolujen häiritsijöiden mekanismi ja vaikutukset:
Ultraäänisolujen häiriöt käyttivät ultraääniaaltojen voimaa. Ultraäänihomogenisaattori / soluhäiritsijä on varustettu titaaniseoksesta valmistetulla anturilla (alias sonotrode), joka värähtelee korkealla taajuudella noin 20 kHz. Tämä tarkoittaa, että ultraäänianturi yhdistää 20 000 tärinää sekunnissa sonikoituun nesteeseen. Nesteeseen kytketyille ultraääniaalloille on tunnusomaista vuorottelevat korkeapaine- / matalapainesyklit. Matalapainejakson aikana neste laajenee ja syntyy pieniä tyhjiökuplia. Nämä hyvin pienet kuplat kasvavat useiden vuorottelevien painesyklien aikana, kunnes ne eivät pysty absorboimaan enempää energiaa. Tässä vaiheessa kavitaatiokuplat luhistuvat rajusti ja luovat paikallisesti poikkeuksellisen energiatiheän ympäristön. Tätä ilmiötä kutsutaan akustiseksi kavitaatioksi, ja sille on ominaista paikallisesti erittäin korkeat lämpötilat, erittäin korkeat paineet ja leikkausvoimat. Nämä leikkausjännitykset rikkovat tehokkaasti soluseinät ja lisäävät massansiirtoa solun sisäosan ja ympäröivän liuottimen välillä. Puhtaasti mekaanisena tekniikkana ultraäänellä tuotettuja leikkausvoimia käytetään laajalti ja suositeltua menettelyä bakteerisolujen häiriöihin sekä proteiinien eristämiseen. Yksinkertaisena ja nopeana solujen häiriömenetelmänä sonikaatio on ihanteellinen pienten, keskisuurten ja suurten määrien eristämiseen. Hielscherin digitaaliset ultraäänilaitteet on varustettu selkeällä asetusvalikolla tarkkaa sonikaatiota varten. Kaikki sonikaatiotiedot tallennetaan automaattisesti sisäänrakennetulle SD-kortille ja ovat yksinkertaisesti käytettävissä. Kehittyneet lämmöntuottovaihtoehdot, kuten ulkoinen jäähdytys, sonikaatio pulssitilassa jne., Ultraäänihajoamisprosessin aikana varmistavat ihanteellisen prosessilämpötilan säilymisen ja siten uutettujen lämpöherkkien yhdisteiden eheyden.
Tutkimus korostaa ultraäänisolujen häiriöiden ja uuttamisen vahvuuksia
(2017) jatkaa tutkimuksessaan, että "ultraääniavusteinen uuttaminen on vihreä ja taloudellisesti kannattava vaihtoehto tavanomaisille elintarvikkeiden ja luonnontuotteiden tekniikoille. Tärkeimmät edut ovat uutto- ja käsittelyajan lyheneminen, käytetyn energian ja liuottimien määrä, yksikkötoiminnot ja CO2 päästöjä."
(2014) käytti tutkimuksessaan korkeapainehomogenisaattoria ja ultraäänisolujen dsintegraattoria itiöiden hajottamiseksi DNA: n vapauttamiseksi. Vertaamalla molempia solun häiriömenetelmiä tutkimusryhmä päättelee, että itiö-DNA: n solulyysin osalta "analyysi on tehty käyttämällä solulysaatteja korkeapainehomogenisoinnista. Jälkeenpäin tajusimme, että ultraäänisolujen häiriöllä on erinomaiset edut tähän tarkoitukseen. Se on melko nopea ja sitä voidaan käsitellä pienillä näytemäärillä." (Gabig-Ciminska et ai., 2014)
Solutehtaiden biomolekyylejä ruoantuotantoon
Mikrobisolutehtaat ovat toteuttamiskelpoinen ja tehokas tuotantomenetelmä, jossa käytetään mikrobiorganismeja tuottamaan suuria natiivien ja ei-kotoperäisten metaboliittien saantoja mikrobien mikro-organismien, kuten bakteerien, hiivojen, sienien jne., metabolisen biotekniikan avulla. Bulkkientsyymejä tuotetaan esimerkiksi käyttämällä mikro-organismeja, kuten Aspergillus oryzae, sieniä ja bakteereja. Näitä irtoentsyymejä käytetään elintarvikkeiden ja juomien tuotannossa sekä maataloudessa, bioenergiassa ja kodinhoidossa.
Tietyt bakteerit, kuten Acetobacter xylinum ja Gluconacetobacter xylinus, tuottavat selluloosaa käymisprosessin aikana, jossa nanokuidut syntetisoidaan alhaalta ylöspäin suuntautuvassa prosessissa. Bakteeriselluloosa (tunnetaan myös nimellä mikrobiselluloosa) vastaa kemiallisesti kasviselluloosaa, mutta sillä on korkea kiteisyysaste ja korkea puhtaus (vapaa ligniinistä, hemiselluloosasta, pektiinistä ja muista biogeenisistä komponenteista) sekä ainutlaatuinen rakenne selluloosa-nanokuitukudotusta kolmiulotteisesta (3D) verkkoverkosta. (vrt. Zhong, 2020) Kasviperäiseen selluloosaan verrattuna bakteeriselluloosa on kestävämpää ja tuotettu selluloosa on puhdasta eikä vaadi monimutkaisia puhdistusvaiheita. Ultrasonication ja liuottimen uuttaminen käyttämällä NaOH: ta tai SDS: ää (natriumdodekyylisulfaatti) ovat erittäin tehokkaita bakteeriselluloosan eristämiseksi bakteerisoluista.
Solutehtaiden biomolekyylejä lääke- ja rokotetuotantoon
Yksi merkittävimmistä solutehtaista peräisin olevista farmaseuttisista tuotteista on ihmisinsuliini. Biomuokatun insuliinin tuotannossa käytetään pääasiassa E. colia ja Saccharomyces cerevisiaeta. Koska biosyntetisoidut nanokokoiset molekyylit tarjoavat korkean biologisen yhteensopivuuden, biologiset nanohiukkaset, kuten ferritiini, ovat edullisia lukuisissa biovalmistussovelluksissa. Lisäksi metabolisesti muokattujen mikrobien tuotanto on usein huomattavasti tehokkaampaa saaduissa saannoissa. Esimerkiksi artemisiinihapon, resveratrolin ja lykopeenin tuotanto on kymmenkertaistunut useisiin satoihin, ja se on jo vakiintunut tai kehitteillä teollisen mittakaavan tuotantoon. (vrt. Liu et al.; Mikrobi. Solun tosiasia. 2017)
Esimerkiksi proteiinipohjaiset nanokokoiset biomolekyylit, joilla on itsejärjestäytyviä ominaisuuksia, kuten ferritiini ja viruksen kaltaiset hiukkaset, ovat erityisen mielenkiintoisia rokotteiden kehittämisen kannalta, koska ne jäljittelevät sekä patogeenien kokoa että rakennetta ja ovat alttiita antigeenien pintakonjugaatiolle vuorovaikutuksen edistämiseksi immuunisolujen kanssa. Tällaiset molekyylit ilmentyvät niin sanotuissa solutehtaissa (esim. muokatut E. coli -kannat), jotka tuottavat tietyn kohdemolekyylin.
Protokolla ultraäänilyysille ja E. coli BL21 ferritiinin vapautumiselle
Ferritiini on proteiini, jonka ensisijainen tehtävä on raudan varastointi. Ferritiinillä on lupaavia ominaisuuksia itsejärjestäytyvinä nanohiukkasina rokotteissa, joissa sitä käytetään rokotteiden annosteluvälineenä (esim. SARS-Cov-2-piikkiproteiinit). Tieteellinen tutkimus Sun et. (2016) osoittaa, että rekombinantti ferritiini voidaan vapauttaa liukoisena muotona Escherichia colista alhaisilla NaCl-pitoisuuksilla (≤50 mmol/l). Ferritiinin ilmentämiseksi E. coli BL21: ssä ja ferrtiinin vapauttamiseksi seuraavaa protokollaa sovellettiin onnistuneesti. Rekombinantti pET-28a/ferritiiniplasmidi muunnettiin E coli BL21 (DE3) -kannaksi. Ferritiini E coli BL21 (DE3) -soluja viljeltiin LB-kasvualustassa 0,5-prosenttisella kanamysiinillä 37 °C:ssa ja indusoitiin OD600-arvolla 0,6 0,4-prosenttisella isopropyyli-β-D-tiogalaktopyranosidilla 3 tunnin ajan 37 °C:ssa. Lopullinen viljelmä kerättiin sitten sentrifugoimalla 8000 g:ssa 10 minuutin ajan 4 °C:ssa, ja pelletti kerättiin. Sitten pelletti suspendoitiin uudelleen LB-väliaineeseen (1% NaCl, 1% typone, 0,5% hiivauute) / lyysipuskuriin (20 mmol/l Tris, 50 mmol/l NaCl, 1 mmol/l EDTA, pH 7,6) ja eri pitoisuuksiin NaCl-liuosta (0, 50, 100, 170 ja 300 mmol/l). Bakteerisolujen lyysiä varten sonikaatiota sovellettiin pulssitilassa: esimerkiksi käyttämällä Ultraäänilaite UP400St 100 %:n amplitudilla käyttösuhteen ollessa 5 sekuntia päällä, 10 sekuntia pois päältä, 40 syklin ajan) ja sentrifugoidaan sitten 10 000 g:ssa 15 minuutin ajan 4 °C:ssa. Supernatantti ja sakka analysoitiin natriumdodekyylisulfaattipolyakryyliamidigeelielektroforeesilla (SDS-PAGE). Kaikki natriumdodekyylisulfaatilla värjätyt geelit skannattiin korkean resoluution skannerilla. Geelikuvat analysoitiin Magic Chemi 1D -ohjelmistolla. Optimaalisen selkeyden saavuttamiseksi proteiininauhat havaittiin säätämällä parametreja. Kaistojen tiedot tuotettiin teknisistä kolmosista. (vrt. Sun et al., 2016)
Ultraäänisolujen häiritsijät solutehtaiden teolliseen lyysiin
Ultraäänilyysi ja uuttaminen on luotettava ja mukava menetelmä metaboliittien vapauttamiseksi solutehtaista, mikä auttaa kohdemolekyylien tehokasta tuotantoa. Ultraäänisolujen häiritsijöitä on saatavana laboratoriosta teolliseen kokoon ja prosessit voidaan skaalata täysin lineaarisiksi.
Hielscher Ultrasonics on pätevä kumppanisi korkean suorituskyvyn ultraäänihäiriöille ja sillä on pitkäaikainen kokemus ultraäänijärjestelmien istuttamisesta penkki- ja teollisuusympäristöissä.
Mitä tulee hienostuneisiin laitteistoihin ja ohjelmistoihin, Hielscher Ultrasonics -solujen häiriöjärjestelmät täyttävät kaikki optimaalisen prosessinohjauksen, helpon käytön ja käyttäjäystävällisyyden vaatimukset. Hielscher-ultraäänilaitteiden asiakkaat ja käyttäjät arvostavat Hielscherin ultraäänisolujen häiritsijöiden ja uuttimien tarjoamaa hyötyä prosessin tarkasta seurannasta ja ohjauksesta – digitaalisen kosketusnäytön ja selaimen kaukosäätimen kautta. Kaikki tärkeät sonikaatiotiedot (esim. nettoenergia, kokonaisenergia, amplitudi, kesto, lämpötila, paine) tallennetaan automaattisesti CSV-tiedostona integroidulle SD-kortille. Tämä auttaa saamaan toistettavia ja toistettavia tuloksia ja helpottaa prosessien standardointia sekä hyvien tuotantotapojen (cGMP) noudattamista.
Tietenkin, Hielscherin ultraääniprosessorit on rakennettu 24/7 toimintaan täydellä kuormituksella, ja siksi niitä voidaan käyttää luotettavasti teollisessa tuotannossa. Korkean kestävyyden ja vähäisen huollon vuoksi ultraäänilaitteiden seisokit ovat todella alhaiset. CIP (clean-in-place) ja SIP (steriloi-in-place) -ominaisuudet minimoivat työlään puhdistuksen, varsinkin kun kaikki märkäosat ovat sileitä metallipintoja (ei piilotettuja aukkoja tai suuttimia).
Alla oleva taulukko antaa sinulle viitteitä ultraäänilaitteidemme likimääräisestä käsittelykapasiteetista:
Erän tilavuus | Virtausnopeus | Suositellut laitteet |
---|---|---|
1 - 500 ml | 10 - 200 ml / min | UP100H |
10 - 2000ml | 20–400 ml/min | UP200Ht, UP400St |
0.1 - 20L | 0.2–4 l/min | UIP2000hdT |
10-100L | 2 - 10L / min | UIP4000hdT |
n.a. | 10-100L / min | UIP16000 |
n.a. | suurempi | klusteri UIP16000 |
Ota yhteyttä! / Kysy meiltä!
Kirjallisuus / Viitteet
- Sun, W., Jiao, C., Xiao, Y., Wang, L., Yu, C., Liu, J., Yu, Y., Wang, L. (2016):Salt-Dependent Aggregation and Assembly of E Coli-Expressed Ferritin. Dose-Response, March 2016.
- Rodrigues, M.Q.; Alves, P.M.; Roldão, A. (2021): Functionalizing Ferritin Nanoparticles for Vaccine Development. Pharmaceutics 2021, 13, 1621.
- Farid Chemat, Natacha Rombaut, Anne-Gaëlle Sicaire, Alice Meullemiestre, Anne-Sylvie Fabiano-Tixier, Maryline Abert-Vian (2017): Ultrasound assisted extraction of food and natural products. Mechanisms, techniques, combinations, protocols and applications. A review. Ultrasonics Sonochemistry, Volume 34, 2017. 540-560.
- Villaverde, Antonio (2010): Nanotechnology, bionanotechnology and microbial cell factories. Microbial Cell Factories 2010 9:53.
Faktoja, jotka kannattaa tietää
Sono-bioreaktorit
Ultraääntä käytetään toisaalta solujen häiritsemiseen solunsisäisten yhdisteiden vapauttamiseksi, mutta sitä käytetään lievemmillä amplitudilla ja / tai sykkivinä ultraäänipurskeina, sonikaatio voi suuresti parantaa mikrobi-, kasvi- ja eläinsolujen metabolista tuottavuutta bioreaktoreissa, mikä tehostaa bioteknologisia prosesseja. Ultraäänianturit voidaan yksinkertaisesti integroida bioreaktoreihin (ns. sono-bioreaktoreihin) elävien biokatalyyttien tehokkuuden tehostamiseksi. Hielscher-ultraäänilaitteet mahdollistavat tarkasti kontrolloidut ultraääniolosuhteet, jotka voidaan hienosäätää optimaalisesti elävien solujen korkeaan katalyyttiseen muuntamiseen. Lisätietoja Hielscherin ultraääniantureista sonobioreaktoreille ja ultraäänellä tehostetun biokatalyysin vaikutuksista!
Solutehtaat ja metaboliittien synteesi
Eri mikro-organismit voivat syntetisoida samanlaisia metaboliitteja, esimerkiksi aminohappojen Corynebacterium-, Brevibacterium- ja Escherichia coli -bakteerien tuottamiseksi on käytetty onnistuneesti; vitamiinit hae syntetisoitu käyttämällä Propionibacteriumia ja Pseudomonasia; orgaaniset hapot ovat peräisin Aspergilluksesta, Lactobacilluksesta, Rhizopusista; kun taas entsyymejä voivat valmistaa Aspergillus ja Bacillus; antibiootteja voivat tuottaa Streptomyces ja Penicillium; kun taas biopinta-aktiivisten aineiden tuotannossa yleisesti muodostuneita Pseudomonasia, Bacillusta ja Lactobacillusta käytetään solutehtaina.
E. coli mikrobisolutehtaina
E. coli -bakteeria ja sen lukuisia kantoja käytetään laajalti molekyylibiologiassa ja siitä on tullut yksi ensimmäisistä tehokkaista solumalleista, joita käytettiin mikrobisolutehtaina rekombinanttiproteiinien, biopolttoaineiden ja monien muiden kemikaalien tuotantoon. E. coli -bakteerilla on luonnollinen kyky tuottaa useita yhdisteitä, jota on parannettu biotekniikalla ja geneettisillä muunnoksilla. Esimerkiksi siirtämällä heterologisia entsyymejä E. colin kykyä tuottaa lukuisia tuotteita on muutettu uusien biosynteettisten reittien kehittämiseksi.
(Antonio Valle, Jorge Bolívar: Chapter 8 – Escherichia coli, the workhorse cell factory for the production of chemicals. In: Editor(s): Vijai Singh, Microbial Cell Factories Engineering for Production of Biomolecules, Academic Press, 2021. 115-137.)
Streptomyces mikrobisolutehtaina
Streptomyces on suurin aktinomykeettien ryhmä; Streptomyces-lajit ovat yleisiä vesi- ja maaekosysteemeissä. Streptomyces-suvun jäsenet ovat kaupallisesti kiinnostavia, koska ne kykenevät tuottamaan valtavan määrän biomolekyylejä ja bioaktiivisia sekundaarisia metaboliitteja. Se tuottaa kliinisesti hyödyllisiä antibiootteja, kuten tetrasykliinejä, aminoglykosideja, makrolideja, kloramfenikolia ja rifamysiiniä. Antibioottien lisäksi Streptomyces tuottaa myös muita erittäin arvokkaita farmaseuttisia tuotteita, kuten syöpälääkkeitä, immunostimuloivia, immunosuppressiivisia, antioksidatiivisia aineita, hyönteismyrkkyjä ja loislääkkeitä, joilla on laajat lääketieteelliset ja maataloussovellukset.
Streptomyces-lajit tuottavat useita entsyymejä, jotka ovat lääketieteellisesti tärkeitä, mukaan lukien L-asparaginaasi, urikaasi ja kolesterolioksidaasi. Monet aktinomykeetit voivat tuottaa teollisesti tärkeitä entsyymejä, kuten sellulaaseja, kitinaaseja, kitosaaseja, α-amylaasia, proteaaseja ja lipaaseja. Monet aktinomykeetit voivat tuottaa erilaisia pigmenttejä, jotka ovat mahdollisesti hyvä vaihtoehto synteettisille väreille. Streptomyces-lajeilla on suuri kyky tuottaa aktiivisia pinnan biomolekyylejä, mukaan lukien bioemulgointiaineet ja biopinta-aktiiviset aineet. Antidiabeettinen akarboosi tuotettiin Streptomyces-kannoilla mikrobikäymisen kautta. Streptomyces-lajit ovat osoittaneet kyvyn syntetisoida kolesterolisynteesin estäjiä, kuten pravastatiinia. Viime aikoina Streptomyces-lajeja voidaan käyttää ympäristöystävällisinä "nanotehtaina" nanohiukkasten synteesiin. Jotkut Streptomyces-lajit ovat lupaavia B12-vitamiinin tuotannossa.
(Noura El-Ahmady El-Naggar: Chapter 11 – Streptomyces-based cell factories for production of biomolecules and bioactive metabolites, In: Editor(s): Vijai Singh, Microbial Cell Factories Engineering for Production of Biomolecules, Academic Press, 2021. 183-234.)