Suuren läpimenon sonikaation mahdollistama testien miniatyrisointi
Määritysten pienentäminen on nykyaikaisen biotieteellisen tutkimuksen keskeinen suuntaus. Kun laboratoriot pyrkivät käsittelemään suurempia näytemääriä ja samalla vähentämään reagenssien kulutusta ja tutkimuskustannuksia, pienemmät reaktiotilavuudet ja mikrolevyihin perustuvat työnkulut korvaavat yhä useammin perinteiset putkipohjaiset määritykset. Tämä siirtyminen kohti testien pienentämistä antaa tutkijoille mahdollisuuden nopeuttaa testien kehittämistä, lyhentää koesyklejä ja tuottaa vankempia tietokokonaisuuksia suuremman näytetiheyden ansiosta.
Määritysten pienentämiseen liittyvät haasteet
Miniatyrisoidut määritykset tuovat mukanaan myös teknisiä haasteita. Työskentely pienillä näytemäärillä suuritiheyksisissä mikrolevyissä edellyttää erittäin johdonmukaista näytteenvalmistusta kaikissa kuopissa. Käsittelyolosuhteiden vaihtelut voivat nopeasti johtaa epäjohdonmukaisiin tuloksiin, erityisesti työprosesseissa, joihin liittyy solujen hajottamista, nukleiinihappojen uuttamista, proteiinien eristämistä tai nanohiukkasten dispergointia. Kaikkien näytteiden yhdenmukaisen käsittelyn varmistaminen on näin ollen ratkaisevan tärkeää tietojen luotettavuuden ja kokeellisen toistettavuuden säilyttämiseksi.
UIP400MTP:n avulla voit voittaa määritysten miniatyrisoinnin haasteet.
Microplate Sonicator UIP400MTP vastaa näihin haasteisiin mahdollistamalla korkean läpimenon sonikointi suoraan tavallisilla monikuoppalevyillä. Sen sijaan, että näytteitä käsiteltäisiin yksitellen, järjestelmä käyttää ultraäänienergiaa samanaikaisesti koko mikrolevylle. Tämä lähestymistapa takaa yhdenmukaiset sonikaatio-olosuhteet jokaiselle kuopalle ja lisää samalla huomattavasti käsittelynopeutta. Tämän ansiosta tutkijat voivat integroida ultraääninäytteiden valmistuksen saumattomasti nykyaikaisiin korkean läpimenon työnkulkuihin.
Ultraäänikäsittely on jo pitkään ollut hyväksi havaittu tekniikka biotieteiden laboratorioissa. Ultraääni rikkoo tehokkaasti solukalvoja, pirstoo DNA:ta, uuttaa solunsisäisiä biomolekyylejä ja hajottaa hiukkasia. Perinteiset sonikointimenetelmät edellyttävät kuitenkin usein anturipohjaisia järjestelmiä tai putkikohtaista käsittelyä, mikä voi rajoittaa läpimenoa, kun työskennellään suurilla näytemäärillä. Sitä vastoin UIP400MTP:n avulla laboratoriot voivat käsitellä kokonaisia mikrolevyjä kerralla, jolloin yksittäisten näytteiden toistuvaa käsittelyä ei tarvita ja työnkulut ovat todella skaalautuvia.
Mikrolevyäänittimen UIP400MTP edut
UIP400MTP:n keskeinen etu on sen kyky jakaa ultraäänienergia tasaisesti kaikkiin mikrolevyn kuoppiin. Yhdenmukaiset sonikaatio-olosuhteet ovat olennaisen tärkeitä toistettavuuden säilyttämiseksi korkean läpimenon määrityksissä, erityisesti kun verrataan satoja näytteitä yhdessä kokeessa. Käsittelemällä kaikkia kuoppia samanaikaisesti identtisillä parametreilla UIP400MTP varmistaa, että jokaiselle näytteelle on samat käsittelyolosuhteet.
Tämä kyky tukee monenlaisia biotieteellisiä sovelluksia, jotka perustuvat kontrolloituun ultraäänikäsittelyyn. Tutkijat käyttävät korkean läpimenon sonikointia muun muassa seuraaviin tehtäviin:
- solujen lyysi ja solujen liuotus molekyylianalyysiä varten
- DNA:n ja RNA:n uuttaminen biologisista näytteistä
- DNA:n fragmentointi genomitutkimuksen työnkulkuja varten
- proteiinien uuttaminen proteomiikkaa ja biokemiallisia tutkimuksia varten
- seuraavan sukupolven sekvensoinnin (NGS) kirjaston valmistelu
- nanohiukkasten dispersio nanobioteknologian tutkimuksessa
- solujen tai biofilmien irtoaminen pinnoilta
Koska ultraäänikäsittely tehdään tasaisesti koko levylle, kokeellinen vaihtelu minimoituu ja myöhemmät analyyttiset työnkulut hyötyvät suuremmasta luotettavuudesta.
Toinen tärkeä näkökohta määritysten pienentämisessä on laboratorioautomaation ja robottityöasemien yleistyminen. Automatisoidut nesteenkäsittelyjärjestelmät ja integroidut robottialustat mahdollistavat sen, että laboratoriot voivat käsitellä suuria määriä näytteitä minimaalisella manuaalisella toiminnalla. Näiden ympäristöjen tukemiseksi laboratoriolaitteet on suunniteltava niin, että ne voidaan integroida saumattomasti automatisoituihin järjestelmiin.
Integrointi automatisoituihin laboratoriotyöasemiin
UIP400MTP on suunniteltu tätä vaatimusta silmällä pitäen. Sen selkeä rakenteellinen muotoilu, kompakti tilantarve ja erittäin kestävä laitekotelo mahdollistavat sen helpon liittämisen automatisoituihin laboratoriotyöasemiin. Järjestelmä voidaan integroida robotisoituihin työnkulkuihin automaattisten nesteenkäsittelijöiden, mikrolevylukijoiden ja muiden korkean läpimenon analyyttisten laitteiden rinnalle. Tämän yhteensopivuuden ansiosta se soveltuu erityisen hyvin laboratorioihin, jotka suorittavat automatisoituja solumäärityksiä, genomityönkulkuja tai seulontakokeita, joissa toistettavuus ja skaalautuvuus ovat kriittisiä. Lue lisää UIP400MTP:n integroinnista automaattisiin nesteenkäsittelyjärjestelmiin!
| Sonicator: Sonicator: Robottiautomaation tärkeimmät edut | Miksi sillä on merkitystä |
| Vakiolevytuki | Toimii SBS-formaattien kanssa, joita robotit jo käsittelevät. |
| Suuri suorituskyky | Rinnakkainen sonikointi lyhentää syklien kestoa. |
| kaukosäädin & kirjaaminen | Mahdollistaa valvomattoman käytön ja jäljitettävyyden. |
| kosketukseton sonikaatio | Pienempi kontaminaatioriski ja parempi levyn tiivistys. |
| Lämpötilan säätö | Säilyttää näytteen eheyden automaattisissa ajoissa. |
| Skaalautuva eri kaivomuodoissa | Sopii kehittyviin automaation läpimenotarpeisiin. |
Yhteensopivuus laboratorio-ohjelmistojen kanssa
Mekaanisen integroinnin lisäksi UIP400MTP tukee digitaalista liitettävyyttä automaattista ohjausta ja tiedonvaihtoa varten. Nykyaikaisissa laboratorioympäristöissä käytetään yhä useammin verkkoon kytkettyjä laitteita, joita voidaan etäohjata, valvoa ja integroida laboratoriotietojärjestelmiin. Mikrolevykaikuluotaimessa on siksi useita hyvin dokumentoituja avoimia liitäntöjä, jotka helpottavat kommunikointia automaatioalustojen ja ohjausohjelmistojen kanssa.
Tärkeimpiä viestintä- ja integrointiominaisuuksia ovat:
- etäohjaus XML- ja JSON-pohjaisten viestintäprotokollien avulla
- yhteensopivuus teollisuus- ja laboratorioautomaatiojärjestelmien ModBUS-yhteensopivuus
- SYSLOG-tuki tapahtumalokitusta ja järjestelmän seurantaa varten
Näiden avointen standardiliitäntöjen ansiosta laboratoriot voivat liittää UIP400MTP:n monimutkaisiin automatisoituihin työnkulkuihin ja digitaalisiin laboratorioinfrastruktuureihin. Tämän ansiosta tutkijat voivat toteuttaa täysin automatisoituja prosesseja, joissa mikrolevyjen sonikointi on integroitu vaihe laajemmassa kokeellisessa prosessissa.
Kehittynyt biotiede ja tutkimus Assay Sonicatorin avulla
Kun biotieteellinen tutkimus siirtyy yhä enemmän kohti suurempaa läpimenoa, pienempiä reaktiovolyymeja ja automatisoituja työnkulkuja, testien pienentämistä tukevat teknologiat ovat yhä tärkeämpiä. Luotettava näytteenvalmistus on edelleen avaintekijä kokeiden onnistumisen varmistamisessa, erityisesti silloin, kun satoja tai tuhansia näytteitä on käsiteltävä identtisissä olosuhteissa.
UIP400MTP mahdollistaa korkean läpimenon sonikaation, jossa energia jakautuu tasaisesti koko mikrolevyyn, ja tarjoaa tutkijoille tehokkaan työkalun skaalautuvaan ja toistettavaan näytteenvalmistukseen. Sen automaatiovalmis rakenne, digitaalinen liitettävyys ja yhteensopivuus standardimikrolevyjen kanssa tekevät siitä ihanteellisen ratkaisun laboratorioille, jotka haluavat tehostaa määritysten kehittämistä tieteellisen tarkkuuden säilyttäen.
Tällä tavoin UIP400MTP Microplate Sonicator auttaa yksinkertaistamaan yhtä nykyaikaisten laboratorioiden työnkulkujen keskeisistä haasteista: johdonmukaista ja laadukasta näytteenvalmistusta yhä pienemmissä ja automatisoiduissa koeympäristöissä.
Suuren läpimenon määritykset sonikaatio 96-kuoppaisella levysonikaattorilla UIP400MTP
Kirjallisuus / Viitteet
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
Usein Kysytyt Kysymykset
Mikä on määritys?
Määritys on analyyttinen menetelmä, jota käytetään biologisen molekyylin, solupopulaation tai biokemiallisen prosessin läsnäolon, pitoisuuden, aktiivisuuden tai toiminnallisen vaikutuksen kvalitatiiviseen tai kvantitatiiviseen havaitsemiseen näytteessä. Määritykset ovat perustavanlaatuisia välineitä biotieteissä, biokemiassa ja lääketutkimuksessa, ja niiden avulla tutkijat voivat tutkia molekyylien vuorovaikutuksia, entsyymiaktiivisuutta, geeniekspressiota, solujen elinkelpoisuutta ja monia muita biologisia parametreja kontrolloiduissa koeolosuhteissa.
Mitkä ovat yleisimmät määritykset?
Yleisimpiä määrityksiä biotieteellisessä tutkimuksessa ovat entsyymisidonnaiset immunosorbenttimääritykset (ELISA) proteiinien tai vasta-aineiden havaitsemiseksi, polymeraasiketjureaktiomääritykset (PCR) ja kvantitatiiviset PCR-määritykset (qPCR) nukleiinihappojen havaitsemiseksi ja kvantifioimiseksi, solujen elinkelpoisuusmääritykset, kuten MTT- tai resatsuriinimääritykset, reportterigeenimääritykset geenien säätelyn tutkimiseksi sekä entsyymiaktiivisuusmääritykset, joilla mitataan katalyyttisiä reaktioita. Lisäksi biotekniikassa ja lääkekehityksessä käytetään laajalti DNA:n/RNA:n uuttamiseen, proteiinien kvantifiointiin (esim. Bradfordin tai BCA:n määritykset) ja korkean läpimenon seulontamäärityksiä.
Mitkä ovat 4 analyysityyppiä?
Määritykset luokitellaan usein neljään päätyyppiin käytetyn analyysiperiaatteen perusteella.
- Biokemialliset määritykset mitata biomolekyylien, kuten entsyymien, proteiinien tai aineenvaihduntatuotteiden aktiivisuutta tai pitoisuutta kontrolloidussa reaktioympäristössä.
- solupohjaiset määritykset arvioida biologisia prosesseja elävissä soluissa, kuten solujen lisääntymistä, sytotoksisuutta, signaalireittejä tai geeniekspressiota.
- Immunomääritykset käyttävät antigeenin ja vasta-aineen vuorovaikutusta tiettyjen proteiinien tai biomarkkereiden havaitsemiseksi erittäin spesifisesti.
- Sitoutumiskokeet analysoida molekyylien välistä vuorovaikutusta, esimerkiksi ligandien ja reseptorien välistä sitoutumista tai proteiinien ja proteiinien välistä vuorovaikutusta, mikä on erityisen tärkeää lääkkeiden löytämisessä ja farmakologisissa tutkimuksissa.
Mitä eroa on määrityksen ja testin välillä?
Määrityksen ja testin välinen ero on lähinnä niiden tieteellisessä laajuudessa ja kontekstissa. Määritys on tyypillisesti standardoitu analyysimenetelmä, joka on suunniteltu tietyn biologisen tai kemiallisen parametrin mittaamiseen määritellyllä menetelmällä ja jota käytetään usein tutkimuksessa, lääkekehityksessä ja laadunvalvonnassa. Testi on laajempi termi, joka viittaa mihin tahansa arviointiin tai tutkimukseen, joka suoritetaan jonkin asian olemassaolon, tilan tai suorituskyvyn määrittämiseksi. Tieteellisissä ja kliinisissä yhteyksissä monet diagnostiset testit perustuvat määrityksiin, mutta termi “testi” voi viitata myös muihin kuin analyyttisiin arviointeihin tai yksinkertaistettuihin diagnostisiin menettelyihin.
Hielscher Ultrasonics valmistaa korkean suorituskyvyn ultraäänihomogenisaattoreita laboratorio jotta Teollisuuden koko.




