High-Throughput Sonication에 의해 촉진되는 대사체학(Metabolomics)
대사체학(Metabolomics)은 소변, 혈청, 혈장, 대변 및 타액과 같은 다양한 생체 유체에서 작은 분자를 특성화하고 정량화하기 위해 고처리량 기술을 사용하여 고유한 대사 서명을 밝히는 연구 분야입니다. 멀티웰 플레이트용으로 설계된 고처리량 초음파 발생기 UIP400MTP는 이러한 샘플의 세포를 용해하는 강력한 도구로, 다운스트림 분석을 위한 대사 산물의 방출을 용이하게 합니다. 이 정확하고 신뢰할 수 있는 접근 방식은 정확한 연구 설계, 세심한 시료 준비, 최적화된 플랫폼 설정, 포괄적인 데이터 분석 및 의미 있는 생물학적 해석이 가장 중요한 대사체학에 필수적입니다. 대사체학은 탄수화물, 지질, 아미노산과 같은 특정 종류의 분자에 초점을 맞추는 표적 접근법과 시료 내 대사 프로파일에 대한 광범위한 개요를 제공하여 대사 신호전달의 복잡한 복잡성을 드러내는 비표적 기법을 모두 사용합니다.
UIP400MTP는 다중 웰 플레이트에서 세포 용해 및 대사 산물 추출을 위한 비접촉식 고처리량 초음파 발생기입니다
96웰 플레이트 초음파를 사용한 고처리량 시료 전처리 UIP400MTP
비접촉식 초음파 발생기 UIP400MTP을 96웰 플레이트와 함께 사용하는 것은 고처리량 균질화 및 대사 산물 추출을 위한 효율적인 방법입니다. 이 설정은 시료와의 직접 접촉을 방지하여 여러 시료를 동시에 처리하는 동안 교차 오염의 위험을 줄입니다.
96-Well Sonicator UIP400MTP를 사용한 균질화를 위한 단계별 프로토콜
- 대사체학 시료의 준비
샘플 배치: 각 샘플(예: 대변, 장 조직 또는 발광 내용물)을 96웰 플레이트 또는 마이크로플레이트의 개별 웰에 분주합니다.
용매: 메탄올, 에탄올, 아세토니트릴, 클로로포름 및 이들(수용성) 혼합물과 같은 유기 용매는 대사 산물 추출에 필수적이며 세포 기질에서 세포 내 대사 산물의 방출을 돕습니다. 웰당 100–300 μL의 용매를 사용하여 시료를 완전히 담글 수 있는 충분한 부피를 확보합니다.
내부 기준: 선택적으로, 다운스트림 대사체 분석 중 정규화를 위해 각 웰에 내부 표준물질을 추가합니다. - 커플링 매체 설정
수위: 설명서에 설명 된대로 물 (커플 링 매체)로 채워진 초음파 처리 플랫폼에 96well 플레이트를 놓습니다. - UIP400MTP 매개 변수 구성
전원 설정: 효율적인 균질화를 위해 초음파 진폭을 최대 전력의 50-80%로 조정합니다.
펄스 모드: 초음파 처리 주기를 번갈아 펄스(예: 30초 ON, 30초 OFF)로 설정하여 냉각을 허용하고 샘플 과열을 방지합니다.
총 시간: 4–10분, 시료의 복잡성과 인성에 따라 다름.
온도 제어: 열에 민감한 대사 산물을 보호하기 위해 초음파 처리 중에 물을 4-8 ° C로 유지하기 위해 실험실 냉각기를 사용하십시오. - 초음파 처리 과정
초음파 처리 주기에 대한 UIP400MTP 시작합니다.
UIP400MTP 인터페이스를 통해 프로세스를 모니터링합니다.
캐비테이션 효과는 웰 내의 샘플과 세포를 균질화하여 세포 내 대사 산물을 용매로 방출합니다. - 포스트소닉
원심 분리: 초음파 처리 후 필요한 경우 플레이트 내용물을 수집 튜브로 옮깁니다. 4,000–6,000 × g에서 10분 동안 원심분리하여 불용성 파편과 세포 물질을 펠릿화합니다.
상층액 수집: 분석을 위해 각 웰의 상층액을 새 튜브 또는 플레이트로 조심스럽게 옮깁니다.
선택적인 건조: 농도가 필요한 경우 진공 농축기(예: SpeedVac)를 사용하여 상층액을 건조시킨 다음 적절한 용매를 소량으로 재구성합니다.
UIP400MTP 멀티웰 플레이트 초음파 발생기의 고처리량 처리 용량을 활용하고 대사체학 연구 및 분석을 용이하게 하십시오!
UIP400MTP 고처리량 초음파 발생기 multi-well plate, 96-well plate, tube 및 Petri dish의 대사체학 연구용.
UIP400MTP 대사체학 연구에서 고처리량 시료 전처리를 위한 Multiwell Plate Sonicator.
UIP400MTP와의 비접촉 초음파 처리 원리
이 UIP400MTP는 커플링 매체(예: 물)를 통해 간접적으로 96웰 플레이트의 웰에 초음파를 적용합니다. 이러한 파동은 캐비테이션을 생성하여 세포를 파괴하고 초음파 발생기 프로브와 샘플 사이의 물리적 접촉없이 대사 산물을 방출합니다.
“분변 마이크로바이옴 샘플의 균일하고 일관된 박테리아 용해를 위해 UIP400MTP 초음파 발생기를 사용한 환상적인 경험에 감사드립니다. 당사는 고처리량 용해 기술의 한계를 뛰어넘고 있으며, 귀하의 기기는 이러한 작업에 매우 적합합니다. 주요 하이라이트 중 일부는 다음과 같습니다.
- 작동의 용이성 – Instrument는 사용하기 쉽고 메뉴 선택을 사용하여 간단하게 사용자 정의할 수 있습니다.
- 높은 처리량 – 한 번에 96개의 시료가 있는 플레이트 취급에 탁월함
- 모든 선박의 균일 한 초음파 처리 – 이 장치는 모든 우물에 동일한 양의 초음파 처리를 전달할 수 있었으며, 이는 우리의 응용 분야에 매우 중요했습니다
- Hielscher 팀의 지원 – 지원은 훌륭했고, 당신은 항상 교육에서 우리를 위해 거기에 있었고, 우리의 질문에 답하고 문제를 해결했으며, 우리가 목표를 달성하는 데 도움이 된 제안을 했습니다.
프로토콜을 최적화하기 위해 노력하는 동안 여러분의 도움과 도움에 다시 한 번 감사드립니다.”
마크 D. 드리스콜 박사 (Mark D. Driscoll, Ph.D.) – 최고과학책임자(CSO) – 인투스 바이오사이언스
멀티웰 플레이트 초음파 발생기는 UIP400MTP 예를 들어 대사 산물 연구 및 분석에서 고처리량 시료 준비를 용이하게 합니다.
96 웰 플레이트 초음파 발생기 UIP400MTP : 초음파 투과 액체가 모든 웰을 둘러싸고 각 샘플의 균일 한 초음파 처리를 제공합니다
UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator의 주요 특징
| 고처리량 초음파 처리 | 96-wells 및 기타 multiwell 플레이트에 완벽하게 적합한 이 UIP400MTP는 여러 샘플의 동시 동일한 초음파 처리를 허용하여 샘플 준비 기간을 크게 단축하고 높은 샘플 수 테스트의 처리량을 증가시킵니다. |
| 원하는 Multiwell 플레이트를 사용하십시오. | 이 UIP400MTP는 모든 표준 멀티웰 플레이트, PCR 플레이트 또는 마이크로타이터 플레이트를 초음파 처리하도록 설계되었습니다. 실험에 가장 적합한 플레이트를 선택합니다. UIP400MTP에는 독점 소모품이 필요하지 않기 때문에 많은 비용을 절약할 수 있습니다! |
| 비접촉 초음파 | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP는 샘플에 아무것도 삽입하지 않고 강렬한 초음파를 적용합니다. ealed multiwell 플레이트, 밀폐된 용기 및 바이알을 초음파 처리할 수 있습니다. Hielscher는 비표준 바이알 또는 용기에 대한 맞춤형 샘플 홀더를 제공합니다. |
| 정밀도 및 제어 | 정밀 제어 및 스마트 소프트웨어를 사용하면 특정 처리 요구 사항에 맞게 초음파 매개 변수를 최적으로 설정할 수 있습니다. 모든 실험에 대해 최대의 초음파 처리 효율성과 효과를 얻을 수 있습니다. |
| 온도 제어 | 초음파 처리를위한 특정 온도를 설정하십시오. UIP400MTP 플레이트 초음파 발생기는 샘플 온도를 모니터링하고 그에 따라 초음파 처리를 조정할 수 있습니다. 재순환 냉각액은 정확한 온도 제어를 위해 플레이트의 각 웰을 냉각시킵니다. |
| 프로토콜 및 원격 제어 | 각 초음파 처리는 컴퓨터에서 제어 할 수 있습니다. 소프트웨어 설치가 필요하지 않습니다. 모든 운영 체제(예: MacOS, Windows, Android, iOS 또는 Linux)에서 표준 브라우저(예: Chrome, Firefox, Edge 또는 Safari)를 사용하여 원격으로 UIP400MTP 제어하고 모니터링할 수 있습니다. 각 초음파 처리 실행은 평가 및 문서화를 위한 자세한 초음파 처리 프로토콜을 생성합니다. 프로토콜 파일은 비독점 CSV 형식으로, 선호하는 프로그램(예: Microsoft Excel, Apple Numbers 또는 OpenOffice Calc)으로 열 수 있습니다. |
| 견고하고 신뢰할 수 있음 | 독일에서 최고 품질 기준에 따라 설계 및 제작된 이 UIP400MTP은 강력할 뿐만 아니라 내구성이 뛰어납니다. 이 설계는 산업 표준을 충족하며 까다로운 실험실 환경에서 매일 사용하는 혹독한 환경을 쉽게 견딜 수 있습니다. 처리량이 많은 작업에서 주 7일, 24시간 지속적으로 UIP400MTP 사용할 수 있습니다. |
- 고능률
- 최첨단 기술
- 신뢰도 & 견고성
- 조정 가능하고 정밀한 공정 제어
- 인텔리전트 소프트웨어
- 스마트 기능(예: 프로그래밍 가능, 데이터 프로토콜링, 원격 제어)
- 쉽고 안전한 작동
- 낮은 유지 보수
- CIP(clean-in-place, 클린-인-플레이스)
설계, 제조 및 컨설팅 – 독일에서 만든 품질
Hielscher 초음파는 최고의 품질과 디자인 표준으로 잘 알려져 있습니다. 견고 함과 쉬운 작동으로 초음파를 산업 시설에 원활하게 통합 할 수 있습니다. 거친 조건과 까다로운 환경은 Hielscher 초음파기로 쉽게 처리 할 수 있습니다.
Hielscher 초음파는 ISO 인증 회사이며 최첨단 기술과 사용자 친화성을 갖춘 고성능 초음파에 특히 중점을 둡니다. 물론, Hielscher 초음파는 CE를 준수하며 UL, CSA 및 RoHs의 요구 사항을 충족합니다.
비접촉 초음파 발생기 UIP400MTP 마이크로플레이트의 대사체학 시료 전처리용.
문헌 / 참고문헌
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Metabolomic Research에 대해 자주 묻는 질문
마이크로바이옴이란 무엇인가요?
마이크로바이옴은 박테리아, 바이러스, 곰팡이 및 고세균을 포함한 미생물과 그들의 유전 물질을 포함하여 인체와 같은 특정 환경에 서식하는 미생물의 집합적 군집을 나타냅니다. 그것은 신진대사, 면역 기능 및 병원체에 대한 보호에 영향을 미치면서 식단, 생활 방식 및 환경과 같은 요인에 의해 형성됨으로써 숙주 건강에 중요한 역할을 합니다.
대사체학(Metabolomics)이란 무엇인가요?
대사체학(Metabolomics)은 생물학적 시스템 내의 대사 과정에서 생성되는 작은 분자인 대사 산물에 대한 포괄적인 연구입니다. 여기에는 세포 기능, 대사 경로 및 유전적, 환경적 또는 병리학적 변화에 어떻게 반응하는지 이해하기 위해 이러한 분자의 식별, 정량화 및 분석이 포함됩니다.
대사체(Metabolome)란 무엇인가요?
대사체는 주어진 시간에 세포, 조직 또는 유기체와 같은 생물학적 시스템 내에 존재하는 작은 분자 또는 대사 산물의 완전한 집합입니다. 이는 시스템의 생화학적 활동과 생리적 상태를 반영하여 신진대사 및 환경과의 상호 작용에 대한 통찰력을 제공합니다.
