Amiloid fibrillák képződése a UIP400MTP mikrolemezes ultrahangos készülékkel
Az amiloid fibrillák, hasonlóan a kristályokhoz, a nukleáció és az azt követő növekedés folyamata során alakulnak ki. A nukleáció magas szabad energiájú gátja miatt azonban a spontán amiloid fibrillák képződése csak hosszan tartó késleltetési fázis után következik be. Az ultrahangos kezelés hatékony eszközként jelent meg az amiloid nukleáció kiváltására, ezáltal jelentősen felgyorsítva a fibrillák képződését. A tioflavin T (ThT) fluoreszcenciát használó mikrolemez-olvasóval kombinálva az ultrahangos kezelés lehetővé teszi az amiloid fibrillák nagy áteresztőképességű kimutatását egyszerre több mintában.
Ultrahanggal indukált amiloid fibrillák képződése a UIP400MTP mikrolemez ultrahangos készülékkel
A UIP400MTP többlyukú lemezes ultrahangos készülékkel az azonos minőségű, nagy mennyiségben lévő amiloid fibrillák gyorsan szintetizálhatók kutatási célokra. Ez a hatékony megközelítés lehetővé teszi a fehérje amiloidogenitásának tanulmányozását. Ez a technika elősegíti a gyors és reprodukálható amiloid fibrillációt, amint azt a dialízissel összefüggő amiloidózissal társuló amiloidogén fehérje, a β2-mikroglobulin (β2-m) bizonyítja.
Egyszerű kísérleti megközelítés: ultrahanggal kiváltott amiloid fibrilláció
A fibrillák kialakulásának kiváltása érdekében egy 96 lyukú mikrolemezt helyeztek a UIP400MTP többlyukú lemezes ultrahangos ultrahangos ultrahangos készülék közepére, amely biztosítja az egyenletes ultrahangos expozíciót minden kútban. A kísérleti körülmények a következők voltak:
- Mindegyik lyuk 0,2 ml β2-mikroglobulin oldatot (0,3 mg/ml, pH 2,5) tartalmazott, 5 μM ThT-vel kiegészítve.
- A lemezt ultrahangos ciklusoknak vetették alá, például 1 perces ultrahangos kezelésnek, majd 9 perc szünetnek.
- Az ultrahangos kezelés után a ThT fluoreszcenciát mikrolemez-olvasóval mértük.
(vö. So et al., 2011)
Összehasonlítás a hagyományos keveréssel
A hagyományos keverési módszerekhez képest az ultrahangos kezelés drasztikusan csökkentette a fibrillák képződésének késleltetési fázisát. Hagyományos mikrolemez-rázási körülmények között 10 lyukból csak 1 mutatott megnövekedett ThT-fluoreszcenciát 20 óra elteltével. Ezzel szemben a ciklusos ultrahangos kezeléssel (15 perc ultrahangos kezelés, majd 5 perc nyugalom) az első ultrahangos kezelés után közvetlenül a ThT fluoreszcencia jelentős növekedését észlelték.
A fibrillációs kinetika gyors gyorsulása
A So et al. (2011) kimutatta, hogy a β2-mikroglobulin spontán fibrillák képződése pH-n 2,5 órán keresztül felgyorsítható ultrahangos kezeléssel.
Az atomerő-mikroszkópos (AFM) képek megerősítették, hogy a 10 percenként 15 perces ultrahangos kezeléssel generált fibrillák morfológiailag megkülönböztethetetlenek a 10 percenként 1 perces ultrahangos kezeléssel kialakult fibrilláktól. Ez kiemeli az ultrahanggal kiváltott amiloid fibrilláció reprodukálhatóságát és robusztusságát.
Az amiloid fibrillák AFM képei 1 perces ultrahangos kezeléssel 10 percenként (i), 10 perces ultrahangos kezeléssel 15 percenként (ii) és az ultrahangos vetési reakcióval (iii). A fehér skálasáv 1 μm-t jelent.
Tanulmány és képek: ©So et al., 2011
Fibrilláció semleges pH-viszonyok között
Még semleges pH-körülmények között is 1,5 órás késleltetés után alakult ki a fibrillák képződése, ami azt mutatja, hogy az ultrahangos kezelés jelentősen csökkenti a nukleáció és a növekedés energetikai gátját. Ez tovább támasztja azt a hipotézist, hogy az amiloid fibrilláció elsősorban fizikai reakció, amelyet nagyrészt korlátoz a nukleációs energiagát, amelyet az ultrahangos kezelés hatékonyan csökkent.
Hatás az amiloiddal kapcsolatos betegségek kutatására
Az amiloid fibrillák könnyű és megbízható képződése a UIP400MTP mikrolemezes ultrahangos készülékkel jelentős következményekkel jár az Alzheimer-kór (AD) kutatására és más amiloiddal kapcsolatos rendellenességekre, például a Parkinson-kórra, a II. típusú cukorbetegségre és a szisztémás amiloidózisokra. Alzheimer-kórban az amiloid-β (Aβ) aggregáció kulcsfontosságú kóros jellemző, de a fibrillációs kinetika tanulmányozása továbbra is kihívást jelent a hosszú késleltetési fázisok és a hagyományos módszerek változékonysága miatt. Az ultrahangos kezelés által vezérelt fibrillák képződése felgyorsítja a nukleációt, biztosítva a magas reprodukálhatóságot és a csökkentett variabilitást, ami kulcsfontosságú a potenciális inhibitorok szűréséhez és az amiloid mechanizmusok megértéséhez. Ezenkívül a UIP400MTP nagy áteresztőképessége lehetővé teszi a fehérjék hibás feltekeredésének és aggregációjának nagyszabású vizsgálatát, megkönnyítve olyan terápiás szerek felfedezését, amelyek modulálhatják a fibrillák képződését és potenciálisan enyhíthetik a neurodegeneratív progressziót.
Ez a tanulmány az ultrahangos kezelést a UIP400MTP többlyukú lemezes ultrahangos készülékkel hozza létre, mint rendkívül hatékony módszert az amiloid fibrillák képződésének felgyorsítására. Ennek a megközelítésnek a legfontosabb előnyei a következők:
- A fibrilláció késleltetési idejének drámai csökkenése.
- Egyenletes ultrahang expozíció minden kútban, lehetővé téve a reprodukálható fibrillák képződését.
- Nagy áteresztőképességű szűrési képesség, így alkalmas a fehérje amiloidogenitás genomszintű kutatására.
Az ultrahangos kezelés és a ThT fluoreszcencia detektálás integrálásával ez a módszer gyors, skálázható és megbízható platformot biztosít az amiloid fibrilláció tanulmányozásához. Hatékonysága és nagy áteresztőképességi potenciálja miatt ez a megközelítés megkönnyítheti az amiloid fibrillák egyszerű szintézisét a biofizikai és gyógyszerészeti kutatásokhoz, ígéretes eszközt kínálva az amiloiddal kapcsolatos vizsgálatokhoz és a gyógyszerszűréshez.
Nagy áteresztőképességű EM extrakció A 96 lyukú lemezes szonikátor UIP400MTP
Irodalom / Hivatkozások
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Masatomo So, Hisashi Yagi, Kazumasa Sakurai, Hirotsugu Ogi, Hironobu Naiki, Yuji Goto (2011): Ultrasonication-Dependent Acceleration of Amyloid Fibril Formation. Journal of Molecular Biology, Volume 412, Issue 4, 2011. 568-577.
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
Gyakran Ismételt Kérdések
Mi az amiloid primer nukleáció?
Az amiloid primer nukleáció az amiloid fibrillák képződésének kezdeti, sebességkorlátozó lépése, ahol a monomer fehérjék konformációs változásokon mennek keresztül, és kritikus maggá szerveződnek. Ez a mag sablonként szolgál a további aggregációhoz.
Hogyan alakul ki a fibrillák amiloidózisban?
Az amiloidózisban a rosszul feltekeredett fehérjék nukleációfüggő polimerizáció útján aggregálódnak. Miután egy atommag kialakul, a monomerek gyorsan megnyúlnak β lapban gazdag fibrillákká a másodlagos nukleáció és a templátnövekedés révén, ami amiloid lerakódásokhoz vezet.
Mi az amiloid fibrilla polimorfizmus?
Az amiloid fibrillák polimorfizmusa az ugyanazon fehérje által alkotott fibrillák szerkezeti változásaira utal. A fibrillák morfológiájában, a protofilamentumok elrendezésében és a molekuláris tömörítésben mutatkozó különbségek a környezeti feltételek, mutációk vagy különböző aggregációs útvonalak miatt merülnek fel.
Mi a különbség az amiloid fibrillák és a plakkok között?
Az amiloid fibrillák lineáris, β lapban gazdag fehérjeaggregátumok, míg az amiloid plakkok aggregált rostok extracelluláris lerakódásai, gyakran lipidekkel, fémekkel és sejttörmelékekkel keveredve, amint az olyan neurodegeneratív betegségekben is megfigyelhető, mint az Alzheimer-kór.
Mi a különbség az alfa-szinuklein és az amiloid között?
Az alfa-szinuklein egy idegsejt fehérje, amely részt vesz a szinaptikus működésben, de kóros állapotokban rosszul feltekeredik és amiloidszerű rostokat képez. “Amiloid” a rosszul feltekeredett, fibrilláris fehérje aggregátumok általános kifejezése, míg az alfa-szinuklein fibrillák olyan betegségekre jellemzőek, mint a Parkinson-kór.
Mi az a fehérjefibrill?
A fehérjefibrilla egy erősen rendezett, β lapban gazdag, fonalas aggregátum, amelyet rosszul feltekeredett vagy részben kibontott fehérjék alkotnak. Ezek a rostok jellemzően oldhatatlanok, és nukleációfüggő polimerizáció révén keletkeznek. Különféle kóros állapotokkal társulnak, beleértve az amiloidózisokat és a neurodegeneratív betegségeket (pl. Alzheimer-kór, Parkinson-kór). Néhány funkcionális fehérjeszál azonban létezik a biológiai rendszerekben, például a baktériumokban a göndör rostok és a pókok selyemrostjai.
Hielscher Ultrasonics gyárt nagy teljesítményű ultrahangos homogenizátorok labor hoz ipari méret.


