超音波処理によるマイクロバイオーム研究と臨床分析の効率化
超音波処理は、マイクロバイオーム研究や臨床分析で広く用いられる強力な技術であり、ハイスループットのサンプル前処理を促進します。この超音波法は、微生物を含むサンプルなど、複雑な生体サンプルの処理に特に効果的です。超音波処理を用いることで、細胞溶解、核酸・タンパク質・代謝物の抽出および分析が容易になり、微生物群集と、それらが健康や疾患において果たす役割への理解を深めることができます。Hielscherのハイスループット超音波処理装置は、その精度、効率、結果の再現性で高く評価されており、マイクロバイオーム研究に最適な選択肢です。
マイクロバイオーム研究にハイスループット超音波処理を活用しましょう
96ウェルプレート用超音波処理装置UIP400MTPは ハイスループットのサンプル前処理によってマイクロバイオーム研究を効率化します
96ウェルプレート用超音波処理装置UIP400MTPによるハイスループットのサンプル前処理
マイクロバイオーム研究における超音波処理の用途
効率的な細胞溶解
超音波処理は、グラム陽性細菌や真菌のように強固な細胞壁を持つものを含め、微生物細胞の溶解に非常に効果的です。超音波はサンプル中にキャビテーション気泡を生成し、その気泡が崩壊して衝撃波を生み出すことで、細胞壁や細胞膜を破壊します。このプロセスにより、徹底した細胞破砕と、DNA、RNA、タンパク質などの細胞内成分の効率的な放出が確実に行われます。
制御されたDNA断片化
次世代シーケンシングなどの用途では、DNAをせん断して、より小さく均一な断片にする必要があることがよくあります。超音波処理では断片化プロセスを精密に制御できるため、研究者は目的のサイズのDNA断片を得ることができます。この制御は、シーケンシングライブラリーの調製と高品質な配列データの確保に不可欠です。
サンプルの均質化を促進
マイクロバイオーム研究では、サンプルに多様な微生物が混在していることがよくあります。超音波処理は、これらの微生物をサンプル内に均一に分布させるのに役立ち、一貫性と再現性のある結果を確保します。この均質化は、微生物量の測定や特定の代謝活性の測定など、正確な定量分析に不可欠です。
信頼性の高い代謝物抽出
超音波処理による信頼性の高い代謝物抽出は、生体サンプルから低分子を分離するためにメタボロミクスで広く用いられている技術です。超音波処理は機械的振動を利用して細胞膜を破壊し、細胞内代謝物の溶媒中への放出を促進します。この方法は効率的で再現性があり、さまざまなサンプルの種類に対応するため、ハイスループットのメタボロミクス研究やターゲットメタボロミクス研究に有用な手段となります。 超音波による代謝物抽出について詳しくはこちら!
「糞便マイクロバイオームサンプルの細菌を均一かつ一貫して溶解するために、貴社の超音波処理装置UIP400MTPを使用し、素晴らしい成果を得られたことへの感謝をお伝えしたく、ご連絡いたしました。私たちはハイスループットの溶解技術の限界に挑戦しており、貴社の装置はこの課題に非常に適しています。特に優れている点は以下のとおりです。
- 操作の容易さ – 装置は使いやすく、メニューの選択肢を使って簡単にカスタマイズできます
- 高い処理能力 – 一度に96サンプルを処理でき、プレートの処理に非常に優れています
- すべての容器への均一な超音波処理 – 装置はすべてのウェルに同量の超音波処理を施すことができ、これは私たちの用途にとって極めて重要でした
- Hielscherチームによるサポート – サポートは素晴らしく、トレーニング、質問への回答、問題への対応など、常に私たちを支えてくださり、目標達成に役立つ提案をしてくださいました。
プロトコルの最適化に取り組む中でいただいたご協力とご支援に、改めて感謝申し上げます。」
Mark D. Driscoll, Ph.D. – 最高科学責任者 – Intus Biosciences
マイクロバイオーム研究と診断では超音波処理をどのように活用しますか?
メタボロミクス、メタゲノミクス、メタプロテオミクスは、微生物群集とその機能を総合的に理解するための情報を共同で提供するため、マイクロバイオーム研究において相互に関連しています。細胞溶解、タンパク質精製、DNA / RNAの断片化は、サンプル前処理に不可欠な工程であり、96ウェルプレート用超音波処理装置UIP400MTPを利用することで効率化できます。
メタボロミクスとメタボローム分析
メタボロミクスは、生物系内の低分子代謝物を体系的に研究する分野です。マイクロバイオーム研究では、超音波処理を用いて微生物細胞を溶解し、細胞内代謝物を放出させます。96ウェルプレート用超音波処理装置UIP400MTPを使用すると、多数のサンプルを迅速に処理できます。抽出した代謝物は、質量分析(MS)や核磁気共鳴(NMR)分光法などの高度な技術を用いて定量します。得られたデータはマイクロバイオームの代謝状態をある時点で捉えたものであり、微生物群集内の生化学的活動や相互作用に関する知見をもたらします。
メタゲノミクスとメタトランスクリプトミクス
メタゲノミクスは、環境サンプルから直接回収した遺伝物質を包括的に分析する分野です。超音波処理は、微生物細胞を溶解して高品質なDNAを抽出することで、このプロセスにおいて重要な役割を果たします。その後、抽出したDNAの配列を解析し、存在する微生物種を同定・定量します。メタトランスクリプトミクスでは、同様の超音波処理法を用いてRNAを抽出し、さまざまな微生物群集の遺伝子発現プロファイルを研究します。DNAおよびRNAのシーケンシングでは、核酸を特定の塩基対長に断片化する必要があります。ハイスループット超音波処理装置UIP400MTPは、これらすべての作業を確実かつ迅速に実行します!
プロテオミクス
プロテオミクス分析には、微生物細胞からのタンパク質抽出が必要です。超音波処理は、細胞を破砕してタンパク質を溶液中に放出させるために効果的に用いられます。その後、これらのタンパク質を精製・分析することで、マイクロバイオーム内での機能的役割や代謝経路への関与を理解できます。マルチウェルプレート用超音波処理装置UIP400MTPを使用すれば、細胞溶解とタンパク質抽出を数分以内に実行して再現性のある結果を得ることができ、微生物群集内のタンパク質が駆動する生物学的プロセスへの知見を得られます。
メタプロテオミクス
メタプロテオミクスは、プロテオミクス分析を微生物群集全体に拡張し、タンパク質全体を研究することで、マイクロバイオーム内の機能発現や相互作用を理解する分野です。超音波処理を用いて細胞を溶解し、放出されたタンパク質を精製した後、質量分析などの技術で分析します。このアプローチにより、さまざまな環境における微生物群集の活発な生物学的プロセスや適応に関する詳細な知見を得られます。
マルチウェルプレート用超音波処理装置UIP400MTPのハイスループット処理能力を活用して、マイクロバイオーム研究と分析を促進しましょう!
ハイスループット超音波処理装置UIP400MTPは マルチウェルプレート、96ウェルプレート、チューブ、ペトリ皿でのマイクロバイオーム研究に使用できます。
マルチウェルプレート用超音波処理装置UIP400MTPの主な特長
| ハイスループット超音波処理 | 96ウェルプレートやその他のマルチウェルプレートに最適なUIP400MTPは、複数のサンプルに同時に同一の超音波処理を施すことができ、サンプル前処理時間を大幅に短縮し、多数のサンプルを用いる試験の処理能力を向上させます。 |
| お好みのマルチウェルプレートを使用 | UIP400MTPは、あらゆる標準的なマルチウェルプレート、PCRプレート、マイクロタイタープレートに超音波処理を施せるように設計されています。実験に最適なプレートを選べます。 UIP400MTPは専用の消耗品を必要としないため、費用を大幅に節約できます! |
| 非接触超音波処理 | マルチウェルプレート用超音波処理装置UIP400MTPは、サンプルに何も挿入せずに強力な超音波を作用させます。密封されたマルチウェルプレート、閉じた容器やバイアルに超音波処理を施すことができます。Hielscherは、あらゆる非標準のバイアルや容器に合わせてカスタマイズしたサンプルホルダーを提供します。 |
| 精度と制御 | 精密な制御とスマートなソフトウェアにより、特定の処理ニーズに最適に適合するよう超音波パラメーターを設定できます。あらゆる実験で、超音波処理の効率と効果を最大限に得られます。 |
| 温度制御 | 超音波処理の温度を指定できます。プレート用超音波処理装置UIP400MTPは、サンプル温度を監視し、それに応じて超音波処理を調整できます。再循環する冷却液がプレートの各ウェルを冷却し、精密な温度制御を実現します。 |
| 処理記録と遠隔制御 | 各超音波処理の実行は、コンピューターから制御できます。ソフトウェアのインストールは不要です。あらゆるオペレーティングシステム(例:MacOS、Windows、Android、iOS、Linux)で標準的なブラウザー(例:Chrome、Firefox、Edge、Safari)を使用して、UIP400MTPを遠隔で制御・監視できます。超音波処理を実行するたびに、評価と文書化のための詳細な超音波処理記録が生成されます。記録ファイルは独自仕様ではないCSV形式であり、Microsoft Excel、Apple Numbers、OpenOffice Calcなど、お好みのプログラムで開くことができます。 |
| 堅牢性と信頼性 | 最高の品質基準に従ってドイツで設計・製造されたUIP400MTPは、強力であるだけでなく、極めて高い耐久性も備えています。その設計は産業規格を満たし、厳しい実験室環境での日常的な使用の負荷にも容易に耐えます。ハイスループット運用において、UIP400MTPを24時間、週7日連続で使用できます。 |
- 高効率
- 最先端技術
- 信頼性と堅牢性
- 調整可能で精密なプロセス制御
- インテリジェントなソフトウェア
- スマートな機能(例:プログラム設定、データ記録、遠隔制御)
- 簡単で安全な操作
- 少ないメンテナンス
- CIP(定置洗浄)
設計、製造、コンサルティング – ドイツ製の品質
Hielscherの超音波処理装置は、最高の品質および設計基準で広く知られています。堅牢性と操作の容易さにより、当社の超音波処理装置を産業設備に円滑に組み込むことができます。Hielscherの超音波処理装置は、過酷な条件や要求の厳しい環境にも容易に対応します。
Hielscher UltrasonicsはISO認証を取得した企業であり、最先端技術と使いやすさを備えた高性能超音波処理装置に特に力を入れています。もちろん、Hielscherの超音波処理装置はCEに適合し、UL、CSA、RoHsの要件を満たしています。
非接触超音波処理装置UIP400MTPは マルチウェルプレートでのマイクロバイオームサンプルの前処理に使用できます。
文献 / 参考資料
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- InfoGraphic UIP400MTP – 96-well plate Ultrasonicator for High-Throughput Sample Prep – english – Hielscher Ultrasonics
- Jannike L. Krause, Sven-Bastiaan Haange, Stephanie S. Schäpe, Beatrice Engelmann, Ulrike Rolle-Kampczyk, Katarina Fritz-Wallace, Zhipeng Wang, Nico Jehmlich, Dominique Türkowsky, Kristin Schubert, Judith Pöppe, Katrin Bote, Uwe Rösler, Gunda Herberth, Martin von Bergen (2020): The glyphosate formulation Roundup® LB plus influences the global metabolome of pig gut microbiota in vitro. Science of The Total Environment, Volume 745, 2020.
- Tröscher-Mußotter, Johanna; Sáenz, Johan; Grindler, Sandra; Meyer, Jennifer; Kononov, Susanne; Mezger, Beate; Borda, Daniel; Frahm, Jana; Dänicke, Sven; Camarinha-Silva, Amelia; Huber, Korinna; Seifert, Jana (2021): Microbiome Clusters Disclose Physiologic Variances in Dairy Cows Challenged by Calving and Lipopolysaccharides. mSystems 2021.
- Jannike Lea Krause, Beatrice Engelmann, Stephanie Serena Schaepe, Ulrike Rolle-Kampczyk, Nico Jehmlich, Hyun-Dong Chang, Ulla Slanina, Maximillian Hoffman, Jörg Lehmann, Ana Claudia Zenclussen, Gunda Herberth, Martin von Bergen, Sven-Bastiaan Haange (2024): DSS treatment does not affect murine colonic microbiota in absence of thehost. Gut Microbes 2024.
マイクロバイオーム研究に関するよくある質問
超音波処理は細菌にどのように作用しますか?
超音波処理は、高周波の音波を用いてキャビテーションを発生させ、衝撃波と機械的な力を生み出すことで細菌細胞を破砕し、細胞溶解と細胞内成分の放出を引き起こします。
マイクロバイオームの研究にはどのような方法が用いられますか?
マイクロバイオームの研究方法には、16S rRNA遺伝子シーケンシングやメタゲノミクスなどのDNAシーケンシング技術に加え、微生物の機能や相互作用を分析するためのトランスクリプトミクス、プロテオミクス、メタボロミクスがあります。生成される膨大なデータの解釈には、バイオインフォマティクスのツールが用いられます。
マイクロバイオーム分析にはどのような技術が用いられますか?
マイクロバイオーム分析に用いられる技術には、分類学的プロファイリングのための16S rRNA遺伝子シーケンシング、包括的な遺伝的分析のためのメタゲノムシーケンシング、遺伝子発現を研究するためのメタトランスクリプトミクス、タンパク質を分析するためのメタプロテオミクス、代謝産物を同定するためのメタボロミクスがあります。データの処理と解釈には、バイオインフォマティクスのツールが不可欠です。
マイクロバイオーム研究におけるメタボロミクス、メタゲノミクス、メタプロテオミクスとは何ですか?
マイクロバイオーム研究において、メタボロミクスは微生物が産生する低分子や代謝物を分析し、その代謝活動に関する知見を提供します。メタゲノミクスでは、微生物群集のゲノム全体の配列を解析し、その遺伝的構成と潜在的な機能を理解します。メタプロテオミクスは、マイクロバイオームのタンパク質全体を研究し、遺伝子の機能的発現や微生物群集内でタンパク質が果たす役割を明らかにします。
マイクロバイオーム研究における細菌コロニーとは何ですか?
マイクロバイオーム研究における細菌コロニーとは、固体培地上で単一の細胞または少数の細胞から増殖し、目に見える集塊を形成した細菌の集団です。これらのコロニーはクローン集団であり、微生物群集内の特定の細菌株の特性、多様性、機能を研究するために用いられます。
Hielscher Ultrasonicsは、 実験室用 から 産業用サイズまでの高性能超音波ホモジナイザーを製造しています。


