Metabolomiikka, jota helpottaa korkean suorituskyvyn sonikaatio
Metabolomiikka on tutkimusala, joka käyttää korkean suorituskyvyn tekniikoita pienten molekyylien karakterisoimiseksi ja kvantifioimiseksi erilaisissa bionesteissä, kuten virtsassa, seerumissa, plasmassa, ulosteissa ja syljessä, paljastaen ainutlaatuisia metabolisia allekirjoituksia. Korkean suorituskyvyn sonikaattori-UIP400MTP, joka on suunniteltu monikuoppalevyille, on tehokas työkalu solujen lysoimiseksi näissä näytteissä, mikä helpottaa metaboliittien vapautumista loppupään analyysiin. Tämä tarkka ja luotettava lähestymistapa on välttämätön metabolomiikalle, jossa tarkka tutkimussuunnittelu, huolellinen näytteiden valmistelu, optimoitu alustan asennus, kattava data-analyysi ja mielekäs biologinen tulkinta ovat ensiarvoisen tärkeitä. Metabolomiikka käyttää sekä kohdennettuja lähestymistapoja, jotka keskittyvät tiettyihin molekyyliluokkiin, kuten hiilihydraatteihin, lipideihin ja aminohappoihin, että kohdistamattomia tekniikoita, jotka tarjoavat laajan yleiskuvan näytteen aineenvaihduntaprofiileista ja paljastavat metabolisen signaloinnin monimutkaisen monimutkaisuuden.
UIP400MTP on kosketukseton, suuritehoinen sonikaattori solulyysiin ja metaboliitin uuttamiseen monikuoppalevyissä
Korkean suorituskyvyn näytteen valmistelu 96-kuoppaisella levysonikaattorilla UIP400MTP
Kosketuksettoman sonikaattorin UIP400MTP käyttö yhdessä 96-kuoppalevyjen kanssa on tehokas menetelmä korkean suorituskyvyn homogenointiin ja metaboliitin uuttamiseen. Tällä asetuksella vältetään suora kosketus näytteeseen, mikä vähentää ristikontaminaation riskiä käsiteltäessä useita näytteitä samanaikaisesti.
Vaiheittainen protokolla homogenoimiseksi 96-Well Sonicator UIP400MTP: n kanssa
- Metabolomisten näytteiden valmistus
Näytteen sijoitus: Annostele jokainen näyte (esim. ulosteet, suolistokudos tai luminaalisisältö) 96-kuoppaisen levyn tai mikrolevyn yksittäisiin kuoppiin.
Liuotin: Orgaaniset liuottimet, kuten metanoli, etanoli, asetonitriili, kloroformi ja niiden (vesipitoiset seokset), ovat välttämättömiä metaboliitin uuttamiselle, mikä auttaa solunsisäisten metaboliittien vapautumisessa solumatriisista. Käytetään 100–300 μ0 μl liuotinta kuoppaa kohti, jotta varmistetaan riittävä tilavuus näytteen upottamiseksi kokonaan.
Sisäiset standardit: Valinnaisesti lisätään sisäisiä standardeja kuhunkin kuoppaan normalisointia varten metabolomisen loppupään analyysin aikana. - Kytkentävälineen asetukset
Vedenpinta: Aseta 96well-levy sonikaatioalustalle, joka on täytetty vedellä (kytkentäväliaineella) käsikirjassa kuvatulla tavalla. - UIP400MTP Parametrien määritys
Virta-asetukset: Säädä ultraääniamplitudi 50–80%: iin maksimitehosta tehokkaaseen homogenointiin.
Pulssi-tila: Aseta sonikaatiosykli vaihtoehtoisiin pulsseihin (esim. 30 sekuntia päällä, 30 sekuntia pois päältä) jäähdytyksen mahdollistamiseksi ja näytteen ylikuumenemisen estämiseksi.
Kokonaisaika: 4–10 minuuttia näytteen monimutkaisuudesta ja sitkeydestä riippuen.
Lämpötilan säätö: Käytä laboratoriojäähdytintä pitämään vesi 4–8 ° C: ssa sonikoinnin aikana lämpöherkkien metaboliittien suojaamiseksi. - Sonikaatioprosessi
Käynnistä sonikaatiosyklien UIP400MTP.
Seuraa prosessia UIP400MTP-käyttöliittymän kautta.
Kavitaatiovaikutus homogenisoi näytteet ja lyseeraa solut kuopissa vapauttaen solunsisäisiä metaboliitteja liuottimeen. - Postsonikaatio
Linkoaminen: Sonikoinnin jälkeen siirrä levyn sisältö tarvittaessa keräysputkiin. Sentrifugoidaan 4 000–6 000 × g:ssa 10 minuutin ajan liukenemattomien roskien ja solumateriaalin pelletoimiseksi.
Supernatanttikokoelma: Supernatantti siirretään varovasti kustakin kuopasta uusiin putkiin tai levyihin analysointia varten.
Valinnainen kuivaus: Supernatantit kuivataan tyhjiörikastimella (esim. SpeedVac), jos konsentraatio vaaditaan, ja saatetaan sitten käyttövalmiiksi pieneen määrään sopivaa liuotinta.
Hyödynnä UIP400MTP multi-well plate sonicatorin korkean suorituskyvyn prosessointikapasiteettia ja helpota metabolomista tutkimusta ja analyysiä!
UIP400MTP korkean suorituskyvyn sonikaattori metabolomiikkatutkimukseen monikuoppalevyillä, 96-kuoppaisilla lautasilla, putkilla ja petrimaljoilla.
UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator korkean suorituskyvyn näytteen valmistukseen metabolomiikkatutkimuksessa.
Kosketuksettoman sonikoinnin periaate UIP400MTP kanssa
UIP400MTP kohdistaa ultraääniaaltoja 96-kuoppaisen levyn kuoppiin epäsuorasti kytkentäväliaineen (esim. veden) kautta. Nämä aallot luovat kavitaatiota, joka häiritsee soluja ja vapauttaa metaboliitteja ilman fyysistä kosketusta sonikaattorianturin ja näytteen välillä.
“Kirjoitan kiittääkseni sinua fantastisesta kokemuksestamme käyttää UIP400MTP sonicator -laitettasi ulosteen mikrobiominäytteiden yhtenäiseen ja johdonmukaiseen bakteerilyysiin. Venytämme rajoja korkean suorituskyvyn lyysitekniikalle, ja instrumenttisi sopii hyvin tehtävään. Jotkut tärkeimmistä kohokohdista ovat:
- Helppokäyttöisyys – Instrumentti on helppokäyttöinen, ja räätälöinti on suoraviivaista valikkovalintojen avulla
- Suuri suorituskyky – Erinomainen levyjen käsittelyyn, 96 näytettä kerrallaan
- Kaikkien alusten jopa sonikaatio – Laite pystyi toimittamaan saman määrän sonikaatiota kaikkiin kaivoihin, mikä oli ratkaisevan tärkeää sovelluksellemme
- Hielscher-tiimin tuki – Tuki oli erinomaista, olit aina tukenamme koulutuksessa, vastasit kysymyksiimme ja käsittelit ongelmia ehdotuksilla, jotka auttoivat meitä saavuttamaan tavoitteemme.
Kiitos vielä kerran avustasi ja avustasi, kun työskentelimme protokolliemme optimoimiseksi.”
Mark D. Driscoll, tohtori – Tieteellinen johtaja – Intus Biotieteet
Monikuoppalevyinen sonikaattori helpottaa UIP400MTP suuren suorituskyvyn näytteen valmistelua esimerkiksi metaboliittitutkimuksessa ja -analyysissä.
96-kuoppainen levysoitin UIP400MTP: Ultraääniä lähettävä neste ympäröi kaikkia kaivoja ja tarjoaa kunkin näytteen yhtenäisen sonikoinnin
UIP400MTP Multi-well Plate Sonicatorin tärkeimmät ominaisuudet
| Korkean suorituskyvyn sonikaatio | Sopii täydellisesti 96-kuoppiin ja muihin multiwell-levyihin, UIP400MTP mahdollistaa useiden näytteiden samanaikaisen, identtisen sonikaation, mikä lyhentää merkittävästi näytteen valmistuksen kestoa ja lisää suuren näytemäärän testauksen läpäisykykyä. |
| Käytä valitsemaasi Multiwell-levyä | UIP400MTP on suunniteltu sonikoimaan kaikki tavalliset multiwell-levyt, PCR-levyt tai mikrotitterilevyt. Valitset kokeiluihisi sopivimman levyn. Koska UIP400MTP ei vaadi omia kulutustarvikkeita, tämä säästää paljon rahaa! |
| Kosketukseton ultraääni | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP käyttää voimakasta ultraääntä lisäämättä mitään näytteeseen. Voit sonikoida ealed-multiwell-levyjä, suljettuja astioita ja injektiopulloja. Hielscher toimittaa sinulle räätälöityjä näytteenpitimiä epätyypillisille injektiopulloille tai astioille. |
| Tarkkuutta ja hallintaa | Tarkan ohjauksen ja älykkään ohjelmiston avulla voit asettaa ultraääniparametrit vastaamaan erityisiä käsittelytarpeitasi optimaalisesti. Saat maksimaalisen sonikaatiotehokkuuden ja tehokkuuden jokaiselle kokeilulle. |
| Lämpötilan säätö | Aseta tietty lämpötila sonikaatiollesi. UIP400MTP levysonikoija voi seurata näytteen lämpötilaa ja säätää sonikaatiota vastaavasti. Kierrätettävä jäähdytysneste jäähdyttää levyn jokaisen kaivon tarkkaa lämpötilan säätöä varten. |
| Protokollat ja kaukosäädin | Jokaista sonikaatioajoa voidaan ohjata tietokoneelta. Ohjelmiston asennusta ei tarvita. Voit käyttää tavallista selaintasi (esim. Chrome, Firefox, Edge tai Safari) missä tahansa käyttöjärjestelmässä (esim. MacOS, Windows, Android, iOS tai Linux) UIP400MTP etähallintaan ja -valvontaan. Jokainen sonikaatioajo tuottaa yksityiskohtaisen sonikaatioprotokollan arviointia ja dokumentointia varten. Protokollatiedosto on ei-omistetussa CSV-muodossa, jonka voit avata haluamallasi ohjelmalla, kuten Microsoft Excelillä, Apple Numbersilla tai OpenOffice Calcilla. |
| Vankka ja luotettava | Saksassa korkeimpien laatustandardien mukaisesti suunniteltu ja valmistettu UIP400MTP ei ole vain tehokas, vaan myös huomattavan kestävä. Sen rakenne täyttää teolliset standardit ja kestää helposti päivittäisen käytön rasitukset vaativassa laboratorioympäristössä. Voit käyttää UIP400MTP jatkuvasti 24 tuntia 7 päivänä viikossa suuren suorituskyvyn toiminnoissa. |
- korkea hyötysuhde
- Uusinta teknologiaa
- luotettavuus & rotevuus
- säädettävä, tarkka prosessinohjaus
- Älykäs ohjelmisto
- älykkäät ominaisuudet (esim. ohjelmoitava, dataprotokolla, kaukosäädin)
- Helppo ja turvallinen käyttää
- vähän huoltoa vaativa
- CIP (puhdas paikan päällä)
Suunnittelu, valmistus ja konsultointi – Laatu valmistettu Saksassa
Hielscher-ultraääniastiat ovat tunnettuja korkeimmista laatu- ja suunnittelustandardeistaan. Kestävyys ja helppokäyttöisyys mahdollistavat ultraäänilaitteidemme sujuvan integroinnin teollisuuslaitoksiin. Hielscher-ultraäänilaitteet käsittelevät helposti karkeita olosuhteita ja vaativia ympäristöjä.
Hielscher Ultrasonics on ISO-sertifioitu yritys ja painottaa erityisesti korkean suorituskyvyn ultraäänilaitteita, joissa on huipputeknologia ja käyttäjäystävällisyys. Tietenkin, Hielscher-ultraäänilaitteet ovat CE-yhteensopivia ja täyttävät UL: n, CSA: n ja RoHs: n vaatimukset.
Kosketukseton sonikaattori UIP400MTP metabolomisen näytteen valmistamiseksi mikrolevyissä.
Kirjallisuus / Viitteet
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Usein kysyttyä metabolomiikkatutkimuksesta
Mikä on mikrobiomi?
Mikrobiomi viittaa mikro-organismien kollektiiviseen yhteisöön, mukaan lukien bakteerit, virukset, sienet ja arkeonit sekä niiden geneettinen materiaali, jotka asuvat tietyssä ympäristössä, kuten ihmiskehossa. Sillä on kriittinen rooli isännän terveydessä vaikuttamalla aineenvaihduntaan, immuunitoimintaan ja suojaan taudinaiheuttajia vastaan, samalla kun sitä muokkaavat tekijät, kuten ruokavalio, elämäntapa ja ympäristö.
Mikä on metabolomiikka?
Metabolomiikka on kattava tutkimus metaboliiteista, jotka ovat pieniä molekyylejä, joita syntyy biologisen järjestelmän aineenvaihduntaprosessien aikana. Se sisältää näiden molekyylien tunnistamisen, kvantifioinnin ja analysoinnin solujen toimintojen, aineenvaihduntareittien ja niiden reagoinnin geneettisiin, ympäristöllisiin tai patologisiin muutoksiin.
Mikä on metabolomi?
Metabolomi on täydellinen joukko pieniä molekyylejä tai metaboliitteja, jotka ovat läsnä biologisessa järjestelmässä, kuten solussa, kudoksessa tai organismissa, tiettynä ajankohtana. Se heijastaa järjestelmän biokemiallista aktiivisuutta ja fysiologista tilaa ja antaa tietoa aineenvaihdunnasta ja sen vuorovaikutuksesta ympäristön kanssa.
Hielscher Ultrasonics valmistaa korkean suorituskyvyn ultraäänihomogenisaattoreita laboratorio jotta Teollisuuden koko.