تحقیقات ژنومی تسهیل شده توسط Sonication

تحقیقات ژنومی درک ما از سیستم های بیولوژیکی را متحول کرده است و امکان روشن شدن مکانیسم های ژنتیکی پیچیده ای را که زمینه ساز بیماری ها و صفات مختلف است، فراهم می کند. روش فراصوت، یک تکنیک در اصل برای اختلال در غشاهای سلولی توسعه یافته است، ابزار گسترده ای در تحقیقات ژنومی پیدا کرده است. این مقاله یک مرور کلی از استفاده از فراصوت در مطالعات ژنومی، از جمله جداسازی DNA و تکه تکه شدن، کروماتین immunoprecipitation (ChIP)، و اماده سازی نسل بعدی کتابخانه توالی فراهم می کند. این مقاله یک مرور کلی از اصول، روش ها و برنامه های کاربردی فراصوت در تحقیقات ژنومی را فراهم می کند و شما را به مناسب ترین sonicators برای تحقیقات ژنومی معرفی می کند.

Sonicators در تحقیقات ژنومی

پروب نوع SONICATOR UP100H برای اماده سازی نمونه های بیولوژیکی، به عنوان مثال تکه تکه شدن DNA، برش کروماتین، لیز سلولی.تحقیقات ژنومی در دهه های اخیر پیشرفت های قابل توجهی داشته است که با توسعه فن اوری های توالی یابی با کارایی بالا و روش های تجربی نواورانه تقویت شده است. این پیشرفت ها تجزیه و تحلیل جامع ژنوم ها، اپی ژنوم ها و ترانسکریپ ها را تسهیل کرده و بینش هایی را در مورد پایه ژنتیکی بیماری ها، تکامل و تنوع فنوتیپی ارائه می دهد.
روش فراصوت، یک فرایند مکانیکی شامل استفاده از نیروهای فیزیکی سونوگرافی برای مختل کردن ساختارهای مولکولی، به عنوان یک ابزار همه کاره در تحقیقات ژنومی ظهور کرده است. روش فراصوت یک تکنیک به خوبی تثبیت شده مورد استفاده برای تکه تکه شدن DNA، برش کروماتین، و اماده سازی کتابخانه NGS است.

درخواست اطلاعات




توجه داشته باشید ما سیاست حفظ حریم خصوصی.


 

این اموزش توضیح می دهد که چه نوع sonicator برای وظایف اماده سازی نمونه شما مانند لیز، اختلال سلولی، جداسازی پروتئین، تکه تکه شدن DNA و RNA در ازمایشگاه ها، تجزیه و تحلیل و تحقیق بهتر است. نوع sonicator ایده ال برای درخواست خود را انتخاب کنید، حجم نمونه، شماره نمونه و توان عملیاتی. Hielscher فرا صوت است هموژنایزر اولتراسونیک ایده ال برای شما!

چگونه برای پیدا کردن Sonicator کامل برای اختلال سلول و استخراج پروتئین در علم و تجزیه و تحلیل

تصویر بندانگشتی ویدئو

 

کاربردهای فراصوت در تحقیقات ژنومی

روش فراصوت به نمونه های بیولوژیکی برای اماده سازی نمونه قبل از سنجش، تجزیه و تحلیل و یا در اماده سازی برای فرایندهای پایین دست بیشتر اعمال می شود. رایج ترین برنامه های کاربردی امادگی نمونه با استفاده از فراصوت عبارتند از:

  • تکه تکه شدن DNA: به عنوان مرحله اماده سازی برای سنجش و سایر تکنیک های تجزیه و تحلیل، DNA ژنومی باید به اندازه تعریف شده قطعات برش داده شود.
    روش فراصوت برای تکه تکه شدن دقیق DNA ژنومی استفاده می شود و تولید قطعات DNA با اندازه های مورد نظر را برای برنامه های مختلف پایین دست، از جمله PCR، شبیه سازی و لکه جنوبی امکان پذیر می کند. روش فراصوت ارائه می دهد مزایای بیش از روش های انزیمی، ان را به عنوان اجازه می دهد تا برای کنترل انعطاف پذیر بر اندازه قطعه و توزیع. اماده سازی نمونه با توان بالا با sonicator صفحه UIP400MTP ساده پردازش تعداد نمونه بزرگ است.
    اطلاعات بیشتر در مورد اولتراسونیک تکه تکه شدن DNA . تکه تکه شدن پلاسمید!
  • کروماتین Immunoprecipitation (ChIP): ChIP یک تکنیک به طور گسترده ای برای بررسی تعاملات پروتئین و DNA مانند تغییرات هیستون و اتصال فاکتور رونویسی است. روش فراصوت نقش مهمی در تکه تکه شدن کروماتین به قطعات کوچکتر (~ 200-1000 جفت پایه)، که به immunoprecipitation هستند. این امکان جداسازی و تجزیه و تحلیل مناطق ژنومی خاص مرتبط با پروتئین های مورد علاقه را فراهم می کند.
  • نسل بعدی توالی (NGS): فن اوری های توالی با کارایی بالا، مانند Illumina و Ion Torrent، نیاز به DNA تکه تکه شده برای اماده سازی دارند. روش فراصوت تکه تکه شدن کنترل شده DNA ژنومی را برای تولید قطعات DNA با اندازه یکنواخت تسهیل می کند که متعاقبا برای ساخت کتابخانه استفاده می شود. این تضمین نمایندگی دقیق از محتوای ژنومی و افزایش بهره وری توالی.
    اطلاعات بیشتر در مورد استفاده از فراصوت برای نسل بعدی توالی!
  • راه اندازی VialTweeter کامل: sonotrode VialTweeter در پردازنده مافوق صوت UP200St

    VialTweeter sonicator (ویال گروهی) برای اماده سازی نمونه همزمان از ویال های متعدد

    چگونه بهترین دستگاه Sonicator را برای تحقیقات مربوط به DNA انتخاب کنم؟

    عبارت “روش فراصوت” برای کاربردهای مختلف سونوگرافی استفاده می شود. شایع ترین روش حمام اولتراسونیک و پروب نوع sonicator. در زیر، شما کشف خواهد کرد که چرا انتخاب مناسب از sonicator کیفیت و اعتبار تحقیقات خود را بهبود بخشد.

    در مورد تفاوت بین مدل های مختلف اولتراسونیکاتور، مزایا و محدودیت های انها یاد بگیرید. در اینجا ما را به مدل sonicator به طور گسترده ای مورد استفاده برای تحقیقات ژنومی شیرجه رفتن.

    حمام فراصوت: چرا sonicators حمام نوع به شما نتایج غیر قابل اعتماد، غیر قابل تکرار؟ نمونه های ژنومی در یک حمام اب مجهز به چندین مبدل اولتراسونیک متصل به پایین مخزن اب قرار می گیرند. لکه های کاویتاسیون صوتی بسیار ناهموار از طریق مخزن رخ می دهد و یک قدرت اولتراسوند سازگار را فراهم نمی کند. این روش نمونه ها را با شدت های مختلف درمان می کند و نتایج قابل تکرار در اماده سازی نمونه مانند تکه تکه شدن DNA را ارائه نمی دهد. به عنوان نتیجه این درمان نابرابر، کنترل بر اندازه قطعه DNA داده نمی شود. با یک حمام اولتراسونیک مشترک، قابل اعتماد، تحقیقات تکراری غیر ممکن است.
    ایا می خواهید برای کسب اطلاعات بیشتر در مورد پروب نوع sonicator در مقابل حمام اولتراسونیک؟ اینجا کلیک کنید!

    در مقایسه با حمام اولتراسونیک، Hielscher sonicators دقیقا قابل کنترل است که ارائه سونوگرافی قدرتمند است. شدت فراصوت را می توان دقیقا به نرم افزار تنظیم به طوری که تخریب ناخواسته از نمونه های بیولوژیکی اجتناب شود. حفاظت بهینه از اسیدهای نوکلئیک و سایر مولکول های زیستی در طول پردازش نمونه را تضمین می کند. این به ویژه برای تحقیقات ژنومی سودمند است، جایی که یکپارچگی نمونه برای تجزیه و تحلیل پایین دست حیاتی است. ویژگی های هوشمند مانند تنظیم قابل برنامه ریزی، کنترل از راه دور مرورگر و ضبط خودکار داده ها کار تحقیقاتی را در ازمایشگاه ها تسهیل می کند.

    مدل های Sonicator Hielscher برای تحقیقات ژنومی

    • پروب نوع فراصوت: پروب فراصوت به طور مستقیم به لوله نمونه قرار داده، اجازه می دهد برای فراصوت محلی و کنترل دقیق بر پارامترهای تکه تکه شدن. این روش برای تعداد نمونه های کوچک مانند ویال های تک یا فنجان ترجیح داده می شود.
      یافتن تمام پروب نوع sonicator برای تکه تکه شدن DNA و اماده سازی نمونه در اینجا!
    • CupHorn و UIP400MTP: مدل Sonicator Hielscher Ultrasonic Cuphorn و UIP400MTP Plate Sonicator به طور قابل توجهی از یک حمام اولتراسونیک معمولی یا مخزن تمیز کردن متفاوت است. در حالی که در دیدگاه اول، اصل انتقال غیر مستقیم امواج اولتراسوند از طریق حمام اب مشابه به نظر می رسد – تفاوت بین Hielscher cuphorn مافوق صوت یا sonicator صفحه و حمام اولتراسونیک مشترک نمی تواند بزرگتر! در سیستم های Hielscher، پایین کامل از cuphorn و sonicator صفحه یکنواخت توسط سونوگرافی قدرتمند اشفته است. این بدان معنی است که سطح کامل دقیقا در همان دامنه و فرکانس ارتعاش می کند. هیچ مرده، نقطه سازمان ملل متحد فراصوت داده شده یافت می شود، تمام نمونه ها در همان شدت فراصوت داده! این تضمین یکنواخت، نتایج تجدید پذیر در اماده سازی نمونه اولتراسونیک خود را.
      شما می توانید اطلاعات بیشتر در مورد cuphorn مافوق صوت در اینجا پیدا کنید!
      شما می توانید اطلاعات بیشتر در مورد صفحه sonicator UIP400MTP اینجا پیدا کنید!
    • ویال گروهی: VialTweeter با بهره گیری از یک طراحی منحصر به فرد از sonotrode بلوک ویال برگزاری ارتعاشی برای انتقال انرژی مافوق صوت به طور مستقیم به ویال نمونه بدون نیاز به غوطه وری در حمام اب و یا رسانه های دیگر. این روش فراصوت غیر مستقیم و در عین حال بسیار کارامد ایده ال برای درمان تا 10 ویال بسته و اجتناب از الودگی متقابل است.
      اطلاعات بیشتر در مورد فراصوت بدون الودگی تا 10 ویال بسته با ویال گروهی!
    cuphorn مافوق صوت برای یکنواخت و فراصوت شدید تا 5 لوله های بسته و ویال برای یکنواخت و سریع استریل نمونه همگن.

    cuphorn التراسونیک برای فراصوت شدید لوله های بسته و ویال برای تکه تکه شدن DNA استریل.

    درخواست اطلاعات




    توجه داشته باشید ما سیاست حفظ حریم خصوصی.


    Sonicators در سیستم های خودکار – ادغام ساده

    Hielscher ultrasonicators را می توان از راه دور از طریق کنترل مرورگر کنترل. پارامترهای فراصوت را می توان نظارت و تنظیم دقیق به الزامات فرایند.Sonicators Hielscher را می توان به سیستم های خودکار یکپارچه شده است. با رابط شبکه باز و ویژگی های برنامه نویسی، sonicators Hielscher مناسب برای اتوماسیون هستند. ادغام با اتوماسیون و رباتیک پردازش با کارایی بالا از نمونه های ژنومی، تسهیل مطالعات در مقیاس بزرگ و ابتکارات پزشکی شخصی را امکان پذیر می کند. امکان یکپارچه سازی sonicator خود را به یک سیستم اماده سازی نمونه خودکار بهینه سازی دست زدن به نمونه و کارامد، تجدید پذیر، و پردازش نمونه امن در سراسر انواع برنامه های کاربردی و انواع نمونه اطمینان حاصل شود.

    چرا Hielscher فرا صوت؟

    • بازدهی بالا
    • تکنولوژی دولت از هنر
    • قابلیت اطمینان & نیرومندی
    • قابل تنظیم، کنترل فرایند دقیق
    • دسته & درون خطی
    • برای هر حجم
    • نرم افزار هوشمند
    • ویژگی های هوشمند (به عنوان مثال، قابل برنامه ریزی، پروتکل داده ها، کنترل از راه دور)
    • آسان و ایمن برای کارکردن
    • تعمیر و نگهداری کم
    • CIP (تمیز در محل)

    طراحی، ساخت و مشاوره – کیفیت ساخته شده در آلمان

    Ultrasonicators Hielscher به خوبی برای بالاترین کیفیت و استانداردهای طراحی خود شناخته شده است. استحکام و عملیات آسان اجازه می دهد ادغام صاف از مافوق صوت ما را به امکانات صنعتی. شرایط خشن و محیط های خواستار به راحتی توسط Ultrasonicators Hielscher رسیدگی می شود.

    Hielscher Ultrasonics یک شرکت گواهی ایزو و تاکید ویژه ای بر مافوق صوت با عملکرد بالا شامل دولت از هنر فن آوری و کاربر دوستی است. البته، سونوگرافی Hielscher سازگار CE و دیدار با الزامات UL، CSA و RoHs.

    جدول زیر به شما می دهد نشانه ای از ظرفیت پردازش تقریبی ultrasonicators ازمایشگاه ما، که ایده ال برای وظایف اماده سازی نمونه مانند DNA و RNA تکه تکه شدن، لیز سلولی و همچنین DNA و جداسازی پروتئین:

    دستگاه قدرت [W] نوع حجم [میلی لیتر]
    UIP400MTP ۴۰۰ برای میکروپلیت ها 6 – چاه های ۳۴۵۶
    VialTweeter(ویال گروهی) ۲۰۰ تا 10 ویال به علاوه امکان گیره در 00.5 – ۱/۵
    UP50H ۵۰ پروب نوع 0.01 – ۲۵۰
    UP100H ۱۰۰ پروب نوع 0.01 – ۵۰۰
    UP200Ht ۲۰۰ پروب نوع 00.1 – ۱۰۰۰
    UP200St ۲۰۰ پروب نوع 00.1 – ۱۰۰۰
    UP400St ۴۰۰ پروب نوع ۵/۰ – ۲۰۰۰
    Cuphorn ۲۰۰ CupHorn، sonoreactor 10 – ۲۰۰
    GDmini2 ۲۰۰ سلول جریانی بدون آلاینده

    تماس با ما! / از ما بپرسید!

    برای اطلاعات بیشتر بپرسید

    لطفا فرم زیر را برای درخواست اطلاعات بیشتر در مورد پردازنده مافوق صوت، برنامه های کاربردی و قیمت استفاده کنید. ما خوشحال خواهد شد به بحث در مورد روند خود را با شما و به شما ارائه یک سیستم مافوق صوت انجام الزامات خود را!









    لطفا توجه داشته باشید ما سیاست حفظ حریم خصوصی.


    این کلیپ ویدئویی نشان می دهد Hielscher هموژنیزر مافوق صوت UP100H, مافوق صوت به طور گسترده ای برای آماده سازی نمونه در آزمایشگاه استفاده می شود.

    هموژنیزر مافوق صوت UP100H

    تصویر بندانگشتی ویدئو



    سوالات متداول در مورد ژنومیکس و فراصوت

    پیدا کردن در اینجا پاسخ به سوال اغلب پرسیده می شود که ان را به امواج فراصوت و تحقیقات ژنومی می اید.

    فراصوت به DNA چیست؟

    روش فراصوت DNA را به قطعات کوچکتر با استفاده از امواج صوتی با فرکانس بالا که نیروهای مکانیکی ایجاد می کند، باعث می شود رشته های DNA در نقاط تصادفی شکسته شوند. تنظیم شدت فراصوت اجازه می دهد تا برای ایجاد قطعات DNA بزرگتر یا کوچکتر بسته به الزامات برای پردازش و تجزیه و تحلیل پس از ان.

    پروتکل فراصوت برای تکه تکه شدن DNA چیست؟

    یک پروتکل فراصوت معمولی برای تکه تکه شدن DNA شامل استفاده از امواج مافوق صوت به نمونه های DNA در یک راه حل بافر برای یک سری از انفجار کوتاه، به دنبال فواصل خنک کننده برای جلوگیری از گرمایش نمونه. پارامترهایی مانند دامنه، مدت زمان و تعداد چرخه بر اساس نوع نمونه و اندازه قطعه مورد نظر بهینه سازی می شوند.

    چگونه فراصوت برای برش DNA کار می کند؟

    روش فراصوت برای برش DNA شامل استفاده از نیروهای مکانیکی کنترل شده به مولکول های DNA با استفاده از امواج مافوق صوت. این نیروها پیوندهای هیدروژنی و سایر تعاملاتی را که رشته های DNA را با هم نگه می دارند، مختل می کنند و منجر به شکستن تصادفی و تکه تکه شدن DNA به قطعات کوچکتر می شوند.

    چه مدت باید نمونه های DNA را فراصوت دهید؟

    مدت زمان فراصوت برای نمونه های DNA بستگی به عواملی مانند حجم نمونه، غلظت و اندازه قطعه مورد نظر دارد. به طور معمول، فراصوت برای انفجار کوتاه اعم از چند ثانیه تا چند دقیقه، با فواصل خنک کننده برای جلوگیری از گرم شدن بیش از حد نمونه انجام می شود.

    بهترین فراصوت دهنده برای جداسازی DNA چیست؟

    انتخاب بهترین فراصوت دهنده برای جداسازی DNA بستگی به عواملی مانند حجم نمونه، توان و اندازه قطعه مورد نظر دارد. برخی از گزینه های محبوب عبارتند از Hielscher UIP400MTP بشقاب فراصوت دهنده، VialTweeter، CupHorn، و پروب اولتراسونیک UP100H. این sonicators ارائه کنترل دقیق بر پارامترهای فراصوت و مناسب برای برنامه های مختلف DNA انزوا در ازمایشگاه های تحقیقاتی هستند.

    ژنومیک چیست؟

    ژنومیک یک شاخه چند رشته ای از زیست شناسی است که به درک ارایش کامل، توابع، تکامل، نقشه برداری و اصلاح ژنوم می پردازد. ژنوم شامل تمام DNA در یک ارگانیسم است که شامل ژن های ان و سازمان پیچیده سه بعدی انها است. بر خلاف ژنتیک، که بر ژن های فردی و الگوهای وراثت انها تمرکز دارد، ژنومیک قصد دارد به طور جامع تمام ژن ها را در یک ارگانیسم مشخص و اندازه گیری کند و تعاملات و تاثیر انها را بر ارگانیسم به طور کلی روشن کند. ژن ها نقش محوری در هدایت سنتز پروتئین ها دارند که توسط انزیم ها و مولکول های پیام رسان تسهیل می شوند. این پروتئین ها، به نوبه خود، اجزای ساختاری اندام ها و بافت ها را تشکیل می دهند، فرایندهای بیوشیمیایی را تنظیم می کنند و ارتباطات سلول به سلول را تسهیل می کنند. ژنومیک شامل توالی و تجزیه و تحلیل کل ژنوم، با استفاده از تکنیک های توالی DNA با کارایی بالا و ابزارهای بیوانفورماتیک برای کشف ساختار و عملکرد ژنوم به طور کامل است.
    ژنومیک مطالعه کل مواد ژنتیکی یک ارگانیسم، از جمله توالی DNA، سازمان، عملکرد و تنوع ان است. این شامل تجزیه و تحلیل ژن ها، تعاملات انها و تاثیر انها بر صفات و رفتارها است. تحقیقات ژنومی شامل تکنیک ها و رویکردهای مختلف برای درک ساختار و عملکرد ژنوم و همچنین نقش انها در سلامت، بیماری، تکامل و سایر فرایندهای بیولوژیکی است.

    تحقیقات ژنومی با هدف:

    • توالی ژنوم: این شامل تعیین ترتیب نوکلئوتیدها (A، T، C و G) در DNA ارگانیسم است. این می تواند کل ژنوم یا مناطق خاص مورد علاقه باشد.
    • تجزیه و تحلیل تنوع ژنتیکی: تحقیقات ژنومی به بررسی تغییرات در توالی DNA در میان افراد یا جمعیت ها می پردازد که می تواند بینش هایی را در مورد پایه ژنتیکی بیماری ها، صفات و فرایندهای تکاملی ارائه دهد.
    • ژنومیک عملکردی: این زمینه به بررسی چگونگی عملکرد ژن ها و تعامل با یکدیگر و محیط زیست می پردازد. این شامل رونویسی (مطالعه بیان ژن)، پروتئومیکس (مطالعه پروتئین ها) و متابولومیکس (مطالعه متابولیت ها) است.
    • ژنومیکس مقایسه ای: با مقایسه ژنوم در گونه های مختلف، محققان می توانند روابط تکاملی را کشف کنند، مناطق حفاظت شده را شناسایی کنند و پایه ژنتیکی تنوع زیستی را درک کنند.
    • ژنومیک پزشکی: تحقیقات ژنومی در پزشکی بر درک پایه ژنتیکی بیماری ها، پیش بینی خطر بیماری و توسعه درمان ها و مداخلات شخصی تمرکز دارد.

    تحقیقات ژنومی منجر به پیشرفت های قابل توجهی در زمینه هایی مانند پزشکی، کشاورزی، زیست شناسی تکاملی و بیوتکنولوژی شده است که به درک ما از زندگی در سطح مولکولی و بهبود سلامت و رفاه انسان کمک می کند.

    ادبیات/منابع


    مافوق صوت با کارایی بالا! محدوده محصول Hielscher طیف کامل را پوشش می دهد از اولتراسونیک آزمایشگاه جمع و جور بیش از نیمکت بالا واحد به تمام صنعتی سیستم های مافوق صوت.

    Hielscher Ultrasonics تولید هموژنیزرهای مافوق صوت با کارایی بالا از ازمایشگاه ها تا اندازه صنعتی.


    خوشحال خواهیم شد که در مورد روند شما بحث کنیم.

    بيا باهاش تماس بگيرم