Pienimmän inhibitoripitoisuuden (MIC) määritysprotokolla
Biofilmipohjainen MIC-määritys (Minimum Inhibitory Concentration) on olennainen menetelmä arvioitaessa mikrobilääkkeiden tehokkuutta biofilmeihin liittyviä mikro-organismeja vastaan, joilla on lisääntynyt resistenssi suojaavan soluväliaineensa vuoksi. Ratkaiseva vaihe tässä määrityksessä on biofilmirakenteiden häiriöt sulautettujen solujen vapauttamiseksi tarkkaa elinkelpoisuuden arviointia varten. UIP400MTP monikuoppainen levysonikoija helpottaa tätä prosessia käyttämällä kohdennettua ultraääntä kontrolloidun kavitaation tuottamiseksi, irrottamalla tehokkaasti biofilmisolut ja hajottamalla ne yhtenäiseen suspensioon. Tämä tarkka ja toistettavissa oleva biofilmihäiriö parantaa MIC-määritysten luotettavuutta ja suorituskykyä, mikä tekee UIP400MTP olennaisen työkalun biofilmitutkimuksen edistämisessä.
Sonikaatio biofilmin irtoamiseen
Biofilmipohjainen MIC-määritys mittaa tyypillisesti bakteerien elinkelpoisuutta tai kasvun estymistä käyttämällä menetelmiä, kuten pinnoitusta, pesäkkeiden laskentaa tai optisen tiheyden mittauksia. Sonikaatio on kriittinen vaihe biofilmipohjaisissa MIC-määrityksissä, kun arvioidaan biofilmiin liittyvien mikro-organismien antimikrobista herkkyyttä. Sen ensisijainen tehtävä on irrottaa ja hajottaa biofilmimatriisiin upotetut solut yhtenäiseksi suspensioksi tarkkaa analyysiä varten.
Biokalvot ovat huomattavasti vastustuskykyisempiä antimikrobisille aineille kuin planktoniset solut, mikä tekee asianmukaisesta irtoamisesta kriittisen tarkan analyysin kannalta. Tämän prosessin aikana ultraääniaallot tuottavat kontrolloitua kavitaatiota, hajottavat biofilmimatriisin ja vapauttavat sulautetut solut yhtenäiseksi suspensioksi talteenottoväliaineessa. Tämä vaihe mahdollistaa biofilmiin dispergoituneiden solujen tarkan elinkykyisyyden arvioinnin menetelmillä, kuten pinnoitus, laimennus ja pesäkkeiden laskenta. Oikea biofilmin häiriö sonikaatiolla estää jäljellä olevia matriisikomponentteja suojaamasta soluja, mikä voisi muuten johtaa antimikrobisen aktiivisuuden aliarviointiin. Monikuoppainen levysoitin UIP400MTP soveltuu erityisen hyvin tähän tarkoitukseen, ja se tarjoaa tarkat ja toistettavat sonikaatio-olosuhteet määrityslevyjen luotettavan ja korkean suorituskyvyn valmistuksen varmistamiseksi.
UIP400MTP mikrolevyn sonikaattori tarkasti kontrolloitavaan biofilmin irtoamiseen MIC- ja MBEC-määrityksissä.
Miksi sonikaatio on välttämätöntä biofilmipohjaisissa vähimmäisinhibitrorypitoisuusmäärityksissä
Elinkykymittauksia ja solujen laskentaa varten tarvitaan yksittäisten solujen täydellinen ja luotettava irtoaminen ja leviäminen. UIP400MTP edistää tasaista, vahingoittamatonta biofilmin irtoamista ja solujen dispersiota luotettavien määritystulosten saavuttamiseksi.
- Biofilmin monimutkaisuus: Biofilmit ovat strukturoituja mikrobiyhteisöjä, jotka on koteloitu solunulkoiseen polymeeriseen ainematriisiin (EPS), joka suojaa mikro-organismeja ja tekee niistä vastustuskykyisempiä antimikrobisille aineille.
- Tasainen hajonta: Jotta biofilmiin upotettujen solujen elinkykyä tai herkkyyttä mikrobilääkkeille voidaan mitata tarkasti, biofilmi on ensin irrotettava ja hajotettava homogeeniseksi suspensioksi.
Biofilmipohjainen pienimmän inhiboivan pitoisuuden määritysprotokolla
Minimum Inhibitory Concentration (MIC) -määritys määrittää mikrobilääkkeen pienimmän pitoisuuden, joka tarvitaan mikro-organismien näkyvän kasvun estämiseen. Tämä protokolla on suunniteltu biofilmiin liittyville mikro-organismeille, UIP400MTP käytetään monikuoppaista levysonikaattoria biofilmin häiritsemiseen.
Vaihe 1: Bakteeri-inokulaatin valmistus
- Valmistele bakteerisuspensio:
Kasvata bakteereja sopivassa väliaineessa logaritmisen vaiheen puoliväliin.
Viljelmä laimennetaan standardoidun solutiheyden saavuttamiseksi (esim. 0,5 McFarlandin standardi tai OD600 ~0,1). - Valmistele antimikrobisia liuoksia:
Antimikrobinen aine laimennetaan sopivaan väliaineeseen pitoisuusalueen luomiseksi (esim. kaksinkertaiset sarjalaimennokset). - Annostele 96kuoppalevyyn:
Antimikrobiset liuokset lisätään tavallisen 96-kuoppaisen levyn kuoppiin, jolloin lopullinen kuoppatilavuus on ~150–200 μl.
Sisältää kasvukontrollit (ei antimikrobista) ja steriiliyskontrollit (ei bakteeri-inokulaattia).
Vaihe 2: Biofilmin muodostuminen tapin kannessa
- Kiinnitä tapin kansi:
Aseta erikoistapin kansi inokuloituihin kuoppiin varmistaen, että tapit ovat täysin upotettuina bakteerisuspensioon. - Inkuboidaan levyä:
Inkuboidaan sopivassa lämpötilassa (esim. 37 °C) määrätyn ajan (esim. 24 tuntia) staattisissa olosuhteissa, jotta tappeihin muodostuu biokalvoa. - Huuhtele nastat:
Poista tapin kansi bakteerisuspensiosta ja huuhtele varovasti steriilillä suolaliuoksella tai PBS:llä löysästi kiinnittyneiden planktonisten solujen poistamiseksi. - Altistu mikrobilääkkeille:
Siirrä tapin kansi uuteen 96well-levyyn, joka sisältää aiemmin valmistetut antimikrobiset laimennokset.
Inkuboidaan määrätyn ajan (esim. 24 tuntia) staattisissa olosuhteissa, jotta mikrobilääke voi vaikuttaa biofilmeihin.
Vaihe 3: Altistuminen mikrobilääkkeille
Multi-well-levyn sonikaattori UIP400MTP suuren suorituskyvyn näytteen valmistukseen
Vaihe 4: Sonikaatio Microplate Sonicator -UIP400MTP kanssa
Sonikaatiovaihe on kriittinen biokalvojen irrottamiseksi tapin kansista elinkelpoisuuden arvioimiseksi. Noudata näitä ohjeita UIP400MTP sonicatorille:
- Valmistele asennus:
Täytä tuore 96-kuoppainen levy keräysaineella (esim. neutraloivalla liemellä tai steriilillä kasvualustalla) jokaisessa kuopassa. - Siirrä tapin kansi:
Poista tapin kansi antimikrobisesta hoitolevystä.
Huuhtele tapin kansi steriilillä suolaliuoksella tai PBS:llä antimikrobisten aineiden jäämien poistamiseksi. - Aseta levy sonikaattoriin:
Kiinnitä tapin kansi keräysväliainelevyyn.
Aseta talteenottoväliainelevy UIP400MTP sonikaattoriin varmistaen, että levy istuu keskellä ja vakaasti kuvatun käsikirjan mukaisesti. - Säädä sonikaatioparametreja:
Aseta sonikaatioparametrit UIP400MTP (asetukset voidaan säätää biofilmiin):
Amplitudi: 70–100%.
Sonikaatioaika: 1–3 minuuttia (säädä biofilmin rakenteen perusteella) syklitilassa. - Sonikaatti:
Aloita sonikaatioprosessi. Ultraääniaallot häiritsevät biofilmimatriisia ja syrjäyttävät solut talteenottoväliaineeseen. - Seuraa prosessia:
Käytä kytkettävää lämpötila-anturia näytteen lämpötilan seuraamiseen kaivoissa. UIP400MTP voidaan liittää laboratoriojäähdyttimeen jäähdytystä varten. - Post-sonication-käsittely:
Irronneita biokalvoja sisältävä keräysaine siirretään välittömästi tuoreelle steriilille levylle myöhempää analyysia varten.
A) TSB:tä sisältävä levy, jossa on 2 % glukoosia ja jota käytetään biofilmin muodostukseen, solujen talteenottoon sekä MIC:n ja MBEC:n määrittämiseen; B) Kansi, jossa on tapit stafylokokkibiofilmien muodostamiseksi.
Nastoille muodostetut biofilmisolut irrotettiin sonikaatiolla (Hielscher Ultrasound Technology) 5 minuutin ajan 96-kuoppalevyissä, jotka sisälsivät tuoretta viljelyalustaa solujen talteenottoa varten.
(Kuva ja tutkimus: ©de Oliveira et ai., 2016)
Vaihe 4: Elinkelpoisuuden arviointi
Levy- ja viljelmäirrotetut biofilmit:
- Keräyselatusaine ja malja laimennetaan sarjalaimennoksina agarille pesäkkeitä muodostavien yksiköiden (CFU) luettelemiseksi.
- Arvioi MIC:
Määritä MIC pienimmäksi antimikrobiseksi pitoisuudeksi, joka estää täysin näkyvän mikrobikasvun talteenottoväliaineessa.
Suunnittelu, valmistus ja konsultointi – Laatu valmistettu Saksassa
Hielscher-ultraääniastiat ovat tunnettuja korkeimmista laatu- ja suunnittelustandardeistaan. Kestävyys ja helppokäyttöisyys mahdollistavat ultraäänilaitteidemme sujuvan integroinnin teollisuuslaitoksiin. Hielscherin sonikaattorit käsittelevät helposti karkeita olosuhteita ja vaativia ympäristöjä.
Hielscher Ultrasonics on ISO-sertifioitu yritys ja painottaa erityisesti korkean suorituskyvyn ultraäänilaitteita, joissa on huipputeknologia ja käyttäjäystävällisyys. Tietenkin, Hielscher-ultraäänilaitteet ovat CE-yhteensopivia ja täyttävät UL: n, CSA: n ja RoHs: n vaatimukset.
Virtaviivaista näytteen valmistelua 96-kuoppalevyissä ja määrityslevyissä käyttämällä monikuoppaista levysonikaattoria UIP400MTP
Kirjallisuus / Viitteet
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Usein Kysytyt Kysymykset
Mikä on MIC-määritys?
Minimum Inhibitory Concentration (MIC) -määritys on standardoitu testi, jota käytetään määrittämään mikrobilääkkeen pienin pitoisuus, joka tarvitaan mikro-organismin näkyvän kasvun estämiseen. Se tehdään yleensä käyttämällä liemimikrolaimennus- tai agarlaimennusmenetelmiä, joissa mikro-organismit altistetaan antimikrobisen aineen sarjalaimennoksille. MIC-määritykset ovat kriittisiä arvioitaessa mikrobilääkkeiden tehoa, ohjattaessa kliinistä hoitoa ja arvioitaessa resistenssitasoja sekä planktonisissa että biofilmiin liittyvissä mikro-organismeissa.
Mitä eroa on biofilmipohjaisella pienimmän inhiboivan pitoisuuden määrityksellä ja MBIC-määrityksellä?
Biofilmipohjainen MIC-määritys (Minimum Inhibitory Concentration) ja MBIC-määritys (Minimum Biofilm Inhibitory Concentration) liittyvät toisiinsa, mutta niiden tarkoitus ja menetelmät eroavat toisistaan.
Biofilmipohjainen MIC-määritys arvioi pienimmän antimikrobisen aineen pitoisuuden, joka tarvitaan estämään näkyvän biofilmin kasvua tai elinkelpoisuutta, keskittyen biofilmiin liittyviin soluihin planktonisten bakteerien sijaan. Sitä vastoin MBIC-määritys mittaa erityisesti mikrobilääkkeen kykyä estää biofilmin muodostumista sen sijaan, että käsiteltäisiin ennalta muodostettuja biofilmejä. Vaikka molemmat määritykset käsittelevät biofilmiin liittyviä bakteereja, biofilmipohjainen MIC-määritys käsittelee hoitoa ja MBIC-määritys korostaa ennaltaehkäisyä, mikä tekee niistä täydentäviä työkaluja antimikrobisen tehon tutkimiseen biofilmejä vastaan.
Mitä biofilmejä käytetään MIC-määrityksissä?
Mikrobibiofilmejä ja planktonisia soluja käytetään sekä MIC-määrityksissä (Minimum Inhibitory Concentration) antimikrobisen tehon tutkimiseen eri olosuhteissa.
- Planktoniset solut:
Planktoniset solut ovat vapaasti kelluvia, yksittäisiä mikrobisoluja, jotka toimivat standardimallina perinteisille MIC-määrityksille. Yleisiä mikro-organismeja ovat Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus ja Candida albicans. Nämä määritykset määrittävät MIC: n, jota tarvitaan estämään vapaasti elävien solujen kasvua, ja ne ovat kriittisiä mikrobilääkkeiden alustavan seulonnan kannalta. - Biofilmiin liittyvät solut:
Biofilmisolut ovat solunulkoiseen matriisiin upotettuja mikro-organismeja, mikä lisää merkittävästi niiden vastustuskykyä mikrobilääkkeille. Biofilmin MIC-määritykset sisältävät usein:- Gramnegatiiviset bakteerit: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa ja Klebsiella pneumoniae, jotka tunnetaan biofilmin muodostumisesta infektioissa ja teollisissa olosuhteissa.
- Grampositiiviset bakteerit: Staphylococcus aureus (mukaan lukien MRSA), Staphylococcus epidermidis ja Enterococcus faecalis, jotka ovat yleisesti mukana laitteeseen liittyvissä infektioissa.
- Sienet: Candida albicans ja siihen liittyvät lajit, jotka ovat tärkeitä biofilmiin liittyvissä sieni-infektioissa.
- Sekalajien biofilmit: Näitä käytetään joskus kopioimaan luonnollisia polymikrobisia biofilmejä, kuten kroonisista haavoista tai teollisesta biolikaantumisesta.
Vertaamalla planktonisten solujen ja biofilmiin liittyvien solujen MIC-arvoja tutkijat voivat arvioida biofilmien lisääntynyttä vastustuskykyä ja tunnistaa aineita, jotka ovat tehokkaita näitä joustavampia mikrobiyhteisöjä vastaan.
Mitä eroa on MIC: llä ja MBEC: llä?
Pienin inhibitorinen pitoisuus (MIC) on pienin antimikrobisen aineen pitoisuus, joka tarvitaan estämään biofilmin muodostuminen, kun taas pienin biofilmin hävittämispitoisuus (MBEC) on pienin pitoisuus, joka tarvitaan vakiintuneen biofilmin hävittämiseen. MIC keskittyy biofilmien ehkäisyyn, kun taas MBEC arvioi hoidon tehoa kypsiä biofilmejä vastaan.
Mitä levyjä käytetään yleisesti MBEC-määrityksissä?
MBEC-määrityksissä yleisesti käytetyt mikrotiitterilevyt ovat tyypillisesti polystyreenistä tai polypropeenista valmistettuja 96-kuoppalevyjä. Nämä materiaalit tarjoavat sopivan pinnan biofilmin muodostumiselle ja ovat kemiallisesti resistenttejä määrityksen aikana testatuille mikrobilääkkeille. Polystyreenilevyjä suositaan laajalti niiden optisen selkeyden vuoksi, mikä on edullista loppupään analyyseissä, kuten spektrofotometrisissä tai fluoresenssipohjaisissa mittauksissa. Näiden levyjen suunnittelussa on irrotettavat tapin kannet, jotka ovat välttämättömiä määrityksessä, koska biokalvot muodostuvat tappeihin, jotka upotetaan kasvualustoja sisältäviin kuoppiin. Standardoidut levyt, kuten MBEC-määritysprotokollan mukaiset levyt, on erityisesti suunniteltu varmistamaan toistettavuus ja yhteensopivuus UIP400MTP sonicatorin tai muun prosessointilaitteen kanssa.
Mitä ovat PEG-kansilevyt?
PEG-kansilevyt ovat erikoistuneita monikuoppalevyjärjestelmiä, joissa kansi on varustettu pienillä polyetyleeniglykoli (PEG) -tapilla tai tapilla, jotka ulottuvat kuhunkin kuoppaan. Nämä tapit tarjoavat pinnan mikrobien biofilmin muodostumiselle valvotuissa olosuhteissa jäljittelemällä todellista biofilmin kasvua. Rakenne mahdollistaa biofilmien kehittymisen tappeihin, kun taas kuopat sisältävät kasvualustoja tai antimikrobisia aineita, mikä mahdollistaa biofilmiherkkyyden korkean suorituskyvyn testauksen hoidoille, kuten MBEC-, MBIC- ja MIC-määrityksissä.
Mikä on ultraäänibiofilmin siirtymisen etu verrattuna solujen kaavintaan?
Ultraäänibiofilmin irtoaminen tarjoaa merkittävän edun solujen kaavintaan verrattuna tarjoamalla ei-invasiivisen, yhtenäisen ja erittäin tehokkaan menetelmän biokalvojen poistamiseksi pinnoilta. Toisin kuin kaavinta, joka voi olla epäjohdonmukainen ja vahingoittaa alla olevaa pintaa tai soluja, ultraääniaallot tunkeutuvat biofilmimatriisiin ja hajottavat sen vaarantamatta vierekkäisten rakenteiden eheyttä. Tämä menetelmä varmistaa toistettavuuden, minimoi kontaminaatioriskin ja on erityisen tehokas sovelluksissa, jotka edellyttävät tarkkaa biofilmin poistoa, kuten mikrobiologisissa tutkimuksissa tai lääkinnällisten laitteiden testauksessa. Lue lisää kuinka UIP400MTP Sonicator ylittää solujen kaavinnan!
Hielscher Ultrasonics valmistaa korkean suorituskyvyn ultraäänihomogenisaattoreita laboratorio jotta Teollisuuden koko.


