شرکت Hielscher Ultrasonics
ما خوشحال خواهیم شد که در مورد روند شما صحبت کنیم.
با ما تماس بگیرید: +49 3328 437-420
به ما ایمیل بزنید: info@hielscher.com

تکه تکه شدن DNA اولتراسونیک برای توالی یابی نسل بعدی

توالی یابی نسل بعدی (NGS) به برش و تکه تکه شدن DNA ژنومی قابل اعتماد به منظور توالی رشته های DNA ژنومی و ایجاد کتابخانه های ژنوم نیاز دارد. تکه تکه شدن کنترل شده DNA به قطعات DNA یک مرحله ضروری آماده سازی نمونه است که قبل از توالی یابی DNA مورد نیاز است. امواج فراصوت به عنوان یک روش کارآمد و قابل اعتماد برای تکه تکه شدن DNA با طول معین ثابت شده است. پروتکل های تکه تکه شدن DNA اولتراسونیک دستیابی به نتایج تکه تکه شدن قابل تکرار. مافوق صوت Hielscher قادر به تولید طیف گسترده ای از توزیع اندازه قطعه DNA ژنومی هستند که دقیقا از طریق پارامترهای عملیاتی قابل کنترل هستند. از آنجا که سیستم های برش DNA مافوق صوت Hielscher برای ویال های تک و چند و همچنین برای microplates در دسترس هستند، آماده سازی نمونه بسیار کارآمد می شود.

درخواست اطلاعات




توجه داشته باشید ما سیاست حفظ حریم خصوصی.




UIP400MTP Plate Sonicator برای آماده سازی نمونه با توان بالا: UIP400MTP به طور یکنواخت نمونه ها را در صفحات چند چاه، میکروتیتر و صفحات 96 چاهی که سلول ها را مختل می کند، پروتئین ها را استخراج می کند، DNA را تکه تکه می کند، RNA و فیبریل های آلفا سینوکلئین.

UIP400MTP صفحه Sonicator برای آماده سازی نمونه با توان بالا، نمونه ها را به طور یکنواخت در صفحات چند چاه، میکروتیتر و صفحات 96 چاهی فراصوت می کنند

مزایای استفاده از تکه تکه شدن DNA اولتراسونیک

  • نتایج قابل تکرار / تکرارپذیر
  • دقیقا قابل تنظیم برای به دست آوردن طول قطعه خاص
  • پردازش سریع
  • نتایج تکه تکه شدن DNA سازگار
  • دستگاه هایی برای هر حجم نمونه (به عنوان مثال، چندین ویال یا میکروپلیت)
  • توان عملیاتی بالا
  • کنترل دقیق دما
  • عملیات ساده و کاربرپسند

توالی یابی نسل بعدی: تکه تکه شدن DNA اولتراسونیک برای آماده سازی کتابخانه

به منظور انجام توالی یابی نسل بعدی، سه مرحله اساسی (1) آماده سازی کتابخانه، (2) توالی یابی و (3) تجزیه و تحلیل داده ها باید انجام شود. در طول آماده سازی کتابخانه ، DNA تکه تکه می شود ، سپس انتهای قطعه با افزودن یک پایه آدنین ترمیم می شود (صیقل داده می شود) و قطعات هدف به DNA دو رشته ای تبدیل می شوند. سرانجام به اصطلاح آداپتورها با بستن ، PCR یا برچسب گذاری متصل می شوند تا بتوان محصول نهایی DNA کتابخانه را برای توالی یابی تعیین کرد.
تکه تکه شدن DNA با استفاده از فراصوت سازی: به خصوص هنگامی که فن آوری های توالی یابی کوتاه خوان مانند ایلومینا، که نمی تواند قطعات DNA طولانی تر به راحتی بخواند، پایه های DNA باید به اندازه مشخصی تکه تکه شوند که می تواند به طور قابل اعتماد توسط سونوگرافی به دست آید.
امواج فراصوت را می توان به طور قابل اعتماد برای DNA ، RNA و تکه تکه شدن کروماتین استفاده می شود.

توالی یابی نسل بعدی – آماده سازی کتابخانه

تکه تکه شدن DNA مافوق صوت است که معمولا در آماده سازی کتابخانه های توالی یابی DNA برای سیستم عامل های توالی یابی نسل بعدی (NGS) استفاده می شود. این تکنیک برای شکستن مولکول های DNA به قطعات کوچکتر با محدوده اندازه مورد نظر استفاده می شود که مراحل بعدی در آماده سازی کتابخانه را تسهیل می کند. تکه تکه شدن DNA اولتراسونیک به طور معمول در طول مرحله آماده سازی کتابخانه گردش کار NGS مورد نیاز است تا DNA ژنومی را به قطعات کوچکتر مناسب برای پردازش پایین دست و توالی یابی تقسیم کند. این نقش مهمی در تضمین موفقیت آزمایش توالی یابی با تولید قطعات DNA با محدوده اندازه مناسب برای پلت فرم توالی یابی خاص مورد استفاده ایفا می کند.

تکه تکه شدن DNA التراسونیک است که اغلب به عنوان مرحله آماده سازی نمونه در توالی یابی نسل بعدی (NGS) استفاده می شود

تجزیه و تحلیل الکتروفورتیک DNA ژنومی E. coli EDL933 تحت 0 تا 15 دقیقه سونوگرافیکاسیون L نردبان DNA را نشان می دهد. (باسلت و همکاران 2008)

توالی یابی نسل بعدی – مراحل فرآیند:

  • تکه تکه شدن DNA اولتراسونیک: قبل از ساخت کتابخانه، DNA ژنومی به قطعات کوچکتر و قابل کنترل تر تقسیم می شود. تکه تکه شدن اولتراسونیک شامل استفاده از امواج صوتی با فرکانس بالا برای برش مولکول های DNA به قطعات از محدوده اندازه مورد نظر است. این مرحله بسیار مهم است زیرا کمک می کند تا اطمینان حاصل شود که خوانش های توالی که بعدا ایجاد می شوند طول مناسبی برای پلت فرم توالی یابی مورد استفاده خواهند داشت. محدوده اندازه قطعات را می توان بر اساس الزامات خاص آزمایش توالی تنظیم کرد.
  • تقویت کلونال توسط PCR: پس از تکه تکه شدن اولتراسونیک، قطعات DNA تحت تعمیر پایان، بستن آداپتور و تقویت PCR برای تولید کتابخانه های توالی یابی DNA نهایی قرار می گیرند. این مراحل مولکول های DNA تکه تکه شده را برای فرآیند توالی یابی با افزودن توالی های آداپتور لازم برای اتصال به پلت فرم توالی یابی و فراهم کردن مکان های پرایمینگ برای تقویت PCR آماده می کند.
  • توالی یابی DNA با سنتز: پس از آماده سازی کتابخانه های توالی یابی ، روند توالی یابی DNA با سنتز (SBS) آغاز می شود. در طول SBS، توالی DNA با افزودن متوالی نوکلئوتیدها به رشته مکمل تعیین می شود. این مرحله شامل واکنش های چرخه ای ترکیب نوکلئوتید، تصویربرداری و شکاف است که امکان تعیین توالی DNA را بر اساس سیگنال های فلورسنت ساطع شده از نوکلئوتیدهای گنجانده شده فراهم می کند.
  • توالی موازی انبوه: در مرحله آخر، الگوهای DNA تفکیک شده و تکثیر شده از نظر مکانی به طور همزمان به صورت موازی انبوه توالی یابی می شوند. این رویکرد توالی یابی با توان عملیاتی بالا، تولید میلیون ها تا میلیاردها خوانش توالی را در یک اجرای توالی یابی امکان پذیر می کند و امکان تعیین کارآمد و سریع توالی های DNA را فراهم می کند.

تکه تکه شدن DNA اولتراسونیک چگونه کار می کند؟

فراصوت که به عنوان پردازش نمونه صوتی نیز شناخته می شود، روشی است که به طور گسترده ای برای تکه تکه کردن DNA استفاده می شود. برای برش DNA اولتراسونیک، نمونه ها تحت شرایط کنترل شده در معرض امواج اولتراسونیک قرار می گیرند. اصل کار تکه تکه شدن DNA اولتراسونیک بر اساس ارتعاشات و کاویتاسیون تولید شده توسط امواج اولتراسوند است. نیروهای برشی که از کاویتاسیون اولتراسونیک (آکوستیک) حاصل می شوند، مولکول های DNA با وزن مولکولی بالا را می شکنند. تنظیم فراصوت مانند شدت (دامنه، مدت زمان)، حالت ضربان و دما اجازه می دهد برای تکه تکه شدن DNA دقیق به طول مورد نظر مشخص از قطعات DNA. در حالی که DNA اغلب با استفاده از سونوگرافی به 100 تا 600 جفت باز کاهش می یابد، قطعات DNA طولانی تر تا 1300 جفت باز را می توان زمانی که شرایط اولتراسونیک خفیف تر اعمال می شود، به دست آورد.

هموژنایزرهای التراسونیک برای برش DNA قابل اعتماد هستند

برش DNA اولتراسونیک در طول ChIP – رسوب ایمنی کروماتین
اقتباس شده از Jkwchui تحت CC-BY-SA.03

 

این آموزش توضیح می دهد که چه نوع از فراصوت بهترین است برای وظایف آماده سازی نمونه خود را مانند لیز ، اختلال سلولی ، جداسازی پروتئین ، تکه تکه شدن DNA و RNA در آزمایشگاه ها ، تجزیه و تحلیل و تحقیقات. نوع سونیکاتور ایده آل را برای کاربرد، حجم نمونه، تعداد نمونه و توان عملیاتی خود انتخاب کنید. Hielscher Ultrasonics دارای هموژنایزر اولتراسونیک ایده آل برای شما!

چگونه می توان سونیکتور مناسب برای اختلال سلولی و استخراج پروتئین را در علم و تجزیه و تحلیل پیدا کرد

تصویر کوچک ویدیو

 

کنترل دما برای جلوگیری از تخریب DNA

شکل مولکولی دو رشته ای DNA به دماهای بالا بسیار حساس است، به طوری که کنترل دقیق دما در طول مراحل آماده سازی نمونه یک عامل مهم برای نتایج تجزیه و تحلیل قابل اعتماد است.
این که آیا شما با استفاده از اولتراسونیک کاوشگر Hielscher است, VialTweeter و یا UIP400MTP – نظارت و کنترل مداوم دما به دلیل سنسور دما قابل اتصال و نرم افزار دستگاه هوشمند تضمین می شود. به منظور حفظ دما در یک محدوده مشخص، می توانید حد دمای بالا و پایین را تعیین کنید. در نتیجه، ultrasonicator به محض اینکه این حد دما فراتر رفته است مکث خواهد کرد و به طور خودکار به فراصوت ادامه خواهد داد زمانی که درجه حرارت توسط یک مجموعه ای ∆T کاهش یافته است.
نرم افزار پیچیده از مافوق صوت Hielscher تضمین تعمیر و نگهداری قابل اعتماد از شرایط درمان نمونه ایده آل.

توده نمونه تکه تکه شدن DNA با UIP400MTP چند چاه صفحه اولتراسونیک

التراسونیک چند نمونه آماده سازی واحد UIP400MTP برای فراصوت صفحه چند خوبیتعداد نمونه ها در علوم زیستی در دهه گذشته به طور قابل توجهی افزایش یافته است. این بدان معناست که تعداد بسیار بالایی از نمونه ها (به عنوان مثال، 384، 1536 یا 3456 چاه در هر میکروپلیت) باید در طول آماده سازی و تجزیه و تحلیل نمونه در شرایط مساوی پردازش شوند تا نتایج قابل مقایسه و معتبر به دست آید. با UIP400MTP، Hielscher مافوق صوت به دنبال روند پردازش نمونه انبوه. UIP400MTP یک مافوق صوت برای آماده سازی نمونه با استفاده از میکروپلیت است. UIP400MTP می تواند صفحات با چاه های 6 ، 12 ، 24 ، 48 ، 96 ، 384 ، 1536 یا 3456 را پردازش کند. بسته به نوع میکروپلیت، هر چاه معمولا می تواند حجم نمونه را بین ده ها نانولیتر تا چند میلی لیتر نگه دارد. این UIP400MTP که به طور گسترده در تحقیقات علوم زیستی استفاده می شود، معمولا برای آماده سازی نمونه قبل از سنجش هایی مانند الایزا (سنجش ایمونوسوربنت مرتبط با آنزیم) یا PCR، قبل از تجزیه و تحلیل پروتئین، و همچنین برای آماده سازی کروماتین قبل از CHiP و CHiP-seq، شناسایی اصلاح هیستون و سایر درمان های تحلیلی (به عنوان مثال، الکتروفورز ژل، طیف سنجی جرمی) استفاده می شود.

هموژنایزر اولتراسونیک UIP400MTP می تواند چند به خوبی صفحات و میکرو تیتر صفحات برای لیز سلول، تکه تکه شدن DNA، پراکنده شدن یا همگن سازی فراصوت کند.

UIP400MTP برای فراصوت چند چاه صفحه

تصویر کوچک ویدیو

VialTweeter برای نمونه پراپاراسیون حداکثر 10 ویال

راه اندازی کامل VialTweeter: سونوترود VialTweeter در پردازنده اولتراسونیک UP200StVialTweeter به طور گسترده ای مورد استفاده اولتراسونیک آزمایشگاه VialTweeter است که اجازه می دهد تا برای فراصوت موثر و راحت تا 10 ویال به طور همزمان است. از آنجا که ویال ها و لوله های test (به عنوان مثال، ویال های Eppendorf، ویال های کرایو، لوله های سانتریفیوژ) به طور غیر مستقیم فراصوت می شوند، از هرگونه آلودگی متقابل جلوگیری می شود. همانطور که همان شدت سونوگرافی به هر نمونه تحویل داده می شود، تمام نتایج فراصوت همگن و تکرارپذیر است. VialTweeter تمام ویژگی های هوشمند مانند سایر دستگاه های دیجیتال ما را ارائه می دهد (به عنوان مثال، منوی هوشمند، تنظیمات قابل برنامه ریزی، کنترل دما، کنترل از راه دور و غیره) به طوری که بالاترین راحتی کاربر تضمین می شود.

پروب های چند انگشتی برای صفحات میکروول

4 سر پروب و یا 4 sonotrodes برای فراصوت همزمان از 4 نمونه در همان شدت با Hielscher 200 وات مدل های ultrasonicator UP200ST و UP200HTدر دسترس برای هموژنایزرهای پروب اولتراسونیک UP200Ht و UP200St، پروب های چند انگشت با 4 یا 8 انگشت یک گزینه راحت برای فراصوت نمونه های متعدد در همان زمان تحت شرایط مشابه هستند. به عنوان مثال، سونوترود MTP-24-8-96 یک پروب هشت انگشتی است که برای ادغام در سیستم های خودکار یا آماده سازی نمونه دستی کارآمد چاه های صفحات چند چاهی ایده آل است. sonotrode چند انگشت ایده آل برای خودکار برای آزمایشگاه است, که در آن عمدتا لیوان ها و لوله های test با استفاده از سونوترود اولتراسونیک استاندارد پردازش می شوند. پروب های چند انگشت و استاندارد را می توان به سرعت در عرض چند دقیقه تغییر داد و مافوق صوت تک پروب را به یک مختل کننده اولتراسونیک چند پروب تبدیل کرد.

درخواست اطلاعات




توجه داشته باشید ما سیاست حفظ حریم خصوصی.




Hielscher Ultrasonicators برای تکه تکه شدن DNA

Hielscher مافوق صوت ارائه می دهد سیستم عامل های مختلف مبتنی بر سونوگرافی برای DNA, RNA, و تکه تکه شدن کروماتین. این سیستم عامل های مختلف شامل پروب های مافوق صوت (sonotrodes)، راه حل های فراصوت غیر مستقیم برای آماده سازی نمونه همزمان از لوله های متعدد و یا صفحات چند چاه (به عنوان مثال، صفحات 96 چاه، صفحات microtiter)، sonoreactors، و cuphorns مافوق صوتی. تمام سیستم عامل های برش DNA توسط پردازنده های اولتراسونیک تنظیم شده با فرکانس و با کارایی بالا تغذیه می شوند که دقیقا قابل کنترل هستند و نتایج قابل تکرار را ارائه می دهند.

پردازنده های اولتراسونیک برای هر تعداد نمونه و اندازه

با مافوق صوت چند نمونه Hielscher ، VialTweeter (تا 10 test لوله) و UIP400MTP (برای microplates / صفحات چند چاه) آن را به راحتی ممکن می شود برای کاهش زمان پردازش نمونه با توجه به سونوگرافی شدید و دقیق قابل کنترل در حالی که به دست آوردن توزیع اندازه قطعه DNA مورد نظر و بازده. تکه تکه شدن DNA اولتراسونیک باعث می شود آماده سازی نمونه کارآمد، قابل اعتماد و مقیاس پذیر باشد. پروتکل ها را می توان به صورت خطی از یک نمونه به چندین نمونه با استفاده از سونوگرافی به طور مداوم کنترل شده مقیاس بندی کرد.
پروب اولتراسونیک با یک تا پنج انگشت ایده آل برای آماده سازی تعداد نمونه کوچکتر هستند. مافوق صوت آزمایشگاه Hielscher در اندازه های مختلف در دسترس هستند به طوری که ما می توانیم دستگاه ایده آل برای نرم افزار و نیازهای شما را به شما توصیه می کنیم.

کنترل دقیق فرآیند

مافوق صوت Hielscher را می توان از راه دور از طریق کنترل مرورگر کنترل. پارامترهای فراصوت را می توان دقیقا با توجه به نیازهای فرآیند نظارت و تنظیم کرد.تنظیمات فراصوت دقیق قابل کنترل بسیار مهم است از فراصوت جامع می تواند DNA ، RNA و کروماتین را از بین ببرد ، اما نتایج برش اولتراسونیک ناکافی در قطعات DNA و کروماتین بیش از حد طولانی. اولتراسونیک های دیجیتال Hielscher را می توان به راحتی به پارامتر فراصوت دقیق تنظیم. تنظیمات فراصوت خاص نیز می تواند به عنوان تنظیمات برنامه ریزی شده برای تکرار سریع همان روش ذخیره شود.
تمام فراصوت به طور خودکار پروتکل شده و ذخیره شده به عنوان فایل CSV بر روی ساخته شده در کارت SD. این اجازه می دهد تا برای مستندات دقیق از آزمایش های انجام شده و باعث می شود آن را ممکن است برای تجدید نظر فراصوت اجرا می شود به راحتی.
از طریق کنترل از راه دور مرورگر، تمام مافوق صوت دیجیتال را می توان از طریق هر مرورگر استاندارد عمل و نظارت کرد. نصب نرم افزار اضافی مورد نیاز نیست، زیرا اتصال LAN امکان راه اندازی بسیار ساده plug-n-play را فراهم می کند.

بالاترین کاربر پسند بودن در آماده سازی نمونه اولتراسونیک

همه مافوق صوت Hielscher طراحی شده اند برای ارائه سونوگرافی با کارایی بالا، در حالی که در همان زمان همیشه بسیار کاربر پسند و آسان برای کار. همه تنظیمات به خوبی در یک منوی واضح ساختار یافته اند که به راحتی از طریق نمایشگر لمسی رنگی یا کنترل از راه دور مرورگر قابل دسترسی است. نرم افزار هوشمند با تنظیمات قابل برنامه ریزی و ضبط خودکار داده ها تنظیمات فراصوت بهینه را برای نتایج قابل اعتماد و قابل تکرار تضمین می کند. رابط منوی تمیز و آسان برای استفاده به نوبه خود مافوق صوت Hielscher را به دستگاه های کاربر پسند و کارآمد.
جدول زیر به شما نشانه ای از ظرفیت پردازش تقریبی مافوق صوت آزمایشگاه ما می دهد، که برای وظایف آماده سازی نمونه مانند تکه تکه شدن DNA و RNA، لیز سلول و همچنین استخراج پروتئین ایده آل هستند:

دستگاه توان [W] نوع حجم [میلی لیتر]
UIP400MTP 400 برای میکروپلیت ها 6 – 3456 چاه
VialTweeter(ویال گروهی) 200 برای حداکثر 10 ویال به علاوه امکان گیره زدن 0.5 – 1.5
UP50H 50 نوع کاوشگر 0.01 – 250
UP100H 100 نوع کاوشگر 0.01 – 500
تا 200 هرتز 200 نوع کاوشگر 0.1 – 1000
200 خیابان 200 نوع کاوشگر 0.1 – 1000
UP400St 400 نوع کاوشگر 5.0 – 2000
کاپ هورن 200 CupHorn، سونوراکتر 10 – 200
GDmini2 200 سلول جریانی بدون آلاینده

تماس با ما! / از ما بپرسید!

اطلاعات بیشتر بخواهید

لطفا از فرم زیر برای درخواست اطلاعات بیشتر در مورد پردازنده های اولتراسونیک، برنامه ها و قیمت استفاده کنید. ما خوشحال خواهیم شد که روند شما را با شما در میان بگذاریم و یک سیستم اولتراسونیک را به شما ارائه دهیم که نیازهای شما را برآورده می کند!









لطفا توجه داشته باشید که ما سیاست حفظ حریم خصوصی.




VialTweeter یک MultiSample Ultraonicator است که امکان آماده سازی نمونه قابل اعتماد را در شرایط دمایی دقیق کنترل شده فراهم می کند.

واحد آماده سازی چند نمونه اولتراسونیک VialTweeter(ویال گروهی) اجازه می دهد تا برای فراصوت همزمان تا 10 ویال. با دستگاه گیره دار VialPress، حداکثر 4 لوله اضافی را می توان به جلو برای فراصوت شدید فشار داد.


سونوترود MTP-24-8-96 دارای هشت پروب اولتراسونیک برای فراصوت چاه از صفحات میکروتیتر.

سونوترود MTP-24-8-96 دارای هشت پروب اولتراسونیک برای فراصوت چاه از صفحات میکروتیتر.



ادبیات / منابع

حقایقی که ارزش دانستن دارند

توالی نسل بعدی چیست؟

توالی یابی نسل بعدی، همچنین توالی یابی نسل بعدی (NGS)، توالی یابی با توان عملیاتی بالا یا توالی یابی نسل دوم، به رویکرد توالی یابی موازی عظیم اشاره دارد، که در آن مقادیر بسیار زیاد (عظیم) DNA میلیون ها قطعه به طور همزمان به صورت موازی در هر اجرا توالی یابی می شوند.
به منظور انجام توالی یابی نسل بعدی، سه مرحله اساسی

  1. آماده سازی کتابخانه،
  2. توالی یابی و
  3. تجزیه و تحلیل داده ها

مورد نیاز است.
در طول آماده سازی کتابخانه ، رشته های DNA باید به قطعات DNA با طول معین تقسیم شوند. فراصوت یکی از تکنیک های ترجیحی برای قطعه قطعه DNA است.
در طی فرآیند توالی یابی DNA، ترتیب نوکلئوتیدها در DNA – شناخته شده به عنوان توالی اسید نوکلئیک - تعیین می شود. توالی اسید نوکلئیک از چهار باز نوکلئوتیدی تشکیل شده است - آدنین، سیتوزین، گوانین، تیمین – کدام کد برای اطلاعات است.
توالی یابی نسل بعدی تحقیقات در علوم زیستی و پزشکی شخصی را هدایت می کند، زیرا توالی یابی DNA و RNA به شدت در تحقیقات ژنومی، تحقیقات سرطان، تحقیقات بیماری های نادر و پیچیده، تحقیقات میکروبی، آگرژنومیک و بسیاری از زمینه های تحقیقاتی دیگر استفاده می شود.

توالی یابی نسل بعدی در مقابل توالی یابی Sanger

در حالی که با توالی یابی نسل بعدی (NGS) امکان توالی یابی تعداد زیادی از نمونه های ژنومی وجود دارد، توالی یابی سانگر (همچنین به عنوان روش خاتمه زنجیره ای یا توالی یابی نسل اول شناخته می شود) تنها توانایی توالی یابی تعداد نمونه های کوچک را دارد. توالی یابی سانگر فقط یک قطعه DNA را در یک زمان توالی یابی می کند و می تواند در یک روز انجام شود. به دلیل دقت آن، توالی یابی سانگر نیز به عنوان فناوری استاندارد طلایی در نظر گرفته می شود که برای تأیید نتایج به دست آمده توسط توالی یابی نسل بعدی استفاده می شود.
توالی یابی سانگر به طول خواندن تقریبا 800 جفت باز (معمولا 500-600 جفت باز با DNA غنی نشده) دست می یابد. طول خواندن طولانی تر در توالی یابی سانگر مزایای قابل توجهی نسبت به سایر روش های توالی یابی به ویژه از نظر توالی یابی مناطق تکراری ژنوم نشان می دهد. چالش داده های توالی کوتاه خوان به ویژه در توالی یابی ژنوم های جدید (de novo) و در توالی یابی بخش های ژنوم بسیار بازآرایی شده، معمولا آنهایی که در ژنوم های سرطانی یا در مناطقی از کروموزوم ها دیده می شوند که تنوع ساختاری را نشان می دهند، یک مسئله است. [cp. موروزوا و مارا، 2008]

Dna – اسید دئوکسی ریبونوکلئیک – اشکال و عملکردهای آن

هر شکل از DNA دارای ویژگی ها و کاربردهای منحصر به فردی است که به طیف گسترده ای از زمینه های تحقیقاتی، از جمله انکولوژی، ژنتیک، علوم پزشکی قانونی و زیست شناسی تکاملی کمک می کند. فراصوت Hielscher یک راه حل بسیار کارآمد و قابل اعتماد برای جداسازی و قطعه DNA و RNA برای اهداف تجزیه و تحلیل خود را. در لیست زیر اشکال خاص DNA را به شما توضیح می دهیم و آنها را بر اساس زمینه و عملکرد بیولوژیکی آنها دسته بندی می کنیم:

  • DNA ژنومی (gDNA)
    DNA ژنومی (gDNA): مجموعه کاملی از DNA در یک ارگانیسم ، شامل مناطق کد کننده (ژن ها) و غیر کد کننده.
  • DNA خارج سلولی
    DNA تومور در گردش (ctDNA): تکه هایی از DNA که توسط سلول های تومور در جریان خون آزاد می شوند.
    DNA بدون سلول (cfDNA): قطعات DNA که آزادانه در جریان خون در گردش هستند و از بافت های مختلف سرچشمه می گیرند.
  • DNA دایره ای خارج کروموزومی (eccDNA): مولکول های DNA دایره ای که در خارج از کروموزوم ها در سلول های یوکاریوتی یافت می شوند.
    DNA ویروسی: DNA سرچشمه گرفته از ویروس ها، یا در ژنوم میزبان ادغام شده یا به عنوان DNA اپیزومی.
  • DNA میتوکندری
    DNA میتوکندری (mtDNA): DNA واقع در میتوکندری ، به صورت مادری به ارث می رسد و در تولید انرژی نقش دارد.
  • DNA پلاسمید
    DNA پلاسمید: مولکول های DNA کوچک و دایره ای شکل که مستقل از DNA کروموزومی تکثیر می شوند و معمولا در باکتری ها یافت می شوند و در مهندسی ژنتیک استفاده می شوند.
  • DNA هسته ای
    DNA هسته ای (nDNA): DNA موجود در هسته سلولهای یوکاریوتی که اکثر مواد ژنتیکی موجود در یک ارگانیسم را تشکیل می دهد.
  • DNA تک سلولی
    DNA تک سلولی (scDNA): DNA استخراج شده از یک سلول، برای تجزیه و تحلیل ژنومی دقیق در سطح سلول های فردی استفاده می شود.
  • DNA نوترکیب
    DNA نوترکیب (rDNA): مولکول های DNA که توسط روش های آزمایشگاهی نوترکیبی ژنتیکی تشکیل شده اند تا مواد ژنتیکی را از منابع مختلف گرد هم آورند.
  • فرم های تخصصی
    DNA محیطی (eDNA): DNA جمع آوری شده از نمونه های محیطی (خاک، آب) بدون جداسازی ارگانیسم های منبع
    DNA باستانی (aDNA): DNA استخراج شده از نمونه های باستانی، بینش هایی در مورد زیست شناسی تکاملی و جمعیت های باستانی ارائه می دهد.
  • DNA کروموزومی
    DNA کروموزومی: DNA که کروموزوم های هسته سلول را تشکیل می دهد و شامل مناطق کد کننده و غیر کد کننده است.
  • اشکال ویروسی و مصنوعی
    DNA ویروسی: DNA مشتق شده از ویروس ها، که می توانند در ژنوم میزبان ادغام شوند یا به عنوان موجودات مستقل وجود داشته باشند.
    DNA مصنوعی: توالی های DNA سنتز شده مصنوعی ایجاد شده از طریق فرآیندهای شیمیایی، که اغلب در تحقیقات و بیوتکنولوژی استفاده می شود.

High performance ultrasonics! Hielscher's product range covers the full spectrum from the compact lab ultrasonicator over bench-top units to full-industrial ultrasonic systems.

Hielscher مافوق صوت تولید کننده هموژنایزرهای مافوق صوت با کارایی بالا از ازمایشگاه ها تا اندازه صنعتی.

ما خوشحال خواهیم شد که در مورد روند شما صحبت کنیم.

Let's get in contact.