E. კოლის ულტრაბგერითი ლიზი
- E. coli ბაქტერია წარმოადგენს ყველაზე ხშირად გამოყენებულ ბაქტერიას მიკრობიოლოგიასა და ბიოტექნოლოგიაში.
- ულტრაბგერითი უჯრედის დარღვევები ე.კოლის ლილისთვის საიმედო და რეპროდუქციულ შედეგებს აწვდის.
- ინტენსიური ჯერჯერობით ზუსტად კონტროლირებადი cavitation და shear ძალების შედეგად სრული დარღვევა და მაღალი მოპოვების შემოსავალი (მაგ. ცილები, დნმ).
უჯრედის დარღვევა კვატაციის გზით
ულტრაბგერითი გამოსაძიებელი ჰომოგენიერები მოქმედებს. 20,000 ციკლის წამში (20 კგ-ზე) და გამოიწვიოს სითხეებში ან დამატებების დროს. აკუსტიკური cavitation მიკროსკოპული სფეროებში ვაკუუმი მსგავსი წნევა და მაღალი ტემპერატურა, რომ ცრემლსადენი საკნები გარდა. მიუხედავად იმისა, რომ ტემპერატურამ შესაძლოა რამდენიმე ათასი გრადუსამდე მიაღწიოს, მცირე ზომის კვამლის ტომი ძალიან მნიშვნელოვანია, რადგან ისინი მნიშვნელოვნად არ ამცირებენ პროცესს. ულტრაბგერითი გენერირებული აკუსტიკური cavitation და shear ძალების perforate ან შესვენება საკანში გარსის E.coli – დამოკიდებულია მოწყობილობის პარამეტრი ულტრაბგერითი homogenizer.
ულტრაბგერითი ლიზის უპირატესობები
- ლილის ზუსტი კონტროლი (ინტენსივობა, ამპლიტუდა, ტემპერატურა)
- ოპტიმალური ადაპტაცია კონკრეტული ნიმუშების მიმართ
- ტემპერატურის კონტროლი
- ძალიან მცირე ძალიან დიდი ნიმუშები (μL ლიტრი)
- სუფთა მექანიკური მკურნალობა
- ლაბორატორიიდან წარმოების ხაზოვანი მასშტაბი

VialTweeter ულტრაბგერითი ლიზისთვის
ულტრაბგერითი ლიზისი ემყარება მხოლოდ მექანიკურ ძალებს. ქიმიკატები არ ემატება, გაჟღენთილი ძალებით არღვევს უჯრედის კედელს. ქიმიურმა ლიზისმა შეიძლება შეცვალოს ცილის სტრუქტურა და შემოიტანოს გაწმენდის პრობლემები. ფერმენტული მოშლა მოითხოვს ხანგრძლივ ინკუბაციურ პერიოდს და არ არის გამრავლება. E.coli ბაქტერიის უჯრედების ულტრაბგერითი უჯრედების მოშლა არის სწრაფი, მარტივი, საიმედო და განმეორებადი. ამიტომ Hielscher ულტრაბგერითი საშუალებები გამოიყენება ბიოლოგიურ და ბიოქიმიურ ლაბორატორიებში მთელს მსოფლიოში ნიმუშების მოსამზადებლად, ანანალიტიკებში, in vitro დიაგნოზში და მრავალფეროვანი ანალიზებისთვის.
ზოგადი რეკომენდაციები
Sonication არის ყველაზე პოპულარული ტექნიკა, რომელიც იძლევა ძალიან მცირე, საშუალო და დიდი რაოდენობით უჯრედების შეჩერებას – პიკო-ლიტრიდან 100 ლ / სთ-მდე (ულტრაბგერითი ნაკადის უჯრედის გამოყენებით). უჯრედები lysed მიერ თხევადი shear და cavitation. დნმ ასევე გამოიმუშავებს sonication, ამიტომ არ არის აუცილებელი დაამატოთ DNase საკანში შეჩერების.
ტემპერატურის კონტროლი:
ნიმუშის წინასწარი გაგრილებით და ნიმუშის ნიმუშის ყინვის დროს ნიმუშის შენახვა, ნიმუშის თერმული დეგრადაციის ნიმუში ადვილად შეიძლება.
იდეალურ შემთხვევაში, ნიმუშები უნდა იყოს ინახება ცივი ცივი სიცხის დროს, მაგრამ ნიმუშების უმრავლესობა საკმარისია თუ ტემპერატურა არ აღემატება კულტურის ან ქსოვილის წყაროს ზემოთ. აქედან გამომდინარე, რეკომენდებულია, რომ ყინულზე შეჩერება და 5-10 წმ-მდე რამდენიმე მოკლე ულტრაბგერითი pulses და sonicate 10-30 წამი pauses. დროს pauses, სითბოს შეიძლება dissipate, რათა აღდგენა დაბალი ტემპერატურა. დიდი უჯრედების ნიმუშებისთვის, სხვადასხვა ნაკადის საკანში რეაქტორი გაგრილების ქურთუკებით არის შესაძლებელი.
პროტოკოლები ე.კოლის ლაისტების მომზადებისთვის
გამოხატვის ანალიზი და გამწმენდი რეაქბინანტიანი ცილა
E. coli pellet იყო sonicated ერთად ულტრაბგერითი სისტემა UP100H (Hielscher). ამ მიზნით, საკანში ნალექი იყო გაცივებული გაცივებული ლიზის ბუფერში (50 მმ Tris-HCl pH = 7.5, 100 მმ NaCl, 5 მმ DTT, 1 მმ PMSF) და ყინულზე 10 წუთის განმავლობაში. შემდეგ, უჯრედების შეჩერებას 10 წამში 10 მოკლე აფეთქება მოჰყვა, რასაც მოჰყვა 30 სთ ინტერვალი გაგრილებისთვის. საბოლოოდ, საკანში ნამსხვრევები ამოიღეს ულტრაცენტრიფუგაზე 4 ° C- დან 15 მლნ-მდე 14000 rpm- ზე. RPR გამოხატვის დასამტკიცებლად, supernatant- ი 12% -იანი პოლილიკრილამიდული ლარით აწარმოებდა და გაანალიზდა SDS-PAGE და დასავლეთის ბლოკირება. RPR- ის გაწმენდა მოხდა Ni- ის გამოყენებით2+-ნან ფისოვანი (მოწინააღმდეგე, აშშ) მწარმოებლის სახელმძღვანელოს მიხედვით. ამ ეტაპზე გამოყენებული იყო ადგილობრივი გამწმენდი მეთოდი. გაწმენდილი ცილის სისუფთავე შეფასდა ელექტროფორეზის გამოყენებით 12% პოლიკარრილამდის გელზე და შემდგომ კომოსი ლურჯი შეღებვა. გაწმენდილი ცილის კონცენტრაცია იზომება მიკრო BCA პროტეინის ასაკის ნაკრებით (PIERCE, USA). (Azarnezhad et al. 2016)

ულტრაბგერითი ჰომოგენიზატორი UP100H (100W)
უჯრედების ზრდის, გადაჯგუფების და ე.კოლის უჯრედების ექსტრაქტების მომზადება
იყიდება SeqA და RNA პოლიმერაზა ChIP-Chip E. coli MG1655 ან MG1655 ΔseqA გაიზარდა 37 ° C მდე OD600 დაახლოებით 50 მლ LB (+ 0.2% გლუკოზა), დაახლოებით 27 მლ ფორმალდეჰიდის (37%) თითო მლ / მლ-ზე დამატებამდე (საბოლოო კონცენტრაცია 1%). Crosslinking შეასრულა ნელა აფეთქება (100 rpm) ოთახის ტემპერატურაზე 20 წუთი, შემდეგ 10 მლ 2.5 მგ გლიცინის (საბოლოო კონცენტრაცია 0.5 მ) ჩაქუჩით. სითბოს-შოკის ექსპერიმენტებისათვის, E. coli MG1655 65 მლ ლმ-ში საშუალო 30 ° C- მდე გაიზარდა600 დაახლოებით 0.3. შემდგომში 30 მლ კულტურა გადაეცა წინასწარ დათბუნებულ ფაზას 43 ° C და დანარჩენი 30 ° C- ზე. გადაკვეთა და ჩაქრობა იყო ზემოთ აღწერილი, გარდა იმისა, რომ საკნები ინახებოდა 30 ან 43 ° C 5 წთ-ის განმავლობაში, სანამ ოთახის ტემპერატურაზე უფრო ნელა მოხდებოდა. საკნები შეგროვდა ცენტრიფუგაციით და ორჯერ ცივი TBS (pH7.5 )თ. 1 მლ ლიზის ბუფერში (10 მმ Tris (pH 8.0), 20% საქაროზა, 50 მმ ნაქსოვი, 10 მმ EDTA, 10 მგ / მლ ლიზოსმი) და ინკუბაცია 30 ° C- ზე, შემდეგ 4 მლ IP ბუფერი, უჯრედები იყენებდნენ ყინულზე 12-ჯერ 30 წამით და 30 წმ-ზე UP400St ულტრაბგერითი პროცესორი (Hielscher Ultrasonics GmbH) 100% -ით. 10 მმ-ის დაშორებით 9000 გ-ის შემდეგ, 800 მლ სიგნალის შემცველობა იყო ინახება -20 ° C -ზე. (Waldminghaus 2010)
ფერმენტების მოხმარება და გამწმენდი.
დეჰჰისტიდინის (მისი 10) შემცველობის პროტეინების დასადგენად, E. coli BL21 (DE3) გარდაიქმნა pET19b- ით. ღამის სიბრტყეზე მოსავლელი იყო ცენტრიფუგა, ხოლო 1% გამოყენებული იყო კულტურის გამოხატულებაში. PET19mgtB- ის უჯრედები 22 ° C- მდე გაიზარდა, სანამ ოპტიკური სიმკვრივე 600 ნმ600) 0.7. კულტურა გადაეცათ 17 ° C და გამოწვეული იყო 100 μM IPTG. 16 სთ-ის შემდეგ, კულტურის მოსავლიანობა ცენტრიფუგაციით 7,500 × გ 4 ° C- ზე. საკნებში აღინიშნებოდა 50 მმ ფოსფატიანი ბალიშის სანელებლით (PBS) 0.3 მ NaCl- ზე pH 7.4 და ჩაიშალა ულტრაბგერითი გამოყოფით S2 მიკრო-წვერიანი sonotrode UP200St ულტრაბგერითი (Hielscher, Teltow, გერმანია) დროს ციკლი 0.5 და ამპლიტუდა 75%.
დეჰჰისიდინდინი-გიგანტური GtfC- ის ზედმეტი გამონაკლისი იყო 37 ° C- ზე OD- ზე600 0.6-დან 100 μM IPTG- ით. უჯრედები შემდგომში დაიბომბა 4 საათის განმავლობაში, მოსავალს და იწოვდნენ როგორც ზემოთ აღინიშნა MgtB- სთვის.
უჯრედის ნამსხვრევების ნალექი იყო 15,000 × გ და 4 ° C- ზე. დაზუსტებული ექსტრაქტები დატვირთული იქნა 1 მლ მისტრაბში FF Crude სვეტების მიერ ÄKTAprime Plus სისტემით (GE Healthcare) გამოყენებით. ფერმენტები გაწმენდილი იყო მწარმოებლის პროტოკოლის მიხედვით მისი ციტატის ცილების გრადიენტური სიბრტყისათვის. გამოხატული პროტეინის ხსნარები ორჯერ დიამეტრიანი იყო 50 მმ-ის PBS, pH 7.4, 0.3 M NaCl- ზე, 4 ° C- ზე. გამწმენდი გაანალიზდა 12% SDS-PAGE. ცილის კონცენტრაცია განისაზღვრა ბრედფორდის მეთოდით Roti-Quant- ის გამოყენებით (კარლ როტ GmbH, კარლსრუე, გერმანია). (რაბუსჩი და სხვ. 2013)
ცილოვანი ბაქტერიების პროტეინის ექსტრაქცია
დაინტერესების საშიში ცილა (ამ შემთხვევაში, არაბვიპოსის თალიანის MTV1) GST- ის ტოლერანტთან არის დაკავშირებული და გამოხატულია BL21 Escherichia coli (E. coli) საკნებში.
1. მიიღეთ ერთი გლეტი GST-MTV1 და GST (შეესაბამება 50 მლ ბაქტერიულ კულტურას) და ყოველი 2.5 მლ ყინულის ცივი მოცილების ბუფერში.
2. გამოიყენეთ ულტრაბგერითი UP100H (აღჭურვილია MS3 მიკროტოპი- sonotrode მცირე მოცულობით (2-5 მლ)), რათა ჩაიშალოს ბაქტერიული უჯრედები, სანამ არ აისახება, რაც აღინიშნება შეწოვისა და სიბლანტის შემცირებით. ეს უნდა ჩატარდეს ყინულზე და რეკომენდებულია ინტერვალებით გამოსაყენებლად (მაგ. 10 წამიანი გამაძლიერებელი, რომელიც მოყვება 10 წამს ყინულზე და ა.შ.). ზრუნვა უნდა იქნას მიღებული არა ძალიან მაღალი ინტენსივობით. თუ fomaming ან ფორმირების თეთრი precipitate აღმოჩენილი, ინტენსივობის უნდა შემცირდეს.
3. Lysed ბაქტერიების ხსნარი 1.5 მლ მიკროციფრულების მილები და ცენტრიფუგა 4 ° C, 16,000 x 20 წთ.
ალინი-მოდიფიცირებული პროტეინები E. coli- ში
სულფჰიდრილის შემცველობის განსაზღვრა 5,5-დიტირობით (2-ნიტრობენზოური მჟავა) (DTNB)
ეკო კოლი MG1655 ღამე კულტურა გამოყენებულ იქნა MOPS მინიმალური საშუალო ინოვაციისთვის (1: 100). კულტურის აეროდრომი გაიზარდა, სანამ A600 0.4 მიღწეული იყო. კულტურა გაყოფილი იყო სამ -15 მლ კულტურაზე სტრესული მკურნალობისთვის. არათანმიმდევრული კულტურა ნეგატიურ კონტროლს წარმოადგენს. 0.79 მმ ალცინი (128 მკგ მლ-1) ან 1 მმ დიამედი დაემატა ერთ დანარჩენ ორ კულტურას. კულტურები 15 წუთის განმავლობაში დაიხარჯა თითოეული კულტურის 5 მლ-ზე მოსავალს მიეკუთვნება ცენტრიფუგა (8,525 × გ, 4 ° C, 10 წთ). უჯრედები დაიბანეთ ორჯერ 1 მლ PBS (137 მმ NaCl, 2.7 მმ კკკ, 10 მმ2HPO42 მმ კჰ2PO4, pH 7.4, ინახება ანაერობულად ადრე გამოყენება) და ცენტრიფუგით (13,000 × გ, 4 ° C, 10 წთ). საკნებში აღინიშნა ლიზონური ბუფერში (PBS 6 მმ Guanidinium HCl, pH 7.4), სანამ არღვევდა 4 ° C- ს მიერ ულტრაბგერითიVialTweeter ულტრაბგერითი, Hielscher GmbH, გერმანია) (3 × 1 წთ). უჯრედის ნამსხვრევები გაჟღენთილი იყო ცენტრიფუგაით (13,000 × გ, 4 ° C, 15 წთ). სუნამომ გადაიყვანა 3.5 მლ QS-macro cuvette (10 მმ) მაგნიტური სტაბილური ბარი და შერეული 1 მლ ლიზის ბუფერი. ნიმუშების გადანაწილება 412 ნმ-ზე მონიტორინგს იწყებს, რომელიც აღჭურვილია PSC-718 ტემპერატურული კონტროლირებადი საკანში (ჯასკო) ოთახის ტემპერატურის მქონე Jasco V-650 სპექტროფოტომეტრით. დაემატა 3 მმ დიტირობის 100 მლ (2-ნიტრობენზოური მჟავა) ხსნარი. გადაშენება მოხდა მანამ, სანამ არ მოხდებოდა ინტენსივობა. თოლილი კონცენტრაციის გაანგარიშება განხორციელდა გადაშენების კოეფიციენტის ε412 = 13,700 მ-1 სმ-1 thio-2-nitrobenzoic მჟავა (TNB). უჯრედული თიოლური კონცენტრაციები გამოითვალა ე.კოლის უჯრედების მოცულობით 6.7 × 10-15 ლიტრი და საკანში სიმჭიდროვე600 = 0.5 (1 × 10 ექვივალენტი8 უჯრედების მლ-1 კულტურა). (მიულერის და 2016 წ.)
ვივო გლუტათოიონში განსაზღვრა
E.coli MG1655 გაიზარდა MOPS მინიმალური საშუალო რაოდენობა 200 მლ-მდე, სანამ ა600 0.5-ს მიაღწია. კულტურა გაყოფილი იყო 50 მლ კულტურაში სტრესული მკურნალობისთვის. 15 მგ ინკუბაციის შემდეგ 0.79 მმ ალცინის, 1 მმ დიამედი, ან დიმეთილის სულფაიდიდი (კონტროლი), უჯრედები მოსავალს 4,000 გ 4 ° C 10 წუთის განმავლობაში. საკნებში ორჯერ დაიბლოკა კეპ-ის ბუფერით 700 მლ KPE ბუფერში გრანულების რეზისტენტობის წინ. დეტროტერაციისთვის, უჯრედების დარღვევამდე 10% -მდე (ვ / ვ) სულფოსალიცილის მჟავას დამატებამდე (3 x 1 წთ; VialTweeter ულტრაბგერითი). Supernatants შეგროვდა შემდეგ ცენტრიფუგირება (30 წუთი, 13,000 გ, 4 ° C). Sulfosalicylic მჟავა კონცენტრაციები შემცირდა 1% KPE ბუფერის 3 ტომის დამატებით. ზემოთ აღწერილი იქნა შესრულებული მთლიანი გლუტავტონისა და GSSG- ის გაზომვები. უჯრედული გლუტავითონური კონცენტრაციები გამოითვალა ე.კოლის უჯრედების მოცულობის მიხედვით 6.7×10-15 ლიტრი და საკანში სიმჭიდროვე600 0.5 (ეკვივალენტი 1×108 უჯრედების მლ-1 კულტურა). GSH- ის კონცენტრაციები გამოითვალა გლუტავტონის საერთო ჯამში 2 [GSSG] გამოყოფით. (მიულერის და 2016 წ.)

კვლევის ტიპი ულტრასონი UP400St
ადამიანის ასახვა ე.კოლისადმი
E. coli BL21- ის (DE3) ერთ კოლონიაში, გამოხატვის ვექტორი, Luria-Bertani (LB) საშუალო 100 მგ / მლ ამპიცილინის შემცველი 30 მლ-იანი ამპლიცილინის შემცველი და შემდეგ გაშენებულია 37ºC- მდე ოპტიკური სიმკვრივის600) მიაღწია 0.6. უჯრედები მოსავლიანობით 4000 × გ 10 წთ-ით გაიზარდა და 3L ახალი LB საშუალო შემცველობით 100 მგ / მლ ამპიცილინზე აღინიშნა.
შემდგომში პროტეინის გამოხატულება გამოწვეული იქნა 1 მმ იზოპროპილის β-1-thiogalactopyranoside (IPTG) 20 საათის განმავლობაში 16 სმ. უჯრედები მოსავალს ღებულობდნენ ცენტრში 8000 × გ 15 წუთის განმავლობაში და გარეცხილით ბუფერი A (20 მმ NaH2PO4, 0.5 მ NaCl, pH 7.4). სავარაუდო 45 გ (სველი წონა) უჯრედები მიიღეს 3 ლ კულტურისგან. ცენტრიფუგების შემდეგ, უჯრედების მარცვლები აღდგა 40 მლ-ში (1 ლ კულტურისათვის) ყინულის გამონაბოლქვის ბუფერული ატრიბუტი, რომელიც იწყება ულტრაბგერითი გზით ცივი ცივი ტემპერატურის გამოყენებით UP400St ინსტრუმენტი (დოქტორი Hielscher GmbH, გერმანია). უჯრედების ლიზინგი 12 მილიარდი rpm- ზე ცენტრიფუგირებული იყო 15 წუთის განმავლობაში ხსნადი ხსნარის და მწვავე (ნალექის) ფრაქციების განცალკევებით. (Jiang et al., 2015)
ქვემოთ მოყვანილი ცხრილი გაძლევთ ჩვენს ულტრასონისტების სავარაუდო დამუშავების შესაძლებლობებს:
Batch მოცულობა | დინების სიჩქარე | რეკომენდირებული მოწყობილობები |
---|---|---|
05 დან 1.5 მლ | na | VialTweeter |
1-დან 500 მლ-მდე | 10 დან 200 მლ / წთ | UP100H |
10 დან 2000 მლ | 20 დან 400 მლ / წთ | Uf200 ः t, UP400St |
01-დან 20 ლ-მდე | 02-დან 4 ლ / წთ | UIP2000hdT |
10-დან 100 ლ | 2-დან 10 ლ / წთ | UIP4000 |
na | 10-დან 100 ლ / წთ | UIP16000 |
na | უფრო დიდი | კასეტური UIP16000 |
ლიტერატურა / ლიტერატურა
- აზარშხად ა., შარიფი ზ., სეიედაბადი რ., ჰოსეინი ა., იოჰარი ბ., სობანი ფარდ მ. (2016): ხსნარის და შემსუბუქებული აივ-1 CRF35- ის კლონირება და გამოხატვა Protease-HP Thioredoxin Fusion Protein. Avicenna J Med Biotechnol. 8 (4), 2016. 175-181.
- ჯიგან X., ვან ჯ., შონ ჰ .; ჟუ ი (2016): ადამიანის mitochondrial aspartotransase- ის სექსუალური ფორმის რეკონსტანციური გამოხატვა, გამწმენდი და კრისტოგრაფიული კვლევები. ბიოფიზიკის ტენდენციები 2016.
- მიულერის ა., ელლერი ჯ., ალბრეჩტ ფ., პროჩნოვ პ., კჰლმანის კ., ბანდოე JE, სლუსენკო აჯ, ლეიშერტ ლიო (2016): Allicin აღენიშნებათ ბაქტერიაში თივის სტრესი S-Allylmercapto- ს მეშვეობით ცილოვანი ციტოენების მოდიფიკაცია. ბიოლოგიური ქიმიის ჟურნალი 291, No. 22, 2016. 11477-11490.
- რაბოსშ უ., იუერგენენს ჯ., ილბერგერ ნ., ბოჰენკე ს., ფიშერ ს., შუბაკ ბ., შულტი მ., სტრეტი ვრ (2013): მეტაგენომი და გენომი ბიბლიოთეკების ფუნქციური სკრინინგი ნოველა ფლავონოიდული მოდიფიცირების ფერმენტების გამოვლენისათვის. გამოყენებითი და გარემოსდაცვითი მიკრობიოლოგია 79 (15), 2013. 4551-4563.
- Sauer M. (2014): MTV1 გაიყვანეთ ქვემოთ არაბული სიმპტომებით. ბიო-პროტოკოლი Vol 4, Iss 12, Jun 20, 2014.
- Waldminghaus T., Skarstad K. (2010): Chip on ჩიპი: გასაკვირი შედეგები ხშირად ნიმუშებს. BMC გენომიკა 11, 2010. 414.
ფაქტები Worth Knowing
E.coli
Escherichia coli (E. coli) არის გრამ-ნეგატიური, ფაკულტეულურად ანაერობული, როდ ფორმირებული, კოლორიფული ბაქტერია ეშერიჩია, რომელიც ხშირად გვხვდება თბილ-სისხლძარღვთა ორგანიზმის ქვედა ნაწლავში (ენდოთერაპია). არსებობს დიდი რაოდენობით E. coli შტამები (ან subtypes) მრავალფეროვანი მახასიათებლები. უმეტესი E. coli შტამები უვნებელია ადამიანისთვის, მაგ. B და K-12 შტამები, რომლებიც გამოიყენება ლაბორატორიებში კვლევითი განაცხადებისთვის. თუმცა, ზოგიერთი შტამების მავნე და შეიძლება გამოიწვიოს სერიოზული ავადმყოფობის.
E. coli მნიშვნელოვან როლს ასრულებს თანამედროვე ბიოლოგიურ საინჟინრო და სამრეწველო მიკრობიოლოგიაში, რადგან ბაქტერიები ადვილად მანიპულირებადია. საერთო ლაბორატორიული აპლიკაციები, რომლებიც ხშირად იწვევენ E. coli- ის გამოყენებას, მაგალითად, რეკომბინანტი დეოქსირიბორნუკლის მჟავას (დნმ) შექმნას ან მოდელის ორგანიზმში.
E. coli არის ძალიან მრავალმხრივი მასპინძელი წარმოების ჰეტეროლოგიური ცილებისა და მრავალფეროვანი ცილის გამოხატვის სისტემები ხელმისაწვდომია რეკომბინენტური პროტეინის წარმოებაში E. coli. პლაზმატების გამოყენება, რომელიც იძლევა პროტეინის მაღალი დონის გამოხატვას, გენების მიღება შესაძლებელია ბაქტერიაში, რაც საშუალებას აძლევს ასეთი ცილების წარმოება მაღალ რაოდენობით სამრეწველო დუღილის პროცესებში.
E.coli გამოიყენება როგორც უჯრედული ქარხნები ინსულინის წარმოებისათვის. შემდგომი აპლიკაციები მოიცავს მოდიფიცირებული ეკოლოზის უჯრედების გამოყენებას ვაქცინებისა და იმობილიზირებული ფერმენტების შემუშავებასა და წარმოებაზე, ბიოპროდუქტების წარმოებაზე, ასევე ბიორემიაციისთვის.
შტამპი K-12 არის E. კოლის მუტანული ფორმა, რომელიც გამოხატავს ფერმენტ ალკალინ ფოსფატასს (ALP). ეს მუტაცია ხდება გენის დეფექტის გამო, რომელიც მუდმივად ემსახურება ფერმენტს. თუ გენი აწარმოებს პროდუქტს რაიმე დათრგუნვის გარეშე, ეს არის ცნობილი როგორც აქტიური საქმიანობა. ეს კონკრეტული მუტანტის ფორმა გამოიყენება ALP ფერმენტის იზოლაციისა და გაწმენდისათვის.
E. coli ბაქტერია ასევე ფართოდ გამოიყენება როგორც უჯრედული ქარხნები. ინჟინერიული მიკრობები (მაგ., ბაქტერიები) და მცენარეული უჯრედები შეიძლება გამოყენებულ იქნას, როგორც ე.წ. უჯრედების ქარხნები. ეს გენმოდიფიცირებული უჯრედები აწარმოებენ მოლეკულებს, ქიმიკატებს, პოლიმერებს, ცილებს და სხვა ნივთიერებებს, რომლებიც გამოიყენება მაგალითად ფარმაცევტულ, საკვებ და ქიმიურ მრეწველობაში. ასეთი ბიოინჟინერიული უჯრედების ინტერიერში წარმოქმნილი მოლეკულების გასათავისუფლებლად, ულტრაბგერითი ლიზისი ჩვეულებრივი მეთოდია უჯრედის კედლების დასაშლელად და სამიზნე ნივთიერებების მიმდებარე სითხეში გადასატანად. წაიკითხეთ მეტი ბიოინჟინერიული უჯრედების ლიზისის შესახებ!
ულტრაბგერითი დნმ Shearing
ულტრაბგერითი თხრილის ძალები არის საყოველთაოდ გამოყენებული მეთოდი, რომელიც გამოყოფენ უჯრედს და დნმ-ს დაშლას ცალი. აკუსტიკური cavitation არღვევს საკანში კედლები და მემბრანის ამონაწერი დნმ უჯრედები და წარმოქმნის ფრაგმენტები დაახლოებით 600 – 800 bp სიგრძის, რომელიც იდეალურია ანალიზისთვის.
დააწკაპუნეთ აქ, რომ გაიგოთ უფრო მეტი ულტრაბგერითი ჰომოგენეზერები დნმ-ის ფრაგმენტაციისთვის!