마이크로바이옴 연구 및 임상 분석은 Sonication에 의해 간소화되었습니다.
초음파 처리는 마이크로바이옴 연구 및 임상 분석에 널리 사용되는 강력한 기술로, 고처리량 시료 준비를 용이하게 합니다. 초음파 방법은 미생물을 포함하는 것과 같은 복잡한 생물학적 샘플을 처리하는 데 특히 효과적입니다. 초음파 처리를 사용하면 세포 용해, 핵산, 단백질 및 대사 산물의 추출 및 분석을 용이하게하여 미생물 군집과 건강 및 질병에서의 역할에 대한 더 깊은 이해를 가능하게합니다. Hielscher 고처리량 초음파 발생기는 정밀도, 효율성 및 재현 가능한 결과로 유명하여 마이크로바이옴 연구에 탁월한 선택입니다.
마이크로바이옴 연구에서 고처리량 초음파 처리 활용
96웰 플레이트 초음파 발생기 UIP400MTP 고처리량 시료 전처리를 통한 마이크로바이옴 연구 간소화
96웰 플레이트 초음파를 사용한 고처리량 시료 전처리 UIP400MTP
마이크로바이옴 연구에서 초음파 처리의 응용
효율적인 세포 용해
초음파 처리는 그람 양성 박테리아 및 곰팡이와 같은 단단한 세포벽을 가진 세포를 포함하여 미생물 세포를 용해하는 데 매우 효과적입니다. 초음파는 샘플에 캐비테이션 기포를 생성하고, 이 기포는 붕괴되어 열린 세포벽과 막을 파괴하는 충격파를 생성합니다. 이 과정은 포괄적인 세포 파괴와 DNA, RNA 및 단백질과 같은 세포 내 내용물의 효율적인 방출을 보장합니다.
제어된 DNA 단편화
차세대 염기서열분석과 같은 응용 분야에서는 DNA를 더 작고 균일한 조각으로 전단해야 하는 경우가 많습니다. 초음파 처리는 단편화 과정을 정밀하게 제어하여 연구원이 원하는 크기의 DNA 단편을 얻을 수 있도록합니다. 이 제어는 염기서열분석 라이브러리를 준비하고 고품질 염기서열 데이터를 보장하는 데 매우 중요합니다.
향상된 시료 균질화
마이크로바이옴 연구에서 샘플에는 종종 다양한 미생물이 혼합되어 있습니다. 초음파 처리는 샘플 내에서 이러한 미생물의 균일한 분포를 달성하여 일관되고 재현 가능한 결과를 보장하는 데 도움이 됩니다. 이러한 균질화는 미생물 풍부도를 측정하거나 특정 대사 활동을 측정하는 것과 같은 정확한 정량 분석에 매우 중요합니다.
신뢰할 수 있는 대사산물 추출
초음파 처리에 의한 신뢰할 수있는 대사 산물 추출은 생물학적 샘플에서 작은 분자를 분리하기 위해 대사체학에서 널리 사용되는 기술입니다. 초음파 처리는 세포막을 파괴하는 기계적 진동을 사용하여 세포 내 대사 산물이 용매로 방출되는 것을 촉진합니다. 이 방법은 효율적이고 재현성이 높으며 다양한 시료 유형과 호환되므로 고처리량 및 표적 대사체학 연구에 유용한 도구입니다. 초음파 대사 산물 추출에 대해 자세히 알아보십시오!
“분변 마이크로바이옴 샘플의 균일하고 일관된 박테리아 용해를 위해 UIP400MTP 초음파 발생기를 사용한 환상적인 경험에 감사드립니다. 당사는 고처리량 용해 기술의 한계를 뛰어넘고 있으며, 귀하의 기기는 이러한 작업에 매우 적합합니다. 주요 하이라이트 중 일부는 다음과 같습니다.
- 작동 용이성 - 기기는 사용하기 쉽고 메뉴 선택을 사용하여 간단하게 사용자 정의할 수 있습니다.
- 높은 처리량 - 한 번에 96개의 시료를 처리할 수 있는 플레이트 처리에 탁월
- 모든 선박의 초음파 처리조차도 -이 장치는 모든 우물에 동일한 양의 초음파 처리를 전달할 수 있었으며, 이는 우리의 응용 분야에 매우 중요했습니다
- Hielscher 팀의 지원-지원은 훌륭했으며, 당신은 항상 훈련에서 우리를 위해 거기에 있었고, 우리의 질문에 답하고 문제를 해결했으며, 우리가 목표를 달성하는 데 도움이되는 제안을 받았습니다.
프로토콜을 최적화하기 위해 노력하는 동안 여러분의 도움과 도움에 다시 한 번 감사드립니다.”
마크 D. 드리스콜 박사 (Mark D. Driscoll, Ph.D.) – 최고과학책임자(CSO) – 인투스 바이오사이언스
초음파 처리는 마이크로바이옴 연구 및 진단에 어떻게 적용됩니까?
대사체학(metabolomics), 균유전체학(metagenomics) 및 균단체학(metaproteomics)은 미생물 군집과 그 기능에 대한 포괄적인 이해를 총체적으로 제공하기 때문에 마이크로바이옴 연구에서 서로 얽혀 있습니다. 용해, 단백질 정제 및 DNA/RNA 단편화는 96웰 플레이트 초음파 발생기 UIP400MTP 사용하여 간소화된 필수 시료 전처리 단계입니다.
대사체학 및 대사체 분석
대사체학(metabolomics)은 생물학적 시스템 내의 소분자 대사 산물에 대한 체계적인 연구를 포함합니다. 마이크로바이옴 연구에서 초음파 처리는 미생물 세포를 용해하여 세포 내 대사 산물을 방출하는 데 사용됩니다. 96웰 플레이트 초음파 발생기 UIP400MTP를 사용하여 높은 샘플 수를 빠르게 처리할 수 있습니다. 추출된 대사 산물은 질량 분석법(MS) 및 핵 자기 공명(NMR) 분광법과 같은 고급 기술을 사용하여 정량화합니다. 결과 데이터는 마이크로바이옴의 대사 상태에 대한 스냅샷을 제공하여 미생물 군집 내의 생화학적 활동과 상호 작용에 대한 통찰력을 보여줍니다.
균유전체학(metagenomics) 및 메타전사체학(metatranscriptomics)
균유전체학(metagenomics)은 환경 샘플에서 직접 회수한 유전 물질에 대한 포괄적인 분석을 포함합니다. 초음파 처리는 미생물 세포를 용해하여 고품질 DNA를 추출한 다음 존재하는 미생물 종을 식별하고 정량화하기 위해 시퀀싱함으로써 이 과정에서 중요한 역할을 합니다. 메타전사체학(metatranscriptomics)에서 RNA는 다양한 미생물 군집에서 유전자 발현 프로필을 연구하기 위해 유사한 초음파 처리 방법을 사용하여 추출됩니다. DNA 및 RNA 염기서열분석을 위해 핵산은 특정 염기쌍 길이로 단편화되어야 합니다. 이러한 모든 작업은 UIP400MTP 고 처리량 초음파 발생기에 의해 안정적이고 신속하게 수행됩니다!
프로테오믹스(Proteomics)
단백질체 분석은 미생물 세포에서 단백질을 추출해야 합니다. 초음파 처리는 세포를 파괴하여 단백질을 용액으로 방출하는 데 효과적으로 사용됩니다. 그런 다음 이러한 단백질을 정제하고 분석하여 마이크로바이옴 내에서 기능적 역할과 대사 경로에 대한 관여를 이해할 수 있습니다. UIP400MTP 멀티웰 플레이트 초음파기를 사용하면 몇 분 내에 용해 및 단백질 추출 작업을 수행하여 미생물 군집에서 단백질에 의해 주도되는 생물학적 과정에 대한 통찰력을 얻기 위한 재현 가능한 결과를 생성할 수 있습니다.
메타단백질체학(metaproteomics)
메타단백질체학(metaproteomics)은 단백질체 분석을 전체 미생물 군집으로 확장하여 집단 단백질 함량을 연구하여 마이크로바이옴 내의 기능적 발현과 상호 작용을 이해합니다. 초음파 처리는 세포를 용해하여 단백질을 방출하는 데 사용되며, 단백질은 질량 분석법과 같은 기술을 통해 정제 및 분석됩니다. 이 접근법은 다양한 환경에서 미생물 군집의 활성 생물학적 과정과 적응에 대한 자세한 통찰력을 제공합니다.
UIP400MTP 멀티웰 플레이트 초음파 발생기의 고처리량 처리 용량을 활용하고 마이크로바이옴 연구 및 분석을 용이하게 하십시오!
UIP400MTP 고처리량 초음파 발생기 multi-well plate, 96-well plate, tube 및 Petri dish의 마이크로바이옴 연구용.
UIP400MTP 마이크로바이옴 진단에서 고처리량 시료 전처리를 위한 Multiwell Plate Sonicator.
멀티웰 플레이트 초음파 발생기는 예를 들어 마이크로바이옴 연구 및 진단에서 고처리량 시료 준비를 용이하게 UIP400MTP.
96 웰 플레이트 초음파 발생기 UIP400MTP : 초음파 투과 액체가 모든 웰을 둘러싸고 각 샘플의 균일 한 초음파 처리를 제공합니다
UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator의 주요 특징
| 고처리량 초음파 처리 | 96-wells 및 기타 multiwell 플레이트에 완벽하게 적합한 이 UIP400MTP는 여러 샘플의 동시 동일한 초음파 처리를 허용하여 샘플 준비 기간을 크게 단축하고 높은 샘플 수 테스트의 처리량을 증가시킵니다. |
| 원하는 Multiwell 플레이트를 사용하십시오. | 이 UIP400MTP는 모든 표준 멀티웰 플레이트, PCR 플레이트 또는 마이크로타이터 플레이트를 초음파 처리하도록 설계되었습니다. 실험에 가장 적합한 플레이트를 선택합니다. UIP400MTP에는 독점 소모품이 필요하지 않기 때문에 많은 비용을 절약할 수 있습니다! |
| 비접촉 초음파 | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP는 샘플에 아무것도 삽입하지 않고 강렬한 초음파를 적용합니다. ealed multiwell 플레이트, 밀폐된 용기 및 바이알을 초음파 처리할 수 있습니다. Hielscher는 비표준 바이알 또는 용기에 대한 맞춤형 샘플 홀더를 제공합니다. |
| 정밀도 및 제어 | 정밀 제어 및 스마트 소프트웨어를 사용하면 특정 처리 요구 사항에 맞게 초음파 매개 변수를 최적으로 설정할 수 있습니다. 모든 실험에 대해 최대의 초음파 처리 효율성과 효과를 얻을 수 있습니다. |
| 온도 제어 | 초음파 처리를위한 특정 온도를 설정하십시오. UIP400MTP 플레이트 초음파 발생기는 샘플 온도를 모니터링하고 그에 따라 초음파 처리를 조정할 수 있습니다. 재순환 냉각액은 정확한 온도 제어를 위해 플레이트의 각 웰을 냉각시킵니다. |
| 프로토콜 및 원격 제어 | 각 초음파 처리는 컴퓨터에서 제어 할 수 있습니다. 소프트웨어 설치가 필요하지 않습니다. 모든 운영 체제(예: MacOS, Windows, Android, iOS 또는 Linux)에서 표준 브라우저(예: Chrome, Firefox, Edge 또는 Safari)를 사용하여 원격으로 UIP400MTP 제어하고 모니터링할 수 있습니다. 각 초음파 처리 실행은 평가 및 문서화를 위한 자세한 초음파 처리 프로토콜을 생성합니다. 프로토콜 파일은 비독점 CSV 형식으로, 선호하는 프로그램(예: Microsoft Excel, Apple Numbers 또는 OpenOffice Calc)으로 열 수 있습니다. |
| 견고하고 신뢰할 수 있음 | 독일에서 최고 품질 기준에 따라 설계 및 제작된 이 UIP400MTP은 강력할 뿐만 아니라 내구성이 뛰어납니다. 이 설계는 산업 표준을 충족하며 까다로운 실험실 환경에서 매일 사용하는 혹독한 환경을 쉽게 견딜 수 있습니다. 처리량이 많은 작업에서 주 7일, 24시간 지속적으로 UIP400MTP 사용할 수 있습니다. |
- 고능률
- 최첨단 기술
- 신뢰도 & 견고성
- 조정 가능하고 정밀한 공정 제어
- 인텔리전트 소프트웨어
- 스마트 기능(예: 프로그래밍 가능, 데이터 프로토콜링, 원격 제어)
- 쉽고 안전한 작동
- 낮은 유지 보수
- CIP(clean-in-place, 클린-인-플레이스)
설계, 제조 및 컨설팅 – 독일에서 만든 품질
Hielscher 초음파는 최고의 품질과 디자인 표준으로 잘 알려져 있습니다. 견고 함과 쉬운 작동으로 초음파를 산업 시설에 원활하게 통합 할 수 있습니다. 거친 조건과 까다로운 환경은 Hielscher 초음파기로 쉽게 처리 할 수 있습니다.
Hielscher 초음파는 ISO 인증 회사이며 최첨단 기술과 사용자 친화성을 갖춘 고성능 초음파에 특히 중점을 둡니다. 물론, Hielscher 초음파는 CE를 준수하며 UL, CSA 및 RoHs의 요구 사항을 충족합니다.
비접촉 초음파 발생기 UIP400MTP 멀티웰 플레이트(multi-well plate)에서 마이크로바이옴 시료 전처리용.
문헌 / 참고문헌
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- InfoGraphic UIP400MTP – 96-well plate Ultrasonicator for High-Throughput Sample Prep – english – Hielscher Ultrasonics
- Jannike L. Krause, Sven-Bastiaan Haange, Stephanie S. Schäpe, Beatrice Engelmann, Ulrike Rolle-Kampczyk, Katarina Fritz-Wallace, Zhipeng Wang, Nico Jehmlich, Dominique Türkowsky, Kristin Schubert, Judith Pöppe, Katrin Bote, Uwe Rösler, Gunda Herberth, Martin von Bergen (2020): The glyphosate formulation Roundup® LB plus influences the global metabolome of pig gut microbiota in vitro. Science of The Total Environment, Volume 745, 2020.
- Tröscher-Mußotter, Johanna; Sáenz, Johan; Grindler, Sandra; Meyer, Jennifer; Kononov, Susanne; Mezger, Beate; Borda, Daniel; Frahm, Jana; Dänicke, Sven; Camarinha-Silva, Amelia; Huber, Korinna; Seifert, Jana (2021): Microbiome Clusters Disclose Physiologic Variances in Dairy Cows Challenged by Calving and Lipopolysaccharides. mSystems 2021.
- Jannike Lea Krause, Beatrice Engelmann, Stephanie Serena Schaepe, Ulrike Rolle-Kampczyk, Nico Jehmlich, Hyun-Dong Chang, Ulla Slanina, Maximillian Hoffman, Jörg Lehmann, Ana Claudia Zenclussen, Gunda Herberth, Martin von Bergen, Sven-Bastiaan Haange (2024): DSS treatment does not affect murine colonic microbiota in absence of thehost. Gut Microbes 2024.
마이크로바이옴 연구에 대해 자주 묻는 질문
초음파 처리는 박테리아에 무엇을합니까?
초음파 처리는 고주파 음파를 사용하여 박테리아 세포를 파괴하여 충격파와 기계적 힘을 생성하는 캐비테이션을 일으켜 세포 용해 및 세포 내 내용물의 방출을 유도합니다.
마이크로바이옴을 연구하는 데 사용되는 방법은 무엇입니까?
마이크로바이옴을 연구하는 방법에는 16S rRNA 유전자 염기서열 분석 및 균유전체학과 같은 DNA 염기서열 분석 기술뿐만 아니라 전사체학, 단백질체학 및 미생물 기능 및 상호 작용을 분석하기 위한 대사체학이 포함됩니다. 생성된 방대한 데이터를 해석하기 위해 생물정보학 도구가 사용됩니다.
마이크로바이옴 분석에 사용되는 기법은 무엇입니까?
마이크로바이옴 분석에 사용되는 기술에는 분류학적 프로파일링을 위한 16S rRNA 유전자 염기서열분석, 포괄적인 유전자 분석을 위한 메타게놈 염기서열분석, 유전자 발현을 연구하기 위한 메타전사체학, 단백질을 분석하기 위한 메타단백질체학, 대사산물을 식별하기 위한 대사체학이 포함됩니다. 생물정보학 도구는 데이터 처리 및 해석에 필수적입니다.
마이크로바이옴 연구에서 대사체학(Metabolomics), 균유전체학(Metabolomics), 균유전체학(Metaproteomics) 및 메타프로테오믹스(Metaproteomics)는 무엇입니까?
마이크로바이옴 연구에서 대사체학은 미생물에 의해 생성되는 작은 분자와 대사 산물을 분석하여 미생물의 대사 활동에 대한 통찰력을 제공합니다. 균유전체학(metagenomics)은 미생물 군집의 집단 게놈을 시퀀싱하여 유전적 구성과 기능적 잠재력을 이해하는 것을 포함합니다. 메타단백질체학(metaproteomics)은 마이크로바이옴의 전체 단백질 함량을 연구하여 유전자의 기능적 발현과 미생물 군집 내에서 단백질이 수행하는 역할을 밝힙니다.
마이크로바이옴 연구에서 박테리아 군집이란 무엇입니까?
마이크로바이옴 연구에서 박테리아 콜로니는 고형 성장 배지에서 단일 또는 몇 개의 세포에서 성장하여 눈에 보이는 클러스터를 형성하는 박테리아 그룹입니다. 이러한 콜로니는 미생물 군집 내에서 특정 박테리아 균주의 특성, 다양성 및 기능을 연구하는 데 사용되는 클론 개체군을 나타냅니다.
