MBEC-määrityksen menetelmäohje 96-kuoppalevyjen ultraäänilaitteella UIP400MTP
MBEC-määrityksellä selvitetään tappikansiin muodostuneiden biofilmien hävittämiseen tarvittava antimikrobisten aineiden pitoisuus. Biofilmien elinkyvyn arvioimiseksi biofilmit on ensin irrotettava 96-kuoppalevyn tappikansista. Ultraäänikäsittely on luotettavin ja tehokkain menetelmä tähän irrotukseen. Monikuoppalevyjen ultraäänilaite UIP400MTP on suunniteltu erityisesti määrityslevyjen käsittelyyn mahdollisimman tehokkaasti ja vaivattomasti, mikä sujuvoittaa ja nopeuttaa suurten näytemäärien MBEC-määrityksiä.
Ultraäänikäsittely biofilmien irrottamiseen
Ultraäänikäsittely on ratkaiseva vaihe biofilmin hävittävän vähimmäispitoisuuden (Minimum Biofilm Eradication Concentration, MBEC) määrityksissä, sillä se mahdollistaa biofilmin solujen tehokkaan irrottamisen pinnasta, johon ne ovat kiinnittyneet. Biofilmit ovat luontaisesti järjestäytyneitä mikro-organismiyhteisöjä, joita ympäröi solunulkoinen matriksi. Tämä tekee niistä huomattavasti vastustuskykyisempiä antimikrobisille aineille kuin planktoniset solut. MBEC-määrityksissä ultraäänikäsittely tuottaa ultraääniaaltojen avulla hallittua kavitaatiota, joka hajottaa biofilmin matriksin ja vapauttaa siihen sitoutuneet solut suspensioon. Tämä vaihe varmistaa, että biofilmin solut jakautuvat tasaisesti talteenottoväliaineeseen, mikä helpottaa elinkyvyn tarkkaa arviointia maljaviljelyllä, laimennuksilla tai spektrofotometrisillä menetelmillä. Jos biofilmiä ei irroteta asianmukaisesti, jäljelle jäävät matriksin osat voivat suojata soluja ja johtaa antimikrobisen tehon aliarviointiin. Ultraäänikäsittely on siksi välttämätön luotettavien ja toistettavien MBEC-arvojen saamiseksi. Nämä arvot kuvastavat testattujen aineiden todellista hävittämiskykyä. Monikuoppalevyjen ultraäänilaite UIP400MTP mahdollistaa suurten näytemäärien helpon valmistelun määrityslevyillä.
Monikuoppalevyjen ultraäänilaite UIP400MTP helpottaa suurten näytemäärien valmistelua määrityslevyillä.
Biofilmin hävittävän vähimmäispitoisuuden (MBEC) määrityksen menetelmäohje
Vaihe 1: Biofilmin muodostuminen
- Valmista bakteerisuspensio:
Kasvata bakteereja sopivissa kasvatusväliaineissa logaritmiseen kasvuvaiheeseen asti.
Laimenna bakteeriviljelmä määritettyyn optiseen tiheyteen (esim. OD600 ~0,1). - Inokuloi 96-kuoppalevy:
Lisää bakteerisuspensiota (esim. 150–200 µL) tavallisen 96-kuoppaisen mikrotiitterilevyn jokaiseen kuoppaan. - Kiinnitä tappikansi:
Aseta tappikansi inokuloidun levyn päälle, jotta tappien pinnoille voi muodostua biofilmiä. - Inkuboi levy:
Inkuboi kokonaisuutta sopivassa lämpötilassa (esim. 37°C) 24–48 tuntia ravistamatta biofilmin kasvun edistämiseksi.
Vaihe 2: Käsittely antimikrobisilla aineilla
- Valmista antimikrobiset liuokset:
Valmista tuoreisiin kasvatusväliaineisiin antimikrobisten aineiden pitoisuussarja.
Altista biofilmit antimikrobisille aineille:
Poista tappikansi bakteeriviljelmästä ja huuhtele se steriilissä suolaliuoksessa tai PBS:ssä planktonisten solujen poistamiseksi.
Aseta tappikansi uuteen 96-kuoppalevyyn, joka sisältää antimikrobiset liuokset. - Inkuboi levy:
Inkuboi määritetyn ajan (esim. 24 tuntia), jotta biofilmit altistuvat antimikrobisille aineille.
Monikuoppalevyjen ultraäänilaite UIP400MTP suurten näytemäärien valmisteluun
Vaihe 3: Ultraäänikäsittely 96-kuoppalevyjen ultraäänilaitteella UIP400MTP
Ultraäänikäsittelyvaihe on ratkaiseva biofilmien irrottamiseksi tappikansista elinkyvyn arviointia varten. Noudata näitä vaiheita käyttäessäsi ultraäänilaitetta UIP400MTP:
- Valmistele kokonaisuus:
Lisää uuden 96-kuoppalevyn jokaiseen kuoppaan talteenottoväliainetta (esim. neutraloivaa lientä tai tuoretta kasvatusväliainetta). - Siirrä tappikansi:
Poista tappikansi antimikrobiseen käsittelyyn käytetystä levystä.
Huuhtele tappikansi steriilissä suolaliuoksessa tai PBS:ssä antimikrobisten aineiden jäämien poistamiseksi. - Aseta levy ja ultraäänilaite paikoilleen:
Kiinnitä tappikansi talteenottoväliainetta sisältävään levyyn.
Aseta talteenottoväliainetta sisältävä levy ultraäänilaitteen UIP400MTP alustalle ja varmista, että levy on keskellä ja vakaasti paikallaan. - Säädä ultraäänikäsittelyn parametrit:
Aseta ultraäänikäsittelyn parametrit laitteessa UIP400MTP (asetuksia voidaan säätää biofilmin mukaan):
Amplitudi: 70–100%.
Ultraäänikäsittelyn kesto: 1–3 minuuttia (säädä biofilmin kestävyyden mukaan) syklisessä tilassa. - Käsittele ultraäänellä:
Käynnistä ultraäänikäsittely. Ultraäänivärähtely irrottaa biofilmit tappien pinnoilta talteenottoväliaineeseen. - Seuraa prosessia:
Seuraa kuopissa olevien näytteiden lämpötilaa liitettävällä lämpötila-anturilla. UIP400MTP voidaan liittää laboratoriojäähdyttimeen jäähdytystä varten. - Ultraäänikäsittelyn jälkeinen käsittely:
Siirrä talteenottoväliaine (joka sisältää nyt irrotetut biofilmit) välittömästi uuteen steriiliin levyyn jatkoanalyysiä varten.
(A) Levy, joka sisältää TSB:tä ja 2% glukoosia ja jota käytetään biofilmien muodostukseen, solujen talteenottoon ja
MIC:n ja MBCB:n määritykseen; (B) Tappikansi stafylokokkibiofilmien muodostukseen. MIC:n ja MBCB:n määritys; (B) Tappikansi stafylokokkibiofilmien muodostukseen.
Tappeihin muodostuneet biofilmin solut irrotettiin 5 min kestävällä ultraäänikäsittelyllä (Hielscher Ultrasound Technology) 96-kuoppalevyissä, jotka sisälsivät tuoretta kasvatusväliainetta solujen talteenottoa varten.
(Kuva ja tutkimus: ©de Oliveira et al., 2016)
Vaihe 4: Elinkyvyn arviointi
Siirrä irrotetut biofilmit maljoille ja viljele ne:
- Tee talteenottoväliaineesta sarjalaimennokset ja siirrä ne agarmaljoille pesäkkeitä muodostavien yksiköiden (CFU) laskemiseksi.
Vaihtoehtoisesti käytä kolorimetristä tai fluoresenssiin perustuvaa elinkyvyn määritystä. - Kirjaa tulokset:
Määritä MBEC antimikrobisen aineen pienimmäksi pitoisuudeksi, joka poisti biofilmin havaittavan elinkyvyn.
Suunnittelu, valmistus ja konsultointi – Saksassa valmistettua laatua
Hielscher-ultraäänilaitteet tunnetaan korkeimmista laatu- ja suunnittelustandardeistaan. Kestävyys ja helppokäyttöisyys mahdollistavat ultraäänilaitteidemme sujuvan integroinnin teollisuuslaitoksiin. Hielscher-ultraäänilaitteet selviytyvät helposti ankarista olosuhteista ja vaativista ympäristöistä.
Hielscher Ultrasonics on ISO-sertifioitu yritys, joka painottaa erityisesti tehokkaita ultraäänilaitteita, joissa yhdistyvät uusinta tekniikkaa edustava teknologia ja käyttäjäystävällisyys. Hielscher-ultraäänilaitteet ovat luonnollisesti CE-vaatimusten mukaisia ja täyttävät UL-, CSA- ja RoHs-vaatimukset.
Sujuvoita näytteiden valmistelua 96-kuoppalevyillä ja määrityslevyillä käyttämällä monikuoppalevyjen ultraäänilaitetta UIP400MTP
Kirjallisuus / Viitteet
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Microplate Sonicator Validated in Peer-Reviewed Proteomics Study
Usein kysytyt kysymykset
Mikä on MBEC-määritys?
Biofilmin hävittävän vähimmäispitoisuuden (Minimum Biofilm Eradication Concentration, MBEC) määritys on standardoitu menetelmä, jolla selvitetään pienin antimikrobisen aineen pitoisuus, joka tarvitaan biofilmiin liittyvien bakteerien hävittämiseen. Siinä kasvatetaan biofilmejä erityisillä pinnoilla, altistetaan ne antimikrobisten aineiden eri pitoisuuksille ja arvioidaan irrotettujen solujen elinkyky biofilmin hajottamisen jälkeen. Hajottaminen tehdään tavallisesti ultraäänikäsittelyllä, ja elinkyvyn arvioinnilla selvitetään käsittelyn teho.
Mitä eroa on MBIC:llä ja MBEC:llä?
Biofilmin muodostumisen estävä vähimmäispitoisuus (Minimum Biofilm Inhibitory Concentration, MBIC) on pienin antimikrobisen aineen pitoisuus, joka tarvitaan biofilmin muodostumisen estämiseen, kun taas biofilmin hävittävä vähimmäispitoisuus (Minimum Biofilm Eradication Concentration, MBEC) on pienin pitoisuus, joka tarvitaan jo muodostuneen biofilmin hävittämiseen. MBIC keskittyy biofilmin muodostumisen ehkäisyyn, kun taas MBEC arvioi käsittelyn tehoa kypsiä biofilmejä vastaan.
Mitä levyjä MBEC-määrityksissä yleisesti käytetään?
MBEC-määrityksissä yleisesti käytettävät mikrotiitterilevyt ovat tavallisesti polystyreenistä tai polypropeenista valmistettuja 96-kuoppalevyjä. Nämä materiaalit tarjoavat sopivan pinnan biofilmin muodostumiselle ja kestävät kemiallisesti määrityksessä testattavia antimikrobisia aineita. Polystyreenilevyjä suositaan laajalti niiden optisen kirkkauden vuoksi, mistä on hyötyä jatkoanalyyseissä, kuten spektrofotometrisissä tai fluoresenssiin perustuvissa mittauksissa. Näiden levyjen rakenteeseen kuuluu irrotettava tappikansi, joka on määritykselle välttämätön, koska biofilmit muodostuvat tappeihin, jotka ovat upotettuina kasvatusväliainetta sisältäviin kuoppiin. Standardoidut levyt, kuten MBEC-määrityksen menetelmäohjeen mukaiset levyt, on suunniteltu erityisesti varmistamaan toistettavuus ja yhteensopivuus ultraäänilaitteen UIP400MTP tai muiden käsittelylaitteiden kanssa.
Mitä ovat PEG-kannelliset levyt?
PEG-kannelliset levyt ovat erityisiä monikuoppalevyjärjestelmiä, joiden kannessa on pieniä polyetyleeniglykolista (PEG) valmistettuja tappeja tai piikkejä, jotka ulottuvat jokaiseen kuoppaan. Nämä tapit tarjoavat pinnan mikrobien biofilmien muodostumiselle hallituissa olosuhteissa ja jäljittelevät biofilmien kasvua todellisissa olosuhteissa. Rakenne mahdollistaa biofilmien kehittymisen tappeihin samalla, kun kuopissa on kasvatusväliaineita tai antimikrobisia aineita. Näin biofilmien herkkyyttä käsittelyille voidaan testata suurilla näytemäärillä esimerkiksi MBEC- ja MBIC-määrityksissä.
Hielscher Ultrasonics valmistaa tehokkaita ultraäänihomogenisaattoreita laboratoriokoosta aina teolliseen kokoon asti.