Sonication de l'essai – L'essai en une seule fois Sonicator UIP400MTP
La sonication est une technique essentielle dans les protocoles de laboratoire, en particulier pour des applications telles que les essais d'immunoprécipitation de la chromatine (ChIP). En utilisant l'énergie ultrasonique pour décomposer les cellules, cisailler l'ADN et solubiliser la chromatine, la sonication permet aux chercheurs de préparer des échantillons de manière plus efficace et plus reproductible. Les sonicateurs pour plaques multi-puits Hielscher sont parmi les outils les plus avancés et les plus efficaces disponibles à cette fin, rationalisant les flux de travail à haut débit en accueillant jusqu'à 96 plaques à puits.
Principaux avantages des sonificateurs pour plaques multi-puits pour les essais
Les sonicateurs Hielscher sans contact pour plaques de 96 puits, tels que l'UIP400MTP, offrent une approche très fiable et contrôlée de la lyse cellulaire et du cisaillement de la chromatine. Cette conception sans contact garantit que chaque puits est traité uniformément, ce qui permet d'obtenir des résultats cohérents pour un grand nombre d'échantillons. Avec ce sonicateur, les chercheurs peuvent effectuer de multiples processus, notamment :
- Lyse cellulaire : Une sonication efficace ouvre les membranes cellulaires et libère le contenu des cellules.
- Cisaillement de l’ADN et de l’ARN : Les ondes ultrasoniques de haute intensité fragmentent l'ADN et l'ARN en fonction de la taille souhaitée, ce qui est essentiel pour les essais en aval.
- Fragmentation de la chromatine : Cisaillement de la chromatine en petits morceaux pour des analyses en aval, telles que l’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP), le séquençage de l’ADN ou d’autres études épigénétiques. En savoir plus sur la fragmentation de la chromatine à l’aide de l’UIP400MTP !
- Solubilisation : Améliore la solubilité des composants de l'échantillon, facilitant la préparation d'échantillons uniformes et reproductibles.
Ces fonctions sont essentielles pour la préparation d'échantillons à haut débit et la miniaturisation des échantillons, car elles permettent aux chercheurs de traiter plusieurs échantillons avec un risque minimal de contamination croisée.
Importance de la sonication dans les essais ChIP
Les tests d'immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) dépendent d'un cisaillement précis de la chromatine pour produire des fragments d'ADN de taille optimale, généralement entre 200 et 600 paires de bases (pb). Ces fragments sont nécessaires pour une immunoprécipitation efficace, une résolution précise des pics et des résultats fiables dans les essais ChIP-Seq. Le sonicateur Hielscher UIP400MTP Assay-At-Once est particulièrement adapté aux protocoles ChIP, car il permet une fragmentation uniforme de la chromatine dans plusieurs puits. Les avantages de cette précision dans les flux de travail ChIP sont les suivants :
- Rendement élevé de la chromatine : Une sonication efficace permet de libérer une plus grande quantité de chromatine de chaque échantillon.
- Cohérence entre les échantillons : Le sonicateur multi-puits maintient des tailles de fragment cohérentes dans tous les puits, réduisant ainsi la variabilité des essais ChIP.
- Sensibilité et résolution accrues pour ChIP-Seq : L'ADN correctement fragmenté garantit une meilleure résolution des pics, un facteur essentiel pour la détection d'interactions précises entre les protéines et l'ADN.
Le rôle d'une sonication fiable dans la réussite des essais
La reproductibilité et le débit sont essentiels pour les essais qui impliquent un grand nombre d'échantillons, comme dans le cas des diagnostics cliniques ou de la découverte de médicaments. Les sonicateurs pour plaques multi-puits Hielscher apportent une solution en facilitant la préparation uniforme des échantillons sur un grand nombre de puits. Cette uniformité améliore non seulement la robustesse des essais, mais aussi l'efficacité globale du flux de travail, ce qui permet de gagner du temps et d'économiser des ressources dans le laboratoire.
Les sonicateurs pour plaques multipuits Hielscher sont d'une valeur inestimable dans les protocoles d'essai, en particulier ceux qui nécessitent un traitement à haut débit. En assurant une lyse cellulaire, un cisaillement de l'ADN et une solubilisation fiables, ces sonicateurs optimisent la préparation des échantillons pour des résultats précis et reproductibles. Pour les chercheurs travaillant sur des essais ChIP, le sonicateur UIP400MTP offre un outil robuste qui améliore le rendement de la chromatine, la cohérence des fragments et la sensibilité de l'essai, ce qui conduit finalement à des expériences plus réussies et à des connaissances plus claires.
Le sonicateur à plaques multipuits facilite UIP400MTP la préparation d’échantillons à haut débit, rationalisant ainsi les travaux de recherche et les dosages.
Principales caractéristiques du sonicateur multipuits UIP400MTP
| Sonication à haut débit | Parfaitement adapté aux plaques à 96 puits et autres plaques multipuits, le UIP400MTP permet une sonication simultanée et identique de plusieurs échantillons, ce qui réduit considérablement la durée de préparation des échantillons et augmente le débit des tests à grand nombre d’échantillons. |
| Utilisez la plaque multipuits de votre choix | Le UIP400MTP est conçu pour soniser n’importe quelle plaque multipuits standard, plaque PCR ou plaque de microtitration. Vous choisissez la plaque la plus adaptée à vos expériences. Comme le UIP400MTP ne nécessite pas de consommables propriétaires, cela vous permet d’économiser beaucoup d’argent ! |
| Ultrasonication sans contact | Le sonicateur à plaques multipuits UIP400MTP applique des ultrasons intenses sans rien insérer dans l’échantillon. Vous pouvez sonicer des plaques multipuits ealed, des récipients fermés et des flacons. Hielscher vous fournit des porte-échantillons personnalisés pour tous les flacons ou récipients non standard. |
| Précision et contrôle | Un contrôle de précision et un logiciel intelligent vous permettent de régler de manière optimale les paramètres ultrasoniques en fonction de vos besoins de traitement spécifiques. Vous obtenez une efficacité et une efficience de sonication maximales pour chaque expérience. |
| contrôle de la température | Réglez une température spécifique pour votre sonication. Le sonicateur à plaque UIP400MTP peut surveiller la température de l’échantillon et ajuster la sonication en conséquence. Un liquide de refroidissement à recirculation refroidit chaque puits dans la plaque pour un contrôle précis de la température. |
| Protocolage et contrôle à distance | Chaque sonication peut être contrôlée à partir d’un ordinateur. Aucune installation de logiciel n’est nécessaire. Vous pouvez utiliser votre navigateur standard (par exemple Chrome, Firefox, Edge ou Safari) sur n’importe quel système d’exploitation (par exemple MacOS, Windows, Android, iOS ou Linux) pour contrôler et surveiller le UIP400MTP à distance. Chaque sonication produit un protocole de sonication détaillé pour l’évaluation et la documentation. Le fichier de protocole est dans un format CSV non propriétaire, que vous pouvez ouvrir avec votre programme préféré, par exemple Microsoft Excel, Apple Numbers ou OpenOffice Calc. |
| robuste et fiable | Conçu et fabriqué en Allemagne selon les normes de qualité les plus élevées, le UIP400MTP est non seulement puissant, mais aussi remarquablement durable. Sa conception répond aux normes industrielles et résiste facilement aux rigueurs d’une utilisation quotidienne dans un environnement de laboratoire exigeant. Vous pouvez utiliser le UIP400MTP en continu 24 heures sur 24, 7 jours sur 7 dans le cadre d’opérations à haut débit. |
Comment l'UIP400MTP facilite la miniaturisation des essais
Le sonicateur pour plaques multi-puits UIP400MTP de Hielscher joue un rôle crucial dans la miniaturisation des essais, permettant aux scientifiques et aux cliniciens de réduire les volumes d'essai sans compromettre l'exactitude ou la précision. Cette capacité est inestimable dans des domaines tels que la microbiologie, la découverte de médicaments, le diagnostic, la médecine personnalisée et le diagnostic clinique, où les essais miniaturisés permettent des tests plus efficaces, plus rentables et plus rapides.
- Sonication sans contact dans des plaques à 96 puits
La technologie de sonication sans contact de l'UIP400MTP est parfaitement adaptée aux formats d'essai miniaturisés. En s'adaptant aux plaques à 96 puits, ce sonicateur peut traiter simultanément de très petits volumes d'échantillons dans plusieurs puits. Les méthodes de sonication traditionnelles ont souvent du mal à être cohérentes avec des volumes plus faibles en raison d'une distribution inégale de l'énergie, mais l'UIP400MTP délivre des ondes ultrasoniques uniformes dans tous les puits, ce qui permet d'obtenir des résultats fiables, même dans des formats miniaturisés. - Précision et uniformité entre les échantillons
La miniaturisation exige un contrôle précis de la préparation des échantillons, car les petits volumes peuvent être plus sensibles aux variations. La sonication ciblée fournie par l'UIP400MTP garantit que chaque puits reçoit un niveau de sonication identique, ce qui est essentiel pour maintenir la précision et la reproductibilité de tous les échantillons. Cette cohérence est essentielle dans des domaines tels que la découverte de médicaments et les diagnostics cliniques, où même de légères variations peuvent affecter les résultats. En savoir plus sur la sonication ciblée ! - Lyse cellulaire et cisaillement de l'ADN efficaces dans des volumes réduits
Avec des volumes réduits, la lyse cellulaire et le cisaillement de l'ADN deviennent plus difficiles à réaliser, alors qu'ils sont essentiels pour obtenir des résultats d'analyse de haute qualité. Les ondes ultrasoniques à haute intensité de l'UIP400MTP sont suffisamment puissantes pour assurer une désintégration cellulaire et un cisaillement de l'ADN efficaces, même dans des volumes réduits. Cette capacité permet aux chercheurs d'obtenir la qualité nécessaire de lysats et de fragments d'ADN sans avoir à augmenter les volumes, ce qui en fait un outil idéal pour les flux de travail miniaturisés. - Réduction des coûts et utilisation efficace des ressources
Les essais miniaturisés consomment moins de réactifs et réduisent le gaspillage d'échantillons, ce qui est particulièrement bénéfique lorsque l'on travaille avec des échantillons rares ou coûteux. L'UIP400MTP y contribue en permettant la préparation d'échantillons à haut débit dans de petits volumes, ce qui permet aux scientifiques de maximiser leurs ressources. Dans des domaines tels que la médecine personnalisée, où les échantillons dérivés de patients peuvent être limités, cette efficacité est particulièrement avantageuse. - Augmentation du débit et de la vitesse
En réduisant les volumes d'essai, l'UIP400MTP aide les laboratoires à traiter plus d'échantillons dans un délai plus court, ce qui augmente considérablement le débit. Ce traitement rapide est crucial dans des domaines très demandés comme le diagnostic et la découverte de médicaments, où les résultats sensibles au temps peuvent avoir un impact direct sur les soins aux patients ou les résultats de la recherche. Les tests miniaturisés combinés à la capacité à haut débit de l'UIP400MTP permettent des tests et des analyses plus rapides et à plus grande échelle. - Soutien à l'automatisation et au criblage à haut débit
La compatibilité de l'UIP400MTP avec tous les formats de plaques multipuits standard permet une intégration transparente avec les systèmes automatisés utilisés pour le criblage à haut débit. Cette intégration est un avantage majeur dans des domaines tels que la microbiologie et la découverte de médicaments, où un traitement rapide et automatisé est essentiel pour le criblage de grandes bibliothèques de composés ou l'analyse de nombreuses souches microbiennes.
L'UIP400MTP facilite la miniaturisation des essais en assurant une sonication fiable pour les petits volumes, garantissant ainsi la précision et la cohérence des échantillons. Sa capacité à traiter des essais miniaturisés avec une précision, une reproductibilité et une efficacité élevées permet aux scientifiques et aux cliniciens de réduire les volumes tout en obtenant des résultats plus rapides, rentables et de haute qualité dans divers domaines de la recherche et de la clinique.
Essais facilités par le sonificateur de plaques multipuits UIP400MTP
Le sonicateur pour plaques multipuits UIP400MTP est utilisé pour les essais impliquant la perturbation des cellules afin de libérer des protéines et des biomolécules, la recherche sur les biofilms et les tests antimicrobiens, tels que :
- ELISA : La sonication est utilisée lorsque la préparation de l'échantillon consiste à ouvrir les cellules pour obtenir des extraits de protéines.
- Essais MBEC (concentration minimale d'éradication du biofilm) : Pour déterminer la concentration d'agents antimicrobiens nécessaire pour éradiquer les biofilms établis. En savoir plus sur l'utilisation de l'UIP400MTP pour les essais MBEC, y compris le protocole.
- Essais MBIC (concentration minimale inhibitrice du biofilm) : Pour évaluer la capacité des antimicrobiens à prévenir la formation de biofilms.
- Essais de quantification du biofilm : Pour perturber les biofilms afin de mesurer la biomasse ou la viabilité cellulaire à l'aide de méthodes telles que la numération des UFC ou la spectrophotométrie.
- Criblage de médicaments à haut débit : Pour évaluer l'efficacité des composés antimicrobiens contre les bactéries formant un biofilm dans des formats multi-puits.
- Extraction de la matrice extracellulaire : L'extraction de l'ECM est une étape essentielle de la préparation des échantillons avant de nombreux essais. Retrouvez le protocole pour l'extraction de la matrice extracellulaire en profondeur avec l'UIP400MTP ici !
- PMCA : L'amplification cyclique des protéines mal repliées est une étape indispensable pour une détection fiable des prions. Découvrez comment l'UIP400MTP facilite la réalisation de PMCA à haut débit pour des résultats robustes !
Littérature / Références
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- UIP400MTP-Multi-well-Plate-Sonicator-Infographic
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Questions fréquemment posées
Qu'est-ce que la sonication des essais ?
La sonication est une technique qui utilise des ondes ultrasoniques pour perturber les cellules, cisailler l'ADN et solubiliser les protéines ou la chromatine, ce qui permet une préparation efficace des échantillons pour les essais biochimiques.
Qu'est-ce qu'un essai ?
Un essai est une procédure de laboratoire utilisée pour mesurer la présence, la quantité ou l'activité d'une substance spécifique ou d'un analyte dans un échantillon, souvent pour évaluer des propriétés biologiques, chimiques ou biochimiques. Les essais sont une procédure courante dans les laboratoires cliniques, les sciences de la vie, la biologie moléculaire, la pharmacologie, la biologie environnementale et l'exploitation minière.
Quelle est la différence entre essai et test ?
Les termes “essai” et “test” sont souvent utilisés de manière interchangeable, mais ils ont des significations distinctes dans des contextes scientifiques :
- Essai : Un essai est une procédure analytique précise, quantitative ou semi-quantitative, conçue pour mesurer la présence, la quantité ou l'activité fonctionnelle d'une substance spécifique (analyte) dans un échantillon. Les essais sont généralement des protocoles bien définis et reproductibles utilisés pour évaluer la pureté, la concentration ou l'activité biologique. Ils sont souvent utilisés dans les analyses biochimiques, pharmacologiques ou chimiques.
- Test : Un test est un terme plus large qui fait référence à toute méthode ou processus utilisé pour évaluer les propriétés ou la fonctionnalité d'un échantillon ou d'un système. Les tests peuvent être qualitatifs ou quantitatifs et peuvent aller d'évaluations simples (par exemple, un test de pH) à des évaluations plus complexes. Contrairement aux essais, les tests peuvent ne pas exiger un degré aussi élevé de spécificité ou de mesure quantitative.
En résumé, si tous les essais sont des tests, tous les tests ne sont pas des essais. Les essais sont généralement plus spécifiques et quantitatifs, tandis que les tests peuvent inclure un large éventail de procédures dont la spécificité et le niveau de détail varient.
Quels sont les trois types d'essais ?
Les trois principaux types de tests sont les suivants :
- Essais biochimiques : Ces essais mesurent l'activité ou la concentration de molécules spécifiques (telles que les enzymes, les substrats ou les métabolites) dans les réactions biochimiques. Ils sont largement utilisés pour analyser la cinétique des enzymes, les affinités de liaison et les voies métaboliques.
- Essais sur cellules : Les essais cellulaires évaluent les effets des composés, des protéines ou d'autres substances sur des cellules vivantes. Ils mesurent des paramètres tels que la viabilité cellulaire, la prolifération, la cytotoxicité, les voies de signalisation et l'expression des gènes, ce qui permet de mieux comprendre les réponses cellulaires et les effets des médicaments.
- Tests immunologiques : Les immunodosages utilisent des anticorps pour détecter et quantifier des antigènes ou des analytes spécifiques dans un échantillon. Les types les plus courants sont l'ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay), le western blotting et l'immunofluorescence. Ces tests sont largement utilisés dans le diagnostic et la recherche pour détecter des protéines, des hormones et des agents pathogènes.
Chacun de ces tests est essentiel pour la recherche, le diagnostic et le développement de médicaments, car ils fournissent des données quantitatives ou qualitatives sur différentes propriétés biologiques ou chimiques.
Quels sont les essais les plus importants en sciences de la vie et en microbiologie ?
- Test d'immuno-absorption lié à l'enzyme (ELISA) : ELISA est un test immunologique largement utilisé pour détecter et quantifier des protéines, des anticorps ou des antigènes spécifiques dans des échantillons biologiques. Il est très utile pour le diagnostic des maladies, le suivi des réponses immunitaires et la détection des biomarqueurs. La sonication est utilisée pour lyser les cellules ou les tissus afin de libérer les protéines cibles lors de l'analyse des composants intracellulaires.
- Essais de réaction en chaîne par polymérase (PCR) : La PCR et ses variantes (telles que la qPCR et la RT-PCR) amplifient l'ADN ou l'ARN, ce qui permet de détecter et de quantifier rapidement du matériel génétique spécifique. Ces tests sont essentiels pour la détection des agents pathogènes, les études génétiques et les diagnostics. La sonication est utilisée pour l'extraction d'ADN à partir de cellules ou de tissus, en particulier si l'on étudie des cellules microbiennes ou eucaryotes dotées de parois cellulaires ou de membranes robustes.
- Tirage au sort : Cette technique détecte et quantifie des protéines spécifiques dans un échantillon, fournissant des informations sur l'expression des protéines, le poids moléculaire et les modifications post-traductionnelles. Elle est largement utilisée en biologie moléculaire et dans la recherche sur les maladies. La sonication est utilisée pour lyser les cellules ou les tissus afin de libérer et de cisailler les protéines, les préparant ainsi à l'analyse.
- Essais de gènes rapporteurs : Ces tests mesurent l'expression des gènes et l'activité régulatrice en introduisant des gènes rapporteurs tels que la GFP ou la luciférase dans les cellules. Ils sont largement utilisés pour étudier l'expression des gènes, l'activité des promoteurs et les effets des médicaments sur les voies de signalisation. La sonication est parfois utilisée pour lyser les cellules afin d'analyser les produits des gènes rapporteurs, tels que les enzymes comme la luciférase, dans les essais cellulaires.
- Essais d'immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) : Les tests ChIP étudient les interactions protéine-ADN, ce qui permet aux chercheurs d'étudier les facteurs de transcription, les modifications des histones et la régulation épigénétique de l'expression des gènes, ce qui est important pour les études sur la régulation des gènes et la recherche sur les maladies. La sonication est une étape clé pour cisailler la chromatine en fragments de taille appropriée, permettant une immunoprécipitation efficace.
- Essais Luminex : Ces tests multiplex à base de billes mesurent simultanément plusieurs analytes (par exemple, cytokines, hormones) dans un seul échantillon, ce qui est utile en immunologie, en oncologie et pour la découverte de biomarqueurs. La sonication est utilisée pour préparer les lysats de cellules ou de tissus afin de mesurer les analytes intracellulaires, mais elle n'est pas nécessaire pour les échantillons de plasma ou de sérum.
Hielscher Ultrasonics fabrique des homogénéisateurs à ultrasons très performants à partir de laboratoires à taille industrielle.