Sådan kan sonikering øge lysozyms effektivitet ved bakteriel cellelyse markant
, Kathrin Hielscher, udgivet i Hielscher Nyheder
At bryde bakterieceller op er et afgørende trin inden for bioteknologi, farmaceutisk forskning og proteinproduktion. Et af de mest almindelige værktøjer til denne opgave er lysozym, et enzym, der svækker bakteriers cellevægge. Men selv om lysozym er effektivt, er det ofte ikke hurtigt eller kraftigt nok alene – især ved arbejde med tætte kulturer eller bakterier, der er modificeret til at overudtrykke proteiner.
Her kommer sonikering ind i billedet. Forskere anvender i stigende grad ultralydsbehandling til at forbedre lysozymbaseret cellelyse markant. Når lysozym og sonikering anvendes sammen, danner de et yderst effektivt, komplementært system, der giver hurtigere, mere fuldstændige og mere reproducerbare resultater.
Hvorfor lysozym alene ofte ikke er tilstrækkeligt
Lysozym virker ved at nedbryde peptidoglykan, en central strukturel bestanddel af bakteriers cellevægge. Denne enzymatiske tilgang er skånsom og udbredt, især til E. coli. Under praktiske laboratorieforhold kan behandling med lysozym alene dog være begrænsende.
Almindelige udfordringer omfatter:
- Ufuldstændig celleopbrydning i kulturer med høj celletæthed eller celleaggregater
- Lange inkubationstider
- Nedsat effektivitet i overudtrykkende eller stresstilpassede bakterier
- Variation fra batch til batch
Disse begrænsninger kan påvirke efterfølgende processer såsom proteinekstraktion, klaring og oprensning negativt – hvilket i sidste ende reducerer udbyttet og ensartetheden.
Videnskaben bag synergien mellem lysozym og sonikering
Sonikering tilfører ultralydsbølger med høj intensitet til en væskeprøve. Disse bølger danner mikroskopiske bobler, der hurtigt kollapser i en proces kendt som kavitation. De resulterende forskydningskræfter, trykændringer og mikrostråler bryder fysisk cellestrukturer op.
Når sonikering anvendes efter – eller samtidig med – lysozymbehandling, forstærker de to metoder hinanden på flere vigtige måder:
- Lettere adgang til cellevæggen
Lysozym svækker bakteriers cellevæg, hvilket gør den langt mere sårbar over for de mekaniske kræfter, som ultralyd skaber. - Hurtigere cellelyse
Ultralydsenergi forkorter den tid, der kræves for at opnå fuldstændig celleopbrydning, markant sammenlignet med enzymatisk behandling alene. - Mere ensartet behandling
Sonikering forbedrer blandingen og sikrer, at alle celler udsættes ensartet for både lysozym og mekanisk belastning. - Højere proteinudbytter
Mere fuldstændig lyse betyder større frigivelse af intracellulære proteiner, enzymer og metabolitter – hvilket forbedrer det samlede udbytte.
En typisk arbejdsgang for lysozymassisteret sonikering
I laboratorier, der arbejder med overudtrykkende bakteriestammer, kombinerer en veletableret arbejdsgang enzymatisk lyse og ultralydslyse:
- Resuspension af celler
Høstede bakteriepellets resuspenderes i en egnet lysebuffer, der indeholder lysozym, typisk i koncentrationer på 0,1–1 mg/mL. Skånsom sonikering fremmer en hurtig og ensartet resuspension af celler. - Enzymatisk forbehandling
Suspensionen inkuberes i 10–30 minutter ved kontrollerede temperaturer (almindeligvis mellem 4 °C og 25 °C), så lysozym kan svække cellevæggen. - Opbrydning med ultralyd
Den forbehandlede suspension sonikeres med en ultralydsprocessor fra Hielscher med optimeret amplitude, pulstilstand og køling. - Klaring
Cellerester fjernes ved centrifugering eller filtrering, så der er et klaret lysat tilbage med et højt indhold af målproteiner.
Hvorfor forskere vælger sonikatorer fra Hielscher
Sonikatorer fra Hielscher er særligt velegnede til lysozymassisteret cellelyse takket være deres præcision og fleksibilitet. De vigtigste fordele omfatter:
- Justerbar amplitude og energitilførsel til reproducerbar behandling
- Drift i pulstilstand for at reducere varmeopbygning
- Effektiv kavitation over et bredt spektrum af volumener og viskositeter
- Nem opskalering fra laboratorieprøver på mikroliterniveau til industriel produktion
Denne kombination gør systemer fra Hielscher til værdifulde værktøjer i både forskningslaboratorier og produktionsmiljøer i stor skala.
Sonikator til multibrøndsplader UIP400MTP til prøveforberedelse med høj prøvekapacitet
Vigtige faktorer til optimering af resultater
For at få mest muligt ud af lysozymassisteret sonikering justerer forskere omhyggeligt flere parametre:
- Lysozymkoncentration: Brug den laveste effektive dosis for at styre omkostningerne og minimere interferens i efterfølgende processer.
- Ultralydsenergi: Tilfør tilstrækkelig effekt til at sikre fuldstændig lyse uden at beskadige følsomme proteiner.
- Temperaturstyring: Kølesystemer eller isbade hjælper med at beskytte varmefølsomme målmolekyler.
- Pulsindstillinger: Intermitterende sonikering forbedrer kavitationseffektiviteten og prøvestabiliteten.
Øg lysozymers effektivitet med sonikering!
Kombinationen af lysozym og opbrydning med ultralyd giver en pålidelig og højtydende løsning til bakteriel cellelyse. Sonikering øger effektiviteten af enzymatisk behandling og giver hurtigere behandling, mere fuldstændig opbrydning og højere udbytter af intracellulære produkter.
Med præcist regulerbare og skalerbare ultralydssystemer, såsom dem fra Hielscher, kan forskere finjustere deres arbejdsgange for at opfylde kravene inden for moderne bioteknologi – hvad enten det er i et lille laboratorium eller på en industriel produktionslinje.
Bakteriel lyse med høj prøvekapacitet med mikropladesonikatoren UIP400MTP
Litteratur / Referencer
- Ghosh, A., Bhar, K. & Siddhanta, A. (2019): Oxygen sequestration by Leghemoglobin is positively regulated via its interaction with another late nodulin, Nlj16 of Lotus japonicus. Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology 28, 2019. 414–423.
- Hannah K. Lembke; Adeline Espinasse; Mckenna G. Hanson; Christian J. Grimme;Zhe Tan; Theresa M. Reineke; Erin E. Carlson (2023): Cationic Polymers Enable Internalization of Negatively Charged Chemical Probes into Bacteria. ACS Chem Biol . 2023 September 15; 18(9): 2063–2072.
- Müller MRA, Ehrmann MA, Vogel RF (2000): Multiplex PCR for the Detection ofLactobacillus pontis and Two Related Species in a Sourdough Fermentation. Applied Environmental Microbiology 66, 2000.
- Di Giosia, Matteo; Bomans, Paul; Bottoni, Andrea; Cantelli, Andrea; Falini, Giuseppe; Franchi, Paola; Guarracino, Giuseppe; Friedrich, Heiner; Lucarini, Marco; Paolucci, Francesco; Rapino, Stefania; Sommerdijk, Nico; Soldà, Alice; valle, Francesco ; Zerbetto, Francesco; Calvaresi, Matteo (2018): Proteins as Supramolecular Hosts for C60: A True Solution of C60 in Water. Nanoscale 10(21); 2018.
Ofte stillede spørgsmål
Hvad er lysozymer?
Lysozymer er antimikrobielle enzymer, der katalyserer hydrolysen af β(1→4)-glykosidbindinger i peptidoglykan, en central strukturel bestanddel af bakteriers cellevægge, hvilket fører til svækkelse af cellevæggen og lyse, især i grampositive bakterier og permeabiliserede gramnegative celler.
Hvad er fordelene og begrænsningerne ved cellelyse med lysosomer?
Cellelyse med lysozymer giver fordele såsom milde reaktionsbetingelser, bevarelse af proteiners funktionalitet og lav mekanisk belastning, men begrænses af langsom kinetik, ufuldstændig lyse i tætte eller resistente bakteriekulturer, nedsat effektivitet over for intakte ydre membraner hos gramnegative bakterier og variation afhængigt af cellefysiologi og vækstbetingelser.
Hvordan øger sonikering lysozymers aktivitet?
Sonikering øger lysozymaktiviteten ved mekanisk at bryde bakteriers cellevægge op og permeabilisere dem gennem kavitationsinducerede forskydningskræfter, hvilket øger enzymets adgang til peptidoglykan, accelererer lysekinetikken og resulterer i mere fuldstændig og homogen celleopbrydning.

