超音波処理によるマイクロバイオーム研究と臨床分析の効率化

超音波処理は、マイクロバイオーム研究や臨床分析で広く使用されている強力な技術であり、ハイスループットなサンプル調製を促進します。超音波法は、微生物を含むもののような複雑な生物学的サンプルの処理に特に効果的です。超音波処理の使用は、核酸、タンパク質、および代謝産物の細胞溶解、抽出および分析を容易にし、微生物群集および健康および疾患におけるそれらの役割についてのより深い理解を可能にする。ヒールシャーのハイスループット超音波処理器は、その精度、効率、再現性のある結果で有名であり、マイクロバイオーム研究に最適です。
 
 
マイクロバイオーム研究におけるハイスループット超音波処理の活用

96ウェルプレートソニケーターによるハイスループットサンプル調製 UIP400MTP

マイクロバイオーム研究における超音波処理の応用

効率的な細胞溶解
超音波処理は、グラム陽性菌や真菌などの強靭な細胞壁を持つ微生物細胞を含む微生物細胞の溶解に非常に効果的です。超音波はサンプル内にキャビテーション気泡を生成し、それが崩壊して衝撃波を発生させ、開いた細胞壁や膜を破壊します。このプロセスにより、包括的な細胞破壊と、DNA、RNA、タンパク質などの細胞内内容物の効率的な放出が保証されます。

制御されたDNA断片化
次世代シーケンシングのようなアプリケーションでは、DNAをより小さく均一な断片に剪断する必要がしばしばあります。超音波処理は、断片化プロセスを正確に制御し、研究者が所望のサイズのDNA断片を得ることを可能にする。この制御は、シーケンシングライブラリを調製し、高品質のシーケンスデータを確保するために重要です。

サンプルの均質化の強化
マイクロバイオームの研究では、サンプルにはさまざまな微生物が含まれていることがよくあります。超音波処理は、サンプル内のこれらの微生物の均一な分布を達成するのを助け、一貫した再現性のある結果を保証します。この均質化は、微生物の存在量の測定や特定の代謝活性の測定など、正確な定量分析に不可欠です。

信頼性の高い代謝物抽出
超音波処理による信頼性の高い代謝物抽出は、生体サンプルから小分子を単離するためのメタボロミクスで広く使用されている技術です。超音波処理は、細胞膜を破壊する機械的振動を使用し、細胞内代謝産物の溶媒への放出を促進します。この分析法は、効率的で再現性があり、さまざまなサンプルタイプに適合しているため、ハイスループットで標的を絞ったメタボローム研究に貴重なツールとなっています。 超音波代謝物抽出についてもっと読む!

超音波処理はマイクロバイオームの研究と診断にどのように適用されますか?

メタボロミクス、メタゲノミクス、メタプロテオミクスは、微生物群集とその機能を包括的に理解するために、マイクロバイオーム研究に絡み合っています。溶解、タンパク質精製、DNA/RNA断片化は、96ウェルプレートソニケーター UIP400MTPを利用して合理化された重要なサンプル調製ステップです。

メタボロミクスとメタボローム解析
メタボロミクスは、生体システム内の低分子代謝物を体系的に研究するものです。マイクロバイオーム研究では、超音波処理を使用して微生物細胞を溶解し、細胞内代謝産物を放出します。96ウェルプレートソニケーター UIP400MTPを使用して、高いサンプル数を迅速に処理できます。抽出された代謝物は、質量分析(MS)や核磁気共鳴(NMR)分光法などの高度な技術を使用して定量されます。得られたデータは、マイクロバイオームの代謝状態のスナップショットを提供し、微生物群集内の生化学的活動と相互作用に関する洞察を明らかにします。

メタゲノミクスおよびメタトランスクリプトミクス
メタゲノミクスは、環境サンプルから直接回収された遺伝物質を包括的に解析するものです。超音波処理は、微生物細胞を溶解して高品質のDNAを抽出し、その後、存在する微生物種を同定し定量するために配列決定することにより、このプロセスにおいて重要な役割を果たします。メタトランスクリプトミクスでは、RNAは同様の超音波処理方法を使用して抽出され、さまざまな微生物群集にわたる遺伝子発現プロファイルを研究します。DNAおよびRNAシーケンシングでは、核酸を特定塩基対の長さまで断片化する必要があります。これらすべてのタスクは、UIP400MTPハイスループットソニケーターによって確実かつ迅速に実行されます。

プロテオミクス
プロテオミクス解析では、微生物細胞からタンパク質を抽出する必要があります。超音波処理は、細胞を破壊し、タンパク質を溶液中に放出するために効果的に使用されます。その後、これらのタンパク質を精製および分析して、マイクロバイオーム内での機能的役割と代謝経路への関与を理解することができます。UIP400MTPマルチウェルプレートソニケーターを使用すると、溶解とタンパク質抽出のタスクを数分以内に実行でき、微生物群集のタンパク質によって駆動される生物学的プロセスに関する洞察を得るための再現性のある結果を得ることができます。

メタプロテオミクス
メタプロテオミクスは、プロテオミクス解析を微生物群集全体に拡張し、集団タンパク質含有量を研究することで、マイクロバイオーム内の機能発現と相互作用を理解します。超音波処理は細胞を溶解するために使用され、タンパク質を放出し、タンパク質は質量分析法などの技術を通じて精製および分析されます。このアプローチは、さまざまな環境における微生物群集の活発な生物学的プロセスと適応に関する詳細な洞察を提供します。

UIP400MTPマルチウェルプレートソニケーターのハイスループット処理能力を活用して、マイクロバイオームの研究と分析を容易にします。

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